9fco

Structure of E. coli 30S-IF1-IF3-mRNA-Kasugamycin complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Small ribosomal subunit protein uS4

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （P0A7W1） Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform × 1 （P02358） Small ribosomal subunit protein uS8 × 1 （P0A7W7） Translation initiation factor IF-1 × 1 （P69222） Translation initiation factor IF-3 × 1 （P0A707） Small ribosomal subunit protein uS11 × 1 （P0A7R9） Small ribosomal subunit protein uS12 × 1 （P0A7S3） Small ribosomal subunit protein uS15 × 1 （P0ADZ4） Small ribosomal subunit protein bS16 × 1 （P0A7T3） Small ribosomal subunit protein uS17 × 1 （P0AG63） Small ribosomal subunit protein bS18 × 1 （P0A7T7） Small ribosomal subunit protein bS20 × 1 （P0A7U7） Small ribosomal subunit protein bS21 × 1 （P68679） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS4_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–206； UniProt 1–206

Small ribosomal subunit protein uS5

Escherichia coli

UniProt P0A7W1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （P0A7V8） Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform × 1 （P02358） Small ribosomal subunit protein uS8 × 1 （P0A7W7） Translation initiation factor IF-1 × 1 （P69222） Translation initiation factor IF-3 × 1 （P0A707） Small ribosomal subunit protein uS11 × 1 （P0A7R9） Small ribosomal subunit protein uS12 × 1 （P0A7S3） Small ribosomal subunit protein uS15 × 1 （P0ADZ4） Small ribosomal subunit protein bS16 × 1 （P0A7T3） Small ribosomal subunit protein uS17 × 1 （P0AG63） Small ribosomal subunit protein bS18 × 1 （P0A7T7） Small ribosomal subunit protein bS20 × 1 （P0A7U7） Small ribosomal subunit protein bS21 × 1 （P68679） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS5_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–167； UniProt 1–167

Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform

Escherichia coli

UniProt P02358

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （P0A7V8） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （P0A7W1） Small ribosomal subunit protein uS8 × 1 （P0A7W7） Translation initiation factor IF-1 × 1 （P69222） Translation initiation factor IF-3 × 1 （P0A707） Small ribosomal subunit protein uS11 × 1 （P0A7R9） Small ribosomal subunit protein uS12 × 1 （P0A7S3） Small ribosomal subunit protein uS15 × 1 （P0ADZ4） Small ribosomal subunit protein bS16 × 1 （P0A7T3） Small ribosomal subunit protein uS17 × 1 （P0AG63） Small ribosomal subunit protein bS18 × 1 （P0A7T7） Small ribosomal subunit protein bS20 × 1 （P0A7U7） Small ribosomal subunit protein bS21 × 1 （P68679） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS6_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

Small ribosomal subunit protein uS8

Escherichia coli

UniProt P0A7W7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （P0A7V8） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （P0A7W1） Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform × 1 （P02358） Translation initiation factor IF-1 × 1 （P69222） Translation initiation factor IF-3 × 1 （P0A707） Small ribosomal subunit protein uS11 × 1 （P0A7R9） Small ribosomal subunit protein uS12 × 1 （P0A7S3） Small ribosomal subunit protein uS15 × 1 （P0ADZ4） Small ribosomal subunit protein bS16 × 1 （P0A7T3） Small ribosomal subunit protein uS17 × 1 （P0AG63） Small ribosomal subunit protein bS18 × 1 （P0A7T7） Small ribosomal subunit protein bS20 × 1 （P0A7U7） Small ribosomal subunit protein bS21 × 1 （P68679） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS8_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130

Translation initiation factor IF-1

Escherichia coli

UniProt P69222

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （P0A7V8） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （P0A7W1） Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform × 1 （P02358） Small ribosomal subunit protein uS8 × 1 （P0A7W7） Translation initiation factor IF-3 × 1 （P0A707） Small ribosomal subunit protein uS11 × 1 （P0A7R9） Small ribosomal subunit protein uS12 × 1 （P0A7S3） Small ribosomal subunit protein uS15 × 1 （P0ADZ4） Small ribosomal subunit protein bS16 × 1 （P0A7T3） Small ribosomal subunit protein uS17 × 1 （P0AG63） Small ribosomal subunit protein bS18 × 1 （P0A7T7） Small ribosomal subunit protein bS20 × 1 （P0A7U7） Small ribosomal subunit protein bS21 × 1 （P68679） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	IF1_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–72； UniProt 1–72

