← 返回搜索
8i9t

Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-1

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 239.7 Å Quality: EXCELLENT
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Brix domain-containing protein

物种未注明

UniProt G0RXZ3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CA； UniProt 1–316 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 CA 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CA 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CA 1–316（316 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CA 1–316（316 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CA 1–316（316 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CA 1–316（316 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CA 1–316（316 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CA 1–316（316 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0RXZ3_CHATD
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 CA； PDB构建体 1–316； UniProt 1–316

Ribosome biogenesis protein C8F11.04

物种未注明

UniProt G0S7X0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CB； UniProt 1–391 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5JPQ Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome 提交 2016-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 k 1–391（391 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
5OQL Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome from Chaetomium thermophilum 提交 2017-08-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：55-meric
链 Q 1–391（391 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6RXT Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state A 提交 2019-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：57-meric
链 UZ 1–391（391 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
6RXU Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state B1 提交 2019-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 64 PDB 声明：66-meric
链 UZ 1–391（391 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6RXV Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state B2 提交 2019-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：68-meric
链 UZ 1–391（391 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
6RXY Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state a 提交 2019-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 UZ 1–391（391 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6RXZ Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state b 提交 2019-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：68-meric
链 UZ 1–391（391 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 CB 1–391（391 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CB 1–391（391 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CB 1–391（391 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CB 1–391（391 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CB 1–391（391 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CB 1–391（391 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CB 1–391（391 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CB 1–391（391 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CB 1–391（391 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CB 1–391（391 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 CB 1–391（391 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CB 1–391（391 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 CB 1–391（391 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S7X0_CHATD
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 CB； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391

Ribosome biogenesis protein ERB1

物种未注明

UniProt G0SCK6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CC； UniProt 1–801 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5CXB Structure of Ytm1 bound to the C-terminal domain of Erb1 in P21 21 2 space group 提交 2015-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 433–801（369 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；20% PEG 8000, 0.1M Hepes pH 7.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.213
5CXC Structure of Ytm1 bound to the C-terminal domain of Erb1 in P 65 2 2 space group 提交 2015-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 433–801（369 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；294 K；15% PEG 4000,0.1M Na citrate pH 5.6, 0.2M Ammonium sulfate
分辨率 3.10 Å R-free 0.239
5CYK Structure of Ytm1 bound to the C-terminal domain of Erb1-R486E 提交 2015-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 433–801（369 aa） 片段：UNP residues 433-801
突变：R486E CL CHLORIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；0.1M Hepes pH 7.5, 2M Ammonium Sulfate
分辨率 3.00 Å R-free 0.262
5EM2 Crystal structure of the Erb1-Ytm1 complex 提交 2015-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 423–801（379 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；20-28% ethylene glycol
分辨率 2.67 Å R-free 0.251
5EM2 Crystal structure of the Erb1-Ytm1 complex 提交 2015-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 423–801（379 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；20-28% ethylene glycol
分辨率 2.67 Å R-free 0.251
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 CC 1–801（801 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CC 1–801（801 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CC 1–801（801 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CC 1–801（801 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CC 1–801（801 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CC 1–801（801 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CC 1–801（801 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CC 1–801（801 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 CC 1–801（801 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å

共 13 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ERB1_CHATD
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 CC； PDB构建体 1–801； UniProt 1–801

RNA helicase

物种未注明

UniProt G0RYU9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CE； UniProt 1–556 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 CE 1–556（556 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CE 1–556（556 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CE 1–556（556 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CE 1–556（556 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CE 1–556（556 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CE 1–556（556 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CE 1–556（556 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CE 1–556（556 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0RYU9_CHATD
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 CE； PDB构建体 1–598； UniProt 1–556

Ribosome assembly factor mrt4

物种未注明

UniProt G0S616

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CF； UniProt 1–270 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 CF 1–270（270 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9XB4 Crystal structure of Mrt4 (L96C) mutant 提交 2025-10-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–270（270 aa）
突变：L96C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；0.1 M bicine and 2.22 M (NH4)2SO4
分辨率 2.50 Å R-free 0.283

