9czq

Ca2+ bound open-inactivated hSlo1 + beta2N-beta4 channel in detergent.

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 172.2 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Isoform 5 of Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1

Homo sapiens

UniProt Q12791

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 66–1121 链 B; UniProt 66–1121 链 C; UniProt 66–1121 链 D; UniProt 66–1121 未记录 Large-conductance Ca2+-activated K+ channel beta2 subunit,Calcium-activated potassium channel subunit beta-4 × 4 (B5BNX0,Q86W47) MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 20 CLR CHOLESTEROL × 11 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl pH 8.0, 450 mM KCl, 5 mM EDTA, 15 mM MgCl2, 0.02% GDN and 0.05 mg/ml POPE:POPC:POPA 5:5:1 (w:w:w). cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.88 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 27 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KCMA1_HUMAN
Isoform Q12791-5
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–1056; UniProt 66–1121 作者链 B; PDB构建体 1–1056; UniProt 66–1121 作者链 C; PDB构建体 1–1056; UniProt 66–1121 作者链 D; PDB构建体 1–1056; UniProt 66–1121

Large-conductance Ca2+-activated K+ channel beta2 subunit,Calcium-activated potassium channel subunit beta-4

Homo sapiens

UniProt B5BNX0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 2–44 链 F; UniProt 2–44 链 G; UniProt 2–44 链 H; UniProt 2–44 片段:;N-terminal 45 residues of kcnmb2 ligated to kcnmb4 (devoid of N terminal first 15 residues),N-terminal 45 residues of kcnmb2 ligated to kcnmb4 (devoid of N terminal first 15 residues) ; Isoform 5 of Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1 × 4 (Q12791) MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 20 CLR CHOLESTEROL × 11 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl pH 8.0, 450 mM KCl, 5 mM EDTA, 15 mM MgCl2, 0.02% GDN and 0.05 mg/ml POPE:POPC:POPA 5:5:1 (w:w:w). cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.88 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 B5BNX0_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–43; UniProt 2–44 作者链 F; PDB构建体 1–43; UniProt 2–44 作者链 G; PDB构建体 1–43; UniProt 2–44 作者链 H; PDB构建体 1–43; UniProt 2–44

Large-conductance Ca2+-activated K+ channel beta2 subunit,Calcium-activated potassium channel subunit beta-4

Homo sapiens

UniProt Q86W47

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 15–210 链 F; UniProt 15–210 链 G; UniProt 15–210 链 H; UniProt 15–210 片段:;N-terminal 45 residues of kcnmb2 ligated to kcnmb4 (devoid of N terminal first 15 residues),N-terminal 45 residues of kcnmb2 ligated to kcnmb4 (devoid of N terminal first 15 residues) ; Isoform 5 of Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1 × 4 (Q12791) MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 20 CLR CHOLESTEROL × 11 K POTASSIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl pH 8.0, 450 mM KCl, 5 mM EDTA, 15 mM MgCl2, 0.02% GDN and 0.05 mg/ml POPE:POPC:POPA 5:5:1 (w:w:w). cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.88 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KCMB4_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 44–239; UniProt 15–210 作者链 F; PDB构建体 44–239; UniProt 15–210 作者链 G; PDB构建体 44–239; UniProt 15–210 作者链 H; PDB构建体 44–239; UniProt 15–210

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9czq

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9czq
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9czq
沉积日期 deposition_date2024-08-05
结构标题 titleCa2+ bound open-inactivated hSlo1 + beta2N-beta4 channel in detergent.
关键词 keywords;Potassium ion channel, calcium and voltage gated ion channel, big potassium channel, human BK, hSlo1, open-inactivated hSlo1, ball and chain inactivation, hSlo1 inactivating subunit complex, detergent micelle, MEMBRANE PROTEIN ;; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier55.07
回转半径 Rg (电子) rg_electron53.87
零角强度 I(0) i03260700000.00
分子量 molecular_weight512410.0 kDa
排除体积 excluded_volume653860 ų
包络体积 envelope_volume942920 ų
水化壳体积 shell_volume139130 ų
包络直径 envelope_diameter168.9
壳层 Rg shell_rg62.69
包络 Rg envelope_rg52.28
形状 Rg shape_rg53.87
总 Rg total_rg54.11
总原子数 total_atoms36018
残基数 n_residues4392
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax172.2
Rg (实空间) rg_real54.77
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.43
I(0) (实空间) i0_real3.2610e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.9330e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal55.31
I(0) (倒空间) i0_reciprocal3263000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8832
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary71.2
偏度 Skewness skewness0.091
峰度 Kurtosis kurtosis-0.534
角度范围 angular_range— – 0.1450 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha476900000.0000
实空间数据点数 n_real_points30
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.914; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.953; Smooth: 0.783

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)