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8s0j

A fragment-based inhibitor of SHP2

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 129.2 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11

Homo sapiens

UniProt Q06124

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–528 未记录 A1H4R 3-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-6-yl]propan-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl 分辨率 1.89 Å R-free 0.242
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–528 未记录 A1H4R 3-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-6-yl]propan-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl 分辨率 1.89 Å R-free 0.242

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8S0J Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2SHP TYROSINE PHOSPHATASE SHP-2 提交 1997-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
突变：T2K, F41L, F513S, DEL(528-593) CAT DODECANE-TRIMETHYLAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.270
2SHP TYROSINE PHOSPHATASE SHP-2 提交 1997-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
突变：T2K, F41L, F513S, DEL(528-593) CAT DODECANE-TRIMETHYLAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；pH 8.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.270
3B7O Crystal structure of the human tyrosine phosphatase SHP2 (PTPN11) with an accessible active site 提交 2007-10-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 237–529（293 aa） 片段：;'Residues 237-529 (Isoform 2)' ;
未记录 MLT D-MALATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG 3350, 0.15 M Na Malate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.209
3MOW Crystal structure of SHP2 in complex with a tautomycetin analog TTN D-1 提交 2010-04-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 262–532（271 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN (UNP RESIDUES 262-528)
未记录 B2B (2Z)-2-[(1R)-3-{[(1R,2S,3R,6S,7S,10S,12S,15E,17E)-18-carboxy-16-ethyl-3,7-dihydroxy-1,2,6,10,12-pentamethyl-5-oxooctade ca-15,17-dien-1-yl]oxy}-1-hydroxy-3-oxopropyl]-3-methylbut-2-enedioic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；25% w/v polyethylene glycol 3350, 100 mM sodium chloride, and 100 mM HEPES buffer (pH 7.5), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.222
3O5X Crystal structure of the oncogenic tyrosine phosphatase SHP2 complexed with a salicylic acid-based small molecule inhibitor 提交 2010-07-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 262–532（271 aa） 片段：UNP RESIDUES 262-532, CATALYTIC DOMAIN
未记录 JZG 3-{1-[3-(biphenyl-4-ylamino)-3-oxopropyl]-1H-1,2,3-triazol-4-yl}-6-hydroxy-1-methyl-2-phenyl-1H-indole-5-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20%PEG3350,1%v/v Tacsimate pH7.0, 100mM NaCl, 100 mM HEPES, pH7.5 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.238
3TKZ Structure of the SHP-2 N-SH2 domain in a 1:2 complex with RVIpYFVPLNR peptide 提交 2011-08-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain (UNP residues 1-106)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；20% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris, 0.2M Li2SO4, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.80 Å R-free 0.216
3TL0 Structure of SHP2 N-SH2 domain in complex with RLNpYAQLWHR peptide 提交 2011-08-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain, (UNP residues 1-106)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；20% PEG 3350, 0.1 M bis-Tris, 0.2 M Li2SO4, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.05 Å R-free 0.234
3ZM0 Catalytic domain of human SHP2 提交 2013-02-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 248–527（280 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 248-527
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 16-22 % (W/V) PEG3350, 0.1-0.2 M SODIUM CITRATE
分辨率 1.50 Å R-free 0.213
3ZM1 Catalytic domain of human SHP2 提交 2013-02-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 248–527（280 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 248-527
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 16-22% (W/V) PEG3350, 0.1-0.2 M SODIUM CITRATE
分辨率 1.40 Å R-free 0.203
3ZM2 Catalytic domain of human SHP2 提交 2013-02-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 248–527（280 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 248-527
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 16-22% (W/V) PEG3350 0.1-0.2 M SODIUM CITRATE
分辨率 1.50 Å R-free 0.223
3ZM3 Catalytic domain of human SHP2 提交 2013-02-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 248–531（284 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 248-527
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 16-22% (W/V) PEG3350, 0.1-0.2 M SODIUM CITRATE
分辨率 1.50 Å R-free 0.227
4DGP The wild-type Src homology 2 (SH2)-domain containing protein tyrosine phosphatase-2 (SHP2) 提交 2012-01-26 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2, and PTP domains (UNP residues 1-532)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；20% PEG3350, 300 mM potassium formate, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.255
4DGX LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/Y279C mutant 提交 2012-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2, and PTP domains (UNP residues 1-532)
突变：Y279C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；20% PEG3350, 300 mM potassium formate, 10 mM calcium chloride, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.266
4GWF Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with Y279C mutation 提交 2012-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–543（543 aa） 片段：UNP residues 22-560
突变：Y279C EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.1M Tris buffer pH8.0, 15% PEG4000, 0.02M DDT, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.243
4GWF Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with Y279C mutation 提交 2012-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–543（543 aa） 片段：UNP residues 22-560
突变：Y279C EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.1M Tris buffer pH8.0, 15% PEG4000, 0.02M DDT, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.243
4H1O Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with D61G mutation 提交 2012-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–543（543 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 and Phosphatase domain
突变：D61G EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.9；293 K；0.02M DDT, 0.1M Tris pH7.9, 13% PEG4000, 0.1M LiCl , VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.233
4H34 Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with Q506P mutation 提交 2012-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–543（543 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 and Phosphatase domain
突变：Q506P EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；0.02M DDT, 0.1M Tris pH8.0, 19% PEG4000, 10% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.242
4JE4 Crystal Structure of Monobody NSa1/SHP2 N-SH2 Domain Complex 提交 2013-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–103（103 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；30% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl, 0.2M Magnesium Chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.31 Å R-free 0.255
4JEG Crystal Structure of Monobody CS1/SHP2 C-SH2 Domain Complex 提交 2013-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 97–217（121 aa） 片段：C-terminal SH2 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis-tris, 0.2M Sodium Chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.227
4JMG Crystal structure of the synthetic protein in complex with pY peptide 提交 2013-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 579–591（13 aa） 片段：unp residues 579-591
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；30% (w/v) PEG3000, 0.2 M MgCl2, 0.1 M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.40 Å R-free 0.206