Translation initiation factor IF-3

Escherichia coli

UniProt P0A707

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （P0A7V8） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （P0A7W1） Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform × 1 （P02358） Small ribosomal subunit protein uS8 × 1 （P0A7W7） Translation initiation factor IF-1 × 1 （P69222） Small ribosomal subunit protein uS11 × 1 （P0A7R9） Small ribosomal subunit protein uS12 × 1 （P0A7S3） Small ribosomal subunit protein uS15 × 1 （P0ADZ4） Small ribosomal subunit protein bS16 × 1 （P0A7T3） Small ribosomal subunit protein uS17 × 1 （P0AG63） Small ribosomal subunit protein bS18 × 1 （P0A7T7） Small ribosomal subunit protein bS20 × 1 （P0A7U7） Small ribosomal subunit protein bS21 × 1 （P68679） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	IF3_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–180； UniProt 1–180

Small ribosomal subunit protein uS11

Escherichia coli

UniProt P0A7R9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （P0A7V8） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （P0A7W1） Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform × 1 （P02358） Small ribosomal subunit protein uS8 × 1 （P0A7W7） Translation initiation factor IF-1 × 1 （P69222） Translation initiation factor IF-3 × 1 （P0A707） Small ribosomal subunit protein uS12 × 1 （P0A7S3） Small ribosomal subunit protein uS15 × 1 （P0ADZ4） Small ribosomal subunit protein bS16 × 1 （P0A7T3） Small ribosomal subunit protein uS17 × 1 （P0AG63） Small ribosomal subunit protein bS18 × 1 （P0A7T7） Small ribosomal subunit protein bS20 × 1 （P0A7U7） Small ribosomal subunit protein bS21 × 1 （P68679） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS11_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–129； UniProt 1–129

Small ribosomal subunit protein uS12

Escherichia coli

UniProt P0A7S3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （P0A7V8） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （P0A7W1） Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform × 1 （P02358） Small ribosomal subunit protein uS8 × 1 （P0A7W7） Translation initiation factor IF-1 × 1 （P69222） Translation initiation factor IF-3 × 1 （P0A707） Small ribosomal subunit protein uS11 × 1 （P0A7R9） Small ribosomal subunit protein uS15 × 1 （P0ADZ4） Small ribosomal subunit protein bS16 × 1 （P0A7T3） Small ribosomal subunit protein uS17 × 1 （P0AG63） Small ribosomal subunit protein bS18 × 1 （P0A7T7） Small ribosomal subunit protein bS20 × 1 （P0A7U7） Small ribosomal subunit protein bS21 × 1 （P68679） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS12_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124

Small ribosomal subunit protein uS15

Escherichia coli

UniProt P0ADZ4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （P0A7V8） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （P0A7W1） Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform × 1 （P02358） Small ribosomal subunit protein uS8 × 1 （P0A7W7） Translation initiation factor IF-1 × 1 （P69222） Translation initiation factor IF-3 × 1 （P0A707） Small ribosomal subunit protein uS11 × 1 （P0A7R9） Small ribosomal subunit protein uS12 × 1 （P0A7S3） Small ribosomal subunit protein bS16 × 1 （P0A7T3） Small ribosomal subunit protein uS17 × 1 （P0AG63） Small ribosomal subunit protein bS18 × 1 （P0A7T7） Small ribosomal subunit protein bS20 × 1 （P0A7U7） Small ribosomal subunit protein bS21 × 1 （P68679） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS15_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89

