7ozp

RNA Polymerase II dimer (Class 3)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	DNA-directed RNA polymerase subunit × 2 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 2 （A0A481DF93） RNA polymerase II subunit D × 2 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 2 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 2 （F1SKN8） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 2 （I3LJZ9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 2 （A0A4X1ULF2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 2 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 2 （A0A7K6NXI9） RNA_pol_L_2 domain-containing protein × 2 （A0A4X1UK25） RNA polymerase II subunit K × 2 （I3LN51） ZINC ION × 10	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0B8RVL1_PIG
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1174； UniProt 1–1174 作者链 N； PDB构建体 1–1174； UniProt 1–1174

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

物种未注明

UniProt A0A481DF93

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	DNA-directed RNA polymerase subunit × 2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 2 （A0A0B8RVL1） RNA polymerase II subunit D × 2 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 2 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 2 （F1SKN8） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 2 （I3LJZ9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 2 （A0A4X1ULF2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 2 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 2 （A0A7K6NXI9） RNA_pol_L_2 domain-containing protein × 2 （A0A4X1UK25） RNA polymerase II subunit K × 2 （I3LN51） ZINC ION × 10	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A481DF93_PIG
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–275； UniProt 46–320 作者链 O； PDB构建体 1–275； UniProt 46–320

RNA polymerase II subunit D

物种未注明

UniProt A0A287ADR4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	DNA-directed RNA polymerase subunit × 2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 2 （A0A0B8RVL1） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 2 （A0A481DF93） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 2 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 2 （F1SKN8） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 2 （I3LJZ9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 2 （A0A4X1ULF2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 2 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 2 （A0A7K6NXI9） RNA_pol_L_2 domain-containing protein × 2 （A0A4X1UK25） RNA polymerase II subunit K × 2 （I3LN51） ZINC ION × 10	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A287ADR4_PIG
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–142； UniProt 43–184 作者链 P； PDB构建体 1–142； UniProt 43–184

DNA-directed RNA polymerase II subunit E

物种未注明

UniProt I3LSI7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	DNA-directed RNA polymerase subunit × 2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 2 （A0A0B8RVL1） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 2 （A0A481DF93） RNA polymerase II subunit D × 2 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 2 （F1SKN8） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 2 （I3LJZ9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 2 （A0A4X1ULF2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 2 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 2 （A0A7K6NXI9） RNA_pol_L_2 domain-containing protein × 2 （A0A4X1UK25） RNA polymerase II subunit K × 2 （I3LN51） ZINC ION × 10	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I3LSI7_PIG
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210 作者链 Q； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210

DNA-directed RNA polymerase II subunit F

物种未注明

UniProt F1SKN8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	DNA-directed RNA polymerase subunit × 2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 2 （A0A0B8RVL1） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 2 （A0A481DF93） RNA polymerase II subunit D × 2 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 2 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 2 （I3LJZ9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 2 （A0A4X1ULF2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 2 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 2 （A0A7K6NXI9） RNA_pol_L_2 domain-containing protein × 2 （A0A4X1UK25） RNA polymerase II subunit K × 2 （I3LN51） ZINC ION × 10	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	F1SKN8_PIG
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127 作者链 R； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

物种未注明

UniProt I3LJZ9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	DNA-directed RNA polymerase subunit × 2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 2 （A0A0B8RVL1） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 2 （A0A481DF93） RNA polymerase II subunit D × 2 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 2 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 2 （F1SKN8） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 2 （A0A4X1ULF2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 2 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 2 （A0A7K6NXI9） RNA_pol_L_2 domain-containing protein × 2 （A0A4X1UK25） RNA polymerase II subunit K × 2 （I3LN51） ZINC ION × 10	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I3LJZ9_PIG
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172 作者链 S； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