共 17 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MRT4_CHATD
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 CF； PDB构建体 1–270； UniProt 1–270

60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7

物种未注明

UniProt G0S435

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CG； UniProt 1–184 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CG 1–184（184 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CG 1–184（184 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CG 1–184（184 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CG 1–184（184 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CG 1–184（184 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CG 1–184（184 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CG 1–184（184 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S435_CHATD
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 CG； PDB构建体 1–184； UniProt 1–184

Nucleolar GTP-binding protein 1

物种未注明

UniProt G0S8F1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CH； UniProt 1–661 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 CH 1–661（661 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å

共 17 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NOG1_CHATD
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 CH； PDB构建体 1–661； UniProt 1–661

Putative RNA-binding protein

物种未注明

UniProt G0S1H0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CI； UniProt 1–414 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 CI 1–414（414 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S1H0_CHATD
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 CI； PDB构建体 1–414； UniProt 1–414

Pescadillo homolog

物种未注明

UniProt G0SHX6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CJ； UniProt 1–679 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 CJ 1–679（679 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SHX6_CHATD
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 CJ； PDB构建体 1–679； UniProt 1–679

Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog

物种未注明

UniProt G0S081

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CK； UniProt 1–261 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2MVF Structural insight into an essential assembly factor network on the pre-ribosome 提交 2014-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 168–261（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；280 K；离子强度（mmCIF原始值）5；压力 ambient
NMR样品组成 10 % D2O, 10 mM TRIS, 90 % H2O, 5 mM sodium chloride, 1 uM DSS, 2 mM TCEP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 CK 1–261（261 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å

共 17 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S081_CHATD
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 CK； PDB构建体 1–261； UniProt 1–261

Putative GTP binding protein

物种未注明

UniProt G0SEW3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CL； UniProt 1–558 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 CL 1–558（558 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SEW3_CHATD
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 CL； PDB构建体 1–558； UniProt 1–558

60S ribosomal protein l7-like protein

物种未注明

UniProt G0SFL0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CM； UniProt 1–249 链 LF； UniProt 1–249 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 CM 1–249（249 aa）
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LF 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SFL0_CHATD
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 CM； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249 作者链 LF； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249

Eukaryotic translation initiation factor 6

物种未注明

UniProt G0S683

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CN； UniProt 1–246 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5M3Q Crystal structure of Tif6 from Chaetomium thermophilum 提交 2016-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–246（246 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；291 K；0.1 M Na-citrate pH 5.6 0.5 M Ammonium sulfate 1 M Lithium sulfate
分辨率 1.50 Å R-free 0.177
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 CN 1–246（246 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S683_CHATD
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 CN； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246

DUF2423 domain-containing protein

物种未注明

UniProt G0SHK0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CO； UniProt 1–120 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 CO 1–120（120 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SHK0_CHATD
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 CO； PDB构建体 1–120； UniProt 1–120

RNA methyltransferase nop2-like protein

物种未注明

UniProt G0SHQ0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CP； UniProt 1–751 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CP 1–751（751 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CP 1–751（751 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CP 1–751（751 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CP 1–751（751 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CP 1–751（751 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CP 1–751（751 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CP 1–751（751 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SHQ0_CHATD
Isoform —
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 CP； PDB构建体 1–751； UniProt 1–751

Ribosome biogenesis protein RLP24

物种未注明

UniProt G0S497

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CQ； UniProt 1–225 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 CQ 1–225（225 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å

共 17 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S497_CHATD
Isoform —
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 CQ； PDB构建体 1–225； UniProt 1–225

Nucleolar protein 16

物种未注明

UniProt G0S832

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CR； UniProt 1–237 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 CR 1–237（237 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CR 1–237（237 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CR 1–237（237 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CR 1–237（237 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CR 1–237（237 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CR 1–237（237 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CR 1–237（237 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CR 1–237（237 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S832_CHATD
Isoform —
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 CR； PDB构建体 1–237； UniProt 1–237

AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1

物种未注明

UniProt G0SGD8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CS； UniProt 1–548 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CS 1–834（834 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CS 1–834（834 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CS 1–834（834 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CS 1–834（834 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CS 1–834（834 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CS 1–834（834 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SGD8_CHATD
Isoform —
PDB实体 21
链与序列区间 作者链 CS； PDB构建体 1–548； UniProt 1–548

rRNA-processing protein EBP2

物种未注明

UniProt G0SGC2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CU； UniProt 1–451 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 CU 1–451（451 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CU 1–451（451 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CU 1–451（451 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CU 1–451（451 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CU 1–451（451 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CU 1–451（451 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CU 1–451（451 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CU 1–451（451 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SGC2_CHATD
Isoform —
PDB实体 22
链与序列区间 作者链 CU； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451

60S ribosomal subunit-like protein

物种未注明

UniProt G0SGJ0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 CX； UniProt 1–203 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 CX 1–203（203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 CX 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 CX 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CX 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 CX 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 CX 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 CX 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SGJ0_CHATD
Isoform —
PDB实体 23
链与序列区间 作者链 CX； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203

rRNA-processing protein

物种未注明

UniProt G0SCP3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Cz； UniProt 1–123 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 Cz 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SCP3_CHATD
Isoform —
PDB实体 24
链与序列区间 作者链 Cz； PDB构建体 1–123； UniProt 1–123

ATP-dependent RNA helicase DBP10

物种未注明

UniProt G0S5S8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Cb； UniProt 1–634 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 Cb 1–924（924 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 Cb 1–924（924 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Cb 1–924（924 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S5S8_CHATD
Isoform —
PDB实体 25
链与序列区间 作者链 Cb； PDB构建体 1–634； UniProt 1–634

Ribosomal RNA-processing protein 15

物种未注明

UniProt G0S5P7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Ch； UniProt 1–354 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Ch 1–354（354 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S5P7_CHATD
Isoform —
PDB实体 26
链与序列区间 作者链 Ch； PDB构建体 1–354； UniProt 1–354

60S ribosomal protein L3-like protein

物种未注明

UniProt G0RXW1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LB； UniProt 1–392 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LB 1–388（388 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LB 1–392（392 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 24 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0RXW1_CHATD
Isoform —
PDB实体 27
链与序列区间 作者链 LB； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392

60S ribosomal protein L4-like protein

物种未注明

UniProt G0SFC3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LC； UniProt 1–365 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5TQB Crystal structure of assembly chaperone of ribosomal protein L4 (Acl4) in complex with ribosomal protein L4 (RpL4) 提交 2016-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–277（277 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；294 K；0.1 M BIS-TRIS (pH 5.5) 2 % (v/v) Tacsminate (pH 5.5) 13 % (w/v) PEG 3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.225
5TQC Crystal structure of transport factor karyopherin-beta 2 in complex with the PY-NLS of ribosomal protein L4 (RpL4) 提交 2016-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 308–332（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；0.5 M Sodium citrate tribasic 0.1 M BIS-TRIS-propane pH 7.0
分辨率 3.00 Å R-free 0.238
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LC 1–365（365 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 27 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SFC3_CHATD
Isoform —
PDB实体 28
链与序列区间 作者链 LC； PDB构建体 1–365； UniProt 1–365

60S ribosomal protein L6

物种未注明

UniProt G0S0D6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LE； UniProt 1–200 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LE 1–200（200 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S0D6_CHATD
Isoform —
PDB实体 29
链与序列区间 作者链 LE； PDB构建体 1–200； UniProt 1–200

60S ribosomal protein L8

物种未注明

UniProt G0SAJ9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LG； UniProt 1–262 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LG 1–262（262 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SAJ9_CHATD
Isoform —
PDB实体 30
链与序列区间 作者链 LG； PDB构建体 1–262； UniProt 1–262

