SAXSdb — 7nep

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Tropomyosin alpha-1 chain × 4 （P58771） Myosin-4 × 2 （Q5SX39） Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform × 2 （P05977） Myosin regulatory light chain 2, skeletal muscle isoform × 2 （P97457）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACTS_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–374； UniProt 4–377 作者链 B； PDB构建体 1–374； UniProt 4–377 作者链 C； PDB构建体 1–374； UniProt 4–377 作者链 D； PDB构建体 1–374； UniProt 4–377 作者链 E； PDB构建体 1–374； UniProt 4–377 作者链 F； PDB构建体 1–374； UniProt 4–377 作者链 G； PDB构建体 1–374； UniProt 4–377 作者链 H； PDB构建体 1–374； UniProt 4–377 作者链 I； PDB构建体 1–374； UniProt 4–377 作者链 J； PDB构建体 1–374； UniProt 4–377 作者链 K； PDB构建体 1–374； UniProt 4–377

Tropomyosin alpha-1 chain

物种未注明

UniProt P58771

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Actin, alpha skeletal muscle × 11 （P68134） Myosin-4 × 2 （Q5SX39） Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform × 2 （P05977） Myosin regulatory light chain 2, skeletal muscle isoform × 2 （P97457）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TPM1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–251； UniProt 11–261 作者链 Q； PDB构建体 1–251； UniProt 11–261 作者链 T； PDB构建体 1–251； UniProt 11–261 作者链 U； PDB构建体 1–251； UniProt 11–261

Myosin-4

物种未注明

UniProt Q5SX39

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Actin, alpha skeletal muscle × 11 （P68134） Tropomyosin alpha-1 chain × 4 （P58771） Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform × 2 （P05977） Myosin regulatory light chain 2, skeletal muscle isoform × 2 （P97457）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MYH4_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–813； UniProt 32–844 作者链 M； PDB构建体 1–813； UniProt 32–844

Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform

物种未注明

UniProt P05977

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Actin, alpha skeletal muscle × 11 （P68134） Tropomyosin alpha-1 chain × 4 （P58771） Myosin-4 × 2 （Q5SX39） Myosin regulatory light chain 2, skeletal muscle isoform × 2 （P97457）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MYL1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–148； UniProt 40–187 作者链 O； PDB构建体 1–148； UniProt 40–187

Myosin regulatory light chain 2, skeletal muscle isoform

物种未注明

UniProt P97457

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 21	Actin, alpha skeletal muscle × 11 （P68134） Tropomyosin alpha-1 chain × 4 （P58771） Myosin-4 × 2 （Q5SX39） Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform × 2 （P05977）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MLRS_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–144； UniProt 21–164 作者链 S； PDB构建体 1–144； UniProt 21–164

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7nep
沉积日期 deposition_date	2021-02-04
结构标题 title	Homology model of the in situ actomyosin complex from the A-band of mouse psoas muscle sarcomere in the rigor state
关键词 keywords	Muscle proteins, force generation, sarcomere, cytoskeleton, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7nep__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7nep__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7nep__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	91.87 Å
Rg（电子密度）	92.95 Å
总 Rg	92.80 Å
原子数	57453
残基数	7276
排除体积	1023200 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7nep__assembly_1__model_1`	21-meric （21）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Actin, alpha skeletal muscle
分子量 formula_weight	41747.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	11

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K
原子数 atom_count	57453

EDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tropomyosin alpha-1 chain
分子量 formula_weight	28922.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,Q,T,U

LKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELY

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Myosin-4
分子量 formula_weight	92518.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,M

FDAKSSVFVVDAKESYVKATVQSREGGKVTAKTEGGATVTVKDDQVFSMNPPKYDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYNPEVVAAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFATIAVTGDKKKEEATSGKMQGTLEDQIISANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLASADIETYLLEKSRVTFQLKAERSYHIFYQIMSNKKPELIEMLLITTNPYDFAYVSQGEITVPSIDDQEELMATDTAVDILGFSADEKVAIYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAAYLTSLNSADLLKALCYPRVKVGNEYVTKGQTVQQVYNSVGALAKSMYEKMFLWMVTRINQQLDTKQPRQYFIGVLDIAGFEIFDFNTLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIDWEFIDFGMDLAACIELIEKPMGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYEQHLGKSNNFQKPKPAKGKAEAHFSLVHYAGTVDYNIIGWLDKNKDPLNETVVGLYQKSGLKTLAFLFSGGQAAEAEGGGGKKGGKKKGSSFQTVSALFRENLNKLMTNLKSTHPHFVRCLIPNETKTPGAMEHELVLHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRILYADFKQRYKVLNASAIPEGQFIDSKKASEKLLGSIDIDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGTLEEMRDEKLAQLITRTQAVCRGYLMRVEFKKMMERRESIFCIQYNVRAFMNVKHWPWMKLYFKIKPLL

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform
分子量 formula_weight	16573.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N,O

EFSKEQQEDFKEAFLLFDRTGECKITLSQVGDVLRALGTNPTNAEVKKVLGNPSNEEMNAKKIEFEQFLPMMQAISNNKDQGGYEDFVEGLRVFDKEGNGTVMGAELRHVLATLGEKMKEEEVEALLAGQEDSNGCINYEAFVKHIMS

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Myosin regulatory light chain 2, skeletal muscle isoform
分子量 formula_weight	16326.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R,S

MFDQTQIQEFKEAFTVIDQNRDGIIDKEDLRDTFAAMGRLNVKNEELDAMMKEASGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEDVITGAFKVLDPEGKGTIKKQFLEELLTTQCDRFSQEEIKNMWAAFPPDVGGNVDYKNICYVITHGD

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分辨率 resolution	10.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	18090

Homology model of the in situ actomyosin complex from the A-band of mouse psoas muscle sarcomere in the rigor state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tropomyosin alpha-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myosin-4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myosin regulatory light chain 2, skeletal muscle isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7nep__assembly_1__model_1

7nep__assembly_1__model_1 | I(q)

7nep__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

Homology model of the in situ actomyosin complex from the A-band of mouse psoas muscle sarcomere in the rigor state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha skeletal muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tropomyosin alpha-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Myosin-4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Myosin regulatory light chain 2, skeletal muscle isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7nep__assembly_1__model_1

7nep__assembly_1__model_1 | I(q)

7nep__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)