SAXSdb — 8dd0

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha cardiac muscle 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–377 链 B； UniProt 1–377 链 C； UniProt 1–377 链 D； UniProt 1–377 链 E； UniProt 1–377 链 F； UniProt 1–377	未记录	Tropomyosin alpha-1 chain × 8 （P42639） Troponin T2, cardiac type × 2 （I3LS66） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8DD0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5NOG Ca2+-induced Movement of Tropomyosin on Native Cardiac Thin Filaments - "Blocked" state 提交 2017-04-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 7–373（367 aa）链 B 7–373（367 aa）链 C 7–373（367 aa）链 D 7–373（367 aa）链 E 7–373（367 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 11.00 Å
5NOL Ca2+-induced Movement of Tropomyosin on Native Cardiac Thin Filaments - "Closed" state 提交 2017-04-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 7–373（367 aa）链 B 7–373（367 aa）链 C 7–373（367 aa）链 D 7–373（367 aa）链 E 7–373（367 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.00 Å
7JH7 cardiac actomyosin complex 提交 2020-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7LRG Filamentous actin decorated with human cardiac myosin binding protein C C2 domain 提交 2021-02-16	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
8EFH Helical reconstruction of the human cardiac actin-tropomyosin-myosin complex in complex with ADP-Mg2+ 提交 2022-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8EFI Helical reconstruction of the human cardiac actin-tropomyosin-myosin complex in the rigor form 提交 2022-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8ENC Helical reconstruction of the human cardiac actin-tropomyosin-myosin loop 4 7G mutant complex 提交 2022-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 1–377（377 aa）链 C 1–377（377 aa）链 D 1–377（377 aa）链 E 1–377（377 aa）链 F 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8UWW The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free state from the upper strand 提交 2023-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
8UWX The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free tilted state from the upper strand 提交 2023-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.00 Å
8UWY The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free rotated state from the upper strand 提交 2023-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.50 Å
8UYD The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free state from the lower strand 提交 2023-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.30 Å
8UZ5 The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free rotated state from the lower strand 提交 2023-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.90 Å
8UZ6 The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free tilted state from the lower strand 提交 2023-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
8UZX The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-bound fully activated state from the upper strand 提交 2023-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.40 Å
8UZY The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-bound partially activated state from the upper strand 提交 2023-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.30 Å
8V01 The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-bound fully activated state 1 from the lower strand 提交 2023-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.50 Å
8V0I The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-bound fully activated state 2 from the lower strand 提交 2023-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8V0K The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-bound partially activated state from the lower strand 提交 2023-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.20 Å
8V0Y The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free state from the upper strand activated by the C1-domain of cardiac myosin binding protein C 提交 2023-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–377（377 aa）链 B 1–377（377 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.00 Å

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B6VNT8_PIG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 B； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 C； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 D； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 E； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 F； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377

Tropomyosin alpha-1 chain

物种未注明

UniProt P42639

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 1–284 链 H； UniProt 1–284 链 I； UniProt 1–284 链 J； UniProt 1–284 链 L； UniProt 1–284 链 M； UniProt 1–284 链 N； UniProt 1–284 链 O； UniProt 1–284	未记录	Actin, alpha cardiac muscle 1 × 6 （B6VNT8） Troponin T2, cardiac type × 2 （I3LS66） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8DD0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1C1G CRYSTAL STRUCTURE OF TROPOMYOSIN AT 7 ANGSTROMS RESOLUTION IN THE SPERMINE-INDUCED CRYSTAL FORM 提交 1999-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–284（284 aa）链 B 1–284（284 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 7.4；291 K；SPERMINE, pH 7.4, LIQUID DIFFUSION, temperature 18K	分辨率 7.00 Å
1C1G CRYSTAL STRUCTURE OF TROPOMYOSIN AT 7 ANGSTROMS RESOLUTION IN THE SPERMINE-INDUCED CRYSTAL FORM 提交 1999-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–284（284 aa）链 D 1–284（284 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 7.4；291 K；SPERMINE, pH 7.4, LIQUID DIFFUSION, temperature 18K	分辨率 7.00 Å
8UWW The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free state from the upper strand 提交 2023-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 1–284（284 aa）链 G 1–284（284 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.10 Å
8UWX The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free tilted state from the upper strand 提交 2023-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 1–284（284 aa）链 G 1–284（284 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.00 Å
8UWY The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free rotated state from the upper strand 提交 2023-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 1–284（284 aa）链 G 1–284（284 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.50 Å
8UYD The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free state from the lower strand 提交 2023-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 1–284（284 aa）链 G 1–284（284 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.30 Å
8UZ5 The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free rotated state from the lower strand 提交 2023-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 1–284（284 aa）链 G 1–284（284 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.90 Å
8UZ6 The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free tilted state from the lower strand 提交 2023-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 1–284（284 aa）链 G 1–284（284 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.10 Å
8UZX The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-bound fully activated state from the upper strand 提交 2023-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 1–284（284 aa）链 G 1–284（284 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.40 Å
8UZY The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-bound partially activated state from the upper strand 提交 2023-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 1–284（284 aa）链 G 1–284（284 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.30 Å
8V01 The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-bound fully activated state 1 from the lower strand 提交 2023-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 1–284（284 aa）链 G 1–284（284 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.50 Å
8V0I The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-bound fully activated state 2 from the lower strand 提交 2023-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 1–284（284 aa）链 G 1–284（284 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
8V0K The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-bound partially activated state from the lower strand 提交 2023-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 1–284（284 aa）链 G 1–284（284 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.20 Å
8V0Y The structure of the native cardiac thin filament troponin core in Ca2+-free state from the upper strand activated by the C1-domain of cardiac myosin binding protein C 提交 2023-11-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 1–284（284 aa）链 G 1–284（284 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.00 Å

共 13 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TPM1_PIG
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 H； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 I； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 J； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 L； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 M； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 N； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 O； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284

Troponin T2, cardiac type

物种未注明

UniProt I3LS66

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 1–295 链 P； UniProt 1–295	未记录	Actin, alpha cardiac muscle 1 × 6 （B6VNT8） Tropomyosin alpha-1 chain × 8 （P42639） ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I3LS66_PIG
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–295； UniProt 1–295 作者链 P； PDB构建体 1–295； UniProt 1–295

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8dd0
沉积日期 deposition_date	2022-06-17
结构标题 title	The structure of the native cardiac thin filament junction region
关键词 keywords	thin filament, actin, tropomyosin, troponin, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	56.04 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	56.44 Å
零角强度 I(0) i0	1581500000.00
分子量 molecular_weight	326640.0 kDa
排除体积 excluded_volume	406820 Å³
包络体积 envelope_volume	595560 Å³
水化壳体积 shell_volume	91697 Å³
包络直径 envelope_diameter	214.6 Å
壳层 Rg shell_rg	54.83 Å
包络 Rg envelope_rg	56.27 Å
形状 Rg shape_rg	56.46 Å
总 Rg total_rg	56.34 Å
总原子数 total_atoms	22892
残基数 n_residues	2876
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	197.5 Å
Rg (实空间) rg_real	56.51 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.19 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.5810e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.1720e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	55.64 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1579000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8090
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	56.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.622
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.053
角度范围 angular_range	— – 0.1400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	145200000.0000
实空间数据点数 n_real_points	29
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.667; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.950; Smooth: 0.563

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Actin, alpha cardiac muscle 1
分子量 formula_weight	42064.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	22892

MCDDEETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDEAGPSIVHRKCF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tropomyosin alpha-1 chain
分子量 formula_weight	32762.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H,I,J,L,M,N,O

MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKRLEDELVSLQKKLKATEDELDKYSEAPKDAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALNDMTSI

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Troponin T2, cardiac type
分子量 formula_weight	35158.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,P

MSDVEETVDEYEEEQEEGAAEEEEAWRQDGDEQEEAVEEEAGGEAEAEEANAEEAGQEEDGREAEDGPMEESKPKPRLFMPNLVPPKIPDGERVDFDDIHRKRMKDLNELQTLIEAHFENRKKEEELVSLKDRIEKRRAERAEQQRIRTEREKERQTRLAEERARREEEENRRKAEDEARKKKALSNMMHFGGYIQKQAQTERKSGKRQTEREKKKKILAERRKVLAIDHLNEDQLREKAKELWQSIYNLEAEKFDLQEKFKQQKYEINVLRNRINDNQKVSKTRGKAKVTGRWK

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	8dd0A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	8dd0B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	8dd0C01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	8dd0D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	8dd0E01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	8dd0F01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

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8. 引用文献 (1)

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分辨率 resolution	3.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	236359

fit	/app/data/saxs_computation/dd/8dd0/8dd0.fit
pddf	/app/data/pr_computation/dd/8dd0/8dd0.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/dd/8dd0/8dd0.dat

The structure of the native cardiac thin filament junction region

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha cardiac muscle 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tropomyosin alpha-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Troponin T2, cardiac type

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)