9mj5

Catalytic domain of human DNA polymerase alpha in complex with DNA and RPA

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 138.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Replication protein A 14 kDa subunit

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 4 DNA 2 PDB 声明：hexameric（6）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 1–121	未记录	Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） RNA-DNA primer (11-mer) × 1 DNA polymerase alpha catalytic subunit × 1 （P09884） DNA template (35-mer) × 1 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9MJ5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1L1O Structure of the human Replication Protein A (RPA) trimerization core 提交 2002-02-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–121（121 aa）片段：RPA14 链 D 1–121（121 aa）片段：RPA14	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；300 K；0.1 M Hepes, 9% glycerol, and 1.6 M ammonium sulfate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1QUQ COMPLEX OF REPLICATION PROTEIN A SUBUNITS RPA14 AND RPA32 提交 1999-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–121（121 aa）片段：RPA14 链 D 1–121（121 aa）片段：RPA14	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES, 0.75 M AMMONIUM SULPHATE, 20% PEG 8K, 10 MM DTT., pH 6.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.291
1QUQ COMPLEX OF REPLICATION PROTEIN A SUBUNITS RPA14 AND RPA32 提交 1999-07-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–121（121 aa）片段：RPA14	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES, 0.75 M AMMONIUM SULPHATE, 20% PEG 8K, 10 MM DTT., pH 6.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.291
1QUQ COMPLEX OF REPLICATION PROTEIN A SUBUNITS RPA14 AND RPA32 提交 1999-07-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–121（121 aa）片段：RPA14	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES, 0.75 M AMMONIUM SULPHATE, 20% PEG 8K, 10 MM DTT., pH 6.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.291
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–121（121 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–121（121 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–121（121 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–121（121 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PQA Crystal Structure of Full-length Human RPA 14/32 Heterodimer 提交 2007-05-01	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–121（121 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Bicine pH 9, 20% saturated ammonium sulfate, 10% acetonitrile, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 9.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.280
2PQA Crystal Structure of Full-length Human RPA 14/32 Heterodimer 提交 2007-05-01	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–121（121 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Bicine pH 9, 20% saturated ammonium sulfate, 10% acetonitrile, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 9.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.280
2Z6K Crystal structure of full-length human RPA14/32 heterodimer 提交 2007-08-03	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–121（121 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.9；293 K；0.95M KNa tartrate, 0.1M MES, 10mM DTT, pH 5.9, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.269
2Z6K Crystal structure of full-length human RPA14/32 heterodimer 提交 2007-08-03	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–121（121 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.9；293 K；0.95M KNa tartrate, 0.1M MES, 10mM DTT, pH 5.9, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.269
3KDF X-ray Crystal Structure of the Human Replication Protein A Complex from Wheat Germ Cell Free Expression 提交 2009-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–121（121 aa）链 C 1–121（121 aa）	突变：M1S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：M1S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；11% PEG 8000, 50 mM BisTris-propane pH 7.0, 50 mM NaCl, 5 mM HEPES pH 7.0, 0.3 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.98 Å R-free 0.206
3KDF X-ray Crystal Structure of the Human Replication Protein A Complex from Wheat Germ Cell Free Expression 提交 2009-10-22	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–121（121 aa）	突变：M1S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；11% PEG 8000, 50 mM BisTris-propane pH 7.0, 50 mM NaCl, 5 mM HEPES pH 7.0, 0.3 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.98 Å R-free 0.206
3KDF X-ray Crystal Structure of the Human Replication Protein A Complex from Wheat Germ Cell Free Expression 提交 2009-10-22	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–121（121 aa）	突变：M1S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；11% PEG 8000, 50 mM BisTris-propane pH 7.0, 50 mM NaCl, 5 mM HEPES pH 7.0, 0.3 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.98 Å R-free 0.206
8RK2 Human Replication protein A (RPA; trimeric core) - ssDNA complex 提交 2023-12-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–121（121 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 P 1–121（121 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 P 1–121（121 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 9 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RFA3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–121； UniProt 1–121

