SAXSdb — 8k37

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tail tube protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Tail tube terminator protein × 6 （P03732） Head-tail connector protein FII × 6 （P03714）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TUBE_LAMBD
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246 作者链 H； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246 作者链 I； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246 作者链 J； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246 作者链 K； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246 作者链 L； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246

Tail tube terminator protein

物种未注明

UniProt P03732

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Tail tube protein × 6 （P03733） Head-tail connector protein FII × 6 （P03714）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TTTP_LAMBD
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131 作者链 B； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131 作者链 C； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131 作者链 D； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131 作者链 E； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131 作者链 F； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131

Head-tail connector protein FII

物种未注明

UniProt P03714

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Tail tube protein × 6 （P03733） Tail tube terminator protein × 6 （P03732）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FII_LAMBD
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117 作者链 N； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117 作者链 O； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117 作者链 P； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117 作者链 Q； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117 作者链 R； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8k37
沉积日期 deposition_date	2023-07-14
结构标题 title	Structure of the bacteriophage lambda neck
关键词 keywords	Complex, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8k37__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8k37__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8k37__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	45.50 Å
Rg（电子密度）	44.46 Å
总 Rg	44.76 Å
原子数	18528
残基数	2394
排除体积	324510 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8k37__assembly_1__model_1`	octadecameric （18）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Tail tube protein
分子量 formula_weight	25831.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H,I,J,K,L
原子数 atom_count	18528

MPVPNPTMPVKGAGTTLWVYKGSGDPYANPLSDVDWSRLAKVKDLTPGELTAESYDDSYLDDEDADWTATGQGQKSAGDTSFTLAWMPGEQGQQALLAWFNEGDTRAYKIRFPNGTVDVFRGWVSSIGKAVTAKEVITRTVKVTNVGRPSMAEDRSTVTAATGMTVTPASTSVVKGQSTTLTVAFQPEGVTDKSFRAVSADKTKATVSVSGMTITVNGVAAGKVNIPVVSGNGEFAAVAEITVTAS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tail tube terminator protein
分子量 formula_weight	14659.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F

MKHTELRAAVLDALEKHDTGATFFDGRPAVFDEADFPAVAVYLTGAEYTGEELDSDTWQAELHIEVFLPAQVPDSELDAWMESRIYPVMSDIPALSDLITSMVASGYDYRRDDDAGLWSSADLTYVITYEM

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Head-tail connector protein FII
分子量 formula_weight	12775.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,N,O,P,Q,R

MADFDNLFDAAIARADETIRGYMGTSATITSGEQSGAVIRGVFDDPENISYAGQGVRVEGSSPSLFVRTDEVRQLRRGDTLTIGEENFWVDRVSPDDGGSCHLWLGRGVPPAVNRRR

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分辨率 resolution	3.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	75098

Structure of the bacteriophage lambda neck

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tail tube protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tail tube terminator protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Head-tail connector protein FII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8k37__assembly_1__model_1

8k37__assembly_1__model_1 | I(q)

8k37__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

Structure of the bacteriophage lambda neck

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tail tube protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tail tube terminator protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Head-tail connector protein FII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8k37__assembly_1__model_1

8k37__assembly_1__model_1 | I(q)

8k37__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)