← 返回搜索
7xti

RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58hex)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 201.6 Å Quality: GOOD
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit

物种未注明

UniProt C4R4Y0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 1–1743 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 M 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X50 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-2 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2 M sodium citrate, 8% PGA-LM and 1 % dextran sulfate sodium salt
分辨率 4.29 Å R-free 0.296
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 M 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5XOG RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt5 KOW5 and Elf1 提交 2017-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50 mM potassium malonate (pH 6.0), 150 mM Tris malonate (malonic acid titrated with Tris(hydroxymethyl) aminomethane, pH 6.0), 6.67% (v/v) glycerol, 6.67% (w/v) trehalose dihydrate and 10% PEG20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.225
5XON RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS 提交 2017-05-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8YFQ Cryo EM structure of Komagataella phaffii RNAPII-Rat1-Rai1 pre-termination complex 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.30 Å
8YFR Cryo EM structure of Komagataella phaffii Rat1-Rai1 complex bound within the RNAPII cleft 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.40 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.54 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 A 1–1743（1743 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 44 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R4Y0_KOMPG
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–1743； UniProt 1–1743

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

物种未注明

UniProt C4QZQ7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 B； UniProt 1–1227 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 N 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X50 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-2 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2 M sodium citrate, 8% PGA-LM and 1 % dextran sulfate sodium salt
分辨率 4.29 Å R-free 0.296
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 N 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5XOG RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt5 KOW5 and Elf1 提交 2017-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50 mM potassium malonate (pH 6.0), 150 mM Tris malonate (malonic acid titrated with Tris(hydroxymethyl) aminomethane, pH 6.0), 6.67% (v/v) glycerol, 6.67% (w/v) trehalose dihydrate and 10% PEG20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.225
5XON RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS 提交 2017-05-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8YFQ Cryo EM structure of Komagataella phaffii RNAPII-Rat1-Rai1 pre-termination complex 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.30 Å
8YFR Cryo EM structure of Komagataella phaffii Rat1-Rai1 complex bound within the RNAPII cleft 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.40 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.54 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 B 1–1227（1227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 44 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4QZQ7_KOMPG
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–1227； UniProt 1–1227

RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core

物种未注明

UniProt C4R7L2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 1–304 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 O 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X50 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-2 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2 M sodium citrate, 8% PGA-LM and 1 % dextran sulfate sodium salt
分辨率 4.29 Å R-free 0.296
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 O 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5XOG RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt5 KOW5 and Elf1 提交 2017-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50 mM potassium malonate (pH 6.0), 150 mM Tris malonate (malonic acid titrated with Tris(hydroxymethyl) aminomethane, pH 6.0), 6.67% (v/v) glycerol, 6.67% (w/v) trehalose dihydrate and 10% PEG20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.225
5XON RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS 提交 2017-05-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8YFQ Cryo EM structure of Komagataella phaffii RNAPII-Rat1-Rai1 pre-termination complex 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.30 Å
8YFR Cryo EM structure of Komagataella phaffii Rat1-Rai1 complex bound within the RNAPII cleft 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.40 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.54 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 C 1–304（304 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 44 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R7L2_KOMPG
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–304； UniProt 1–304

RNA polymerase II subunit B32

物种未注明

UniProt C4R2U9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 D； UniProt 1–186 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 P 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X50 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-2 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2 M sodium citrate, 8% PGA-LM and 1 % dextran sulfate sodium salt
分辨率 4.29 Å R-free 0.296
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 P 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5XOG RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt5 KOW5 and Elf1 提交 2017-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50 mM potassium malonate (pH 6.0), 150 mM Tris malonate (malonic acid titrated with Tris(hydroxymethyl) aminomethane, pH 6.0), 6.67% (v/v) glycerol, 6.67% (w/v) trehalose dihydrate and 10% PEG20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.225
5XON RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS 提交 2017-05-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8YFQ Cryo EM structure of Komagataella phaffii RNAPII-Rat1-Rai1 pre-termination complex 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.30 Å
8YFR Cryo EM structure of Komagataella phaffii Rat1-Rai1 complex bound within the RNAPII cleft 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.40 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.54 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 D 1–186（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 44 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R2U9_KOMPG
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–186； UniProt 1–186

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1

物种未注明

UniProt C4R3P8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 E； UniProt 1–214 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 Q 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X50 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-2 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2 M sodium citrate, 8% PGA-LM and 1 % dextran sulfate sodium salt
分辨率 4.29 Å R-free 0.296
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 Q 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5XOG RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt5 KOW5 and Elf1 提交 2017-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50 mM potassium malonate (pH 6.0), 150 mM Tris malonate (malonic acid titrated with Tris(hydroxymethyl) aminomethane, pH 6.0), 6.67% (v/v) glycerol, 6.67% (w/v) trehalose dihydrate and 10% PEG20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.225
5XON RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS 提交 2017-05-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8YFQ Cryo EM structure of Komagataella phaffii RNAPII-Rat1-Rai1 pre-termination complex 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.30 Å
8YFR Cryo EM structure of Komagataella phaffii Rat1-Rai1 complex bound within the RNAPII cleft 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.40 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.54 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 E 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 43 个其他 PDB 条目、45 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R3P8_KOMPG
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–214； UniProt 1–214

RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III

物种未注明

UniProt C4R1V1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 F； UniProt 1–155 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 R 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X50 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-2 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2 M sodium citrate, 8% PGA-LM and 1 % dextran sulfate sodium salt
分辨率 4.29 Å R-free 0.296
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 R 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5XOG RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt5 KOW5 and Elf1 提交 2017-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50 mM potassium malonate (pH 6.0), 150 mM Tris malonate (malonic acid titrated with Tris(hydroxymethyl) aminomethane, pH 6.0), 6.67% (v/v) glycerol, 6.67% (w/v) trehalose dihydrate and 10% PEG20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.225
5XON RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS 提交 2017-05-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8YFQ Cryo EM structure of Komagataella phaffii RNAPII-Rat1-Rai1 pre-termination complex 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.30 Å
8YFR Cryo EM structure of Komagataella phaffii Rat1-Rai1 complex bound within the RNAPII cleft 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.40 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.54 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 F 1–155（155 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 44 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R1V1_KOMPG
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155

RNA polymerase II subunit

物种未注明

UniProt C4R9A1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 G； UniProt 1–171 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 S 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X50 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-2 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2 M sodium citrate, 8% PGA-LM and 1 % dextran sulfate sodium salt
分辨率 4.29 Å R-free 0.296
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 S 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5XOG RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt5 KOW5 and Elf1 提交 2017-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50 mM potassium malonate (pH 6.0), 150 mM Tris malonate (malonic acid titrated with Tris(hydroxymethyl) aminomethane, pH 6.0), 6.67% (v/v) glycerol, 6.67% (w/v) trehalose dihydrate and 10% PEG20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.225
5XON RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS 提交 2017-05-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8YFQ Cryo EM structure of Komagataella phaffii RNAPII-Rat1-Rai1 pre-termination complex 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.30 Å
8YFR Cryo EM structure of Komagataella phaffii Rat1-Rai1 complex bound within the RNAPII cleft 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.40 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.54 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 G 1–171（171 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 44 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R9A1_KOMPG
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–171； UniProt 1–171

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

物种未注明

UniProt C4R273

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 H； UniProt 1–145 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 T 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X50 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-2 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2 M sodium citrate, 8% PGA-LM and 1 % dextran sulfate sodium salt
分辨率 4.29 Å R-free 0.296
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 T 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5XOG RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt5 KOW5 and Elf1 提交 2017-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50 mM potassium malonate (pH 6.0), 150 mM Tris malonate (malonic acid titrated with Tris(hydroxymethyl) aminomethane, pH 6.0), 6.67% (v/v) glycerol, 6.67% (w/v) trehalose dihydrate and 10% PEG20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.225
5XON RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS 提交 2017-05-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8YFQ Cryo EM structure of Komagataella phaffii RNAPII-Rat1-Rai1 pre-termination complex 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.30 Å
8YFR Cryo EM structure of Komagataella phaffii Rat1-Rai1 complex bound within the RNAPII cleft 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.40 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.54 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 H 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 44 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R273_KOMPG
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

DNA-directed RNA polymerase subunit

物种未注明

UniProt F2QPE6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 I； UniProt 1–115 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 U 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X50 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-2 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2 M sodium citrate, 8% PGA-LM and 1 % dextran sulfate sodium salt
分辨率 4.29 Å R-free 0.296
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 U 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5XOG RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt5 KOW5 and Elf1 提交 2017-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50 mM potassium malonate (pH 6.0), 150 mM Tris malonate (malonic acid titrated with Tris(hydroxymethyl) aminomethane, pH 6.0), 6.67% (v/v) glycerol, 6.67% (w/v) trehalose dihydrate and 10% PEG20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.225
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8YFQ Cryo EM structure of Komagataella phaffii RNAPII-Rat1-Rai1 pre-termination complex 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.30 Å
8YFR Cryo EM structure of Komagataella phaffii Rat1-Rai1 complex bound within the RNAPII cleft 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.40 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.54 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 I 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 43 个其他 PDB 条目、45 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F2QPE6_KOMPC
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–115； UniProt 1–115

RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III

物种未注明

UniProt C4R009

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 J； UniProt 1–72 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 V 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X50 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-2 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2 M sodium citrate, 8% PGA-LM and 1 % dextran sulfate sodium salt
分辨率 4.29 Å R-free 0.296
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 V 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5XOG RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt5 KOW5 and Elf1 提交 2017-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50 mM potassium malonate (pH 6.0), 150 mM Tris malonate (malonic acid titrated with Tris(hydroxymethyl) aminomethane, pH 6.0), 6.67% (v/v) glycerol, 6.67% (w/v) trehalose dihydrate and 10% PEG20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.225
5XON RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS 提交 2017-05-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8YFQ Cryo EM structure of Komagataella phaffii RNAPII-Rat1-Rai1 pre-termination complex 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.30 Å
8YFR Cryo EM structure of Komagataella phaffii Rat1-Rai1 complex bound within the RNAPII cleft 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.40 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.54 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 J 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 43 个其他 PDB 条目、45 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R009_KOMPG
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–72； UniProt 1–72

RNA polymerase II subunit B12.5

物种未注明

UniProt C4R3Z5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 K； UniProt 1–118 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X4Z RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-1 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 W 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M sodium citrate, 8% PGA-LM, 10% glycerol
分辨率 7.80 Å R-free 0.357
5X50 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-2 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；287 K；0.2 M sodium citrate, 8% PGA-LM and 1 % dextran sulfate sodium salt
分辨率 4.29 Å R-free 0.296
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5X51 RNA Polymerase II from Komagataella Pastoris (Type-3 crystal) 提交 2017-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 W 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M sodium citrate, 10% PGA-LM, 0.5% dextran sulfate sodium salt, 15 mM Tris, and 35 mM Hepes
分辨率 7.00 Å R-free 0.335
5XOG RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt5 KOW5 and Elf1 提交 2017-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50 mM potassium malonate (pH 6.0), 150 mM Tris malonate (malonic acid titrated with Tris(hydroxymethyl) aminomethane, pH 6.0), 6.67% (v/v) glycerol, 6.67% (w/v) trehalose dihydrate and 10% PEG20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.225
5XON RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS 提交 2017-05-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8YFQ Cryo EM structure of Komagataella phaffii RNAPII-Rat1-Rai1 pre-termination complex 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.30 Å
8YFR Cryo EM structure of Komagataella phaffii Rat1-Rai1 complex bound within the RNAPII cleft 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.40 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.54 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 K 1–118（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 44 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R3Z5_KOMPG
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

RNA polymerase subunit ABC10-alpha

物种未注明

UniProt F2QMI1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 L； UniProt 1–72 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5XOG RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt5 KOW5 and Elf1 提交 2017-05-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；50 mM potassium malonate (pH 6.0), 150 mM Tris malonate (malonic acid titrated with Tris(hydroxymethyl) aminomethane, pH 6.0), 6.67% (v/v) glycerol, 6.67% (w/v) trehalose dihydrate and 10% PEG20000
分辨率 3.00 Å R-free 0.225
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8YFQ Cryo EM structure of Komagataella phaffii RNAPII-Rat1-Rai1 pre-termination complex 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.30 Å
8YFR Cryo EM structure of Komagataella phaffii Rat1-Rai1 complex bound within the RNAPII cleft 提交 2024-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；EMGP2
分辨率 3.40 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.54 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 L 1–72（72 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 40 个其他 PDB 条目、40 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F2QMI1_KOMPC
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–72； UniProt 1–72

Transcription elongation factor 1 homolog

Komagataella phaffii

UniProt C4QZ45

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 M； UniProt 1–110 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 M 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 22 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4QZ45_KOMPG
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 4–113； UniProt 1–110

Transcription elongation factor SPT4

Komagataella phaffii

UniProt C4R0E6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 V； UniProt 8–114 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5XON RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS 提交 2017-05-29 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 V 8–114（107 aa） 片段：UNP residues 8-114
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 V 7–114（108 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 V 8–114（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 22 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R0E6_KOMPG
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 V； PDB构建体 2–108； UniProt 8–114

Transcription elongation factor SPT5

Komagataella phaffii

UniProt C4R370

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 W； UniProt 1–908 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5XON RNA Polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and TFIIS 提交 2017-05-29 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 W 206–815（610 aa） 片段：UNP residues 206-815
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 W 1–908（908 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 23 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R370_KOMPG
Isoform —
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 W； PDB构建体 4–911； UniProt 1–908

Transcription elongation factor Spt6

Komagataella phaffii

UniProt C4R7H2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 m； UniProt 1–1500 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 m 1–1500（1500 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 m 1–1500（1500 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 m 1–1500（1500 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 m 1–1500（1500 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 m 1–1500（1500 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 m 1–1500（1500 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 m 1–1500（1500 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 m 1–1500（1500 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 m 1–1500（1500 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 m 1–1500（1500 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 m 1–1500（1500 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R7H2_KOMPG
Isoform —
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 m； PDB构建体 4–1503； UniProt 1–1500

Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II

Komagataella phaffii

UniProt C4R7L8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 n； UniProt 1–414 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 n 1–414（414 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 n 1–414（414 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 n 1–414（414 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 n 1–414（414 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 n 1–414（414 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 n 1–414（414 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 n 1–414（414 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 n 1–414（414 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 n 1–414（414 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 n 1–414（414 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 n 1–414（414 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R7L8_KOMPG
Isoform —
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 n； PDB构建体 4–417； UniProt 1–414

Component of the Paf1p complex

Komagataella phaffii

UniProt C4R6B2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 q； UniProt 1–1044 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 q 1–1044（1044 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 q 1–1044（1044 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 q 1–1044（1044 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 q 1–1044（1044 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 q 1–1044（1044 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 q 1–1044（1044 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 q 1–1044（1044 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 q 1–1044（1044 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 q 1–1044（1044 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 q 1–1044（1044 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 q 1–1044（1044 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R6B2_KOMPG
Isoform —
PDB实体 21
链与序列区间 作者链 q； PDB构建体 41–1084； UniProt 1–1044

RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit

Komagataella phaffii

UniProt F2QQ42

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 r； UniProt 1–514 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 r 1–514（514 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 r 1–514（514 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 r 1–514（514 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 r 1–514（514 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 r 1–514（514 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 r 1–514（514 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 r 1–514（514 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 r 1–514（514 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 r 1–514（514 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 r 1–514（514 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 r 1–514（514 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F2QQ42_KOMPC
Isoform —
PDB实体 22
链与序列区间 作者链 r； PDB构建体 31–544； UniProt 1–514

Leo1

Komagataella phaffii

UniProt C4R3K1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 u； UniProt 1–429 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 u 1–429（429 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 u 1–429（429 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 u 1–429（429 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 u 1–429（429 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 u 1–429（429 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 u 1–429（429 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 u 1–429（429 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 u 1–429（429 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 u 1–429（429 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 u 1–429（429 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 u 1–429（429 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R3K1_KOMPG
Isoform —
PDB实体 23
链与序列区间 作者链 u； PDB构建体 31–459； UniProt 1–429

RNAP II-associated protein

Komagataella phaffii

UniProt C4R997

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 v； UniProt 1–393 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 v 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 v 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 v 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 v 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 v 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 v 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 v 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 v 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 v 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 v 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 v 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R997_KOMPG
Isoform —
PDB实体 24
链与序列区间 作者链 v； PDB构建体 4–396； UniProt 1–393

Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p

Komagataella phaffii

UniProt C4R1E6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 x； UniProt 1–365 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7XN7 RNA polymerase II elongation complex containing Spt4/5, Elf1, Spt6, Spn1 and Paf1C 提交 2022-04-28 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 x 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 x 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 x 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 x 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 x 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 x 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 x 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 x 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 x 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 x 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 x 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4R1E6_KOMPG
Isoform —
PDB实体 25
链与序列区间 作者链 x； PDB构建体 31–395； UniProt 1–365