Replication protein A 32 kDa subunit

Homo sapiens

UniProt P15927

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 4 DNA 2 PDB 声明：hexameric（6）与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 35–270	未记录	Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） RNA-DNA primer (11-mer) × 1 DNA polymerase alpha catalytic subunit × 1 （P09884） DNA template (35-mer) × 1 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9MJ5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1DPU SOLUTION STRUCTURE OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF HUMAN RPA32 COMPLEXED WITH UNG2(73-88) 提交 1999-12-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 202–270（69 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN (RESIDUES 172-270)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM PHOSPHATE, 50mM NACL；压力 AMBIENT NMR样品组成 1MM RPA32(172-270) U- 15N,13C; 1.2 MM UNG2(73- 88) NA; 25MM PHOSPHATE BUFFER NA; 50MM NACL; 5 MM DTT NA	分辨率未提供
1L1O Structure of the human Replication Protein A (RPA) trimerization core 提交 2002-02-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 44–171（128 aa）片段：RPA32 central domain (residues 44-171) 链 E 44–171（128 aa）片段：RPA32 central domain (residues 44-171)	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；300 K；0.1 M Hepes, 9% glycerol, and 1.6 M ammonium sulfate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 2.80 Å R-free 0.282
1QUQ COMPLEX OF REPLICATION PROTEIN A SUBUNITS RPA14 AND RPA32 提交 1999-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 43–171（129 aa）片段：CENTRAL DOMAIN, RESIDUES 43-171 链 C 43–171（129 aa）片段：CENTRAL DOMAIN, RESIDUES 43-171	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES, 0.75 M AMMONIUM SULPHATE, 20% PEG 8K, 10 MM DTT., pH 6.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.291
1QUQ COMPLEX OF REPLICATION PROTEIN A SUBUNITS RPA14 AND RPA32 提交 1999-07-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 43–171（129 aa）片段：CENTRAL DOMAIN, RESIDUES 43-171	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES, 0.75 M AMMONIUM SULPHATE, 20% PEG 8K, 10 MM DTT., pH 6.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.291
1QUQ COMPLEX OF REPLICATION PROTEIN A SUBUNITS RPA14 AND RPA32 提交 1999-07-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 43–171（129 aa）片段：CENTRAL DOMAIN, RESIDUES 43-171	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M MES, 0.75 M AMMONIUM SULPHATE, 20% PEG 8K, 10 MM DTT., pH 6.50	分辨率 2.50 Å R-free 0.291
1Z1D Structural Model for the interaction between RPA32 C-terminal domain and SV40 T antigen origin binding domain. 提交 2005-03-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 172–270（99 aa）片段：RPA32 C-terminal domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.03 M；压力 ambient NMR样品组成 0.2mM RPA32C U-15N, 0.6mM Tag-OBD, 20mM Tris buffer pH 7.0, 2 mM DTT, 5mM MgCl2, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.2mM Tag-OBD U-15N, 0.6mM RPA32C, 20mM Tris buffer pH 7.0, 2mM DTT, 5mM MgCl2, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–270（270 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–270（270 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–270（270 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PI2 Full-length Replication protein A subunits RPA14 and RPA32 提交 2007-04-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–270（270 aa）	未记录	DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% dioxane, 0.1 M MES pH 6.5, 39% saturated ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.255
2PQA Crystal Structure of Full-length Human RPA 14/32 Heterodimer 提交 2007-05-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 42–172（131 aa）片段：UNP residues 42-172	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Bicine pH 9, 20% saturated ammonium sulfate, 10% acetonitrile, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 9.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.280
2PQA Crystal Structure of Full-length Human RPA 14/32 Heterodimer 提交 2007-05-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 42–172（131 aa）片段：UNP residues 42-172	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Bicine pH 9, 20% saturated ammonium sulfate, 10% acetonitrile, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 9.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.280
2Z6K Crystal structure of full-length human RPA14/32 heterodimer 提交 2007-08-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–270（270 aa）片段：residues 42-175	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.9；293 K；0.95M KNa tartrate, 0.1M MES, 10mM DTT, pH 5.9, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.269
2Z6K Crystal structure of full-length human RPA14/32 heterodimer 提交 2007-08-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–270（270 aa）片段：residues 42-175	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.9；293 K；0.95M KNa tartrate, 0.1M MES, 10mM DTT, pH 5.9, EVAPORATION, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.269
3KDF X-ray Crystal Structure of the Human Replication Protein A Complex from Wheat Germ Cell Free Expression 提交 2009-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 41–172（132 aa）片段：Residues 41-172 链 D 41–172（132 aa）片段：Residues 41-172	突变：A41S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：A41S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；11% PEG 8000, 50 mM BisTris-propane pH 7.0, 50 mM NaCl, 5 mM HEPES pH 7.0, 0.3 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.98 Å R-free 0.206
3KDF X-ray Crystal Structure of the Human Replication Protein A Complex from Wheat Germ Cell Free Expression 提交 2009-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 41–172（132 aa）片段：Residues 41-172	突变：A41S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；11% PEG 8000, 50 mM BisTris-propane pH 7.0, 50 mM NaCl, 5 mM HEPES pH 7.0, 0.3 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.98 Å R-free 0.206
3KDF X-ray Crystal Structure of the Human Replication Protein A Complex from Wheat Germ Cell Free Expression 提交 2009-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 41–172（132 aa）片段：Residues 41-172	突变：A41S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；11% PEG 8000, 50 mM BisTris-propane pH 7.0, 50 mM NaCl, 5 mM HEPES pH 7.0, 0.3 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.98 Å R-free 0.206
4MQV Crystal complex of Rpa32c and Smarcal1 N-terminus 提交 2013-09-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 202–270（69 aa）片段：C-Terminal domain, UNP residues 202-270	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；298 K；25% PEG 4000, 0.2M Sodium Acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 1.95 Å R-free 0.220
4MQV Crystal complex of Rpa32c and Smarcal1 N-terminus 提交 2013-09-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 202–270（69 aa）片段：C-Terminal domain, UNP residues 202-270	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；298 K；25% PEG 4000, 0.2M Sodium Acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 1.95 Å R-free 0.220
4OU0 Crystal Structure of RPA32C 提交 2014-02-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 202–270（69 aa）片段：UNP RESIDUES 202-270	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；294 K；50 mM Sodium Acetate, 20% PEG 3350, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 1.40 Å R-free 0.238
8RK2 Human Replication protein A (RPA; trimeric core) - ssDNA complex 提交 2023-12-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–270（270 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 O 1–270（270 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 O 1–270（270 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 13 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RFA2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–236； UniProt 35–270

Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit

Homo sapiens

UniProt P27694

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 4 DNA 2 PDB 声明：hexameric（6）与全部聚合物数一致	链 C； UniProt 438–616	未记录	Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） RNA-DNA primer (11-mer) × 1 DNA polymerase alpha catalytic subunit × 1 （P09884） DNA template (35-mer) × 1 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9MJ5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1EWI HUMAN REPLICATION PROTEIN A: GLOBAL FOLD OF THE N-TERMINAL RPA-70 DOMAIN REVEALS A BASIC CLEFT AND FLEXIBLE C-TERMINAL LINKER 提交 2000-04-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–114（114 aa）片段：N-TERMINAL FRAGMENT (RESIDUES 1-114)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 ambient NMR样品组成 1mM d169, 100 mM Tris, 100 mM Tris-HCL, 0.25 mM EDTA, 50 mM NaCl, 0.2% NaN3 and 1mM DTT, pH 7.6 \| 90% H20, 10% D20	分辨率未提供
1FGU SSDNA-BINDING DOMAIN OF THE LARGE SUBUNIT OF REPLICATION PROTEIN A 提交 2000-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 182–432（251 aa）片段：CENTRAL DOMAIN 链 B 182–432（251 aa）片段：CENTRAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.1 M K,NaH2PO4 0.1 M Tris 3.8 M NaCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.281
1JMC SINGLE STRANDED DNA-BINDING DOMAIN OF HUMAN REPLICATION PROTEIN A BOUND TO SINGLE STRANDED DNA, RPA70 SUBUNIT, RESIDUES 183-420 提交 1996-11-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 181–422（242 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；24-27% PEG2000 MME, 20MM NA_CL, 20MM MGCL2, 5MM DTT, 100MM MES PH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 2.40 Å R-free 0.330
1L1O Structure of the human Replication Protein A (RPA) trimerization core 提交 2002-02-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 436–616（181 aa）片段：RPA70 C-terminal domain (residues 436-616) 链 F 436–616（181 aa）片段：RPA70 C-terminal domain (residues 436-616)	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；300 K；0.1 M Hepes, 9% glycerol, and 1.6 M ammonium sulfate, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 2.80 Å R-free 0.282
2B29 N-terminal domain of the RPA70 subunit of human replication protein A. 提交 2005-09-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：N-terminal domain (Residues 1-120)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；Ammonium Sulphate, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.261
2B3G p53N (fragment 33-60) bound to RPA70N 提交 2005-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–120（120 aa）片段：N-terminal domain (Residues 1-120)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.9；298 K；Na3 Citrate, Hepes, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 7.90	分辨率 1.60 Å R-free 0.239
4IJH Fragment-based Discovery of Protein-Protein Interaction Inhibitors of Replication Protein A 提交 2012-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-120)	突变：E7R	1EJ 3-chloro-6-[3-(4-fluorophenyl)-5-sulfanyl-4H-1,2,4-triazol-4-yl]-1-benzothiophene-2-carboxylic acid × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；100 mM MES, 200 mM calcium acetate, 15% PEG8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.50 Å R-free 0.189
4IJL Fragment-based Discovery of Protein-Protein Interaction Inhibitors of Replication Protein A 提交 2012-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-120)	突变：E7R	1EK {[5-(3-chloro-1-benzothiophen-2-yl)-4-phenyl-4H-1,2,4-triazol-3-yl]sulfanyl}acetic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；100 mM MES, 200 calcium acetate, 15% PEG8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.70 Å R-free 0.233
4IPC Structure of the N-terminal domain of RPA70, E7R mutant 提交 2013-01-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）	突变：E7R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；100 mM MES, 200 mM Calcium Acetate, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.22 Å R-free 0.175
4IPD Structure of the N-terminal domain of RPA70, E100R mutant 提交 2013-01-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）	突变：E100R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；294 K；100 mM BIS-TRIS, 2M ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.51 Å R-free 0.166
4IPG Structure of the N-terminal domain of RPA70, E7R, E100R mutant 提交 2013-01-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）	突变：E7R, E100R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；294 K；100 mM Citrate, 200 mM NaCl, 30% PEG 8000, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.58 Å R-free 0.201
4IPH Structure of N-terminal domain of RPA70 in complex with VU079104 inhibitor 提交 2013-01-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）	突变：E7R	1FJ ~{N}-(2,3-dimethylphenyl)-7-oxidanylidene-12-sulfanylidene-5,11-dithia-1,8-diazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-2(6),3,9-triene-10-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；100 mM MES, 200 mM Calcium Acetate, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.94 Å R-free 0.274
