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8rjd

Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 2

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 207.1 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1

物种未注明

UniProt P38377

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 1； UniProt 1–476 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2WWB CRYO-EM STRUCTURE OF THE MAMMALIAN SEC61 COMPLEX BOUND TO THE ACTIVELY TRANSLATING WHEAT GERM 80S RIBOSOME 提交 2009-10-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–476（476 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 30 MM HEPES/KOH, PH 7.5 180 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 1 MM DTT, 3.5 % (W/V) GLYCEROL 0.3 % (W/V) DIGITONIN；pH 7.5；30 MM HEPES/KOH, PH 7.5 180 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 1 MM DTT, 3.5 % (W/V) GLYCEROL 0.3 % (W/V) DIGITONIN
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- VITROBOT, METHOD- BLOT FOR 10 SECONDS BEFORE PLUNGING, USE 2 LAYERS OF FILTER PAPER
分辨率 6.48 Å
3JC2 The structure of the mammalian Sec61 channel opened by a signal sequence 提交 2015-11-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 1 1–476（476 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 3 uL sample was added to the grid, incubated for 30 seconds at 4 C, blotted for 9 seconds；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was added to the grid, incubated for 30 seconds at 4 C, blotted for 9 seconds, and then plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT).
分辨率 3.60 Å
4CG5 Cryo-EM of the Sec61-complex bound to the 80S ribosome translating a secretory substrate 提交 2013-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–476（476 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT；pH 7.6；30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 3 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 7.40 Å
4CG6 Cryo-em of the Sec61-complex bound to the 80s ribosome translating a membrane-inserting substrate 提交 2013-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–476（476 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT；pH 7.6；30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 3 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 7.80 Å
4CG7 Cryo-EM of the Sec61-complex bound to the idle 80S ribosome 提交 2013-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–476（476 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT；pH 7.6；30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 3 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 6.90 Å
5A6U Native mammalian ribosome-bound Sec61 protein-conducting channel in the 'non-inserting' state 提交 2015-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 26–476（451 aa） 片段：UNP RESIDUES 26-476
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20MM HEPES, 50MM KCL, 2MM MGCL2；pH 7.6；20MM HEPES, 50MM KCL, 2MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 70, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT 3 SECONDS BEFORE PLUNGING.,
分辨率 9.00 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 x 5–465（461 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 x 5–465（461 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 x 5–465（461 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 XX 5–465（461 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6Z3T Structure of canine Sec61 inhibited by mycolactone 提交 2020-05-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–476（476 aa）
未记录 Q6B [(6~{S},7~{S},9~{Z},12~{R})-12-[(~{Z},2~{S},6~{R},7~{R},9~{R})-4,6-dimethyl-7,9-bis(oxidanyl)dec-4-en-2-yl]-7,9-dimethyl-2-oxidanylidene-1-oxacyclododec-9-en-6-yl] (2~{E},4~{E},6~{E},8~{E},10~{E},12~{S},13~{S},15~{S})-4,6,10-trimethyl-12,13,15-tris(oxidanyl)hexadeca-2,4,6,8,10-pentaenoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 5 seconds Blot force -15 Incubation time 15 seconds
分辨率 2.69 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 1 1–476（476 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 1 1–476（476 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 SX 1–476（476 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8OJ0 60S ribosomal subunit bound to the E3-UFM1 complex - state 2 (native) 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric
链 1 1–476（476 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8OJ8 60S ribosomal subunit bound to the E3-UFM1 complex - state 1 (native) 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 1 1–476（476 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 1 1–476（476 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 1 1–476（476 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 S61A1_CANLF
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 1； PDB构建体 1–476； UniProt 1–476

Protein transport protein Sec61 subunit beta

物种未注明

UniProt P60467

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 2； UniProt 1–96 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2WWB CRYO-EM STRUCTURE OF THE MAMMALIAN SEC61 COMPLEX BOUND TO THE ACTIVELY TRANSLATING WHEAT GERM 80S RIBOSOME 提交 2009-10-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：pentadecameric
链 C 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 30 MM HEPES/KOH, PH 7.5 180 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 1 MM DTT, 3.5 % (W/V) GLYCEROL 0.3 % (W/V) DIGITONIN；pH 7.5；30 MM HEPES/KOH, PH 7.5 180 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 1 MM DTT, 3.5 % (W/V) GLYCEROL 0.3 % (W/V) DIGITONIN
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- VITROBOT, METHOD- BLOT FOR 10 SECONDS BEFORE PLUNGING, USE 2 LAYERS OF FILTER PAPER
分辨率 6.48 Å
4CG5 Cryo-EM of the Sec61-complex bound to the 80S ribosome translating a secretory substrate 提交 2013-11-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 61–96（36 aa） 片段：RESIDUES 61-96
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT；pH 7.6；30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 3 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 7.40 Å
4CG6 Cryo-em of the Sec61-complex bound to the 80s ribosome translating a membrane-inserting substrate 提交 2013-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT；pH 7.6；30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 3 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 7.80 Å
5A6U Native mammalian ribosome-bound Sec61 protein-conducting channel in the 'non-inserting' state 提交 2015-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 61–96（36 aa） 片段：UNP RESIDUES 61-96
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20MM HEPES, 50MM KCL, 2MM MGCL2；pH 7.6；20MM HEPES, 50MM KCL, 2MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 70, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT 3 SECONDS BEFORE PLUNGING.,
分辨率 9.00 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 z 68–96（29 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 z 68–96（29 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 z 68–96（29 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 ZZ 68–96（29 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 2 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 2 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 SZ 1–96（96 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 2 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 2 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SC61B_CANLF
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 2； PDB构建体 1–96； UniProt 1–96