4NWF Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with N308D mutation 提交 2013-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–543（543 aa） 片段：UNP residues 1-543
突变：N308D EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.6；293 K；13% PEG4000, 0.1M Tris buffer, 10% glycerol, 0.02M DDT, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.309
4NWF Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with N308D mutation 提交 2013-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–543（543 aa） 片段：UNP residues 1-543
突变：N308D EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.6；293 K；13% PEG4000, 0.1M Tris buffer, 10% glycerol, 0.02M DDT, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.309
4NWG Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with E139D mutation 提交 2013-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–543（543 aa） 片段：UNP residues 1-543
突变：E139D EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；14.5% PEG4000, 0.1M Tris buffer, 0.02M DDT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.45 Å R-free 0.326
4NWG Crystal structure of the tyrosine phosphatase SHP-2 with E139D mutation 提交 2013-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–543（543 aa） 片段：UNP residues 1-543
突变：E139D EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；14.5% PEG4000, 0.1M Tris buffer, 0.02M DDT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.45 Å R-free 0.326
4OHD LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/A461T mutant 提交 2014-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 AND PTP DOMAIN
突变：A461T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；18% PEG3350, 300 mM KF, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.271
4OHE LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/G464A mutant 提交 2014-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 AND PTP DOMAIN
突变：G464A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；20% PEG3350, 300 mM LiCl, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.51 Å R-free 0.256
4OHH LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/Q506P mutant 提交 2014-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 AND PTP DOMAIN
突变：Q506P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；20% PEG3350, 200 mM KF, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
4OHI LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/Q510E mutant 提交 2014-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 AND PTP DOMAIN
突变：Q510E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；18% PEG3350, 200 mM KF, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.262
4OHL LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/T468M mutant 提交 2014-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 AND PTP DOMAIN
突变：T468M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；20% PEG3350, 300 mM KCOOH, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
4OHL LEOPARD Syndrome-Associated SHP2/T468M mutant 提交 2014-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–532（532 aa） 片段：N-SH2, C-SH2 AND PTP DOMAIN
突变：T468M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；293 K；20% PEG3350, 300 mM KCOOH, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
4PVG Crystal structure of protein tyrosine phosphatase Shp2 catalytic domain complex with small molecular compound L88N79 提交 2014-03-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 240–532（293 aa）
未记录 2WT 2-[3-({4-[(1,3-benzodioxol-5-ylmethyl)amino]-4-oxobutanoyl}amino)phenyl]-6-hydroxy-3-iodo-1-methyl-1H-indole-5-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；298 K；30% w/v polyethylene glycol 3350, 100 mM NaCl, 1mM L88N79 and 100mM HEPES (pH 7.7) , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.286
4QSY SHP2 SH2 domain in complex with GAB1 peptide 提交 2014-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：SH2 domain, UNP residues 1-104
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；25% PEG3000, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
4RDD Co-crystal structure of SHP2 in complex with a Cefsulodin derivative 提交 2014-09-18 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 262–532（271 aa） 片段：SHP2 CATALYTIC DOMAIN
未记录 3LU 1-({(2R)-4-carboxy-2-[(R)-carboxy{[(2R)-2-phenyl-2-sulfoacetyl]amino}methyl]-3,6-dihydro-2H-1,3-thiazin-5-yl}methyl)pyridinium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.4；293 K；20% PEG3350, 33 mM citric acid, 67 mM BIS-TRIS propane, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.201
5BK8 Cancer-associated SHP2/T507K mutant 提交 2019-06-01 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
突变：T507K 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% PEG3350, 200 mM LiCl
分辨率 2.25 Å R-free 0.262
5DF6 Crystal structure of PTPN11 tandem SH2 domains in complex with a TXNIP peptide 提交 2015-08-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–222（222 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；20% PEG-3350, 0.2 M ammonium formate
分辨率 1.78 Å R-free 0.248
5EHP Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP836 提交 2015-10-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa） 片段：UNP residues 1-525
未记录 5OA 5-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-2-[(3~{R},5~{S})-3,5-dimethylpiperazin-1-yl]pyrimidin-4-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG 3350, 200mM Ammonium Phosphate
分辨率 1.85 Å R-free 0.208
5EHP Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP836 提交 2015-10-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa） 片段：UNP residues 1-525
未记录 5OA 5-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-2-[(3~{R},5~{S})-3,5-dimethylpiperazin-1-yl]pyrimidin-4-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG 3350, 200mM Ammonium Phosphate
分辨率 1.85 Å R-free 0.208
5EHR Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP099 提交 2015-10-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa） 片段：UNP residues 1-525
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200mM Ammonium Phosphate
分辨率 1.70 Å R-free 0.221
5EHR Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP099 提交 2015-10-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa） 片段：UNP residues 1-525
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200mM Ammonium Phosphate
分辨率 1.70 Å R-free 0.221
5I6V Structure of F285S, a Cancer-Associated Mutation of the Oncogenic Phosphatase SHP2 提交 2016-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
突变：F285S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；297 K；0.2M Sodium Malonate, pH7.0, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.87 Å R-free 0.232
5I6V Structure of F285S, a Cancer-Associated Mutation of the Oncogenic Phosphatase SHP2 提交 2016-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
突变：F285S GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；297 K；0.2M Sodium Malonate, pH7.0, 20% w/v PEG3350
分辨率 1.87 Å R-free 0.232
5IBM Structure of S502P, a Cancer-Associated Mutation of the Oncogenic Phosphatase SHP2 提交 2016-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
突变：S502P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris, 20% PEG 3350 and 1 mM TCEP
分辨率 2.18 Å R-free 0.240
5IBM Structure of S502P, a Cancer-Associated Mutation of the Oncogenic Phosphatase SHP2 提交 2016-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
突变：S502P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris, 20% PEG 3350 and 1 mM TCEP
分辨率 2.18 Å R-free 0.240
5IBS Structure of E76Q, a Cancer-Associated Mutation of the Oncogenic Phosphatase SHP2 提交 2016-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa） 片段：UNP residues 1-525
突变：E76Q 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris, 20% PEG 3350 and 1 mM TCEP
分辨率 2.32 Å R-free 0.238
5IBS Structure of E76Q, a Cancer-Associated Mutation of the Oncogenic Phosphatase SHP2 提交 2016-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa） 片段：UNP residues 1-525
突变：E76Q 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris, 20% PEG 3350 and 1 mM TCEP