4LUO Fragment-Based Discovery of a Potent Inhibitor of Replication Protein A Protein-Protein Interactions 提交 2013-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：RPA70N (unp residues 1-120)	突变：E7R	1DZ 1-(3-methylphenyl)-5-phenyl-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；100 MM MES, 200 MM CALCIUM ACETATE, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.54 Å R-free 0.189
4LUV Fragment-Based Discovery of a Potent Inhibitor of Replication Protein A Protein-Protein Interactions 提交 2013-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：RPA70N (unp residues 1-120)	突变：E7R	1XS 5-(3-chloro-4-fluorophenyl)furan-2-carboxylic acid × 1 1DZ 1-(3-methylphenyl)-5-phenyl-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；100 MM MES, 200 MM CALCIUM ACETATE, 20% PEG 8000, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.40 Å R-free 0.170
4LUZ Fragment-Based Discovery of a Potent Inhibitor of Replication Protein A Protein-Protein Interactions 提交 2013-07-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：RPA70N (unp residues 1-120)	突变：E7R	1XT 5-(4-{[4-(5-carboxyfuran-2-yl)benzyl]oxy}phenyl)-1-(3-methylphenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；100 MM MES, 200 MM CALCIUM ACETATE, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.90 Å R-free 0.237
4LW1 Fragment-Based Discovery of a Potent Inhibitor of Replication Protein A Protein-Protein Interactions 提交 2013-07-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：RPA70N (unp residues 1-120)	突变：E7R	1XS 5-(3-chloro-4-fluorophenyl)furan-2-carboxylic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；100 MM MES, 200 MM CALCIUM ACETATE, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.63 Å R-free 0.210
4LWC Fragment-Based Discovery of a Potent Inhibitor of Replication Protein A Protein-Protein Interactions 提交 2013-07-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：RPA70N (unp residues 1-120)	突变：E7R	1XU 5-[3-chloro-4-({4-[1-(3,4-dichlorophenyl)-1H-pyrazol-5-yl]benzyl}carbamothioyl)phenyl]furan-2-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；100 MM MES, 200 MM CALCIUM ACETATE, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.61 Å R-free 0.215
4NB3 Crystal structure of RPA70N in complex with a 3,4 dichlorophenylalanine ATRIP derived peptide 提交 2013-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–120（120 aa）	突变：E7R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM ammonium acetate, 25% PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.35 Å R-free 0.175
4NB3 Crystal structure of RPA70N in complex with a 3,4 dichlorophenylalanine ATRIP derived peptide 提交 2013-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–120（120 aa）	突变：E7R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM ammonium acetate, 25% PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.35 Å R-free 0.175
4O0A Fragment-Based Discovery of a Potent Inhibitor of Replication Protein A Protein-Protein Interactions 提交 2013-12-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：N-terminal domain of Replication Protein A	突变：E7R	2P9 5-{4-[({[4-(5-carboxyfuran-2-yl)-2-chlorophenyl]carbonothioyl}amino)methyl]phenyl}-1-(3,4-dichlorophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；100 MM MES, 200 MM CALCIUM ACETATE, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.20 Å R-free 0.176
4R4C Structure of RPA70N in complex with 5-(4-((4-(5-carboxyfuran-2-yl)-2-chlorobenzamido)methyl)phenyl)-1-(3,4-dichlorophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid 提交 2014-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-120)	突变：E7R	3HS 5-[4-({[4-(5-carboxyfuran-2-yl)-2-chlorobenzoyl]amino}methyl)phenyl]-1-(3,4-dichlorophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；100 MM MES, 200 MM CALCIUM ACETATE, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 1.40 Å R-free 0.189
4R4I Structure of RPA70N in complex with 5-(4-((6-(5-carboxyfuran-2-yl)-1-thioxo-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl)methyl)phenyl)-1-(3,4-dichlorophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid 提交 2014-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-120)	突变：E7R	3HV 5-(4-{[6-(5-carboxyfuran-2-yl)-1-thioxo-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]methyl}phenyl)-1-(3,4-dichlorophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；100 MM MES, 200 MM CALCIUM ACETATE, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 1.40 Å R-free 0.191
4R4O Crystal structure of RPA70N in complex with 5-(4-((4-(5-carboxyfuran-2-yl)benzyl)carbamothioyl)phenyl)-1-(3,4-dichlorophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid 提交 2014-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-120)	突变：E7R	3HW 5-(4-{[4-(5-carboxyfuran-2-yl)benzyl]carbamothioyl}phenyl)-1-(3,4-dichlorophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；100 mM MES, 200 mM Calcium Acetate, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 1.33 Å R-free 0.195
4R4Q Crystal structure of RPA70N in complex with 5-(3-((N-(4-(5-carboxyfuran-2-yl)benzyl)acetamido)methyl)phenyl)-1-(3,4-dichlorophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid 提交 2014-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-120)	突变：E7R	3HZ 5-[4-({acetyl[4-(5-carboxyfuran-2-yl)benzyl]amino}methyl)phenyl]-1-(3,4-dichlorophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；100 mM MES, 200 mM Calcium Acetate, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 1.35 Å R-free 0.188
4R4T Crystal Structure of RPA70N in complex with 5-(4-((4-(5-carboxyfuran-2-yl)phenylthioamido)methyl)phenyl)-1-(3,4-dichlorophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid 提交 2014-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：N-terminal domain (UNP residues 1-120)	突变：E7R	3J0 5-{4-[({[4-(5-carboxyfuran-2-yl)phenyl]carbonothioyl}amino)methyl]phenyl}-1-(3,4-dichlorophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；100 mM MES, 200 mM Calcium Acetate, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 1.28 Å R-free 0.175
5E7N Crystal Structure of RPA70N in complex with VU0085636 提交 2015-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：residues 1-120	突变：E7R	5KR 2-({3-[(4-bromophenyl)sulfamoyl]-4-methylbenzoyl}amino)benzoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；100 mM MES, 200 mM Calcium Acetate, 20% PEG 8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 1.21 Å R-free 0.215
5EAY Crystal structure of a Dna2 peptide in complex with Rpa 70N 提交 2015-10-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 3–120（118 aa）片段：UNP residues 3-120 链 B 3–120（118 aa）片段：UNP residues 3-120 链 C 3–120（118 aa）片段：UNP residues 3-120 链 D 3–120（118 aa）片段：UNP residues 3-120	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；50 mM Tris-HCl, 35 % PEG 1500, 2 mM TCEP, pH 8.0	分辨率 1.55 Å R-free 0.267
5N85 Structure of RPA70N in complex with PrimPol (fragment 514-525) 提交 2017-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–120（120 aa）	突变：E7R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293.15 K；0.2 M Ammonium acetate 0.1 M Sodium acetate 4.5 20 % w/v PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
5N8A Structure of RPA70N in complex with PrimPol (fragment 480-560) 提交 2017-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–120（120 aa）	突变：E7R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.15 K；0.2M imidazole malate, 30% w/v PEG 4000	分辨率 1.28 Å R-free 0.178
7XUT Crystal structure of RPA70N-WRN fusion 提交 2022-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–121（121 aa）链 B 1–121（121 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；278 K；20% PEG3350, 200 mM ammonium sulfate	分辨率 1.60 Å R-free 0.214
7XUV Crystal structure of RPA70N-RMI1 fusion 提交 2022-05-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–120（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；278 K；30% PEG 2000 MME	分辨率 1.60 Å R-free 0.220
7XUW Crystal structure of RPA70N-BLMp2 fusion 提交 2022-05-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–121（121 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；278 K；8% PEG 4000	分辨率 1.80 Å R-free 0.217
7XV0 Crystal structure of RPA70N-BLMp1 fusion 提交 2022-05-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–121（121 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；278 K；2000 mM Ammonium sulfate	分辨率 1.50 Å R-free 0.200
7XV1 Crystal structure of RPA70N-HelB fusion 提交 2022-05-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–120（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；278 K；20% PEG3350 200 mM Ammonium Acetate	分辨率 1.80 Å R-free 0.216
7XV4 Crystal structure of RPA70N-ATRIP fusion 提交 2022-05-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–120（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；2400 mM ammonium sulfate	分辨率 1.60 Å R-free 0.224
8JZV RPA70N-ETAA1 fusion 提交 2023-07-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–120（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 3350, Ammonium chloride	分辨率 1.50 Å R-free 0.200
8JZY RPA70N-RAD9 fusion 提交 2023-07-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–120（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 3350, sodium phosphate	分辨率 1.50 Å R-free 0.200
8K00 RPA70N-MRE11 fusion 提交 2023-07-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–120（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；Ammonium sulate	分辨率 1.40 Å R-free 0.199
8RK2 Human Replication protein A (RPA; trimeric core) - ssDNA complex 提交 2023-12-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–616（616 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9J1S Human replication protein A: RPA70 subunit N-terminal domain 提交 2024-08-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–120（120 aa）片段：N-terminal domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M Bis-Tris, pH 7.0, 25% PEG 3350	分辨率 1.55 Å R-free 0.230
9PD3 NER dual incision complex - DuIS 提交 2025-06-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：17-meric	链 N 1–616（616 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9PD4 NER dual incision complex - DuIM 提交 2025-06-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 N 1–616（616 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 41 个其他 PDB 条目、42 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	RFA1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–179； UniProt 438–616

DNA polymerase alpha catalytic subunit

Homo sapiens

UniProt P09884

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 4 DNA 2 PDB 声明：hexameric（6）与全部聚合物数一致	链 S； UniProt 335–1244	未记录	Replication protein A 14 kDa subunit × 1 （P35244） Replication protein A 32 kDa subunit × 1 （P15927） Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit × 1 （P27694） RNA-DNA primer (11-mer) × 1 DNA template (35-mer) × 1 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9MJ5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1K0P NMR Structures of the Zinc Finger Domain of Human DNA Polymerase-alpha 提交 2001-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1347–1377（31 aa）片段：zinc finger domain (residues 1347-1377)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；296 K；压力 ambient NMR样品组成 3mM Zinc Finger Domain; 3.6mM Zn(II)nitrate \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1K18 Minimized Average NMR Structure of the Zinc Finger Domain of Human DNA Polymerase-alpha 提交 2001-09-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1347–1377（31 aa）片段：zinc finger domain (residues 1347-1377)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；296 K；压力 ambient NMR样品组成 3mM Zinc Finger Peptide; 3.6 mM Zn(II)nitrate \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1N5G NMR Structures of the Zinc Finger Domain of Human DNA Polymerase-alpha 提交 2002-11-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1345–1382（38 aa）片段：zinc finger domain (residues 1345-1382)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.2；296 K；压力 ambient NMR样品组成 3mM peptide, 3.6mM Zn(II)nitrate \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
4BPX Crystal structure of human primase in complex with the primase- binding motif of DNA polymerase alpha 提交 2013-05-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1445–1462（18 aa）片段：PRIMASE-BINDING MOTIF RESIDUES 1445-1462, PRIL RESIDUES 19-253	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100MM TRIS-HCL/BICINE PH 8.5, 20% GLYCEROL, 10% PEG4000 AND 20MM EACH OF AN ALCOHOL MIX COMPRISING 1,6-HEXANEDIOL, 1-BUTANOL, 1,2-PROPANEDIOL, 2-PROPANOL, 1,4- BUTANEDIOL AND 1,3-PROPANEDIOL.	分辨率 3.40 Å R-free 0.267
4BPX Crystal structure of human primase in complex with the primase- binding motif of DNA polymerase alpha 提交 2013-05-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1445–1462（18 aa）片段：PRIMASE-BINDING MOTIF RESIDUES 1445-1462, PRIL RESIDUES 19-253	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100MM TRIS-HCL/BICINE PH 8.5, 20% GLYCEROL, 10% PEG4000 AND 20MM EACH OF AN ALCOHOL MIX COMPRISING 1,6-HEXANEDIOL, 1-BUTANOL, 1,2-PROPANEDIOL, 2-PROPANOL, 1,4- BUTANEDIOL AND 1,3-PROPANEDIOL.	分辨率 3.40 Å R-free 0.267
4Q5V Crystal structure of the catalytic core of human DNA polymerase alpha in ternary complex with an RNA-primed DNA template and aphidicolin 提交 2014-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 336–1257（922 aa）片段：Human DNA polymerase apha catalytic core domain residues 336-1257	突变：V516A	2ZE (3R,4R,4aR,6aS,8R,9R,11aS,11bS)-4,9-bis(hydroxymethyl)-4,11b-dimethyltetradecahydro-8,11a-methanocyclohepta[a]naphthale ne-3,9-diol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；100 mM KCl, 12.5 mM MgCl2, 25 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 6 % 2-propanol, 2 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295 K	分辨率 2.52 Å R-free 0.268
4Q5V Crystal structure of the catalytic core of human DNA polymerase alpha in ternary complex with an RNA-primed DNA template and aphidicolin 提交 2014-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 E 336–1257（922 aa）片段：Human DNA polymerase apha catalytic core domain residues 336-1257	突变：V516A	2ZE (3R,4R,4aR,6aS,8R,9R,11aS,11bS)-4,9-bis(hydroxymethyl)-4,11b-dimethyltetradecahydro-8,11a-methanocyclohepta[a]naphthale ne-3,9-diol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；100 mM KCl, 12.5 mM MgCl2, 25 mM Na-Cacodylate, pH 6.5, 6 % 2-propanol, 2 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295 K	分辨率 2.52 Å R-free 0.268
4QCL Crystal structure of the catalytic core of human DNA polymerase alpha in ternary complex with an RNA-primed DNA template and dCTP 提交 2014-05-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 336–1257（922 aa）片段：Human dna polymerase apha catalytic core domain residues 336-1257	突变：V516A	DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 K POTASSIUM ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；reservoir solution: 0.8 mm zinc sulfate, 50 mm MES buffer pH 6.5, 8.8% v/v PEG MME 550; cryo solution: 100 mm potassium chloride, 0.8 mm zinc sulfate, 50 mm MES buffer pH 6.5, 1.1 magnesium chloride, 15% v/v PEG MME 550, 15% v/v ethylene glycol;, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.239
4Y97 Crystal Structure of human Pol alpha B-subunit in complex with C-terminal domain of catalytic subunit 提交 2015-02-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1265–1444（180 aa）片段：UNP residues 1265-1444	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；The diffraction quality crystals are growing in 2-3 weeks in 100 mM ammonium acetate, 50 mM Na citrate pH 5.6, 10 - 10.4% w/v PEG 4000, 2 mM TCEP and 50 mM guanidine HCl.	分辨率 2.51 Å R-free 0.257
4Y97 Crystal Structure of human Pol alpha B-subunit in complex with C-terminal domain of catalytic subunit 提交 2015-02-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1265–1444（180 aa）片段：UNP residues 1265-1444	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；The diffraction quality crystals are growing in 2-3 weeks in 100 mM ammonium acetate, 50 mM Na citrate pH 5.6, 10 - 10.4% w/v PEG 4000, 2 mM TCEP and 50 mM guanidine HCl.	分辨率 2.51 Å R-free 0.257
4Y97 Crystal Structure of human Pol alpha B-subunit in complex with C-terminal domain of catalytic subunit 提交 2015-02-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1265–1444（180 aa）片段：UNP residues 1265-1444	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；The diffraction quality crystals are growing in 2-3 weeks in 100 mM ammonium acetate, 50 mM Na citrate pH 5.6, 10 - 10.4% w/v PEG 4000, 2 mM TCEP and 50 mM guanidine HCl.	分辨率 2.51 Å R-free 0.257