Histone H3.3

Homo sapiens

UniProt P84243

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 a； UniProt 1–136 链 e； UniProt 1–136 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2L43 Structural basis for histone code recognition by BRPF2-PHD1 finger 提交 2010-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–13（12 aa）
突变：C29S, C36S ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR样品组成 0.8mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein-1, 1.6mM ZINC ION-2, 20mM Bis-Tris-3, 150mM sodium chloride-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein-5, 1.6mM ZINC ION-6, 20mM Bis-Tris-7, 150mM sodium chloride-8, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
3ASK Structure of UHRF1 in complex with histone tail 提交 2010-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 P 2–14（13 aa） 片段：residues in UNP 2-14
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris propane, 200mM sodium citrate, 20% PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.286
3ASK Structure of UHRF1 in complex with histone tail 提交 2010-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Q 2–14（13 aa） 片段：residues in UNP 2-14
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris propane, 200mM sodium citrate, 20% PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.286
3ASK Structure of UHRF1 in complex with histone tail 提交 2010-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 R 2–14（13 aa） 片段：residues in UNP 2-14
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M Bis-Tris propane, 200mM sodium citrate, 20% PEG3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.286
3ASL Structure of UHRF1 in complex with histone tail 提交 2010-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–12（11 aa） 片段：residues in UNP 2-12
未记录 ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10mM sodium citrate, 42% PEGMME2000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.41 Å R-free 0.196
3AV2 The human nucleosome structure containing the histone variant H3.3 提交 2011-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.272
3JVK Crystal structure of bromodomain 1 of mouse Brd4 in complex with histone H3-K(ac)14 提交 2009-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 13–20（8 aa） 片段：UNP residues 13-20
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；3.6M Na formate, 10% glycerol, soaked with 10-times excess of histone peptide, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.259
3MUK Crystal structure of Brd4 bromodomain 1 with propionylated histone H3-K(prop)23 提交 2010-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 22–29（8 aa） 片段：histone H3 peptide, UNP residues 22-29
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；3.6M Na formate, 10% glycerol, soaked with 20-times excess of histone octapeptide, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.75 Å R-free 0.219
3MUL Crystal structure of Brd4 bromodomain 1 with butyrylated histone H3-K(buty)14 提交 2010-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 13–20（8 aa） 片段：histone H3 peptide, UNP residues 13-20
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；3.6M Na formate, 10% glycerol, soaked with 20-times excess of histone octapeptide, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.65 Å R-free 0.226
3QL9 Monoclinic complex structure of ATRX ADD bound to histone H3K9me3 peptide 提交 2011-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–16（15 aa） 片段：K9 trimethylated H3 N-terminal fragment, UNP residues 2-16
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；277 K；14% PEG 4000, 0.1M MES, 0.2 M KCL, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 0.93 Å R-free 0.131
3QLA Hexagonal complex structure of ATRX ADD bound to H3K9me3 peptide 提交 2011-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–16（15 aa） 片段：N-terminal tail, UNP residues 2-16
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；277 K；14% PEG 4000, 0.1M MES, 0.2M KCL, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.60 Å R-free 0.179
3QLA Hexagonal complex structure of ATRX ADD bound to H3K9me3 peptide 提交 2011-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 2–16（15 aa） 片段：N-terminal tail, UNP residues 2-16
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；277 K；14% PEG 4000, 0.1M MES, 0.2M KCL, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.60 Å R-free 0.179
3QLC Complex structure of ATRX ADD domain bound to unmodified H3 1-15 peptide 提交 2011-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–16（15 aa） 片段：N-terminal tail, UNP residues 2-16
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；24% PEG 3350, 0.1M HEPES-NaOH, 0.2M KCL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.241
3QLC Complex structure of ATRX ADD domain bound to unmodified H3 1-15 peptide 提交 2011-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–16（15 aa） 片段：N-terminal tail, UNP residues 2-16
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；24% PEG 3350, 0.1M HEPES-NaOH, 0.2M KCL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.241
3WTP Crystal Structure of the heterotypic nucleosome containing human CENP-A and H3.3 提交 2014-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 E 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.67 Å R-free 0.270
4GNE Crystal Structure of NSD3 tandem PHD5-C5HCH domains complexed with H3 peptide 1-7 提交 2012-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–8（7 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-8
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；283 K；0.1M Tris-HCl pH 7.0, 30% (w/v) PEG 3000, 0.2M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 1.47 Å R-free 0.178
4GNF Crystal Structure of NSD3 tandem PHD5-C5HCH domains complexed with H3 peptide 1-15 提交 2012-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–16（15 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-16
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；283 K；0.1M Hepes pH 7.5, 70% v/v MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 1.55 Å R-free 0.205
4GNG Crystal Structure of NSD3 tandem PHD5-C5HCH domains complexed with H3K9me3 peptide 提交 2012-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–16（15 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-16
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；283 K；0.1M Mes pH 6.5, 20% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 1.73 Å R-free 0.214
4GNG Crystal Structure of NSD3 tandem PHD5-C5HCH domains complexed with H3K9me3 peptide 提交 2012-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 2–16（15 aa） 片段：UNP RESIDUES 2-16
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；283 K；0.1M Mes pH 6.5, 20% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
分辨率 1.73 Å R-free 0.214
4GU0 Crystal structure of LSD2 with H3 提交 2012-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 2–27（26 aa） 片段：UNP residues 2-27
突变：K4M FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.2M (NH4)2 Tartrate, 0.1M HEPES, 10% PEG20000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.10 Å R-free 0.221
4GU0 Crystal structure of LSD2 with H3 提交 2012-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 2–27（26 aa） 片段：UNP residues 2-27
突变：K4M FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 ZN ZINC ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；0.2M (NH4)2 Tartrate, 0.1M HEPES, 10% PEG20000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.10 Å R-free 0.221
4GUR Crystal structure of LSD2-NPAC with H3 in space group P21 提交 2012-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–22（21 aa） 片段：UNP residues 2-22
突变：K4M FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；0.02M Citric acid, 0.03M Bis_tris propane, 10% PEG3350, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.51 Å R-free 0.204
4GUS Crystal structure of LSD2-NPAC with H3 in space group P3221 提交 2012-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–22（21 aa） 片段：UNP residues 2-22
突变：K4M FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 IOD IODIDE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；277 K；0.1M Ammonium Iodide, 0.1M MES, 10% PEG3350, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.23 Å R-free 0.237
4GY5 Crystal structure of the tandem tudor domain and plant homeodomain of UHRF1 with Histone H3K9me3 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2–18（17 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；20% PEG 3350, 200mM Ammonium Tartrate, 100mM Bis-Tris, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.96 Å R-free 0.288
4GY5 Crystal structure of the tandem tudor domain and plant homeodomain of UHRF1 with Histone H3K9me3 提交 2012-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 2–18（17 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；20% PEG 3350, 200mM Ammonium Tartrate, 100mM Bis-Tris, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.96 Å R-free 0.288
4H9N Complex structure 1 of DAXX/H3.3(sub5)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–136（135 aa）
突变：S96A, Y99F, G102A, A111T, M120F PO4 PHOSPHATE ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.209
4H9O Complex structure 2 of DAXX/H3.3(sub5,G90M)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–136（135 aa）
突变：G90M, S96A, Y99F, G102A, A111T, M120F PO4 PHOSPHATE ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.225
4H9P Complex structure 3 of DAXX/H3.3(sub5,G90A)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–136（135 aa）
突变：G90A, S96A, Y99F, G102A, A111T, M120F PO4 PHOSPHATE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
4H9P Complex structure 3 of DAXX/H3.3(sub5,G90A)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–136（135 aa）
突变：G90A, S96A, Y99F, G102A, A111T, M120F PO4 PHOSPHATE ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
4H9Q Complex structure 4 of DAXX(E225A)/H3.3(sub5)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–136（135 aa）
突变：S96A, Y99F, G102A, A111T, M120F PO4 PHOSPHATE ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.221
4H9Q Complex structure 4 of DAXX(E225A)/H3.3(sub5)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–136（135 aa）
突变：S96A, Y99F, G102A, A111T, M120F PO4 PHOSPHATE ION × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.221
4H9R Complex structure 5 of DAXX(E225A)/H3.3(sub5,G90A)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–136（135 aa）
突变：G90A, S96A, Y99F, G102A, A111T, M120F PO4 PHOSPHATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；1.6 M Na/K-phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
4H9R Complex structure 5 of DAXX(E225A)/H3.3(sub5,G90A)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–136（135 aa）
突变：G90A, S96A, Y99F, G102A, A111T, M120F PO4 PHOSPHATE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；1.6 M Na/K-phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
4H9S Complex structure 6 of DAXX/H3.3(sub7)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–136（135 aa）
突变：A75C, F84W, S96A, Y99F, G102A, A111T, M120F PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；0.1 M Na/K-phosphate, 2.5M NaCl, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.250
4H9S Complex structure 6 of DAXX/H3.3(sub7)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 2–136（135 aa）
突变：A75C, F84W, S96A, Y99F, G102A, A111T, M120F PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；0.1 M Na/K-phosphate, 2.5M NaCl, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.250
4H9S Complex structure 6 of DAXX/H3.3(sub7)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–136（135 aa）
链 B 2–136（135 aa）
突变：A75C, F84W, S96A, Y99F, G102A, A111T, M120F 突变：A75C, F84W, S96A, Y99F, G102A, A111T, M120F PO4 PHOSPHATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；0.1 M Na/K-phosphate, 2.5M NaCl, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.250
4HGA Structure of the variant histone H3.3-H4 heterodimer in complex with its chaperone DAXX 提交 2012-10-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–136（136 aa）
未记录 PC4 TETRACHLOROPLATINATE(II) × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；298 K；0.1M HEPES-Na, pH 7.6, 23% (v/v) PEG 3350, 0.25M Ammonium acetate, 1% Tacsimate pH 7.0, 6% ethanol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.271
4N4I Crystal structure of the Bromo-PWWP of the mouse zinc finger MYND-type containing 11 isoform alpha in complex with histone H3.3K36me3 提交 2013-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 20–43（24 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；289 K；25% (w/v) polyethylene glycol 4000, 0.1M Tris-HCl, pH 8.3, 0.2M Li2SO4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 289K
分辨率 2.00 Å R-free 0.245
4QQ4 CW-type zinc finger of MORC3 in complex with the amino terminus of histone H3 提交 2014-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–16（15 aa） 片段：unp residues 2-16
链 D 2–16（15 aa） 片段：unp residues 2-16
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 UNX UNKNOWN LIGAND × 7 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG-3350, 0.2 M ammonium chloride, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
分辨率 1.75 Å R-free 0.223
4TMP Crystal structure of AF9 YEATS bound to H3K9ac peptide 提交 2014-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–12（11 aa） 片段：UNP residues 2-12
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；291 K；20% PEG4000, 5% 2-Propanol, 0.1 M Sodium Citrate Tribasic Dihydrate
分辨率 2.30 Å R-free 0.229
4TMP Crystal structure of AF9 YEATS bound to H3K9ac peptide 提交 2014-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–12（11 aa） 片段：UNP residues 2-12
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；291 K；20% PEG4000, 5% 2-Propanol, 0.1 M Sodium Citrate Tribasic Dihydrate
分辨率 2.30 Å R-free 0.229
4U7T Crystal structure of DNMT3A-DNMT3L in complex with histone H3 提交 2014-07-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 2–13（12 aa）
链 G 2–13（12 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M Sodium Acetate, 0.6M Ammonium Sulfate
分辨率 2.90 Å R-free 0.261
4W5A Complex structure of ATRX ADD bound to H3K9me3S10ph peptide 提交 2014-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–16（15 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；13-20% PEG 4000, 0.1 M MES, 3 mM MgCl2
分辨率 2.60 Å R-free 0.260
4W5A Complex structure of ATRX ADD bound to H3K9me3S10ph peptide 提交 2014-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–16（15 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；13-20% PEG 4000, 0.1 M MES, 3 mM MgCl2
分辨率 2.60 Å R-free 0.260
4W5A Complex structure of ATRX ADD bound to H3K9me3S10ph peptide 提交 2014-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 2–16（15 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；13-20% PEG 4000, 0.1 M MES, 3 mM MgCl2
分辨率 2.60 Å R-free 0.260
5B32 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.3. 提交 2016-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.35 Å R-free 0.259
5B33 The crystal structure of the H2AZ nucleosome with H3.3. 提交 2016-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.92 Å R-free 0.252
5BNV Crystal structure of Human MCM2 HBD chaperoning a histone H3-H4 tetramer 提交 2015-05-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 58–136（79 aa） 片段：UNP residues 58-136
链 D 58–136（79 aa） 片段：UNP residues 58-136
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；1.5 M sodium/potassium phosphate, pH 8.0
分辨率 2.79 Å R-free 0.220
5BNX Crystal structure of Human MCM2 HBD and ASF1b chaperoning a histone H3.3-H4 dimer 提交 2015-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 58–136（79 aa） 片段：UNP residues 58-136
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；3.2 M sodium formate, 0.1 M Tris, pH 8.5
分辨率 2.31 Å R-free 0.213
5DWQ Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated H3 peptide (R17) 提交 2015-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 14–31（18 aa） 片段：UNP residues 14-31
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.257
5DWQ Crystal structure of CARM1, sinefungin, and methylated H3 peptide (R17) 提交 2015-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 14–31（18 aa） 片段：UNP residues 14-31
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.36 Å R-free 0.257
5DX0 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and H3 peptide (R17) 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 14–31（18 aa） 片段：UNP residues 14-31
链 G 14–31（18 aa） 片段：UNP residues 14-31
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.263
5DX0 Crystal structure of CARM1, sinefungin, and H3 peptide (R17) 提交 2015-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 14–31（18 aa） 片段：UNP residues 14-31
链 I 14–31（18 aa） 片段：UNP residues 14-31
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SFG SINEFUNGIN × 2 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 18% w/v PEG 3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.263
5JA4 Crystal structure of human TONSL and MCM2 HBDs binding to a histone H3-H4 tetramer 提交 2016-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 58–136（79 aa）
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；0.1M MES pH 5.6, 7% isopropanol
分辨率 2.42 Å R-free 0.246
5JJY Crystal structure of SETD2 bound to histone H3.3 K36M peptide 提交 2016-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 30–43（14 aa） 片段：H3 peptide, UNP residues 30-43
突变：K36M ZN ZINC ION × 3 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 SCN THIOCYANATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.2 M KSCN, 0.1 M Bis-Tris Propane, 20% PEG3350
分辨率 2.05 Å R-free 0.213
5JLB Crystal structure of SETD2 bound to histone H3.3 K36I peptide 提交 2016-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 30–43（14 aa） 片段：H3 peptide, UNP residues 30-43
突变：K36I SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 SCN THIOCYANATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.2 M KSCN, 0.1 M Bis-Tris Propane, 20% PEG3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.190
5KDM Crystal structure of EBV tegument protein BNRF1 in complex with histone chaperone DAXX and histones H3.3-H4 提交 2016-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–136（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；0.1M MES pH 6.0, 0.8 M ammonium sulfate
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
5X7X The crystal structure of the nucleosome containing H3.3 at 2.18 angstrom resolution 提交 2017-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.18 Å R-free 0.256
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6HGT Crystal structure of human KDM4A complexed with co-substrate analog NOG and histone H3 peptide with K9R mutation 提交 2018-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 4–18（15 aa）
突变：K9R ZN ZINC ION × 2 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Crystallisation solution is 0.1M Bis-Tris-Propane pH7.5, 12-16% PEG-4000. Co-substrate analog NOG and H3R9 peptide were co-crystallised with the protein.
分辨率 2.33 Å R-free 0.280
6HGT Crystal structure of human KDM4A complexed with co-substrate analog NOG and histone H3 peptide with K9R mutation 提交 2018-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 4–18（15 aa）
突变：K9R ZN ZINC ION × 2 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Crystallisation solution is 0.1M Bis-Tris-Propane pH7.5, 12-16% PEG-4000. Co-substrate analog NOG and H3R9 peptide were co-crystallised with the protein.
分辨率 2.33 Å R-free 0.280
6HGT Crystal structure of human KDM4A complexed with co-substrate analog NOG and histone H3 peptide with K9R mutation 提交 2018-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 4–18（15 aa）
突变：K9R ZN ZINC ION × 2 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Crystallisation solution is 0.1M Bis-Tris-Propane pH7.5, 12-16% PEG-4000. Co-substrate analog NOG and H3R9 peptide were co-crystallised with the protein.
分辨率 2.33 Å R-free 0.280
6HGT Crystal structure of human KDM4A complexed with co-substrate analog NOG and histone H3 peptide with K9R mutation 提交 2018-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 4–18（15 aa）
突变：K9R ZN ZINC ION × 2 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；Crystallisation solution is 0.1M Bis-Tris-Propane pH7.5, 12-16% PEG-4000. Co-substrate analog NOG and H3R9 peptide were co-crystallised with the protein.
分辨率 2.33 Å R-free 0.280
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6PZV Crystal Structure of Bovine DNMT1 RFTS domain in complex with H3K9me3 and Ubiquitin 提交 2019-08-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 2–27（26 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） FLC CITRATE ANION × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；277 K；0.1M citric acid (pH 3.5), 28% PEG8000
分辨率 3.01 Å R-free 0.272
6PZV Crystal Structure of Bovine DNMT1 RFTS domain in complex with H3K9me3 and Ubiquitin 提交 2019-08-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 2–27（26 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；277 K；0.1M citric acid (pH 3.5), 28% PEG8000
分辨率 3.01 Å R-free 0.272
6R0C Human-D02 Nucleosome Core Particle with biotin-streptavidin label 提交 2019-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6RNY PFV intasome - nucleosome strand transfer complex 提交 2019-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：octadecameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；1 min incubation 3.5s blot
分辨率 3.90 Å
6U04 Crystal structure of human BRPF1 PZP bound to histone H3 tail 提交 2019-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–13（12 aa）
未记录 PR PRASEODYMIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291.15 K；0.2 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, 40% (v/v) PEG400, and 0.01M Praseodymium(III) acetate hydrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.208
7A08 CryoEM Structure of cGAS Nucleosome complex 提交 2020-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 d 2–136（135 aa）
链 h 2–136（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7CIZ Crystal structure of DNAJC9 HBD helix2 in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 58–136（79 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05 M Lithium sulfate, 0.05 M Sodium sulfate; 0.05 M Tris, pH 8.5, 30% (v/v) PEG400.
分辨率 1.80 Å R-free 0.214
7CIZ Crystal structure of DNAJC9 HBD helix2 in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 58–136（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05 M Lithium sulfate, 0.05 M Sodium sulfate; 0.05 M Tris, pH 8.5, 30% (v/v) PEG400.
分辨率 1.80 Å R-free 0.214
7CIZ Crystal structure of DNAJC9 HBD helix2 in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 58–136（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05 M Lithium sulfate, 0.05 M Sodium sulfate; 0.05 M Tris, pH 8.5, 30% (v/v) PEG400.
分辨率 1.80 Å R-free 0.214
7CJ0 Crystal structure of DNAJC9 HBD in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 58–136（79 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.17 M Sodium acetate, 0.1 M Tris, pH8.5, 25% (v/v) PEG 4000, 20% (v/v) Glycerol
分辨率 2.50 Å R-free 0.295
7CJ0 Crystal structure of DNAJC9 HBD in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 58–136（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.17 M Sodium acetate, 0.1 M Tris, pH8.5, 25% (v/v) PEG 4000, 20% (v/v) Glycerol
分辨率 2.50 Å R-free 0.295
7CWH Structural basis of RACK7 PHD to read a pediatric glioblastoma-associated histone mutation H3.3G34R 提交 2020-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 32–42（11 aa）
突变：G34R ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；293 K；离子强度（mmCIF原始值）500；压力 1
NMR样品组成 0.7 mM [U-13C; U-15N] RACK7 PHD, 1.4 mM H3.3G34R, 100 mM sodium chloride, 0.02 % w/v sodium azide, 50 mM sodium phosphate, 2 mM [U-2H] DDT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.7 mM [U-13C; U-15N] RACK7 PHD, 1.4 mM H3.3G34R, 100 mM sodium chloride, 0.02 % w/v sodium azide, 50 mM sodium phosphate, 2 mM [U-2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] G34R, 1.2 mM RACK7 PHD, 100 mM sodium chloride, 0.02 % w/v sodium azide, 50 mM sodium phosphate, 2 mM [U-2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7OKP Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-22 K18 acetylated 提交 2021-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 14–23（10 aa）
链 F 14–23（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MLI MALONATE ION × 2 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1M sodium malonate, 0.1M MES pH7.0, 0.2M sodium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
7OKP Crystal structure of mouse CARM1 in complex with histone H3_13-22 K18 acetylated 提交 2021-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 14–23（10 aa）
链 H 14–23（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MLI MALONATE ION × 8 QVR (2~{R},3~{R},4~{S},5~{R})-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[(~{E})-prop-1-enyl]oxolane-3,4-diol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1M sodium malonate, 0.1M MES pH7.0, 0.2M sodium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.254
7V1L Structure of sNASP core in complex with H3 alpha3 helix peptide 提交 2021-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 V 117–136（20 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.4M Na-K phosphate, pH 8.2
分辨率 2.85 Å R-free 0.246
7V1M Structural basis for the co-chaperone relationship of sNASP and ASF1b 提交 2021-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–136（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8% v/v Tacsimate, pH 6.0, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.240
7V1M Structural basis for the co-chaperone relationship of sNASP and ASF1b 提交 2021-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–136（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8% v/v Tacsimate, pH 6.0, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.240
7VCQ structure of viral protein BKRF4 in complex with H3.3-H4-ASF1 提交 2021-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 58–136（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2% Tacsimate pH 7.0; o.1M HEPES pH 7.5; 20% PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.283
7VCQ structure of viral protein BKRF4 in complex with H3.3-H4-ASF1 提交 2021-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 58–136（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2% Tacsimate pH 7.0; o.1M HEPES pH 7.5; 20% PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.283
7VCQ structure of viral protein BKRF4 in complex with H3.3-H4-ASF1 提交 2021-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 58–136（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2% Tacsimate pH 7.0; o.1M HEPES pH 7.5; 20% PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.283
7W5M Crystal structure of AtNASP in complex of H3 alpha3 helix peptide 提交 2021-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 117–136（20 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG 300, 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Phosphate citrate, pH 4.2, 10% Glycerol
分辨率 2.15 Å R-free 0.227
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9B3P The cryo-EM structure of the H2A.Z-H3.3 double-variant nucleosome 提交 2024-03-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–136（136 aa）
链 E 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Tris-HCl, 5mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Freezing condition: blot force 0, blot time 4.5 second
分辨率 3.00 Å
9EOZ Human OGG1 bound to a nucleosome core particle with 8-oxodGuo lesion at SHL6.0 提交 2024-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 E 2–136（135 aa）
链 K 2–136（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9L1X hDEK-nucleosome complex (conformation 1) 提交 2024-12-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–136（135 aa）
链 E 2–136（135 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
9L22 hDEK-nucleosome complex (conformation 2) 提交 2024-12-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 A 2–136（135 aa）
链 E 2–136（135 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9UTH DPF3b in complex with H3K14cr peptide 提交 2025-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–27（26 aa）
链 D 2–27（26 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；4 M Sodium Formate, pH 7.0
分辨率 2.69 Å R-free 0.230
9UTH DPF3b in complex with H3K14cr peptide 提交 2025-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 2–27（26 aa）
链 H 2–27（26 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；4 M Sodium Formate, pH 7.0
分辨率 2.69 Å R-free 0.230
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
突变：K36M 突变：K36M ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
突变：K36M 突变：K36M ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
突变：K36M 突变：K36M ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 a 1–136（136 aa）
链 e 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 94 个其他 PDB 条目、123 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H33_HUMAN
Isoform —
PDB实体 26
链与序列区间 作者链 a； PDB构建体 4–139； UniProt 1–136 作者链 e； PDB构建体 4–139； UniProt 1–136