60S ribosomal protein l9-like protein

物种未注明

UniProt G0S0E5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LH； UniProt 1–229 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LH 1–229（229 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LH 1–229（229 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LH 1–229（229 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LH 1–229（229 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LH 1–229（229 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LH 1–229（229 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LH 1–229（229 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LH 1–229（229 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LH 1–15（15 aa）
链 LH 53–229（177 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LH 1–229（229 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LH 1–229（229 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S0E5_CHATD
Isoform —
PDB实体 31
链与序列区间 作者链 LH； PDB构建体 1–192； UniProt 1–229

60S ribosomal protein L12-like protein

物种未注明

UniProt G0SGH8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LK； UniProt 1–165 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LK 1–165（165 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å

共 22 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SGH8_CHATD
Isoform —
PDB实体 32
链与序列区间 作者链 LK； PDB构建体 1–165； UniProt 1–165

60S ribosomal protein L13

物种未注明

UniProt G0S992

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LL； UniProt 1–213 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LL 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S992_CHATD
Isoform —
PDB实体 33
链与序列区间 作者链 LL； PDB构建体 1–213； UniProt 1–213

60S ribosomal protein L14-like protein

物种未注明

UniProt G0S1R0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LM； UniProt 1–142 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LM 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S1R0_CHATD
Isoform —
PDB实体 34
链与序列区间 作者链 LM； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

Ribosomal protein L15

物种未注明

UniProt G0RZ88

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LN； UniProt 1–203 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LN 1–203（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0RZ88_CHATD
Isoform —
PDB实体 35
链与序列区间 作者链 LN； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203

60S ribosomal protein L16-like protein

物种未注明

UniProt G0SH61

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LO； UniProt 1–204 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LO 1–204（204 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LO 1–204（204 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LO 1–204（204 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LO 1–204（204 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LO 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LO 2–204（203 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LO 2–204（203 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SH61_CHATD
Isoform —
PDB实体 36
链与序列区间 作者链 LO； PDB构建体 1–204； UniProt 1–204

60S ribosomal protein l17-like protein

物种未注明

UniProt G0SGY1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LP； UniProt 1–187 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LP 2–187（186 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LP 1–187（187 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SGY1_CHATD
Isoform —
PDB实体 37
链与序列区间 作者链 LP； PDB构建体 1–187； UniProt 1–187

Ribosomal protein L18-like protein

物种未注明

UniProt G0S9B5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LQ； UniProt 1–213 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LQ 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S9B5_CHATD
Isoform —
PDB实体 38
链与序列区间 作者链 LQ； PDB构建体 1–213； UniProt 1–213

60S ribosomal protein L20

物种未注明

UniProt G0SCE2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LS； UniProt 1–174 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LS 1–174（174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SCE2_CHATD
Isoform —
PDB实体 39
链与序列区间 作者链 LS； PDB构建体 1–174； UniProt 1–174

60S ribosomal protein l21-like protein

物种未注明

UniProt G0S0Z3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LT； UniProt 1–160 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LT 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S0Z3_CHATD
Isoform —
PDB实体 40
链与序列区间 作者链 LT； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160

60S ribosomal protein l23-like protein

物种未注明

UniProt G0SI44

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LV； UniProt 1–139 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LV 1–139（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 24 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SI44_CHATD
Isoform —
PDB实体 41
链与序列区间 作者链 LV； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139

60S ribosomal protein L25-like protein

物种未注明

UniProt G0S507

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LX； UniProt 1–156 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8ONZ Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LX 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S507_CHATD
Isoform —
PDB实体 42
链与序列区间 作者链 LX； PDB构建体 1–156； UniProt 1–156

60S ribosomal protein L26-like protein

物种未注明

UniProt G0RYN9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 LY； UniProt 1–138 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8ONZ Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 LY 1–138（138 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 26 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0RYN9_CHATD
Isoform —
PDB实体 43
链与序列区间 作者链 LY； PDB构建体 1–138； UniProt 1–138