Small ribosomal subunit protein bS16

Escherichia coli

UniProt P0A7T3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （P0A7V8） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （P0A7W1） Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform × 1 （P02358） Small ribosomal subunit protein uS8 × 1 （P0A7W7） Translation initiation factor IF-1 × 1 （P69222） Translation initiation factor IF-3 × 1 （P0A707） Small ribosomal subunit protein uS11 × 1 （P0A7R9） Small ribosomal subunit protein uS12 × 1 （P0A7S3） Small ribosomal subunit protein uS15 × 1 （P0ADZ4） Small ribosomal subunit protein uS17 × 1 （P0AG63） Small ribosomal subunit protein bS18 × 1 （P0A7T7） Small ribosomal subunit protein bS20 × 1 （P0A7U7） Small ribosomal subunit protein bS21 × 1 （P68679） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS16_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82

Small ribosomal subunit protein uS17

Escherichia coli

UniProt P0AG63

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （P0A7V8） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （P0A7W1） Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform × 1 （P02358） Small ribosomal subunit protein uS8 × 1 （P0A7W7） Translation initiation factor IF-1 × 1 （P69222） Translation initiation factor IF-3 × 1 （P0A707） Small ribosomal subunit protein uS11 × 1 （P0A7R9） Small ribosomal subunit protein uS12 × 1 （P0A7S3） Small ribosomal subunit protein uS15 × 1 （P0ADZ4） Small ribosomal subunit protein bS16 × 1 （P0A7T3） Small ribosomal subunit protein bS18 × 1 （P0A7T7） Small ribosomal subunit protein bS20 × 1 （P0A7U7） Small ribosomal subunit protein bS21 × 1 （P68679） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS17_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84

Small ribosomal subunit protein bS18

Escherichia coli

UniProt P0A7T7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （P0A7V8） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （P0A7W1） Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform × 1 （P02358） Small ribosomal subunit protein uS8 × 1 （P0A7W7） Translation initiation factor IF-1 × 1 （P69222） Translation initiation factor IF-3 × 1 （P0A707） Small ribosomal subunit protein uS11 × 1 （P0A7R9） Small ribosomal subunit protein uS12 × 1 （P0A7S3） Small ribosomal subunit protein uS15 × 1 （P0ADZ4） Small ribosomal subunit protein bS16 × 1 （P0A7T3） Small ribosomal subunit protein uS17 × 1 （P0AG63） Small ribosomal subunit protein bS20 × 1 （P0A7U7） Small ribosomal subunit protein bS21 × 1 （P68679） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS18_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–75； UniProt 1–75

Small ribosomal subunit protein bS20

Escherichia coli

UniProt P0A7U7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （P0A7V8） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （P0A7W1） Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform × 1 （P02358） Small ribosomal subunit protein uS8 × 1 （P0A7W7） Translation initiation factor IF-1 × 1 （P69222） Translation initiation factor IF-3 × 1 （P0A707） Small ribosomal subunit protein uS11 × 1 （P0A7R9） Small ribosomal subunit protein uS12 × 1 （P0A7S3） Small ribosomal subunit protein uS15 × 1 （P0ADZ4） Small ribosomal subunit protein bS16 × 1 （P0A7T3） Small ribosomal subunit protein uS17 × 1 （P0AG63） Small ribosomal subunit protein bS18 × 1 （P0A7T7） Small ribosomal subunit protein bS21 × 1 （P68679） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS20_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–87； UniProt 1–87

Small ribosomal subunit protein bS21

Escherichia coli

UniProt P68679

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 14 RNA 2	16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （P0A7V8） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （P0A7W1） Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform × 1 （P02358） Small ribosomal subunit protein uS8 × 1 （P0A7W7） Translation initiation factor IF-1 × 1 （P69222） Translation initiation factor IF-3 × 1 （P0A707） Small ribosomal subunit protein uS11 × 1 （P0A7R9） Small ribosomal subunit protein uS12 × 1 （P0A7S3） Small ribosomal subunit protein uS15 × 1 （P0ADZ4） Small ribosomal subunit protein bS16 × 1 （P0A7T3） Small ribosomal subunit protein uS17 × 1 （P0AG63） Small ribosomal subunit protein bS18 × 1 （P0A7T7） Small ribosomal subunit protein bS20 × 1 （P0A7U7） mRNA × 1 ;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ; × 1 MAGNESIUM ION × 53 POTASSIUM ION × 25 water × 16	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS21_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–71； UniProt 1–71

