6ww7

Structure of the human ER membrane protein complex in a lipid nanodisc

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ER membrane protein complex subunit 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 2	ER membrane protein complex subunit 2 × 1 （Q15006） ER membrane protein complex subunit 3 × 1 （Q9P0I2） ER Membrane Protein Complex Subunit 4 × 1 Membrane magnesium transporter 1 × 1 （Q8N4V1） ER membrane protein complex subunit 6 × 1 （Q9BV81） ER membrane protein complex subunit 7 × 1 （Q9NPA0） ER membrane protein complex subunit 8 × 1 （O43402） ER membrane protein complex subunit 10 × 1 （Q5UCC4） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EMC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–993； UniProt 1–993

ER membrane protein complex subunit 2

物种未注明

UniProt Q15006

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 2	ER membrane protein complex subunit 1 × 1 （Q8N766） ER membrane protein complex subunit 3 × 1 （Q9P0I2） ER Membrane Protein Complex Subunit 4 × 1 Membrane magnesium transporter 1 × 1 （Q8N4V1） ER membrane protein complex subunit 6 × 1 （Q9BV81） ER membrane protein complex subunit 7 × 1 （Q9NPA0） ER membrane protein complex subunit 8 × 1 （O43402） ER membrane protein complex subunit 10 × 1 （Q5UCC4） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	EMC2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–297； UniProt 1–297

ER membrane protein complex subunit 3

物种未注明

UniProt Q9P0I2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 2	ER membrane protein complex subunit 1 × 1 （Q8N766） ER membrane protein complex subunit 2 × 1 （Q15006） ER Membrane Protein Complex Subunit 4 × 1 Membrane magnesium transporter 1 × 1 （Q8N4V1） ER membrane protein complex subunit 6 × 1 （Q9BV81） ER membrane protein complex subunit 7 × 1 （Q9NPA0） ER membrane protein complex subunit 8 × 1 （O43402） ER membrane protein complex subunit 10 × 1 （Q5UCC4） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	EMC3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261

Membrane magnesium transporter 1

物种未注明

UniProt Q8N4V1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 2	ER membrane protein complex subunit 1 × 1 （Q8N766） ER membrane protein complex subunit 2 × 1 （Q15006） ER membrane protein complex subunit 3 × 1 （Q9P0I2） ER Membrane Protein Complex Subunit 4 × 1 ER membrane protein complex subunit 6 × 1 （Q9BV81） ER membrane protein complex subunit 7 × 1 （Q9NPA0） ER membrane protein complex subunit 8 × 1 （O43402） ER membrane protein complex subunit 10 × 1 （Q5UCC4） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MMGT1_HUMAN
Isoform	Q8N4V1-2
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–131； UniProt 66–196

ER membrane protein complex subunit 6

物种未注明

UniProt Q9BV81

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 2	ER membrane protein complex subunit 1 × 1 （Q8N766） ER membrane protein complex subunit 2 × 1 （Q15006） ER membrane protein complex subunit 3 × 1 （Q9P0I2） ER Membrane Protein Complex Subunit 4 × 1 Membrane magnesium transporter 1 × 1 （Q8N4V1） ER membrane protein complex subunit 7 × 1 （Q9NPA0） ER membrane protein complex subunit 8 × 1 （O43402） ER membrane protein complex subunit 10 × 1 （Q5UCC4） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	EMC6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–110； UniProt 1–110

ER membrane protein complex subunit 7

物种未注明

UniProt Q9NPA0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 2	ER membrane protein complex subunit 1 × 1 （Q8N766） ER membrane protein complex subunit 2 × 1 （Q15006） ER membrane protein complex subunit 3 × 1 （Q9P0I2） ER Membrane Protein Complex Subunit 4 × 1 Membrane magnesium transporter 1 × 1 （Q8N4V1） ER membrane protein complex subunit 6 × 1 （Q9BV81） ER membrane protein complex subunit 8 × 1 （O43402） ER membrane protein complex subunit 10 × 1 （Q5UCC4） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	EMC7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–242； UniProt 1–242

