6z6p

HDAC-PC-Nuc

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone deacetylase HDA1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 12 DNA 2	HDA1 complex subunit 3,HDA1 complex subunit 3 × 1 （Q06623） HDA1 complex subunit 2 × 1 （Q06629） Histone H3 × 1 （A0A310TTQ1） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQA5） Histone H3.2 × 1 （P84233） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A type 1 × 1 （P06897） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQ56） DNA (145-MER) × 1 DNA (145-MER) × 1 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	HDA1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1, 2
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–661； UniProt 40–700 作者链 L； PDB构建体 1–672； UniProt 29–700

HDA1 complex subunit 3,HDA1 complex subunit 3

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q06623

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 12 DNA 2	Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） HDA1 complex subunit 2 × 1 （Q06629） Histone H3 × 1 （A0A310TTQ1） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQA5） Histone H3.2 × 1 （P84233） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A type 1 × 1 （P06897） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQ56） DNA (145-MER) × 1 DNA (145-MER) × 1 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	HDA3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–307； UniProt 28–334 作者链 M； PDB构建体 308–543； UniProt 404–639

HDA1 complex subunit 2

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q06629

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 12 DNA 2	Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） HDA1 complex subunit 3,HDA1 complex subunit 3 × 1 （Q06623） Histone H3 × 1 （A0A310TTQ1） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQA5） Histone H3.2 × 1 （P84233） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A type 1 × 1 （P06897） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQ56） DNA (145-MER) × 1 DNA (145-MER) × 1 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	HDA2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–629； UniProt 10–638

Histone H3

Xenopus laevis

UniProt A0A310TTQ1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 12 DNA 2	Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） HDA1 complex subunit 3,HDA1 complex subunit 3 × 1 （Q06623） HDA1 complex subunit 2 × 1 （Q06629） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQA5） Histone H3.2 × 1 （P84233） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A type 1 × 1 （P06897） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQ56） DNA (145-MER) × 1 DNA (145-MER) × 1 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A310TTQ1_XENLA
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–97； UniProt 39–135

Histone H4

Xenopus laevis

UniProt P62799

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 12 DNA 2	Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） HDA1 complex subunit 3,HDA1 complex subunit 3 × 1 （Q06623） HDA1 complex subunit 2 × 1 （Q06629） Histone H3 × 1 （A0A310TTQ1） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQA5） Histone H3.2 × 1 （P84233） Histone H2A type 1 × 1 （P06897） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQ56） DNA (145-MER) × 1 DNA (145-MER) × 1 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H4_XENLA
Isoform	—
PDB实体	6, 10
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–83； UniProt 21–103 作者链 F； PDB构建体 1–78； UniProt 26–103

Histone H2A

Xenopus laevis

UniProt Q6AZJ8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 12 DNA 2	Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） HDA1 complex subunit 3,HDA1 complex subunit 3 × 1 （Q06623） HDA1 complex subunit 2 × 1 （Q06629） Histone H3 × 1 （A0A310TTQ1） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQA5） Histone H3.2 × 1 （P84233） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A type 1 × 1 （P06897） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQ56） DNA (145-MER) × 1 DNA (145-MER) × 1 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q6AZJ8_XENLA
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–103； UniProt 17–119

Histone H2B

Xenopus laevis

UniProt A0A1L8FQA5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 12 DNA 2	Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） HDA1 complex subunit 3,HDA1 complex subunit 3 × 1 （Q06623） HDA1 complex subunit 2 × 1 （Q06629） Histone H3 × 1 （A0A310TTQ1） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H3.2 × 1 （P84233） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A type 1 × 1 （P06897） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQ56） DNA (145-MER) × 1 DNA (145-MER) × 1 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A1L8FQA5_XENLA
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–95； UniProt 32–126

Histone H3.2

Xenopus laevis

UniProt P84233

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 12 DNA 2	Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） HDA1 complex subunit 3,HDA1 complex subunit 3 × 1 （Q06623） HDA1 complex subunit 2 × 1 （Q06629） Histone H3 × 1 （A0A310TTQ1） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQA5） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A type 1 × 1 （P06897） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQ56） DNA (145-MER) × 1 DNA (145-MER) × 1 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H32_XENLA
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–97； UniProt 40–136