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9fco
沉积日期 deposition_date	2024-05-15
最后修订 last_revision	2025-03-19
结构标题 title	Structure of E. coli 30S-IF1-IF3-mRNA-Kasugamycin complex
关键词 keywords	Ribosome, Antibiotic, TRANSLATION; TRANSLATION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9fco__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9fco__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9fco__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	54.39 Å
Rg（电子密度）	55.01 Å
总 Rg	55.02 Å
原子数	34125
残基数	2488
排除体积	526020 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9fco__assembly_1__model_1`	16-meric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (20)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	16S rRNA
分子量 formula_weight	339708.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	35974

AAAUUGAAGAGUUUGAUCAUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAGGCCUAACACAUGCAAGUCGAACGGUAACAGGAAUGCUGACGAGUGGCGGACGGGUGAGUAAUGUCUGGGAAACUGCCUGAUGGAGGGGGAUAACUACUGGAAACGGUAGCUAAUACCGCAUAACGUCGCAAGACCAAAGAGGGGGCCUCUUGCCAUCGGAUGUGCCCAGAUGGGAUUAGCUAGUAGGUGGGGUAACGGCUCACCUAGGCGACGAUCCCUAGCUGGUCUGAGAGGAUGACCAGCCACACUGGAACUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCACAAUGGGCGCAAGCCUGAUGCAGCCAUGCCGCGUGUAUGAAGAAGCCCUUCGGGUUGUAAAGUACUUUCAGCGGGGAGGAAGGGAGUAAAGUUAAUACCUUUGCUCAUUGACGUUACCCGCAGAAGAAGCACCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGUGCAAGCGUUAAUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGCACGCAGGCGGUUUGUUAAGUCAGAUGUGAAAUCCCCGGGCUCAACCUGGGAACUGCAUCUGAUACUGGCAAGCUUGAGUCUCGUAGAGGGGGGUAGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCUGGAGGAAUACCGGUGGCGAAGGCGGCCCCCUGGACGAAGACUGACGCUCAGGUGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGUCGACUUGGAGGUUGUGCCGGCGUGGCUUCCGGAGCUAACGCGUUAAGUCGACCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCAAAUGAAUUGACGGGGGUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUAGCUUAACCUUCGGGAGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein uS4
分子量 formula_weight	23514.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MARYLGPKLKLSRREGTDLFLKSGVRAIDTKCKIEQAPGQHGARKPRLSDYGVQLREKQKVRRIYGVLERQFRNYYKEAARLKGNTGENLLALLEGRLDNVVYRMGFGATRAEARQLVSHKAIMVNGRVVNIASYQVSPNDVVSIREKAKKQSRVKAALELAEQREKPTWLEVDAGKMEGTFKRKPERSDLSADINEHLIVELYSK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein uS5
分子量 formula_weight	17629.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MAHIEKQAGELQEKLIAVNRVSKTVKGGRIFSFTALTVVGDGNGRVGFGYGKAREVPAAIQKAMEKARRNMINVALNNGTLQHPVKGVHTGSRVFMQPASEGTGIIAGGAMRAVLEVAGVHNVLAKAYGSTNPINVVRATIDGLENMNSPEMVAAKRGKSVEEILGK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform
分子量 formula_weight	15727.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MRHYEIVFMVHPDQSEQVPGMIERYTAAITGAEGKIHRLEDWGRRQLAYPINKLHKAHYVLMNVEAPQEVIDELETTFRFNDAVIRSMVMRTKHAVTEASPMVKAKDERRERRDDFANETADDAEAGDSEEEEEE

