Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
Rattus norvegicus
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 1–847 链 C； UniProt 1–847 | 未记录 | polyclonal antibody Fab fragment, termed FabEnc1 × 2 Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A × 2 （Q00959） | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE | 分辨率 4.07 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 9PZQ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1PB7 CRYSTAL STRUCTURE OF THE NR1 LIGAND BINDING CORE IN COMPLEX WITH GLYCINE AT 1.35 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 2003-05-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
394–544（151 aa）
片段：Ligand Binding Core
链 A
663–800（138 aa）
片段：Ligand Binding Core
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；PEG 1000, sodium cacodylate, lithium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.216 |
| 1PB8 CRYSTAL STRUCTURE OF THE NR1 LIGAND BINDING CORE IN COMPLEX WITH D-SERINE AT 1.45 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 2003-05-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
394–544（151 aa）
片段：Ligand Binding Core
链 A
663–800（138 aa）
片段：Ligand Binding Core
|
未记录 | DSN D-SERINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；PEG 1000, sodium cacodylate, lithium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.226 |
| 1PB9 CRYSTAL STRUCTURE OF THE NR1 LIGAND BINDING CORE IN COMPLEX WITH D-CYCLOSERINE AT 1.60 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 2003-05-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
394–544（151 aa）
片段：Ligand Binding Core
链 A
663–800（138 aa）
片段：Ligand Binding Core
|
未记录 | 4AX (R)-4-AMINO-ISOXAZOLIDIN-3-ONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；PEG 1000, sodium cacodylate, lithium sulfate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.227 |
| 1PBQ CRYSTAL STRUCTURE OF THE NR1 LIGAND BINDING CORE IN COMPLEX WITH 5,7-DICHLOROKYNURENIC ACID (DCKA) AT 1.90 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 2003-05-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
394–544（151 aa）
片段：Ligand Binding Core
链 A
663–800（138 aa）
片段：Ligand Binding Core
|
未记录 | DK1 5,7-DICHLORO-4-HYDROXYQUINOLINE-2-CARBOXYLIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG2000, HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.270 |
| 1PBQ CRYSTAL STRUCTURE OF THE NR1 LIGAND BINDING CORE IN COMPLEX WITH 5,7-DICHLOROKYNURENIC ACID (DCKA) AT 1.90 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 2003-05-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 未唯一映射
参考区间未声明
片段：Ligand Binding Core
|
未记录 | DK1 5,7-DICHLORO-4-HYDROXYQUINOLINE-2-CARBOXYLIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG2000, HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.270 |
| 1Y1M Crystal structure of the NR1 ligand binding core in complex with cycloleucine 提交 2004-11-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
394–544（151 aa）
片段：ligand-binding core
链 A
663–800（138 aa）
片段：ligand-binding core
|
未记录 | AC5 1-AMINOCYCLOPENTANECARBOXYLIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.224 |
| 1Y1M Crystal structure of the NR1 ligand binding core in complex with cycloleucine 提交 2004-11-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
394–544（151 aa）
片段：ligand-binding core
链 B
663–800（138 aa）
片段：ligand-binding core
|
未记录 | AC5 1-AMINOCYCLOPENTANECARBOXYLIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.224 |
| 1Y1M Crystal structure of the NR1 ligand binding core in complex with cycloleucine 提交 2004-11-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
394–544（151 aa）
片段：ligand-binding core
链 A
663–800（138 aa）
片段：ligand-binding core
链 B
394–544（151 aa）
片段：ligand-binding core
链 B
663–800（138 aa）
片段：ligand-binding core
|
未记录 | AC5 1-AMINOCYCLOPENTANECARBOXYLIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.224 |
| 1Y1Z Crystal structure of the NR1 ligand binding core in complex with ACBC 提交 2004-11-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
394–544（151 aa）
片段：ligand-binding core
链 A
663–800（138 aa）
片段：ligand-binding core
|
未记录 | 192 1-AMINOCYCLOBUTANECARBOXLIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；PEG, pH 6., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.237 |
| 1Y20 Crystal structure of the NR1 ligand-binding core in complex with ACPC 提交 2004-11-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
394–544（151 aa）
片段：ligand-binding core
链 A
663–800（138 aa）
片段：ligand-binding core
|
未记录 | 1AC 1-AMINOCYCLOPROPANECARBOXYLIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；PEG, pH 6., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.220 |
| 2A5T Crystal Structure Of The NR1/NR2A ligand-binding cores complex 提交 2005-06-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
394–544（151 aa）
片段：S1S2 ligand-binding core
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7；277 K；PEG 8000, HEPES, Calcium acetate, pH 7., EVAPORATION, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 3Q41 Crystal structure of the GluN1 N-terminal domain (NTD) 提交 2010-12-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
21–393（373 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 21-393
链 B
21–393（373 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 21-393
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 CL CHLORIDE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；protein in (20mM Tris-HCl pH 7.5, 150mM NaCl) was mixed 1:1 with 4M Formate and 20mM TCEP, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.279 |
| 3Q41 Crystal structure of the GluN1 N-terminal domain (NTD) 提交 2010-12-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
21–393（373 aa）
片段：N-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 21-393
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；protein in (20mM Tris-HCl pH 7.5, 150mM NaCl) was mixed 1:1 with 4M Formate and 20mM TCEP, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.279 |
| 4KCC Crystal Structure of the NMDA Receptor GluN1 Ligand Binding Domain Apo State 提交 2013-04-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
394–544（151 aa）
片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 394-544, 663-800)
链 A
663–800（138 aa）
片段：Ligand Binding Domain (UNP residues 394-544, 663-800)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.2 M NaKphosphate, 20% PEG 3350, 2% glycerol, 0.2 M NaCl, 0.01 M Tris, 0.001 M EDTA, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.206 |
| 4KFQ Crystal structure of the NMDA receptor GluN1 ligand binding domain in complex with 1-thioxo-1,2-dihydro-[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoxalin-4(5H)-one 提交 2013-04-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
394–544（151 aa）
片段：UNP residues 394-554, 663-800
链 A
663–800（138 aa）
片段：UNP residues 394-554, 663-800
|
未记录 | KFQ 1-sulfanyl[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoxalin-4(5H)-one × 1 GOL GLYCEROL × 9 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；279 K；1-thioxo-1,2-dihydro-[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoxalin-4(5H)-one was added as solid compound and the solution was gently shaken overnight.