物种未注明

UniProt A0A4X1ULF2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	DNA-directed RNA polymerase subunit × 2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 2 （A0A0B8RVL1） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 2 （A0A481DF93） RNA polymerase II subunit D × 2 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 2 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 2 （F1SKN8） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 2 （I3LJZ9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 2 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 2 （A0A7K6NXI9） RNA_pol_L_2 domain-containing protein × 2 （A0A4X1UK25） RNA polymerase II subunit K × 2 （I3LN51） ZINC ION × 10	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A4X1ULF2_PIG
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150 作者链 T； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

物种未注明

UniProt P60899

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	DNA-directed RNA polymerase subunit × 2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 2 （A0A0B8RVL1） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 2 （A0A481DF93） RNA polymerase II subunit D × 2 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 2 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 2 （F1SKN8） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 2 （I3LJZ9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 2 （A0A4X1ULF2） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 2 （A0A7K6NXI9） RNA_pol_L_2 domain-containing protein × 2 （A0A4X1UK25） RNA polymerase II subunit K × 2 （I3LN51） ZINC ION × 10	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB9_PIG
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125 作者链 U； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

物种未注明

UniProt A0A7K6NXI9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	DNA-directed RNA polymerase subunit × 2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 2 （A0A0B8RVL1） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 2 （A0A481DF93） RNA polymerase II subunit D × 2 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 2 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 2 （F1SKN8） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 2 （I3LJZ9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 2 （A0A4X1ULF2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 2 （P60899） RNA_pol_L_2 domain-containing protein × 2 （A0A4X1UK25） RNA polymerase II subunit K × 2 （I3LN51） ZINC ION × 10	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A7K6NXI9_PEDTO
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67 作者链 V； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67

RNA_pol_L_2 domain-containing protein

物种未注明

UniProt A0A4X1UK25

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	DNA-directed RNA polymerase subunit × 2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 2 （A0A0B8RVL1） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 2 （A0A481DF93） RNA polymerase II subunit D × 2 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 2 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 2 （F1SKN8） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 2 （I3LJZ9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 2 （A0A4X1ULF2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 2 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 2 （A0A7K6NXI9） RNA polymerase II subunit K × 2 （I3LN51） ZINC ION × 10	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A4X1UK25_PIG
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117 作者链 W； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

RNA polymerase II subunit K

物种未注明

UniProt I3LN51

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 24	DNA-directed RNA polymerase subunit × 2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 2 （A0A0B8RVL1） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 2 （A0A481DF93） RNA polymerase II subunit D × 2 （A0A287ADR4） DNA-directed RNA polymerase II subunit E × 2 （I3LSI7） DNA-directed RNA polymerase II subunit F × 2 （F1SKN8） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 2 （I3LJZ9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 2 （A0A4X1ULF2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 2 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 2 （A0A7K6NXI9） RNA_pol_L_2 domain-containing protein × 2 （A0A4X1UK25） ZINC ION × 10	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	I3LN51_PIG
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–58； UniProt 1–58 作者链 X； PDB构建体 1–58； UniProt 1–58

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7ozp
沉积日期 deposition_date	2021-06-28
结构标题 title	RNA Polymerase II dimer (Class 3)
关键词 keywords	Polymerase, Dimer, Complex, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7ozp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7ozp__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7ozp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	72.97 Å
Rg（电子密度）	72.56 Å
总 Rg	72.55 Å
原子数	54330
残基数	6774
排除体积	969180 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7ozp__assembly_1__model_1`	24-meric （24）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit
分子量 formula_weight	217450.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,M
原子数 atom_count	54330

