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7pmk

S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 275.0 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA replication licensing factor MCM2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q1S9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 2； UniProt 1–868 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–868（868 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 2 1–868（868 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 2 1–868（868 aa）
链 a 1–868（868 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 2 1–868（868 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–868（868 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–868（868 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 2 1–868（868 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5Q1S9_YEASX
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 2； PDB构建体 1–868； UniProt 1–868

DNA replication licensing factor MCM3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P24279

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 3； UniProt 1–971 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
3JA8 Cryo-EM structure of the MCM2-7 double hexamer 提交 2015-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.70 Å
3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.70 Å R-free 0.331
3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.80 Å
5BK4 Cryo-EM structure of Mcm2-7 double hexamer on dsDNA 提交 2017-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 B 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å R-free 0.391
5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å R-free 0.394
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5XF8 Cryo-EM structure of the Cdt1-MCM2-7 complex in AMPPNP state 提交 2017-04-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
6EYC Re-refinement of the MCM2-7 double hexamer using ISOLDE 提交 2017-11-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；All details as per 3ja8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6F0L S. cerevisiae MCM double hexamer bound to duplex DNA 提交 2017-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 B 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.77 Å
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 j 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 G 1–971（971 aa）
链 i 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6RQC Cryo-EM structure of an MCM loading intermediate 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
6SKO Cryo-EM Structure of the Fork Protection Complex Bound to CMG at a Replication Fork - conformation 2 MCM CTD:ssDNA 提交 2019-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 3 1–971（971 aa） 片段：Mcm5-CTD
突变：CBP-tag at N-terminus ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.40 Å
6U0M Structure of the S. cerevisiae replicative helicase CMG in complex with a forked DNA 提交 2019-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 3 17–738（722 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6WGC Atomic model of semi-attached mutant OCCM-DNA complex (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6WGF Atomic model of mutant Mcm2-7 hexamer with Mcm6 WHD truncation 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
7P30 3.0 A resolution structure of a DNA-loaded MCM double hexamer 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 B 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.00 Å
7P5Z Structure of a DNA-loaded MCM double hexamer engaged with the Dbf4-dependent kinase 提交 2021-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 B 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.30 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PT6 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ATPgS, state III 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 C 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.20 Å
7PT7 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ADP:BeF3, state I 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 C 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 12 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.80 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7V3U Cryo-EM structure of MCM double hexamer with structured Mcm4-NSD 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 C 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7V3V Cryo-EM structure of MCM double hexamer bound with DDK in State I 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 C 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 11 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7W8G Cryo-EM structure of MCM double hexamer 提交 2021-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 3 1–971（971 aa）
链 C 1–971（971 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.52 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 b 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8RIF Cryo-EM structure of the MCM double hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 B 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8RIG Cryo-EM structure of an MCM helicase single hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å
9GJP OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 2 提交 2024-08-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9GJW OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm2 提交 2024-08-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9GM5 OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 1 提交 2024-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9I3I Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication. 提交 2025-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 3 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 b 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9RHL Phospho-DH bound by Sld3-MBD on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 b 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9RHM Phospho-MCM double hexamer bound to Sld3-Sld7-Cdc45 on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 3 1–971（971 aa）
链 b 1–971（971 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 59 个其他 PDB 条目、59 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM3_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 3； PDB构建体 39–1009； UniProt 1–971

DNA replication licensing factor MCM4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P30665