0.3 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, and 30 % PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.232 |
| 4KFQ Crystal structure of the NMDA receptor GluN1 ligand binding domain in complex with 1-thioxo-1,2-dihydro-[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoxalin-4(5H)-one 提交 2013-04-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
394–544（151 aa）
片段：UNP residues 394-554, 663-800
链 B
663–800（138 aa）
片段：UNP residues 394-554, 663-800
|
未记录 | KFQ 1-sulfanyl[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoxalin-4(5H)-one × 1 GOL GLYCEROL × 9 SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；279 K；1-thioxo-1,2-dihydro-[1,2,4]triazolo[4,3-a]quinoxalin-4(5H)-one was added as solid compound and the solution was gently shaken overnight.
0.3 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, and 30 % PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 279K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.232 |
| 4NF4 Crystal structure of GluN1/GluN2A ligand-binding domain in complex with DCKA and glutamate 提交 2013-10-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
393–543（151 aa）
片段：Ligand-binding domain, unp residues 393-543; unp residues 663-800
链 A
663–800（138 aa）
片段：Ligand-binding domain, unp residues 393-543; unp residues 663-800
|
未记录 | 2JK 4-hydroxy-5,7-dimethylquinoline-2-carboxylic acid × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；300 K；PEG2000MME, HEPES, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 300K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.217 |
| 4NF5 Crystal structure of GluN1/GluN2A ligand-binding domain in complex with glycine and D-AP5 提交 2013-10-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
393–543（151 aa）
片段：unp residues 393-543; unp residues 663-800
链 A
663–800（138 aa）
片段：unp residues 393-543; unp residues 663-800
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 2JJ 5-phosphono-D-norvaline × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；300 K；PEG2000MME, HEPES, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 300K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.213 |
| 4NF6 Crystal structure of GluN1/GluN2A ligand-binding domain in complex with glycine and PPDA 提交 2013-10-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
393–543（151 aa）
片段：Ligand-binding domain, unp residues 393-543; unp residues 663-800
链 A
663–800（138 aa）
片段：Ligand-binding domain, unp residues 393-543; unp residues 663-800
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 2JL (2S,3R)-1-(phenanthren-2-ylcarbonyl)piperazine-2,3-dicarboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；300 K；PEG2000MMG and HEPES, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 300K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.215 |
| 4NF8 Crystal structure of GluN1/GluN2A ligand-binding domain in complex with glycine and glutamate in PEG2000MME 提交 2013-10-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
393–543（151 aa）
片段：Ligand-binding domain, unp residues 393-543; unp residues 663-800
链 A
663–800（138 aa）
片段：Ligand-binding domain, unp residues 393-543; unp residues 663-800
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；300 K；PEG2000MME and HEPES, pH 7, VAPOR DIFFUSION, temperature 300K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.218 |
| 4PE5 Crystal Structure of GluN1a/GluN2B NMDA Receptor Ion Channel 提交 2014-04-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–847（825 aa）
片段：UNP residues 23-847
链 C
23–847（825 aa）
片段：UNP residues 23-847
|
突变：N61Q, N239D, N350Q, N471Q, N491Q, T561C, E594Q, E595S, E597S, E598T, N771Q, F810C, R844N, R845G, K846A 突变：N61Q, N239D, N350Q, N471Q, N491Q, T561C, E594Q, E595S, E597S, E598T, N771Q, F810C, R844N, R845G, K846A | W TUNGSTEN ION × 84 GLY GLYCINE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 QEL 4-[(1R,2S)-2-(4-benzylpiperidin-1-yl)-1-hydroxypropyl]phenol × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；291 K；PEG 4000, Tris-HCl, NaCl, Magnesium acetate, metatungstate
|
分辨率 3.96 Å R-free 0.295 |
| 5DEX Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, phenyl-ACEPC 提交 2015-08-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
394–544（151 aa）
片段：UNP residues 394-544, 663-800
链 A
663–800（138 aa）
片段：UNP residues 394-544, 663-800