Histone H4

Homo sapiens

UniProt P62805

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 b； UniProt 1–103 链 f； UniProt 1–103 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
10XZ Non-damaged nucleosome 提交 2026-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
10YA Nucleosome containing a nick at SHL-4 提交 2026-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
10YB Nucleosome containing a nick at SHL-2 提交 2026-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
10YC Nucleosome containing a nick at SHL-4 提交 2026-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
10YD Nucleosome containing a nick at SHL-6 提交 2026-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
10YE DNA Ligase IIIa bound to nucleosome containing a nick at SHL0 提交 2026-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric
链 B 23–102（80 aa）
链 F 23–102（80 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
10YF DNA Ligase IIIa bound to nucleosome containing a nick at SHL-2 (composite) 提交 2026-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric
链 B 23–102（80 aa）
链 F 23–102（80 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率未提供
10YG DNA Ligase IIIa bound to a nucleosome containing a nick at SHL-4 (composite) 提交 2026-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric
链 B 23–102（80 aa）
链 F 23–102（80 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率未提供
10YH DNA Ligase IIIa bound to a nucleosome containing a nick at SHL-6 (composite) 提交 2026-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric
链 B 23–102（80 aa）
链 F 23–102（80 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
10YI XRCC1-DNA Ligase IIIa complex bound to a nucleosome containing a nick at SHL-6 (composite) 提交 2026-02-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric
链 B 23–102（80 aa）
链 F 23–102（80 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
2BQZ Crystal structure of a ternary complex of the human histone methyltransferase Pr-SET7 (also known as SET8) 提交 2005-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 17–25（9 aa） 片段：RESIDUES 17-25
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.00
分辨率 1.50 Å R-free 0.206
2BQZ Crystal structure of a ternary complex of the human histone methyltransferase Pr-SET7 (also known as SET8) 提交 2005-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 17–25（9 aa） 片段：RESIDUES 17-25
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.00
分辨率 1.50 Å R-free 0.206
2CV5 Crystal structure of human nucleosome core particle 提交 2005-05-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 0–102（103 aa）
链 F 0–102（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 9 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å R-free 0.277
2LVM Solution structure of human 53BP1 tandem Tudor domains in complex with a histone H4K20me2 peptide 提交 2012-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 15–28（14 aa） 片段：UNP residues 15-28
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成 1.7 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 8.5 mM protein_2, 25 mM sodium phosphate, 0.001 % DSS, 0.001 % NaN3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.7 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 8.5 mM protein_2, 25 mM sodium phosphate, 0.001 % DSS, 0.001 % NaN3, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 5 mM protein_1, 4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_2, 25 mM sodium phosphate, 0.001 % DSS, 0.001 % NaN3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 5 mM protein_1, 4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_2, 25 mM sodium phosphate, 0.001 % DSS, 0.001 % NaN3, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2RNY Complex Structures of CBP Bromodomain with H4 ack20 Peptide 提交 2008-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 14–28（15 aa） 片段：UNP residues 14-28
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成 0.5mM [U-100% 13C; U-100% 15N] sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2RS9 Solution structure of the bromodomain of human BRPF1 in complex with histone H4K5ac peptide 提交 2011-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–11（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient
NMR样品组成 1.5 mM H4K5ac-1, 0.54 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Bromodomain-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3A6N The nucleosome containing a testis-specific histone variant, human H3T 提交 2009-09-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
3AFA The human nucleosome structure 提交 2010-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.270
3AV1 The human nucleosome structure containing the histone variant H3.2 提交 2011-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.290
3AV2 The human nucleosome structure containing the histone variant H3.3 提交 2011-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.272
3AYW Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K56Q mutation 提交 2011-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.90 Å R-free 0.273
3AZE Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K64Q mutation 提交 2011-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.302
3AZF Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K79Q mutation 提交 2011-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.263
3AZG Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K115Q mutation 提交 2011-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.40 Å R-free 0.269
3AZH Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K122Q mutation 提交 2011-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.49 Å R-free 0.266
3AZI Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K31Q mutation 提交 2011-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
突变：K31Q 突变：K31Q CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
3AZJ Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K44Q mutation 提交 2011-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
突变：K44Q 突变：K44Q CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.89 Å R-free 0.268
3AZK Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K59Q mutation 提交 2011-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
突变：K59Q 突变：K59Q CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3AZL Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K77Q mutation 提交 2011-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
突变：K77Q 突变：K77Q CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
3AZM Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K79Q mutation 提交 2011-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
突变：K79Q 突变：K79Q CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.89 Å R-free 0.296
3AZN Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K91Q mutation 提交 2011-05-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
突变：K91Q 突变：K91Q CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.254
3CFS Structural basis of the interaction of RbAp46/RbAp48 with histone H4 提交 2008-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 28–42（15 aa） 片段：UNP residues 28 to 42
未记录 ARS ARSENIC × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；18% PEG8000, 0.2M Ca acetate, 0.1M Na Cacodylate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.40 Å R-free 0.249
3CFV Structural basis of the interaction of RbAp46/RbAp48 with histone H4 提交 2008-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 25–42（18 aa） 片段：UNP residues 25 to 42
未记录 ARS ARSENIC × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；13% PEG 2000, 0.2M Ca acetate, 0.1M Na Cacodylate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
3CFV Structural basis of the interaction of RbAp46/RbAp48 with histone H4 提交 2008-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 25–42（18 aa） 片段：UNP residues 25 to 42
未记录 ARS ARSENIC × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；13% PEG 2000, 0.2M Ca acetate, 0.1M Na Cacodylate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.257
3F9W Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.206
3F9W Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.206
3F9W Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.206
3F9W Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.206
3F9X Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20me2 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.25 Å R-free 0.207
3F9X Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20me2 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.25 Å R-free 0.207
3F9X Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20me2 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.25 Å R-free 0.207
3F9X Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20me2 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.25 Å R-free 0.207
3F9Y Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20me1 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.220
3F9Y Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y334F / H4-Lys20me1 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.220
3F9Z Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y245F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.257
3F9Z Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y245F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.257
3F9Z Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y245F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.257
3F9Z Structural Insights into Lysine Multiple Methylation by SET Domain Methyltransferases, SET8-Y245F / H4-Lys20 / AdoHcy 提交 2008-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 16–25（10 aa） 片段：UNP residues 16-25
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；25% Pentaerythritol ethoxylate, 50mM Ammonium sulfate, 50mM Bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.257
3NQJ Crystal structure of (CENP-A/H4)2 heterotetramer 提交 2010-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 21–103（83 aa） 片段：UNP residues 21-103
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.17 M ammonium sulfate, 0.085 M sodium cacodylate (pH 6.5), 25.5% PEG-8000, 15% glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3NQU Crystal structure of partially trypsinized (CENP-A/H4)2 heterotetramer 提交 2010-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–103（103 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；295 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES (pH 7.9), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.50 Å R-free 0.302
3O36 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H4(14-19)K16ac peptide 提交 2010-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 15–20（6 aa） 片段：UNP residues 15-20
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Bis-Tris (pH 6.5), 30% Polyethylene glycol 3350, 100 mM ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.216
3O36 Crystal structure of TRIM24 PHD-Bromo complexed with H4(14-19)K16ac peptide 提交 2010-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 15–20（6 aa） 片段：UNP residues 15-20
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Bis-Tris (pH 6.5), 30% Polyethylene glycol 3350, 100 mM ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.216
3QZS Crystal Structure of BPTF bromo in complex with histone H4K16ac - Form I 提交 2011-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 13–22（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；100 mM Tris-HCl pH 8.0, 20% Glycerol, vapor diffusion, hanging drop
分辨率 1.80 Å R-free 0.230
3QZS Crystal Structure of BPTF bromo in complex with histone H4K16ac - Form I 提交 2011-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 13–22（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；100 mM Tris-HCl pH 8.0, 20% Glycerol, vapor diffusion, hanging drop
分辨率 1.80 Å R-free 0.230
3QZT Crystal Structure of BPTF bromo in complex with histone H4K16ac - Form II 提交 2011-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 13–22（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；20% (W/V) PEGMME 2K, 20% Glycerol and 0.2 M KCl, 0.1 M Tris-HCL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.50 Å R-free 0.198
3QZV Crystal Structure of BPTF PHD-linker-bromo in complex with histone H4K12ac peptide 提交 2011-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 8–18（11 aa） 片段：Histone H4 7-17
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% (W/V) PEG3000, 0.3 M NaAcetate, 0.1 M Na-Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
3R45 Structure of a CENP-A-Histone H4 Heterodimer in complex with chaperone HJURP 提交 2011-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–103（103 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 13 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；2M ammonium sulfate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.60 Å R-free 0.245
3UVW Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H4K5acK8ac) 提交 2011-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–12（11 aa） 片段：unp residues 2-12
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；278 K；0.1M Tris, 20% MPD, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K, pH 8.0
分辨率 1.37 Å R-free 0.171
3UVY Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H4K16acK20ac) 提交 2011-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 16–26（11 aa） 片段：UNP RESIDUES 16-26
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；278 K；0.2M NaI, 0.1M BTProp, 20% PEG 3350, 10% EtGly, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
分辨率 2.02 Å R-free 0.258
3UW9 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H4K8acK12ac) 提交 2011-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 8–18（11 aa） 片段：unp residues 8-18
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1M Tris, 0.3M LiCl 15% PEG6000, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K, pH 8.0
分辨率 2.30 Å R-free 0.257
3UW9 Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with a diacetylated histone 4 peptide (H4K8acK12ac) 提交 2011-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 8–18（11 aa） 片段：unp residues 8-18
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1M Tris, 0.3M LiCl 15% PEG6000, 10% EtGly, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K, pH 8.0
分辨率 2.30 Å R-free 0.257
3W96 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H2A N-terminal region 提交 2013-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.296
3W97 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H2B N-terminal region 提交 2013-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.321
3W98 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H3.1 N-terminal region 提交 2013-04-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.42 Å R-free 0.303
3W99 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H4 N-terminal region 提交 2013-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 17–103（87 aa） 片段：UNP residues 17-103
链 F 17–103（87 aa） 片段：UNP residues 17-103
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.312
3WA9 The nucleosome containing human H2A.Z.1 提交 2013-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.07 Å R-free 0.271
3WAA The nucleosome containing human H2A.Z.2 提交 2013-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.271
3WKJ The nucleosome containing human TSH2B 提交 2013-10-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.291
3WTP Crystal Structure of the heterotypic nucleosome containing human CENP-A and H3.3 提交 2014-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.67 Å R-free 0.270
3X1S Crystal structure of the nucleosome core particle 提交 2014-11-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70mM KCL, 70-90mM MnCl2, 24% MPD, 20mM Na-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.81 Å R-free 0.270
3X1T Crystal structure of nucleosome core particle consisting of mouse testis specific histone variants H2aa and H2ba 提交 2014-11-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 22 CL CHLORIDE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70mM Kcl, 70-90mM MnCl2, 24% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.81 Å R-free 0.266
3X1U Crystal structure of nucleosome core particle in the presence of histone variants involved in reprogramming 提交 2014-11-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 CL CHLORIDE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70 mM KCl, 70-90 mM MnCl2, 24% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.25 Å R-free 0.270
3X1V Crystal structure of nucleosome core particle in the presence of histone variant involved in reprogramming 提交 2014-11-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 19 CL CHLORIDE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70 mM KCl, 70-90 mM MnCl2, Na-cocodylate, 24% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.92 Å R-free 0.259
4GQB Crystal Structure of the human PRMT5:MEP50 Complex 提交 2012-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 2–22（21 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 0XU (2S,5S,6E)-2,5-diamino-6-[(3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxydihydrofuran-2(3H)-ylidene]hexanoic acid × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20-30% PEG3350, 100-250 mM ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.06 Å R-free 0.222
4H9N Complex structure 1 of DAXX/H3.3(sub5)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 2–103（102 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.209
4H9O Complex structure 2 of DAXX/H3.3(sub5,G90M)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 2–103（102 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.225
4H9P Complex structure 3 of DAXX/H3.3(sub5,G90A)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 2–103（102 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
4H9P Complex structure 3 of DAXX/H3.3(sub5,G90A)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 2–103（102 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
4H9Q Complex structure 4 of DAXX(E225A)/H3.3(sub5)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 2–103（102 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.221
4H9Q Complex structure 4 of DAXX(E225A)/H3.3(sub5)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 2–103（102 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；1.8 M Na/K-phosphate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.221
4H9R Complex structure 5 of DAXX(E225A)/H3.3(sub5,G90A)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 2–103（102 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；1.6 M Na/K-phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
4H9R Complex structure 5 of DAXX(E225A)/H3.3(sub5,G90A)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 2–103（102 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；1.6 M Na/K-phosphate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
4H9S Complex structure 6 of DAXX/H3.3(sub7)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 21–103（83 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；0.1 M Na/K-phosphate, 2.5M NaCl, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.250
4H9S Complex structure 6 of DAXX/H3.3(sub7)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 21–103（83 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；0.1 M Na/K-phosphate, 2.5M NaCl, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.250
4H9S Complex structure 6 of DAXX/H3.3(sub7)/H4 提交 2012-09-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 21–103（83 aa）
链 D 21–103（83 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；0.1 M Na/K-phosphate, 2.5M NaCl, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.250
4HGA Structure of the variant histone H3.3-H4 heterodimer in complex with its chaperone DAXX 提交 2012-10-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–103（103 aa）
未记录 PC4 TETRACHLOROPLATINATE(II) × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；298 K；0.1M HEPES-Na, pH 7.6, 23% (v/v) PEG 3350, 0.25M Ammonium acetate, 1% Tacsimate pH 7.0, 6% ethanol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.271
4M38 Crystal structure of Trypanosoma brucei protein arginine methyltransferase 7 complex with AdoHcy and histone H4 peptide 提交 2013-08-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 2–22（21 aa） 片段：UNP residues 2-22
链 F 2–22（21 aa） 片段：UNP residues 2-22
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；100mM MES, 20% PEG 1000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.230
4QUT Structure of the bromodomain of human ATPase family AAA domain-containing protein 2 (ATAD2) complexed with Histone H4-K(ac)12 提交 2014-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 7–13（7 aa） 片段：histone H4 tail
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；apo crystals grew in 1.8-2.2 M ammonium sulphate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5-6.5. Soaking performed in 28-32% PEG 3350, 50 mM bis-tris pH 5.5, 50 mM ammonium phosphate and 20% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
分辨率 1.70 Å R-free 0.180
4QUU Structure of the bromodomain of human ATPase family AAA domain-containing protein 2 (ATAD2) complexed with Histone H4-K(ac)5 提交 2014-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–13（13 aa） 片段：histone H4 tail
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；apo crystals grew in 1.8-2.2 M ammonium sulphate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5-6.5. Soaking performed in 28-32% PEG 3350, 50 mM bis-tris pH 5.5, 50 mM ammonium phosphate and 20% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
分辨率 1.80 Å R-free 0.200
4QYD Crystal Structure of the human BRPF1 bromodomain in complex with a histone H4K12ac peptide 提交 2014-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 5–18（14 aa） 片段：histone H4K12ac peptide (UNP residues 5-18)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 10% w/v polyethylene glycol (PEG) 6,000, 5% v/v (+/-)-2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.94 Å R-free 0.213
4YM5 Crystal structure of the human nucleosome containing 6-4PP (inside) 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 4.00 Å R-free 0.289
4YM6 Crystal structure of the human nucleosome containing 6-4PP (outside) 提交 2015-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 3.51 Å R-free 0.287
4YY6 Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a butyryllysine peptide 提交 2015-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；277 K；0.2 M sodium malonate, pH 4.0, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.45 Å R-free 0.208
4YYD Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a crotonyllysine peptide 提交 2015-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.2 M sodium malonate, pH 7.0, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.52 Å R-free 0.226
4YYG Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a butyryllysine peptide 提交 2015-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.05 M calcium chloride dihydrate, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 30% v/v PEG550 MME
分辨率 2.10 Å R-free 0.311
4YYH Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a crotonyllysine peptide 提交 2015-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Z 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.5, 0.2 M sodium chloride, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.74 Å R-free 0.260
4YYH Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a crotonyllysine peptide 提交 2015-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 Y 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium citrate, pH 5.5, 0.2 M sodium chloride, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.74 Å R-free 0.260
4YYI Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to an acetylated peptide 提交 2015-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% w/v PEG3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.242
4YYI Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to an acetylated peptide 提交 2015-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% w/v PEG3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.242
4YYJ Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a butyryllysine peptide 提交 2015-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M ammonium chloride, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.244
4YYJ Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a butyryllysine peptide 提交 2015-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M ammonium chloride, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.244
4YYK Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a crotonyllysine peptide 提交 2015-03-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES, pH 6.5, 15% w/v PEG550 MME
分辨率 1.79 Å R-free 0.261
4YYK Crystal structure of BRD9 Bromodomain bound to a crotonyllysine peptide 提交 2015-03-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES, pH 6.5, 15% w/v PEG550 MME
分辨率 1.79 Å R-free 0.261
4YYM Crystal structure of TAF1 BD2 Bromodomain bound to a butyryllysine peptide 提交 2015-03-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Z 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M calcium chloride, 20 w/v PEG3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.261
4YYN Crystal structure of TAF1 BD2 Bromodomain bound to a crotonyllysine peptide 提交 2015-03-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Z 2–12（11 aa） 片段：N-terminal tail (UNP residues 2-12)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.2 M calcium acetate, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.243
4Z2M Crystal structure of human SPT16 Mid-AID/H3-H4 tetramer FACT Histone complex 提交 2015-03-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 H 1–103（103 aa）
链 J 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；10% PEG400, 0.9-1.1 M Imidazole, 100-150 mM L-histidine
分辨率 2.98 Å R-free 0.246
4Z5T The nucleosome containing human H3.5 提交 2015-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.80 Å R-free 0.269
5AV5 human nucleosome core particle 提交 2015-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.233
5AV6 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.229
5AV8 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.233
5AV9 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.239
5AVB human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.236
5AVC human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.238
5AY8 Crystal structure of human nucleosome containing H3.Y 提交 2015-08-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；sodium acetate, manganese chloride, 2-propanol, trimethylamine N-oxide
分辨率 2.80 Å R-free 0.249
5B0Y Crystal structure of the nucleosome containing histone H3 with the crotonylated lysine 122 提交 2015-11-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.56 Å R-free 0.249
5B0Z The crystal structure of the nucleosome containing H3.2, at 1.98 A resolution 提交 2015-11-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 1.99 Å R-free 0.254
5B24 The crystal structure of the nucleosome containing cyclobutane pyrimidine dimer 提交 2015-12-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 3.60 Å R-free 0.249
5B2I Human nucleosome containing CpG unmethylated DNA 提交 2016-01-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 3.00 Å R-free 0.257
5B2J Human nucleosome containing CpG methylated DNA 提交 2016-01-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.60 Å R-free 0.252
5B31 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.1. 提交 2016-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.271
5B32 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.3. 提交 2016-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.35 Å R-free 0.259
5B33 The crystal structure of the H2AZ nucleosome with H3.3. 提交 2016-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.92 Å R-free 0.252
5B40 The nucleosome structure containing H2B-K120 and H4-K31 monoubiquitinations 提交 2016-03-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
突变：K31C 突变：K31C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；90mM Tris-HCl (pH 7.8), 3.6% PGA-LM, 25.2% PEG 400, 2-6% Pentaerythritol ethoxylate (3/4 EO/OH)
分辨率 3.33 Å R-free 0.263
5BNV Crystal structure of Human MCM2 HBD chaperoning a histone H3-H4 tetramer 提交 2015-05-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 2–103（102 aa）
链 E 2–103（102 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；1.5 M sodium/potassium phosphate, pH 8.0
分辨率 2.79 Å R-free 0.220
5BNX Crystal structure of Human MCM2 HBD and ASF1b chaperoning a histone H3.3-H4 dimer 提交 2015-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–103（102 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；3.2 M sodium formate, 0.1 M Tris, pH 8.5
分辨率 2.31 Å R-free 0.213
5BO0 Crystal structure of Human MCM2 HBD and ASF1b chaperoning a histone H3.2-H4 dimer 提交 2015-05-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–103（102 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；3.2 M sodium formate, 0.1 M Tris, pH 8.5
分辨率 2.91 Å R-free 0.238
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0
分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0
分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0
分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 O 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0
分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 S 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0
分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5C3I Crystal structure of the quaternary complex of histone H3-H4 heterodimer with chaperone ASF1 and the replicative helicase subunit MCM2 提交 2015-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 W 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；20% PEG 3350, 2% Tacsimate,0.1 M Tris-HCl pH 8.0
分辨率 3.50 Å R-free 0.253
5CPI Nucleosome containing unmethylated Sat2R DNA 提交 2015-07-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.90 Å R-free 0.295
5CPJ Nucleosome containing methylated Sat2R DNA 提交 2015-07-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 3.15 Å R-free 0.295
5CPK Nucleosome containing methylated Sat2L DNA 提交 2015-07-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.63 Å R-free 0.284
5FA5 Crystal Structure of PRMT5:MEP50 in complex with MTA and H4 peptide 提交 2015-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 C 2–21（20 aa） 片段：DNA binding residues 2-21
未记录 MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；200 mM ammonium sulfate, 20-28% PEG 3350, 2 mM 5-deoxy-5-(methylthio)adenosine, 1 mM H4 peptide (1-20)
分辨率 2.34 Å R-free 0.221
5FA5 Crystal Structure of PRMT5:MEP50 in complex with MTA and H4 peptide 提交 2015-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 2–21（20 aa） 片段：DNA binding residues 2-21
未记录 MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；200 mM ammonium sulfate, 20-28% PEG 3350, 2 mM 5-deoxy-5-(methylthio)adenosine, 1 mM H4 peptide (1-20)
分辨率 2.34 Å R-free 0.221
5FA5 Crystal Structure of PRMT5:MEP50 in complex with MTA and H4 peptide 提交 2015-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 2–21（20 aa） 片段：DNA binding residues 2-21
未记录 MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；200 mM ammonium sulfate, 20-28% PEG 3350, 2 mM 5-deoxy-5-(methylthio)adenosine, 1 mM H4 peptide (1-20)
分辨率 2.34 Å R-free 0.221
5FA5 Crystal Structure of PRMT5:MEP50 in complex with MTA and H4 peptide 提交 2015-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–21（20 aa） 片段：DNA binding residues 2-21
未记录 MTA 5'-DEOXY-5'-METHYLTHIOADENOSINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281 K；200 mM ammonium sulfate, 20-28% PEG 3350, 2 mM 5-deoxy-5-(methylthio)adenosine, 1 mM H4 peptide (1-20)
分辨率 2.34 Å R-free 0.221
5FWE JMJD2A COMPLEXED WITH NI(II), NOG AND HISTONE H4(1-15)R3me2s PEPTIDE 提交 2016-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–16（15 aa） 片段：HISTONE H4(1-15)R3ME2S PEPTIDE, UNP RESIDUES 2-16
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NI NICKEL (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；SITTING DROPS, 277 K, 0.15 M POTASSIUM BROMIDE, 30 % W/V PEG 2000 MME, pH 7.5
分辨率 2.05 Å R-free 0.255
5FWE JMJD2A COMPLEXED WITH NI(II), NOG AND HISTONE H4(1-15)R3me2s PEPTIDE 提交 2016-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–16（15 aa） 片段：HISTONE H4(1-15)R3ME2S PEPTIDE, UNP RESIDUES 2-16
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NI NICKEL (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；SITTING DROPS, 277 K, 0.15 M POTASSIUM BROMIDE, 30 % W/V PEG 2000 MME, pH 7.5
分辨率 2.05 Å R-free 0.255
5GSE Crystal structure of unusual nucleosome 提交 2016-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；potassium bromide, potassium thiocyanate, Tris-HCl, PGA-LM, PEG 400
分辨率 3.14 Å R-free 0.255
5GSU Crystal structure of nucleosome core particle consisting of human testis-specific histone variants, Th2A and Th2B 提交 2016-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；20mM Pottasium Cacodylate pH 6.0, 60-70mM KCl, 70-90mM MnCl2
分辨率 3.10 Å R-free 0.257
5GT0 Crystal structure of nucleosome complex with human testis-specific histone variants, Th2a 提交 2016-08-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 CL CHLORIDE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；60-70mM KCl, 70-90mM MnCl2, 24% MPD
分辨率 2.82 Å R-free 0.280
5GT3 Crystal structure of nucleosome particle in the presence of human testis-specific histone variant, hTh2b 提交 2016-08-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 12 CL CHLORIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；60-70mM KCl, 70-90mM MnCl2, 24% MPD
分辨率 2.91 Å R-free 0.258
5GTC Crystal structure of complex between DMAP-SH conjugated with a Kaposi's sarcoma herpesvirus LANA peptide (5-15) and nucleosome core particle 提交 2016-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.267
5GXQ The crystal structure of the nucleosome containing H3.6 提交 2016-09-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.85 Å R-free 0.262
5JA4 Crystal structure of human TONSL and MCM2 HBDs binding to a histone H3-H4 tetramer 提交 2016-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 2–103（102 aa）
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；0.1M MES pH 5.6, 7% isopropanol
分辨率 2.42 Å R-free 0.246
5JRG Crystal structure of the nucleosome containing the DNA with tetrahydrofuran (THF) 提交 2016-05-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
5KDM Crystal structure of EBV tegument protein BNRF1 in complex with histone chaperone DAXX and histones H3.3-H4 提交 2016-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；0.1M MES pH 6.0, 0.8 M ammonium sulfate
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
5X7X The crystal structure of the nucleosome containing H3.3 at 2.18 angstrom resolution 提交 2017-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.18 Å R-free 0.256
5XF3 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (R,R-configuration) 提交 2017-04-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 RRK (1R,2R)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55 mM MnCl2, 25-49 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.270
5XF4 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (S,S-configuration) 提交 2017-04-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 SSK (1S,2S)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55 mM MnCl2, 25-49 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0
分辨率 2.87 Å R-free 0.266
5XF5 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (R,S-configuration) 提交 2017-04-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 RSK (1S,2R)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55mM MnCl2, 25-49mM KCl, 20mM K-Cacodylate pH 6.0
分辨率 2.82 Å R-free 0.264
5Y0C Crystal Structure of the human nucleosome at 2.09 angstrom resolution 提交 2017-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 10 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.09 Å R-free 0.249
5Y0D Crystal Structure of the human nucleosome containing the H2B E76K mutant 提交 2017-07-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 1.99 Å R-free 0.252
5Z23 Crystal structure of the nucleosome containing a chimeric histone H3/CENP-A CATD 提交 2017-12-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.73 Å R-free 0.261
5Z30 The crystal structure of the nucleosome containing a cancer-associated histone H2A.Z R80C mutant 提交 2018-01-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.45 Å R-free 0.243
5ZBX The crystal structure of the nucleosome containing histone H3.1 CATD(V76Q, K77D) 提交 2018-02-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.58 Å R-free 0.249
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6BUZ Cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with kinetochore protein CENP-N 提交 2017-12-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
6C0W Cryo-EM structure of human kinetochore protein CENP-N with the centromeric nucleosome containing CENP-A 提交 2018-01-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–102（102 aa）
链 F 1–102（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6E0C Cryo-EM structure of the CENP-A nucleosome (W601) in complex with a single chain antibody fragment 提交 2018-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
6E0P Cryo-EM structure of the centromeric nucleosome (Native alpha satellite DNA) in complex with a single chain antibody fragment 提交 2018-07-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 sec before plunging
分辨率 2.60 Å
6FML CryoEM Structure INO80core Nucleosome complex 提交 2018-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 N 2–103（102 aa）
链 R 2–103（102 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES pH 8, 60 mM KCl, 0.5% glycerol, 0.25 mM CaCl2, 20 uM ZnCl2, 0.25 mM DTT, 0.05% Octyl-beta-glucoside
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.34 Å
6HKT Structure of an H1-bound 6-nucleosome array 提交 2018-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：50-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 V 1–103（103 aa）
链 Z 1–103（103 aa）
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
链 l 1–103（103 aa）
链 p 1–103（103 aa）
链 v 1–103（103 aa）
链 z 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293.15 K；15% MPD, 0.1 M NaCl and 0.1 M Tris pH 8.8
分辨率 9.70 Å R-free 0.286
6HTS Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to nucleosome 提交 2018-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 J 1–103（103 aa）
链 N 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IPU Human nucleosome core particle containing 145 bp of DNA 提交 2018-11-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 22–103（82 aa）
链 F 17–103（87 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate
分辨率 1.99 Å R-free 0.263
6IQ4 Nucleosome core particle cross-linked with a hetero-binuclear molecule possessing RAPTA and gold(I) 4-(diphenylphosphino)benzoic acid groups. 提交 2018-11-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 22–103（82 aa）
链 F 17–103（87 aa）
未记录 AU GOLD ION × 1 XIS 4-diphenylphosphanylbenzoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 D0X [Ru(eta(6)-p-cymene)Cl-2(pta) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate
分辨率 2.25 Å R-free 0.257
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6JOU Crystal structure of the human nucleosome containing H2A.Z.1 S42R 提交 2019-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.17 Å R-free 0.250
6JR0 Crystal structure of the human nucleosome phased with 12 selenium atoms 提交 2019-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.50 Å R-free 0.253
6JR1 Crystal structure of the human nucleosome phased with 16 selenium atoms 提交 2019-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.243
6JXD Human nucleosome core particle with cohesive end DNA termini 提交 2019-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 22–103（82 aa）
链 F 17–103（87 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate
分辨率 2.25 Å R-free 0.292
6K1I Human nucleosome core particle with gammaH2A.X variant 提交 2019-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 23 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；potassium chloride, manganese chloride, potassium cacodylate
分辨率 2.75 Å R-free 0.277
6K1J Human nucleosome core particle with H2A.X variant 提交 2019-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；Potassium Chloride, Manganese Chloride, Potassium Cacodylate
分辨率 2.85 Å R-free 0.319
6K1K Human nucleosome core particle with H2A.X S139E variant 提交 2019-05-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 33 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；potassium chloride, manganese chloride, potassium cacodylate
分辨率 2.20 Å R-free 0.275
6KE9 The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-07-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 17–103（87 aa）
链 F 17–103（87 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose
分辨率 2.22 Å R-free 0.230
6KVD Crystal structure of human nucleosome containing H2A.J 提交 2019-09-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 13 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.21 Å R-free 0.257
6KXV Crystal structure of a nucleosome containing Leishmania histone H3 提交 2019-09-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium acetate, isopropanol, manganese chloride, trimethylamine N-oxide
分辨率 3.63 Å R-free 0.264
6L49 H3-CA-H3 tri-nucleosome with the 22 base-pair linker DNA 提交 2019-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 T 1–103（103 aa）
链 X 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 18.90 Å
6L4A H3-H3-H3 tri-nucleosome with the 22 base-pair linker DNA 提交 2019-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 T 1–103（103 aa）
链 X 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.30 Å
6L9H The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 17–103（87 aa）
链 F 17–103（87 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose
分辨率 2.60 Å R-free 0.278
6L9Z 338 bp di-nucleosome assembled with linker histone H1.X 提交 2019-11-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 8 CA CALCIUM ION × 65 K POTASSIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
6LA2 343 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：38-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 V 1–103（103 aa）
链 Z 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
链 j 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Sodium acetate
分辨率 3.89 Å R-free 0.267
6LA8 349 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 23 K POTASSIUM ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate (cryo-25% MPD)
分辨率 3.40 Å R-free 0.265
6LA9 349 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 (high cryoprotectant) 提交 2019-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 40 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate
分辨率 3.70 Å R-free 0.266
6LAB 169 bp nucleosome, harboring cohesive DNA termini, assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 20 K POTASSIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate
分辨率 3.20 Å R-free 0.262
6LE9 The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-11-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 17–103（87 aa）
链 F 17–103（87 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose
分辨率 2.60 Å R-free 0.281
6LER 169 bp nucleosome harboring non-identical cohesive DNA termini. 提交 2019-11-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate
分辨率 3.00 Å R-free 0.261
6LER 169 bp nucleosome harboring non-identical cohesive DNA termini. 提交 2019-11-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 8 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate
分辨率 3.00 Å R-free 0.261
6M3V 355 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini 提交 2020-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate, Poly glutamic acid
分辨率 4.60 Å R-free 0.261
6M44 355 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini (high cryoprotectant) 提交 2020-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate, Poly glutamic acid
分辨率 3.81 Å R-free 0.286
6M4D Structural mechanism of nucleosome dynamics governed by human histone variants H2A.B and H2A.Z.2.2 提交 2020-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6M4G Structural mechanism of nucleosome dynamics governed by human histone variants H2A.B and H2A.Z.2.2 提交 2020-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6M4H Structural mechanism of nucleosome dynamics governed by human histone variants H2A.B and H2A.Z.2.2 提交 2020-03-07 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6MLC PHD6 domain of MLL3 in complex with histone H4 提交 2018-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 E 2–21（20 aa） 片段：residues 2-21
未记录 ZN ZINC ION × 42 GOL GLYCEROL × 6 UNX UNKNOWN LIGAND × 30 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；2 M Na-Form, 0.1 M Tris, pH 8.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.216
6MLC PHD6 domain of MLL3 in complex with histone H4 提交 2018-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 F 2–21（20 aa） 片段：residues 2-21
未记录 ZN ZINC ION × 42 GOL GLYCEROL × 24 UNX UNKNOWN LIGAND × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；2 M Na-Form, 0.1 M Tris, pH 8.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.216
6MUO CENP-A nucleosome bound by two copies of CENP-C(CD) and one copy CENP-N(NT) 提交 2018-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 9–102（94 aa）
链 F 9–102（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM HEPES, 50 mN NaCl, 1 mM EDTA, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 8 seconds before plunging
分辨率 3.60 Å
6MUP CENP-A nucleosome bound by two copies of CENP-C(CD) and two copies CENP-N(NT) 提交 2018-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 9–102（94 aa）
链 F 9–102（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM HEPES, 50 mN NaCl, 1 mM EDTA, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 8 seconds before plunging
分辨率 3.50 Å
6O1D Cryo-EM structure of the centromeric nucleosome with native alpha satellite DNA 提交 2019-02-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 sec before plunging
分辨率 3.40 Å
6R0C Human-D02 Nucleosome Core Particle with biotin-streptavidin label 提交 2019-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6R8Y Cryo-EM structure of NCP-6-4PP(-1)-UV-DDB 提交 2019-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6R8Z Cryo-EM structure of NCP_THF2(-1)-UV-DDB 提交 2019-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6R90 Cryo-EM structure of NCP-THF2(+1)-UV-DDB class A 提交 2019-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6R91 Cryo-EM structure of NCP_THF2(-3)-UV-DDB 提交 2019-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6R92 Cryo-EM structure of NCP-THF2(+1)-UV-DDB class B 提交 2019-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6R93 Cryo-EM structure of NCP-6-4PP 提交 2019-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6R94 Cryo-EM structure of NCP_THF2(-3) 提交 2019-04-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RNY PFV intasome - nucleosome strand transfer complex 提交 2019-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：octadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；1 min incubation 3.5s blot
分辨率 3.90 Å
6RXS Crystal structure of CobB Ac3(A76G,Y92A, I131L, V187Y) in complex with H4K16-Acetyl peptide 提交 2019-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 13–23（11 aa） 片段：H4K16Ac
突变：K16ALY 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.1M Bis-Tris, 0.03 M HCl, 23% PEG3350
分辨率 1.60 Å R-free 0.205
6SE0 Class 1 : CENP-A nucleosome 提交 2019-07-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6SE6 Class2 : CENP-A nucleosome in complex with CENP-C central region 提交 2019-07-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6SEE Class2A : CENP-A nucleosome in complex with CENP-C central region 提交 2019-07-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6SEF Class2C : CENP-A nucleosome in complex with CENP-C central region 提交 2019-07-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6SEG Class1: CENP-A nucleosome in complex with CENP-C central region 提交 2019-07-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6T79 Structure of a human nucleosome at 3.2 A resolution 提交 2019-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.
分辨率 3.20 Å
6T7A Structure of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.
分辨率 3.70 Å
6T7B Structure of human Sox2 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.
分辨率 5.10 Å
6T7C Structure of two copies of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.
分辨率 4.00 Å
6T7D Structure of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.
分辨率 4.40 Å
6T90 OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2019-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
6T93 Nucleosome with OCT4-SOX2 motif at SHL-6 提交 2019-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
6UPK Structure of FACT_subnucleosome complex 1 提交 2019-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
6UPL Structure of FACT_subnucleosome complex 2 提交 2019-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.40 Å
6USJ Structure of two nucleosomes bridged by human PARP2 提交 2019-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Buffer was pH-adjusted and filtered through a 0.22 um filter.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 2s, blot force 0
分辨率 10.50 Å
6V2K The nucleosome structure after H2A-H2B exchange 提交 2019-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.60 Å R-free 0.248
6V92 RSC-NCP 提交 2019-12-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 20.00 Å
6VO5 Crystal structure of Human histone acetytransferas 1 (HAT1) in complex with isobutryl-COA and K12A mutant variant of histone H4 提交 2020-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–21（20 aa）
未记录 ACT ACETATE ION × 1 CO6 ISOBUTYRYL-COENZYME A × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 20K and 0.1M MES pH6.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.198
6VO5 Crystal structure of Human histone acetytransferas 1 (HAT1) in complex with isobutryl-COA and K12A mutant variant of histone H4 提交 2020-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–21（20 aa）
未记录 CO6 ISOBUTYRYL-COENZYME A × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 20K and 0.1M MES pH6.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.198
6X59 The mouse cGAS catalytic domain binding to human assembled nucleosome 提交 2020-05-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
6X5A The mouse cGAS catalytic domain binding to human nucleosome that purified from HEK293T cells 提交 2020-05-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.36 Å
6XJD Two mouse cGAS catalytic domain binding to human assembled nucleosome 提交 2020-06-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6Y5D Structure of human cGAS (K394E) bound to the nucleosome 提交 2020-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 N 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 9 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6Y5E Structure of human cGAS (K394E) bound to the nucleosome (focused refinement of cGAS-NCP subcomplex) 提交 2020-02-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 23–103（81 aa）
链 F 21–103（83 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 8 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
6YOV OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 提交 2020-04-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
7A08 CryoEM Structure of cGAS Nucleosome complex 提交 2020-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 e 2–103（102 aa）
链 i 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7BWD Structure of Dot1L-H2BK34ub Nucleosome Complex 提交 2020-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.32 Å
7BXT The cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with CENP-C peptide and CENP-N N-terminal domain 提交 2020-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7BY0 The cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with the phosphorylated CENP-C 提交 2020-04-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–102（102 aa）
链 F 1–102（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7C0M Human cGAS-nucleosome complex 提交 2020-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
链 b 2–103（102 aa）
链 f 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7CIZ Crystal structure of DNAJC9 HBD helix2 in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–103（102 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05 M Lithium sulfate, 0.05 M Sodium sulfate; 0.05 M Tris, pH 8.5, 30% (v/v) PEG400.
分辨率 1.80 Å R-free 0.214
7CIZ Crystal structure of DNAJC9 HBD helix2 in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05 M Lithium sulfate, 0.05 M Sodium sulfate; 0.05 M Tris, pH 8.5, 30% (v/v) PEG400.
分辨率 1.80 Å R-free 0.214
7CIZ Crystal structure of DNAJC9 HBD helix2 in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05 M Lithium sulfate, 0.05 M Sodium sulfate; 0.05 M Tris, pH 8.5, 30% (v/v) PEG400.
分辨率 1.80 Å R-free 0.214
7CJ0 Crystal structure of DNAJC9 HBD in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 2–103（102 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.17 M Sodium acetate, 0.1 M Tris, pH8.5, 25% (v/v) PEG 4000, 20% (v/v) Glycerol
分辨率 2.50 Å R-free 0.295
7CJ0 Crystal structure of DNAJC9 HBD in complex with H3.3-H4 dimer and MCM2 HBD 提交 2020-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.17 M Sodium acetate, 0.1 M Tris, pH8.5, 25% (v/v) PEG 4000, 20% (v/v) Glycerol
分辨率 2.50 Å R-free 0.295
7COW 353 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini with linker histone H1.0 提交 2020-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 3 K POTASSIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；potassium acetate, calcium chloride, potassium chloride
分辨率 2.86 Å R-free 0.297
7D1Z Cryo-EM structure of SET8-nucleosome complex 提交 2020-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
7D20 Cryo-EM structure of SET8-CENP-A-nucleosome complex 提交 2020-09-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7DBP Linker histone defines structure and self-association behaviour of the 177 bp human chromosome 提交 2020-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7E8D NSD2 E1099K mutant bound to nucleosome 提交 2021-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 SFG SINEFUNGIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7EIC Crystal structure of AF9 YEATS domain in complex with H4K5acK8ac peptide 提交 2021-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–13（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Bis-Tris buffer (pH 6.5) containing 100 mM ammonium acetate and 25% PEG3350
分辨率 1.95 Å R-free 0.205
7JO9 1:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-08-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7JOA 2:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-08-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7JZV Cryo-EM structure of the BRCA1-UbcH5c/BARD1 E3-E2 module bound to a nucleosome 提交 2020-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 Q 2–103（102 aa）
链 q 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7K5X Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.0 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
7K5Y Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.4 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7K60 Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.10 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
7K61 Cryo-EM structure of 197bp nucleosome aided by scFv 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
7K63 Cryo-EM structure of a chromatosome containing chimeric linker histone gH1.10-ncH1.4 提交 2020-09-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
7LMK Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me3 提交 2021-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 15–27（13 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline, 0.1 M HEPES (pH 7.5)
分辨率 2.65 Å R-free 0.258
7LMK Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me3 提交 2021-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 15–27（13 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline, 0.1 M HEPES (pH 7.5)
分辨率 2.65 Å R-free 0.258
7LMK Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me3 提交 2021-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 15–27（13 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline, 0.1 M HEPES (pH 7.5)
分辨率 2.65 Å R-free 0.258
7LMK Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me3 提交 2021-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 15–27（13 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline, 0.1 M HEPES (pH 7.5)
分辨率 2.65 Å R-free 0.258
7LMM Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me2 提交 2021-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 15–27（13 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES (pH 6.5) ,13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline
分辨率 2.80 Å R-free 0.267
7LMM Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me2 提交 2021-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 15–27（13 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES (pH 6.5) ,13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline
分辨率 2.80 Å R-free 0.267
7LMM Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me2 提交 2021-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 15–27（13 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES (pH 6.5) ,13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline
分辨率 2.80 Å R-free 0.267
7LMM Crystal structure of bovine DNMT1 BAH1 domain in complex with H4K20me2 提交 2021-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 15–27（13 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M MES (pH 6.5) ,13% PEG1500, 20 mM DTT and 200 mM L-proline
分辨率 2.80 Å R-free 0.267
7LYA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle with linked histone proteins H2A and H2B 提交 2021-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
7LYB Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with BRCA1-BARD1-UbcH5c 提交 2021-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
7LYC Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A Lys13 and Lys15 in complex with BARD1 (residues 415-777) 提交 2021-03-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
7M98 ATAD2 bromodomain complexed with histone H4K5ac (res 1-10) ligand 提交 2021-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–16（15 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；2.0 M sodium phosphate monobasic monohydrate/potassium phosphate dibasic, pH 6.6
分辨率 1.60 Å R-free 0.219
7NL0 Cryo-EM structure of the Lin28B nucleosome core particle 提交 2021-02-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7PET The 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
链 l 1–103（103 aa）
链 p 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.50 Å
7PEU Trinucleosome of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7PEV Nucleosome stack of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.00 Å
7PEW Nucleosome 1 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
7PEX Nucleosome 2 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
7PEY Nucleosome 3 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7PEZ Nucleosome 4 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 l 1–103（103 aa）
链 p 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
7PF0 Trinucleosome of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.00 Å
7PF2 Nucleosome stack of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
7PF3 Nucleosome 4 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 l 1–103（103 aa）
链 p 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7PF4 Nucleosome 3 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7PF5 Nucleosome 2 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7PF6 Nucleosome 1 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7PFA Trinucleosome of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.70 Å
7PFC Nucleosome stack of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
7PFD Nucleosome 1 of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7PFE Nucleosome 2 of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7PFF Nucleosome 3 of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7PFT Trinucleosome of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.80 Å
7PFU Nucleosome stack of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
7PFV Nucleosome 1 of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7PFW Nucleosome 2 of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
7PFX Nucleosome 3 of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7PII Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2021-08-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
7R5R Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.44 Å
7SCY Nuc147 bound to single BRCT 提交 2021-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7SCZ Nuc147 bound to multiple BRCTs 提交 2021-09-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7TAN Structure of VRK1 C-terminal tail bound to nucleosome core particle 提交 2021-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
7U0G structure of LIN28b nucleosome bound 3 OCT4 提交 2022-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7U0I Structure of LIN28b nucleosome bound 2 OCT4 提交 2022-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7U0J Structure of 162bp LIN28b nucleosome 提交 2022-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7U46 Cryo-EM structure of CENP-A nucleosome (palindromic alpha satellite DNA) in complex with CENP-N 提交 2022-02-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
7U47 CryoEM structure of CENP-N promoted nucleosome stacks with CENP-A and palindromic alpha satellite DNA sequence 提交 2022-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 M 1–103（103 aa）
链 Q 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.50 Å
7U4D CryoEM structure of CENP-N promoted nucleosome stacks with CENP-A and 601 DNA sequence 提交 2022-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 M 1–103（103 aa）
链 Q 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å
7U50 APE1 bound to a nucleosome core particle with AP-site at SHL-6 提交 2022-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7U51 Nucleosome core particle with AP-site at SHL-6 提交 2022-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7U52 nucleosome core particle with AP-site at SHL-6.5 提交 2022-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7U53 Nucleosome core particle with AP-site at SHL0 提交 2022-03-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7UV9 KDM2A-nucleosome structure stabilized by H3K36C-UNC8015 covalent conjugate 提交 2022-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 OH0 N-heptanoyl-N-hydroxy-beta-alanine × 1 FE FE (III) ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7V1M Structural basis for the co-chaperone relationship of sNASP and ASF1b 提交 2021-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8% v/v Tacsimate, pH 6.0, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.240
7V1M Structural basis for the co-chaperone relationship of sNASP and ASF1b 提交 2021-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8% v/v Tacsimate, pH 6.0, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.240
7V6Q Crystal structure of sNASP-ASF1A-H3.1-H4 complex 提交 2021-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 3–103（101 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；18% (v/v) Tacsimate, pH 5.0 11% (v/v) PEG2000MME
分辨率 3.00 Å R-free 0.203
7V6Q Crystal structure of sNASP-ASF1A-H3.1-H4 complex 提交 2021-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 3–103（101 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；18% (v/v) Tacsimate, pH 5.0 11% (v/v) PEG2000MME
分辨率 3.00 Å R-free 0.203
7V90 Telomeric mononucleosome 提交 2021-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7V96 Telomeric Dinucleosome 提交 2021-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
7V9C Telomeric Dinucleosome in open state 提交 2021-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7V9J Telomeric trinucleosome 提交 2021-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 T 1–103（103 aa）
链 X 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.00 Å
7V9K Telomeric tetranucleosome 提交 2021-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 T 1–103（103 aa）
链 X 1–103（103 aa）
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å
7V9S Telomeric trinucleosome in open state 提交 2021-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 T 1–103（103 aa）
链 X 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.00 Å
7VA4 Telomeric tetranucleosome in open state 提交 2021-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 T 1–103（103 aa）
链 X 1–103（103 aa）
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 14.00 Å
7VCQ structure of viral protein BKRF4 in complex with H3.3-H4-ASF1 提交 2021-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2% Tacsimate pH 7.0; o.1M HEPES pH 7.5; 20% PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.283
7VCQ structure of viral protein BKRF4 in complex with H3.3-H4-ASF1 提交 2021-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2% Tacsimate pH 7.0; o.1M HEPES pH 7.5; 20% PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.283
7VCQ structure of viral protein BKRF4 in complex with H3.3-H4-ASF1 提交 2021-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2% Tacsimate pH 7.0; o.1M HEPES pH 7.5; 20% PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.283
7VZ4 Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601L DNA sequence 提交 2021-11-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 1.89 Å
7W9V Cryo-EM structure of nucleosome in complex with p300 acetyltransferase catalytic core (complex I) 提交 2021-12-10 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 b 2–103（102 aa）
链 f 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 b 2–103（102 aa）
链 f 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 b 2–103（102 aa）
链 f 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7X57 Cryo-EM structure of human subnucleosome (closed form) 提交 2022-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 H 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
7X58 Cryo-EM structure of human subnucleosome (open form) 提交 2022-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 D 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
链 H 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.93 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7XVL Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169an DNA fragment) 提交 2022-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 V 1–103（103 aa）
链 Z 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.51 Å R-free 0.280
7XVL Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169an DNA fragment) 提交 2022-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
链 j 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.51 Å R-free 0.280
7XVM Crystal Structure of Nucleosome-H5 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 18 CL CHLORIDE ION × 3 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 2.84 Å R-free 0.259
7XX5 Crystal Structure of Nucleosome-H1.3 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.19 Å R-free 0.259
7XX6 Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 21 K POTASSIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.39 Å R-free 0.296
7XX6 Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric
链 V 1–103（103 aa）
链 Z 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
链 j 1–103（103 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 26 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.39 Å R-free 0.296
7XZX Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 DNA-binding domain 提交 2022-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.53 Å
7XZY Cryo-EM structure of the nucleosome containing 193 base-pair DNA with a p53 target sequence 提交 2022-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.97 Å
7XZZ Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 提交 2022-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7Y00 Cryo-EM structure of the nucleosome containing 169 base-pair DNA with a p53 target sequence 提交 2022-06-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.96 Å
7Y5U Cryo-EM structure of the monomeric human CAF1LC-H3-H4 complex 提交 2022-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7Y5V Cryo-EM structure of the dimeric human CAF1LC-H3-H4 complex 提交 2022-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–103（103 aa）
链 J 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
7Y5W Cryo-EM structure of the left-handed Di-tetrasome 提交 2022-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 H 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7Y60 Cryo-EM structure of human CAF1LC bound right-handed Di-tetrasome 提交 2022-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 H 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7Y61 Cryo-EM structure of the two CAF1LCs bound right-handed Di-tetrasome 提交 2022-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 H 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
7Y7I chicken KNL2 in complex with the CENP-A nucleosome 提交 2022-06-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
7YOZ Cryo-EM structure of human subnucleosome (intermediate form) 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 H 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7YWX Structure of the human CCAN CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.00 Å
7YYH Structure of the human CCANdeltaT CENP-A alpha-satellite complex 提交 2022-02-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.90 Å
7ZI4 Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome 提交 2022-04-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–103（103 aa）
链 N 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4uL of sample applied to Quantifoil R2/2 Cu 300 mesh grids. blot parameters were wait time 30 sec, blot time 0.5 sec, blot force -8
分辨率 3.20 Å
8AAG H1-bound palindromic nucleosome, state 1 提交 2022-07-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
8ATF Nucleosome-bound Ino80 ATPase 提交 2022-08-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 N 2–103（102 aa）
链 R 2–103（102 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
8AV6 CryoEM structure of INO80 core nucleosome complex in closed grappler conformation 提交 2022-08-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 N 2–103（102 aa）
链 R 2–103（102 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.68 Å
8DK5 Structure of 187bp LIN28b nucleosome with site 0 mutation 提交 2022-07-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.71 Å
8EVG 162bp CX3CR1 nucleosome (further classified with better nucleosome end) 提交 2022-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
8EVH CX3CR1 nucleosome and wild type PU.1 complex 提交 2022-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
8EVI CX3CR1 nucleosome and PU.1 complex containing disulfide bond mutations 提交 2022-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.64 Å
8EVJ CX3CR1 nucleosome bound PU.1 and C/EBPa 提交 2022-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8GUI Bre1-nucleosome complex (Model I) 提交 2022-09-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
8GUJ Bre1-nucleosome complex (Model II) 提交 2022-09-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8GUK Human nucleosome core particle (free form) 提交 2022-09-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.51 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8H1T Cryo-EM structure of BAP1-ASXL1 bound to chromatosome 提交 2022-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8HLW Crystal structure of SIRT3 in complex with H4K16la peptide 提交 2022-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 14–21（8 aa） 片段：residues 20-27, with lactylated No.23 lysine
未记录 ZN ZINC ION × 1 2OP (2S)-2-HYDROXYPROPANOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；0.1 M Tris pH 8.5, 25% (w/v) Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.243
8IEG Bre1(mRBD-RING)/Rad6-Ub/nucleosome complex 提交 2023-02-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 F 23–102（80 aa）
链 L 23–102（80 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8IEJ RNF20-RNF40/hRad6A-Ub/nucleosome complex 提交 2023-02-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 F 23–102（80 aa）
链 L 23–102（80 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
8IHL Overlapping tri-nucleosome 提交 2023-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 N 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
链 V 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.64 Å
8IQF Cryo-EM structure of the dimeric human CAF1-H3-H4 complex 提交 2023-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 E 1–103（103 aa）
链 J 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8IQG Cryo-EM structure of the monomeric human CAF1-H3-H4 complex 提交 2023-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8J6S Cryo-EM structure of the single CAF-1 bound right-handed Di-tetrasome 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 H 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8J6T Cryo-EM structure of the double CAF-1 bound right-handed Di-tetrasome 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 H 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8JBX Human canonical 601 DNA nucleosome 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8JCC Human histone H2B variant H2BFWT Cryo-EM structure with 601 DNA sequence 提交 2023-05-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
8JCD Human H2BFWTH100R nucleosome with 601 DNA 提交 2023-05-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8JHF Native SUV420H1 bound to 167-bp nucleosome 提交 2023-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 18–103（86 aa）
链 F 18–103（86 aa）
突变：K20M 突变：K20M ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane
分辨率 3.68 Å
8JHG Native SUV420H1 bound to 167-bp nucleosome 提交 2023-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 18–103（86 aa）
链 F 18–103（86 aa）
突变：K20M 突变：K20M ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane
分辨率 3.58 Å
8JL9 Cryo-EM structure of the human nucleosome with scFv 提交 2023-06-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
8JLA Cryo-EM structure of the human nucleosome lacking N-terminal region of H2A, H2B, H3, and H4 提交 2023-06-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 17–103（87 aa）
链 F 17–103（87 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8JLB Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing H3.2 C110A mutant 提交 2023-06-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.36 Å
8JLD Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing acetylated H3 tail 提交 2023-06-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.48 Å
8JND The cryo-EM structure of the nonameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
8JNE The cryo-EM structure of the decameric RAD51 ring bound to the nucleosome without the linker DNA binding 提交 2023-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.68 Å
8JNF The cryo-EM structure of the RAD51 filament bound to the nucleosome 提交 2023-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.91 Å
8KB5 Cryo-EM structure of the human nucleosome containing H3.8 提交 2023-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.26 Å
8KCY Structure of nucleosome complexed with two DEK molecules 提交 2023-08-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8KD1 Structure of nucleosome complexed with one DEK molecule 提交 2023-08-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8KE0 Structure of H1.2 bound to the nucleosome 提交 2023-08-11 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8OFF Structure of BARD1 ARD-BRCTs in complex with H2AKc15ub nucleosomes (Map1) 提交 2023-03-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 Da 1–103（103 aa）
链 Db 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl and 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force = 0 N blot time = 8 s
分辨率 3.40 Å
8OL1 cGAS-Nucleosome in complex with SPSB3-ELOBC (composite structure) 提交 2023-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 23–103（81 aa）
链 F 23–103（81 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8OO7 CryoEM Structure INO80core Hexasome complex composite model state1 提交 2023-04-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 N 2–103（102 aa）
链 R 2–103（102 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)
分辨率 2.80 Å
8OOA CryoEM Structure INO80core Hexasome complex Hexasome refinement state1 提交 2023-04-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 N 2–103（102 aa）
链 R 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)
分辨率 3.18 Å
8OOP CryoEM Structure INO80core Hexasome complex composite model state2 提交 2023-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 N 2–103（102 aa）
链 R 2–103（102 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)
分辨率 2.70 Å
8OOS CryoEM Structure INO80core Hexasome complex ATPase-hexasome refinement state 2 提交 2023-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 N 2–103（102 aa）
链 R 2–103（102 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；30mM HEPES, pH7.5 50mM NaCl 0.25mM CaCl2 0.25mM DTT 2mM ADP 3.3mM MgCl2 10mM NaF 2mM AlCl3 0.05% octyl-beta-glucoside
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；wait time of 5s, blot force at 3, and a blot time of 2s with Whatman blotting paper (Cytiva, CAT No. 10311807)
分辨率 3.29 Å
8OSJ Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL-6.2 (DNA conformation 1) 提交 2023-04-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
8OSK Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL+5.8 (composite map) 提交 2023-04-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8OSL Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to the native Por enhancer nucleosome (map 2, additional 3D classification and flexible refinement) 提交 2023-04-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
8OTS OCT4 and MYC-MAX co-bound to a nucleosome 提交 2023-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8OTT MYC-MAX bound to a nucleosome at SHL+5.8 提交 2023-04-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 22–103（82 aa）
链 F 22–103（82 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8OX0 Structure of apo telomeric nucleosome 提交 2023-04-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM HEPES-KOH pH 8.0, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1% glycerol, 0.01% Igepal CA-630,1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot Force: -15 Blot Time: 2.5 s
分辨率 2.52 Å
8OX1 Structure of TRF1core in complex with telomeric nucleosome 提交 2023-04-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM HEPES-KOH pH 8.0, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1% glycerol, 0.01% Igepal CA-630, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot Force: -15 Blot Time: 2.5 s
分辨率 2.70 Å
8PEF Crystal structure of SLF1 Ankyrin repeat domain in complex with H4 tail (K20me0) 提交 2023-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 10–26（17 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M Sodium malonate dibasic monohydrate 0.1M Hepes pH 7 30% (w/v) Poly(acrylic acid sodium salt) 2100
分辨率 1.28 Å R-free 0.225
8Q36 Structure of Nucleosome Core with a Bound Metallopeptide Conjugate (Foamy Virus GAG Peptide-Au[I] Compound) 提交 2023-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 BBB 17–103（87 aa）
链 FFF 17–103（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0].
分辨率 2.60 Å R-free 0.262
8Q3E High Resolution Structure of Nucleosome Core with Bound Foamy Virus GAG Peptide 提交 2023-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 BBB 17–103（87 aa）
链 FFF 17–103（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]
分辨率 2.17 Å R-free 0.270
8Q3M Structure of Nucleosome Core with a Bound Kaposi Sarcoma Associated Herpesvirus LANA Peptide Having a Methionine to Ornithine Substitution 提交 2023-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 BBB 17–103（87 aa）
链 FFF 17–103（87 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]
分辨率 2.50 Å R-free 0.268
8Q3X Structure of Nucleosome Core with a Bound Metallopeptide Conjugate (Kaposi Sarcoma Associated Herpesvirus LANA Peptide-Au[I] Compound) 提交 2023-08-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 BBB 17–103（87 aa）
链 FFF 17–103（87 aa）
未记录 AU GOLD ION × 1 XIS 4-diphenylphosphanylbenzoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]
分辨率 2.30 Å R-free 0.262
8QZM Structure of DNMT3A1 UDR region bound to H2AK119ub nucleosome 提交 2023-10-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5, 65 mM NaCl, 1 mM DTT, 0.1 mM S-Adenosyl methionine
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric
链 O 1–103（103 aa）
链 U 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8RGM Cryo-EM structure of nucleosome containing Widom603 DNA 提交 2023-12-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8SB6 Structure of human BRD2-BD1 bound to a histone H4 acetyl-methyllysine peptide 提交 2023-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–16（15 aa） 片段：N-terminal peptide (UNP residues 2-16)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 20-25% PEG5000 MME, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.204
8SB6 Structure of human BRD2-BD1 bound to a histone H4 acetyl-methyllysine peptide 提交 2023-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2–16（15 aa） 片段：N-terminal peptide (UNP residues 2-16)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES, pH 6.7, 20-25% PEG5000 MME, 0.2 M ammonium sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.204
8SMW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 1) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8SMX Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 2) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SMY Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 3) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SMZ Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (Class 4) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SN0 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 5) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SN1 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 6) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8SN2 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8SN3 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8SN4 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SN5 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 3) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8SN6 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 4) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SN7 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 5) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SN8 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 6) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SN9 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8SNA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8SPS High resolution structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site a and site b 提交 2023-05-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8SPU Structure of ESRRB nucleosome bound OCT4 at site c 提交 2023-05-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8SYP Genomic CX3CR1 nucleosome 提交 2023-05-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8TGP Crystal structure of SIRT2 with FAM-PEG4-H4K16(myristoyl) peptide 提交 2023-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 9–21（13 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M MES monohydrate pH 6.5 (NaOH), 20% w/v PEG 4,000
分辨率 1.76 Å R-free 0.230
8TXV Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 1) 提交 2023-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8TXW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 2) 提交 2023-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8TXX Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 3) 提交 2023-08-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8U13 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 1) 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8U14 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 2) 提交 2023-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8U9S Cryo-EM structure of NRCAM nucleosome aided by scFv 提交 2023-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8UBJ Cryo-EM structure of NRCAM nucleosome aided by scFv (3D Flex map) 提交 2023-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8UBK Cryo-EM structure of Ascl1/E12a in complex with NRCAM nucleosome 提交 2023-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8UBL Cryo-EM structure of Ascl1/E12a in complex with NRCAM nucleosome (3D Flex map) 提交 2023-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8UPF Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168-UbcH5c 提交 2023-10-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8VFX Cryo-EM structure of 186bp ALBN1 nucleosome aided by scFv 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
8VFY Cryo-EM structure of FoxA1 in complex with ALBN1 nucleosome (class 1) 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
8VFZ Cryo-EM structure of FoxA1 in complex with ALBN1 nucleosome (class 2) 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8VG0 Cryo-EM structure of GATA4 in complex with ALBN1 nucleosome 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
8VG1 Cryo-EM structure of FoxA1 and GATA4 in complex with ALBN1 nucleosome 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.48 Å
8VG2 Cryo-EM structure of FoxA1 and GATA4 in complex with H14 chromatosome 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8VLR Cryo-EM structure of native H2AK119bu nucleosome at 2.6 提交 2024-01-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 20–103（84 aa）
链 F 20–103（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl, pH 7.5, 50 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8VMJ H3K4me3 nucleosome bound to PRC2_AJ119-450 提交 2024-01-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 J 1–103（103 aa）
链 Q 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VMN H3K4me3 nucleosome bound to PRC2_AJ1-450 提交 2024-01-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 J 1–103（103 aa）
链 Q 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8VO0 H3K36me3-modified nucleosome bound to PRC2_AJ1-450 with histone H3 tail disengaged 提交 2024-01-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 J 26–103（78 aa）
链 Q 25–103（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VOB H3K36me3-modified nucleosome bound to PRC2_AJ1-450 提交 2024-01-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 J 1–103（103 aa）
链 Q 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VWS Nucleosome containing 8oxoG at SHL-6 提交 2024-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；50 mM HEPES (pH-7.1), 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, and 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VWT OGG1 bound to a nucleosome containing 8oxoG at SHL-6 (composite map) 提交 2024-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；50 mM HEPES (pH-7.1), 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, and 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VWU Nucleosome containing 8oxoG at SHL4 提交 2024-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；50 mM HEPES (pH-7.1), 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, and 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8VWV OGG1 bound to a nucleosome containing 8oxoG at SHL4 (composite map) 提交 2024-02-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；50 mM HEPES (pH-7.1), 100 mM NaCl, 1 mM TCEP, and 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8W9D Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 1 提交 2023-09-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 K POTASSIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8W9E Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 2 提交 2023-09-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8W9F Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 3 提交 2023-09-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8WG5 Cryo-EM structure of USP16 bound to H2AK119Ub nucleosome 提交 2023-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 24–102（79 aa）
链 F 24–102（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 D 1–103（103 aa）
链 H 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 D 1–103（103 aa）
链 H 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 D 1–103（103 aa）
链 H 1–103（103 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8X7I Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub in complex with H2AK13Ub nucleosomes determined by intein-based E2-Ub-NCP conjugation strategy 提交 2023-11-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 20–102（83 aa）
链 F 20–102（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
8X7J Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub/nucleosomes complex determined by activity-based chemical trapping strategy 提交 2023-11-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 21–102（82 aa）
链 F 21–102（82 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
8X7K Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub in complex with H2AK13Ub nucleosomes determined by activity-based chemical trapping strategy (adjacent H2AK13/15 dual-monoubiquitination) 提交 2023-11-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 21–102（82 aa）
链 F 21–102（82 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
8XBT The cryo-EM structure of the octameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.12 Å
8XBU The cryo-EM structure of the decameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-12-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.24 Å
8XBW The cryo-EM structure of the RAD51 N-terminal lobe domain bound to the histone H4 tail of the nucleosome 提交 2023-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 b 2–103（102 aa）
链 f 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 b 2–103（102 aa）
链 f 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8Y3C Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (closed form) 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.21 Å
8Y3D Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (intermediate form2) 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
8Y3E Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (open form) 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.32 Å
8Y3F Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (intermediate form1) 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.54 Å
8YBJ Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence 提交 2024-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.38 Å
8YBK Cryo-EM structure of the human nucleosome containing the H3.1 E97K mutant 提交 2024-02-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.69 Å
8YE8 Crystal structure of mouse BAHCC1 TTD domain in complex with H4K20me1 peptide 提交 2024-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 15–26（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM MES, pH 6.5, 10 mM Li2SO4, 8% PEG20000 and 3 mM H4K20me
分辨率 1.90 Å R-free 0.238
8YJF Structure of human SPT16 MD-CTD and MCM2 HBD chaperoning a histone H3-H4 tetramer and an H2A-H2B dimer 提交 2024-03-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M calcium acetate, 0.1 M Sodium cacodylate pH 5.5, 12% (w/v) PEG 8000
分辨率 4.40 Å R-free 0.312
8YJM Structure of human SPT16 MD-CTD and MCM2 HBD chaperoning a histone H3-H4 tetramer and a single chain H2B-H2A chimera 提交 2024-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M sodium acetate, 0.1 M sodium citrate pH 5.5, 5%(w/v) PEG 4000
分辨率 4.15 Å R-free 0.286
8YNY Structure of Cas9-sgRNA ribonucleoprotein bound to nucleosome 提交 2024-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：13-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.52 Å
8YTI Crystal Structure of Nucleosome-H1x Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2024-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 L 1–103（103 aa）
链 P 1–103（103 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 8 CA CALCIUM ION × 52 K POTASSIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45 mM CaCl2, 25 mM KCl, 10 mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 2.70 Å R-free 0.267
8YV8 Cryo-EM structure of CDCA7 bound to nucleosome including hemimethylated CpG site in Widom601 positioning sequence. 提交 2024-03-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8Z50 Crystal structure of the ASF1-H3T-H4 complex 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M MES pH 6.0, 10% PEG 6000
分辨率 2.80 Å R-free 0.255
8ZJR Structure of nucleosome-bound RFX5 complex 提交 2024-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8ZJT Structure of free nucleosome 提交 2024-05-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9BE6 Cryo-EM structure of Human Nucleosome collected by Leginon on Krios at 3.0 Angstrom resolution 提交 2024-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 F 26–103（78 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9D3K Two Dsup molecules in complex with the nucleosome open from both sides 提交 2024-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 24–102（79 aa）
链 F 24–102（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9D3L Two Dsup molecules in complex with the nucleosome open from the left side 提交 2024-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 24–102（79 aa）
链 F 24–102（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9D3M Two HMGN2s in complex with the nucleosome 提交 2024-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 22–103（82 aa）
链 F 22–103（82 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9D3N 167-bp 5S rDNA nucleosome cross-linked with glutaraldehyde 提交 2024-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 25–103（79 aa）
链 F 25–103（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9D3O 167-bp 5S rDNA nucleosome - closed 提交 2024-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 22–103（82 aa）
链 F 22–103（82 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9D3P 167-bp 5S rDNA nucleosome - open I (open only on the downstream side) 提交 2024-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 22–103（82 aa）
链 F 22–103（82 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9D3Q 167-bp 5S rDNA nucleosome - open II 提交 2024-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 23–103（81 aa）
链 F 23–103（81 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9D3R 147-bp 5S rDNA nucleosome - closed 提交 2024-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 22–103（82 aa）
链 F 22–103（82 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9D3S 147-bp 5S rDNA nucleosome - open I (open on the downstream side) 提交 2024-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 22–103（82 aa）
链 F 22–103（82 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9D3T 147-bp 5S rDNA nucleosome cross-linked with glutaraldehyde 提交 2024-08-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 25–102（78 aa）
链 F 25–102（78 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9DWF Nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-4.5 提交 2024-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9DWG DNA Polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-4.5 (State 1, composite) 提交 2024-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9DWH DNA Polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-4.5 (State 2, composite) 提交 2024-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9DWI DNA Polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-4.5 (State 3, composite) 提交 2024-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：12-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9DWJ Nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-3.5 提交 2024-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9DWK DNA Polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-3.5 提交 2024-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：dodecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50 mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9DWL Nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-5.5 提交 2024-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9DWM DNA polymerase Beta bound to a nucleosome containing a 1-nt gap at SHL-5.5 提交 2024-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：dodecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.1；25mM HEPES (pH-7.1), 50mM NaCl, 1mM TCEP, and 5mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9E00 Cryo-EM structure of human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to di-nucleosome 提交 2024-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 N 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.75 Å
9E05 The consensus model of the cryo-EM structure of human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to di-nucleosome 提交 2024-10-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 N 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.00 Å
9E09 Cryo-EM structure a single nucleosome (2) focus of human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to di-nucleosome 提交 2024-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 N 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.72 Å
9E0R Cryo-EM structure of a single nucleosome (1) focus of human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to di-nucleosome 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9E2D Cryo-EM structure of human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to a di-nucleosome with a five base pair linker 提交 2024-10-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 N 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.08 Å
9E2F Cryo-EM structure of a di-nucleosome with a five base pair linker 提交 2024-10-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 N 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
9E2Q Cryo-EM structure of DNMT 3A2/3B3 tetramer in complex with a di-nucleosome with a six base pair linker 提交 2024-10-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 N 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
9E2R Cryo-EM structure of human DNMT3A2-DNMT3B3 complex bound to a di-nucleosome and an histone-3 peptide 提交 2024-10-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 N 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.71 Å
9E3D Cryo-EM structure of DNMT 3A2/3B3 tetramer in complex with a di-nucleosome with K120R mutant H2B 提交 2024-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 N 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9E3R Cryo-EM structure of PWWP domain deleted DNMT 3A2/3B3 in complex with a di-nucleosome 提交 2024-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 N 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 18 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
9E3U Cryo-EM structure of DNMT 3A2/3B3 tetramer bound to a di-nucleosome with a 25 base-pair linker 提交 2024-10-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
9E49 Cryo-EM structure of a di-nucleosome with an eight base-pair linker 提交 2024-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 N 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.93 Å
9ECP Structure of the native human NCP purified from HEK293 cells 提交 2024-11-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 22–103（82 aa）
链 F 22–103（82 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 1.91 Å
9EOZ Human OGG1 bound to a nucleosome core particle with 8-oxodGuo lesion at SHL6.0 提交 2024-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9FGQ Structure of human APC3loop 375-381 bound to the NCP 提交 2024-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPEs pH8.0, 50 mM NaCl, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9FH9 Structure of CyclinB1 N-terminus bound to the NCP 提交 2024-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
9GCG CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 N 2–103（102 aa）
链 R 2–103（102 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9GE4 CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 N 2–103（102 aa）
链 R 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.52 Å
9GE5 CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 N 23–103（81 aa）
链 R 26–103（78 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
9GEL CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 N 2–103（102 aa）
链 R 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.86 Å
9GEV CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 N 2–103（102 aa）
链 R 2–103（102 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
9GF6 CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 N 2–103（102 aa）
链 R 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9GFB CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 N 2–103（102 aa）
链 R 2–103（102 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9GFM CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 N 22–103（82 aa）
链 R 25–103（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9GMK SIRT7:H3K18DTU nucleosome complex 提交 2024-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9GMR SIRT7-H3K36MTUnucleosome complex 提交 2024-08-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 A1IY0 [[(2~{R},3~{a}~{R},5~{R},6~{R},6~{a}~{R})-2-(methylamino)-6-oxidanyl-2-(propylamino)-3~{a},5,6,6~{a}-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]oxathiol-5-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9GW2 State 2 MAP 1 SETD2 bound to proximal H3 of upstream nucleosome 提交 2024-09-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.84 Å
9GXA CENP-A/H4 di-tetrasome assembled on alpha-satellite DNA. 提交 2024-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 D 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
链 H 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.01 Å
9IGW Ku70/80 bound to 147 bp nucleosome 提交 2025-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
9IGX Ku70/80 bound to 153 bp nucleosome 提交 2025-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 B 18–101（84 aa）
链 F 18–101（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9IPU cryo-EM structure of the RNF168(1-193)/UbcH5c-Ub ubiquitylation module bound to H1.0-K63-Ub3 modified chromatosome 提交 2024-07-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9J8M Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (High mobility complex) 提交 2024-08-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
9J8N Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (Low mobility complex) 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：32-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.14 Å
9J8O Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-H1-nucleosome complex 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.05 Å
9J8W Cryo-EM structure of NCP-UV-DDB complex containing CPD 提交 2024-08-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
9JC6 Human H2BW2 nucleosome 提交 2024-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
9K9L Cryo-EM structure of the human CENP-A-H4 octasome. 提交 2024-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 D 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 H 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
9KQO cryo-EM structure of RNF20/RNF40-RAD6A-Ub in complex with H2BS112GlcNAc nucleosome 提交 2024-11-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 F 2–103（102 aa）
链 L 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
9L1X hDEK-nucleosome complex (conformation 1) 提交 2024-12-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
9L22 hDEK-nucleosome complex (conformation 2) 提交 2024-12-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9MLL GammaH2AX containing nucleosomes, Parallel stack 提交 2024-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 M 1–103（103 aa）
链 Q 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9MLN GammaH2AX containing nucleosome, Canonical (Class 1) 提交 2024-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9MLR GammaH2AX containing nucleosome, Half-wrapped (Class 2) 提交 2024-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9MLS GammaH2AX containing nucleosome, Extended (Class 3) 提交 2024-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MMK H2AX containing nucleosome, Canonical (Class 1) 提交 2024-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9MMM H2AX containing nucleosomes, Parallel stack 提交 2024-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 M 1–103（103 aa）
链 Q 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9MMN H2AX containing nucleosomes, Left offset stack 提交 2024-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 M 1–103（103 aa）
链 Q 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MMO H2AX containing nucleosomes, Right offset stack 提交 2024-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 M 1–103（103 aa）
链 Q 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9MMT H2AX containing nucleosome, Unwrapped (Class 2) 提交 2024-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9NQU KDM6B-nucleosome structure stabilized by H3K27C-UNC8015 covalent conjugate 提交 2025-03-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 OH0 N-heptanoyl-N-hydroxy-beta-alanine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.16 Å
9OGR Cryo-EM analysis of human H2A.Z on methylated Sat2R-P DNA (v1) 提交 2025-05-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
9OGS Cryo-EM analysis of human H2A.Z on Sat2R-P DNA (v1) 提交 2025-05-01 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9OGZ Cryo-EM analysis of human H2A.Z on Sat2R-P DNA (v2) 提交 2025-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9OH0 Cryo-EM analysis of human H2A.Z on methylated Sat2R-P DNA (v2) 提交 2025-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
9OH1 Cryo-EM analysis of human H2A.Z on 601L DNA 提交 2025-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9OH2 Cryo-EM analysis of human H2A.Z on methylated 601L DNA 提交 2025-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
9Q80 Ku70/80 with Ku70 linker and SAP domain bound to a 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-02-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9Q8X Ku70/80 bound to a 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-02-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
9Q9F DNA-PK bound to a 153 bp H2AX nucleosome model 1 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.54 Å
9QCR DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome model 2 提交 2025-03-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.37 Å
9QCS Ku80 mediated DNA-PK dimer bound to 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：26-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.38 Å
9QMS DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome with ATPyS 提交 2025-03-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：30-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9R04 p53 bound to the nucleosome at position SHL-5.7 (crosslinked sample) 提交 2025-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9R2M p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (non-crosslinked sample, composite map) 提交 2025-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9R2P p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (crosslinked sample) 提交 2025-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
9R2Q p53 bound to nucleosome at position SHL-5.7 (non-crosslinked sample) 提交 2025-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9RZC State 3 MAP 1 SETD2 bound to distal H3 of upstream nucleosome 提交 2025-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.53 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
9TAX Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a mono-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric
链 d 1–103（103 aa）
链 h 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
9TAY Structure of the human inner kinetochore CCAN bound to a di-CENP-A nucleosome 提交 2025-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 d 1–103（103 aa）
链 h 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 15.50 Å
9U5U The 1:1 cryo-EM structure of BAP1/ASXL1-K351Ub in complex with H2AK119Ub nucleosome 提交 2025-03-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
9UJS RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-4) of the H3-H4 octasome 提交 2025-04-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 d 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
链 h 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9UJT RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-0.5) of the H3-H4 octasome (tetrasome) 提交 2025-04-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 f 1–103（103 aa）
链 h 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.54 Å
9UZ7 Cryo-EM structure of the nucleosome core particle with site-specific DNA-histone crosslinking 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–103（102 aa）
链 D 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；10 mM HEPES, pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率未提供
9V6Q Cryo-EM structure of two cPRC1 complexes bound to opposite faces of an endogenous 147-bp mono-nucleosome 提交 2025-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.60 Å
9V6S Cryo-EM structure of a single cPRC1 complex engaged on one face of an endogenous 147-bp mononucleosome 提交 2025-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
9V6X Cryo-EM structure of the cPRC1 complex bound to an endogenous 184-bp mono-nucleosome 提交 2025-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.00 Å
9V8L Cryo-EM structure of the cPRC1-di-nucleosome (loose) complex 提交 2025-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 S 1–103（103 aa）
链 T 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 6.60 Å
9V9H Cryo-EM structure of the cPRC1-di-nucleosome (tight) complex 提交 2025-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 Q 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.50 Å
9V9P Cryo-EM structure of the cPRC1-di-nucleosome (CBX7) complex 提交 2025-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 B 1–103（103 aa）
链 F 1–103（103 aa）
链 Q 1–103（103 aa）
链 R 1–103（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.40 Å
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 b 1–103（103 aa）
链 f 1–103（103 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9XSF Cryo-EM structure of H4S47GlcNAc nucleosome at 3.39 angstrom 提交 2025-11-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.39 Å
9Y46 Human nucleosome structure on Nickel-NTA lipid affinity grid (C2 refinement) 提交 2025-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.59 Å
9Y47 Human nucleosome structure on Nickel-NTA lipid affinity grid (C1 refinement) 提交 2025-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.74 Å
9YL3 State 1 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å
9YLE State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.63 Å
9YLY MLL4FC bound to a nucleosome with p53 RE 提交 2025-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.77 Å
9YM8 State 2 focused on PHD FYR of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.43 Å
9YMF State 2 focused on H3 N terminal tail of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 B 2–103（102 aa）
链 F 2–103（102 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.45 Å
9ZEN Competition for different elements of the nucleosome acidic patch yields distinct functional outcomes. VHH 1B2 提交 2025-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 B 25–103（79 aa）
链 F 25–103（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES pH7.6, 50 mM NaCl, 0.5 mM MgCl2, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
9ZEO Competition for different elements of the nucleosome acidic patch yields distinct functional outcomes. VHH 1G1 提交 2025-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 B 21–103（83 aa）
链 F 21–103（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES pH7.6, 50 mM NaCl, 0.5 mM MgCl2, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 581 个其他 PDB 条目、633 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 27
链与序列区间 作者链 b； PDB构建体 4–106； UniProt 1–103 作者链 f； PDB构建体 4–106； UniProt 1–103

Histone H2A type 1-B/E

Homo sapiens

UniProt P04908

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 g； UniProt 1–130 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2RVQ Solution structure of the isolated histone H2A-H2B heterodimer 提交 2016-03-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；293 K；离子强度（mmCIF原始值）400；压力 ambient
NMR样品组成 0.1-0.3 mM [U-13C; U-15N; U-2H] entity_1-1, 0.1-0.3 mM [U-13C; U-15N; U-2H] entity_2-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3A6N The nucleosome containing a testis-specific histone variant, human H3T 提交 2009-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
3AFA The human nucleosome structure 提交 2010-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.270
3AN2 The structure of the centromeric nucleosome containing CENP-A 提交 2010-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.60 Å R-free 0.325
3AV1 The human nucleosome structure containing the histone variant H3.2 提交 2011-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.290
3AV2 The human nucleosome structure containing the histone variant H3.3 提交 2011-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.272
3AYW Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K56Q mutation 提交 2011-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.90 Å R-free 0.273
3AZE Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K64Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.302
3AZF Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K79Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.263
3AZG Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K115Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.40 Å R-free 0.269
3AZH Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K122Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.49 Å R-free 0.266
3AZI Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K31Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
3AZJ Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K44Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.89 Å R-free 0.268
3AZK Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K59Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3AZL Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K77Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
3AZM Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K79Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.89 Å R-free 0.296
3AZN Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K91Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.254
3W96 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H2A N-terminal region 提交 2013-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 11–130（120 aa） 片段：UNP residues 11-130
链 G 11–130（120 aa） 片段：UNP residues 11-130
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.296
3W97 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H2B N-terminal region 提交 2013-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.321
3W98 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H3.1 N-terminal region 提交 2013-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.42 Å R-free 0.303
3W99 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H4 N-terminal region 提交 2013-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.312
3WKJ The nucleosome containing human TSH2B 提交 2013-10-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.291
3WTP Crystal Structure of the heterotypic nucleosome containing human CENP-A and H3.3 提交 2014-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.67 Å R-free 0.270
3X1S Crystal structure of the nucleosome core particle 提交 2014-11-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70mM KCL, 70-90mM MnCl2, 24% MPD, 20mM Na-Cacodylate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.81 Å R-free 0.270
3X1V Crystal structure of nucleosome core particle in the presence of histone variant involved in reprogramming 提交 2014-11-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 19 CL CHLORIDE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；60-70 mM KCl, 70-90 mM MnCl2, Na-cocodylate, 24% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.92 Å R-free 0.259
4YM5 Crystal structure of the human nucleosome containing 6-4PP (inside) 提交 2015-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 4.00 Å R-free 0.289
4YM6 Crystal structure of the human nucleosome containing 6-4PP (outside) 提交 2015-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 3.51 Å R-free 0.287
4Z5T The nucleosome containing human H3.5 提交 2015-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.80 Å R-free 0.269
5AV5 human nucleosome core particle 提交 2015-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.233
5AV6 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.229
5AV8 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.233
5AV9 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.239
5AVB human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.236
5AVC human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.238
5AY8 Crystal structure of human nucleosome containing H3.Y 提交 2015-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；sodium acetate, manganese chloride, 2-propanol, trimethylamine N-oxide
分辨率 2.80 Å R-free 0.249
5B0Y Crystal structure of the nucleosome containing histone H3 with the crotonylated lysine 122 提交 2015-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.56 Å R-free 0.249
5B0Z The crystal structure of the nucleosome containing H3.2, at 1.98 A resolution 提交 2015-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 1.99 Å R-free 0.254
5B24 The crystal structure of the nucleosome containing cyclobutane pyrimidine dimer 提交 2015-12-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 3.60 Å R-free 0.249
5B2I Human nucleosome containing CpG unmethylated DNA 提交 2016-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 3.00 Å R-free 0.257
5B2J Human nucleosome containing CpG methylated DNA 提交 2016-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.60 Å R-free 0.252
5B31 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.1. 提交 2016-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.271
5B32 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.3. 提交 2016-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.35 Å R-free 0.259
5B40 The nucleosome structure containing H2B-K120 and H4-K31 monoubiquitinations 提交 2016-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；90mM Tris-HCl (pH 7.8), 3.6% PGA-LM, 25.2% PEG 400, 2-6% Pentaerythritol ethoxylate (3/4 EO/OH)
分辨率 3.33 Å R-free 0.263
5CPI Nucleosome containing unmethylated Sat2R DNA 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.90 Å R-free 0.295
5CPJ Nucleosome containing methylated Sat2R DNA 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 3.15 Å R-free 0.295
5CPK Nucleosome containing methylated Sat2L DNA 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.63 Å R-free 0.284
5GSE Crystal structure of unusual nucleosome 提交 2016-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；potassium bromide, potassium thiocyanate, Tris-HCl, PGA-LM, PEG 400
分辨率 3.14 Å R-free 0.255
5GTC Crystal structure of complex between DMAP-SH conjugated with a Kaposi's sarcoma herpesvirus LANA peptide (5-15) and nucleosome core particle 提交 2016-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.267
5GXQ The crystal structure of the nucleosome containing H3.6 提交 2016-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.85 Å R-free 0.262
5JRG Crystal structure of the nucleosome containing the DNA with tetrahydrofuran (THF) 提交 2016-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
5VEY Solution NMR structure of histone H2A-H2B mono-ubiquitylated at H2A Lys15 in complex with RNF169 (653-708) 提交 2017-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 13–106（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM KCl；压力 1
NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM KCl；压力 1
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5X7X The crystal structure of the nucleosome containing H3.3 at 2.18 angstrom resolution 提交 2017-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.18 Å R-free 0.256
5XF3 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (R,R-configuration) 提交 2017-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 RRK (1R,2R)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55 mM MnCl2, 25-49 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.270
5XF4 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (S,S-configuration) 提交 2017-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 SSK (1S,2S)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55 mM MnCl2, 25-49 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0
分辨率 2.87 Å R-free 0.266
5XF5 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (R,S-configuration) 提交 2017-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 RSK (1S,2R)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55mM MnCl2, 25-49mM KCl, 20mM K-Cacodylate pH 6.0
分辨率 2.82 Å R-free 0.264
5Y0C Crystal Structure of the human nucleosome at 2.09 angstrom resolution 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 10 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.09 Å R-free 0.249
5Y0D Crystal Structure of the human nucleosome containing the H2B E76K mutant 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 1.99 Å R-free 0.252
5Z23 Crystal structure of the nucleosome containing a chimeric histone H3/CENP-A CATD 提交 2017-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
突变：L51M,L58M,L93M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L51M,L58M,L93M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.73 Å R-free 0.261
5ZBX The crystal structure of the nucleosome containing histone H3.1 CATD(V76Q, K77D) 提交 2018-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.58 Å R-free 0.249
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6BUZ Cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with kinetochore protein CENP-N 提交 2017-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
6E0C Cryo-EM structure of the CENP-A nucleosome (W601) in complex with a single chain antibody fragment 提交 2018-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
6E0P Cryo-EM structure of the centromeric nucleosome (Native alpha satellite DNA) in complex with a single chain antibody fragment 提交 2018-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 sec before plunging
分辨率 2.60 Å
6HKT Structure of an H1-bound 6-nucleosome array 提交 2018-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：50-meric
链 0 1–130（130 aa）
链 2 1–130（130 aa）
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 W 1–130（130 aa）
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
链 m 1–130（130 aa）
链 q 1–130（130 aa）
链 w 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293.15 K；15% MPD, 0.1 M NaCl and 0.1 M Tris pH 8.8
分辨率 9.70 Å R-free 0.286
6HTS Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to nucleosome 提交 2018-10-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 K 1–130（130 aa）
链 O 1–130（130 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IPU Human nucleosome core particle containing 145 bp of DNA 提交 2018-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 14–120（107 aa）
链 G 14–120（107 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate
分辨率 1.99 Å R-free 0.263
6IQ4 Nucleosome core particle cross-linked with a hetero-binuclear molecule possessing RAPTA and gold(I) 4-(diphenylphosphino)benzoic acid groups. 提交 2018-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 15–120（106 aa）
链 G 15–120（106 aa）
未记录 AU GOLD ION × 1 XIS 4-diphenylphosphanylbenzoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 D0X [Ru(eta(6)-p-cymene)Cl-2(pta) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate
分辨率 2.25 Å R-free 0.257
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6JR0 Crystal structure of the human nucleosome phased with 12 selenium atoms 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
突变：L65M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L65M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.50 Å R-free 0.253
6JR1 Crystal structure of the human nucleosome phased with 16 selenium atoms 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
突变：L65M, L85M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L65M, L85M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.243
6JXD Human nucleosome core particle with cohesive end DNA termini 提交 2019-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 14–119（106 aa）
链 G 14–119（106 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate
分辨率 2.25 Å R-free 0.292
6KE9 The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 15–119（105 aa）
链 G 15–119（105 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose
分辨率 2.22 Å R-free 0.230
6KXV Crystal structure of a nucleosome containing Leishmania histone H3 提交 2019-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium acetate, isopropanol, manganese chloride, trimethylamine N-oxide
分辨率 3.63 Å R-free 0.264
6L49 H3-CA-H3 tri-nucleosome with the 22 base-pair linker DNA 提交 2019-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 U 1–130（130 aa）
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 18.90 Å
6L4A H3-H3-H3 tri-nucleosome with the 22 base-pair linker DNA 提交 2019-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 U 1–130（130 aa）
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.30 Å
6L9H The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 15–119（105 aa）
链 G 15–119（105 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose
分辨率 2.60 Å R-free 0.278
6L9Z 338 bp di-nucleosome assembled with linker histone H1.X 提交 2019-11-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 8 CA CALCIUM ION × 65 K POTASSIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
6LA2 343 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：38-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 W 1–130（130 aa）
链 a 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
链 k 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Sodium acetate
分辨率 3.89 Å R-free 0.267
6LA8 349 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 23 K POTASSIUM ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate (cryo-25% MPD)
分辨率 3.40 Å R-free 0.265
6LA9 349 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 (high cryoprotectant) 提交 2019-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 40 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate
分辨率 3.70 Å R-free 0.266
6LAB 169 bp nucleosome, harboring cohesive DNA termini, assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 20 K POTASSIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate
分辨率 3.20 Å R-free 0.262
6LE9 The Human Telomeric Nucleosome Displays Distinct Structural and Dynamic Properties 提交 2019-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 15–119（105 aa）
链 G 15–119（105 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；Manganase chloride, potassium chloride, potassium cacodylate, MPD and trehalose
分辨率 2.60 Å R-free 0.281
6LER 169 bp nucleosome harboring non-identical cohesive DNA termini. 提交 2019-11-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate
分辨率 3.00 Å R-free 0.261
6LER 169 bp nucleosome harboring non-identical cohesive DNA termini. 提交 2019-11-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 8 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate
分辨率 3.00 Å R-free 0.261
6M3V 355 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini 提交 2020-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate, Poly glutamic acid
分辨率 4.60 Å R-free 0.261
6M44 355 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini (high cryoprotectant) 提交 2020-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate, Poly glutamic acid
分辨率 3.81 Å R-free 0.286
6O1D Cryo-EM structure of the centromeric nucleosome with native alpha satellite DNA 提交 2019-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 sec before plunging
分辨率 3.40 Å
6R8Y Cryo-EM structure of NCP-6-4PP(-1)-UV-DDB 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6R8Z Cryo-EM structure of NCP_THF2(-1)-UV-DDB 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6R90 Cryo-EM structure of NCP-THF2(+1)-UV-DDB class A 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6R91 Cryo-EM structure of NCP_THF2(-3)-UV-DDB 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6R92 Cryo-EM structure of NCP-THF2(+1)-UV-DDB class B 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6R93 Cryo-EM structure of NCP-6-4PP 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6R94 Cryo-EM structure of NCP_THF2(-3) 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6T79 Structure of a human nucleosome at 3.2 A resolution 提交 2019-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.
分辨率 3.20 Å
6T7A Structure of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.
分辨率 3.70 Å
6T7B Structure of human Sox2 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.
分辨率 5.10 Å
6T7C Structure of two copies of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.
分辨率 4.00 Å
6T7D Structure of human Sox11 transcription factor in complex with a nucleosome 提交 2019-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger.
分辨率 4.40 Å
6T90 OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2019-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
6T93 Nucleosome with OCT4-SOX2 motif at SHL-6 提交 2019-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
6V92 RSC-NCP 提交 2019-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 20.00 Å
6YOV OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 提交 2020-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
7BWD Structure of Dot1L-H2BK34ub Nucleosome Complex 提交 2020-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.32 Å
7BXT The cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with CENP-C peptide and CENP-N N-terminal domain 提交 2020-04-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7BY0 The cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with the phosphorylated CENP-C 提交 2020-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7C0M Human cGAS-nucleosome complex 提交 2020-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
链 c 2–130（129 aa）
链 g 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7CCQ Structure of the 1:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 16–118（103 aa）
链 G 16–118（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7CCR Structure of the 2:2 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 C 16–118（103 aa）
链 G 16–118（103 aa）
链 N 16–118（103 aa）
链 R 16–118（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
7COW 353 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini with linker histone H1.0 提交 2020-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 3 K POTASSIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；potassium acetate, calcium chloride, potassium chloride
分辨率 2.86 Å R-free 0.297
7D1Z Cryo-EM structure of SET8-nucleosome complex 提交 2020-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
7D20 Cryo-EM structure of SET8-CENP-A-nucleosome complex 提交 2020-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7DBP Linker histone defines structure and self-association behaviour of the 177 bp human chromosome 提交 2020-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7K5X Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.0 提交 2020-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
7K5Y Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.4 提交 2020-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7K60 Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.10 提交 2020-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
7K61 Cryo-EM structure of 197bp nucleosome aided by scFv 提交 2020-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
7K63 Cryo-EM structure of a chromatosome containing chimeric linker histone gH1.10-ncH1.4 提交 2020-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
7LYA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle with linked histone proteins H2A and H2B 提交 2021-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 13–130（118 aa）
链 G 13–130（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
7LYB Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with BRCA1-BARD1-UbcH5c 提交 2021-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 13–130（118 aa）
链 G 13–130（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
7LYC Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A Lys13 and Lys15 in complex with BARD1 (residues 415-777) 提交 2021-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 13–130（118 aa）
链 G 13–130（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
7NL0 Cryo-EM structure of the Lin28B nucleosome core particle 提交 2021-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7PET The 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
链 m 1–130（130 aa）
链 q 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.50 Å
7PEU Trinucleosome of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7PEV Nucleosome stack of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.00 Å
7PEW Nucleosome 1 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
7PEX Nucleosome 2 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
7PEY Nucleosome 3 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7PEZ Nucleosome 4 of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 m 1–130（130 aa）
链 q 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
7PF0 Trinucleosome of the 4x177 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.00 Å
7PF2 Nucleosome stack of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
7PF3 Nucleosome 4 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 m 1–130（130 aa）
链 q 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7PF4 Nucleosome 3 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7PF5 Nucleosome 2 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7PF6 Nucleosome 1 of the 4x187 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7PFA Trinucleosome of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.70 Å
7PFC Nucleosome stack of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
7PFD Nucleosome 1 of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7PFE Nucleosome 2 of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7PFF Nucleosome 3 of the 4x197 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7PFT Trinucleosome of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.80 Å
7PFU Nucleosome stack of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
7PFV Nucleosome 1 of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7PFW Nucleosome 2 of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
7PFX Nucleosome 3 of the 4x207 nucleosome array containing H1 提交 2021-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7V90 Telomeric mononucleosome 提交 2021-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7V96 Telomeric Dinucleosome 提交 2021-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
7V99 catalytic core of human telomerase holoenzyme 提交 2021-08-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 K 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
7V9C Telomeric Dinucleosome in open state 提交 2021-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7V9J Telomeric trinucleosome 提交 2021-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 U 1–130（130 aa）
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.00 Å
7V9K Telomeric tetranucleosome 提交 2021-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 U 1–130（130 aa）
链 Y 1–130（130 aa）
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.10 Å
7V9S Telomeric trinucleosome in open state 提交 2021-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 U 1–130（130 aa）
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.00 Å
7VA4 Telomeric tetranucleosome in open state 提交 2021-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：34-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 U 1–130（130 aa）
链 Y 1–130（130 aa）
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 14.00 Å
7VZ4 Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601L DNA sequence 提交 2021-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 1.89 Å
7W9V Cryo-EM structure of nucleosome in complex with p300 acetyltransferase catalytic core (complex I) 提交 2021-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 c 2–130（129 aa）
链 g 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 c 2–130（129 aa）
链 g 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 c 2–130（129 aa）
链 g 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XD1 cryo-EM structure of unmodified nucleosome 提交 2022-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 11–119（109 aa）
链 G 11–119（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7XVL Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169an DNA fragment) 提交 2022-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 W 1–130（130 aa）
链 a 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.51 Å R-free 0.280
7XVL Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169an DNA fragment) 提交 2022-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
链 k 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.51 Å R-free 0.280
7XVM Crystal Structure of Nucleosome-H5 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 18 CL CHLORIDE ION × 3 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 2.84 Å R-free 0.259
7XX5 Crystal Structure of Nucleosome-H1.3 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.19 Å R-free 0.259
7XX6 Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 21 K POTASSIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.39 Å R-free 0.296
7XX6 Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric
链 W 1–130（130 aa）
链 a 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
链 k 1–130（130 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 26 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.39 Å R-free 0.296
7XZX Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 DNA-binding domain 提交 2022-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.53 Å
7XZY Cryo-EM structure of the nucleosome containing 193 base-pair DNA with a p53 target sequence 提交 2022-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.97 Å
7XZZ Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 提交 2022-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7Y00 Cryo-EM structure of the nucleosome containing 169 base-pair DNA with a p53 target sequence 提交 2022-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.96 Å
7Y7I chicken KNL2 in complex with the CENP-A nucleosome 提交 2022-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
突变：L51M, L58M, L93M 突变：L51M, L58M, L93M 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
7ZI4 Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome 提交 2022-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–130（130 aa）
链 O 1–130（130 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4uL of sample applied to Quantifoil R2/2 Cu 300 mesh grids. blot parameters were wait time 30 sec, blot time 0.5 sec, blot force -8
分辨率 3.20 Å
8G57 Structure of nucleosome-bound Sirtuin 6 deacetylase 提交 2023-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；12.5 mM HEPES pH 7.5, 60 mM KCl, 1.5% glycerol, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
8GRM Cryo-EM structure of PRC1 bound to H2AK119-UbcH5b-Ub nucleosome 提交 2022-09-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 C 12–120（109 aa）
链 G 12–120（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HAG Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (3.2 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8HAH Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (3.9 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8HAI Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (4.7 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8HAJ Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (4.8 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8HAK Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 4 (4.5 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8HAL Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8HAM Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8HAN Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 3 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8HQY Cryo-EM structure of SSX1 bound to the H2AK119Ub nucleosome at a resolution of 3.05 angstrom 提交 2022-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 14–119（106 aa）
链 G 14–119（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8HR1 Cryo-EM structure of SSX1 bound to the unmodified nucleosome at a resolution of 3.02 angstrom 提交 2022-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 C 14–119（106 aa）
链 G 14–119（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
8I17 Structural basis for H2A-H2B recognitions by human Spt16 提交 2023-01-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 14–113（100 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.98 Å R-free 0.211
8I17 Structural basis for H2A-H2B recognitions by human Spt16 提交 2023-01-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 14–113（100 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.98 Å R-free 0.211
8I17 Structural basis for H2A-H2B recognitions by human Spt16 提交 2023-01-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 14–113（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.98 Å R-free 0.211
8IEG Bre1(mRBD-RING)/Rad6-Ub/nucleosome complex 提交 2023-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 11–119（109 aa）
链 G 11–119（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8IEJ RNF20-RNF40/hRad6A-Ub/nucleosome complex 提交 2023-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 11–119（109 aa）
链 G 11–119（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
8IHL Overlapping tri-nucleosome 提交 2023-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 O 1–130（130 aa）
链 S 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.64 Å
8JBX Human canonical 601 DNA nucleosome 提交 2023-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
8JCC Human histone H2B variant H2BFWT Cryo-EM structure with 601 DNA sequence 提交 2023-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
8JCD Human H2BFWTH100R nucleosome with 601 DNA 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8JHG Native SUV420H1 bound to 167-bp nucleosome 提交 2023-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 16–130（115 aa）
链 G 16–130（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blotted for 3 s before being plunged into liquid ethane
分辨率 3.58 Å
8JL9 Cryo-EM structure of the human nucleosome with scFv 提交 2023-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
8JLA Cryo-EM structure of the human nucleosome lacking N-terminal region of H2A, H2B, H3, and H4 提交 2023-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 11–130（120 aa）
链 G 11–130（120 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8JLB Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing H3.2 C110A mutant 提交 2023-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.36 Å
8JLD Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing acetylated H3 tail 提交 2023-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.48 Å
8JND The cryo-EM structure of the nonameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
8JNE The cryo-EM structure of the decameric RAD51 ring bound to the nucleosome without the linker DNA binding 提交 2023-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.68 Å
8JNF The cryo-EM structure of the RAD51 filament bound to the nucleosome 提交 2023-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.91 Å
8KB5 Cryo-EM structure of the human nucleosome containing H3.8 提交 2023-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.26 Å
8KCY Structure of nucleosome complexed with two DEK molecules 提交 2023-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8KD1 Structure of nucleosome complexed with one DEK molecule 提交 2023-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8KE0 Structure of H1.2 bound to the nucleosome 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8OSJ Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL-6.2 (DNA conformation 1) 提交 2023-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
8OSK Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL+5.8 (composite map) 提交 2023-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8OSL Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to the native Por enhancer nucleosome (map 2, additional 3D classification and flexible refinement) 提交 2023-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
8OTS OCT4 and MYC-MAX co-bound to a nucleosome 提交 2023-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8OTT MYC-MAX bound to a nucleosome at SHL+5.8 提交 2023-04-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 9–117（109 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8Q36 Structure of Nucleosome Core with a Bound Metallopeptide Conjugate (Foamy Virus GAG Peptide-Au[I] Compound) 提交 2023-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 CCC 14–120（107 aa）
链 GGG 14–120（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0].
分辨率 2.60 Å R-free 0.262
8Q3E High Resolution Structure of Nucleosome Core with Bound Foamy Virus GAG Peptide 提交 2023-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 CCC 14–120（107 aa）
链 GGG 14–120（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]
分辨率 2.17 Å R-free 0.270
8Q3M Structure of Nucleosome Core with a Bound Kaposi Sarcoma Associated Herpesvirus LANA Peptide Having a Methionine to Ornithine Substitution 提交 2023-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 CCC 14–120（107 aa）
链 GGG 14–120（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]
分辨率 2.50 Å R-free 0.268
8Q3X Structure of Nucleosome Core with a Bound Metallopeptide Conjugate (Kaposi Sarcoma Associated Herpesvirus LANA Peptide-Au[I] Compound) 提交 2023-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 CCC 14–120（107 aa）
链 GGG 14–120（107 aa）
未记录 AU GOLD ION × 1 XIS 4-diphenylphosphanylbenzoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Buffers containing MnCl2, KCl and K-cacodylate [pH 6.0]
分辨率 2.30 Å R-free 0.262
8RGM Cryo-EM structure of nucleosome containing Widom603 DNA 提交 2023-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8SMW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 1) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8SMX Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 2) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SMY Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 3) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SMZ Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (Class 4) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SN0 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 5) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SN1 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 6) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8SN2 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8SN3 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8SN4 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SN5 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 3) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8SN6 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 4) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SN7 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 5) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SN8 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 6) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SN9 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8SNA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：R11S, K15C 突变：R11S, K15C ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8TXV Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 1) 提交 2023-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：K13S 突变：K13S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8TXW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 2) 提交 2023-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：K13S 突变：K13S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8TXX Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A K15 in complex with RNF168 (Class 3) 提交 2023-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 12–130（119 aa）
链 G 12–130（119 aa）
突变：K13S 突变：K13S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8U13 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 1) 提交 2023-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 13–130（118 aa）
链 G 13–130（118 aa）
突变：K13S 突变：K13S ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8U14 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 2) 提交 2023-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 13–130（118 aa）
链 G 13–130（118 aa）
突变：K13S 突变：K13S ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8U9S Cryo-EM structure of NRCAM nucleosome aided by scFv 提交 2023-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8UBJ Cryo-EM structure of NRCAM nucleosome aided by scFv (3D Flex map) 提交 2023-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8UBK Cryo-EM structure of Ascl1/E12a in complex with NRCAM nucleosome 提交 2023-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8UBL Cryo-EM structure of Ascl1/E12a in complex with NRCAM nucleosome (3D Flex map) 提交 2023-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8UPF Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168-UbcH5c 提交 2023-10-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 13–130（118 aa）
链 G 13–130（118 aa）
突变：R11S 突变：R11S ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8UQ8 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 2-residue linker 提交 2023-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 13–106（94 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 7 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (9.5 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl
分辨率 2.34 Å R-free 0.236
8UQ8 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 2-residue linker 提交 2023-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 a 13–106（94 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 14 GOL GLYCEROL × 2 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (9.5 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl
分辨率 2.34 Å R-free 0.236
8UQ9 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 4-residue linker 提交 2023-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 13–106（94 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 17 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (8.8 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl
分辨率 2.30 Å R-free 0.206
8UQ9 Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 4-residue linker 提交 2023-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 a 13–106（94 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 19 GOL GLYCEROL × 3 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (8.8 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl
分辨率 2.30 Å R-free 0.206
8UQA Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 12-residue linker 提交 2023-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 K 13–106（94 aa）
突变：C85K in UbcH5c NA SODIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (8.0 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.5, 2.4 M NaCl
分辨率 2.05 Å R-free 0.231
8UQB Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 20-residue linker (crystallization condition 1) 提交 2023-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 13–106（94 aa）
突变：C85K in UbcH5c ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (12 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 50 mM BIS-TRIS propane, pH 7.0, 1 M NaCl
分辨率 2.48 Å R-free 0.260
8UQC Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 20-residue linker (crystallization condition 2) 提交 2023-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 13–106（94 aa）
突变：C85K in UbcH5c ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (12 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 4% tacsimate, pH 6, 13.5% PEG3350
分辨率 2.61 Å R-free 0.252
8UQD Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 20-residue linker (condition 2. RING not modeled in density) 提交 2023-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 13–106（94 aa）
突变：C85K in UbcH5c 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (12 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 4% tacsimate, pH 6, 13.5% PEG3350
分辨率 3.89 Å R-free 0.322
8UQE Crystal structure of RNF168 (RING)-UbcH5c fused to H2A-H2B via a 26-residue linker (RING not modeled in density) 提交 2023-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 13–106（94 aa）
突变：S22R,C85K in UbcH5c 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；Crystals were obtained by mixing 2 microliters of the protein fusion (10 mg/mL) in 10 mM HEPES, pH 7.5, 600 mM NaCl, 1 mM TCEP and 2 microliters of the reservoir solution containing 0.1 M imidazole, pH 6.5, 1.0 M sodium acetate
分辨率 3.56 Å R-free 0.268
8VFX Cryo-EM structure of 186bp ALBN1 nucleosome aided by scFv 提交 2023-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
8VFY Cryo-EM structure of FoxA1 in complex with ALBN1 nucleosome (class 1) 提交 2023-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
8VFZ Cryo-EM structure of FoxA1 in complex with ALBN1 nucleosome (class 2) 提交 2023-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8VG0 Cryo-EM structure of GATA4 in complex with ALBN1 nucleosome 提交 2023-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
8VG1 Cryo-EM structure of FoxA1 and GATA4 in complex with ALBN1 nucleosome 提交 2023-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.48 Å
8VG2 Cryo-EM structure of FoxA1 and GATA4 in complex with H14 chromatosome 提交 2023-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8VLR Cryo-EM structure of native H2AK119bu nucleosome at 2.6 提交 2024-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 12–119（108 aa）
链 G 12–119（108 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl, pH 7.5, 50 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8W9D Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 1 提交 2023-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 K POTASSIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8W9E Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 2 提交 2023-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8W9F Cryo-EM structure of the Rpd3S-nucleosome complex from budding yeast in State 3 提交 2023-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8WG5 Cryo-EM structure of USP16 bound to H2AK119Ub nucleosome 提交 2023-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 11–119（109 aa）
链 G 11–119（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8X7I Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub in complex with H2AK13Ub nucleosomes determined by intein-based E2-Ub-NCP conjugation strategy 提交 2023-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 11–121（111 aa）
链 G 11–119（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
8X7J Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub/nucleosomes complex determined by activity-based chemical trapping strategy 提交 2023-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 12–119（108 aa）
链 G 11–118（108 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
8X7K Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub in complex with H2AK13Ub nucleosomes determined by activity-based chemical trapping strategy (adjacent H2AK13/15 dual-monoubiquitination) 提交 2023-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 15–119（105 aa）
链 G 11–118（108 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
8XBT The cryo-EM structure of the octameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.12 Å
8XBU The cryo-EM structure of the decameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.24 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 c 2–130（129 aa）
链 g 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 c 2–130（129 aa）
链 g 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8Y3C Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (closed form) 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.21 Å
8Y3D Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (intermediate form2) 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
8Y3E Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (open form) 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.32 Å
8Y3F Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (intermediate form1) 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.54 Å
8YBJ Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.38 Å
8YBK Cryo-EM structure of the human nucleosome containing the H3.1 E97K mutant 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.69 Å
8YNY Structure of Cas9-sgRNA ribonucleoprotein bound to nucleosome 提交 2024-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：13-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.52 Å
8YTI Crystal Structure of Nucleosome-H1x Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2024-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 M 1–130（130 aa）
链 Q 1–130（130 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 8 CA CALCIUM ION × 52 K POTASSIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45 mM CaCl2, 25 mM KCl, 10 mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 2.70 Å R-free 0.267
8YV8 Cryo-EM structure of CDCA7 bound to nucleosome including hemimethylated CpG site in Widom601 positioning sequence. 提交 2024-03-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8ZJR Structure of nucleosome-bound RFX5 complex 提交 2024-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8ZJT Structure of free nucleosome 提交 2024-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9BE5 Cryo-EM structure of Human Nucleosome collected by EPU on Glacios at 3.3 Angstrom resolution 提交 2024-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 G 15–119（105 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9BE6 Cryo-EM structure of Human Nucleosome collected by Leginon on Krios at 3.0 Angstrom resolution 提交 2024-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 G 15–119（105 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9GE5 CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 S 12–119（108 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
9GEL CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 S 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.86 Å
9GEV CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 O 2–130（129 aa）
链 S 2–130（129 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
9GF6 CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 O 2–130（129 aa）
链 S 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9GFB CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 O 2–130（129 aa）
链 S 2–130（129 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9GFM CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 O 14–119（106 aa）
链 S 9–119（111 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9GW2 State 2 MAP 1 SETD2 bound to proximal H3 of upstream nucleosome 提交 2024-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.84 Å
9IGW Ku70/80 bound to 147 bp nucleosome 提交 2025-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
9IGX Ku70/80 bound to 153 bp nucleosome 提交 2025-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 C 12–121（110 aa）
链 G 12–121（110 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9IPU cryo-EM structure of the RNF168(1-193)/UbcH5c-Ub ubiquitylation module bound to H1.0-K63-Ub3 modified chromatosome 提交 2024-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9J8M Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (High mobility complex) 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
9J8N Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (Low mobility complex) 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：32-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.14 Å
9J8O Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-H1-nucleosome complex 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.05 Å
9J8W Cryo-EM structure of NCP-UV-DDB complex containing CPD 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
9JC6 Human H2BW2 nucleosome 提交 2024-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
9KQO cryo-EM structure of RNF20/RNF40-RAD6A-Ub in complex with H2BS112GlcNAc nucleosome 提交 2024-11-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
9L1X hDEK-nucleosome complex (conformation 1) 提交 2024-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 2–120（119 aa）
链 G 2–120（119 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
9L22 hDEK-nucleosome complex (conformation 2) 提交 2024-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9R04 p53 bound to the nucleosome at position SHL-5.7 (crosslinked sample) 提交 2025-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9R2M p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (non-crosslinked sample, composite map) 提交 2025-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9R2P p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (crosslinked sample) 提交 2025-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
9R2Q p53 bound to nucleosome at position SHL-5.7 (non-crosslinked sample) 提交 2025-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 C 1–130（130 aa）
链 G 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9RZC State 3 MAP 1 SETD2 bound to distal H3 of upstream nucleosome 提交 2025-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.53 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
9U5U The 1:1 cryo-EM structure of BAP1/ASXL1-K351Ub in complex with H2AK119Ub nucleosome 提交 2025-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
9UZ7 Cryo-EM structure of the nucleosome core particle with site-specific DNA-histone crosslinking 提交 2025-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 E 2–130（129 aa）
链 F 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；10 mM HEPES, pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率未提供
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 c 1–130（130 aa）
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 g 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9XSF Cryo-EM structure of H4S47GlcNAc nucleosome at 3.39 angstrom 提交 2025-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.39 Å
9YL3 State 1 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.50 Å
9YLE State 3 MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.63 Å
9YLY MLL4FC bound to a nucleosome with p53 RE 提交 2025-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.77 Å
9YM8 State 2 focused on PHD FYR of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.43 Å
9YMF State 2 focused on H3 N terminal tail of MLL4FC bound to a nucleosome premodified with H2BK120ub and H4K16ac 提交 2025-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 C 2–130（129 aa）
链 G 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.45 Å
9ZEN Competition for different elements of the nucleosome acidic patch yields distinct functional outcomes. VHH 1B2 提交 2025-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 C 11–121（111 aa）
链 G 11–121（111 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES pH7.6, 50 mM NaCl, 0.5 mM MgCl2, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
9ZEO Competition for different elements of the nucleosome acidic patch yields distinct functional outcomes. VHH 1G1 提交 2025-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 C 11–121（111 aa）
链 G 11–121（111 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM HEPES pH7.6, 50 mM NaCl, 0.5 mM MgCl2, 1 mM EDTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 343 个其他 PDB 条目、350 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2A1B_HUMAN
Isoform —
PDB实体 28
链与序列区间 作者链 g； PDB构建体 4–133； UniProt 1–130

Histone H2B type 1-J

Homo sapiens

UniProt P06899

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 h； UniProt 1–126 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2RVQ Solution structure of the isolated histone H2A-H2B heterodimer 提交 2016-03-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；293 K；离子强度（mmCIF原始值）400；压力 ambient
NMR样品组成 0.1-0.3 mM [U-13C; U-15N; U-2H] entity_1-1, 0.1-0.3 mM [U-13C; U-15N; U-2H] entity_2-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3A6N The nucleosome containing a testis-specific histone variant, human H3T 提交 2009-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.264
3AFA The human nucleosome structure 提交 2010-02-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.270
3AN2 The structure of the centromeric nucleosome containing CENP-A 提交 2010-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.60 Å R-free 0.325
3AV1 The human nucleosome structure containing the histone variant H3.2 提交 2011-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.290
3AV2 The human nucleosome structure containing the histone variant H3.3 提交 2011-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.272
3AYW Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K56Q mutation 提交 2011-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.90 Å R-free 0.273
3AZE Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K64Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.302
3AZF Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K79Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.263
3AZG Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K115Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.40 Å R-free 0.269
3AZH Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H3K122Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.49 Å R-free 0.266
3AZI Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K31Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.289
3AZJ Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K44Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.89 Å R-free 0.268
3AZK Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K59Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
3AZL Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K77Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.70 Å R-free 0.259
3AZM Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K79Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.89 Å R-free 0.296
3AZN Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle Containing H4K91Q mutation 提交 2011-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.254
3W96 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H2A N-terminal region 提交 2013-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.296
3W97 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H2B N-terminal region 提交 2013-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 26–126（101 aa） 片段：UNP residues 26-126
链 H 26–126（101 aa） 片段：UNP residues 26-126
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.321
3W98 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H3.1 N-terminal region 提交 2013-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.42 Å R-free 0.303
3W99 Crystal Structure of Human Nucleosome Core Particle lacking H4 N-terminal region 提交 2013-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；POTASSIUM CACODYLATE, POTASSIUM CHLORIDE, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 3.00 Å R-free 0.312
3WA9 The nucleosome containing human H2A.Z.1 提交 2013-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.07 Å R-free 0.271
3WAA The nucleosome containing human H2A.Z.2 提交 2013-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.271
3WTP Crystal Structure of the heterotypic nucleosome containing human CENP-A and H3.3 提交 2014-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.67 Å R-free 0.270
4CAY Crystal structure of a human Anp32e-H2A.Z-H2B complex 提交 2013-10-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 31–126（96 aa） 片段：GLOBULAR DOMAIN, RESIDUES 31-126
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M NA CACODYLATE, PH 7.0, 0.2 M NA FORMATE, 24% TO 30% PEG 3350
分辨率 1.48 Å R-free 0.195
4YM5 Crystal structure of the human nucleosome containing 6-4PP (inside) 提交 2015-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 4.00 Å R-free 0.289
4YM6 Crystal structure of the human nucleosome containing 6-4PP (outside) 提交 2015-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 3.51 Å R-free 0.287
4Z5T The nucleosome containing human H3.5 提交 2015-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.80 Å R-free 0.269
5AV5 human nucleosome core particle 提交 2015-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.233
5AV6 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.229
5AV8 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.233
5AV9 human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.239
5AVB human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.236
5AVC human nucleosome core particle 提交 2015-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.238
5AY8 Crystal structure of human nucleosome containing H3.Y 提交 2015-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；sodium acetate, manganese chloride, 2-propanol, trimethylamine N-oxide
分辨率 2.80 Å R-free 0.249
5B0Y Crystal structure of the nucleosome containing histone H3 with the crotonylated lysine 122 提交 2015-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.56 Å R-free 0.249
5B0Z The crystal structure of the nucleosome containing H3.2, at 1.98 A resolution 提交 2015-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 1.99 Å R-free 0.254
5B24 The crystal structure of the nucleosome containing cyclobutane pyrimidine dimer 提交 2015-12-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 3.60 Å R-free 0.249
5B2I Human nucleosome containing CpG unmethylated DNA 提交 2016-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 3.00 Å R-free 0.257
5B2J Human nucleosome containing CpG methylated DNA 提交 2016-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, manganese(II) chloride, potassium chloride
分辨率 2.60 Å R-free 0.252
5B31 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.1. 提交 2016-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.20 Å R-free 0.271
5B32 The crystal structure of the heterotypic H2AZ/H2A nucleosome with H3.3. 提交 2016-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.35 Å R-free 0.259
5B33 The crystal structure of the H2AZ nucleosome with H3.3. 提交 2016-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.92 Å R-free 0.252
5B40 The nucleosome structure containing H2B-K120 and H4-K31 monoubiquitinations 提交 2016-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
突变：K121C 突变：K121C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；90mM Tris-HCl (pH 7.8), 3.6% PGA-LM, 25.2% PEG 400, 2-6% Pentaerythritol ethoxylate (3/4 EO/OH)
分辨率 3.33 Å R-free 0.263
5CPI Nucleosome containing unmethylated Sat2R DNA 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.90 Å R-free 0.295
5CPJ Nucleosome containing methylated Sat2R DNA 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 3.15 Å R-free 0.295
5CPK Nucleosome containing methylated Sat2L DNA 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.63 Å R-free 0.284
5FUG Crystal structure of a human YL1-H2A.Z-H2B complex 提交 2016-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 31–126（96 aa） 片段：GLOBULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SUCCINIC ACID/PHOSPHATE/GLYCINE SYSTEM PH 6/7 ; 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
5FUG Crystal structure of a human YL1-H2A.Z-H2B complex 提交 2016-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 31–126（96 aa） 片段：GLOBULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SUCCINIC ACID/PHOSPHATE/GLYCINE SYSTEM PH 6/7 ; 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
5FUG Crystal structure of a human YL1-H2A.Z-H2B complex 提交 2016-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 31–126（96 aa） 片段：GLOBULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SUCCINIC ACID/PHOSPHATE/GLYCINE SYSTEM PH 6/7 ; 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
5FUG Crystal structure of a human YL1-H2A.Z-H2B complex 提交 2016-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 K 31–126（96 aa） 片段：GLOBULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SUCCINIC ACID/PHOSPHATE/GLYCINE SYSTEM PH 6/7 ; 25% PEG 1500
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
5GSE Crystal structure of unusual nucleosome 提交 2016-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；potassium bromide, potassium thiocyanate, Tris-HCl, PGA-LM, PEG 400
分辨率 3.14 Å R-free 0.255
5GTC Crystal structure of complex between DMAP-SH conjugated with a Kaposi's sarcoma herpesvirus LANA peptide (5-15) and nucleosome core particle 提交 2016-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.70 Å R-free 0.267
5GXQ The crystal structure of the nucleosome containing H3.6 提交 2016-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.85 Å R-free 0.262
5JRG Crystal structure of the nucleosome containing the DNA with tetrahydrofuran (THF) 提交 2016-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 15 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
5VEY Solution NMR structure of histone H2A-H2B mono-ubiquitylated at H2A Lys15 in complex with RNF169 (653-708) 提交 2017-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 34–124（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM KCl；压力 1
NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM KCl；压力 1
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5X7X The crystal structure of the nucleosome containing H3.3 at 2.18 angstrom resolution 提交 2017-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.18 Å R-free 0.256
5XF3 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (R,R-configuration) 提交 2017-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 RRK (1R,2R)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55 mM MnCl2, 25-49 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.270
5XF4 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (S,S-configuration) 提交 2017-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 SSK (1S,2S)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55 mM MnCl2, 25-49 mM KCl, 20 mM K-Cacodylate pH 6.0
分辨率 2.87 Å R-free 0.266
5XF5 Nucleosome core particle with an adduct of a binuclear RAPTA (Ru-arene-phosphaadamantane) compound having a 1,2-diphenylethylenediamine linker (R,S-configuration) 提交 2017-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 RUD [ethane6-3-(p-tolyl)propanoic acid]Ru(1,3,5-triaza-7-phosphaadamantane)Cl2 × 2 RSK (1S,2R)-1,2-diphenylethane-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；35-55mM MnCl2, 25-49mM KCl, 20mM K-Cacodylate pH 6.0
分辨率 2.82 Å R-free 0.264
5Y0C Crystal Structure of the human nucleosome at 2.09 angstrom resolution 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 10 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.09 Å R-free 0.249
5Y0D Crystal Structure of the human nucleosome containing the H2B E76K mutant 提交 2017-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
突变：E76K 突变：E76K CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 1.99 Å R-free 0.252
5Z23 Crystal structure of the nucleosome containing a chimeric histone H3/CENP-A CATD 提交 2017-12-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.73 Å R-free 0.261
5Z30 The crystal structure of the nucleosome containing a cancer-associated histone H2A.Z R80C mutant 提交 2018-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.45 Å R-free 0.243
5ZBX The crystal structure of the nucleosome containing histone H3.1 CATD(V76Q, K77D) 提交 2018-02-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.58 Å R-free 0.249
6A5L RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA 提交 2018-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.60 Å
6A5O RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-6) of the nucleosome 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.90 Å
6A5P RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6A5R RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-2) of the nucleosome 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.70 Å
6A5T RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.70 Å
6A5U RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA, tilt conformation 提交 2018-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
6BUZ Cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with kinetochore protein CENP-N 提交 2017-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
6E0C Cryo-EM structure of the CENP-A nucleosome (W601) in complex with a single chain antibody fragment 提交 2018-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
6E0P Cryo-EM structure of the centromeric nucleosome (Native alpha satellite DNA) in complex with a single chain antibody fragment 提交 2018-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 sec before plunging
分辨率 2.60 Å
6HKT Structure of an H1-bound 6-nucleosome array 提交 2018-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：50-meric
链 1 1–126（126 aa）
链 3 1–126（126 aa）
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
链 X 1–126（126 aa）
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
链 n 1–126（126 aa）
链 r 1–126（126 aa）
链 x 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；293.15 K；15% MPD, 0.1 M NaCl and 0.1 M Tris pH 8.8
分辨率 9.70 Å R-free 0.286
6HTS Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to nucleosome 提交 2018-10-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 L 1–126（126 aa）
链 P 1–126（126 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6INQ RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome, with foreign DNA (+1 position) 提交 2018-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：25-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6IPU Human nucleosome core particle containing 145 bp of DNA 提交 2018-11-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 32–126（95 aa）
链 H 32–126（95 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate
分辨率 1.99 Å R-free 0.263
6IQ4 Nucleosome core particle cross-linked with a hetero-binuclear molecule possessing RAPTA and gold(I) 4-(diphenylphosphino)benzoic acid groups. 提交 2018-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 32–126（95 aa）
链 H 32–126（95 aa）
未记录 AU GOLD ION × 1 XIS 4-diphenylphosphanylbenzoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 D0X [Ru(eta(6)-p-cymene)Cl-2(pta) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate
分辨率 2.25 Å R-free 0.257
6IR9 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2018-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6J4W RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-5) of the nucleosome 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.90 Å
6J4X RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1A) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Y RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (+1B) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6J4Z RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6J50 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome (tilted conformation) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：27-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6J51 RNA polymerase II elongation complex bound with Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome, weak Elf1 (+1 position) 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6JOU Crystal structure of the human nucleosome containing H2A.Z.1 S42R 提交 2019-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.17 Å R-free 0.250
6JR0 Crystal structure of the human nucleosome phased with 12 selenium atoms 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
突变：L106M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L106M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.50 Å R-free 0.253
6JR1 Crystal structure of the human nucleosome phased with 16 selenium atoms 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
突变：L101M, L106M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L101M, L106M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.40 Å R-free 0.243
6JXD Human nucleosome core particle with cohesive end DNA termini 提交 2019-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 30–126（97 aa）
链 H 30–126（97 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 17 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；manganese chloride, potassium chloride, potassium cacodylate
分辨率 2.25 Å R-free 0.292
6K1I Human nucleosome core particle with gammaH2A.X variant 提交 2019-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 23 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；potassium chloride, manganese chloride, potassium cacodylate
分辨率 2.75 Å R-free 0.277
6K1J Human nucleosome core particle with H2A.X variant 提交 2019-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；Potassium Chloride, Manganese Chloride, Potassium Cacodylate
分辨率 2.85 Å R-free 0.319
6K1K Human nucleosome core particle with H2A.X S139E variant 提交 2019-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 33 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291.15 K；potassium chloride, manganese chloride, potassium cacodylate
分辨率 2.20 Å R-free 0.275
6KVD Crystal structure of human nucleosome containing H2A.J 提交 2019-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 13 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.21 Å R-free 0.257
6KXV Crystal structure of a nucleosome containing Leishmania histone H3 提交 2019-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；sodium acetate, isopropanol, manganese chloride, trimethylamine N-oxide
分辨率 3.63 Å R-free 0.264
6L49 H3-CA-H3 tri-nucleosome with the 22 base-pair linker DNA 提交 2019-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
链 V 1–126（126 aa）
链 Z 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 18.90 Å
6L4A H3-H3-H3 tri-nucleosome with the 22 base-pair linker DNA 提交 2019-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
链 V 1–126（126 aa）
链 Z 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 12.30 Å
6L9Z 338 bp di-nucleosome assembled with linker histone H1.X 提交 2019-11-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 8 CA CALCIUM ION × 65 K POTASSIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate
分辨率 2.50 Å R-free 0.256
6LA2 343 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：38-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
链 X 1–126（126 aa）
链 b 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
链 l 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Sodium acetate
分辨率 3.89 Å R-free 0.267
6LA8 349 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 23 K POTASSIUM ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate (cryo-25% MPD)
分辨率 3.40 Å R-free 0.265
6LA9 349 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini assembled with linker histone H1.0 (high cryoprotectant) 提交 2019-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 40 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate
分辨率 3.70 Å R-free 0.266
6LAB 169 bp nucleosome, harboring cohesive DNA termini, assembled with linker histone H1.0 提交 2019-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 20 K POTASSIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate
分辨率 3.20 Å R-free 0.262
6LER 169 bp nucleosome harboring non-identical cohesive DNA termini. 提交 2019-11-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 6 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate
分辨率 3.00 Å R-free 0.261
6LER 169 bp nucleosome harboring non-identical cohesive DNA termini. 提交 2019-11-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 8 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；Calcium chloride, potassium chloride, sodium acetate
分辨率 3.00 Å R-free 0.261
6M3V 355 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini 提交 2020-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate, Poly glutamic acid
分辨率 4.60 Å R-free 0.261
6M44 355 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini (high cryoprotectant) 提交 2020-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：octadecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；Calcium chloride, Potassium chloride, Potassium Cacodylate, Poly glutamic acid
分辨率 3.81 Å R-free 0.286
6O1D Cryo-EM structure of the centromeric nucleosome with native alpha satellite DNA 提交 2019-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 2.5 sec before plunging
分辨率 3.40 Å
6R8Y Cryo-EM structure of NCP-6-4PP(-1)-UV-DDB 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6R8Z Cryo-EM structure of NCP_THF2(-1)-UV-DDB 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6R90 Cryo-EM structure of NCP-THF2(+1)-UV-DDB class A 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
6R91 Cryo-EM structure of NCP_THF2(-3)-UV-DDB 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6R92 Cryo-EM structure of NCP-THF2(+1)-UV-DDB class B 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6R93 Cryo-EM structure of NCP-6-4PP 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6R94 Cryo-EM structure of NCP_THF2(-3) 提交 2019-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6T90 OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2019-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
6T93 Nucleosome with OCT4-SOX2 motif at SHL-6 提交 2019-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
6USJ Structure of two nucleosomes bridged by human PARP2 提交 2019-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Buffer was pH-adjusted and filtered through a 0.22 um filter.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 2s, blot force 0
分辨率 10.50 Å
6V2K The nucleosome structure after H2A-H2B exchange 提交 2019-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；potassium cacodylate, potassium chloride, manganese chloride
分辨率 2.60 Å R-free 0.248
6YOV OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 提交 2020-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
7BY0 The cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with the phosphorylated CENP-C 提交 2020-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7C0M Human cGAS-nucleosome complex 提交 2020-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
链 d 2–126（125 aa）
链 h 2–126（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7CCQ Structure of the 1:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 33–125（93 aa）
链 H 33–125（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7CCR Structure of the 2:2 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 D 33–125（93 aa）
链 H 33–125（93 aa）
链 O 33–125（93 aa）
链 S 33–125（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
7COW 353 bp di-nucleosome harboring cohesive DNA termini with linker histone H1.0 提交 2020-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 3 K POTASSIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291.15 K；potassium acetate, calcium chloride, potassium chloride
分辨率 2.86 Å R-free 0.297
7D1Z Cryo-EM structure of SET8-nucleosome complex 提交 2020-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
7D20 Cryo-EM structure of SET8-CENP-A-nucleosome complex 提交 2020-09-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7E8D NSD2 E1099K mutant bound to nucleosome 提交 2021-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 SFG SINEFUNGIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7K5X Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.0 提交 2020-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
7K5Y Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.4 提交 2020-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
7K60 Cryo-EM structure of a chromatosome containing human linker histone H1.10 提交 2020-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
7K61 Cryo-EM structure of 197bp nucleosome aided by scFv 提交 2020-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
7K63 Cryo-EM structure of a chromatosome containing chimeric linker histone gH1.10-ncH1.4 提交 2020-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
7LYA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle with linked histone proteins H2A and H2B 提交 2021-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
7LYB Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with BRCA1-BARD1-UbcH5c 提交 2021-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
7LYC Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A Lys13 and Lys15 in complex with BARD1 (residues 415-777) 提交 2021-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
7NL0 Cryo-EM structure of the Lin28B nucleosome core particle 提交 2021-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7SCY Nuc147 bound to single BRCT 提交 2021-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7SCZ Nuc147 bound to multiple BRCTs 提交 2021-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7VZ4 Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601L DNA sequence 提交 2021-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 1.89 Å
7W9V Cryo-EM structure of nucleosome in complex with p300 acetyltransferase catalytic core (complex I) 提交 2021-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.95 Å
7WBV RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-4) of the nucleosome 提交 2021-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 d 2–126（125 aa）
链 h 2–126（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7WBW RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2021-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 d 2–126（125 aa）
链 h 2–126（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7WBX RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1 and Spt4/5, stalled at SHL(-3) of the nucleosome 提交 2021-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 d 2–126（125 aa）
链 h 2–126（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7XSE RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC42) 提交 2022-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XSZ RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC115) 提交 2022-05-15 构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7XVL Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169an DNA fragment) 提交 2022-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 X 1–126（126 aa）
链 b 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.51 Å R-free 0.280
7XVL Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169an DNA fragment) 提交 2022-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
链 l 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.51 Å R-free 0.280
7XVM Crystal Structure of Nucleosome-H5 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 18 CL CHLORIDE ION × 3 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 2.84 Å R-free 0.259
7XX5 Crystal Structure of Nucleosome-H1.3 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.19 Å R-free 0.259
7XX6 Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 21 K POTASSIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.39 Å R-free 0.296
7XX6 Crystal Structure of Nucleosome-H1.0 Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2022-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：21-meric
链 X 1–126（126 aa）
链 b 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
链 l 1–126（126 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 26 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45mM CaCl2, 25mM KCl, 10mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 3.39 Å R-free 0.296
7XZX Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 DNA-binding domain 提交 2022-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.53 Å
7XZY Cryo-EM structure of the nucleosome containing 193 base-pair DNA with a p53 target sequence 提交 2022-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.97 Å
7XZZ Cryo-EM structure of the nucleosome in complex with p53 提交 2022-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7Y00 Cryo-EM structure of the nucleosome containing 169 base-pair DNA with a p53 target sequence 提交 2022-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.96 Å
7Y7I chicken KNL2 in complex with the CENP-A nucleosome 提交 2022-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
7ZI4 Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome 提交 2022-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–126（126 aa）
链 P 1–126（126 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4uL of sample applied to Quantifoil R2/2 Cu 300 mesh grids. blot parameters were wait time 30 sec, blot time 0.5 sec, blot force -8
分辨率 3.20 Å
8G57 Structure of nucleosome-bound Sirtuin 6 deacetylase 提交 2023-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；12.5 mM HEPES pH 7.5, 60 mM KCl, 1.5% glycerol, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
8GUI Bre1-nucleosome complex (Model I) 提交 2022-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
8GUJ Bre1-nucleosome complex (Model II) 提交 2022-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8GUK Human nucleosome core particle (free form) 提交 2022-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.51 Å
8H0V RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type I) 提交 2022-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8H0W RNA polymerase II transcribing a chromatosome (type II) 提交 2022-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8HAG Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (3.2 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8HAH Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (3.9 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8HAI Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (4.7 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8HAJ Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (4.8 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8HAK Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 4 (4.5 angstrom resolution) 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8HAL Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8HAM Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8HAN Cryo-EM structure of the CBP catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 3 提交 2022-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8HE5 RNA polymerase II elongation complex bound with Rad26 and Elf1, stalled at SHL(-3.5) of the nucleosome 提交 2022-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：25-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.95 Å
8I17 Structural basis for H2A-H2B recognitions by human Spt16 提交 2023-01-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 28–126（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.98 Å R-free 0.211
8I17 Structural basis for H2A-H2B recognitions by human Spt16 提交 2023-01-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 28–126（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.98 Å R-free 0.211
8I17 Structural basis for H2A-H2B recognitions by human Spt16 提交 2023-01-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 28–126（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.0, 14% w/v Polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.98 Å R-free 0.211
8IHL Overlapping tri-nucleosome 提交 2023-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 P 1–126（126 aa）
链 T 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.64 Å
8JH2 RNA polymerase II elongation complex bound with Elf1, Spt4/5 and foreign DNA, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：28-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8JH3 RNA polymerase II elongation complex containing 40 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8JH4 RNA polymerase II elongation complex containing 60 bp upstream DNA loop, stalled at SHL(-1) of the nucleosome 提交 2023-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 50 mM Potassium acetate, 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8JL9 Cryo-EM structure of the human nucleosome with scFv 提交 2023-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
8JLA Cryo-EM structure of the human nucleosome lacking N-terminal region of H2A, H2B, H3, and H4 提交 2023-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 26–126（101 aa）
链 H 26–126（101 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8JLB Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing H3.2 C110A mutant 提交 2023-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.36 Å
8JLD Cryo-EM structure of the 145 bp human nucleosome containing acetylated H3 tail 提交 2023-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.48 Å
8JND The cryo-EM structure of the nonameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
8JNE The cryo-EM structure of the decameric RAD51 ring bound to the nucleosome without the linker DNA binding 提交 2023-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.68 Å
8JNF The cryo-EM structure of the RAD51 filament bound to the nucleosome 提交 2023-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.91 Å
8KB5 Cryo-EM structure of the human nucleosome containing H3.8 提交 2023-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.26 Å
8KCY Structure of nucleosome complexed with two DEK molecules 提交 2023-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8KD1 Structure of nucleosome complexed with one DEK molecule 提交 2023-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8KE0 Structure of H1.2 bound to the nucleosome 提交 2023-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8OSJ Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL-6.2 (DNA conformation 1) 提交 2023-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
8OSK Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL+5.8 (composite map) 提交 2023-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8OSL Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to the native Por enhancer nucleosome (map 2, additional 3D classification and flexible refinement) 提交 2023-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
8OTS OCT4 and MYC-MAX co-bound to a nucleosome 提交 2023-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8OTT MYC-MAX bound to a nucleosome at SHL+5.8 提交 2023-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 33–125（93 aa）
链 H 33–125（93 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8QKT Structure of a nucleosome composed of a palindromic 167-base pair blunt-ended DNA fragment 提交 2023-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 DDD 30–125（96 aa）
链 HHH 30–126（97 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 19 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；MnCl2-containing buffers
分辨率 3.26 Å R-free 0.321
8QKT Structure of a nucleosome composed of a palindromic 167-base pair blunt-ended DNA fragment 提交 2023-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 NNN 30–125（96 aa）
链 RRR 30–126（97 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；MnCl2-containing buffers
分辨率 3.26 Å R-free 0.321
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric
链 R 1–126（126 aa）
链 W 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8RGM Cryo-EM structure of nucleosome containing Widom603 DNA 提交 2023-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8SMW Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 1) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8SMX Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 2) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SMY Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 3) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SMZ Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (Class 4) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SN0 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 5) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8SN1 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A. No density for Ub.) (class 6) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8SN2 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8SN3 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8SN4 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SN5 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 3) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8SN6 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 4) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SN7 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 5) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SN8 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c~Ub (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 6) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8SN9 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 1) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8SNA Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168 and UbcH5c with backside ubiquitin (UbcH5c chemically conjugated to histone H2A) (class 2) 提交 2023-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8U14 Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle ubiquitylated at histone H2A lysine 15 in complex with RNF168-UbcH5c (class 2) 提交 2023-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–124（124 aa）
链 H 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8U9S Cryo-EM structure of NRCAM nucleosome aided by scFv 提交 2023-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8UBI Cryo-EM structure of NRCAM nucleosome aided by scFv (Class_A) 提交 2023-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 31–125（95 aa）
链 H 31–125（95 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8UBJ Cryo-EM structure of NRCAM nucleosome aided by scFv (3D Flex map) 提交 2023-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8UBK Cryo-EM structure of Ascl1/E12a in complex with NRCAM nucleosome 提交 2023-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8UBL Cryo-EM structure of Ascl1/E12a in complex with NRCAM nucleosome (3D Flex map) 提交 2023-09-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8UPF Cryo-EM structure of the human nucleosome core particle in complex with RNF168-UbcH5c 提交 2023-10-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 6–124（119 aa）
链 H 6–124（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8VFX Cryo-EM structure of 186bp ALBN1 nucleosome aided by scFv 提交 2023-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
8VFY Cryo-EM structure of FoxA1 in complex with ALBN1 nucleosome (class 1) 提交 2023-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
8VFZ Cryo-EM structure of FoxA1 in complex with ALBN1 nucleosome (class 2) 提交 2023-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8VG0 Cryo-EM structure of GATA4 in complex with ALBN1 nucleosome 提交 2023-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
8VG1 Cryo-EM structure of FoxA1 and GATA4 in complex with ALBN1 nucleosome 提交 2023-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.48 Å
8VG2 Cryo-EM structure of FoxA1 and GATA4 in complex with H14 chromatosome 提交 2023-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8XBT The cryo-EM structure of the octameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.12 Å
8XBU The cryo-EM structure of the decameric RAD51 ring bound to the nucleosome with the linker DNA binding 提交 2023-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.24 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 d 2–126（125 aa）
链 h 2–126（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 d 2–126（125 aa）
链 h 2–126（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8Y3C Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (closed form) 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.21 Å
8Y3D Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (intermediate form2) 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
8Y3E Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (open form) 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.32 Å
8Y3F Cryo-EM structure of the overlapping di-nucleosome (intermediate form1) 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.54 Å
8YBJ Cryo-EM structure of human nucleosome core particle composed of the Widom 601 DNA sequence 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.38 Å
8YBK Cryo-EM structure of the human nucleosome containing the H3.1 E97K mutant 提交 2024-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.69 Å
8YNY Structure of Cas9-sgRNA ribonucleoprotein bound to nucleosome 提交 2024-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：13-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.52 Å
8YTI Crystal Structure of Nucleosome-H1x Linker Histone Assembly (sticky-169a DNA fragment) 提交 2024-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：22-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 N 1–126（126 aa）
链 R 1–126（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 8 CA CALCIUM ION × 52 K POTASSIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；40-45 mM CaCl2, 25 mM KCl, 10 mM Na-acetate (pH 4.5)
分辨率 2.70 Å R-free 0.267
9BE5 Cryo-EM structure of Human Nucleosome collected by EPU on Glacios at 3.3 Angstrom resolution 提交 2024-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 48–126（79 aa）
链 H 48–126（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9BE6 Cryo-EM structure of Human Nucleosome collected by Leginon on Krios at 3.0 Angstrom resolution 提交 2024-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 48–126（79 aa）
链 H 33–125（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9GMK SIRT7:H3K18DTU nucleosome complex 提交 2024-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9GMR SIRT7-H3K36MTUnucleosome complex 提交 2024-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 A1IY0 [[(2~{R},3~{a}~{R},5~{R},6~{R},6~{a}~{R})-2-(methylamino)-6-oxidanyl-2-(propylamino)-3~{a},5,6,6~{a}-tetrahydrofuro[2,3-d][1,3]oxathiol-5-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9IGW Ku70/80 bound to 147 bp nucleosome 提交 2025-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：12-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
9IGX Ku70/80 bound to 153 bp nucleosome 提交 2025-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 30–126（97 aa）
链 H 30–126（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9II7 RNA polymerase II elongation complex stalled at SHL(-1) of the nucleosome containing histone variant H2A.B 提交 2024-06-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：24-meric
链 d 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH(pH7.5), 200 nM Zinc acetate, 0.1 mM TCEP-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9INC High resolutional Crystal Structure of human H2A.Z-H2B dimer in complex with human YL1-Z domain 提交 2024-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 34–125（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；45% PEG200 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 2.01 Å R-free 0.257
9INC High resolutional Crystal Structure of human H2A.Z-H2B dimer in complex with human YL1-Z domain 提交 2024-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 34–125（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；45% PEG200 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 2.01 Å R-free 0.257
9INC High resolutional Crystal Structure of human H2A.Z-H2B dimer in complex with human YL1-Z domain 提交 2024-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 34–125（92 aa）
链 E 34–125（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；45% PEG200 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 2.01 Å R-free 0.257
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9J0O Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC1-nuc) 提交 2024-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9J0P Arrested elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (AEC2-nuc) 提交 2024-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9J8M Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (High mobility complex) 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
9J8N Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-nucleosome complex (Low mobility complex) 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：32-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.14 Å
9J8O Cryo-EM structure of BAF-Lamin A/C IgF-H1-nucleosome complex 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：28-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.05 Å
9J8W Cryo-EM structure of NCP-UV-DDB complex containing CPD 提交 2024-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
9L1X hDEK-nucleosome complex (conformation 1) 提交 2024-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
9L22 hDEK-nucleosome complex (conformation 2) 提交 2024-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9MLL GammaH2AX containing nucleosomes, Parallel stack 提交 2024-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 O 1–126（126 aa）
链 S 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9MLN GammaH2AX containing nucleosome, Canonical (Class 1) 提交 2024-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9MLR GammaH2AX containing nucleosome, Half-wrapped (Class 2) 提交 2024-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9MLS GammaH2AX containing nucleosome, Extended (Class 3) 提交 2024-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MMK H2AX containing nucleosome, Canonical (Class 1) 提交 2024-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9MMM H2AX containing nucleosomes, Parallel stack 提交 2024-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 O 1–126（126 aa）
链 S 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9MMN H2AX containing nucleosomes, Left offset stack 提交 2024-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 O 1–126（126 aa）
链 S 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MMO H2AX containing nucleosomes, Right offset stack 提交 2024-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：eicosameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 O 1–126（126 aa）
链 S 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9MMT H2AX containing nucleosome, Unwrapped (Class 2) 提交 2024-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9OGR Cryo-EM analysis of human H2A.Z on methylated Sat2R-P DNA (v1) 提交 2025-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
9OGS Cryo-EM analysis of human H2A.Z on Sat2R-P DNA (v1) 提交 2025-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9OGZ Cryo-EM analysis of human H2A.Z on Sat2R-P DNA (v2) 提交 2025-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9OH0 Cryo-EM analysis of human H2A.Z on methylated Sat2R-P DNA (v2) 提交 2025-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
9OH1 Cryo-EM analysis of human H2A.Z on 601L DNA 提交 2025-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9OH2 Cryo-EM analysis of human H2A.Z on methylated 601L DNA 提交 2025-05-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
9Q80 Ku70/80 with Ku70 linker and SAP domain bound to a 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9Q8X Ku70/80 bound to a 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
9Q9F DNA-PK bound to a 153 bp H2AX nucleosome model 1 提交 2025-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.54 Å
9QCR DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome model 2 提交 2025-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.37 Å
9QCS Ku80 mediated DNA-PK dimer bound to 153 bp H2AX nucleosome 提交 2025-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：26-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.38 Å
9QMS DNA-PK bound to 153 bp H2AX nucleosome with ATPyS 提交 2025-03-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：30-meric
链 D 1–126（126 aa）
链 H 1–126（126 aa）
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
9R04 p53 bound to the nucleosome at position SHL-5.7 (crosslinked sample) 提交 2025-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9R2M p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (non-crosslinked sample, composite map) 提交 2025-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9R2P p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (crosslinked sample) 提交 2025-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
9R2Q p53 bound to nucleosome at position SHL-5.7 (non-crosslinked sample) 提交 2025-04-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric
链 D 1–125（125 aa）
链 H 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9SI3 Chromosomal Passenger Complex in complex with H3T3ph Nucleosome 提交 2025-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9SI9 Chromosomal Passenger Complex in complex with H3T3ph Nucleosome (Class0) 提交 2025-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9SJ5 Chromosomal Passenger Complex in complex with H3T3ph Nucleosome (Class1) 提交 2025-08-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
9SLJ Chromosomal Passenger Complex in complex with H3T3ph Nucleosome (Double Occupancy) 提交 2025-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric
链 D 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9UBD The Structural Basis of the Recognition of the Histone Variant H2A.Z by the SRCAP Catalytic Subunit 提交 2025-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 B 34–125（92 aa）
链 E 34–125（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；0.2 M Potassium thiocyanate 15 % w/v PEG 3,350 pH 7.0
分辨率 2.53 Å R-free 0.288
9UZ7 Cryo-EM structure of the nucleosome core particle with site-specific DNA-histone crosslinking 提交 2025-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 G 2–126（125 aa）
链 H 2–126（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；10 mM HEPES, pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率未提供
9WMS Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type B) 提交 2025-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
突变：K121C-ubiquitination mimic 突变：K121C-ubiquitination mimic ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9WMT Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, type A) 提交 2025-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
突变：K121C-ubiquitination mimic 突变：K121C-ubiquitination mimic ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
9WMU Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type A) 提交 2025-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.28 Å
9WMV Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp130, type B) 提交 2025-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 d 1–126（126 aa）
链 h 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.66 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 h 1–126（126 aa）
突变：K121C-ubiquitination mimic ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 290 个其他 PDB 条目、301 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H2B1J_HUMAN
Isoform —
PDB实体 29
链与序列区间 作者链 h； PDB构建体 4–129； UniProt 1–126

FACT complex subunit

Komagataella phaffii

UniProt C4QYQ8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 j； UniProt 1–1005 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit POB3 × 1 （F2QNN8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 j 1–953（953 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 j 1–1005（1005 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 j 1–938（938 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C4QYQ8_KOMPG
Isoform —
PDB实体 30
链与序列区间 作者链 j； PDB构建体 4–1008； UniProt 1–1005

FACT complex subunit POB3

Komagataella phaffii

UniProt F2QNN8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 30 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：33-meric（33） 与全部聚合物数一致 链 k； UniProt 32–559 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （C4R4Y0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （C4QZQ7） RNA polymerase II third largest subunit B44, part of central core × 1 （C4R7L2） RNA polymerase II subunit B32 × 1 （C4R2U9） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （C4R3P8） RNA polymerase subunit ABC23, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R1V1） RNA polymerase II subunit × 1 （C4R9A1） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （C4R273） DNA-directed RNA polymerase subunit × 1 （F2QPE6） RNA polymerase subunit ABC10-beta, common to RNA polymerases I, II, and III × 1 （C4R009） RNA polymerase II subunit B12.5 × 1 （C4R3Z5） RNA polymerase subunit ABC10-alpha × 1 （F2QMI1） Transcription elongation factor 1 homolog × 1 （C4QZ45） DNA (198-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*UP*GP*UP*AP*AP*UP*CP*CP*CP*CP*UP*UP*GP*GP*CP*GP*GP*UP*U)-3') ; × 1 DNA (198-MER) × 1 Transcription elongation factor SPT4 × 1 （C4R0E6） Transcription elongation factor SPT5 × 1 （C4R370） Transcription elongation factor Spt6 × 1 （C4R7H2） Protein that interacts with Spt6p and copurifies with Spt5p and RNA polymerase II × 1 （C4R7L8） Component of the Paf1p complex × 1 （C4R6B2） RNAPII-associated chromatin remodeling Paf1 complex subunit × 1 （F2QQ42） Leo1 × 1 （C4R3K1） RNAP II-associated protein × 1 （C4R997） Constituent of Paf1 complex with RNA polymerase II, Paf1p, Hpr1p, Ctr9, Leo1, Rtf1 and Ccr4p × 1 （C4R1E6） Histone H3.3 × 2 （P84243） Histone H4 × 2 （P62805） Histone H2A type 1-B/E × 1 （P04908） Histone H2B type 1-J × 1 （P06899） FACT complex subunit × 1 （C4QYQ8） ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7XTI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7XSX RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49) 提交 2022-05-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 k 32–559（528 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7XT7 RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC49B) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 k 32–559（528 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XTD RNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58oct) 提交 2022-05-16 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 k 32–559（528 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9WMW Co-transcriptional histone H3K36 methylation complex containing RNA polymerase II elongation complex, Set2, and the upstream nucleosome. (temp115, FACT-hexamer) 提交 2025-09-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 k 32–559（528 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F2QNN8_KOMPC
Isoform —
PDB实体 31
链与序列区间 作者链 k； PDB构建体 4–531； UniProt 32–559

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7xti

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7xti
下载 Download
▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7xti
沉积日期 deposition_date2022-05-17
结构标题 titleRNA polymerase II elongation complex transcribing a nucleosome (EC58hex)
关键词 keywordschromatin, nucleosome, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTION-DNA-RNA complex; TRANSCRIPTION/DNA/RNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier77.52 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron77.33 Å
零角强度 I(0) i018558300000.00
分子量 molecular_weight1121500.0 kDa
排除体积 excluded_volume1388900 ų
包络体积 envelope_volume2251900 ų
水化壳体积 shell_volume236560 ų
包络直径 envelope_diameter279.6 Å
壳层 Rg shell_rg80.56 Å
包络 Rg envelope_rg76.15 Å
形状 Rg shape_rg77.37 Å
总 Rg total_rg77.24 Å
总原子数 total_atoms78660
残基数 n_residues9510
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax201.6 Å
Rg (实空间) rg_real74.56 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.51 Å
I(0) (实空间) i0_real1.7960e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.1360e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal77.66 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal18570000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8995
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary90.7 Å
偏度 Skewness skewness0.173
峰度 Kurtosis kurtosis-0.556
角度范围 angular_range— – 0.1000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.1783
最高正则化参数 α highest_alpha1891000000.0000
实空间数据点数 n_real_points21
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.994; Stabil: 0.987; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.001
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (33)

▶

8. 引用文献 (1)

▶

9. 文件与曲线 (10)