分辨率 2.32 Å R-free 0.238
5X7B Crystal structure of SHP2_SH2-CagA EPIYA_C peptide complex 提交 2017-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–220（220 aa） 片段：SH2 (UNP RESIDUES 1-220)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；29%(w/v) PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, 0.13 M sodium acetate
分辨率 2.45 Å R-free 0.278
5X94 Crystal structure of SHP2_SH2-CagA EPIYA_D peptide complex 提交 2017-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–220（220 aa） 片段：SH2 domain (UNP RESIDUES 1-220)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；31% PEG 4000, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.60 Å R-free 0.246
5X94 Crystal structure of SHP2_SH2-CagA EPIYA_D peptide complex 提交 2017-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–220（220 aa） 片段：SH2 domain (UNP RESIDUES 1-220)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；31% PEG 4000, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.60 Å R-free 0.246
5XZR The atomic structure of SHP2 E76A mutant in complex with allosteric inhibitor 9b 提交 2017-07-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–534（534 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-534
未记录 8J6 4-(3-phenylphenyl)-N-(2,2,6,6-tetramethylpiperidin-4-yl)-1,3-thiazol-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Sodium formate, 0.1 M Bicine pH 8.5, 15% w/v PEG 5000MME
分辨率 2.80 Å R-free 0.281
6ATD Oxidized SHP2 forms a disulfide bond between Cys367 and Cys459 提交 2017-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–526（526 aa） 片段：residues 1-526
突变：N308D PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.1；277 K；0.2 M sodium phosphate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
6ATD Oxidized SHP2 forms a disulfide bond between Cys367 and Cys459 提交 2017-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–526（526 aa） 片段：residues 1-526
突变：N308D PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.1；277 K；0.2 M sodium phosphate, 20% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
6BMR Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP244 提交 2017-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 DZV 4-[(2-chlorophenyl)methyl]-1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-5(4H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.21 Å R-free 0.224
6BMR Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP244 提交 2017-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 DZV 4-[(2-chlorophenyl)methyl]-1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-5(4H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.21 Å R-free 0.224
6BMU Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitors SHP099 and SHP244 提交 2017-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 DZV 4-[(2-chlorophenyl)methyl]-1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-5(4H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.12 Å R-free 0.225
6BMU Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitors SHP099 and SHP244 提交 2017-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 DZV 4-[(2-chlorophenyl)methyl]-1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-5(4H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.12 Å R-free 0.225
6BMV Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP504 提交 2017-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 DZS 3-{4-[(2-chlorophenyl)methyl]-5-oxo-4,5-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-1-yl}-4-hydroxybenzoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.05 Å R-free 0.223
6BMV Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP504 提交 2017-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 DZS 3-{4-[(2-chlorophenyl)methyl]-5-oxo-4,5-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-1-yl}-4-hydroxybenzoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.05 Å R-free 0.223
6BMW Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitors SHP099 and SHP504 提交 2017-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 DZS 3-{4-[(2-chlorophenyl)methyl]-5-oxo-4,5-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-1-yl}-4-hydroxybenzoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6BMW Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitors SHP099 and SHP504 提交 2017-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 DZS 3-{4-[(2-chlorophenyl)methyl]-5-oxo-4,5-dihydro[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-1-yl}-4-hydroxybenzoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6BMX Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP844 提交 2017-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 DYV 1-(3-chloro-4-{[1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)-5-oxo[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-4(5H)-yl]methyl}benzene-1-carbonyl)-L-proline × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.42 Å R-free 0.252
6BMX Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor SHP844 提交 2017-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 DYV 1-(3-chloro-4-{[1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)-5-oxo[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-4(5H)-yl]methyl}benzene-1-carbonyl)-L-proline × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.42 Å R-free 0.252
6BMY Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitors SHP099 and SHP844 提交 2017-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 DYV 1-(3-chloro-4-{[1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)-5-oxo[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-4(5H)-yl]methyl}benzene-1-carbonyl)-L-proline × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.09 Å R-free 0.228
6BMY Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitors SHP099 and SHP844 提交 2017-11-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 DYV 1-(3-chloro-4-{[1-(2-hydroxy-3-methoxyphenyl)-5-oxo[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinazolin-4(5H)-yl]methyl}benzene-1-carbonyl)-L-proline × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.09 Å R-free 0.228
6BN5 Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 F285S in Complex with Allosteric Inhibitor JLR-2 提交 2017-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
突变：F285S DZJ 3-benzyl-8-chloro-2-hydroxy-4H-pyrimido[2,1-b][1,3]benzothiazol-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.6；298.15 K；100 mM Tris pH 8.6, 20% PEG 3350, 1 mM TCEP
分辨率 2.22 Å R-free 0.292
6BN5 Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 F285S in Complex with Allosteric Inhibitor JLR-2 提交 2017-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
突变：F285S DZJ 3-benzyl-8-chloro-2-hydroxy-4H-pyrimido[2,1-b][1,3]benzothiazol-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.6；298.15 K；100 mM Tris pH 8.6, 20% PEG 3350, 1 mM TCEP
分辨率 2.22 Å R-free 0.292
6CMP Closed structure of inactive SHP2 mutant C459E 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–529（529 aa）
突变：C459E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；200 mM lithium nitrate, 20% PEG 3,350
分辨率 1.80 Å R-free 0.231
6CMP Closed structure of inactive SHP2 mutant C459E 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–529（529 aa）
突变：C459E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；200 mM lithium nitrate, 20% PEG 3,350
分辨率 1.80 Å R-free 0.231
6CMQ Structure of human SHP2 without N-SH2 domain 提交 2018-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 106–529（424 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM ammonium formate, 22% PEG 3,350 and 1.5% xylitol
分辨率 2.90 Å R-free 0.276
6CMQ Structure of human SHP2 without N-SH2 domain 提交 2018-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 106–529（424 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM ammonium formate, 22% PEG 3,350 and 1.5% xylitol
分辨率 2.90 Å R-free 0.276