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein uS8
分子量 formula_weight	14146.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MSMQDPIADMLTRIRNGQAANKAAVTMPSSKLKVAIANVLKEEGFIEDFKVEGDTKPELELTLKYFQGKAVVESIQRVSRPGLRIYKRKDELPKVMAGLGIAVVSTSKGVMTDRAARQAGLGGEIICYVA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Translation initiation factor IF-1
分子量 formula_weight	8262.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MAKEDNIEMQGTVLETLPNTMFRVELENGHVVTAHISGKMRKNYIRILTGDKVTVELTPYDLSKGRIVFRSR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Translation initiation factor IF-3
分子量 formula_weight	20601.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MKGGKRVQTARPNRINGEIRAQEVRLTGLEGEQLGIVSLREALEKAEEAGVDLVEISPNAEPPVCRIMDYGKFLYEKSKSSKEQKKKQKVIQVKEIKFRPGTDEGDYQVKLRSLIRFLEEGDKAKITLRFRGREMAHQQIGMEVLNRVKDDLQELAVVESFPTKIEGRQMIMVLAPKKKQ

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein uS11
分子量 formula_weight	15055.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MAKAPIRARKRVRKQVSDGVAHIHASFNNTIVTITDRQGNALGWATAGGSGFRGSRKSTPFAAQVAAERCADAVKEYGIKNLEVMVKGPGPGRESTIRALNAAGFRITNITDVTPIPHDGCRPPKKRRVGCRPPKKRRV

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein uS12
分子量 formula_weight	13814.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MATVNQLVRKPRARKVAKSNVPALEACPQKRGVCTRVYTTTPKKPNSALRKVCRVRLTNGFEVTSYIGGEGHNLQEHSVILIRGGRVKXLPGVRYHTVRGALDCSGVKDRKQARSKYGVKRPKA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein uS15
分子量 formula_weight	10290.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MSLSTEATAKIVSEFGRDANDTGSTEVQVALLTAQINHLQGHFAEHKKDHHSRRGLLRMVSQRRKLLDYLKRKDVARYTQLIERLGLRR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein bS16
分子量 formula_weight	9207.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MVTIRLARHGAKKRPFYQVVVADSRNARNGRFIERVGFFNPIASEKEEGTRLDLDRIAHWVGQGATISDRVAALIKEVNKAA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein uS17
分子量 formula_weight	9724.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MTDKIRTLQGRVVSDKMEKSIVVAIERFVKHPIYGKFIKRTTKLHVHDENNECGIGDVVEIRECRPLSKTKSWTLVRVVEKAVL

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein bS18
分子量 formula_weight	9005.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MARYFRRRKFCRFTAEGVQEIDYKDIATLKNYITESGKIVPSRITGTRAKYQRQLARAIKRARYLSLLPYTDRHQ

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein bS20
分子量 formula_weight	9708.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MANIKSAKKRAIQSEKARKHNASRRSMMRTFIKKVYAAIEAGDKAAAQKAFNEMQPIVDRQAAKGLIHKNKAARHKANLTAQINKLA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein bS21
分子量 formula_weight	8524.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MPVIKVRENEPFDVALRRFKRSCEKAGVLAEVRRREFYEKPTTERKRAKASAVKRHAKKLARENARRTRLY

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	mRNA
分子量 formula_weight	13074.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	Y

AAACAAUUGGAGGAAUAAGGUAUGUUUGGCGGAAAACGAG

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	;(1S,2R,3S,4R,5S,6S)-2,3,4,5,6-PENTAHYDROXYCYCLOHEXYL 2-AMINO-4-{[CARBOXY(IMINO)METHYL]AMINO}-2,3,4,6-TETRADEOXY-ALPHA-D-ARABINO-HEXOPYRANOSIDE ;
分子量 formula_weight	379.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	53

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	25

实体 20 Entity 20 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1849

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	332988

Structure of E. coli 30S-IF1-IF3-mRNA-Kasugamycin complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Small ribosomal subunit protein uS4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small ribosomal subunit protein uS5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small ribosomal subunit protein bS6, fully modified isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small ribosomal subunit protein uS8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Translation initiation factor IF-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Translation initiation factor IF-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small ribosomal subunit protein uS11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small ribosomal subunit protein uS12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small ribosomal subunit protein uS15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small ribosomal subunit protein bS16

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体