Histone H2A type 1

Xenopus laevis

UniProt P06897

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 12 DNA 2	Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） HDA1 complex subunit 3,HDA1 complex subunit 3 × 1 （Q06623） HDA1 complex subunit 2 × 1 （Q06629） Histone H3 × 1 （A0A310TTQ1） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQA5） Histone H3.2 × 1 （P84233） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQ56） DNA (145-MER) × 1 DNA (145-MER) × 1 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H2A1_XENLA
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–105； UniProt 15–119

Histone H2B

Xenopus laevis

UniProt A0A1L8FQ56

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 12 DNA 2	Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） Histone deacetylase HDA1 × 1 （P53973） HDA1 complex subunit 3,HDA1 complex subunit 3 × 1 （Q06623） HDA1 complex subunit 2 × 1 （Q06629） Histone H3 × 1 （A0A310TTQ1） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A × 1 （Q6AZJ8） Histone H2B × 1 （A0A1L8FQA5） Histone H3.2 × 1 （P84233） Histone H4 × 1 （P62799） Histone H2A type 1 × 1 （P06897） DNA (145-MER) × 1 DNA (145-MER) × 1 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A1L8FQ56_XENLA
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–93； UniProt 33–125

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6z6p
沉积日期 deposition_date	2020-05-28
结构标题 title	HDAC-PC-Nuc
关键词 keywords	Protein complex, GENE REGULATION; GENE REGULATION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6z6p__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6z6p__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6z6p__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	64.36 Å
Rg（电子密度）	64.13 Å
总 Rg	64.35 Å
原子数	31115
残基数	3428
排除体积	536250 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6z6p__assembly_1__model_1`	tetradecameric （14）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (15)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Histone deacetylase HDA1
分子量 formula_weight	74852.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.5.1.98
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K
原子数 atom_count	31115

RQVIVPVCMPKIHYSPLKTGLCYDVRMRYHAKIFTSYFEYIDPHPEDPRRIYRIYKILAENGLINDPTLSGVDDLGDLMLKIPVRAATSEEILEVHTKEHLEFIESTEKMSREELLKETEKGDSVYFNNDSYASARLPCGGAIEACKAVVEGRVKNSLAVVRPPGHHAEPQAAGGFCLFSNVAVAAKNILKNYPESVRRIMILDWDIHHGNGTQKSFYQDDQVLYVSLHRFEMGKYYPGTIQGQYDQTGEGKGEGFNCNITWPVGGVGDAEYMWAFEQVVMPMGREFKPDLVIISSGFDAADGDTIGQCHVTPSCYGHMTHMLKSLARGNLCVVLEGGYNLDAIARSALSVAKVLIGEPPDELPDPLSDPKPEVIEMIDKVIRLQSKYWNCFRRRHANSGCNFNEPINDSIISKNFPLQKAIRQQQQHYLSDEFNFVTLPLVSMDLPDNTVLCTPNISESNTIIIVVHDTSDIWAKRNVISGTIDLSSSVIIDNSLDFIKWGLDRKYGIIDVNIPLTLFEPDNYSGMITSQEVLIYLWDNYIKYFPSVAKIAFIGIGDSYSGIVHLLGHRDTRAVTKTVINFLGDKQLKPLVPLVDETLSEWYFKNSLIFSNNSHQCWKENESRKPRKKFGRVLRCDTDGLNNIIEERFEEATDFILDSFE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone deacetylase HDA1
分子量 formula_weight	76017.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.5.1.98
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

ENSLSTTSKSKRQVIVPVCMPKIHYSPLKTGLCYDVRMRYHAKIFTSYFEYIDPHPEDPRRIYRIYKILAENGLINDPTLSGVDDLGDLMLKIPVRAATSEEILEVHTKEHLEFIESTEKMSREELLKETEKGDSVYFNNDSYASARLPCGGAIEACKAVVEGRVKNSLAVVRPPGHHAEPQAAGGFCLFSNVAVAAKNILKNYPESVRRIMILDWDIHHGNGTQKSFYQDDQVLYVSLHRFEMGKYYPGTIQGQYDQTGEGKGEGFNCNITWPVGGVGDAEYMWAFEQVVMPMGREFKPDLVIISSGFDAADGDTIGQCHVTPSCYGHMTHMLKSLARGNLCVVLEGGYNLDAIARSALSVAKVLIGEPPDELPDPLSDPKPEVIEMIDKVIRLQSKYWNCFRRRHANSGCNFNEPINDSIISKNFPLQKAIRQQQQHYLSDEFNFVTLPLVSMDLPDNTVLCTPNISESNTIIIVVHDTSDIWAKRNVISGTIDLSSSVIIDNSLDFIKWGLDRKYGIIDVNIPLTLFEPDNYSGMITSQEVLIYLWDNYIKYFPSVAKIAFIGIGDSYSGIVHLLGHRDTRAVTKTVINFLGDKQLKPLVPLVDETLSEWYFKNSLIFSNNSHQCWKENESRKPRKKFGRVLRCDTDGLNNIIEERFEEATDFILDSFE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	HDA1 complex subunit 3,HDA1 complex subunit 3
分子量 formula_weight	63422.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