6CMQ Structure of human SHP2 without N-SH2 domain 提交 2018-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 106–529（424 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM ammonium formate, 22% PEG 3,350 and 1.5% xylitol
分辨率 2.90 Å R-free 0.276
6CMQ Structure of human SHP2 without N-SH2 domain 提交 2018-03-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 106–529（424 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM ammonium formate, 22% PEG 3,350 and 1.5% xylitol
分辨率 2.90 Å R-free 0.276
6CMR Closed structure of active SHP2 mutant E76D bound to SHP099 inhibitor 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–529（529 aa）
突变：E76D 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；15% PEG 20,000 and 10 mM potassium hydrogen tartrate
分辨率 2.21 Å R-free 0.261
6CMS Closed structure of active SHP2 mutant E76K bound to SHP099 inhibitor 提交 2018-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–529（529 aa）
突变：E76K 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；291 K；100 mM bicine pH 9, 100 mM NaCl, 19 % PEG MME 550
分辨率 2.68 Å R-free 0.265
6CRF Crystal Structure of Shp2 E76K GOF Mutant in the Open Conformation 提交 2018-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
突变：E76K 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M MES pH 6.5, 12% PEG 20,000, and 5% Sucrose
分辨率 2.62 Å R-free 0.237
6CRF Crystal Structure of Shp2 E76K GOF Mutant in the Open Conformation 提交 2018-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
突变：E76K GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M MES pH 6.5, 12% PEG 20,000, and 5% Sucrose
分辨率 2.62 Å R-free 0.237
6CRG Crystal Structure of Shp2 E76K GOF Mutant in complex with SHP099 提交 2018-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
突变：E76K 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M Tris pH 8.5, 30% PEG 4000, and 0.2 M LiSO4
分辨率 2.75 Å R-free 0.250
6CRG Crystal Structure of Shp2 E76K GOF Mutant in complex with SHP099 提交 2018-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
突变：E76K 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M Tris pH 8.5, 30% PEG 4000, and 0.2 M LiSO4
分辨率 2.75 Å R-free 0.250
6MD7 Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrimidinone 7 提交 2018-09-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 JE1 2-[4-(aminomethyl)-4-methylpiperidin-1-yl]-5-{[2-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]sulfanyl}pyrimidin-4(3H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 1.96 Å R-free 0.209
6MD7 Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrimidinone 7 提交 2018-09-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 JE1 2-[4-(aminomethyl)-4-methylpiperidin-1-yl]-5-{[2-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]sulfanyl}pyrimidin-4(3H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 1.96 Å R-free 0.209
6MD9 NON-RECEPTOR PROTEIN TYROSINE PHOSPHATASE SHP2 IN COMPLEX WITH ALLOSTERIC INHIBITOR Isoxazolo-pyridinone 3 提交 2018-09-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 JEJ 3-(2-chlorophenyl)-6-{4-[(dimethylamino)methyl]phenyl}-5-methyl[1,2]oxazolo[4,5-c]pyridin-4(5H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.12 Å R-free 0.272
6MD9 NON-RECEPTOR PROTEIN TYROSINE PHOSPHATASE SHP2 IN COMPLEX WITH ALLOSTERIC INHIBITOR Isoxazolo-pyridinone 3 提交 2018-09-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 JEJ 3-(2-chlorophenyl)-6-{4-[(dimethylamino)methyl]phenyl}-5-methyl[1,2]oxazolo[4,5-c]pyridin-4(5H)-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.12 Å R-free 0.272
6MDA Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrazolo-pyridine 4 提交 2018-09-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 JED 3-(4-bromophenyl)-6-(4-methylphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carboxylic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.21 Å R-free 0.251
6MDA Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrazolo-pyridine 4 提交 2018-09-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 JED 3-(4-bromophenyl)-6-(4-methylphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-4-carboxylic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.21 Å R-free 0.251
6MDB Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrazolo-pyrimidinone 5 提交 2018-09-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 JE4 6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-3-(2,3-dichlorophenyl)-5-methyl-1,5-dihydro-4H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.34 Å R-free 0.236
6MDB Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrazolo-pyrimidinone 5 提交 2018-09-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 JE4 6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-3-(2,3-dichlorophenyl)-5-methyl-1,5-dihydro-4H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.34 Å R-free 0.236
6MDC Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrazolo-pyrimidinone 1 SHP389 提交 2018-09-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 JEA 6-[(3S,4S)-4-amino-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-3-[3-chloro-2-(cyclopropylamino)pyridin-4-yl]-5-methyl-2,5-dihydro-4H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.14 Å R-free 0.239
6MDC Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Pyrazolo-pyrimidinone 1 SHP389 提交 2018-09-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 JEA 6-[(3S,4S)-4-amino-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-3-[3-chloro-2-(cyclopropylamino)pyridin-4-yl]-5-methyl-2,5-dihydro-4H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.14 Å R-free 0.239
6MDD Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Imidazo-pyridine 24 提交 2018-09-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 JE7 5-[(2,3-dichlorophenyl)sulfanyl]-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.05 Å R-free 0.251
6MDD Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Imidazo-pyridine 24 提交 2018-09-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 JE7 5-[(2,3-dichlorophenyl)sulfanyl]-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-2-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；17% PEG3350, 200MM AMMONIUM PHOSPHATE
分辨率 2.05 Å R-free 0.251
6R5G C-SH2 domain of SHP-2 in complex with phospho-ITSM of PD-1 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 105–220（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 800 uM [U-13C; U-15N] C-SH2 domain of SHP-2, 1000 uM ITSM, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 800 uM [U-13C; U-15N] C-SH2 domain of SHP-2, 640 uM ITSM, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6ROY Structure of the N-SH2 domain of the human tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 in complex with the phosphorylated immune receptor tyrosine-based inhibitory motif 提交 2019-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 3–104（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；291 K；31.7% (w/v) PEG3350, 0.1 M HEPES, 0.233 M MgSO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.279
6ROY Structure of the N-SH2 domain of the human tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 in complex with the phosphorylated immune receptor tyrosine-based inhibitory motif 提交 2019-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3–104（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；291 K；31.7% (w/v) PEG3350, 0.1 M HEPES, 0.233 M MgSO4
分辨率 2.10 Å R-free 0.279
6ROZ Structure of the N-SH2 domain of the human tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 in complex with the phosphorylated immune receptor tyrosine-based switch motif 提交 2019-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 3–104（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；293 K；31.7% (w/v) PEG 3350, 0.1 M HEPES, 0.233 M MgSO4
分辨率 2.89 Å R-free 0.285
6ROZ Structure of the N-SH2 domain of the human tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 in complex with the phosphorylated immune receptor tyrosine-based switch motif 提交 2019-05-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 3–104（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；293 K；31.7% (w/v) PEG 3350, 0.1 M HEPES, 0.233 M MgSO4