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 4； UniProt 1–933 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
3JA8 Cryo-EM structure of the MCM2-7 double hexamer 提交 2015-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.70 Å
3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.70 Å R-free 0.331
3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.80 Å
5BK4 Cryo-EM structure of Mcm2-7 double hexamer on dsDNA 提交 2017-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 C 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å R-free 0.391
5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å R-free 0.394
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5XF8 Cryo-EM structure of the Cdt1-MCM2-7 complex in AMPPNP state 提交 2017-04-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
6EYC Re-refinement of the MCM2-7 double hexamer using ISOLDE 提交 2017-11-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；All details as per 3ja8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6F0L S. cerevisiae MCM double hexamer bound to duplex DNA 提交 2017-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 C 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.77 Å
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 k 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 H 1–933（933 aa）
链 j 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6RQC Cryo-EM structure of an MCM loading intermediate 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
6SKO Cryo-EM Structure of the Fork Protection Complex Bound to CMG at a Replication Fork - conformation 2 MCM CTD:ssDNA 提交 2019-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 4 1–933（933 aa） 片段：Mcm6-CTD
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.40 Å
6U0M Structure of the S. cerevisiae replicative helicase CMG in complex with a forked DNA 提交 2019-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 4 177–929（753 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6WGF Atomic model of mutant Mcm2-7 hexamer with Mcm6 WHD truncation 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
7P30 3.0 A resolution structure of a DNA-loaded MCM double hexamer 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 C 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.00 Å
7P5Z Structure of a DNA-loaded MCM double hexamer engaged with the Dbf4-dependent kinase 提交 2021-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 C 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.30 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PT6 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ATPgS, state III 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 D 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.20 Å
7PT7 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ADP:BeF3, state I 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 D 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 12 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.80 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7V3U Cryo-EM structure of MCM double hexamer with structured Mcm4-NSD 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 D 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7V3V Cryo-EM structure of MCM double hexamer bound with DDK in State I 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 D 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 11 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7W8G Cryo-EM structure of MCM double hexamer 提交 2021-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 4 1–933（933 aa）
链 D 1–933（933 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.52 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 c 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8RIF Cryo-EM structure of the MCM double hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 C 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8RIG Cryo-EM structure of an MCM helicase single hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å
9GJP OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 2 提交 2024-08-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9GJW OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm2 提交 2024-08-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9GM5 OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 1 提交 2024-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9I3I Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication. 提交 2025-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 4 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 c 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9RHL Phospho-DH bound by Sld3-MBD on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 c 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9RHM Phospho-MCM double hexamer bound to Sld3-Sld7-Cdc45 on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 4 1–933（933 aa）
链 c 1–933（933 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 58 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM4_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 4； PDB构建体 1–933； UniProt 1–933

DNA helicase

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5PUY8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 5； UniProt 1–775 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 5 1–775（775 aa）
链 d 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9BCX Cryo-EM structure of the S. cerevisiae ORC-Cdc6-Mcm2-7-DNA complex with a fully closed Mcm2-Mcm5 DNA entry gate 提交 2024-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 5 1–775（775 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5PUY8_YEASX
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 5； PDB构建体 1–775； UniProt 1–775

DNA replication licensing factor MCM6

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P53091

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 6； UniProt 1–1017 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
3JA8 Cryo-EM structure of the MCM2-7 double hexamer 提交 2015-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.70 Å
3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.70 Å R-free 0.331
3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.80 Å
5BK4 Cryo-EM structure of Mcm2-7 double hexamer on dsDNA 提交 2017-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 E 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å R-free 0.391
5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å R-free 0.394
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
5XF8 Cryo-EM structure of the Cdt1-MCM2-7 complex in AMPPNP state 提交 2017-04-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
6EYC Re-refinement of the MCM2-7 double hexamer using ISOLDE 提交 2017-11-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；All details as per 3ja8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6F0L S. cerevisiae MCM double hexamer bound to duplex DNA 提交 2017-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 E 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.77 Å
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 m 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 J 1–1017（1017 aa）
链 l 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6RQC Cryo-EM structure of an MCM loading intermediate 提交 2019-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
6SKO Cryo-EM Structure of the Fork Protection Complex Bound to CMG at a Replication Fork - conformation 2 MCM CTD:ssDNA 提交 2019-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.40 Å
6WGF Atomic model of mutant Mcm2-7 hexamer with Mcm6 WHD truncation 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
7P30 3.0 A resolution structure of a DNA-loaded MCM double hexamer 提交 2021-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 E 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.00 Å
7P5Z Structure of a DNA-loaded MCM double hexamer engaged with the Dbf4-dependent kinase 提交 2021-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 E 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 seconds before plunging
分辨率 3.30 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7PT6 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ATPgS, state III 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 F 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 12 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.20 Å
7PT7 Structure of MCM2-7 DH complexed with Cdc7-Dbf4 in the presence of ADP:BeF3, state I 提交 2021-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 F 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ZN ZINC ION × 12 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 1.5 seconds and blot force +2
分辨率 3.80 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7V3U Cryo-EM structure of MCM double hexamer with structured Mcm4-NSD 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 F 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7V3V Cryo-EM structure of MCM double hexamer bound with DDK in State I 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 F 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 11 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 11 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7W8G Cryo-EM structure of MCM double hexamer 提交 2021-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 F 1–1017（1017 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 12 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.52 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 e 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8RIF Cryo-EM structure of the MCM double hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 E 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8RIG Cryo-EM structure of an MCM helicase single hexamer loaded onto dsDNA. 提交 2023-12-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9BCX Cryo-EM structure of the S. cerevisiae ORC-Cdc6-Mcm2-7-DNA complex with a fully closed Mcm2-Mcm5 DNA entry gate 提交 2024-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å
9GJP OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 2 提交 2024-08-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9GJW OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm2 提交 2024-08-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9GM5 OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 1 提交 2024-08-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9I3I Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication. 提交 2025-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.
分辨率 4.40 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 e 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9RHL Phospho-DH bound by Sld3-MBD on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 e 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9RHM Phospho-MCM double hexamer bound to Sld3-Sld7-Cdc45 on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 6 1–1017（1017 aa）
链 e 1–1017（1017 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 58 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM6_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 6； PDB构建体 1–1017； UniProt 1–1017