60S ribosomal protein L32-like protein

物种未注明

UniProt G0S6V4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Le； UniProt 1–131 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 Le 1–131（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S6V4_CHATD
Isoform —
PDB实体 44
链与序列区间 作者链 Le； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131

60S ribosomal protein l33-like protein

物种未注明

UniProt G0SCL3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Lf； UniProt 1–109 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 Lf 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SCL3_CHATD
Isoform —
PDB实体 45
链与序列区间 作者链 Lf； PDB构建体 1–109； UniProt 1–109

dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase

物种未注明

UniProt G0S0D7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Lh； UniProt 1–935 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 Lh 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Lh 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 Lh 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 Lh 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8ONZ Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 Lh 1–126（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 Lh 1–935（935 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 Lh 1–126（126 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 Lh 1–126（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 26 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S0D7_CHATD
Isoform —
PDB实体 46
链与序列区间 作者链 Lh； PDB构建体 1–935； UniProt 1–935

60S ribosomal protein L36

物种未注明

UniProt G0SBN1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Li； UniProt 1–110 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SBN1_CHATD
Isoform —
PDB实体 47
链与序列区间 作者链 Li； PDB构建体 1–110； UniProt 1–110

Ribosomal protein L37

物种未注明

UniProt G0S101

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Lj； UniProt 1–95 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OLC Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at idle POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 571 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OLD Thermophilic eukaryotic 80S ribosome at pe/E (TI)-POST state 提交 2021-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7Z3N Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-1 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 455 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7Z3O Cryo-EM structure of the ribosome-associated RAC complex on the 80S ribosome - RAC-2 conformation 提交 2022-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：86-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 472 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8OO0 Chaetomium thermophilum Methionine Aminopeptidase 2 autoproteolysis product at the 80S ribosome 提交 2023-04-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：85-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PV1 Chaetomium thermophilum pre-60S State 6 - pre-5S rotation - L1 intermediate - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.56 Å
8PV2 Chaetomium thermophilum pre-60S State 10 - pre-5S rotation with Ytm1-Erb1 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
8PV3 Chaetomium thermophilum pre-60S State 9 - pre-5S rotation - immature H68/H69 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV5 Chaetomium thermophilum pre-60S State 8 - pre-5S rotation without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV7 Chaetomium thermophilum pre-60S State 1 - pre-5S rotation (Arx1/Nog2 state) - Composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：59-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.12 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å
8PVL Chaetomium thermophilum pre-60S State 7 - pre-5S rotation lacking Utp30/ITS2 - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：58-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
9I1W High resolution structure of the thermophilic 60S ribosomal subunit of Chaetomium thermophilum 提交 2025-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 2 SPM SPERMINE × 2 MG MAGNESIUM ION × 239 K POTASSIUM ION × 188 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.38 Å
9I78 Cryo-EM structure of Chaetomium thermophilum ribosome-bound SND3 translocon 提交 2025-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 Lj 1–95（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 379 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；waiting time: 15 s blot force: 0
分辨率 2.20 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S101_CHATD
Isoform —
PDB实体 48
链与序列区间 作者链 Lj； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95

Ribosomal protein

物种未注明

UniProt G0S4Z9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Lq； UniProt 1–217 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Lq 1–217（217 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 Lq 1–217（217 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9W Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Dbp10-3 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric
链 Lq 1–217（217 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9X Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-1 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Lq 1–217（217 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8I9Y Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - Ytm1-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric
链 Lq 1–217（217 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9Z Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Spb4 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：60-meric
链 Lq 1–217（217 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8IA0 Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Puf6 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：64-meric
链 Lq 1–217（217 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8PV4 Chaetomium thermophilum pre-60S State 2 - pre-5S rotation with Rix1 complex - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 62 PDB 声明：66-meric
链 Lr 1–217（217 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8PV6 Chaetomium thermophilum pre-60S State 3 - post-5S rotation with Rix1 complex with Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：64-meric
链 Lr 1–217（217 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
8PV8 Chaetomium thermophilum pre-60S State 4 - post-5S rotation with Rix1 complex without Foot - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：60-meric
链 Lt 1–217（217 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.91 Å
8PVK Chaetomium thermophilum pre-60S State 5 - pre-5S rotation - L1 inward - composite structure 提交 2023-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 Lr 1–217（217 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S4Z9_CHATD
Isoform —
PDB实体 49
链与序列区间 作者链 Lq； PDB构建体 1–217； UniProt 1–217