4Y97 Crystal Structure of human Pol alpha B-subunit in complex with C-terminal domain of catalytic subunit 提交 2015-02-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1265–1444（180 aa）片段：UNP residues 1265-1444	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；The diffraction quality crystals are growing in 2-3 weeks in 100 mM ammonium acetate, 50 mM Na citrate pH 5.6, 10 - 10.4% w/v PEG 4000, 2 mM TCEP and 50 mM guanidine HCl.	分辨率 2.51 Å R-free 0.257
5EXR Crystal structure of human primosome 提交 2015-11-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 335–1462（1128 aa）	突变：V516A	ZN ZINC ION × 3 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；0.2 M lithium sulphate, 50 mM TRIS HCl pH 8.5, 2 mM TCEP pH 7.5, 11.2% w/v PEG 4,000, 3% v/v ethanol, 0.5% v/v polypropylene glycol P400 and 0.2 mM EDTA	分辨率 3.60 Å R-free 0.326
5EXR Crystal structure of human primosome 提交 2015-11-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 335–1462（1128 aa）	突变：V516A	ZN ZINC ION × 3 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；295 K；0.2 M lithium sulphate, 50 mM TRIS HCl pH 8.5, 2 mM TCEP pH 7.5, 11.2% w/v PEG 4,000, 3% v/v ethanol, 0.5% v/v polypropylene glycol P400 and 0.2 mM EDTA	分辨率 3.60 Å R-free 0.326
5IUD Human DNA polymerase alpha in binary complex with a DNA:DNA template-primer 提交 2016-03-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 338–1255（918 aa）片段：UNP Residues 338-1255	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；10% polyethylene glycol 4000, 0.2M sodium citrate, 10% isopropanol, 0.1M sodium citrate buffer (pH = 5.5)	分辨率 3.30 Å R-free 0.228
5IUD Human DNA polymerase alpha in binary complex with a DNA:DNA template-primer 提交 2016-03-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 D 338–1255（918 aa）片段：UNP Residues 338-1255	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；10% polyethylene glycol 4000, 0.2M sodium citrate, 10% isopropanol, 0.1M sodium citrate buffer (pH = 5.5)	分辨率 3.30 Å R-free 0.228
5IUD Human DNA polymerase alpha in binary complex with a DNA:DNA template-primer 提交 2016-03-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 G 338–1255（918 aa）片段：UNP Residues 338-1255	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；10% polyethylene glycol 4000, 0.2M sodium citrate, 10% isopropanol, 0.1M sodium citrate buffer (pH = 5.5)	分辨率 3.30 Å R-free 0.228
5IUD Human DNA polymerase alpha in binary complex with a DNA:DNA template-primer 提交 2016-03-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 J 338–1255（918 aa）片段：UNP Residues 338-1255	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；10% polyethylene glycol 4000, 0.2M sodium citrate, 10% isopropanol, 0.1M sodium citrate buffer (pH = 5.5)	分辨率 3.30 Å R-free 0.228
6AS7 CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC CORE OF HUMAN DNA POLYMERASE ALPHA IN TERNARY COMPLEX WITH AN DNA-PRIMED DNA TEMPLATE AND DCTP 提交 2017-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 336–1257（922 aa）	突变：V516A	DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 CO COBALT (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；6MM COCL2, 2 MM TCEP, 50 MM NA ACETATE PH 4.6, 225 MM 1,6HEXADEDIOL	分辨率 2.95 Å R-free 0.301
7N2M Crystal structure of DNA polymerase alpha catalytic core in complex with dCTP and template/primer having T-C mismatch at the post-insertion site 提交 2021-05-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 336–1257（922 aa）	未记录	DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 4 K POTASSIUM ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；0.8 mM zinc sulfate, 8.8% v/v PEG MME 550, and 50 mM MES pH 6.5	分辨率 2.90 Å R-free 0.228
7OPL CryoEM structure of DNA Polymerase alpha - primase bound to SARS CoV nsp1 提交 2021-06-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 334–1462（1129 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.12 Å
7U5C Cryo-EM structure of human CST bound to DNA polymerase alpha-primase in a recruitment state 提交 2022-03-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：octameric	链 C 335–1462（1128 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
8B9D Human replisome bound by Pol Alpha 提交 2022-10-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric	链 B 1–1462（1462 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8D0B Human CST-DNA polymerase alpha/primase preinitiation complex bound to 4xTEL-foldback template 提交 2022-05-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：octameric	链 F 324–1462（1139 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；CHAPSO is only added just before sample vitrification. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.43 Å
8D0K Human CST-DNA polymerase alpha/primase preinitiation complex bound to 4xTEL-foldback template - PRIM2C advanced PIC 提交 2022-05-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：octameric	链 F 2–1462（1461 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；CHAPSO is only added just before sample vitrification. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.27 Å
8D96 Human DNA polymerase alpha/primase elongation complex I bound to primer/template 提交 2022-06-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–1462（1462 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；CHAPSO is made fresh at 80 mM before added to the sample at a final concentration of 4-8 mM immediately before vitrification. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
8D9D Human DNA polymerase-alpha/primase elongation complex II bound to primer/template 提交 2022-06-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 C 1–1462（1462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；CHAPSO is made fresh at 80 mM before added to the sample at a final concentration of 4-8 mM immediately before vitrification. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.59 Å
8QJ7 Cryo-EM structure of human DNA polymerase alpha-primase in pre-initiation stage 1 提交 2023-09-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–1462（1462 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.07 Å
8VY3 Human DNA polymerase alpha/primase - AavLEA1 (1:40 molar ratio) 提交 2024-02-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 338–1456（1119 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
9C8V Human DNA polymerase alpha/primase - CHAPSO (4 mM) 提交 2024-06-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 338–1456（1119 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.39 Å

共 21 个其他 PDB 条目、30 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DPOLA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–910； UniProt 335–1244

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9mj5
沉积日期 deposition_date	2024-12-13
结构标题 title	Catalytic domain of human DNA polymerase alpha in complex with DNA and RPA
关键词 keywords	DNA replication, Replication-DNA-RNA complex; Replication/DNA/RNA
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	41.81 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	41.60 Å
零角强度 I(0) i0	467948000.00
分子量 molecular_weight	170520.0 kDa
排除体积 excluded_volume	210930 Å³
包络体积 envelope_volume	313340 Å³
水化壳体积 shell_volume	63285 Å³
包络直径 envelope_diameter	138.8 Å
壳层 Rg shell_rg	46.40 Å
包络 Rg envelope_rg	40.74 Å
形状 Rg shape_rg	41.58 Å
总 Rg total_rg	41.93 Å
总原子数 total_atoms	11919
残基数 n_residues	1420
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	138.1 Å
Rg (实空间) rg_real	41.82 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.12 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.6790e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.5880e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	41.81 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	467900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8775
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	47.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.339
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.425
角度范围 angular_range	— – 0.1900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	82820000.0000
实空间数据点数 n_real_points	39
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.897; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.713

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Replication protein A 14 kDa subunit
分子量 formula_weight	13583.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	11919

MVDMMDLPRSRINAGMLAQFIDKPVCFVGRLEKIHPTGKMFILSDGEGKNGTIELMEPLDEEISGIVEVVGRVTAKATILCTSYVQFKEDSHPFDLGLYNEAVKIIHDFPQFYPLGIVQHD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Replication protein A 32 kDa subunit
分子量 formula_weight	25931.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

AEKKSRARAQHIVPCTISQLLSATLVDEVFRIGNVEISQVTIVGIIRHAEKAPTNIVYKIDDMTAAPMDVRQWVDTDDTSSENTVVPPETYVKVAGHLRSFQNKKSLVAFKIMPLEDMNEFTTHILEVINAHMVLSKANSQPSAGRAPISNPGMSEAGNFGGNSFMPANGLTVAQNQVLNLIKACPRPEGLNFQDLKNQLKHMSVSSIKQAVDFLSNEGHIYSTVDDDHFKSTDAE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit
分子量 formula_weight	21031.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

SNTNWKTLYEVKSENLGQGDKPDYFSSVATVVYLRKENCMYQACPTQDCNKKVIDQQNGLYRCEKCDTEFPNFKYRMILSVNIADFQENQWVTCFQESAEAILGQNAAYLGELKDKNEQAFEEVFQNANFRSFIFRVRVKVETYNDESRIKATVMDVKPVDYREYGRRLVMSIRRSALM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	RNA-DNA primer (11-mer)
分子量 formula_weight	3505.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide/polyribonucleotide hybrid
链编号 strand_id	P

GCCUGGAGCGC

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	DNA polymerase alpha catalytic subunit
分子量 formula_weight	103957.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.7
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

ADEEQVFHFYWLDAYEDQYNQPGVVFLFGKVWIESAETHVSCCVMVKNIERTLYFLPREMKIDLNTGKETGTPISMKDVYEEFDEKIATKYKIMKFKSKPVEKNYAFEIPDVPEKSEYLEVKYSAEMPQLPQDLKGETFSHVFGTNTSSLELFLMNRKIKGPCWLEVKSPQLLNQPVSWCKVEAMALKPDLVNVIKDVSPPPLVVMAFSMKTMQNAKNHQNEIIAMAALVHHSFALDKAAPKPPFQSHFCVVSKPKDCIFPYAFKEVIEKKNVKVEVAATERTLLGFFLAKVHKIDPDIIVGHNIYGFELEVLLQRINVCKAPHWSKIGRLKRSNMPKLGGRSGFGERNATCGRMICDVEISAKELIRCKSYHLSELVQQILKTERVVIPMENIQNMYSESSQLLYLLEHTWKDAKFILQIMCELNVLPLALQITNIAGNIMSRTLMGGRSERNEFLLLHAFYENNYIVPDKQIFRKPQQKLGDEDEEIDGDTNKYKKGRKKAAYAGGLVLDPKVGFYDKFILLLDFNSLYPSIIQEFNICFTTVQRVASEAQKVTEDGEQEQIPELPDPSLEMGILPREIRKLVERRKQVKQLMKQQDLNPDLILQYDIRQKALKLTANSMYGCLGFSYSRFYAKPLAALVTYKGREILMHTKEMVQKMNLEVIYGDTDSIMINTNSTNLEEVFKLGNKVKSEVNKLYKLLEIDIDGVFKSLLLLKKKKYAALVVEPTSDGNYVTKQELKGLDIVRRDWCDLAKDTGNFVIGQILSDQSRDTIVENIQKRLIEIGENVLNGSVPVSQFEINKALTKDPQDYPDKKSLPHVHVALWINSQGGRKVKAGDTVSYVICQDGSNLTASQRAYAPEQLQKQDNLTIDTQYYLAQQIHPVVARICEPIDGIDAVLIATWLGLDPT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA template (35-mer)
分子量 formula_weight	10765.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	T

AATCTAGTAACATAGTATACATAGGCGCTCCAGGC

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	467.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	18529

fit	/app/data/saxs_computation/mj/9mj5/9mj5.fit
pddf	/app/data/pr_computation/mj/9mj5/9mj5.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/mj/9mj5/9mj5.dat

Catalytic domain of human DNA polymerase alpha in complex with DNA and RPA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Replication protein A 14 kDa subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Replication protein A 32 kDa subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

DNA polymerase alpha catalytic subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)