9lh8

human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in complex with L-nicotine (four-nicotine-bound desensitized state)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 155.0 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7

Homo sapiens

UniProt P36544

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 5 其他聚合物 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–502 链 B; UniProt 1–502 链 C; UniProt 1–502 链 D; UniProt 1–502 链 E; UniProt 1–502 未记录 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 44 个其他 PDB 条目、44 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACHA7_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–502; UniProt 1–502 作者链 B; PDB构建体 1–502; UniProt 1–502 作者链 C; PDB构建体 1–502; UniProt 1–502 作者链 D; PDB构建体 1–502; UniProt 1–502 作者链 E; PDB构建体 1–502; UniProt 1–502

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9lh8

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9lh8
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9lh8
沉积日期 deposition_date2025-01-11
结构标题 titlehuman alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in complex with L-nicotine (four-nicotine-bound desensitized state)
关键词 keywordsLigand-gated ion channel, Nicotine, Desensitization, Recovery, Closed pore, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier45.21
回转半径 Rg (电子) rg_electron44.71
零角强度 I(0) i0707867000.00
分子量 molecular_weight229560.0 kDa
排除体积 excluded_volume291230 ų
包络体积 envelope_volume395600 ų
水化壳体积 shell_volume75523 ų
包络直径 envelope_diameter162.3
壳层 Rg shell_rg47.78
包络 Rg envelope_rg44.49
形状 Rg shape_rg44.75
总 Rg total_rg44.74
总原子数 total_atoms16168
残基数 n_residues2000
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax155.0
Rg (实空间) rg_real45.53
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.70
I(0) (实空间) i0_real7.0790e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.4950e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal45.22
I(0) (倒空间) i0_reciprocal707600000.0000
解质量估计 total_estimate0.6008
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary48.7
偏度 Skewness skewness0.603
峰度 Kurtosis kurtosis-0.041
角度范围 angular_range— – 0.1750 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha135100000.0000
实空间数据点数 n_real_points36
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.666; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.062; Positv: 1.000; Valcen: 0.963; Smooth: 0.660

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)