ER membrane protein complex subunit 8

物种未注明

UniProt O43402

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 2	ER membrane protein complex subunit 1 × 1 （Q8N766） ER membrane protein complex subunit 2 × 1 （Q15006） ER membrane protein complex subunit 3 × 1 （Q9P0I2） ER Membrane Protein Complex Subunit 4 × 1 Membrane magnesium transporter 1 × 1 （Q8N4V1） ER membrane protein complex subunit 6 × 1 （Q9BV81） ER membrane protein complex subunit 7 × 1 （Q9NPA0） ER membrane protein complex subunit 10 × 1 （Q5UCC4） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EMC8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210

ER membrane protein complex subunit 10

物种未注明

UniProt Q5UCC4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 9 其他聚合物 2	ER membrane protein complex subunit 1 × 1 （Q8N766） ER membrane protein complex subunit 2 × 1 （Q15006） ER membrane protein complex subunit 3 × 1 （Q9P0I2） ER Membrane Protein Complex Subunit 4 × 1 Membrane magnesium transporter 1 × 1 （Q8N4V1） ER membrane protein complex subunit 6 × 1 （Q9BV81） ER membrane protein complex subunit 7 × 1 （Q9NPA0） ER membrane protein complex subunit 8 × 1 （O43402） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	EMC10_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–262； UniProt 1–262

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6ww7
沉积日期 deposition_date	2020-05-08
结构标题 title	Structure of the human ER membrane protein complex in a lipid nanodisc
关键词 keywords	Insertase, endoplasmic reticulum, transmembrane chaperone, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6ww7__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6ww7__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6ww7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	58.39 Å
Rg（电子密度）	58.62 Å
总 Rg	58.40 Å
原子数	16576
残基数	2074
排除体积	296120 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6ww7__assembly_1__model_1`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ER membrane protein complex subunit 1
分子量 formula_weight	111886.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	16576

MAAEWASRFWLWATLLIPAAAVYEDQVGKFDWRQQYVGKVKFASLEFSPGSKKLVVATEKNVIAALNSRTGEILWRHVDKGTAEGAVDAMLLHGQDVITVSNGGRIMRSWETNIGGLNWEITLDSGSFQALGLVGLQESVRYIAVLKKTTLALHHLSSGHLKWVEHLPESDSIHYQMVYSYGSGVVWALGVVPFSHVNIVKFNVEDGEIVQQVRVSTPWLQHLSGACGVVDEAVLVCPDPSSRSLQTLALETEWELRQIPLQSLDLEFGSGFQPRVLPTQPNPVDASRAQFFLHLSPSHYALLQYHYGTLSLLKNFPQTALVSFATTGEKTVAAVMACRNEVQKSSSSEDGSMGSFSEKSSSKDSLACFNQTYTINLYLVETGRRLLDTTITFSLEQSGTRPERLYIQVFLKKDDSVGYRALVQTEDHLLLFLQQLAGKVVLWSREESLAEVVCLEMVDLPLTGAQAELEGEFGKKADGLLGMFLKRLSSQLILLQAWTSHLWKMFYDARKPRSQIKNEINIDTLARDEFNLQKMMVMVTASGKLFGIESSSGTILWKQYLPNVKPDSSFKLMVQRTTAHFPHPPQCTLLVKDKESGMSSLYVFNPIFGKWSQVAPPVLKRPILQSLLLPVMDQDYAKVLLLIDDEYKVTAFPATRNVLRQLHELAPSIFFYLVDAEQGRLCGYRLRKDLTTELSWELTIPPEVQRIVKVKGKRSSEHVHSQGRVMGDRSVLYKSLNPNLLAVVTESTDAHHERTFIGIFLIDGVTGRIIHSSVQKKAKGPVHIVHSENWVVYQYWNTKARRNEFTVLELYEGTEQYNATAFSSLDRPQLPQVLQQSYIFPSSISAMEATITERGITSRHLLIGLPSGAILSLPKALLDPRRPEIPTEQSREENLIPYSPDVQIHAERFINYNQTVSRMRGIYTAPSGLESTCLVVAYGLDIYQTRVYPSKQFDVLKDDYDYVLISSVLFGLVFATMITKRLAQVKLLNRAWR

