9cop

Yeast RAVE bound to V-ATPase V1 complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type proton ATPase catalytic subunit A

物种未注明

UniProt P17255

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 V-type proton ATPase subunit B × 2 (P16140) V-type proton ATPase subunit E × 2 (P22203) V-type proton ATPase subunit G × 2 (P48836) V-type proton ATPase subunit D × 1 (P32610) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P39111) V-type proton ATPase subunit H × 1 (P41807) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 1 × 1 (P47104) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 2 × 1 (Q03956) Suppressor of kinetochore protein 1 × 1 (P52286) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATA_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–1071; UniProt 1–1071 作者链 E; PDB构建体 1–1071; UniProt 1–1071

V-type proton ATPase subunit B

物种未注明

UniProt P16140

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 V-type proton ATPase catalytic subunit A × 2 (P17255) V-type proton ATPase subunit E × 2 (P22203) V-type proton ATPase subunit G × 2 (P48836) V-type proton ATPase subunit D × 1 (P32610) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P39111) V-type proton ATPase subunit H × 1 (P41807) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 1 × 1 (P47104) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 2 × 1 (Q03956) Suppressor of kinetochore protein 1 × 1 (P52286) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATB_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–517; UniProt 1–517 作者链 F; PDB构建体 1–517; UniProt 1–517

V-type proton ATPase subunit E

物种未注明

UniProt P22203

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 V-type proton ATPase catalytic subunit A × 2 (P17255) V-type proton ATPase subunit B × 2 (P16140) V-type proton ATPase subunit G × 2 (P48836) V-type proton ATPase subunit D × 1 (P32610) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P39111) V-type proton ATPase subunit H × 1 (P41807) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 1 × 1 (P47104) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 2 × 1 (Q03956) Suppressor of kinetochore protein 1 × 1 (P52286) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATE_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–233; UniProt 1–233 作者链 K; PDB构建体 1–233; UniProt 1–233

V-type proton ATPase subunit G

物种未注明

UniProt P48836

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 V-type proton ATPase catalytic subunit A × 2 (P17255) V-type proton ATPase subunit B × 2 (P16140) V-type proton ATPase subunit E × 2 (P22203) V-type proton ATPase subunit D × 1 (P32610) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P39111) V-type proton ATPase subunit H × 1 (P41807) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 1 × 1 (P47104) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 2 × 1 (Q03956) Suppressor of kinetochore protein 1 × 1 (P52286) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATG_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–114; UniProt 1–114 作者链 L; PDB构建体 1–114; UniProt 1–114

V-type proton ATPase subunit D

物种未注明

UniProt P32610

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 V-type proton ATPase catalytic subunit A × 2 (P17255) V-type proton ATPase subunit B × 2 (P16140) V-type proton ATPase subunit E × 2 (P22203) V-type proton ATPase subunit G × 2 (P48836) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P39111) V-type proton ATPase subunit H × 1 (P41807) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 1 × 1 (P47104) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 2 × 1 (Q03956) Suppressor of kinetochore protein 1 × 1 (P52286) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATD_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–256; UniProt 1–256

V-type proton ATPase subunit F

物种未注明

UniProt P39111

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 V-type proton ATPase catalytic subunit A × 2 (P17255) V-type proton ATPase subunit B × 2 (P16140) V-type proton ATPase subunit E × 2 (P22203) V-type proton ATPase subunit G × 2 (P48836) V-type proton ATPase subunit D × 1 (P32610) V-type proton ATPase subunit H × 1 (P41807) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 1 × 1 (P47104) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 2 × 1 (Q03956) Suppressor of kinetochore protein 1 × 1 (P52286) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATF_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–117; UniProt 2–118

V-type proton ATPase subunit H

物种未注明

UniProt P41807

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 V-type proton ATPase catalytic subunit A × 2 (P17255) V-type proton ATPase subunit B × 2 (P16140) V-type proton ATPase subunit E × 2 (P22203) V-type proton ATPase subunit G × 2 (P48836) V-type proton ATPase subunit D × 1 (P32610) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P39111) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 1 × 1 (P47104) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 2 × 1 (Q03956) Suppressor of kinetochore protein 1 × 1 (P52286) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VATH_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–478; UniProt 1–478

Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 1

物种未注明

UniProt P47104

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 V-type proton ATPase catalytic subunit A × 2 (P17255) V-type proton ATPase subunit B × 2 (P16140) V-type proton ATPase subunit E × 2 (P22203) V-type proton ATPase subunit G × 2 (P48836) V-type proton ATPase subunit D × 1 (P32610) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P39111) V-type proton ATPase subunit H × 1 (P41807) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 2 × 1 (Q03956) Suppressor of kinetochore protein 1 × 1 (P52286) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RAV1_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 x; PDB构建体 1–1357; UniProt 1–1357

Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 2

物种未注明

UniProt Q03956

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 V-type proton ATPase catalytic subunit A × 2 (P17255) V-type proton ATPase subunit B × 2 (P16140) V-type proton ATPase subunit E × 2 (P22203) V-type proton ATPase subunit G × 2 (P48836) V-type proton ATPase subunit D × 1 (P32610) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P39111) V-type proton ATPase subunit H × 1 (P41807) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 1 × 1 (P47104) Suppressor of kinetochore protein 1 × 1 (P52286) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RAV2_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 y; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351

Suppressor of kinetochore protein 1

物种未注明

UniProt P52286

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 V-type proton ATPase catalytic subunit A × 2 (P17255) V-type proton ATPase subunit B × 2 (P16140) V-type proton ATPase subunit E × 2 (P22203) V-type proton ATPase subunit G × 2 (P48836) V-type proton ATPase subunit D × 1 (P32610) V-type proton ATPase subunit F × 1 (P39111) V-type proton ATPase subunit H × 1 (P41807) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 1 × 1 (P47104) Regulator of V-ATPase in vacuolar membrane protein 2 × 1 (Q03956) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 SKP1_YEAST
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 z; PDB构建体 1–194; UniProt 1–194

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9cop
沉积日期 deposition_date2024-07-17
结构标题 titleYeast RAVE bound to V-ATPase V1 complex
关键词 keywordsV-ATPase, RAVE, assembly, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9cop__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9cop__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9cop__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)74.85 Å
Rg(电子密度)74.16 Å
总 Rg73.37 Å
原子数70017
残基数5041
排除体积643550 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9cop__assembly_1__model_1 14-meric (14) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

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7. 引用文献 (1)