DNA replication licensing factor MCM7

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q4N0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 7； UniProt 1–845 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 7 1–845（845 aa）
链 f 1–845（845 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5Q4N0_YEASX
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 7； PDB构建体 1–845； UniProt 1–845

DNA replication complex GINS protein PSF1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q203

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 1–208 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–208（208 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–208（208 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 H 1–208（208 aa）
链 O 1–208（208 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5Q203_YEASX
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–208； UniProt 1–208

DNA replication complex GINS protein PSF2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5PX40

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 B； UniProt 1–213 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–213（213 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 I 1–213（213 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 I 1–213（213 aa）
链 P 1–213（213 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5PX40_YEASX
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–213； UniProt 1–213

DNA replication complex GINS protein PSF3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6L1BWJ4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 23–216 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 C 23–216（194 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6L1BWJ4_YEASX
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–194； UniProt 23–216

DNA replication complex GINS protein SLD5

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q03406

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 D； UniProt 1–294 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.70 Å
3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.70 Å R-free 0.331
3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.80 Å
4C95 Crystal structure of the carboxy-terminal domain of yeast Ctf4 bound to Sld5 提交 2013-10-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–19（19 aa） 片段：CTF4-BINDING MOTIF, RESIDUES 1-19
链 E 1–19（19 aa） 片段：CTF4-BINDING MOTIF, RESIDUES 1-19
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2 M TRI-SODIUM CITRATE PH 6.2, 7-9% PEG 8000
分辨率 2.69 Å R-free 0.214
5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å R-free 0.391
5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å R-free 0.394
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–294（294 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 D 1–294（294 aa）
链 d 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 D 1–294（294 aa）
链 d 1–294（294 aa）
链 q 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 D 1–294（294 aa） 片段：Ctf4
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
6U0M Structure of the S. cerevisiae replicative helicase CMG in complex with a forked DNA 提交 2019-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 3–293（291 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 D 1–294（294 aa）
链 K 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 F 1–294（294 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 F 1–294（294 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–294（294 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 D 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 D 1–294（294 aa）
链 K 1–294（294 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 33 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SLD5_YEAST
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–294； UniProt 1–294

Cell division control protein 45,Cell division control protein 45

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q08032

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 E； UniProt 1–197 链 E； UniProt 203–650 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 E 1–197（197 aa）
链 E 204–650（447 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
3JC5 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 c 1–650（650 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.70 Å
3JC6 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.70 Å R-free 0.331
3JC7 Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase and pumpjack motion 提交 2015-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric
链 c 1–650（650 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA；pH 7.5；20 mM Tris acetate, pH 7.5, 40 mM potassium glutamate, 2 mM DTT, 0.1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 4.80 Å
5U8S Structure of eukaryotic CMG helicase at a replication fork 提交 2016-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å R-free 0.391
5U8T Structure of Eukaryotic CMG Helicase at a Replication Fork and Implications 提交 2016-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å R-free 0.394
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–650（650 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
6PTJ Structure of Ctf4 trimer in complex with one CMG helicase 提交 2019-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 c 1–650（650 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6PTN Structure of Ctf4 trimer in complex with two CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 H 1–650（650 aa）
链 h 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6PTO Structure of Ctf4 trimer in complex with three CMG helicases 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 E 1–650（650 aa）
链 e 1–650（650 aa）
链 r 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–650（650 aa） 片段：Mcm4
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
6U0M Structure of the S. cerevisiae replicative helicase CMG in complex with a forked DNA 提交 2019-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 E 5–650（646 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 E 1–197（197 aa）
链 E 203–650（448 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 E 1–198（198 aa）
链 E 203–650（448 aa）
链 L 1–198（198 aa）
链 L 203–650（448 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 G 1–198（198 aa）
链 G 203–650（448 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 G 1–198（198 aa）
链 G 203–650（448 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 G 1–198（198 aa）
链 G 203–650（448 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8J09 Crystal structure of the Sld3 Cdc45-binding-domain, in complex with Cdc45 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–650（650 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2M sodium acetate, 0.1M Bis-Tris propane (pH6.5: pH8.5 = 3:7), 20%(w/v) PEG33500
分辨率 2.61 Å R-free 0.262
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 E 1–650（650 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 E 1–197（197 aa）
链 E 204–650（447 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 E 1–197（197 aa）
链 E 204–650（447 aa）
链 L 1–197（197 aa）
链 L 204–650（447 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9RHM Phospho-MCM double hexamer bound to Sld3-Sld7-Cdc45 on ARS1 DNA 提交 2025-06-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 E 1–197（197 aa）
链 E 204–650（447 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 34 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDC45_YEAST
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–197； UniProt 1–197 作者链 E； PDB构建体 210–657； UniProt 203–650