分辨率 2.89 Å R-free 0.285
6WU8 Structure of human SHP2 in complex with inhibitor IACS-13909 提交 2020-05-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–530（530 aa）
未记录 U9Y 1-[3-(2,3-dichlorophenyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.270
6WU8 Structure of human SHP2 in complex with inhibitor IACS-13909 提交 2020-05-04 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–530（530 aa）
未记录 U9Y 1-[3-(2,3-dichlorophenyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.270
7EMN The atomic structure of SHP2 E76A mutant 提交 2021-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–534（534 aa）
突变：E76A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；0.2M sodium formate, 0.1 M Bicine ph 8.5, 15% w/v PEG 5000MME
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
7EMN The atomic structure of SHP2 E76A mutant 提交 2021-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–534（534 aa）
突变：E76A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；0.2M sodium formate, 0.1 M Bicine ph 8.5, 15% w/v PEG 5000MME
分辨率 3.00 Å R-free 0.271
7JVM Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor TNO155 提交 2020-08-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 VKS (3S,4S)-8-{6-amino-5-[(2-amino-3-chloropyridin-4-yl)sulfanyl]pyrazin-2-yl}-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-4-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；17% PEG 3350 and 200 mM ammonium phosphate
分辨率 2.17 Å R-free 0.236
7JVM Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor TNO155 提交 2020-08-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 VKS (3S,4S)-8-{6-amino-5-[(2-amino-3-chloropyridin-4-yl)sulfanyl]pyrazin-2-yl}-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-4-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；17% PEG 3350 and 200 mM ammonium phosphate
分辨率 2.17 Å R-free 0.236
7JVN Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Compound 24 提交 2020-08-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 VKP 6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-3-[(2,3-dichlorophenyl)sulfanyl]pyrazin-2-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；17% PEG 3350 and 200 mM ammonium phosphate
分辨率 1.92 Å R-free 0.214
7JVN Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor Compound 24 提交 2020-08-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 VKP 6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-3-[(2,3-dichlorophenyl)sulfanyl]pyrazin-2-amine × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；17% PEG 3350 and 200 mM ammonium phosphate
分辨率 1.92 Å R-free 0.214
7PPL SHP2 catalytic domain in complex with IRS1 (625-639) phosphopeptide (pTyr-632, pSer-636) 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 246–314（69 aa）
链 A 324–528（205 aa）
突变：catalytic inactivation: C213S 突变：catalytic inactivation: C213S GOL GLYCEROL × 5 EOH ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 100mM HEPES buffer pH 7.5, 50mM EDTA
分辨率 1.53 Å R-free 0.197
7PPM SHP2 catalytic domain in complex with IRS1 (889-901) phosphopeptide (pSer-892, pTyr-896) 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 246–314（69 aa）
链 A 324–528（205 aa）
突变：catalytic inactivation: C213S 突变：catalytic inactivation: C213S GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；10% PEG 20000, 100mM Citrate buffer pH 5.5, EDTA 50mM
分辨率 1.48 Å R-free 0.196
7PPN SHP2 catalytic domain in complex with CD28 (183-198) phosphopeptide (pTyr-191, p-Thr-195) 提交 2021-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 246–314（69 aa）
链 A 324–528（205 aa）
突变：catalytic inactivation: C213S 突变：catalytic inactivation: C213S GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；10% PEG 20000, 100 mM Citrate buffer pH 5.5, 50 mM EDTA
分辨率 1.90 Å R-free 0.207
7R75 Structure of human SHP2 in complex with compound 16 提交 2021-06-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–530（530 aa）
未记录 33I 6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-3-(3-chlorophenyl)-1,5-dihydro-4H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.83 Å R-free 0.289
7R7D Structure of human SHP2 in complex with compound 22 提交 2021-06-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–530（530 aa）
未记录 37I 4-[6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-3-yl]-3-chloro-N-methylpyridin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.260
7R7D Structure of human SHP2 in complex with compound 22 提交 2021-06-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–530（530 aa）
未记录 37I 4-[6-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-3-yl]-3-chloro-N-methylpyridin-2-amine × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.260
7R7I Structure of human SHP2 in complex with compound 27 提交 2021-06-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–530（530 aa）
未记录 3CW [3-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-6-(2,3-dichlorophenyl)-5-methylpyrazin-2-yl]methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.292
7R7I Structure of human SHP2 in complex with compound 27 提交 2021-06-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–530（530 aa）
未记录 3CW [3-(4-amino-4-methylpiperidin-1-yl)-6-(2,3-dichlorophenyl)-5-methylpyrazin-2-yl]methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 2.85 Å R-free 0.292
7R7L Structure of human SHP2 in complex with compound 30 提交 2021-06-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–530（530 aa）
未记录 3ED 6-[(3S,4S)-4-amino-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-3-(2,3-dichlorophenyl)-2-methylpyrimidin-4(3H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.286
7R7L Structure of human SHP2 in complex with compound 30 提交 2021-06-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–530（530 aa）
未记录 3ED 6-[(3S,4S)-4-amino-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-3-(2,3-dichlorophenyl)-2-methylpyrimidin-4(3H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；300 mM potassium formate, 14% w/v PEG3350
分辨率 3.00 Å R-free 0.286
7RCT Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor RMC-4550 提交 2021-07-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 4Q4 {3-[(3S,4S)-4-amino-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-6-(2,3-dichlorophenyl)-5-methylpyrazin-2-yl}methanol × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Sodium Chloride 0.1 M BIS-TRIS propane pH 8.5 11% PEG 1500
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
7RCT Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor RMC-4550 提交 2021-07-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 4Q4 {3-[(3S,4S)-4-amino-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-6-(2,3-dichlorophenyl)-5-methylpyrazin-2-yl}methanol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M Sodium Chloride 0.1 M BIS-TRIS propane pH 8.5 11% PEG 1500
分辨率 1.80 Å R-free 0.225
7TVJ Crystal Structure of Monobody Mb(SHP2PTP_13)/SHP2 PTP Domain Complex 提交 2022-02-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 224–525（302 aa）
未记录 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；292 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 2% Tascimate, 16% PEG3350
分辨率 2.39 Å R-free 0.259
7TVJ Crystal Structure of Monobody Mb(SHP2PTP_13)/SHP2 PTP Domain Complex 提交 2022-02-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 224–525（302 aa）
未记录 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；292 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 2% Tascimate, 16% PEG3350
分辨率 2.39 Å R-free 0.259
7VXG Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor TK-453 提交 2021-11-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 83Q 6-[4-(aminomethyl)-4-methyl-piperidin-1-yl]-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]sulfanyl-pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；295 K；100mM Tris-HCl pH 8.2, 12% (vol/vol) PEG 4000, 20mM DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.325
