9o6v

Recombinant AD PHF complexed with SW-MK-NBD (PHF2)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 139.0 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Microtubule-associated protein tau

Homo sapiens

UniProt P10636

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 F; UniProt 622–696 链 G; UniProt 622–696 链 H; UniProt 622–696 链 I; UniProt 622–696 链 J; UniProt 622–696 链 N; UniProt 622–696 链 O; UniProt 622–696 链 P; UniProt 622–696 链 Y; UniProt 622–696 链 Z; UniProt 622–696 未记录 A1B91 7-nitro-N-[2-(2-{[(3P)-3-(1H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-1-yl)isoquinolin-7-yl]oxy}ethoxy)ethyl]-2,1,3-benzoxadiazol-4-amine × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4;10 mM Phosphate buffer, pH 7.4, with 10 mM DTT and 200 mM MgCl2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.72 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 248 个其他 PDB 条目、270 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TAU_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–75; UniProt 622–696 作者链 G; PDB构建体 1–75; UniProt 622–696 作者链 H; PDB构建体 1–75; UniProt 622–696 作者链 I; PDB构建体 1–75; UniProt 622–696 作者链 J; PDB构建体 1–75; UniProt 622–696 作者链 N; PDB构建体 1–75; UniProt 622–696 作者链 O; PDB构建体 1–75; UniProt 622–696 作者链 P; PDB构建体 1–75; UniProt 622–696 作者链 Y; PDB构建体 1–75; UniProt 622–696 作者链 Z; PDB构建体 1–75; UniProt 622–696

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9o6v

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9o6v
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9o6v
沉积日期 deposition_date2025-04-14
结构标题 titleRecombinant AD PHF complexed with SW-MK-NBD (PHF2)
关键词 keywordsMK-6240 PET Ligand, AD PHF, PROTEIN FIBRIL, SW-MK-NBD, Amyloid Dye; PROTEIN FIBRIL
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier35.76
回转半径 Rg (电子) rg_electron37.28
零角强度 I(0) i0116824000.00
分子量 molecular_weight86850.0 kDa
排除体积 excluded_volume109040 ų
包络体积 envelope_volume143560 ų
水化壳体积 shell_volume35480 ų
包络直径 envelope_diameter143.8
壳层 Rg shell_rg38.70
包络 Rg envelope_rg37.90
形状 Rg shape_rg37.69
总 Rg total_rg35.97
总原子数 total_atoms12340
残基数 n_residues750
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax139.0
Rg (实空间) rg_real36.32
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.61
I(0) (实空间) i0_real1.1680e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.1060e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal35.97
I(0) (倒空间) i0_reciprocal116800000.0000
解质量估计 total_estimate0.7472
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary34.8
偏度 Skewness skewness0.721
峰度 Kurtosis kurtosis0.147
角度范围 angular_range— – 0.2200 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha10650000.0000
实空间数据点数 n_real_points45
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.461; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.374; Smooth: 0.954

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)