SGDYWLPTTMSLYQKELTDQIVSLHYSDILRYFETSHYKEDVILESMKTMCLNGSLVATHPYLLIDHYMPKSLITRDVPAHLAENSGKFSVLRDLINLVQEYETETAIVCRPGRTMDLLEALLLGNKVHIKRYDGHSIKSKQKANDFSCTVHLFSSEGINFTKYPIKSKARFDMLICLDTTVDTSQKDIQYLLQYKRERKGLERYAPIVRLVAINSIDHCRLFFGKKFDKNSREYLENVTAAMVILRDRLGTLPPDLRPIYSQKLHYLVEWLENPTVPWPLPDIYPLKQYTSMDVERSLLTEVHFKKNSSNVNYHLSSGIITHKLIQSMGEVYMDICVQKQELDDYSCLDDLQNDHLKFFSNEDEKIIKEYETVLRTNNENLNRSHELEVENNLKFSQIETLEKDIETLKGSLMAQGETLSKLKDAFVKTDNVQDEIEKEERVSVSRDTEKKYMEQEIKRAVDAIRENEEETHKLNEKQNGLESELKLKFEKSEISTKELNEKIGFLKKELKLENDLNEELVGQLSKTMDNLENLTIPRVRTQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	HDA1 complex subunit 2
分子量 formula_weight	71915.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

KVYYLPVTLTQFQKDLSEILISLHAKSFKASIIGEPQADAVNKPSGLPAGPETHPYPTLSQRQLTYIFDSNIRAIANHPSLLVDHYMPRQLLRMEPTESSIAGSHKFQVLNQLINSICFRDREGSPNEVIKCAIIAHSIKELDLLEGLILGKKFRTKRLSGTSLYNEKHKFPNLPTVDSTINKDGTPNSVSSTSSNSNSTSYTGYSKDDYDYSVKRNLKKRKINTDDWLFLATTKHLKHDQYLLANYDIDMIISFDPMLEVELPALQVLRNNANKDIPIIKLLVQNSPDHYLLDSEIKNSSVKSSHLSNNGHVDDSQEYEEIKSSLLYFLQARNAPVNNCEIDYIKLVKCCLEGKDCNNILPVLDLITLDEASKDSSDSGFWQPQLTKLQYSSTELPLWDGPLDIKTYQTELMHRAVIRLRDIQDEYAKGTVPLYEKRLNETQRQNQLDEIKNSVGLTFKKKQEVEKSINDSEKRLKHAMTESTKLQNKINHLLKNRQELENFNKLPSNTISSENHLEEGSALADKLKEYIDKNATLFNKLKELQQANAEKSKLNDELRSKYQIESSKAAESAQTLKILQESMKSLENEVNGPLTKFSTESLKKELERLQNDFQSLKARNKFLKNYITL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Histone H3
分子量 formula_weight	11431.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

PHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGER

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	9409.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

KVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Histone H2A
分子量 formula_weight	11294.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

TRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPK

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Histone H2B
分子量 formula_weight	10607.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

KTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Histone H3.2
分子量 formula_weight	11405.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

HRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	8795.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

NIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Histone H2A type 1
分子量 formula_weight	11494.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

AKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPK

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Histone H2B
分子量 formula_weight	10348.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

TRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSA

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	DNA (145-MER)
分子量 formula_weight	44520.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	I

ATCAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCGAT

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	DNA (145-MER)
分子量 formula_weight	44991.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	J

ATCGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTGAT

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	4.43 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	41279

HDAC-PC-Nuc

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone deacetylase HDA1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

HDA1 complex subunit 3,HDA1 complex subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

HDA1 complex subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H3.2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2A type 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体