DNA polymerase alpha-binding protein

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q5Y5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 F； UniProt 1–927 链 G； UniProt 1–927 链 H； UniProt 1–927 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5Q5Y5_YEASX
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 36–962； UniProt 1–927 作者链 G； PDB构建体 36–962； UniProt 1–927 作者链 H； PDB构建体 36–962； UniProt 1–927

E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q435

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 K； UniProt 1–194 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8GRE F-box protein in complex with skp1(FL) and substrate 提交 2022-09-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–194（194 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；200 mM Na acetate, 100 mM Na citrate pH 5.5, 10% (w/v) PEG 4000
分辨率 2.30 Å R-free 0.232
8GRF Crystal structure of F-box protein in the ternary complex with adaptor protein Skp1(DL) and its substrate 提交 2022-09-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–194（194 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；70 mM Na citrate pH 5.5, 10.5% (w/v) PEG 6000
分辨率 2.53 Å R-free 0.248

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5Q435_YEASX
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–194； UniProt 1–194

Protein DIA2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q08496

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 L； UniProt 1–732 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 L 1–732（732 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DIA2_YEAST
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 4–735； UniProt 1–732

DNA polymerase epsilon catalytic subunit A

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P21951

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 Q； UniProt 1–2222 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 G 1–2222（2222 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
4M8O TERNARY COMPLEX OF DNA POLYMERASE EPSILON WITH AN INCOMING dATP 提交 2013-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1228（1228 aa） 片段：POL2 domain, UNP residues 1-1228
突变：D290A,E292A DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 TAU 2-AMINOETHANESULFONIC ACID × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% PEG-3350, 50 mM Hepes-NaOH pH 7.0, 10 mM MgCl2, 400 mM LiAc, and 10 mM 2-aminoethanesulfonic acid (taurine) , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.20 Å R-free 0.237
4PTF Ternary crystal structure of yeast DNA polymerase epsilon with template G 提交 2014-03-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1187（1187 aa） 片段：catalytic domain (UNP residues 1-1187)
未记录 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；12% PEG5000 MME, 25 mM magnesium acetate, 1% DMSO, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.81 Å R-free 0.247
5OKI Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC in complex with a 63 kDa fragment of DNA Polymerase epsilon 提交 2017-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–524（524 aa）
突变：D290A. E292A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 10000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium chloride
分辨率 4.50 Å R-free 0.312
5OKI Crystal structure of the Ctf18-1-8 module from Ctf18-RFC in complex with a 63 kDa fragment of DNA Polymerase epsilon 提交 2017-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–524（524 aa）
突变：D290A. E292A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 10000, 0.1 M MES pH 6.5, 0.2 M ammonium chloride
分辨率 4.50 Å R-free 0.312
6FWK The crystal structure of Pol2CORE-M644G in complex with DNA and an incoming nucleotide 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa）
突变：M644G DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；50mM MES, 150mM NaAc and 8% PEG20K
分辨率 2.50 Å R-free 0.263
6FWK The crystal structure of Pol2CORE-M644G in complex with DNA and an incoming nucleotide 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1186（1186 aa）
突变：M644G DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 FE FE (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；50mM MES, 150mM NaAc and 8% PEG20K
分辨率 2.50 Å R-free 0.263
6G0A The crystal structure of the Pol2 catalytic domain of DNA polymerase epsilon carrying a P301R substitution. 提交 2018-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa）
突变：P301R DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES pH 6.5, 150mM NaAc and 8% PEG20K
分辨率 2.62 Å R-free 0.265
6H1V The crystal structure of Pol2CORE in complex with DNA and an incoming nucleotide, carrying an Fe-S cluster 提交 2018-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1187（1187 aa）
突变：D290A and E292A SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% PEG-3350, 50 mM Hepes-NaOH pH 7.0, 10 mM MgCl2, 400 mM LiAc, and 10 mM 2-aminoethanesulfonic acid (taurine)
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；20% PEG-3350, 50 mM Hepes-NaOH pH 7.0, 10 mM MgCl2, 400 mM LiAc, and 10 mM 2-aminoethanesulfonic acid (taurine)
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
6HV8 Cryo-EM structure of S. cerevisiae Polymerase epsilon deltacat mutant 提交 2018-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1308–2221（914 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6I8A The crystal structure of the Pol2 catalytic domain of DNA polymerase epsilon carrying a P301R substitution. 提交 2018-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1185（1185 aa）
突变：P301R DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES pH 6.5, 150mM NaAc, 8%PEG20K
分辨率 2.65 Å R-free 0.279
6I8A The crystal structure of the Pol2 catalytic domain of DNA polymerase epsilon carrying a P301R substitution. 提交 2018-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1185（1185 aa）
突变：P301R DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 FE FE (III) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES pH 6.5, 150mM NaAc, 8%PEG20K
