9n9j

Structure of a GRP94 folding intermediate engaged with a CCDC134- and FKBP11-bound secretory translocon

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 260.0 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9n9j

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9n9j
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9n9j
沉积日期 deposition_date2025-02-10
结构标题 titleStructure of a GRP94 folding intermediate engaged with a CCDC134- and FKBP11-bound secretory translocon
关键词 keywordsRibosome, Membrane protein, Translocon, Transport, N-Glycosylation; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier94.54
回转半径 Rg (电子) rg_electron99.56
零角强度 I(0) i0186752000000.00
分子量 molecular_weight2691300.0 kDa
排除体积 excluded_volume2955200 ų
包络体积 envelope_volume5280600 ų
水化壳体积 shell_volume419630 ų
包络直径 envelope_diameter387.0
壳层 Rg shell_rg106.50
包络 Rg envelope_rg101.10
形状 Rg shape_rg99.83
总 Rg total_rg98.97
总原子数 total_atoms326106
残基数 n_residues15898
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax260.0
Rg (实空间) rg_real89.10
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.73
I(0) (实空间) i0_real1.7800e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.4750e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal93.35
I(0) (倒空间) i0_reciprocal186000000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9058
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary113.7
偏度 Skewness skewness0.300
峰度 Kurtosis kurtosis-0.326
角度范围 angular_range— – 0.0800 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.4159
最高正则化参数 α highest_alpha24210000000.0000
实空间数据点数 n_real_points17
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.007; Oscil: 0.962; Stabil: 0.988; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.928; Smooth: 0.002

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (78)

7. 引用文献 (2)

8. 文件与曲线 (10)