7VXG Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor TK-453 提交 2021-11-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 83Q 6-[4-(aminomethyl)-4-methyl-piperidin-1-yl]-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]sulfanyl-pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；295 K；100mM Tris-HCl pH 8.2, 12% (vol/vol) PEG 4000, 20mM DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.325
7VXG Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor TK-453 提交 2021-11-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–525（525 aa）
未记录 83Q 6-[4-(aminomethyl)-4-methyl-piperidin-1-yl]-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]sulfanyl-pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；295 K；100mM Tris-HCl pH 8.2, 12% (vol/vol) PEG 4000, 20mM DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.325
7VXG Non-receptor Protein Tyrosine Phosphatase SHP2 in Complex with Allosteric Inhibitor TK-453 提交 2021-11-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–525（525 aa）
未记录 83Q 6-[4-(aminomethyl)-4-methyl-piperidin-1-yl]-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]sulfanyl-pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；295 K；100mM Tris-HCl pH 8.2, 12% (vol/vol) PEG 4000, 20mM DTT
分辨率 2.10 Å R-free 0.325
7XHQ Small-molecule Allosteric Regulation Mechanism of SHP2 提交 2022-04-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 FIZ 2-[(3S,4R)-4-azanyl-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-5-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-3-methyl-pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 13%-18% PEG 4000
分辨率 2.20 Å R-free 0.275
7XHQ Small-molecule Allosteric Regulation Mechanism of SHP2 提交 2022-04-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 FIZ 2-[(3S,4R)-4-azanyl-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-8-yl]-5-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-3-methyl-pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 13%-18% PEG 4000
分辨率 2.20 Å R-free 0.275
8B5Y SHP2 in complex with allosteric imidazopyrazine inhibitor 提交 2022-09-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 P8O (1~{S})-1'-[5-[2-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]sulfanyl-3~{H}-imidazo[4,5-b]pyrazin-2-yl]spiro[1,3-dihydroindene-2,4'-piperidine]-1-amine × 1 FMT FORMIC ACID × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293.15 K；21.00 %w/v PEG 3350, 0.30 M K Form
分辨率 1.83 Å R-free 0.218
8B5Y SHP2 in complex with allosteric imidazopyrazine inhibitor 提交 2022-09-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 P8O (1~{S})-1'-[5-[2-(trifluoromethyl)pyridin-3-yl]sulfanyl-3~{H}-imidazo[4,5-b]pyrazin-2-yl]spiro[1,3-dihydroindene-2,4'-piperidine]-1-amine × 1 FMT FORMIC ACID × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293.15 K；21.00 %w/v PEG 3350, 0.30 M K Form
分辨率 1.83 Å R-free 0.218
8CBH SHP2 in complex with a novel allosteric inhibitor 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 U70 [(1~{S},6~{R},7~{S})-3-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-2~{H}-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-7-(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)-3-azabicyclo[4.1.0]heptan-7-yl]methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293.15 K；14.00 %w/v PEG 3350, 0.20 M NH4 Acetate, 0.10 M Tris pH=9.00
分辨率 2.24 Å R-free 0.264
8CBH SHP2 in complex with a novel allosteric inhibitor 提交 2023-01-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 U70 [(1~{S},6~{R},7~{S})-3-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-2~{H}-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-7-(4-methyl-1,3-thiazol-2-yl)-3-azabicyclo[4.1.0]heptan-7-yl]methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293.15 K；14.00 %w/v PEG 3350, 0.20 M NH4 Acetate, 0.10 M Tris pH=9.00
分辨率 2.24 Å R-free 0.264
8GWW Small-molecule Allosteric Regulation Mechanism of SHP2 提交 2022-09-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 KID 2-[4-(aminomethyl)-4-methyl-piperidin-1-yl]-5-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-3-methyl-pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 13%-18% PEG 4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.288
8GWW Small-molecule Allosteric Regulation Mechanism of SHP2 提交 2022-09-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 KID 2-[4-(aminomethyl)-4-methyl-piperidin-1-yl]-5-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-3-methyl-pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-4-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 13%-18% PEG 4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.288
8RZW A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4N 3,5-bis(chloranyl)pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.02 Å R-free 0.272
8RZW A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4N 3,5-bis(chloranyl)pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.02 Å R-free 0.272
8RZY A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4L 1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-5-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.91 Å R-free 0.220
8RZY A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4L 1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-5-amine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.91 Å R-free 0.220
8S01 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4J 3-(4-chlorophenyl)-1H-pyrazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.17 Å R-free 0.231
8S01 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4J 3-(4-chlorophenyl)-1H-pyrazole × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.17 Å R-free 0.231
8S04 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4I N-(1H-indol-7-yl)methanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.89 Å R-free 0.223
8S04 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4I N-(1H-indol-7-yl)methanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.89 Å R-free 0.223
8S06 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4M 1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-7-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.19 Å R-free 0.238
8S06 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4M 1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-7-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.19 Å R-free 0.238
8S07 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 4 A1H4K 7-azanyl-N-pyridin-3-yl-3H-pyrrolo[3,2-b]pyridine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.83 Å R-free 0.212
8S07 A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-13 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4K 7-azanyl-N-pyridin-3-yl-3H-pyrrolo[3,2-b]pyridine-2-carboxamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.83 Å R-free 0.212
8S0H A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4Q 5-(aminomethyl)-N-(3-chloranyl-1-methyl-indol-7-yl)-1,3-dihydroisoindole-2-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.99 Å R-free 0.254
8S0H A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4Q 5-(aminomethyl)-N-(3-chloranyl-1-methyl-indol-7-yl)-1,3-dihydroisoindole-2-sulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.99 Å R-free 0.254
8S0I A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4P 3-phenyl-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.93 Å R-free 0.224
8S0I A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4P 3-phenyl-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.93 Å R-free 0.224
8S0K A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4S 3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-5-methyl-6-(piperazin-1-ylmethyl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.84 Å R-free 0.228
8S0K A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4S 3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-5-methyl-6-(piperazin-1-ylmethyl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.84 Å R-free 0.228
