6w4e

NMR-driven structure of KRAS4B-GTP homodimer on a lipid bilayer nanodisc

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apolipoprotein A-I

Homo sapiens

UniProt P02647

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 GTPase KRas × 2 (P01116) 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 APOA1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–200; UniProt 68–265 作者链 D; PDB构建体 3–200; UniProt 68–265

GTPase KRas

Homo sapiens

UniProt P01116

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Apolipoprotein A-I × 2 (P02647) 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 2 MAGNESIUM ION × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RASK_HUMAN
Isoform P01116-2
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 2–185; UniProt 2–185 作者链 C; PDB构建体 2–185; UniProt 2–185

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6w4e
沉积日期 deposition_date2020-03-10
结构标题 titleNMR-driven structure of KRAS4B-GTP homodimer on a lipid bilayer nanodisc
关键词 keywordsGTPase, nanodisc, ONCOPROTEIN; ONCOPROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6w4e__assembly_1__model_13

Assembly 1 · Model 13 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6w4e__assembly_1__model_13 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6w4e__assembly_1__model_13 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)45.23 Å
Rg(电子密度)40.87 Å
总 Rg40.49 Å
原子数12112
残基数764
排除体积208950 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6w4e__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 6w4e__assembly_1__model_2 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 6w4e__assembly_1__model_3 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 6w4e__assembly_1__model_4 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 6w4e__assembly_1__model_5 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 6w4e__assembly_1__model_6 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 6w4e__assembly_1__model_7 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 6w4e__assembly_1__model_8 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 6w4e__assembly_1__model_9 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 6w4e__assembly_1__model_10 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 6w4e__assembly_1__model_11 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 6w4e__assembly_1__model_12 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 6w4e__assembly_1__model_13 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 6w4e__assembly_1__model_14 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 6w4e__assembly_1__model_15 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 6w4e__assembly_1__model_16 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 6w4e__assembly_1__model_17 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 6w4e__assembly_1__model_18 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 6w4e__assembly_1__model_19 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 6w4e__assembly_1__model_20 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd6w4ea1
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.5 — Apolipoprotein A-I
超家族 Superfamily superfamilyh.5.1 — Apolipoprotein A-I
家族 Family familyh.5.1.1 — Apolipoprotein A-I
结构域编号 domain_idd6w4ea2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd6w4ed_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.5 — Apolipoprotein A-I
超家族 Superfamily superfamilyh.5.1 — Apolipoprotein A-I
家族 Family familyh.5.1.1 — Apolipoprotein A-I

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id6w4eB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id6w4eC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
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7. 引用文献 (1)