分辨率 2.65 Å R-free 0.279
6QIB The crystal structure of Pol2CORE in complex with DNA and an incoming nucleotide, carrying an Fe-S cluster 提交 2019-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1187（1187 aa）
突变：D290A, E292A SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；10mM Tris HCl pH8, 10mM CaCl2, 15% PEG8000
分辨率 2.80 Å R-free 0.286
6S1C P3221 crystal form of the Ctf18-1-8/Pol2(1-528) complex 提交 2019-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–524（524 aa）
突变：D290A, E292A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 14% PEG 20000, 0.1 M HEPES pH 7.0
分辨率 6.10 Å R-free 0.333
6S1C P3221 crystal form of the Ctf18-1-8/Pol2(1-528) complex 提交 2019-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–524（524 aa）
突变：D290A, E292A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M NaCl, 14% PEG 20000, 0.1 M HEPES pH 7.0
分辨率 6.10 Å R-free 0.333
6S2E Cryo-EM structure of Ctf18-1-8 in complex with the catalytic domain of DNA polymerase epsilon 提交 2019-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1186（1186 aa）
突变：D290A, E292A SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6S2F Cryo-EM structure of Ctf18-1-8 in complex with the catalytic domain of DNA polymerase epsilon (Class 2) 提交 2019-06-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1192（1192 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6WJV Structure of the Saccharomyces cerevisiae polymerase epsilon holoenzyme 提交 2020-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–2222（2222 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 Q 1–2222（2222 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 G 1–2222（2222 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7R3X The crystal structure of the L439V variant of Pol2CORE in complex with DNA and an incoming nucleotide 提交 2022-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1185（1185 aa）
突变：L439V DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；8 % PEG 20K , 150 mM NaAc, 0-1,5% Glycerol, 50 mM MES pH6.5
分辨率 2.46 Å R-free 0.256
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 N 1–2222（2222 aa）
链 Q 1–2222（2222 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8B67 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing CTP in the polymerase active site 提交 2022-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G CA CALCIUM ION × 3 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.60 Å R-free 0.276
8B6K The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing dCTP in the polymerase active site 提交 2022-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G, D290A, E292A CA CALCIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.50 Å R-free 0.260
8B6K The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing dCTP in the polymerase active site 提交 2022-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G, D290A, E292A CA CALCIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.50 Å R-free 0.260
8B76 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing dTTP in the polymerase active site 提交 2022-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G CA CALCIUM ION × 3 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.60 Å R-free 0.247
8B76 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing dTTP in the polymerase active site 提交 2022-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G CA CALCIUM ION × 3 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.60 Å R-free 0.247
8B77 The crystal structure of N828V variant of DNA Pol Epsilon containing dATP in the polymerase active site 提交 2022-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa）
突变：N828V DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.70 Å R-free 0.273
8B79 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing UTP in the polymerase active site 提交 2022-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES, PEG20K,2.5% glycerol, 150mM Sodium Actetate
分辨率 2.65 Å R-free 0.248
8B79 The crystal structure of M644G variant of DNA Pol Epsilon containing UTP in the polymerase active site 提交 2022-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：M644G UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 3 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；292 K；50mM MES, PEG20K,2.5% glycerol, 150mM Sodium Actetate
分辨率 2.65 Å R-free 0.248
8B7E The crystal structure of N828V variant of DNA Pol Epsilon containing UTP in the polymerase active site 提交 2022-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：N828V UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.60 Å R-free 0.230
8B7E The crystal structure of N828V variant of DNA Pol Epsilon containing UTP in the polymerase active site 提交 2022-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–1186（1186 aa） 片段：Catalytic subunit of DNA Pol Epsilon
突变：N828V UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；10mM Tris, 15% PEG8K,10mM CaCl2
分辨率 2.60 Å R-free 0.230
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 M 1–2222（2222 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 M 1–2222（2222 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 M 1–2222（2222 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 G 1–2222（2222 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 G 1–2222（2222 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 G 1–2222（2222 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8TW9 Cryo-EM structure of S. cerevisiae PolE-Ctf18-8-1-DNA 提交 2023-08-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 E 1–2222（2222 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8TWA Cryo-EM structure of S. cerevisiae Ctf18-RFC-PCNA-PolE-DNA complex 提交 2023-08-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 E 1–2222（2222 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 8 1–2222（2222 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å

共 33 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DPOE_YEAST
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 Q； PDB构建体 1–2222； UniProt 1–2222

DNA polymerase epsilon subunit B

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P24482

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 R； UniProt 1–689 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
28VY sCMGE assembled on ARS1 DNA with Sld2 and RPA 提交 2026-02-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 F 1–689（689 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
6HV8 Cryo-EM structure of S. cerevisiae Polymerase epsilon deltacat mutant 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6HV9 S. cerevisiae CMG-Pol epsilon-DNA 提交 2018-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–689（689 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.98 Å
6WJV Structure of the Saccharomyces cerevisiae polymerase epsilon holoenzyme 提交 2020-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 2 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 R 1–689（689 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
7QHS S. cerevisiae CMGE nucleating origin DNA melting 提交 2021-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–689（689 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7Z13 S. cerevisiae CMGE dimer nucleating origin DNA melting 提交 2022-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 F 1–689（689 aa）
链 M 1–689（689 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 N 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8KG8 Yeast replisome in state II 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 N 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.23 Å
8KG9 Yeast replisome in state III 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 N 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.52 Å
8P5E S. cerevisiae nexus-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 F 1–689（689 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P62 S. cerevisiae ssDNA-sCMGE after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 F 1–689（689 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P63 S. cerevisiae consensus-sCMGE on ssDNA after DNA replication initiation 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：14-meric
链 F 1–689（689 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8W7M Yeast replisome in state V 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 N 1–689（689 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 4.12 Å
8W7S Yeast replisome in state IV 提交 2023-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：hexadecameric
链 N 1–689（689 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 7.39 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 9 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9RHI pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (monomer) 提交 2025-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 F 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RHJ Pre-Initiation Complex on ARS1 DNA (dimer) 提交 2025-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 F 1–689（689 aa）
链 M 1–689（689 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DPB2_YEAST
Isoform —
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 R； PDB构建体 1–689； UniProt 1–689

Topoisomerase 1-associated factor 1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P53840

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 X； UniProt 1–1238 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Chromosome segregation in meiosis protein 3 × 1 （Q04659） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 X 1–1238（1238 aa） 片段：Mcm2
未记录 ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 X 1–1238（1238 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 X 1–1238（1238 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 X 1–1238（1238 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 X 1–1238（1238 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 K 1–1238（1238 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 I 1–1238（1238 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 X 1–1238（1238 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 X 1–1238（1238 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å
9E2Y Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 3 提交 2024-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 X 354–396（43 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.20 Å

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TOF1_YEAST
Isoform —
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 X； PDB构建体 1–1238； UniProt 1–1238

Chromosome segregation in meiosis protein 3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q04659

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 20 DNA 2 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物数一致 链 Y； UniProt 1–317 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 （A0A6A5Q1S9） DNA replication licensing factor MCM3 × 1 （P24279） DNA replication licensing factor MCM4 × 1 （P30665） DNA helicase × 1 （A0A6A5PUY8） DNA replication licensing factor MCM6 × 1 （P53091） DNA replication licensing factor MCM7 × 1 （A0A6A5Q4N0） DNA replication complex GINS protein PSF1 × 1 （A0A6A5Q203） DNA replication complex GINS protein PSF2 × 1 （A0A6A5PX40） DNA replication complex GINS protein PSF3 × 1 （A0A6L1BWJ4） DNA replication complex GINS protein SLD5 × 1 （Q03406） Cell division control protein 45,Cell division control protein 45 × 1 （Q08032） DNA polymerase alpha-binding protein × 3 （A0A6A5Q5Y5） Leading strand template DNA × 1 Lagging strand template DNA × 1 E3 ubiquitin ligase complex SCF subunit × 1 （A0A6A5Q435） Protein DIA2 × 1 （Q08496） DNA polymerase epsilon catalytic subunit A × 1 （P21951） DNA polymerase epsilon subunit B × 1 （P24482） Topoisomerase 1-associated factor 1 × 1 （P53840） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Manual plunger 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PMK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6SKL Cryo-EM structure of the CMG Fork Protection Complex at a replication fork - Conformation 1 提交 2019-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 Y 1–317（317 aa） 片段：Mcm3
突变：CBP-tag at N-terminus ZN ZINC ION × 5 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Three microlitres of sample was applied on a grid and incubated for 15-30 s at 4 degC before manually blotting with filter paper for 10 s and plunge-freezing in liquid ethane.
分辨率 3.70 Å
7PMN S. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation II) 提交 2021-09-02 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 Y 1–317（317 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Manual plunger
分辨率 3.20 Å
8B9A S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha primase. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 Y 1–317（317 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9B S. cerevisiae replisome + Ctf4, bound by pol alpha. Complex engaged with a fork DNA substrate containing a 60 nucleotide lagging strand. 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 Y 1–317（317 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8B9C S. cerevisiae pol alpha - replisome complex 提交 2022-10-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 Y 1–317（317 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8KG6 Yeast replisome in state I 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 L 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot with filter paper for 3-4 seconds before plunging.
分辨率 3.07 Å
8XGC Structure of yeast replisome associated with FACT and histone hexamer, Composite map 提交 2023-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 J 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9E2W Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 1 提交 2024-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 Y 48–139（92 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.30 Å
9E2X Cryo-EM structure of yeast CMG helicase stalled at G4-containing DNA template, state 2 提交 2024-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 Y 48–139（92 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 30 seconds after sample application; blot time 30 seconds with blot force 0
分辨率 3.50 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CSM3_YEAST
Isoform —
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 Y； PDB构建体 3–319； UniProt 1–317

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7pmk

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7pmk
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7pmk
沉积日期 deposition_date2021-09-02
结构标题 titleS. cerevisiae replisome-SCF(Dia2) complex bound to double-stranded DNA (conformation I)
关键词 keywordsGenome stability, DNA replication, Ubiquitination, termination, replisome, cryo-EM, CMG, SCF(Dia2), REPLICATION; REPLICATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier74.76 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron75.00 Å
零角强度 I(0) i015399100000.00
分子量 molecular_weight1063000.0 kDa
排除体积 excluded_volume1333900 ų
包络体积 envelope_volume2043400 ų
水化壳体积 shell_volume220940 ų
包络直径 envelope_diameter250.0 Å
壳层 Rg shell_rg78.76 Å
包络 Rg envelope_rg73.45 Å
形状 Rg shape_rg75.04 Å
总 Rg total_rg74.91 Å
总原子数 total_atoms74697
残基数 n_residues9198
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax275.0 Å
Rg (实空间) rg_real78.60 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.56 Å
I(0) (实空间) i0_real1.5480e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.1810e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal75.06 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal15410000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8920
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary91.7 Å
偏度 Skewness skewness0.535
峰度 Kurtosis kurtosis0.159
角度范围 angular_range— – 0.1050 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.9775
最高正则化参数 α highest_alpha1559000000.0000
实空间数据点数 n_real_points22
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.771; Stabil: 0.861; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.974; Smooth: 0.757
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (23)

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8. 引用文献 (1)

▶

9. 文件与曲线 (10)