MHGGGPPSGDSACPLRTIKRVQFGVLSPDELKRMSVTEGGIKYPETTEGGRPKLGGLMDPRQGVIERTGRCQTCAGNMTECPGHFGHIELAKPVFHVGFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVDSNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKGKNICEGGEEMDNKFGVEQPEGDEDLTKEKGHGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEPRYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAAHVIAEDVKLLQFHVATMVDNELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRVRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNIDRLQELVRRGNSQYPGAKYIIRDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWSTFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQDTLTAVRKFTKRDVFLERGEVMNLLMFLSTWDGKVPQPAILKPRPLWTGKQIFSLIIPGHINCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMGILCKKSLGTSAGSLVHISYLEMGHDITRLFYSNIQTVINNWLLIEGHTIGIGDSIADSKTYQDIQNTIKKAKQDVIEVIEKAHNNELEPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARDKTGSSAQKSLSEYNNFKSMVVSGAKGSKINISQVIAVVGQQNVEGKRIPFGFKHRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAGLTPTEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDATVRNSINQVVQLRYGEDGLAGESVEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQEDLVKDVLSNAHIQNELEREFERMREDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHINPRLPSDLHPIKVVEGVKELSKKLVIVNGDDPLSRQAQENATLLFNIHLRSTLCSRRMAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAIAHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLKELINISKKPKTPSLTVFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMPDFDVARISPWLLRVELDRKHMTDRKLTMEQIAEKINAGFGDDLNCIFNDDNAEKLVLRIRIMNSDENKMQEEEEVVDKMDDDVFLRCIESNMLTDMTLQGIEQISKVYMHLPQTDNKKKIIITEDGEFKALQEWILETDGVSLMRVLSEKDVDPVRTTSNDIVEIFTVLGIEAVRKALERELYHVISFDGSYVNYRHLALLCDTMTCRGHLMAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLMEAAAHGESDPMKGVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSAPSPMGGISPAMTPWNQGATPAYGAWSPSVGSGMTPGAAGFSPSAASDASGFSPGYSPAWSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAYEPRSPGGYTPQSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPTSPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit beta
分子量 formula_weight	134041.4 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,N

MYDADEDMQYDEDDDEITPDLWQEACWIVISSYFDEKGLVRQQLDSFDEFIQMSVQRIVEDAPPIDLQAEAQHASGEVEEPPRYLLKFEQIYLSKPTHWERDGAPSPMMPNEARLRNLTYSAPLYVDITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLNGLTDRDLCELNECPLDPGGYFIINGSEKVLIAQEKMATNTVYVFAKKDSKYAYTGECRSCLENSSRPTSTIWVSMLARGGQGAKKSAIGQRIVATLPYIKQEVPIIIVFRALGFVSDRDILEHIIYDFEDPEMMEMVKPSLDEAFVIQEQNVALNFIGSRGAKPGVTKEKRIKYAKEVLQKEMLPHVGVSDFCETKKAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAFLFRGMFKNLLKEVRIYAQKFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGLKYSLATGNWGDQKKAHQARAGVSQVLNRLTFASTLSHLRRLNSPIGRDGKLAKPRQLHNTLWGMVCPAETPEGHAVGLVKNLALMAYISVGSQPSPILEFLEEWSMENLEEISPAAIADATKIFVNGCWVGIHKDPEQLMNTLRKLRRQMDIIVSEVSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVEKQKLLLKKRHIDQLKEREYNNYSWQDLVASGVVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAYCSTYTHCEIHPSMILGVCASIIPFPDHNQSPRNTYQSAMGKQAMGVYITNFHVRMDTLAHVLYYPQKPLVTTRSMEYLRFRELPAGINSIVAIASYTGYNQEDSVIMNRSAVDRGFFRSVFYRSYKEQESKKGFDQEEVFEKPTRETCQGMRHAIYDKLDDDGLIAPGVRVSGDDVIIGKTVTLPENEDELEGTNRRYTKRDCSTFLRTSETGIVDQVMVTLNQEGYKFCKIRVRSVRIPQIGDKFASRHGQKGTCGIQYRQEDMPFTCEGITPDIIINPHAIPSRMTIGHLIECLQGKVSANKGEIGDATPFNDAVNVQKISNLLSDYGYHLRGNEVLYNGFTGRKITSQIFIGPTYYQRLKHMVDDKIHSRARGPIQILNRQPMEGRSRDGGLRFGEMERDCQIAHGAAQFLRERLFEASDPYQVHVCNLCGIMAIANTRTHTYECRGCRNKTQISLVRMPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3
分子量 formula_weight	31439.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,O

