7wyi

Native Photosystem I of Chlamydomonas reinhardtii

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 191.1 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

物种未注明

UniProt P12154

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–751 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSAA_CHLRE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–751; UniProt 1–751

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

物种未注明

UniProt P09144

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–735 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 PSAB_CHLRE
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–735; UniProt 1–735

Photosystem I iron-sulfur center

物种未注明

UniProt Q00914

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–81 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 PSAC_CHLRE
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–81; UniProt 1–81

Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q39615

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 1–196 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 PSAD_CHLRE
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–196; UniProt 1–196

Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic

物种未注明

UniProt P12352

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 1–97 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 PSAE_CHLRE
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–97; UniProt 1–97

Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic

物种未注明

UniProt P12356

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 F; UniProt 1–227 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 PSAF_CHLRE
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–227; UniProt 1–227

Photosystem I reaction center subunit IX

物种未注明

UniProt P59777

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 1–41 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSAJ_CHLRE
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–41; UniProt 1–41

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q7DM26

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 1; UniProt 1–224 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q7DM26_CHLRE
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 1; PDB构建体 1–224; UniProt 1–224

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt A8JF10

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 3; UniProt 1–298 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A8JF10_CHLRE
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 3; PDB构建体 1–298; UniProt 1–298

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q84Y02

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 7; UniProt 1–241 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q84Y02_CHLRE
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 7; PDB构建体 1–241; UniProt 1–241

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q75VY7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 8; UniProt 1–243 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q75VY7_CHLRE
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 8; PDB构建体 1–243; UniProt 1–243

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q05093

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 Z; UniProt 1–228 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q05093_CHLRE
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 Z; PDB构建体 1–228; UniProt 1–228

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q75VZ0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 4; UniProt 1–264 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q75VZ0_CHLRE
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 4; PDB构建体 1–264; UniProt 1–264

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q75VY8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 5; UniProt 1–257 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY6) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q75VY8_CHLRE
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 5; PDB构建体 1–257; UniProt 1–257

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q75VY6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白拷贝数一致 链 6; UniProt 1–257 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q7DM26) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (A8JF10) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q84Y02) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY7) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q05093) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VZ0) Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 1 (Q75VY8) CL0 CHLOROPHYLL A ISOMER × 1 CLA CHLOROPHYLL A × 155 PQN PHYLLOQUINONE × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 CHL CHLOROPHYLL B × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;2.6 microliter of sample were applied to cryo-grids and blotted for 4 seconds using Whatman #1 before plunge freezing. 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q75VY6_CHLRE
Isoform
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 6; PDB构建体 1–257; UniProt 1–257

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7wyi

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7wyi
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7wyi
沉积日期 deposition_date2022-02-16
结构标题 titleNative Photosystem I of Chlamydomonas reinhardtii
关键词 keywordsmembrane supercomplex, light harvesting, electron transport, green algae, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier59.81
回转半径 Rg (电子) rg_electron59.18
零角强度 I(0) i01905190000.00
分子量 molecular_weight348030.0 kDa
排除体积 excluded_volume422390 ų
包络体积 envelope_volume889860 ų
水化壳体积 shell_volume124300 ų
包络直径 envelope_diameter187.7
壳层 Rg shell_rg62.13
包络 Rg envelope_rg57.29
形状 Rg shape_rg59.18
总 Rg total_rg59.28
总原子数 total_atoms25007
残基数 n_residues3631
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax191.1
Rg (实空间) rg_real59.61
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.47
I(0) (实空间) i0_real1.9050e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.9780e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal59.93
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1906000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8703
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary66.2
偏度 Skewness skewness0.184
峰度 Kurtosis kurtosis-0.639
角度范围 angular_range— – 0.1300 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha692200000.0000
实空间数据点数 n_real_points27
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.933; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.977; Smooth: 0.534

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (20)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)