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ER membrane protein complex subunit 2
分子量 formula_weight	34882.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MAKVSELYDVTWEEMRDKMRKWREENSRNSEQIVEVGEELINEYASKLGDDIWIIYEQVMIAALDYGRDDLALFCLQELRRQFPGSHRVKRLTGMRFEAMERYDDAIQLYDRILQEDPTNTAARKRKIAIRKAQGKNVEAIRELNEYLEQFVGDQEAWHELAELYINEHDYAKAAFCLEELMMTNPHNHLYCQQYAEVKYTQGGLENLELSRKYFAQALKLNNRNMRALFGLYMSASHIASNPKASAKTKKDNMKYASWAASQINRAYQFAGRSKKETKYSLKAVEDMLETLQITQS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ER membrane protein complex subunit 3
分子量 formula_weight	29981.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MAGPELLLDSNIRLWVVLPIVIITFFVGMIRHYVSILLQSDKKLTQEQVSDSQVLIRSRVLRENGKYIPKQSFLTRKYYFNNPEDGFFKKTKRKVVPPSPMTDPTMLTDMMKGNVTNVLPMILIGGWINMTFSGFVTTKVPFPLTLRFKPMLQQGIELLTLDASWVSSASWYFLNVFGLRSIYSLILGQDNAADQSRMMQEQMTGAAMAMPADTNKAFKTEWEALELTDHQWALDDVEEELMAKDLHFEGMFKKELQTSIF

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	ER Membrane Protein Complex Subunit 4
分子量 formula_weight	1209.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

XXXXXXXXXXXXXX

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Membrane magnesium transporter 1
分子量 formula_weight	14706.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MAPSLWKGLVGIGLFALAHAAFSAAQHRSYMRLTEKEDESLPIDIVLQTLLAFAVTCYGIVHIAGEFKDMDATSELKNKTFDTLRNHPSFYVFNHRGRVLFRPSDTANSSNQDALSSNTSLKLRKLESLRR

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	ER membrane protein complex subunit 6
分子量 formula_weight	12029.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MAAVVAKREGPPFISEAAVRGNAAVLDYCRTSVSALSGATAGILGLTGLYGFIFYLLASVLLSLLLILKAGRRWNKYFKSRRPLFTGGLIGGLFTYVLFWTFLYGMVHVY

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	ER membrane protein complex subunit 7
分子量 formula_weight	26501.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MAAALWGFFPVLLLLLLSGDVQSSEVPGAAAEGSGGSGVGIGDRFKIEGRAVVPGVKPQDWISAARVLVDGEEHVGFLKTDGSFVVHDIPSGSYVVEVVSPAYRFDPVRVDITSKGKMRARYVNYIKTSEVVRLPYPLQMKSSGPPSYFIKRESWGWTDFLMNPMVMMMVLPLLIFVLLPKVVNTSDPDMRREMEQSMNMLNSNHELPDVSEFMTRLFSSKSSGKSSSGSSKTGKSGAGKRR

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	ER membrane protein complex subunit 8
分子量 formula_weight	23807.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MPGVKLTTQAYCKMVLHGAKYPHCAVNGLLVAEKQKPRKEHLPLGGPGAHHTLFVDCIPLFHGTLALAPMLEVALTLIDSWCKDHSYVIAGYYQANERVKDASPNQVAEKVASRIAEGFSDTALIMVDNTKFTMDCVAPTIHVYEHHENRWRCRDPHHDYCEDWPEAQRISASLLDSRSYETLVDFDNHLDDIRNDWTNPEINKAVLHLC

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	ER membrane protein complex subunit 10
分子量 formula_weight	27375.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MAAASAGATRLLLLLLMAVAAPSRARGSGCRAGTGARGAGAEGREGEACGTVGLLLEHSFEIDDSANFRKRGSLLWNQQDGTLSLSQRQLSEEERGRLRDVAALNGLYRVRIPRRPGALDGLEAGGYVSSFVPACSLVESHLSDQLTLHVDVAGNVVGVSVVTHPGGCRGHEVEDVDLELFNTSVQLQPPTTAPGPETAAFIERLEMEQAQKAKNPQEQKSFFAKYWMYIIPVVLFLMMSGAPDTGGQGGGGGGGGGGGSGR

实体 10 Entity 10 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	188746

Structure of the human ER membrane protein complex in a lipid nanodisc

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ER membrane protein complex subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ER membrane protein complex subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ER membrane protein complex subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Membrane magnesium transporter 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ER membrane protein complex subunit 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ER membrane protein complex subunit 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ER membrane protein complex subunit 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ER membrane protein complex subunit 10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6ww7__assembly_1__model_1

6ww7__assembly_1__model_1 | I(q)

6ww7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer