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9mms

Cryo-EM structure of CRAF/MEK1 complex (kinase domain, CRAF Y340D/Y341D mutant)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 80.2 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase

Homo sapiens

UniProt P04049

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–648 突变：Q156R, Y340D, Y341D, D587E Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 × 1 （Q02750） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP, 2 uM ATPgS, 1 uM GDC0623 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9MMS Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1C1Y CRYSTAL STRUCTURE OF RAP.GMPPNP IN COMPLEX WITH THE RAS-BINDING-DOMAIN OF C-RAF1 KINASE (RAFRBD). 提交 1999-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 55–131（77 aa） 片段：RAFRBD, RESIDUES 51-131
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；300 K；mmePeg5000, magnesium chloride, calcium chloride, ammonium sulphate., pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 1.90 Å R-free 0.257
1FAQ RAF-1 CYSTEINE RICH DOMAIN, NMR, 27 STRUCTURES 提交 1996-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 136–187（52 aa） 片段：CYSTEINE-RICH DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1FAR RAF-1 CYSTEINE RICH DOMAIN, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-09-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 136–187（52 aa） 片段：CYSTEINE-RICH DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1GUA HUMAN RAP1A, RESIDUES 1-167, DOUBLE MUTANT (E30D,K31E) COMPLEXED WITH GPPNHP AND THE RAS-BINDING-DOMAIN OF HUMAN C-RAF1, RESIDUES 51-131 提交 1996-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 51–131（81 aa） 片段：RESIDUES 51-131
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å
1RFA NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE RAS-BINDING DOMAIN OF C-RAF-1 提交 1995-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 55–132（78 aa） 片段：RAS BINDING DOMAIN, RESIDUES 55 - 132 WITH AN ADDITIONAL ALA AT THE N-TERMINUS
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
3CU8 Impaired binding of 14-3-3 to Raf1 is linked to Noonan and LEOPARD syndrome 提交 2008-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 256–264（9 aa） 片段：Phosphorylated cRaf1 peptide
链 Q 256–264（9 aa） 片段：Phosphorylated cRaf1 peptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 2 PPI PROPANOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M (Sodium propionate, sodium cacodylate, BIS-TRIS propane), 27% PEG 1500, 2mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
3IQJ Crystal Structure of human 14-3-3 sigma in Complex with Raf1 peptide (10mer) 提交 2009-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–264（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes/NaOH ph 7.5, 0.2M CaCl2, 28% PEG 400, 5% glycerol, 2mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.15 Å R-free 0.153
3IQU Crystal Structure of human 14-3-3 sigma in Complex with Raf1 peptide (6mer) 提交 2009-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–260（6 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M Hepes/NaOH ph 7.5, 0.2M CaCl2, 28% PEG 400, 5% glycerol, 2mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.05 Å R-free 0.151
3IQV Crystal Structure of human 14-3-3 sigma in Complex with Raf1 peptide (6mer) and stabilisator Fusicoccin 提交 2009-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–260（6 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） FSC FUSICOCCIN × 2 CL CHLORIDE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；20mM Hepes/NaOH pH 7.5, 2mM MgCl2 and 2 mM DTT, set up for crystallization in 0.1 M Hepes/NaOH ph 7.5, 0.2 M CaCl2, 28% PEG 400, 5% glycerol, 2mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.20 Å R-free 0.153
3KUC Complex of Rap1A(E30D/K31E)GDP with RafRBD(A85K/N71R) 提交 2009-11-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 51–131（81 aa） 片段：UNP residues 51-131
突变：A85K, N71R GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20-25% PEG 8000, 100 mM Tris or HEPES pH 7.2-7.6, 10-200 mM Ca Acetate or 100 mM Ammonium Sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.92 Å R-free 0.209
3KUD Complex of Ras-GDP with RafRBD(A85K) 提交 2009-11-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 51–131（81 aa） 片段：UNP residues 51-131
突变：A85K GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；1.3M Na-Malonat pH 6.0, 100 mM MES pH 6.1, 4% Betaine, 2% Sarcosine, 2% N,N-dimethylglycine, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.15 Å R-free 0.264
3NKX Impaired binding of 14-3-3 to Raf1 is linked to Noonan and LEOPARD syndrome 提交 2010-06-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–264（10 aa） 片段：phosphorylated C-Raf peptide, UNP residues 255-264
链 Q 255–264（10 aa） 片段：phosphorylated C-Raf peptide, UNP residues 255-264
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） PPI PROPANOIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M (Sodium propionate, sodium cacodylate, BIS-TRIS propane), 27% PEG 1500, 2mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.247
3O8I Structure of 14-3-3 isoform sigma in complex with a C-Raf1 peptide and a stabilizing small molecule fragment 提交 2010-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 255–264（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） M1T 6,6-dihydroxy-1-methoxyhexan-2-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；0.095M HEPES Na, 26.6%(v/v) PEG400, 0.19M CaCl2, 5%(v/v) Glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
分辨率 2.00 Å R-free 0.239
3OMV Crystal structure of c-raf (raf-1) 提交 2010-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 323–618（296 aa） 片段：C-RAF kinase domain, UNP residues 323-618
链 B 323–618（296 aa） 片段：C-RAF kinase domain, UNP residues 323-618
未记录 SM5 (1E)-5-(1-piperidin-4-yl-3-pyridin-4-yl-1H-pyrazol-4-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-one oxime × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；285 K；12% PEG 8K, 100 MM TRIS PH 8.0, 10% TACSIMATE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
分辨率 4.00 Å R-free 0.364
4FJ3 14-3-3 isoform zeta in complex with a diphoyphorylated C-RAF peptide 提交 2012-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 229–264（36 aa） 片段：UNP residues 229-264
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1 M Na-acetate pH 7.0, 0.8 M NaH2PO4 and 1.2 M K2HPO4 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.208
4G0N Crystal Structure of wt H-Ras-GppNHp bound to the RBD of Raf Kinase 提交 2012-07-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 54–131（78 aa） 片段：UNP residues 54-131
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 DTU (2R,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；291 K；Protein solution: 10 - 16 mg/mL, 50 mM HEPES, pH 7.2, 50 mM NaCl, 10mM MgCl2 5% Glycerol, 1mM DTE, 10 M ZnCl2 Reservoir solution:200mM calcium acetate, 100mM sodium cacodylate pH 6.5, 18% PEG 8000. Drop: 1uL protein, 1uL reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.45 Å R-free 0.229
4G3X Crystal Structure of Q61L H-Ras-GppNHp bound to the RBD of Raf Kinase 提交 2012-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 55–131（77 aa） 片段：UNP residues 55-131
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；Protein solution: 10 - 18 mg/mL, 50 mM HEPES, pH 7.2, 50 mM NaCl, 10mM MgCl2 5% Glycerol, 1mM DTE, 10 M ZnCl2 Reservoir solution:200mM calcium acetate, 100mM sodium cacodylate pH 6.5, 18% PEG 8000. Drop: 3uL protein, 3uL reservoir , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 3.25 Å R-free 0.271
4IEA 14-3-3 isoform sigma in complex with a phosphorylated C-RAF peptide 提交 2012-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 618–625（8 aa） 片段：UNP residues 618-625
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；95 mM Na-HEPES pH 7.4, 25.6 % PEG 400, 190 mM CaCl2, 5 % Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.208
4IHL Human 14-3-3 isoform zeta in complex with a diphoyphorylated C-RAF peptide and Cotylenin A 提交 2012-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 229–264（36 aa） 片段：UNP residues 229-264
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） K POTASSIUM ION × 2 1F5 (1R,3aS,4R,5R,6R,9aR,10E)-6-({(1S,2R,4S,5R,6R,8S,9S)-5-hydroxy-2-(methoxymethyl)-9-methyl-9-[(2S)-oxiran-2-yl]-3,7,10,1 1-tetraoxatricyclo[6.2.1.0~1,6~]undec-4-yl}oxy)-1-(methoxymethyl)-4,9a-dimethyl-7-(propan-2-yl)-1,2,3,3a,4,5,6,8,9,9a-de cahydrodicyclopenta[a,d][8]annulene-1,5-diol × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1 M NA-ACETATE PH 7.0, 0.8 M NAH2PO4 AND 1.2 M K2HPO4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.243
6NTC Crystal Structure of G12V HRas-GppNHp bound in complex with the engineered RBD variant 1 of CRAF Kinase protein 提交 2019-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 55–131（77 aa）
突变：F61L, K65Q, Q66E, R67W, N71K, C81S, V88R, R89H, C95S, C96S GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；30% PEG4000, 200mM NH4SO4, 100mM Na CaCo pH 6.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.278
6NTD Crystal Structure of G12V HRas-GppNHp bound in complex with the engineered RBD variant 12 of CRAF Kinase protein 提交 2019-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 55–131（77 aa）
突变：F61L, K65H, Q66E, N71K, C81S, V88R, R89H, C95S, C96S MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293.15 K；30% PEG4000, 200mM NH4SO4, 100mM Na Citrate
分辨率 3.15 Å R-free 0.287
6PTS NMR data-driven model of KRas-GMPPNP:RBD-CRD complex tethered to a nanodisc (state A) 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 56–187（132 aa） 片段：RBD-CRD (UNP residues 56-187)
未记录 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）450；压力 1
NMR测量条件 pH 5.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C KRAS, 0.2 mM U-12C, 14N, 1H RBD-CRD, 0.4 mM U-12C, 14N, 1H MSP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM U-12C, 14N, 1H KRAS, 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C RBD-CRD, 0.4 mM U-12C, 14N, 1H MSP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM U-12C, 14N, 1H KRAS, 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM U-12C, 14N, 1H KRAS, 0.2 mM U-2H; U-15N; Ile Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM U-15N; Ile C-delta-13C, Met methyl-13C KRAS, 0.5 mM Leu C-delta-13C, Val C-gamma-13C, RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 15N]; [U-13C]; RBD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.3 mM [U-99% 15N]; [U-13C]; CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6PTW NMR data-driven model of KRas-GMPPNP:RBD-CRD complex tethered to a nanodisc (state B) 提交 2019-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 56–187（132 aa） 片段：RBD-CRD (UNP residues 56-187)
未记录 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 17F O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）450；压力 1
NMR测量条件 pH 5.5；308 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N; U-2H] KRAS, 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] RBD-CRD, 0.4 mM [U-12C; U-14N; U-1H] MSP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] KRAS, 0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N; U-2H] RBD-CRD, 0.4 mM [U-12C; U-14N; U-1H] MSP, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N] RBD-CRD, 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] KRAS Q43C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [Ile, Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C; U-15N] RBD-CRD, 0.2 mM [U-12C; U-14N; U-1H] KRAS N-term C, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-15N; Ile C-delta-13C; Met methyl-13C] KRAS, 0.5 mM [Leu C-delta-13C; Val C-gamma-13C] RBD-CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] RBD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] CRD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6VJJ Crystal Structure of wild-type KRAS4b (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) of RAF1/CRAF 提交 2020-01-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 52–131（80 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CL CHLORIDE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.09M Halogens, 0.1M Imidazole.MES pH 6.5, 37.5% MPD, PEG 1000 and PEG 3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.195
6XGU Crystal Structure of KRAS-Q61R (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) and cysteine-rich domain (CRD) of RAF1/CRAF 提交 2020-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 52–188（137 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；100 mM Tris 7.8, 200 mM KBr, 200 mM KSCN, 3% PGA, 0.35 mM D-myo-phosphatidylinositol 3,4,5-triphosphate
分辨率 2.70 Å R-free 0.236
6XGV Crystal Structure of KRAS-G13D (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) and cysteine-rich domain (CRD) of RAF1/CRAF 提交 2020-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 52–188（137 aa）
突变：Modified Cys95 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100 mM sodium cacodylate pH 6.5, 700 mM sodium acetate, 0.35 mM D-myo-phosphatidylinositol 3,4,5-triphosphate
分辨率 2.11 Å R-free 0.204
6XHA Crystal Structure of KRAS-G12V (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) and cysteine-rich domain (CRD) of RAF1/CRAF 提交 2020-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 52–188（137 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM MgCl2, 8% PGA, 0.35 mM D-myo-phosphatidylinositol 3,4,5-triphosphate
分辨率 2.87 Å R-free 0.269
6XHB Crystal Structure of wild-type KRAS (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) and cysteine-rich domain (CRD) of RAF1/CRAF (crystal form II) 提交 2020-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 52–188（137 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；100 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM sodium citrate, 15% 2-propanol, 0.25% (w/v) n-octyl-beta-D-glucoside, 0.35 mM D-myo-phosphatidylinositol 3,4,5-triphosphate, and 0.25% (w/v) n-dodecyl-beta-D-maltoside
分辨率 2.50 Å R-free 0.221
6XI7 Crystal Structure of wild-type KRAS (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) and cysteine-rich domain (CRD) of RAF1/CRAF (crystal form I) 提交 2020-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 52–188（137 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；2218.18 mM AMSO4, 6.5% (w/v) PEG 400, pH 5.3
分辨率 1.95 Å R-free 0.232
7JHP Crystal structure of HRas in complex with the Ras-binding and cysteine-rich domains of CRaf-kinase 提交 2020-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 55–187（133 aa） 片段：UNP residues 55-187
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 17% w/v PEG10000
分辨率 2.77 Å R-free 0.264
7Z37 Structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex (RHC-II) 提交 2022-03-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 CP1 1–648（648 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging
分辨率 3.67 Å
7Z38 Structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex (RHC-I) 提交 2022-03-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–648（648 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 3 seconds before plunging
分辨率 3.16 Å
8A68 Small molecule stabilizer (compound 5) for C-RAF(pS259) and 14-3-3 提交 2022-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 255–263（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 6 L7U ~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyldisulfanyl]ethyl]-1-[(2~{R})-2-(6-methoxynaphthalen-2-yl)propanoyl]piperidine-4-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH 7.5, 0.19 M CaCl2, 5% glycerol, 28% PEG 400
分辨率 1.60 Å R-free 0.179
8A6F Small molecule stabilizer (compound 8) for C-RAF and 14-3-3 提交 2022-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–264（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 O56 1-[4-[4-chloranyl-3-(trifluoromethyl)phenyl]-4-oxidanyl-piperidin-1-yl]-3-[2-(dimethylamino)ethyldisulfanyl]propan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH 7.5, 0.19 M CaCl2, 26% (v/v) PEG 400 and 5% (v/v) glycerol
分辨率 1.60 Å R-free 0.181
8A6H Small molecule stabilizer (compound 7) for C-RAF and 14-3-3 提交 2022-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–264（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 L6L 3-[2-(dimethylamino)ethyldisulfanyl]-1-[4-oxidanyl-4-[3-(trifluoromethyl)phenyl]piperidin-1-yl]propan-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH 7.7, 0.19 M CaCl2, 24 % (v/v) PEG 400 and 5% (v/v) glycerol)
分辨率 1.60 Å R-free 0.174
8ATR Small molecular stabilizer for C-RAF (pS259) and 14-3-3 (1075297) 提交 2022-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–263（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 O6L 2-chloranyl-~{N}-[[1-[1-(4-chloranylphenoxy)cyclopentyl]carbonylpiperidin-4-yl]methyl]ethanamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES (pH 7.1), PEG400 (24% (v/v)), 0.19 M CaCl2 and 5% (v/v) Glycerol
分辨率 1.70 Å R-free 0.211
8ATS Small molecular stabilizer for C-RAF (pS259) and 14-3-3 (1075306) 提交 2022-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–263（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 O5I 2-chloranyl-~{N}-[[1-[1-[(4-chlorophenyl)amino]cyclopentyl]carbonylpiperidin-4-yl]methyl]ethanamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES (pH 7.1), PEG400 (24% (v/v)), 0.19 M CaCl2 and 5% (v/v) Glycerol
分辨率 1.40 Å R-free 0.171
8AV0 small molecule stabilizer (compound 1) for C-RAF pS259 and 14-3-3 提交 2022-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 256–264（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 O6C 1-[2-(4-chloranylphenoxy)-2-methyl-propanoyl]-~{N}-[2-[2-(dimethylamino)ethyldisulfanyl]ethyl]piperidine-4-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES (pH 7.1), PEG400 (24% (v/v)), 0.19 M CaCl2 and 5% (v/v) Glycerol
分辨率 1.50 Å R-free 0.180
8CHF cryo-EM Structure of Craf:14-3-3:Mek1 提交 2023-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–648（648 aa）
链 B 1–648（648 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 29L 2-{4-[(1E)-1-(hydroxyimino)-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]-3-(pyridin-4-yl)-1H-pyrazol-1-yl}ethanol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.25 Å
8CPD Cryo-EM structure of CRaf dimer with 14:3:3 提交 2023-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–648（648 aa）
链 B 1–648（648 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.46 Å
8EPW Crystal Structure of KRAS4b-G13D (GMPPNP-bound) in complex with RAS-binding domain (RBD) of RAF1/CRAF 提交 2022-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 52–131（80 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M potassium bromide, 30% PEG 2000 MME
分辨率 2.00 Å R-free 0.253
8GAE Hsp90 provides platform for CRaf dephosphorylation by PP5 提交 2023-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 404–610（207 aa）
未记录 K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3UL OF SAMPLE 10C 100% HUMIDITY 30S WAIT TIME 3S BLOT TIME -2 BLOT FORCE
分辨率 3.30 Å
8GFT Hsp90 provides platform for CRaf dephosphorylation by PP5 提交 2023-03-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 336–618（283 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3uL OF SAMPLE, 10C, 100% HUMIDITY, 30S WAIT TIME, 3S BLOT TIME, -2 BLOT FORCE
分辨率 3.80 Å
8JNA CRAF ras-binding domain chimera, apo form 提交 2023-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 50–101（52 aa）
链 B 114–141（28 aa）
突变：K65S, F99Y, S120W, D129E 突变：K65S, F99Y, S120W, D129E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；1.0M tri-sodium citrate, 0.1M imidazole, pH 8.0
分辨率 1.70 Å R-free 0.272
8JNB CRAF ras-binding domain chimera, ligand complex 提交 2023-06-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 50–101（52 aa）
链 B 114–141（28 aa）
突变：K65S, F99Y, S120W, D129E 突变：K65S, F99Y, S120W, D129E USX 2-[4-[[(2S)-1-ethanoyl-3-oxidanylidene-2H-indol-2-yl]methyl]-2-methoxy-phenoxy]ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.5M ammonium sulfate, 1.0M lithium sulfate, 0.1M sodium citrate, pH 5.6
分辨率 1.62 Å R-free 0.242
8JOF solution-structure of Ras Binding Domain (RBD) in C-RAF 提交 2023-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 51–131（81 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）85；压力 ambient
NMR样品组成 0.3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Serine/threonine-protein Kinase C-RAF, 25 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 10 mM magnesium dichloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
8JOG solution structure of Ras Binding Domein (RBD) in C-RAF with negative allosteric modulator. 提交 2023-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 51–131（81 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）85；压力 ambient
NMR样品组成 0.3 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Serin/threonine protein kinase C-RAF, 25 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 10 mM magnesium dichloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
8S42 Ternary structure of 14-3-3s, C-RAF phosphopeptide (pS259) and compound 80 (1124898) 提交 2024-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–263（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 A1H5F 2-chloranyl-1-[8-[3-fluoranyl-4-(trifluoromethyl)phenyl]sulfonyl-5-oxa-2,8-diazaspiro[3.5]nonan-2-yl]ethanone × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 1.70 Å R-free 0.194
8T74 Crystal structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD) 提交 2023-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 52–131（80 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M DL-malic acid (pH 7.0), 20% PEG 3350
分辨率 1.65 Å R-free 0.196
8T75 Crystal Structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD-CRD) 提交 2023-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 52–188（137 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M sodium formate
分辨率 2.65 Å R-free 0.219
8T75 Crystal Structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD-CRD) 提交 2023-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 52–188（137 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M sodium formate
分辨率 2.65 Å R-free 0.219
8T75 Crystal Structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD-CRD) 提交 2023-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 52–188（137 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M sodium formate
分辨率 2.65 Å R-free 0.219
8T75 Crystal Structure of KRAS4a (GMPPNP) in complex with RAF1 (RBD-CRD) 提交 2023-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 52–188（137 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate (pH 4.6), 2 M sodium formate
分辨率 2.65 Å R-free 0.219
8U1L Cryo-EM structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex in the closed state 提交 2023-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–648（647 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 4.5 seconds before plunging
分辨率 3.70 Å
9AXA CryoEM structure of activated CRAF/MEK/14-3-3 complex with NST-628 提交 2024-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 306–648（343 aa）
链 C 306–648（343 aa）
突变：Y340D Y341D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Y340D Y341D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.36 Å
9AXC Activated CRAF/MEK heterotetramer from focused refinement of CRAF/MEK/14-3-3 complex 提交 2024-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 306–648（343 aa）
链 C 306–648（343 aa）
突变：Y340D Y341D 突变：Y340D Y341D A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
9AY7 Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with NST-628 and inactive RAF 提交 2024-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 337–615（279 aa）
突变：Y340D Y341D ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 ACT ACETATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；0.2M sodium acetate pH 8.0, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.41 Å R-free 0.236
9AYA Crystal structure of CRAF/MEK complex with NST-628 and active RAF dimer 提交 2024-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 337–615（279 aa）
链 C 337–615（279 aa）
突变：Y340D Y341D 突变：Y340D Y341D A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.2M magnesium chloride, 0.1M tris pH 7.0, 10% w/v PEG 8000
分辨率 2.59 Å R-free 0.257
9EW1 Ternary structure of 14-3-3s, CRAF phosphopeptide (pS259) and compound 79 (1124379). 提交 2024-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–263（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 WQT 2-chloranyl-1-[8-(4-iodophenyl)sulfonyl-5-oxa-2,8-diazaspiro[3.5]nonan-2-yl]ethanone × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 1.40 Å R-free 0.168
9EW3 Ternary structure of 14-3-3s, C-RAF phosphopeptide 12-mer (pS259) and compound 78 (1084378) 提交 2024-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–263（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 WQN 1-[8-(4-bromophenyl)sulfonyl-5-oxa-2,8-diazaspiro[3.5]nonan-2-yl]-2-chloranyl-ethanone × 2 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 1.40 Å R-free 0.229
9EW4 Ternary structure of 14-3-3s, C-RAF phosphopeptide 12mer (pS259) and compound 86 (1124384) 提交 2024-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–263（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 WQ9 1-[(5~{R})-2-(4-bromanyl-3-fluoranyl-phenyl)sulfonyl-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-7-yl]-2-chloranyl-ethanone × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 1.60 Å R-free 0.211
9EW5 Ternary structure of 14-3-3s, C-RAF phosphopeptide (pS259) 12mer and compound 23 (1083848) 提交 2024-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 255–265（11 aa）
链 F 255–265（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） WQI 2-chloranyl-~{N}-[[1-(4-iodophenyl)sulfonylpiperidin-4-yl]methyl]ethanamide × 2 CA CALCIUM ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 1.50 Å R-free 0.216
9EW7 Binary structure of 14-3-3s and CRAF phosphopeptide (pS259) 提交 2024-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–264（10 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 1.80 Å R-free 0.193
9MMP Cryo-EM structure of CRAF/MEK1/14-3-3 complex (autoinhibited conformation) 提交 2024-12-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–648（648 aa）
突变：Q156R, D587E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP, 2 uM ATPgS, 1 uM GDC0623
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9MMQ Cryo-EM structure of CRAF/MEK1 complex (kinase domain) 提交 2024-12-20 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–648（648 aa）
突变：Q156R, D587E AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP, 2 uM ATPgS, 1 uM GDC0623
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9MMR Cryo-EM structure of CRAF/MEK1/14-3-3 complex (open monomer conformation, CRAF Y340D/Y341D mutant) 提交 2024-12-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–648（648 aa）
突变：Q156R, Y340D, Y341D, D587E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP, 2 uM ATPgS, 1 uM GDC0623
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9O0U Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720 and CH5126766 提交 2025-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 337–615（279 aa）
突变：Y340D, Y341D 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 2.91 Å R-free 0.264
9O0U Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720 and CH5126766 提交 2025-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 337–615（279 aa）
突变：Y340D, Y341D 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 2.91 Å R-free 0.264
9O0U Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720 and CH5126766 提交 2025-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 337–615（279 aa）
突变：Y340D, Y341D 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 2.91 Å R-free 0.264
9O0U Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720 and CH5126766 提交 2025-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 337–615（279 aa）
突变：Y340D, Y341D 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 2.91 Å R-free 0.264
9O0V Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720, CH5126766, and AMPPNP 提交 2025-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 337–615（279 aa）
突变：Y340D, Y341D 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 3.50 Å R-free 0.254
9O0V Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720, CH5126766, and AMPPNP 提交 2025-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 337–615（279 aa）
突变：Y340D, Y341D 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 3.50 Å R-free 0.254
9O0V Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720, CH5126766, and AMPPNP 提交 2025-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 337–615（279 aa）
突变：Y340D, Y341D 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 3.50 Å R-free 0.254
9O0V Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720, CH5126766, and AMPPNP 提交 2025-04-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 337–615（279 aa）
突变：Y340D, Y341D 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 3.50 Å R-free 0.254
9S2I Ternary structure of 14-3-3, CRAF R256S NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 78 (1124378) 提交 2025-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–265（11 aa）
突变：R256S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 WQN 1-[8-(4-bromophenyl)sulfonyl-5-oxa-2,8-diazaspiro[3.5]nonan-2-yl]-2-chloranyl-ethanone × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 1.67 Å R-free 0.201
9S2J Ternary structure of 14-3-3s, CRAF S257L NS mutant phosphopeptide (pS259) and compound 78 (1084378) 提交 2025-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–265（11 aa）
突变：S257L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 WQN 1-[8-(4-bromophenyl)sulfonyl-5-oxa-2,8-diazaspiro[3.5]nonan-2-yl]-2-chloranyl-ethanone × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 1.50 Å R-free 0.203
9S2K Ternary structure of 14-3-3s, CRAF V263A NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 78 (1124378) 提交 2025-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–265（11 aa）
突变：V263A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 WQN 1-[8-(4-bromophenyl)sulfonyl-5-oxa-2,8-diazaspiro[3.5]nonan-2-yl]-2-chloranyl-ethanone × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 2.15 Å R-free 0.233
9S2L Ternary structure of 14-3-3s, CRAF R256S NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 23 (1083848) 提交 2025-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 255–265（11 aa）
链 S 255–265（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） WQI 2-chloranyl-~{N}-[[1-(4-iodophenyl)sulfonylpiperidin-4-yl]methyl]ethanamide × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 1.85 Å R-free 0.223
9S2M Ternary structure of 14-3-3s, CRAF S257L NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 23 (1083848) 提交 2025-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 255–265（11 aa）
链 S 255–265（11 aa）
突变：S257L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：S257L 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） WQI 2-chloranyl-~{N}-[[1-(4-iodophenyl)sulfonylpiperidin-4-yl]methyl]ethanamide × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 2.00 Å R-free 0.227
9S2N Ternary structure of 14-3-3s, CRAF V263A NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 23 (1083848) 提交 2025-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 255–264（10 aa）
链 S 255–264（10 aa）
突变：V263A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V263A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） WQI 2-chloranyl-~{N}-[[1-(4-iodophenyl)sulfonylpiperidin-4-yl]methyl]ethanamide × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 1.85 Å R-free 0.239
9S2O Ternary structure of 14-3-3s, CRAF R256S NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 22 (1083853) 提交 2025-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 255–265（11 aa）
链 S 255–265（11 aa）
突变：R256S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：R256S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） WPN ~{N}-[[1-(4-bromophenyl)sulfonylpiperidin-4-yl]methyl]-2-chloranyl-ethanamide × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 1.80 Å R-free 0.213
9S2P Ternary structure of 14-3-3s, CRAF V263A NS mutant phosphopeptide (pS259), and compound 22 (1083853) 提交 2025-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 P 255–265（11 aa）
突变：V263A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 WPN ~{N}-[[1-(4-bromophenyl)sulfonylpiperidin-4-yl]methyl]-2-chloranyl-ethanamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES pH=7.1-7.7 0.19 M CaCl2 5% glycerol 24-29% PEG400
分辨率 1.50 Å R-free 0.197
9YGS Crystal structure of GMPPNP bound KRAS-Y71H in complex with RBD domain of CRAF(RAF1) 提交 2025-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 52–131（80 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Potassium thiocyanate, 30% PEG monomethyl ether 2000.
分辨率 1.68 Å R-free 0.233

共 74 个其他 PDB 条目、83 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RAF1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 23–670； UniProt 1–648

Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1

Homo sapiens

UniProt Q02750

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–393 突变：S218A, S222A RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase × 1 （P04049） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5；50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP, 2 uM ATPgS, 1 uM GDC0623 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9MMS Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1S9J X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a complex with ligand and MgATP 提交 2004-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 61–392（332 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 BBM 5-BROMO-N-(2,3-DIHYDROXYPROPOXY)-3,4-DIFLUORO-2-[(2-FLUORO-4-IODOPHENYL)AMINO]BENZAMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；288 K；PEG8K, Ammonium phosphate, Imidazole-malate, DTT, pH 5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.40 Å R-free 0.269
2P55 X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a complex with ligand and MgATP 提交 2007-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 62–393（332 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 MRA 2-[(4-ETHYNYL-2-FLUOROPHENYL)AMINO]-3,4-DIFLUORO-N-(2-HYDROXYETHOXY)BENZAMIDE × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.301
3DV3 MEK1 with PF-04622664 Bound 提交 2008-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 62–382（321 aa） 片段：UNP residues 62-382
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MEK 3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)-5-[(2-hydroxyethoxy)methyl]benzamide × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.221
3DV3 MEK1 with PF-04622664 Bound 提交 2008-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–382（321 aa） 片段：UNP residues 62-382
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MEK 3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)-5-[(2-hydroxyethoxy)methyl]benzamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.30 Å R-free 0.221
3DY7 X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a complex with ligand and MgATP 提交 2008-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–393（332 aa） 片段：Protein Kinase Domain, UNP residues 62-393
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 1CX (5S)-4,5-difluoro-6-[(2-fluoro-4-iodophenyl)imino]-N-(2-hydroxyethoxy)cyclohexa-1,3-diene-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；288 K；PEG8K, Ammonium phosphate, Imidazole-malate, DTT, pH 5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
分辨率 2.70 Å R-free 0.269
3E8N X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) complexed with a potent inhibitor RDEA119 and MgATP 提交 2008-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–393（332 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 VRA N-{3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-6-methoxyphenyl}-1-[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]cyclopropanesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；20 mM HEPES, 150 mM NH4H2PO4, 0.5 mM EDTA, 2 mM TCEP, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.252
3E8N X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) complexed with a potent inhibitor RDEA119 and MgATP 提交 2008-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 62–393（332 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 VRA N-{3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-6-methoxyphenyl}-1-[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]cyclopropanesulfonamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；20 mM HEPES, 150 mM NH4H2PO4, 0.5 mM EDTA, 2 mM TCEP, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.252
3EQB X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a complex with ligand and MgATP 提交 2008-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 62–393（332 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 LUG N-(5-{3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]phenyl}-1,3,4-oxadiazol-2-yl)ethane-1,2-diamine × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.62 Å R-free 0.264
3EQC X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a ternary complex with compound 1, ATP-GS AND MG2P 提交 2008-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 35–393（359 aa） 片段：Protein kinase domain, UNP residues 35-393
突变：S265N, S266K, Y267F 3BM 2-[(2-chloro-4-iodophenyl)amino]-N-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}-3,4-difluorobenzamide × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；281 K；0.1M TRIS-CL, pH 8.0; 18% PEG 4000; 0.2M CALCIUM CHLORIDE; 3% DMSO, VAPOR DIFFUSION HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 1.80 Å R-free 0.235
3EQC X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a ternary complex with compound 1, ATP-GS AND MG2P 提交 2008-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 35–393（359 aa） 片段：Protein kinase domain, UNP residues 35-393
突变：S265N, S266K, Y267F 3BM 2-[(2-chloro-4-iodophenyl)amino]-N-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}-3,4-difluorobenzamide × 2 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；281 K；0.1M TRIS-CL, pH 8.0; 18% PEG 4000; 0.2M CALCIUM CHLORIDE; 3% DMSO, VAPOR DIFFUSION HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 1.80 Å R-free 0.235
3EQD X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a binary complex with ATP-GS and MG2P 提交 2008-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 35–393（359 aa） 片段：Protein kinase domain, UNP residues 35-393
突变：S265N, S266K, Y267F AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；281 K；0.1M TRIS-CL, pH 8.0; 18% PEG 4000; 0.2M CALCIUM CHLORIDE; 3% DMSO, VAPOR DIFFUSION HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 2.10 Å
3EQD X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a binary complex with ATP-GS and MG2P 提交 2008-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 35–393（359 aa） 片段：Protein kinase domain, UNP residues 35-393
突变：S265N, S266K, Y267F AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；281 K；0.1M TRIS-CL, pH 8.0; 18% PEG 4000; 0.2M CALCIUM CHLORIDE; 3% DMSO, VAPOR DIFFUSION HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 2.10 Å
3EQF X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a binary complex with K252A and MG2P 提交 2008-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 35–393（359 aa） 片段：Protein kinase domain, UNP residues 35-393
突变：S265N, S266K, Y267F KSA K-252A × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；281 K；0.1M TRIS-CL, pH 8.0; 18% PEG 4000; 0.2M CALCIUM CHLORIDE; 3% DMSO, VAPOR DIFFUSION HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 2.70 Å
3EQF X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a binary complex with K252A and MG2P 提交 2008-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 35–393（359 aa） 片段：Protein kinase domain, UNP residues 35-393
突变：S265N, S266K, Y267F KSA K-252A × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；281 K；0.1M TRIS-CL, pH 8.0; 18% PEG 4000; 0.2M CALCIUM CHLORIDE; 3% DMSO, VAPOR DIFFUSION HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 2.70 Å
3EQG X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a ternary complex with PD, ADP AND MG2P 提交 2008-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 35–393（359 aa） 片段：Protein kinase domain, UNP residues 35-393
突变：S265N, S266K, Y267F ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 4BM N-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}-3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；281 K；0.1M TRIS-CL, pH 8.0; 18% PEG 4000; 0.2M CALCIUM CHLORIDE; 3% DMSO, VAPOR DIFFUSION HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
3EQG X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a ternary complex with PD, ADP AND MG2P 提交 2008-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 35–393（359 aa） 片段：Protein kinase domain, UNP residues 35-393
突变：S265N, S266K, Y267F ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 4BM N-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}-3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]benzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；281 K；0.1M TRIS-CL, pH 8.0; 18% PEG 4000; 0.2M CALCIUM CHLORIDE; 3% DMSO, VAPOR DIFFUSION HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 2.50 Å R-free 0.273
3EQH X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a ternary complex with U0126, ADP and MG2P 提交 2008-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 35–393（359 aa） 片段：Protein kinase domain, UNP residues 35-393
突变：S265N, S266K, Y267F 5BM (2Z)-bis{amino[(2-aminophenyl)sulfanyl]methylidene}butanedinitrile × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；281 K；0.1M TRIS-CL, pH 8.0; 18% PEG 4000; 0.2M CALCIUM CHLORIDE; 3% DMSO, VAPOR DIFFUSION HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 2.00 Å
3EQH X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a ternary complex with U0126, ADP and MG2P 提交 2008-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 35–393（359 aa） 片段：Protein kinase domain, UNP residues 35-393
突变：S265N, S266K, Y267F 5BM (2Z)-bis{amino[(2-aminophenyl)sulfanyl]methylidene}butanedinitrile × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；281 K；0.1M TRIS-CL, pH 8.0; 18% PEG 4000; 0.2M CALCIUM CHLORIDE; 3% DMSO, VAPOR DIFFUSION HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 2.00 Å
3EQI X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a binary complex with ADP and MG2P 提交 2008-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 35–393（359 aa） 片段：Protein kinase domain, UNP residues 35-393
突变：S265N, S266K, Y267F ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；281 K；0.1M TRIS-CL, pH 8.0; 18% PEG 4000; 0.2M CALCIUM CHLORIDE; 3% DMSO, VAPOR DIFFUSION HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 1.90 Å
3EQI X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in a binary complex with ADP and MG2P 提交 2008-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 35–393（359 aa） 片段：Protein kinase domain, UNP residues 35-393
突变：S265N, S266K, Y267F ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；281 K；0.1M TRIS-CL, pH 8.0; 18% PEG 4000; 0.2M CALCIUM CHLORIDE; 3% DMSO, VAPOR DIFFUSION HANGING DROP, temperature 281K
分辨率 1.90 Å
3MBL Crystal Structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK 1) in complex with ligand and MgADP 提交 2010-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 62–382（321 aa） 片段：Kinase Domain
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 LSG 5-acetyl-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)-1-methyl-1H-pyrrole-3-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.215
3MBL Crystal Structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK 1) in complex with ligand and MgADP 提交 2010-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–382（321 aa） 片段：Kinase Domain
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 LSG 5-acetyl-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)-1-methyl-1H-pyrrole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.215
3ORN Mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in complex with CH4987655 and MgAMP-PNP 提交 2010-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–270（209 aa） 片段：UNP RESIDUES 62-270, 303-393
链 A 303–393（91 aa） 片段：UNP RESIDUES 62-270, 303-393
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 3OR 3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)-5-[(3-oxo-1,2-oxazinan-2-yl)methyl]benzamide × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；2M Ammonium sulfate, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.277
3ORN Mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in complex with CH4987655 and MgAMP-PNP 提交 2010-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 62–270（209 aa） 片段：UNP RESIDUES 62-270, 303-393
链 A 303–393（91 aa） 片段：UNP RESIDUES 62-270, 303-393
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 3OR 3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)-5-[(3-oxo-1,2-oxazinan-2-yl)methyl]benzamide × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 SO4 SULFATE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；2M Ammonium sulfate, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.80 Å R-free 0.277
3OS3 Mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in complex with CH4858061 and MgATP 提交 2010-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–270（209 aa） 片段：UNP RESIDUES 62-270, 303-393
链 A 303–393（91 aa） 片段：UNP RESIDUES 62-270, 303-393
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 3OS 2-[(4-ethynyl-2-fluorophenyl)amino]-3,4-difluoro-N-(2-hydroxyethoxy)-5-{[(2-hydroxyethoxy)imino]methyl}benzamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；7.5-10% PEG 8000, 0.2M NaCl, 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M citrate buffer, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.356
3OS3 Mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in complex with CH4858061 and MgATP 提交 2010-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 62–270（209 aa） 片段：UNP RESIDUES 62-270, 303-393
链 A 303–393（91 aa） 片段：UNP RESIDUES 62-270, 303-393
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 3OS 2-[(4-ethynyl-2-fluorophenyl)amino]-3,4-difluoro-N-(2-hydroxyethoxy)-5-{[(2-hydroxyethoxy)imino]methyl}benzamide × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；7.5-10% PEG 8000, 0.2M NaCl, 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M citrate buffer, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.356
3PP1 Crystal Structure of the Human Mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK 1) in complex with ligand and MgATP 提交 2010-11-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–382（321 aa） 片段：kinase domain
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IZG 3-[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]-6-fluoro-5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-8-methylpyrido[2,3-d]pyrimidine-4,7(3H,8H)-dione × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；10% MPD, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.219
3SLS Crystal Structure of human MEK-1 kinase in complex with UCB1353770 and AMPPNP 提交 2011-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 45–383（339 aa） 片段：MEK-1 F11 fragment
突变：delta 264-307 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 77D 2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-5,5-dimethyl-8-oxo-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-5,6,7,8-tetrahydro-4H-thieno[2,3-c]azepine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；18% PEG-3350, 200mM Ammonium fluoride, 4% Glycerol, 10mM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.30 Å R-free 0.287
3SLS Crystal Structure of human MEK-1 kinase in complex with UCB1353770 and AMPPNP 提交 2011-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 45–383（339 aa） 片段：MEK-1 F11 fragment
突变：delta 264-307 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 77D 2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-5,5-dimethyl-8-oxo-N-[(3R)-piperidin-3-yl]-5,6,7,8-tetrahydro-4H-thieno[2,3-c]azepine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；18% PEG-3350, 200mM Ammonium fluoride, 4% Glycerol, 10mM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.30 Å R-free 0.287
3V01 Discovery of Novel Allosteric MEK Inhibitors Possessing Classical and Non-classical Bidentate Ser212 Interactions. 提交 2011-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–393（332 aa） 片段：UNP residues 62-393
未记录 3V0 N-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}-3-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]furo[3,2-c]pyridine-2-carboxamide × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；286 K；16-20% w/v PEG8K, 0.1M HEPES, 250mM NH4H2PO4, 1mM TCEP, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 286K
分辨率 2.71 Å R-free 0.240
3V04 Discovery of Novel Allosteric MEK Inhibitors Possessing Classical and Non-classical Bidentate Ser212 Interactions. 提交 2011-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–393（332 aa） 片段：UNP residues 62-393
未记录 V04 4-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)-1H-indazole-5-carboxamide × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；286 K；16-20 %w/v PEG8K, 0.1M HEPES, 250mM NH4H2PO4, 1mM TCEP, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 286K
分辨率 2.70 Å R-free 0.243
3VVH X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in complex with an inhibitor and MgATP 提交 2012-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–393（332 aa） 片段：UNP RESIDUES 62-393
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 4BM N-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}-3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；279 K；PEG 4000, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
分辨率 2.00 Å R-free 0.225
3VVH X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in complex with an inhibitor and MgATP 提交 2012-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 62–393（332 aa） 片段：UNP RESIDUES 62-393
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 4BM N-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}-3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；279 K；PEG 4000, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
分辨率 2.00 Å R-free 0.225
3VVH X-ray structure of the human mitogen-activated protein kinase kinase 1 (MEK1) in complex with an inhibitor and MgATP 提交 2012-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 62–393（332 aa） 片段：UNP RESIDUES 62-393
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 4BM N-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}-3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；279 K；PEG 4000, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
分辨率 2.00 Å R-free 0.225
3W8Q Structure of the Human Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase 1 (MEK1) 提交 2013-03-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–382（344 aa） 片段：kinase domain, UNP residues 39-382
突变：T292A, S298A AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；16%(w/v) PEG 3350, 0.1M ammonium citrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.20 Å R-free 0.268
3WIG Human MEK1 kinase in complex with CH5126766 and MgAMP-PNP 提交 2013-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–270（209 aa）
链 A 303–393（91 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；277 K；7.5-10% PEG 8000, 0.2M NaCl, 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M citrate buffer, pH 4.2, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3WIG Human MEK1 kinase in complex with CH5126766 and MgAMP-PNP 提交 2013-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 62–270（209 aa）
链 A 303–393（91 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 CL CHLORIDE ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；277 K；7.5-10% PEG 8000, 0.2M NaCl, 0.2M Ammonium sulfate, 0.1M citrate buffer, pH 4.2, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.250
3ZLS Crystal structure of MEK1 in complex with fragment 6 提交 2013-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–383（347 aa） 片段：RESIDUES 37-383
突变：YES 92P 1H-PYRROLO[2,3-B]PYRIDINE-3-CARBOXYLIC ACID × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；pH 7.7
分辨率 2.50 Å R-free 0.234
3ZLW Crystal structure of MEK1 in complex with fragment 3 提交 2013-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–383（347 aa）
突变：YES MT8 (1R)-1-hydroxy-1-methyl-2,3,6,7-tetrahydro-1H,5H-pyrido[3,2,1-ij]quinolin-5-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；pH 7.7
分辨率 2.12 Å R-free 0.248
3ZLX Crystal structure of MEK1 in complex with fragment 18 提交 2013-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–383（347 aa）
突变：YES 5EZ 7-choro-6-[(3R)-pyrrolidin-3-ylmethoxy]isoquinolin-1(2H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；Appropriate single crystals were grown using this set-up in PEG 4000 18%, Tris 100mM pH7.7, DMSO 2% and CaCl2 0.2M and were extracted from the low volume drops, cryo-protected in mother liquor with 20% glycerol and flash cooled for synchrotron collection
分辨率 2.20 Å R-free 0.236
3ZLY Crystal structure of MEK1 in complex with fragment 8 提交 2013-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–383（347 aa） 片段：RESIDUES 37-383
突变：YES YSO 3-AMINO-1H-INDAZOLE-4-CARBONITRILE × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；Appropriate single crystals were grown using this set-up in PEG 4000 18%, Tris 100mM pH7.7, DMSO 2% and CaCl2 0.2M and were extracted from the low volume drops, cryo-protected in mother liquor with 20% glycerol and flash cooled for synchrotron collection
分辨率 2.11 Å R-free 0.248
3ZM4 Crystal structure of MEK1 in complex with fragment 1 提交 2013-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–383（347 aa） 片段：RESIDUES 37-383
突变：YES 22T 7-chloranyl-6-[(3S)-pyrrolidin-3-yl]oxy-2H-isoquinolin-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；Appropriate single crystals were grown using this set-up in PEG 4000 18%, Tris 100mM pH7.7, DMSO 2% and CaCl2 0.2M and were extracted from the low volume drops, cryo-protected in mother liquor with 20% glycerol and flash cooled for synchrotron collection
分辨率 2.37 Å R-free 0.241
4AN2 Crystal structures of human MEK1 with carboxamide-based allosteric inhibitor XL518 (GDC-0973), or related analogs. 提交 2012-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 61–262（202 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 61-262,305-392
链 A 305–392（88 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 61-262,305-392
突变：YES 突变：YES EUI [3,4-BIS(FLUORANYL)-2-[(2-FLUORANYL-4-IODANYL-PHENYL)AMINO]PHENYL]-[3-OXIDANYL-3-[(2S)-PIPERIDIN-2-YL]AZETIDIN-1-YL]METHANONE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.9；MEK1 (8 MG/ML) WAS INCUBATED WITH INHIBITOR (300 MICROMOLAR FINAL CONCENTRATION) AND AMPPCP (2.8 MM FINAL CONCENTRATION) FOR TWO HOURS ON ICE, FOLLOWED BY CRYSTALLIZION VS. 26.5% PEG-2000 MME, 0.1 M TRIMETHYLAMINE N- OXIDE AND 0.1 M TRIS (PH 8.9)
分辨率 2.50 Å R-free 0.299
4AN3 Crystal structures of human MEK1 with carboxamide-based allosteric inhibitor XL518 (GDC-0973), or related analogs. 提交 2012-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 61–262（202 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 61-262,305-392
链 A 305–392（88 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 61-262,305-392
突变：YES 突变：YES MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5Y0 N-[(2S)-2,3-bis(oxidanyl)propoxy]-3,4-bis(fluoranyl)-2-[(2-fluoranyl-4-iodanyl-phenyl)amino]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION VS. 26.5 % PEG-2000 MME, 0.1 M TRIMETHYLAMINE N-OXIDE, 0.1 M TRIS (PH 8.9)
分辨率 2.10 Å R-free 0.283
4AN9 Crystal structures of human MEK1 with carboxamide-based allosteric inhibitor XL518 (GDC-0973), or related analogs. 提交 2012-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 61–262（202 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 61-262,305-392
链 A 305–392（88 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 61-262,305-392
突变：YES 突变：YES ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 2P7 [3,4-BIS(FLUORANYL)-2-[(2-FLUORANYL-4-IODANYL-PHENYL)AMINO]PHENYL]-(3-OXIDANYLAZETIDIN-1-YL)METHANONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.9；SITTING DROP VAPOR-DIFFUSION VS. 26.5 % PEG-2000 MME, 0.1 M TRIMETHYLAMINE N-OXIDE, 0.1 M TRIS (PH 8.9)
分辨率 2.80 Å R-free 0.313
4ANB Crystal structures of human MEK1 with carboxamide-based allosteric inhibitor XL518 (GDC-0973), or related analogs. 提交 2012-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 61–262（202 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 61-262,305-392
链 A 305–392（88 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 61-262,305-392
突变：YES 突变：YES YQY [3-(AMINOMETHYL)-3-OXIDANYL-AZETIDIN-1-YL]-[3,4-BIS(FLUORANYL)-2-[(2-FLUORANYL-4-IODANYL-PHENYL)AMINO]PHENYL]METHANONE × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.9；SITTING DROP VAPOR DIFFUSION VS. 26.5 % PEG-2000 MME, 0.1 M TRIMETHYLAMINE N-OXIDE, 0.1 M TRIS (PH 8.9)
分辨率 2.20 Å R-free 0.296
4ARK CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN MAP KINASE KINASE 1 (MEK1) IN COMPLEX WITH A SMALL MOLECULE INHIBITOR AND ADP 提交 2012-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 62–393（332 aa） 片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 62-393
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 M3K 2-([3R-3,4-dihydroxybutyl]oxy)-4-fluoro-6-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]benzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M IMIDAZOLE-MALATE, 300 MM(NH4)H2PO4, 13% PEG 8000, PH 5.8
分辨率 2.60 Å R-free 0.211
4LMN Crystal Structure of MEK1 kinase bound to GDC0973 提交 2013-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–393（332 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 62-393)
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EUI [3,4-BIS(FLUORANYL)-2-[(2-FLUORANYL-4-IODANYL-PHENYL)AMINO]PHENYL]-[3-OXIDANYL-3-[(2S)-PIPERIDIN-2-YL]AZETIDIN-1-YL]METHANONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；12% w/v PEG 8000, 0.4M NH4H2PO4, 0.1M HEPES, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.233
4LMN Crystal Structure of MEK1 kinase bound to GDC0973 提交 2013-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 62–393（332 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 62-393)
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 EUI [3,4-BIS(FLUORANYL)-2-[(2-FLUORANYL-4-IODANYL-PHENYL)AMINO]PHENYL]-[3-OXIDANYL-3-[(2S)-PIPERIDIN-2-YL]AZETIDIN-1-YL]METHANONE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；12% w/v PEG 8000, 0.4M NH4H2PO4, 0.1M HEPES, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.80 Å R-free 0.233
4MNE Crystal structure of the BRAF:MEK1 complex 提交 2013-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 62–393（332 aa） 片段：UNP residues 62-393
链 D 62–393（332 aa） 片段：UNP residues 62-393
未记录 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 573 7-fluoro-3-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-{[(2S)-2-hydroxypropyl]oxy}furo[3,2-c]pyridine-2-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；20% PEG8000, 0.1 M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.85 Å R-free 0.240
4MNE Crystal structure of the BRAF:MEK1 complex 提交 2013-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 62–393（332 aa） 片段：UNP residues 62-393
链 H 62–393（332 aa） 片段：UNP residues 62-393
未记录 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 573 7-fluoro-3-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-{[(2S)-2-hydroxypropyl]oxy}furo[3,2-c]pyridine-2-carboxamide × 3 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；20% PEG8000, 0.1 M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.85 Å R-free 0.240
4U7Z Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase (MEK1) bound to G805 提交 2014-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–393（332 aa） 片段：kinase domain (UNP residues 62-393)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 3EW 5-[(4-bromo-2-chlorophenyl)amino]-4-fluoro-N-(2-hydroxyethoxy)-1-methyl-1H-benzimidazole-6-carboxamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；The protein was concentrated to 15mg/ml and incubated with 10 fold molar excess inhibitor plus 1mM MgAMP-PNP before crystallization. MEK1 crystals grew from hanging drop vapor diffusion using 12% w/v PEG 8000, 0.4M NH4H2PO4 and 0.1M HEPES pH 6.9 at 18 degC.
分辨率 2.81 Å R-free 0.214
4U80 MEK 1 kinase bound to G799 提交 2014-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–393（332 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 62-393)
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 3EX 3-[(4-cyclopropyl-2-fluorophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)furo[3,2-c]pyridine-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；The protein was concentrated to 15mg/m1 and incubated with 10 fold molar excess inhibitor plus 1mM MgAMP-PNP before crystallization. MEK1 crystals grew from hanging drop vapor diffusion using 12% w/v PEG 8000, 0.4M NH4H2PO4 and 0.1M HEPES pH 6.9 at 18 degC .
分辨率 2.80 Å R-free 0.224
4U81 MEK1 Kinase bound to small molecule inhibitor G659 提交 2014-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 62–393（332 aa） 片段：Kinase domain (UNP residues 62-393)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 3EY 8-[(4-cyclopropyl-2-fluorophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-7-carboxamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；The protein was concentrated to 15mg/ml and incubated with 10 fold molar excess inhibitor plus 1mM MgAMP-PNP before crystallization. MEK1 crystals grew from hanging drop vapor diffusion using 12% w/v PEG 8000, 0.4M NH4H2PO4 and 0.1M HEPES pH 6.9 at 18 degC.
分辨率 2.70 Å R-free 0.218
5BX0 An Automated Microscale Thermophoresis Screening Approach for Fragment-Based Lead Discovery 提交 2015-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–383（347 aa） 片段：residues 37-383
未记录 4W5 ethyl 2H-indazole-5-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.65；277 K；PEG4000 20% CaCl2 200mM Glycerol 25% ph7.7
分辨率 2.93 Å R-free 0.252
5EYM MEK1 IN COMPLEX WITH BI 847325 提交 2015-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 35–393（359 aa） 片段：UNP residues 35-393
突变：S298N, S299K, Y300F 5U5 3-[(3~{Z})-3-[[[4-[(dimethylamino)methyl]phenyl]amino]-phenyl-methylidene]-2-oxidanylidene-1~{H}-indol-6-yl]-~{N}-ethyl-prop-2-ynamide × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；18 % PEG 4000, 100 mM Tris, 300 mM NaCl
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
5EYM MEK1 IN COMPLEX WITH BI 847325 提交 2015-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 35–393（359 aa） 片段：UNP residues 35-393
突变：S298N, S299K, Y300F 5U5 3-[(3~{Z})-3-[[[4-[(dimethylamino)methyl]phenyl]amino]-phenyl-methylidene]-2-oxidanylidene-1~{H}-indol-6-yl]-~{N}-ethyl-prop-2-ynamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；18 % PEG 4000, 100 mM Tris, 300 mM NaCl
分辨率 2.70 Å R-free 0.308
5HZE Mek1 adopts DFG-out conformation when bound to an analog of E6201. 提交 2016-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–383（347 aa）
突变：S298N, S299K, Y300F E62 (3S,4R,8S,9S,11E)-8,9,16-trihydroxy-3,4-dimethyl-14-(methylamino)-3,4,5,6,9,10-hexahydro-1H-2-benzoxacyclotetradecine-1,7(8H)-dione × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M Tris pH 8.0, 180 mM CaCl2, 14-18% PEG 4000. Co-crystallized with 1mM ATPgammaS (30 mM stock formulated in H2O). Crystals backsoaked for 2 weeks in 1 mM compound 3.3% DMSO final.
分辨率 2.40 Å R-free 0.287
5YT3 Structure of the Human Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase 1 S218D and S222D mutant 提交 2017-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 39–382（344 aa）
链 B 39–382（344 aa）
突变：S218D,S222D,T292A,S298A 突变：S218D,S222D,T292A,S298A ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M HEPES, 12%(w/v) PEG3350, 0.1M ammonium citrate,
分辨率 2.90 Å R-free 0.289
5YT3 Structure of the Human Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase 1 S218D and S222D mutant 提交 2017-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 39–382（344 aa）
链 D 39–382（344 aa）
突变：S218D,S222D,T292A,S298A 突变：S218D,S222D,T292A,S298A ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M HEPES, 12%(w/v) PEG3350, 0.1M ammonium citrate,
分辨率 2.90 Å R-free 0.289
6NYB Structure of a MAPK pathway complex 提交 2019-02-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6PP9 Crystal structure of BRAF:MEK1 complex 提交 2019-07-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；100 mM Bis-Tris pH 6.4, 200 mM Ammonium Sulfate, and 22% PEG3350
分辨率 2.59 Å R-free 0.245
6Q0J Structure of a MAPK pathway complex 提交 2019-08-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–393（393 aa）
链 D 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A 突变：S218A, S222A MG MAGNESIUM ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 2 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
6Q0T Structure of a MAPK pathway complex 提交 2019-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–392（392 aa）
突变：S218A, S222A MG MAGNESIUM ION × 1 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
6U2G BRAF-MEK complex with AMP-PCP bound to BRAF 提交 2019-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–393（392 aa）
未记录 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Ammonium sulfate, MES, PEK 8000
分辨率 2.89 Å R-free 0.276
6V2W Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP 提交 2019-11-25 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Bis-Tris pH 8.5, 200 mM Lithium Sulfate, and 22% PEG3350
分辨率 3.12 Å R-free 0.237
6X2P Crystal Structure of the Mek1NES peptide bound to CRM1 提交 2020-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 28–44（17 aa） 片段：residues 28-44
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；17% (weight/vol) PEG3350, 100 mM Bis-Tris (pH 6.4), 200 mM ammonium nitrate, and 10 mM Spermine HCl
分辨率 2.40 Å R-free 0.252
6X2S Crystal Structure of Mek1(NQ)NES peptide bound to CRM 提交 2020-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 29–44（16 aa） 片段：residues 29-44
突变：D43N, E44Q GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；17% (weight/vol) PEG3350, 100 mM Bis-Tris (pH 6.4), 200 mM ammonium nitrate, and 10 mM Spermine HCl
分辨率 2.50 Å R-free 0.246
6X2X Crystal Structure of Mek1NES peptide bound to CRM1(E571K) 提交 2020-05-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 29–44（16 aa） 片段：residues 29-44
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；17% (weight/vol) PEG3350, 100 mM Bis-Tris (pH 6.4), 200 mM ammonium nitrate, and 10 mM Spermine HCl
分辨率 2.46 Å R-free 0.250
7B3M MEK1 in complex with compound 6 提交 2020-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–263（227 aa）
链 A 308–383（76 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SU5 1~{H}-indol-2-yl(pyridin-3-yl)methanone × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；MEK1 was prepared in buffer containing 25 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol and 1 mM TCEP at a concentration of 10 mg/ml mixed with 2 mM MgCl2 and 2 mM AMP-PNP, and incubated at room temperature for 30 minutes. Crystals were obtained from hanging drops by mixing a 1:1 ratio of protein solution with well solution containing 2 M AmSO4, 0.1 M NaCl and 0.1 M Bis-tris pH 6.1-6.2 at room temperature.
分辨率 2.30 Å R-free 0.268
7B3M MEK1 in complex with compound 6 提交 2020-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 37–263（227 aa）
链 B 308–383（76 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SU5 1~{H}-indol-2-yl(pyridin-3-yl)methanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；MEK1 was prepared in buffer containing 25 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 5% glycerol and 1 mM TCEP at a concentration of 10 mg/ml mixed with 2 mM MgCl2 and 2 mM AMP-PNP, and incubated at room temperature for 30 minutes. Crystals were obtained from hanging drops by mixing a 1:1 ratio of protein solution with well solution containing 2 M AmSO4, 0.1 M NaCl and 0.1 M Bis-tris pH 6.1-6.2 at room temperature.
分辨率 2.30 Å R-free 0.268
7B7R MEK1 in complex with compound 4 提交 2020-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–263（227 aa）
链 A 308–383（76 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 T1K 2-[5-[ethyl(methyl)amino]imidazo[1,2-a]pyrimidin-7-yl]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystals were obtained from hanging drops by mixing a 1:1 ratio of protein solution with well solution containing 2 M AmSO4, 0.1 M NaCl and 0.1 M Bis-tris pH 6.1-6.2
分辨率 1.70 Å R-free 0.218
7B7R MEK1 in complex with compound 4 提交 2020-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 37–263（227 aa）
链 B 308–383（76 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 T1K 2-[5-[ethyl(methyl)amino]imidazo[1,2-a]pyrimidin-7-yl]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystals were obtained from hanging drops by mixing a 1:1 ratio of protein solution with well solution containing 2 M AmSO4, 0.1 M NaCl and 0.1 M Bis-tris pH 6.1-6.2
分辨率 1.70 Å R-free 0.218
7B94 MEK1 in complex with compound 6 提交 2020-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–263（227 aa）
链 A 308–383（76 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 T3W 2-(4-iodophenyl)-8~{H}-imidazo[1,2-c]pyrimidin-5-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystals were obtained from hanging drops by mixing a 1:1 ratio of protein solution with well solution containing 2 M AmSO4, 0.1 M NaCl and 0.1 M Bis-tris pH 6.1-6.2
分辨率 2.00 Å R-free 0.265
7B94 MEK1 in complex with compound 6 提交 2020-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 37–263（227 aa）
链 B 308–383（76 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 T3W 2-(4-iodophenyl)-8~{H}-imidazo[1,2-c]pyrimidin-5-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystals were obtained from hanging drops by mixing a 1:1 ratio of protein solution with well solution containing 2 M AmSO4, 0.1 M NaCl and 0.1 M Bis-tris pH 6.1-6.2
分辨率 2.00 Å R-free 0.265
7B9L MEK1 in complex with compound 23 提交 2020-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–263（227 aa）
链 A 308–383（76 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 T4N ~{N}-(4-methoxyphenyl)-2-[(2~{S})-3-oxidanylidenethiomorpholin-2-yl]ethanamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystals were obtained from hanging drops by mixing a 1:1 ratio of protein solution with well solution containing 2 M AmSO4, 0.1 M NaCl and 0.1 M Bis-tris pH 6.1-6.2
分辨率 1.70 Å R-free 0.214
7B9L MEK1 in complex with compound 23 提交 2020-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 37–263（227 aa）
链 B 308–383（76 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 T4N ~{N}-(4-methoxyphenyl)-2-[(2~{S})-3-oxidanylidenethiomorpholin-2-yl]ethanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystals were obtained from hanging drops by mixing a 1:1 ratio of protein solution with well solution containing 2 M AmSO4, 0.1 M NaCl and 0.1 M Bis-tris pH 6.1-6.2
分辨率 1.70 Å R-free 0.214
7M0T Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and Selumetinib 提交 2021-03-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A 3EW 5-[(4-bromo-2-chlorophenyl)amino]-4-fluoro-N-(2-hydroxyethoxy)-1-methyl-1H-benzimidazole-6-carboxamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris 8.5, 200 mM Lithium Sulfate and 22% PEG 3350
分辨率 3.19 Å R-free 0.254
7M0U Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and Binimetinib 提交 2021-03-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 QO7 5-[(4-bromo-2-fluorophenyl)amino]-4-fluoro-N-(2-hydroxyethoxy)-1-methyl-1H-benzimidazole-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Bis-Tris pH 8.5, 200 mM Lithium Sulfate, and 22% PEG3350
分辨率 3.09 Å R-free 0.230
7M0V Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and Cobimetinib 提交 2021-03-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 EUI [3,4-BIS(FLUORANYL)-2-[(2-FLUORANYL-4-IODANYL-PHENYL)AMINO]PHENYL]-[3-OXIDANYL-3-[(2S)-PIPERIDIN-2-YL]AZETIDIN-1-YL]METHANONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris 8.5, 200 mM Lithium Sulfate and 22% PEG 3,350
分辨率 3.16 Å R-free 0.234
7M0W Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and Pimasertib 提交 2021-03-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 QOA N-[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]-3-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]pyridine-4-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Tris 8.5, 200 mM Lithium Sulfate and 22% PEG 3,350
分辨率 3.09 Å R-free 0.233
7M0X Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and PD0325901 提交 2021-03-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 4BM N-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}-3,4-difluoro-2-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]benzamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；100 mM Bis-Tris pH 6.4, 200 mM Ammonium Sulfate, and 22% PEG3350
分辨率 2.47 Å R-free 0.215
7M0Y Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and Trametinib 提交 2021-03-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 QOM Trametinib × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris 8.5, 200 mM Lithium Sulfate and 22% PEG 3,350
分辨率 3.45 Å R-free 0.218
7M0Z Crystal structure of the BRAF:MEK1 kinases in complex with AMPPNP and CH5126766 提交 2021-03-11 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris 8.5, 200 mM Lithium Sulfate and 22% PEG 3,350
分辨率 3.12 Å R-free 0.225
7MFD Autoinhibited BRAF:(14-3-3)2:MEK complex with the BRAF RBD resolved 提交 2021-04-09 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
7PQV MEK1 IN COMPLEX WITH COMPOUND 7 提交 2021-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 39–382（344 aa） 片段：KINASE DOMAIN
未记录 80C 8-(2-chloranyl-4-methoxy-phenyl)-7-fluoranyl-1-piperidin-4-yl-imidazo[4,5-c]quinoline × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；310 K；The purified protein was used in crystallisation trials employing both, a standard screen with approximately 1200 different conditions, as well as crystallisation conditions identified using literature data. Condi- tions initially obtained have been optimised using standard strategies, systematically varying parameters critically influencing crystallisation, such as temperature, protein concentration, drop ratio, and others. These conditions were also refined by systematically varying pH or precipitant concentrations.