MPYANQPTVRITELTDENVKFIIENTDLAVANSIRRVFIAEVPIIAIDWVQIDANSSVLHDEFIAHRLGLIPLTSDDIVDKLQYSRDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPSDYVEQDDILIVKLRKGQELRLRAYAKKGFGKEHAKWNPTAGVAFEYDPDNALRHTVYPKPEEWPKSEYSELDEDESQAPYDPNGKPERFYYNVESCGSLRPETIVLSALSGLKKKLSDLQTQLSHEIQSDVLTIN

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	RNA polymerase II subunit D
分子量 formula_weight	16331.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,P

MAAGGSDPRAGDVEEDASQLIFPKEFETAETLLNSEVHMLLEHRKQQNESAEDEQELSEVFMKTLNYTARFSRFKNRETIASVRSLLLQKKLHKFELACLANLCPETAEESKALIPSLEGRFEDEELQQILDDIQTKRSFQY

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit E
分子量 formula_weight	24644.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,Q

MDDEEETYRLWKIRKTIMQLCHDRGYLVTQDELDQTLEEFKAQFGDKPSEGRPRRTDLTVLVAHNDDPTDQMFVFFPEEPKVGIKTIKVYCQRMQEENITRALIVVQQGMTPSAKQSLVDMAPKYILEQFLQQELLINITEHELVPEHVVMTKEEVTELLARYKLRENQLPRIQAGDPVARYFGIKRGQVVKIIRPSETAGRYITYRLVQ

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit F
分子量 formula_weight	14477.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,R

MSDNEDNFDGDDFDDVEEDEGLDDLENAEEEGQENVEILPSGERPQANQKRITTPYMTKYERARVLGTRALQIAMCAPVMVELEGETDPLLIAMKELKARKIPIIIRRYLPDGSYEDWGVDELIISD

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7
分子量 formula_weight	19314.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,S

MFYHISLEHEILLHPRYFGPNLLNTVKQKLFTEVEGTCTGKYGFVIAVTTIDNIGAGVIQPGRGFVLYPVKYKAIVFRPFKGEVVDAVVTQVNKVGLFTEIGPMSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTMDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIFAIGSLMDDYLGLVS

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
分子量 formula_weight	17162.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,T

MAGILFEDIFDVKDIDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDVNIQIYPVDLGDKFRLVIASTLYEDGTLDDGEYNPTDDRPSRADQFEYVMYGKVYRIEGDETSTEAATRLSAYVSYGGLLMRLQGDANNLHGFEVDSRVYLLMKKLAF

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
分子量 formula_weight	14541.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,U

MEPDGTYEPGFVGIRFCQECNNMLYPKEDKENRILLYACRNCDYQQEADNSCIYVNKITHEVDELTQIIADVSQDPTLPRTEDHPCQKCGHKEAVFFQSHSARAEDAMRLYYVCTAPHCGHRWTE

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
分子量 formula_weight	7655.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,V

MIIPVRCFTCGKIVGNKWEAYLGLLQAEYTEGDALDALGLKRYCCRRMLLAHVDLIEKLLNYAPLEK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	RNA_pol_L_2 domain-containing protein
分子量 formula_weight	13310.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,W

MNAPPAFESFLLFEGEKKITINKDTKVPNACLFTINKEDHTLGNIIKSQLLKDPQVLFAGYKVPHPLEHKIIIRVQTTPDYSPQEAFTNAITDLISELSLLEERFRVAIKDKQEGIE

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	RNA polymerase II subunit K
分子量 formula_weight	7018.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,X

MDTQKDVQPPKQQPMIYICGECHTENEIKSRDPIRCRECGYRIMYKKRTKRLVVFDAR

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	7ozpB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1110 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase Rpb2, domain 2

结构域编号 domain_id	7ozpN01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1110 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase Rpb2, domain 2

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	41379

RNA Polymerase II dimer (Class 3)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase II subunit D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA_pol_L_2 domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体