8xjv

Structural basis for the linker histone H5-nucleosome binding and chromatin compaction

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H2A

Xenopus laevis

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 108 DNA 2	DNA × 1 DNA × 1 Histone H2B 1.1 × 24 （P02281） Histone H3 × 24 （A0A310TTQ1） Histone H4 × 24 （P62799） Histone H5 × 12 （P02259）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6AZJ8_XENLA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 Ae； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 B； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 C； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 D； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 E； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 F； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 G； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 H； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 I； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 K； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 L； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 aj； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 ak； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 al； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 am； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 an； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 ao； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 ap； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 aq； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 ar； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 as； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 at； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130 作者链 au； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130

Histone H2B 1.1

Xenopus laevis

UniProt P02281

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 108 DNA 2	DNA × 1 DNA × 1 Histone H2A × 24 （Q6AZJ8） Histone H3 × 24 （A0A310TTQ1） Histone H4 × 24 （P62799） Histone H5 × 12 （P02259）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H2B11_XENLA
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 Aa； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 Ab； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 Ac； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 Ad； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 Af； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 Ag； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 At； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 J； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 M； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 N； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 O； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 P； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 Q； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 R； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 S； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 T； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 U； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 V； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 W； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 av； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 aw； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 ax； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 ay； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 az； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126

Histone H3

Xenopus laevis

UniProt A0A310TTQ1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 108 DNA 2	DNA × 1 DNA × 1 Histone H2A × 24 （Q6AZJ8） Histone H2B 1.1 × 24 （P02281） Histone H4 × 24 （P62799） Histone H5 × 12 （P02259）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A310TTQ1_XENLA
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 Y； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 Z； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 a； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 b； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 c； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 d； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 e； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 f； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 g； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 h； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 i； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 j； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 k； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 l； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 m； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 n； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 o； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 p； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 q； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 r； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 s； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 t； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 u； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

Histone H4

Xenopus laevis

UniProt P62799

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 108 DNA 2	DNA × 1 DNA × 1 Histone H2A × 24 （Q6AZJ8） Histone H2B 1.1 × 24 （P02281） Histone H3 × 24 （A0A310TTQ1） Histone H5 × 12 （P02259）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H4_XENLA
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 0； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 1； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 2； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 3； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 4； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 5； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 6； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 7； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 8； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 9； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 CD； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 a2； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 a3； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 a4； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 a5； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 a6； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 a7； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 a8； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 a9； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 v； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 w； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 x； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 y； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 z； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103

Histone H5

Gallus gallus

UniProt P02259

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 108 DNA 2	DNA × 1 DNA × 1 Histone H2A × 24 （Q6AZJ8） Histone H2B 1.1 × 24 （P02281） Histone H3 × 24 （A0A310TTQ1） Histone H4 × 24 （P62799）	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H5_CHICK
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 Ah； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 作者链 Ai； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 作者链 Aj； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 作者链 Ak； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 作者链 Al； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 作者链 Am； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 作者链 An； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 作者链 Ao； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 作者链 Ap； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 作者链 Aq； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 作者链 Ar； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 作者链 As； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8xjv
沉积日期 deposition_date	2023-12-22
结构标题 title	Structural basis for the linker histone H5-nucleosome binding and chromatin compaction
关键词 keywords	Chromatin Fiber, Histone, DNA, Linker Histone, Nucleosome, Epigenetics, Genome Folding, Interaction, GENE REGULATION; GENE REGULATION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8xjv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8xjv__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8xjv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	117.30 Å
总 Rg	117.30 Å
原子数	181715
残基数	16358
排除体积	2965600 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8xjv__assembly_1__model_1`	110-meric （110）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA
分子量 formula_weight	651873.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	Au
原子数 atom_count	181715

GAGCATCCGGATCCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCACATATATACATCCTGTTCCAGTGCCGGACCCGAGCATCCGGATCCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCACATATATACATCCTGTTCCAGTGCCGGACCCGAGCATCCGGATCCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCACATATATACATCCTGTTCCAGTGCCGGACCCGAGCATCCGGATCCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCACATATATACATCCTGTTCCAGTGCCGGACCCGAGCATCCGGATCCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCACATATATACATCCTGTTCCAGTGCCGGACCCGAGCATCCGGATCCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCACATATATACATCCTGTTCCAGTGCCGGACCCGAGCATCCGGATCCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCACATATATACATCCTGTTCCAGTGCCGGACCCGAGCATCCGGATCCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCACATATATACATCCTGTTCCAGTGCCGGACCCGAGCATCCGGATCCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCACATATATACATCCTGTTCCAGTGCCGGACCCGAGCATCCGGATCCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCACATATATACATCCTGTTCCAGTGCCGGACCCGAGCATCCGGATCCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCACATATATACATCCTGTTCCAGTGCCGGACCCGAGCATCCGGATCCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCACATATATACATCCTGTTCCAGTGCCGGACCC

来源 Source

来源生物 organism	synthetic construct
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	32630
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA
分子量 formula_weight	660629.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	Av

GGGTCCGGCACTGGAACAGGATGTATATATGTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGGATCCGGATGCTCGGGTCCGGCACTGGAACAGGATGTATATATGTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGGATCCGGATGCTCGGGTCCGGCACTGGAACAGGATGTATATATGTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGGATCCGGATGCTCGGGTCCGGCACTGGAACAGGATGTATATATGTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGGATCCGGATGCTCGGGTCCGGCACTGGAACAGGATGTATATATGTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGGATCCGGATGCTCGGGTCCGGCACTGGAACAGGATGTATATATGTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGGATCCGGATGCTCGGGTCCGGCACTGGAACAGGATGTATATATGTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGGATCCGGATGCTCGGGTCCGGCACTGGAACAGGATGTATATATGTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGGATCCGGATGCTCGGGTCCGGCACTGGAACAGGATGTATATATGTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGGATCCGGATGCTCGGGTCCGGCACTGGAACAGGATGTATATATGTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGGATCCGGATGCTCGGGTCCGGCACTGGAACAGGATGTATATATGTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGGATCCGGATGCTCGGGTCCGGCACTGGAACAGGATGTATATATGTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGGATCCGGATGCTC

来源 Source

来源生物 organism	synthetic construct
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	32630
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Histone H2A
分子量 formula_weight	14109.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,K,L,aj,ak,al,am,an,ao,ap,aq,ar,as,at,au,Ae

MSGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Histone H2B 1.1
分子量 formula_weight	13641.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,av,aw,ax,ay,az,Aa,Ab,Ac,Ad,Af,Ag,At

MAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Histone H3
分子量 formula_weight	15435.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,Y,Z,a,b,c,d,e,f,g,h,i,j,k,l,m,n,o,p,q,r,s,t,u

MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	11394.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	v,w,x,y,z,0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,CD,a2,a3,a4,a5,a6,a7,a8,a9

MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Histone H5
分子量 formula_weight	21631.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ah,Ai,Aj,Ak,Al,Am,An,Ao,Ap,Aq,Ar,As

MTESLVLSPAPAKPKRVKASRRSASHPTYSEMIAAAIRAEKSRGGSSRQSIQKYIKSHYKVGHNADLQIKLSIRRLLAAGVLKQTKGVGASGSFRLAKSDKAKRSPGKKKKAVRRSTSPKKAARPRKARSPAKKPKATARKARKKSRASPKKAKKPKTVKAKSRKASKAKKVKRSKPRAKSGARKSPKKKHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	chicken
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	13670

Structural basis for the linker histone H5-nucleosome binding and chromatin compaction

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H2A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2B 1.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8xjv__assembly_1__model_1

8xjv__assembly_1__model_1 | I(q)

8xjv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

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7. 引用文献 (1)