分辨率 2.13 Å R-free 0.287
7UMB NanoBRET tracer Tram-bo bound to a KSR2-MEK1 complex 提交 2022-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 35–393（359 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 U9F {3-[(1M,2M)-2-{[(1S,2P)-1H,1'H-[2,2'-bipyrrol]-5-yl-kappaN~1~]methylidene}-2H-pyrrol-5-yl-kappaN]-N-(2-{2-[3-({(3M)-3-[(4aM)-3-cyclopropyl-5-(2-fluoro-4-iodoanilino)-6,8-dimethyl-2,4,7-trioxo-3,4,6,7-tetrahydropyrido[4,3-d]pyrimidin-1(2H)-yl]phenyl}amino)-3-oxopropoxy]ethoxy}ethyl)propanamidato}(difluorido)boron × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 2000, MES, pH 6.5, Magnesium acetate
分辨率 3.23 Å R-free 0.268
7XLP MEK1 bound to DS03090629 提交 2022-04-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–383（347 aa）
突变：S298N, S299K, Y300K FZC (1~{R},3~{S})-3-[[6-[2-chloranyl-4-(4-methylpyrimidin-2-yl)oxy-phenyl]-3-methyl-1~{H}-indazol-4-yl]oxy]cyclohexan-1-amine × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；100 mM Tris (pH 7.75), 200 mM calcium chloride, 2% DMSO, 18-20% PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.246
7XNC MEK1 bound to DS94070624 提交 2022-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 37–383（347 aa）
突变：S298N, S299K, Y300K GIK ~{N}-[4-[[6-(3-chloranylpyridin-4-yl)-3-methyl-1~{H}-indazol-4-yl]oxy]cyclohexyl]ethanamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.75；277 K；100 mM Tris (pH 7.75), 200 mM calcium chloride, 2% DMSO, 18-20% PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.251
8CHF cryo-EM Structure of Craf:14-3-3:Mek1 提交 2023-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–393（393 aa）
链 F 1–393（393 aa）
未记录 29L 2-{4-[(1E)-1-(hydroxyimino)-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]-3-(pyridin-4-yl)-1H-pyrazol-1-yl}ethanol × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.25 Å
8DGS Cryo-EM structure of a RAS/RAF complex (state 1) 提交 2022-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8DGT Cryo-EM structure of a RAS/RAF complex (state 2) 提交 2022-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8YP4 Structure of MAP2K1 complexed with 5Z7-oxozeaenol 提交 2024-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 34–386（353 aa）
突变：T286A, T292A, S298A WNT (4~{S},9~{S},10~{S},12~{E})-16-methoxy-4-methyl-9,10,18-tris(oxidanyl)-3-oxabicyclo[12.4.0]octadeca-1(18),12,14,16-tetraene-2,8-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8% Tacsimete pH 5.0, 19.5% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.284
8YP4 Structure of MAP2K1 complexed with 5Z7-oxozeaenol 提交 2024-03-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 34–386（353 aa）
突变：T286A, T292A, S298A WNT (4~{S},9~{S},10~{S},12~{E})-16-methoxy-4-methyl-9,10,18-tris(oxidanyl)-3-oxabicyclo[12.4.0]octadeca-1(18),12,14,16-tetraene-2,8-dione × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；8% Tacsimete pH 5.0, 19.5% PEG 3350
分辨率 2.35 Å R-free 0.284
9AXA CryoEM structure of activated CRAF/MEK/14-3-3 complex with NST-628 提交 2024-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–393（393 aa）
链 D 1–393（393 aa）
突变：S218A S222A 突变：S218A S222A A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.36 Å
9AXC Activated CRAF/MEK heterotetramer from focused refinement of CRAF/MEK/14-3-3 complex 提交 2024-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–393（393 aa）
链 D 1–393（393 aa）
突变：S218A S222A 突变：S218A S222A A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
9AXH Crystal structure of KSR1/MEK1 complex heterotetramer with NST-628 提交 2024-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 37–263（227 aa）
链 A 308–383（76 aa）
链 B 37–263（227 aa）
链 B 308–383（76 aa）
未记录 A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1M SPG buffer pH 7.0, 25% w/v PEG 1500
分辨率 2.81 Å R-free 0.253
9AXM Crystal structure of ARAF/MEK1 complex with NST-628 and a RAF dimer 提交 2024-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 37–263（227 aa）
链 A 308–383（76 aa）
链 C 37–263（227 aa）
链 C 308–383（76 aa）
突变：S218A S222A 突变：S218A S222A 突变：S218A S222A 突变：S218A S222A A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；291 K；0.1M tri-sodium citrate pH 5.6, 20% 2-propanol, 20% PEG 4000
分辨率 2.42 Å R-free 0.301
9AXX Crystal structure of BRAF/MEK1 complex with NST-628 and an active RAF dimer 提交 2024-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 37–263（227 aa）
链 A 308–383（76 aa）
链 C 37–263（227 aa）
链 C 308–383（76 aa）
突变：S218A S222A 突变：S218A S222A 突变：S218A S222A 突变：S218A S222A A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.24 M di-ammonium hydrogen phosphate pH 8.0, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.07 Å R-free 0.248
9AXY Crystal structure of BRAF/MEK complex with NST-628 and inactive RAF 提交 2024-03-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.2 M Lithium chloride, 0.1 M TRIS pH 8, 20% w/v PEG 8000
分辨率 3.60 Å R-free 0.237
9AY7 Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with NST-628 and inactive RAF 提交 2024-03-07 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A S222A ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 ACT ACETATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；0.2M sodium acetate pH 8.0, 20% w/v PEG 3350
分辨率 2.41 Å R-free 0.236
9AYA Crystal structure of CRAF/MEK complex with NST-628 and active RAF dimer 提交 2024-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 37–263（227 aa）
链 B 308–383（76 aa）
链 D 37–263（227 aa）
链 D 308–383（76 aa）
突变：S218A S222A 突变：S218A S222A 突变：S218A S222A 突变：S218A S222A A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；0.2M magnesium chloride, 0.1M tris pH 7.0, 10% w/v PEG 8000
分辨率 2.59 Å R-free 0.257
9ECU Crystal structure of the inactive BRAF/MEK1 complex bound to IK-595 提交 2024-11-15 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 A1BIS 4-[2-chloro-3-(methylsulfamamido)phenoxy]-N-cyclopropyl-2-(2-fluoro-4-iodoanilino)-1,5-dimethyl-6-oxo-1,6-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% w/v PEG 3350
分辨率 3.46 Å R-free 0.237
9MMP Cryo-EM structure of CRAF/MEK1/14-3-3 complex (autoinhibited conformation) 提交 2024-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP, 2 uM ATPgS, 1 uM GDC0623
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9MMQ Cryo-EM structure of CRAF/MEK1 complex (kinase domain) 提交 2024-12-20 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP, 2 uM ATPgS, 1 uM GDC0623
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9MMR Cryo-EM structure of CRAF/MEK1/14-3-3 complex (open monomer conformation, CRAF Y340D/Y341D mutant) 提交 2024-12-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 LCJ 5-[(2-fluoro-4-iodophenyl)amino]-N-(2-hydroxyethoxy)imidazo[1,5-a]pyridine-6-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP, 2 uM ATPgS, 1 uM GDC0623
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9O0U Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720 and CH5126766 提交 2025-04-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 2.91 Å R-free 0.264
9O0U Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720 and CH5126766 提交 2025-04-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 2.91 Å R-free 0.264
9O0U Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720 and CH5126766 提交 2025-04-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 2.91 Å R-free 0.264
9O0U Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720 and CH5126766 提交 2025-04-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 2.91 Å R-free 0.264
9O0V Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720, CH5126766, and AMPPNP 提交 2025-04-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 3.50 Å R-free 0.254
9O0V Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720, CH5126766, and AMPPNP 提交 2025-04-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 3.50 Å R-free 0.254
9O0V Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720, CH5126766, and AMPPNP 提交 2025-04-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 3.50 Å R-free 0.254
9O0V Crystal structure of CRAF/MEK1 complex with PLX4720, CH5126766, and AMPPNP 提交 2025-04-03 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1–393（393 aa）
突变：S218A, S222A 324 N-{3-[(5-chloro-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)carbonyl]-2,4-difluorophenyl}propane-1-sulfonamide × 1 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；18% PEG 3350, 0.1 M Sodium citrate pH 5.6, 4% Tacsimate pH 5
分辨率 3.50 Å R-free 0.254
9O2Z Autoinhibited BRAF:(14-3-3)2:MEK complex from Insect cells 提交 2025-04-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–393（393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 CHU N-(3-fluoro-4-{[4-methyl-2-oxo-7-(pyrimidin-2-yloxy)-2H-chromen-3-yl]methyl}pyridin-2-yl)-N'-methylsulfuric diamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
9TYG Structure of the MAP2K MEK1 in an inactive conformation in complex with its substrate MAPK ERK2 提交 2026-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–2（2 aa）
链 A 12–393（382 aa）
突变：residue 3-11 replaced with 15 residues GRA24 KIM,Ser218Asp,Ser222Asp 突变：residue 3-11 replaced with 15 residues GRA24 KIM,Ser218Asp,Ser222Asp ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9TYH Structure of the MAP2K MEK1 in an active conformation in complex with its substrate MAPK ERK2 提交 2026-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–2（2 aa）
链 A 12–393（382 aa）
突变：residue 3-11 replaced with GRA24 KIM (15 residues),Ser218Asp,Ser222Asp 突变：residue 3-11 replaced with GRA24 KIM (15 residues),Ser218Asp,Ser222Asp ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9TYI Structure of the MAP2K MEK1 without bound nucleotide in complex with its substrate MAPK ERK2 提交 2026-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–2（2 aa）
链 A 12–393（382 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9UUR The complex of human pMEK1 and uERK1 (ANP) 提交 2025-05-08 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–393（393 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9UUX The complex of human pMEK1 and ERK1 pT202 (ANP) 提交 2025-05-08 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–393（393 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å
9UW3 The complex of human pMEK1 and ERK1 pY204 (ANP) 提交 2025-05-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–393（393 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
9UW4 The complex of human pMEK1 and uERK1 (ANP)(from pY204ERK1) 提交 2025-05-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–393（393 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å

共 92 个其他 PDB 条目、122 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MP2K1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 23–415； UniProt 1–393

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9mms

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9mms
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9mms
沉积日期 deposition_date2024-12-20
结构标题 titleCryo-EM structure of CRAF/MEK1 complex (kinase domain, CRAF Y340D/Y341D mutant)
关键词 keywordsCRAF-MEK1-14-3-3 complex, MAPK pathway, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier25.22 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron24.51 Å
零角强度 I(0) i065078100.00
分子量 molecular_weight63046.0 kDa
排除体积 excluded_volume78932 ų
包络体积 envelope_volume92452 ų
水化壳体积 shell_volume30911 ų
包络直径 envelope_diameter83.8 Å
壳层 Rg shell_rg32.33 Å
包络 Rg envelope_rg24.52 Å
形状 Rg shape_rg24.53 Å
总 Rg total_rg25.28 Å
总原子数 total_atoms4410
残基数 n_residues546
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax80.2 Å
Rg (实空间) rg_real25.14 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.40 Å
I(0) (实空间) i0_real6.5080e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.0900e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal25.16 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal65080000.0000
解质量估计 total_estimate0.9012
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary29.3 Å
偏度 Skewness skewness0.259
峰度 Kurtosis kurtosis-0.415
角度范围 angular_range— – 0.3150 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha20470000.0000
实空间数据点数 n_real_points64
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.905; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.996
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)