Protein transport protein Sec61 subunit gamma

物种未注明

UniProt P60058

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 3； UniProt 1–68 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2WWB CRYO-EM STRUCTURE OF THE MAMMALIAN SEC61 COMPLEX BOUND TO THE ACTIVELY TRANSLATING WHEAT GERM 80S RIBOSOME 提交 2009-10-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：pentadecameric
链 B 1–68（68 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 30 MM HEPES/KOH, PH 7.5 180 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 1 MM DTT, 3.5 % (W/V) GLYCEROL 0.3 % (W/V) DIGITONIN；pH 7.5；30 MM HEPES/KOH, PH 7.5 180 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 1 MM DTT, 3.5 % (W/V) GLYCEROL 0.3 % (W/V) DIGITONIN
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- VITROBOT, METHOD- BLOT FOR 10 SECONDS BEFORE PLUNGING, USE 2 LAYERS OF FILTER PAPER
分辨率 6.48 Å
3JC2 The structure of the mammalian Sec61 channel opened by a signal sequence 提交 2015-11-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 2 7–68（62 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 3 uL sample was added to the grid, incubated for 30 seconds at 4 C, blotted for 9 seconds；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was added to the grid, incubated for 30 seconds at 4 C, blotted for 9 seconds, and then plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT).
分辨率 3.60 Å
4CG5 Cryo-EM of the Sec61-complex bound to the 80S ribosome translating a secretory substrate 提交 2013-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–68（68 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT；pH 7.6；30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 3 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 7.40 Å
4CG6 Cryo-em of the Sec61-complex bound to the 80s ribosome translating a membrane-inserting substrate 提交 2013-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–68（68 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT；pH 7.6；30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 3 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 7.80 Å
4CG7 Cryo-EM of the Sec61-complex bound to the idle 80S ribosome 提交 2013-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–68（68 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT；pH 7.6；30 MM HEPES/KOH 7.6, 10 MM MG(OAC)2, 180 MM KOAC/HAC PH 7.6, 0.3 % DIGITONIN, 1 MM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 3 SECONDS BEFORE PLUNGING,
分辨率 6.90 Å
5A6U Native mammalian ribosome-bound Sec61 protein-conducting channel in the 'non-inserting' state 提交 2015-07-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 7–68（62 aa） 片段：UNP RESIDUES 7-68
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20MM HEPES, 50MM KCL, 2MM MGCL2；pH 7.6；20MM HEPES, 50MM KCL, 2MM MGCL2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, HUMIDITY- 70, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT 3 SECONDS BEFORE PLUNGING.,
分辨率 9.00 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 y 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 y 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 y 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 YY 7–68（62 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6Z3T Structure of canine Sec61 inhibited by mycolactone 提交 2020-05-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–68（68 aa）
未记录 Q6B [(6~{S},7~{S},9~{Z},12~{R})-12-[(~{Z},2~{S},6~{R},7~{R},9~{R})-4,6-dimethyl-7,9-bis(oxidanyl)dec-4-en-2-yl]-7,9-dimethyl-2-oxidanylidene-1-oxacyclododec-9-en-6-yl] (2~{E},4~{E},6~{E},8~{E},10~{E},12~{S},13~{S},15~{S})-4,6,10-trimethyl-12,13,15-tris(oxidanyl)hexadeca-2,4,6,8,10-pentaenoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot time 5 seconds Blot force -15 Incubation time 15 seconds
分辨率 2.69 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 SY 1–68（68 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 3 1–68（68 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 3 1–68（68 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SC61G_CANLF
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 3； PDB构建体 1–68； UniProt 1–68

Stress-associated endoplasmic reticulum protein

物种未注明

UniProt A0A8C0RGL8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 4； UniProt 1–66 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 4 1–66（66 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 4 1–66（66 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A8C0RGL8_CANLF
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 4； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66

Translocon-associated protein subunit alpha

物种未注明

UniProt P16967

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 5； UniProt 1–286 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 TA 1–286（286 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 5 1–286（286 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SSRA_CANLF
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 5； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286

Translocon-associated protein subunit beta

物种未注明

UniProt P23438

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 6； UniProt 1–183 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 TB 1–183（183 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 6 1–183（183 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SSRB_CANLF
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 6； PDB构建体 1–183； UniProt 1–183

Translocon-associated protein subunit gamma

物种未注明

UniProt A0A8C0T6I4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 7； UniProt 1–185 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 7 1–185（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A8C0T6I4_CANLF
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 7； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185

Translocon-associated protein subunit delta

物种未注明

UniProt A0A8I3PXW2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 8； UniProt 1–173 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 8 1–173（173 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A8I3PXW2_CANLF
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 8； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173

Calnexin

物种未注明

UniProt P24643

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 9； UniProt 1–593 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1JHN Crystal Structure of the Lumenal Domain of Calnexin 提交 2001-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 45–468（424 aa） 片段：lumenal domain (residues 45-468)
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；HEPES, MPD, Calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.377
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 9 1–593（593 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 CALX_CANLF
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 9； PDB构建体 1–593； UniProt 1–593

Ribosomal protein L8

物种未注明

UniProt G1TT27

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 1–257 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 A 2–245（244 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 A 2–245（244 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 A 2–245（244 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5Y Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：46-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 A 2–245（244 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 A 2–245（244 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 A 2–245（244 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AA 2–253（252 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 A3 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 A3 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 A3 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 A3 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 A 2–249（248 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 A 2–249（248 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 A 2–249（248 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 A 2–249（248 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AA 1–257（257 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AA 1–257（257 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AA 1–257（257 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AA 1–257（257 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 A 2–249（248 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 A 2–249（248 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 A 2–245（244 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 A 2–249（248 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 A2 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 A3 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 92 2–245（244 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 92 2–245（244 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 A 2–245（244 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 A 2–245（244 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL02 2–249（248 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 A 2–249（248 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 A 2–249（248 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL02 2–249（248 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL02 2–249（248 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL02 2–249（248 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BA 1–257（257 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BA 1–257（257 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BA 1–257（257 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BA 1–257（257 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BA 1–257（257 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 D3 1–257（257 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 A 1–257（257 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 80 个其他 PDB 条目、80 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TT27_RABIT
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–257； UniProt 1–257

Large ribosomal subunit protein uL4

物种未注明

UniProt A0A5F9C3C5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 15–439 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 C2 15–439（425 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 C 15–439（425 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 C 15–439（425 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 C 15–439（425 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A5F9C3C5_RABIT
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–425； UniProt 15–439

Ribosomal_L18_c domain-containing protein

物种未注明

UniProt G1SYJ6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 D； UniProt 1–297 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 D 3–294（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 D 3–294（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 D 3–294（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 D 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 D 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 D 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 D 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 D 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 D 3–294（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 D 3–294（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 D 3–294（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 D3 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 D3 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 D3 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 D3 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 D 3–295（293 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 D 3–295（293 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 D 3–295（293 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 D 3–295（293 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AD 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AD 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AD 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AD 1–297（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 D 3–295（293 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 D 3–295（293 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 D 3–294（292 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 D 3–295（293 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 D2 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 D3 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 G2 3–294（292 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 G2 3–294（292 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 D 2–297（296 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 D3 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 D 2–297（296 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 D 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BD 1–297（297 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BD 1–297（297 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BD 1–297（297 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BD 1–297（297 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 D 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 D 2–297（296 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL05 3–295（293 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL05 3–295（293 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 D 3–293（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 D 3–293（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LG 1–297（297 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 LG 1–297（297 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 D 3–295（293 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 D 3–295（293 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 m3 3–295（293 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 D2 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BD 1–297（297 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BD 1–297（297 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 D 1–297（297 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 73 个其他 PDB 条目、73 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SYJ6_RABIT
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–297； UniProt 1–297

60S ribosomal protein L6

物种未注明

UniProt G1SKF7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 E； UniProt 1–291 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 E3 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 E3 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 E3 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 E3 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AE 1–291（291 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AE 1–291（291 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AE 1–291（291 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AE 1–291（291 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 E 41–291（251 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 E 41–291（251 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 E 41–291（251 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 E2 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 E3 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 T2 91–291（201 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 T2 91–291（201 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 E3 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BE 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BE 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BE 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BE 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 E 44–291（248 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL06 41–291（251 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL06 41–291（251 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 E 42–291（250 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 E 41–291（251 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LH 1–291（291 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 LH 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 n3 41–291（251 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 E2 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BE 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BE 1–291（291 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL06 41–291（251 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL06 41–291（251 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL06 41–291（251 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BE 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BE 1–291（291 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BE 1–291（291 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BE 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BE 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 A2 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 E 1–291（291 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SKF7_RABIT
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–291； UniProt 1–291

Ribosomal Protein uL30

物种未注明

UniProt G1TUB1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 F； UniProt 1–247 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 F3 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 F3 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 F3 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 F3 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 F2 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 F3 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BF 1–247（247 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 F 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BF 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BF 1–247（247 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BF 1–247（247 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BF 1–247（247 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BF 1–247（247 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 K 1–247（247 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 K 1–247（247 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 K 1–247（247 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 K 1–247（247 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 K 1–247（247 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 K 1–247（247 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 K 1–247（247 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 K 1–247（247 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 K 1–247（247 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 K 1–247（247 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 G1TUB1_RABIT
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–247； UniProt 1–247

60S ribosomal protein L7a

物种未注明

UniProt G1STW0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 G； UniProt 1–319 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 G 2–242（241 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 G 2–242（241 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 G 2–242（241 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 G 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 G 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 G 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 G 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 G 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 G 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 G 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 G 1–242（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 G 1–242（242 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 G 1–242（242 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 G 2–242（241 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 G 2–242（241 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 G 2–242（241 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AG 1–242（242 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AG 1–242（242 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AG 1–242（242 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AG 1–242（242 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 G 3–242（240 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 G 3–242（240 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 G 2–242（241 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 G 3–242（240 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 G3 2–242（241 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 G 2–242（241 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 p3 80–319（240 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 G2 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BG 78–319（242 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL08 80–319（240 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL08 80–319（240 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL08 80–319（240 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 C2 1–319（319 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 G 1–319（319 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 G1STW0_RABIT
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–319； UniProt 1–319

60S ribosomal protein L9

物种未注明

UniProt G1SWI6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 H； UniProt 1–192 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 W2 1–190（190 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 W2 1–190（190 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 H3 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BH 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BH 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BH 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BH 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL09 1–190（190 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL09 1–190（190 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LK 1–192（192 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 LK 1–192（192 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 H 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 q3 1–190（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 H2 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BH 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BH 1–192（192 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL09 1–190（190 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL09 1–190（190 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL09 1–190（190 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BH 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BH 1–192（192 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BH 1–192（192 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BH 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BH 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 D2 1–192（192 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 H 1–192（192 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 65 个其他 PDB 条目、65 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SWI6_RABIT
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–192； UniProt 1–192

60S ribosomal protein L10

物种未注明

UniProt B7NZQ2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 I； UniProt 1–214 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 I 2–214（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 I 2–214（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 I 2–214（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 I 2–214（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 I 2–214（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 I 2–214（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AI 3–213（211 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 I3 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 I3 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 I3 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 I3 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AI 1–214（214 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AI 1–214（214 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AI 1–214（214 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AI 1–214（214 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 I 2–214（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 I 2–214（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 I 2–214（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 I 2–214（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 I2 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 I3 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 L2 2–103（102 aa）
链 X2 113–214（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 L2 2–103（102 aa）
链 X2 113–214（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 I3 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BI 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BI 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BI 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BI 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL10 2–214（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL10 2–214（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 I 2–214（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 I 2–214（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LL 1–214（214 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 LL 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 r3 2–214（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 I2 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BI 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BI 1–214（214 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL10 2–214（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL10 2–214（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL10 2–214（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BI 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BI 1–214（214 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BI 1–214（214 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BI 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BI 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 E2 1–214（214 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 I 1–214（214 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 98 个其他 PDB 条目、98 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 B7NZQ2_RABIT
Isoform —
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–214； UniProt 1–214

60S ribosomal protein L11

物种未注明

UniProt G1TUB8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 J； UniProt 1–178 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 J 9–177（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 J 9–177（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 J 9–177（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 J 9–177（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 J 9–177（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 J 9–177（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AJ 9–177（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 J3 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 J3 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 J3 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 J3 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 J 8–177（170 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 J 8–177（170 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 J 8–177（170 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AJ 1–178（178 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AJ 1–178（178 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AJ 1–178（178 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AJ 1–178（178 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 J 8–177（170 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 J 8–177（170 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 J 9–177（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 J 8–177（170 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 J2 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 J3 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Y2 9–177（169 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Y2 9–177（169 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 J3 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 J 3–178（176 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BJ 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BJ 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BJ 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BJ 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL11 9–177（169 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL11 8–177（170 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 J 9–177（169 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 J 8–177（170 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LM 1–178（178 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 LM 1–178（178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 J 8–177（170 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 J 8–177（170 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 s3 8–177（170 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 J2 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BJ 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BJ 1–178（178 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL11 8–177（170 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL11 8–177（170 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL11 8–177（170 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BJ 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BJ 1–178（178 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BJ 1–178（178 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BJ 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BJ 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 F2 1–178（178 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 J 1–178（178 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 97 个其他 PDB 条目、97 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TUB8_RABIT
Isoform —
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–178； UniProt 1–178

60S ribosomal protein L13

物种未注明

UniProt G1TPV0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 L； UniProt 5–203 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 L 2–202（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 L 2–202（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 L 2–202（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 L 2–202（201 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 a7 2–202（201 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 a7 2–202（201 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 L 2–202（201 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 L 2–202（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 L 2–202（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL13 2–202（201 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 L 2–202（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 L 2–202（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 L 5–203（199 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 K 2–202（201 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 K 1–202（202 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 K 1–202（202 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 K 1–202（202 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 K 1–202（202 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 K 1–202（202 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 L 1–202（202 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 G1TPV0_RABIT
Isoform —
PDB实体 21
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–211； UniProt 5–203

60S ribosomal protein L14

物种未注明

UniProt G1SZ12

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 M； UniProt 1–218 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 M3 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 M3 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 M3 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 M3 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 M2 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 M3 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 M3 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BM 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BM 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BM 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BM 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LP 1–218（218 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 LP 1–218（218 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 M 2–139（138 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 M 2–139（138 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 u3 2–139（138 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 L2 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BM 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BM 1–218（218 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 L 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 L 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 L 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 L 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 L 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 L 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL14 2–139（138 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL14 2–139（138 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL14 2–139（138 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BM 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BM 1–218（218 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BM 1–218（218 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 M 1–139（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BM 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BM 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 I2 1–218（218 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 M 1–218（218 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 67 个其他 PDB 条目、67 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SZ12_RABIT
Isoform —
PDB实体 22
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 1–218； UniProt 1–218

Ribosomal protein L15

物种未注明

UniProt G1T0C1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 N； UniProt 1–204 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AN 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 N3 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 N3 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 N3 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 N3 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AN 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AN 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AN 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AN 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 N2 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 N3 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 12 2–204（203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 12 2–204（203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 N3 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BN 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BN 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BN 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BN 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL15 2–204（203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL15 2–204（203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LQ 1–204（204 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 LQ 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 A1 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 M2 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BN 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BN 1–204（204 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 M 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 M 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 M 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 M 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 M 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 M 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL15 2–204（203 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL15 2–204（203 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL15 2–204（203 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BN 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BN 1–204（204 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BN 1–204（204 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 N 2–204（203 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BN 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BN 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 J2 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 N 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 97 个其他 PDB 条目、97 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1T0C1_RABIT
Isoform —
PDB实体 23
链与序列区间 作者链 N； PDB构建体 1–204； UniProt 1–204

60S ribosomal protein L13a

物种未注明

UniProt A0A0N8ETI8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 O； UniProt 1–203 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LR 1–203（203 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 LR 1–203（203 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BO 1–203（203 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BO 1–203（203 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A0N8ETI8_HETGA
Isoform —
PDB实体 24
链与序列区间 作者链 O； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203

uL22

物种未注明

UniProt G1TVT6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 P； UniProt 4–187 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 P 5–157（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 P 5–157（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 P 5–157（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 P3 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 P3 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 P3 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 P3 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AP 4–187（184 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AP 4–187（184 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AP 4–187（184 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AP 4–187（184 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 P 5–157（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 P 5–157（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 P 5–157（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 P 5–157（153 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 P2 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 P3 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 H2 5–157（153 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 H2 5–157（153 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 P 5–157（153 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BP 4–187（184 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BP 4–187（184 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BP 4–187（184 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BP 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 P 5–157（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BP 4–187（184 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BP 4–187（184 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 P 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 O 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 O 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 O 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 O 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 O 4–187（184 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 O 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 P 1–213（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 49 个其他 PDB 条目、49 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TVT6_RABIT
Isoform —
PDB实体 25
链与序列区间 作者链 P； PDB构建体 1–184； UniProt 4–187

Ribosomal protein L18

物种未注明

UniProt F6QKI9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 Q； UniProt 2–188 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 Q 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LT 1–188（188 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 LT 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Q 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BQ 1–188（188 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BQ 1–188（188 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BQ 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BQ 1–188（188 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 M2 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F6QKI9_CALJA
Isoform —
PDB实体 26
链与序列区间 作者链 Q； PDB构建体 1–187； UniProt 2–188

Ribosomal protein L19

物种未注明

UniProt G1TYL6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 R； UniProt 1–196 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 R 1–196（196 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL19 2–181（180 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL19 2–181（180 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 R 2–181（180 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 R 2–181（180 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 R 1–196（196 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 E1 2–181（180 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BR 1–196（196 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL19 2–181（180 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL19 2–181（180 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL19 2–181（180 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 R 1–196（196 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 N2 1–196（196 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TYL6_RABIT
Isoform —
PDB实体 27
链与序列区间 作者链 R； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196

60S ribosomal protein L18a

物种未注明

UniProt A0A287APR1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 S； UniProt 49–224 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3J7Q Structure of the idle mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 S 1–224（224 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 130 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.40 Å
3J7R Structure of the translating mammalian ribosome-Sec61 complex 提交 2014-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 S 1–224（224 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 166 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin；pH 7.5；50 mM HEPES, 200 mM potassium acetate, 15 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 0.25% Digitonin
cryo-EM玻璃化条件 120 K；冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was incubated on the grid for 30 seconds and blotted for 9 seconds before being plunged into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 S 49–224（176 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 S 49–224（176 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 S3 49–224（176 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 S 49–224（176 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 S 49–224（176 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 S 49–224（176 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287APR1_PIG
Isoform —
PDB实体 28
链与序列区间 作者链 S； PDB构建体 1–176； UniProt 49–224

60S ribosomal protein L21

物种未注明

UniProt G1SHQ2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 T； UniProt 1–160 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AT 2–158（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 T3 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 T3 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 T3 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 T3 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AT 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AT 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AT 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AT 1–160（160 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 T2 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 T3 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 72 2–160（159 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 72 2–160（159 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 T3 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BT 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BT 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BT 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BT 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL21 2–160（159 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL21 2–160（159 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LW 1–160（160 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 LW 1–160（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 T 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 G1 2–160（159 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 S2 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BT 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BT 1–160（160 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 S 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 S 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 S 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 S 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 S 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 S 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL21 2–160（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL21 2–160（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL21 2–160（159 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BT 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BT 1–160（160 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BT 1–160（160 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BT 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BT 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 P2 1–160（160 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 T 1–160（160 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 98 个其他 PDB 条目、98 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SHQ2_RABIT
Isoform —
PDB实体 29
链与序列区间 作者链 T； PDB构建体 1–160； UniProt 1–160

Large ribosomal subunit protein eL22

物种未注明

UniProt Q4R5I3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 U； UniProt 1–128 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 U 1–128（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LX 1–128（128 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 LX 1–128（128 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL22_MACFA
Isoform —
PDB实体 30
链与序列区间 作者链 U； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128

Ribosomal protein L23

物种未注明

UniProt G1T6D1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 V； UniProt 1–140 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AV 12–140（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 V3 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 V3 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 V3 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 V3 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AV 1–140（140 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AV 1–140（140 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AV 1–140（140 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AV 1–140（140 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 V2 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 V3 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 k2 10–140（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 k2 10–140（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 V3 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BV 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BV 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BV 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BV 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL23 10–140（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL23 10–140（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 V 11–140（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 V 10–140（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 U2 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BV 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BV 1–140（140 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 U 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 U 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 U 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 U 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 U 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 U 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL23 10–140（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL23 10–140（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL23 10–140（131 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BV 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BV 1–140（140 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BV 1–140（140 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BV 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BV 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 R2 1–140（140 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 V 1–140（140 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 94 个其他 PDB 条目、94 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1T6D1_RABIT
Isoform —
PDB实体 31
链与序列区间 作者链 V； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140

Ribosomal protein L24

物种未注明

UniProt G1SE28

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 W； UniProt 1–157 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 W 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 W 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 W 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AW 2–122（121 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 W3 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 W3 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AW 1–157（157 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AW 1–157（157 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AW 1–157（157 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AW 1–157（157 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 W 1–121（121 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 W 1–121（121 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 W 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 W 1–121（121 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 W2 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 W3 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 l2 1–63（63 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 l2 1–63（63 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 W 1–63（63 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BW 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BW 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BW 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BW 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 W 1–63（63 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL24 1–63（63 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL24 1–121（121 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 W 2–96（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 W 1–121（121 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LZ 1–157（157 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 LZ 1–157（157 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 V2 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BW 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BW 1–157（157 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 V 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 V 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 V 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 V 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 V 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL24 1–121（121 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL24 1–121（121 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL24 1–121（121 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BW 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BW 1–157（157 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BW 1–157（157 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BW 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BW 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 S2 1–157（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 W 1–157（157 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 G1SE28_RABIT
Isoform —
PDB实体 32
链与序列区间 作者链 W； PDB构建体 1–157； UniProt 1–157

Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein

物种未注明

UniProt G1SE76

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 X； UniProt 1–156 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 X 38–156（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 X 38–156（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 X 38–156（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 X 38–156（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 X 38–156（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 X 38–156（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 X3 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 X3 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 X3 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 X3 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AX 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AX 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AX 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AX 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 X 39–156（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 X 39–156（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 X 38–156（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 X 39–156（118 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 X2 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 X3 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 m2 38–156（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 m2 38–156（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 X3 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BX 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BX 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BX 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BX 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 La 1–156（156 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 La 1–156（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 X 39–156（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 X 39–156（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 K1 39–156（118 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 W2 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BX 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BX 1–156（156 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 W 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 W 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 W 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 W 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 W 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 W 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL25 39–156（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL25 39–156（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL25 39–156（118 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BX 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BX 1–156（156 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BX 1–156（156 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BX 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BX 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 T2 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 X 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 88 个其他 PDB 条目、88 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SE76_RABIT
Isoform —
PDB实体 33
链与序列区间 作者链 X； PDB构建体 1–156； UniProt 1–156

Ribosomal protein L26

物种未注明

UniProt G1SQH0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 Y； UniProt 1–145 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AY 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 Y3 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Y3 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 Y3 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Y3 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AY 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AY 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AY 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AY 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Y2 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 Y3 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 o2 1–134（134 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 o2 1–134（134 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Y3 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BY 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BY 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BY 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BY 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL26 1–134（134 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL26 1–134（134 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Y 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 L1 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 X2 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BY 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BY 1–145（145 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 X 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL26 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL26 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL26 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BY 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BY 1–145（145 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BY 1–145（145 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BY 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BY 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 U2 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 Y 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 G1SQH0_RABIT
Isoform —
PDB实体 34
链与序列区间 作者链 Y； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

60S ribosomal protein L27

物种未注明

UniProt G1TXF6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 Z； UniProt 1–136 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AZ 3–136（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 Z3 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Z3 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Z3 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AZ 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AZ 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AZ 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AZ 1–136（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Z2 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 Z3 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 22 2–136（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 22 2–136（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Z3 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BZ 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BZ 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BZ 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BZ 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL27 2–136（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL27 2–136（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Z 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 M1 2–136（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Y2 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BZ 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BZ 1–136（136 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 Y 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 Y 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 Y 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 Y 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 Y 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 Y 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL27 2–136（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL27 2–136（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL27 2–136（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BZ 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BZ 1–136（136 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BZ 1–136（136 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BZ 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BZ 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 V2 1–136（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 Z 1–136（136 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 95 个其他 PDB 条目、95 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TXF6_RABIT
Isoform —
PDB实体 35
链与序列区间 作者链 Z； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

60S ribosomal protein L27a

物种未注明

UniProt G1SNY0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 a； UniProt 1–148 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 a3 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Aa 1–148（148 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Aa 1–148（148 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Aa 1–148（148 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Aa 1–148（148 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 a2 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 a3 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 q2 2–148（147 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 q2 2–148（147 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ba 1–148（148 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ba 1–148（148 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Ba 1–148（148 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Ba 1–148（148 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL28 2–148（147 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL28 2–148（147 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ld 1–148（148 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Ld 1–148（148 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 N1 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Z2 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Ba 1–148（148 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Ba 1–148（148 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 Z 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 Z 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 Z 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 Z 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 Z 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 Z 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 a 2–148（147 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL28 2–148（147 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL28 2–148（147 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL28 2–148（147 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ba 1–148（148 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Ba 1–148（148 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Ba 1–148（148 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Ba 1–148（148 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Ba 1–148（148 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 W2 1–148（148 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 a 1–148（148 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 G1SNY0_RABIT
Isoform —
PDB实体 36
链与序列区间 作者链 a； PDB构建体 1–148； UniProt 1–148

60S ribosomal protein L29

物种未注明

UniProt G1SGR6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 b； UniProt 1–226 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 b 2–76（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 b 2–76（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 b 2–76（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 b3 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 b3 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 b3 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ab 1–226（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ab 1–226（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ab 1–226（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Ab 1–226（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 b 2–117（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 b 2–117（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 b 2–117（116 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 b3 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 b3 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bb 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bb 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Bb 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Bb 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 b 2–117（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 b 2–117（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Le 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Le 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 O1 2–117（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 a2 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Bb 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Bb 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 b 1–226（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 AA 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 AA 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 AA 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 AA 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 AA 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AA 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL29 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL29 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL29 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Bb 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Bb 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Bb 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Bb 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Bb 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 X2 1–245（245 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 b 1–245（245 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 77 个其他 PDB 条目、77 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1SGR6_RABIT
Isoform —
PDB实体 37
链与序列区间 作者链 b； PDB构建体 1–226； UniProt 1–226

Large ribosomal subunit protein eL30

物种未注明

UniProt G1TDL2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 c； UniProt 1–115 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 c3 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 c3 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 c3 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 c3 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 c 10–107（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 c 10–107（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 c 10–107（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 c 10–107（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ac 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ac 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ac 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Ac 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 c 10–107（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 c 10–107（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 c 10–107（98 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 c2 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 c3 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 13 13–106（94 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 13 13–106（94 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 c3 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bc 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bc 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Bc 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Bc 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 c 13–106（94 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL30 10–107（98 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 c 13–107（95 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 c 10–107（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Lf 1–115（115 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Lf 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 c 10–107（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 c 10–107（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 P1 10–107（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 b2 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Bc 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Bc 1–115（115 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 BA 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 BA 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 BA 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 BA 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 BA 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 BA 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 c 10–107（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL30 10–107（98 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL30 10–107（98 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL30 10–107（98 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Bc 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Bc 1–115（115 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Bc 1–115（115 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Bc 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Bc 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Y2 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 c 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 88 个其他 PDB 条目、88 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1TDL2_RABIT
Isoform —
PDB实体 38
链与序列区间 作者链 c； PDB构建体 1–115； UniProt 1–115

60S ribosomal protein L31

物种未注明

UniProt G1SHG0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 d； UniProt 1–125 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ad 18–123（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 d3 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 d3 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 d3 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 d3 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ad 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ad 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ad 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Ad 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 d2 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 d3 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 u2 18–124（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 u2 18–124（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 d3 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bd 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bd 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Bd 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Bd 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL31 18–124（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL31 18–124（107 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Lg 1–125（125 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Lg 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 Q1 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 c2 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Bd 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Bd 1–125（125 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 CA 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 CA 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 CA 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 CA 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 CA 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 CA 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 d 18–124（107 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL31 18–124（107 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL31 18–124（107 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL31 18–124（107 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Bd 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Bd 1–125（125 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Bd 1–125（125 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Bd 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Bd 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Z2 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 d 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SHG0_RABIT
Isoform —
PDB实体 39
链与序列区间 作者链 d； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

Ribosomal protein L32

物种未注明

UniProt G1U437

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 e； UniProt 1–135 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 e3 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 e3 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 e3 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 e 2–129（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 e 2–129（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 e 2–129（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 e 2–129（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ae 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ae 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ae 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Ae 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 e2 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 e3 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 e 1–129（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Be 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Be 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Be 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Be 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL32 2–129（128 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL32 2–129（128 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 e 2–129（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 e 2–129（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Lh 1–135（135 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Lh 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 e 2–129（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 e 2–129（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 R1 2–129（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 d2 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Be 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Be 1–135（135 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 e 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 DA 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 DA 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 DA 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 DA 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 DA 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 DA 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 e 2–129（128 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 52 个其他 PDB 条目、52 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1U437_RABIT
Isoform —
PDB实体 40
链与序列区间 作者链 e； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

60S ribosomal protein L35a

物种未注明

UniProt G1SF08

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 f； UniProt 1–110 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 f3 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 f3 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 f3 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 f3 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Af 1–110（110 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Af 1–110（110 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Af 1–110（110 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Af 1–110（110 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 f2 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 f3 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 x2 2–110（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 x2 2–110（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 f3 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bf 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bf 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Bf 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Bf 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL33 2–110（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL33 2–110（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Li 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 S1 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 e2 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Bf 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Bf 1–110（110 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 EA 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 EA 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 EA 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 EA 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 EA 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 EA 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 f 2–110（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL33 2–110（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL33 2–110（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL33 2–110（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Bf 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Bf 1–110（110 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Bf 1–110（110 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Bf 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Bf 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 b2 1–110（110 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 f 1–110（110 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 G1SF08_RABIT
Isoform —
PDB实体 41
链与序列区间 作者链 f； PDB构建体 1–110； UniProt 1–110

60S ribosomal protein L34

物种未注明

UniProt G1U945

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 g； UniProt 13–128 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 g 12–125（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 g 12–125（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 g 12–125（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 g 11–126（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 g 11–126（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 g 11–126（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 g 11–126（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 g 11–126（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 g 12–125（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 g 12–125（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 g 12–125（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ag 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ag 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ag 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Ag 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 g 12–125（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 g 12–125（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 g 12–125（114 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 g 12–125（114 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 g2 11–126（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 g3 11–126（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 y2 12–125（114 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 y2 12–125（114 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 g 13–128（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 g 1–129（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 g3 3–128（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 g 3–128（126 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 g 3–128（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 g 1–129（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 g 1–129（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 g 1–129（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 g 1–129（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 g 13–128（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 g 13–128（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 f2 13–128（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 g 13–128（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 g 13–128（116 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 FA 1–129（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 FA 1–129（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 FA 1–129（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 FA 1–129（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 FA 1–129（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å

共 42 个其他 PDB 条目、42 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1U945_RABIT
Isoform —
PDB实体 42
链与序列区间 作者链 g； PDB构建体 1–116； UniProt 13–128

60S ribosomal protein L35

物种未注明

UniProt G1SIT5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 h； UniProt 1–123 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 h3 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 h3 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 h3 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 h3 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ah 1–123（123 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ah 1–123（123 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ah 1–123（123 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Ah 1–123（123 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 h2 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 h3 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 A2 2–123（122 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 A2 2–123（122 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 h3 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bh 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bh 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Bh 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Bh 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL35 2–123（122 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL35 2–123（122 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Lk 1–123（123 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Lk 1–123（123 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 U1 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 g2 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Bh 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Bh 1–123（123 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 GA 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 GA 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 GA 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 GA 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 GA 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 GA 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 h 2–123（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL35 2–123（122 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL35 2–123（122 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL35 2–123（122 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Bh 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Bh 1–123（123 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Bh 1–123（123 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Bh 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Bh 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 d2 1–123（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 h 1–123（123 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 97 个其他 PDB 条目、97 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SIT5_RABIT
Isoform —
PDB实体 43
链与序列区间 作者链 h； PDB构建体 1–123； UniProt 1–123

60S ribosomal protein L36

物种未注明

UniProt G1TTQ5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 i； UniProt 1–105 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 i3 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 i3 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 i3 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 i3 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ai 1–105（105 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ai 1–105（105 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ai 1–105（105 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Ai 1–105（105 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 i2 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 i3 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 B2 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 B2 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bi 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bi 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Bi 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Bi 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL36 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL36 2–103（102 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 h2 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Bi 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Bi 1–105（105 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 HA 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 HA 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 HA 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 HA 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 HA 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 HA 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 i 2–103（102 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL36 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL36 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL36 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Bi 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Bi 1–105（105 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Bi 1–105（105 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Bi 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Bi 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 e2 1–105（105 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 i 1–105（105 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 90 个其他 PDB 条目、90 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1TTQ5_RABIT
Isoform —
PDB实体 44
链与序列区间 作者链 i； PDB构建体 1–105； UniProt 1–105

Ribosomal protein L37

物种未注明

UniProt U3KPD5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 j； UniProt 1–97 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Aj 2–85（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 j3 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 j3 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 j3 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 j3 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Aj 1–97（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Aj 1–97（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Aj 1–97（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Aj 1–97（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 j2 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 j3 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 C2 2–87（86 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 C2 2–87（86 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 j3 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bj 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bj 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Bj 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Bj 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL37 2–87（86 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL37 2–87（86 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Lm 1–97（97 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Lm 1–97（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 W1 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 i2 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Bj 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Bj 1–97（97 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 IA 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 IA 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 IA 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 IA 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 IA 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 IA 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 j 2–87（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL37 2–87（86 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL37 2–87（86 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL37 2–87（86 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Bj 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Bj 1–97（97 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Bj 1–97（97 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Bj 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Bj 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 f2 1–97（97 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 j 1–97（97 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 U3KPD5_RABIT
Isoform —
PDB实体 45
链与序列区间 作者链 j； PDB构建体 1–97； UniProt 1–97

Large ribosomal subunit protein eL38

物种未注明

UniProt G1U001

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 k； UniProt 1–70 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 k2 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 k3 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 p2 2–70（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 p2 2–70（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bk 1–70（70 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bk 1–70（70 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Bk 1–70（70 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Bk 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 X1 2–70（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 j2 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Bk 1–70（70 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Bk 1–70（70 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 JA 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 JA 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 JA 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 JA 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 JA 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 JA 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL38 2–70（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL38 2–70（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL38 2–70（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Bk 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Bk 1–70（70 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Bk 1–70（70 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 k 1–70（70 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Bk 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Bk 1–70（70 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 g2 1–70（70 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å

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UniProt名称 G1U001_RABIT
Isoform —
PDB实体 46
链与序列区间 作者链 k； PDB构建体 1–70； UniProt 1–70

60S ribosomal protein L39-like

物种未注明

UniProt G1TTN1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 l； UniProt 1–51 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 l3 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 l3 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 l3 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 l3 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 l 2–51（50 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 l 2–51（50 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 l 2–51（50 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 l 2–51（50 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Al 1–51（51 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Al 1–51（51 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Al 1–51（51 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Al 1–51（51 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 l 2–51（50 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 l 2–51（50 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 l 2–51（50 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 l2 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 l3 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 l3 2–51（50 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bl 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bl 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Bl 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Bl 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL39 2–51（50 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 l 2–51（50 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 l 2–51（50 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Lo 1–51（51 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Lo 1–51（51 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 l 2–51（50 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 l 2–51（50 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 Y1 2–51（50 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 k2 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Bl 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Bl 1–51（51 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 KA 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 KA 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 KA 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 KA 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 KA 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 KA 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 l 2–51（50 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL39 2–51（50 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL39 2–51（50 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL39 2–51（50 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Bl 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Bl 1–51（51 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Bl 1–51（51 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Bl 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Bl 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 h2 1–51（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 l 1–51（51 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 81 个其他 PDB 条目、81 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1TTN1_RABIT
Isoform —
PDB实体 47
链与序列区间 作者链 l； PDB构建体 1–51； UniProt 1–51

60S ribosomal protein L41

物种未注明

UniProt A0A087WNH4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 n； UniProt 1–25 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6P4G Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 n2 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 n3 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 X3 2–24（23 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 X3 2–24（23 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 n3 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL41 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Sl 1–25（25 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Sl 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 a1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 m2 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8Q7Z Structure of the G. gallus 80S non-rotated ribosome 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 494 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8Q87 Structure of the G. gallus 80S rotated ribosome in complex with eEF2 and SERBP1 提交 2023-08-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 492 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 MA 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 MA 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 MA 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 MA 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 MA 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 MA 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL41 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL41 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL41 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 l1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 A0A087WNH4_RABIT
Isoform —
PDB实体 49
链与序列区间 作者链 n； PDB构建体 1–25； UniProt 1–25

60S ribosomal protein L36a-like

物种未注明

UniProt G1U344

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 o； UniProt 1–106 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ao 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ao 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ao 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Ao 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 o2 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 o3 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bo 1–106（106 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bo 1–106（106 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Bo 1–106（106 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Bo 1–106（106 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 o 2–104（103 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 o 2–104（103 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 n2 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Bo 1–106（106 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Bo 1–106（106 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 o 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 NA 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 NA 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 NA 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 NA 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 NA 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 NA 1–106（106 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å

共 37 个其他 PDB 条目、37 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1U344_RABIT
Isoform —
PDB实体 50
链与序列区间 作者链 o； PDB构建体 1–106； UniProt 1–106

60S ribosomal protein L37a

物种未注明

UniProt G1SY53

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 p； UniProt 1–92 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ap 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 p3 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 p3 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 p3 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 p3 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ap 1–92（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ap 1–92（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ap 1–92（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Ap 1–92（92 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 p2 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 p3 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 I2 2–92（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 I2 2–92（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bp 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bp 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Bp 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Bp 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL43 2–92（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL43 2–92（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 c1 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 o2 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Bp 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Bp 1–92（92 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 OA 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 OA 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 OA 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 OA 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 OA 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 OA 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 p 2–92（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL43 2–92（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL43 2–92（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL43 2–92（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Bp 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Bp 1–92（92 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Bp 1–92（92 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Bp 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Bp 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 k2 1–92（92 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 p 1–92（92 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 94 个其他 PDB 条目、94 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SY53_RABIT
Isoform —
PDB实体 51
链与序列区间 作者链 p； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92

60S ribosomal protein L28

物种未注明

UniProt G1U7L1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 r； UniProt 1–137 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosomal protein L3 × 1 （G1TL06） MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 r 2–126（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 r 2–126（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 r 2–126（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 r 2–137（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 r 2–137（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 r 2–137（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 r3 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 r3 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 r3 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 r3 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 r 2–125（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 r 2–125（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 r 2–125（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 r 2–125（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ar 1–137（137 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ar 1–137（137 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Ar 1–137（137 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Ar 1–137（137 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 r 2–125（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 r 2–125（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 r 2–126（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 r 2–125（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 r2 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 r3 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 J2 2–126（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 J2 2–126（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 r3 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 EL28 2–126（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 ALNW 2–125（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 r 2–125（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 r 2–125（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 r 2–125（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 r 2–125（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 d1 2–125（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 p2 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Br 1–137（137 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Br 1–137（137 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 PA 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 PA 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 PA 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 PA 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 PA 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 PA 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 r 2–125（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 ALNW 2–125（124 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 ALNW 2–125（124 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 ALNW 2–125（124 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Br 2–137（136 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Br 2–137（136 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Br 2–137（136 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 r 1–137（137 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 G1U7L1_RABIT
Isoform —
PDB实体 53
链与序列区间 作者链 r； PDB构建体 1–137； UniProt 1–137

Ribosomal protein L3

物种未注明

UniProt G1TL06

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 52 RNA 4 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物数一致 链 w； UniProt 1–403 未记录 Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1 × 1 （P38377） Protein transport protein Sec61 subunit beta × 1 （P60467） Protein transport protein Sec61 subunit gamma × 1 （P60058） Stress-associated endoplasmic reticulum protein × 1 （A0A8C0RGL8） Translocon-associated protein subunit alpha × 1 （P16967） Translocon-associated protein subunit beta × 1 （P23438） Translocon-associated protein subunit gamma × 1 （A0A8C0T6I4） Translocon-associated protein subunit delta × 1 （A0A8I3PXW2） Calnexin × 1 （P24643） Ribosomal protein L8 × 1 （G1TT27） Nascent chain × 1 Large ribosomal subunit protein uL4 × 1 （A0A5F9C3C5） Ribosomal_L18_c domain-containing protein × 1 （G1SYJ6） 60S ribosomal protein L6 × 1 （G1SKF7） Ribosomal Protein uL30 × 1 （G1TUB1） 60S ribosomal protein L7a × 1 （G1STW0） 60S ribosomal protein L9 × 1 （G1SWI6） 60S ribosomal protein L10 × 1 （B7NZQ2） 60S ribosomal protein L11 × 1 （G1TUB8） 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L13 × 1 （G1TPV0） 60S ribosomal protein L14 × 1 （G1SZ12） Ribosomal protein L15 × 1 （G1T0C1） 60S ribosomal protein L13a × 1 （A0A0N8ETI8） uL22 × 1 （G1TVT6） Ribosomal protein L18 × 1 （F6QKI9） Ribosomal protein L19 × 1 （G1TYL6） 60S ribosomal protein L18a × 1 （A0A287APR1） 60S ribosomal protein L21 × 1 （G1SHQ2） Large ribosomal subunit protein eL22 × 1 （Q4R5I3） Ribosomal protein L23 × 1 （G1T6D1） Ribosomal protein L24 × 1 （G1SE28） Large ribosomal subunit protein uL23 N-terminal domain-containing protein × 1 （G1SE76） Ribosomal protein L26 × 1 （G1SQH0） 60S ribosomal protein L27 × 1 （G1TXF6） 60S ribosomal protein L27a × 1 （G1SNY0） 60S ribosomal protein L29 × 1 （G1SGR6） Large ribosomal subunit protein eL30 × 1 （G1TDL2） 60S ribosomal protein L31 × 1 （G1SHG0） Ribosomal protein L32 × 1 （G1U437） 60S ribosomal protein L35a × 1 （G1SF08） 60S ribosomal protein L34 × 1 （G1U945） 60S ribosomal protein L35 × 1 （G1SIT5） 60S ribosomal protein L36 × 1 （G1TTQ5） Ribosomal protein L37 × 1 （U3KPD5） Large ribosomal subunit protein eL38 × 1 （G1U001） 60S ribosomal protein L39-like × 1 （G1TTN1） eL40 × 1 60S ribosomal protein L41 × 1 （A0A087WNH4） 60S ribosomal protein L36a-like × 1 （G1U344） 60S ribosomal protein L37a × 1 （G1SY53） P-site tRNA × 1 60S ribosomal protein L28 × 1 （G1U7L1） 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.79 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 8RJD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 B 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 B 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 B 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 B 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 B 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 B 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 B3 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 B3 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 B3 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 B3 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AB 1–403（403 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 AB 2–403（402 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 AB 2–403（402 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 B2 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 B3 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 52 2–395（394 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 52 2–395（394 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 B 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 B 2–403（402 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 B3 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 B 2–403（402 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 B 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BB 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BB 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BB 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BB 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 B 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 w 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AL03 2–395（394 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL03 2–395（394 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 w 2–403（402 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LE 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 LE 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 B 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 k3 2–395（394 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 B2 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 BB 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 BB 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 w 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 w 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL03 2–395（394 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL03 2–395（394 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL03 2–395（394 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 BB 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 BB 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 BB 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 BB 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 BB 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 E3 1–403（403 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 B 1–403（403 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 96 个其他 PDB 条目、96 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TL06_RABIT
Isoform —
PDB实体 56
链与序列区间 作者链 w； PDB构建体 1–403； UniProt 1–403

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8rjd

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8rjd
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8rjd
沉积日期 deposition_date2023-12-20
结构标题 titleStructure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 2
关键词 keywordsRibosome, Membrane protein, Translocon, Transport; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier80.53 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron82.43 Å
零角强度 I(0) i0134265000000.00
分子量 molecular_weight2168300.0 kDa
排除体积 excluded_volume2318300 ų
包络体积 envelope_volume3768100 ų
水化壳体积 shell_volume345440 ų
包络直径 envelope_diameter316.3 Å
壳层 Rg shell_rg96.72 Å
包络 Rg envelope_rg83.65 Å
形状 Rg shape_rg82.55 Å
总 Rg total_rg82.24 Å
总原子数 total_atoms255550
残基数 n_residues11716
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax207.1 Å
Rg (实空间) rg_real77.43 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.36 Å
I(0) (实空间) i0_real1.2880e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.2030e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal81.18 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal134500000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9102
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary98.1 Å
偏度 Skewness skewness0.160
峰度 Kurtosis kurtosis-0.526
角度范围 angular_range— – 0.0950 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.2587
最高正则化参数 α highest_alpha14650000000.0000
实空间数据点数 n_real_points20
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.981; Stabil: 0.986; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.950; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (58)

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8. 引用文献 (4)

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9. 文件与曲线 (10)