Ribosomal RNA-processing protein 1

物种未注明

UniProt G0S4M2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Cc； UniProt 1–282 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6EMF Crystal structure of Rrp1 from Chaetomium thermophilum in space group C2 提交 2017-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–282（282 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；200 mM Proline 100 mM HEPES pH 7.5 10% PEG3350
分辨率 2.65 Å R-free 0.232
6EMF Crystal structure of Rrp1 from Chaetomium thermophilum in space group C2 提交 2017-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–282（282 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PRO PROLINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；200 mM Proline 100 mM HEPES pH 7.5 10% PEG3350
分辨率 2.65 Å R-free 0.232
6EMG Crystal structure of Rrp1 from Chaetomium thermophilum in space group P6322 提交 2017-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–282（282 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.8M K-H2PO4 0.8M Na-H2PO4
分辨率 2.24 Å R-free 0.207
6EMG Crystal structure of Rrp1 from Chaetomium thermophilum in space group P6322 提交 2017-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–282（282 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.8M K-H2PO4 0.8M Na-H2PO4
分辨率 2.24 Å R-free 0.207
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 Cc 1–282（282 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Cc 1–282（282 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 Cc 1–282（282 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 5 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S4M2_CHATD
Isoform —
PDB实体 50
链与序列区间 作者链 Cc； PDB构建体 1–282； UniProt 1–282

Brix domain-containing protein

物种未注明

UniProt G0S4S2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Cd； UniProt 1–436 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 Cd 1–436（436 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Cd 1–436（436 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 Cd 1–436（436 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S4S2_CHATD
Isoform —
PDB实体 51
链与序列区间 作者链 Cd； PDB构建体 1–436； UniProt 1–436

Protein MAK16

物种未注明

UniProt G0SFD6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Ce； UniProt 1–336 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9P Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Mak16 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 Ce 1–336（336 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Ce 1–336（336 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 Ce 1–336（336 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SFD6_CHATD
Isoform —
PDB实体 52
链与序列区间 作者链 Ce； PDB构建体 1–336； UniProt 1–336

60S ribosome biogenesis protein Rrp14

物种未注明

UniProt G0S2I7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Cf； UniProt 1–570 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） Brix domain-containing protein × 1 （G0S732） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Cf 1–570（570 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8I9V Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-2 提交 2023-02-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 53 PDB 声明：56-meric
链 Cf 1–570（570 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S2I7_CHATD
Isoform —
PDB实体 53
链与序列区间 作者链 Cf； PDB构建体 1–570； UniProt 1–570

Brix domain-containing protein

物种未注明

UniProt G0S732

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 3 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物数一致 链 Cg； UniProt 1–478 未记录 RNA (3341-MER) × 1 RNA (256-MER) × 1 RNA (161-MER) × 1 Brix domain-containing protein × 1 （G0RXZ3） Ribosome biogenesis protein C8F11.04 × 1 （G0S7X0） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （G0SCK6） RNA helicase × 1 （G0RYU9） Ribosome assembly factor mrt4 × 1 （G0S616） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （G0S435） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （G0S8F1） Putative RNA-binding protein × 1 （G0S1H0） Pescadillo homolog × 1 （G0SHX6） Ribosome biogenesis protein NSA2 homolog × 1 （G0S081） Putative GTP binding protein × 1 （G0SEW3） 60S ribosomal protein l7-like protein × 2 （G0SFL0） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （G0S683） DUF2423 domain-containing protein × 1 （G0SHK0） RNA methyltransferase nop2-like protein × 1 （G0SHQ0） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （G0S497） Nucleolar protein 16 × 1 （G0S832） AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 × 1 （G0SGD8） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （G0SGC2） 60S ribosomal subunit-like protein × 1 （G0SGJ0） rRNA-processing protein × 1 （G0SCP3） ATP-dependent RNA helicase DBP10 × 1 （G0S5S8） Ribosomal RNA-processing protein 15 × 1 （G0S5P7） 60S ribosomal protein L3-like protein × 1 （G0RXW1） 60S ribosomal protein L4-like protein × 1 （G0SFC3） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G0S0D6） 60S ribosomal protein L8 × 1 （G0SAJ9） 60S ribosomal protein l9-like protein × 1 （G0S0E5） 60S ribosomal protein L12-like protein × 1 （G0SGH8） 60S ribosomal protein L13 × 1 （G0S992） 60S ribosomal protein L14-like protein × 1 （G0S1R0） Ribosomal protein L15 × 1 （G0RZ88） 60S ribosomal protein L16-like protein × 1 （G0SH61） 60S ribosomal protein l17-like protein × 1 （G0SGY1） Ribosomal protein L18-like protein × 1 （G0S9B5） 60S ribosomal protein L20 × 1 （G0SCE2） 60S ribosomal protein l21-like protein × 1 （G0S0Z3） 60S ribosomal protein l23-like protein × 1 （G0SI44） 60S ribosomal protein L25-like protein × 1 （G0S507） 60S ribosomal protein L26-like protein × 1 （G0RYN9） 60S ribosomal protein L32-like protein × 1 （G0S6V4） 60S ribosomal protein l33-like protein × 1 （G0SCL3） dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase × 1 （G0S0D7） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G0SBN1） Ribosomal protein L37 × 1 （G0S101） Ribosomal protein × 1 （G0S4Z9） Ribosomal RNA-processing protein 1 × 1 （G0S4M2） Brix domain-containing protein × 1 （G0S4S2） Protein MAK16 × 1 （G0SFD6） 60S ribosome biogenesis protein Rrp14 × 1 （G0S2I7） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8I9T Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8I9R Cryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State 5S RNP 提交 2023-02-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Cg 1–478（478 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S732_CHATD
Isoform —
PDB实体 54
链与序列区间 作者链 Cg； PDB构建体 1–478； UniProt 1–478

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8i9t

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8i9t
下载 Download
▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8i9t
沉积日期 deposition_date2023-02-07
结构标题 titleCryo-EM structure of a Chaetomium thermophilum pre-60S ribosomal subunit - State Dbp10-1
关键词 keywordsRibosome, Ribosome biogenesis, pre-60S ribosome; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier87.91 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron90.39 Å
零角强度 I(0) i087872000000.00
分子量 molecular_weight1949100.0 kDa
排除体积 excluded_volume2201300 ų
包络体积 envelope_volume3813500 ų
水化壳体积 shell_volume334960 ų
包络直径 envelope_diameter311.8 Å
壳层 Rg shell_rg97.18 Å
包络 Rg envelope_rg89.21 Å
形状 Rg shape_rg90.53 Å
总 Rg total_rg90.06 Å
总原子数 total_atoms133790
残基数 n_residues12842
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax239.7 Å
Rg (实空间) rg_real84.55 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.61 Å
I(0) (实空间) i0_real8.4220e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.5720e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal87.81 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal87840000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9167
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary106.5 Å
偏度 Skewness skewness0.242
峰度 Kurtosis kurtosis-0.475
角度范围 angular_range— – 0.0900 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.7150
最高正则化参数 α highest_alpha9289000000.0000
实空间数据点数 n_real_points19
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.993; Stabil: 0.980; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.001
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (56)

▶

8. 引用文献 (1)

▶

9. 文件与曲线 (10)