8S0O A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 A1H4G 3-[4-chloranyl-2-(1H-pyrazol-4-ylmethyl)indazol-5-yl]-5-methyl-6-(piperazin-1-ylmethyl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.83 Å R-free 0.236
8S0O A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 A1H4G 3-[4-chloranyl-2-(1H-pyrazol-4-ylmethyl)indazol-5-yl]-5-methyl-6-(piperazin-1-ylmethyl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.83 Å R-free 0.236
8S0P A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4O 1-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-6-yl]-4-methyl-piperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.00 Å R-free 0.244
8S0P A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4O 1-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-6-yl]-4-methyl-piperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 2.00 Å R-free 0.244
8S0Q A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4T (1S,5R)-8-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-6-yl]-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.87 Å R-free 0.236
8S0Q A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4T (1S,5R)-8-[3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-6-yl]-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.87 Å R-free 0.236
8S0S A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
未记录 A1H4H (1R,5S)-8-[7-(4-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazin-3-yl]-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.94 Å R-free 0.258
8S0S A fragment-based inhibitor of SHP2 提交 2024-02-14 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
未记录 A1H4H (1R,5S)-8-[7-(4-chloranyl-2-methyl-indazol-5-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazin-3-yl]-8-azabicyclo[3.2.1]octan-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.5M K formate 15% PEG 3350 0.1M pH=8 Bis-Tris propane/HCl
分辨率 1.94 Å R-free 0.258
8T6D Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 YR2 (3R)-1'-[3-(3,4-dihydro-1,5-naphthyridin-1(2H)-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-3H-spiro[[1]benzofuran-2,4'-piperidin]-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；19% PEG 3350,100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 300 mM Ammonium Sulfate
分辨率 2.40 Å R-free 0.296
8T6D Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 YR2 (3R)-1'-[3-(3,4-dihydro-1,5-naphthyridin-1(2H)-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-3H-spiro[[1]benzofuran-2,4'-piperidin]-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；19% PEG 3350,100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 300 mM Ammonium Sulfate
分辨率 2.40 Å R-free 0.296
8T6G Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 YT2 (1S)-1-{6-[(1S)-1-amino-1,3-dihydrospiro[indene-2,4'-piperidin]-1'-yl]-3-(3,4-dihydro-1,5-naphthyridin-1(2H)-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-5-yl}ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；19% PEG 3350,100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 300 mM Ammonium Sulfate
分辨率 1.84 Å R-free 0.245
8T6G Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 7 YT2 (1S)-1-{6-[(1S)-1-amino-1,3-dihydrospiro[indene-2,4'-piperidin]-1'-yl]-3-(3,4-dihydro-1,5-naphthyridin-1(2H)-yl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-5-yl}ethan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；19% PEG 3350,100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 300 mM Ammonium Sulfate
分辨率 1.84 Å R-free 0.245
8T7Q Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 ZH5 1-{3-[(2-chlorophenyl)sulfanyl]-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl}-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；19% PEG 3350,100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 300 mM Ammonium Sulfate
分辨率 2.10 Å R-free 0.262
8T7Q Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 ZH5 1-{3-[(2-chlorophenyl)sulfanyl]-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl}-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；19% PEG 3350,100 mM Tris-HCl (pH 8.5), 300 mM Ammonium Sulfate
分辨率 2.10 Å R-free 0.262
8T8Q Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 ZJX 1-[(3P)-3-(3-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；19% PEG3350, 0.3 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris (pH 8.5)
分辨率 2.27 Å R-free 0.249
8T8Q Identification of GDC-1971 (RLY-1971), a SHP2 inhibitor designed for the treatment of solid tumors 提交 2023-06-23 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 ZJX 1-[(3P)-3-(3-chloro-2-fluorophenyl)-1H-pyrazolo[3,4-b]pyrazin-6-yl]-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；19% PEG3350, 0.3 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris (pH 8.5)
分辨率 2.27 Å R-free 0.249
8U7W Crystal structure of non-receptor protein tyrosine phosphatase SHP2 in complex with inhibitor compound 7 提交 2023-09-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa） 片段：residues 1-525
未记录 W8I 1-{6-[(2,3-dichlorophenyl)sulfanyl]pyrido[2,3-b]pyrazin-2-yl}-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.2；293 K；17% PEG3350, 0.1M Bicine, pH9.2, 30 mM Ammonium Acetate, 4% Tacsimate
分辨率 2.05 Å R-free 0.178
8U7W Crystal structure of non-receptor protein tyrosine phosphatase SHP2 in complex with inhibitor compound 7 提交 2023-09-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa） 片段：residues 1-525
未记录 W8I 1-{6-[(2,3-dichlorophenyl)sulfanyl]pyrido[2,3-b]pyrazin-2-yl}-4-methylpiperidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.2；293 K；17% PEG3350, 0.1M Bicine, pH9.2, 30 mM Ammonium Acetate, 4% Tacsimate
分辨率 2.05 Å R-free 0.178
8U7X Crystal structure of non-receptor protein tyrosine phosphatase SHP2 in complex with inhibitor compound 24 提交 2023-09-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa） 片段：residues 1-525
未记录 WAB (3S,4S)-8-{6-[(2-amino-3-chloropyridin-4-yl)sulfanyl]pyrido[2,3-b]pyrazin-2-yl}-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；13% PEG3350, 0.1M Bicine, pH7.6, 30mM Ammonium Acetate, 5% Tacsimate
分辨率 2.06 Å R-free 0.175
8U7X Crystal structure of non-receptor protein tyrosine phosphatase SHP2 in complex with inhibitor compound 24 提交 2023-09-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa） 片段：residues 1-525
未记录 WAB (3S,4S)-8-{6-[(2-amino-3-chloropyridin-4-yl)sulfanyl]pyrido[2,3-b]pyrazin-2-yl}-3-methyl-2-oxa-8-azaspiro[4.5]decan-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；293 K；13% PEG3350, 0.1M Bicine, pH7.6, 30mM Ammonium Acetate, 5% Tacsimate
分辨率 2.06 Å R-free 0.175
8WFY The Crystal Structure of SHP2 from Biortus. 提交 2023-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1% Tryptone, 0.001M NaN3, 0.05M HEPEs-Na pH 7.0, 20% PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.317
8WFY The Crystal Structure of SHP2 from Biortus. 提交 2023-09-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 5OD 6-(4-azanyl-4-methyl-piperidin-1-yl)-3-[2,3-bis(chloranyl)phenyl]pyrazin-2-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1% Tryptone, 0.001M NaN3, 0.05M HEPEs-Na pH 7.0, 20% PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.317
8WX7 Crystal structure of SHP2 in complex with JAB-3186 提交 2023-10-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 XD8 (5~{S})-1'-[6-azanyl-5-(2-azanyl-3-chloranyl-pyridin-4-yl)sulfanyl-pyrazin-2-yl]spiro[5,7-dihydrocyclopenta[b]pyridine-6,4'-piperidine]-5-amine × 1 SO4 SULFATE ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M ammonium sulphate, 28 % w/v PEG3350
分辨率 2.02 Å R-free 0.246
8WX7 Crystal structure of SHP2 in complex with JAB-3186 提交 2023-10-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 XD8 (5~{S})-1'-[6-azanyl-5-(2-azanyl-3-chloranyl-pyridin-4-yl)sulfanyl-pyrazin-2-yl]spiro[5,7-dihydrocyclopenta[b]pyridine-6,4'-piperidine]-5-amine × 1 SO4 SULFATE ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M ammonium sulphate, 28 % w/v PEG3350
分辨率 2.02 Å R-free 0.246
9BLG Crystal structure of non-receptor protein tyrosine phosphatase SHP2 in complex with PF-07284892 提交 2024-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–525（525 aa） 片段：residues 1-525
未记录 A1AQ1 (1S)-1'-{6-[(2-amino-3-chloropyridin-4-yl)sulfanyl]-1,2,4-triazin-3-yl}-1,3-dihydrospiro[indene-2,4'-piperidin]-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.2；293 K；9%PEG3350, 0.1M Bicine, pH9.2, 30mM Ammonium Acetate, 5% Tacsimate
分辨率 2.06 Å R-free 0.238
9BLG Crystal structure of non-receptor protein tyrosine phosphatase SHP2 in complex with PF-07284892 提交 2024-04-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–525（525 aa） 片段：residues 1-525
未记录 A1AQ1 (1S)-1'-{6-[(2-amino-3-chloropyridin-4-yl)sulfanyl]-1,2,4-triazin-3-yl}-1,3-dihydrospiro[indene-2,4'-piperidin]-1-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.2；293 K；9%PEG3350, 0.1M Bicine, pH9.2, 30mM Ammonium Acetate, 5% Tacsimate
分辨率 2.06 Å R-free 0.238
9EH9 Crystal structure of unbound N-SH2 domain of SHP2 提交 2024-11-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
未记录 ACY ACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；500 nL of 10 mg/mL SHP2 N-SH2 in 50 mM Bis-Tris pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP; 500 nL of 1.0 M sodium malonate pH 5.0, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.5, and 2% w/v polyethylene glycol 20,000
分辨率 1.83 Å R-free 0.255
9EHA Crystal structure of N-SH2 domain of SHP2 bound to phosphotyrosine 提交 2024-11-22 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
未记录 PTR O-PHOSPHOTYROSINE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；10 mg/mL WT N-SH2 with 20 mM O-phospho-L-tyrosine in 0.5 M Tris pH 9.0, 100 mM sodium acetate pH 4.6, and 2 M ammonium sulfate
分辨率 1.71 Å R-free 0.246
9EHD Crystal structure of N-SH2 domain of SHP2 bound to GAB1 tyrosine phosphorylated peptide (624-633) QVEpYLDLDLD 提交 2024-11-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；500 nL of 10 mg/mL SHP2 N-SH2 in 50 mM Bis-Tris pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP, with GAB1 (QVEpYLDLDLD) 1:1.05 molar ratio; 500 nL of 6% v/v Tacsimate pH 6.0, 0.1 M MES monohydrate pH 6.0, and 25% w/v polyethylene glycol 4,000
分辨率 1.59 Å R-free 0.240
9EIC Crystal structure of unbound N-SH2 domain of SHP2 with T42A mutation 提交 2024-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
突变：T42A PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；500 nL of 10 mg/mL SHP2 N-SH2 in 50 mM Bis-Tris pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP with 500 nL of 0.1 M Tris hydrochloride pH 8.5, 2.0 M Ammonium phosphate monobasic
分辨率 1.58 Å R-free 0.218
9EIK Crystal structure of N-SH2 domain of SHP2 with T42A mutation bound to GAB1 tyrosine phosphorylated peptide (624-633) QVEpYLDLDLD 提交 2024-11-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
突变：T42A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；500 nL 10 mg/mL SHP2 N-SH2 with GAB1 peptide QVEpYLDLDLD (1:1.05 molar ratio) with 500 nL 0.2 M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, and 2.0 M Ammonium sulfate
分辨率 1.25 Å R-free 0.225
9MQ5 Crystal structure SHP2 tandem SH2 domains in complex with PZR doubly tyrosine phosphorylated ITIM peptide 提交 2025-01-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–220（220 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 0.1 M Lithium Acetate, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
分辨率 1.70 Å R-free 0.229
9MUQ Crystal structure of unbound N-SH2 domain of SHP2 (1AYD conditions) 提交 2025-01-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–106（106 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；500 nL 20 mg/mL N-SH2 in 10 mM MES pH 5.5, 50 mM KCl; 500 nL 100 mM MES pH 6.0, 2.05 M ammonium sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.266
9QA5 Structure of the N-SH2 domain of SHP2 in complex with the phosphoY627-Gab1 (613-651) peptide 提交 2025-02-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–106（106 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；5 % PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M BisTris, pH 5.5
分辨率 2.08 Å R-free 0.273
9QCD Micro-ED structure of the NSH2-CSH2 tandem domain of SHP2 in complex with the bis-phosphorylated pY627-pY659-Gab1 (613-694) peptide 提交 2025-03-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–222（222 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液 pH 8.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å R-free 0.353
9R16 Structure of mutant SHP2 提交 2025-04-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–528（528 aa）
突变：Y62D 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M BICINE pH 8.5 and 17% w/v PEG 4000
分辨率 2.63 Å R-free 0.304
9R16 Structure of mutant SHP2 提交 2025-04-25 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–528（528 aa）
突变：Y62D 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M BICINE pH 8.5 and 17% w/v PEG 4000
分辨率 2.63 Å R-free 0.304
9TKT Mapping the SHP2 allosteric pocket with target-biased covalent fragments 提交 2025-12-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–525（524 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M NaF, 0.1M Bis-Tris Propane pH 8.5
分辨率 2.35 Å R-free 0.283
9TKT Mapping the SHP2 allosteric pocket with target-biased covalent fragments 提交 2025-12-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–525（524 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 A1JWN 3-[(1S)-1-azanylspiro[1,3-dihydroindene-2,4'-piperidine]-1'-yl]carbonylbenzenesulfonic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M NaF, 0.1M Bis-Tris Propane pH 8.5
分辨率 2.35 Å R-free 0.283
9Y5X Crystal structure of shorter construct of SHP2 unbound N-SH2 domain 提交 2025-09-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 4–103（100 aa） 片段：N-terminal SH2 domain
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M MES pH 6.0, 2.05 M ammonium sulfate
分辨率 1.80 Å R-free 0.250
9Z70 Crystal structure of shorter construct of SHP2 unbound N-SH2 domain (Y66 in blocking conformation) 提交 2025-11-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 4–103（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 6.5
分辨率 1.73 Å R-free 0.233

共 114 个其他 PDB 条目、187 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PTN11_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–529； UniProt 1–528 作者链 B； PDB构建体 2–529； UniProt 1–528

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8s0j

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8s0j
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8s0j
沉积日期 deposition_date2024-02-14
结构标题 titleA fragment-based inhibitor of SHP2
关键词 keywordsprotein tyrosine phophatase, SH2 domain, autoinhibition, allostery, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier38.37 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron38.17 Å
零角强度 I(0) i0216996000.00
分子量 molecular_weight116670.0 kDa
排除体积 excluded_volume144990 ų
包络体积 envelope_volume196730 ų
水化壳体积 shell_volume44368 ų
包络直径 envelope_diameter134.9 Å
壳层 Rg shell_rg42.57 Å
包络 Rg envelope_rg37.39 Å
形状 Rg shape_rg38.17 Å
总 Rg total_rg38.42 Å
总原子数 total_atoms8246
残基数 n_residues1009
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax129.2 Å
Rg (实空间) rg_real38.60 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.13 Å
I(0) (实空间) i0_real2.1700e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.0570e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal38.46 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal217000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8652
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary37.8 Å
偏度 Skewness skewness0.413
峰度 Kurtosis kurtosis-0.528
角度范围 angular_range— – 0.2050 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha35170000.0000
实空间数据点数 n_real_points42
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.848; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.894; Smooth: 0.808
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)