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 5E0 5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-phenyl-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；AMMONIUM ACETATE, PEG 4000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.285 |
| 5FXG GLUN1B-GLUN2B NMDA RECEPTOR IN ACTIVE CONFORMATION 提交 2016-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–847（825 aa）
片段：UNP RESIDUES 23-868
链 C
23–847（825 aa）
片段：UNP RESIDUES 23-868
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
200 MM NACL, 20 MM HEPES PH 7.0, 10 MM GLYCINE, 10 MM L-GLUTAMATE, 0.002% MNG-3；pH 7；200 MM NACL, 20 MM HEPES PH 7.0, 10 MM GLYCINE, 10 MM L-GLUTAMATE, 0.002% MNG-3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 6.80 Å |
| 5FXH GluN1b-GluN2B NMDA receptor in non-active-1 conformation 提交 2016-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–847（825 aa）
片段：UNP RESIDUES 23-868
链 C
23–847（825 aa）
片段：UNP RESIDUES 23-868
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
200 MM NACL, 20 MM HEPES PH 7.0, 10 MM GLYCINE, 10 MM L-GLUTAMATE, 0.002% MNG-3；pH 7；200 MM NACL, 20 MM HEPES PH 7.0, 10 MM GLYCINE, 10 MM L-GLUTAMATE, 0.002% MNG-3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 5.00 Å |
| 5FXI GluN1b-GluN2B NMDA receptor structure in non-active-2 conformation 提交 2016-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–847（825 aa）
片段：UNP RESIDUES 23-868
链 C
23–847（825 aa）
片段：UNP RESIDUES 23-868
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
200 MM NACL, 20 MM HEPES PH 7.0, 10 MM GLYCINE, 10 MM L-GLUTAMATE, 0.002 % MNG-3；pH 7；200 MM NACL, 20 MM HEPES PH 7.0, 10 MM GLYCINE, 10 MM L-GLUTAMATE, 0.002 % MNG-3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 6.40 Å |
| 5FXJ GluN1b-GluN2B NMDA receptor structure-Class X 提交 2016-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–847（825 aa）
片段：ATD.LBD, TMD, UNP RESIDUES 23-868
链 C
23–847（825 aa）
片段：ATD.LBD, TMD, UNP RESIDUES 23-868
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
200 MM NACL, 20 MM HEPES PH 7.0, 10 MM GLYCINE, 10 MM L-GLUTAMATE, 0.002% MNG-3；pH 7；200 MM NACL, 20 MM HEPES PH 7.0, 10 MM GLYCINE, 10 MM L-GLUTAMATE, 0.002% MNG-3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 6.25 Å |
| 5FXK GluN1b-GluN2B NMDA receptor structure-Class Y 提交 2016-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
23–847（825 aa）
片段：UNP RESIDUES 23-868
链 C
23–847（825 aa）
片段：UNP RESIDUES 23-868
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
200 MM NACL, 20 MM HEPES PH 7.0, 10 MM GLYCINE, 10 MM L-GLUTAMATE, 0.002 % MNG-3；pH 7；200 MM NACL, 20 MM HEPES PH 7.0, 10 MM GLYCINE, 10 MM L-GLUTAMATE, 0.002 % MNG-3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；ETHANE
|
分辨率 6.40 Å |
| 5I56 Agonist-bound GluN1/GluN2A agonist binding domains with TCN201 提交 2016-02-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
链 A
684–821（138 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 67P N-({4-[2-(benzenecarbonyl)hydrazinecarbonyl]phenyl}methyl)-3-chloro-4-fluorobenzene-1-sulfonamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium sulfate and 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.239 |
| 5I57 Glutamate- and glycine-bound GluN1/GluN2A agonist binding domains 提交 2016-02-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
片段：unp residues 415-565; 684-821
链 A
684–821（138 aa）
片段：unp residues 415-565; 684-821
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium sulfate and 16-22% PEG 4000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.222 |
| 5I58 GLUTAMATE- AND GLYCINE-BOUND GLUN1/GLUN2A AGONIST BINDING DOMAINS WITH MPX-004 提交 2016-02-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
链 A
684–821（138 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 67R 5-({[(3-chloro-4-fluorophenyl)sulfonyl]amino}methyl)-N-[(2-methyl-1,3-thiazol-5-yl)methyl]pyrazine-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；0.2 M ammonium sulfate and 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.292 |
| 5I59 Glutamate- and glycine-bound GluN1/GluN2A agonist binding domains with MPX 007 提交 2016-02-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
片段：unp residues 415-565, unp residues 684-821 unp residues 6402-539, unp residues 661-800
链 A
684–821（138 aa）
片段：unp residues 415-565, unp residues 684-821 unp residues 6402-539, unp residues 661-800
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 67Q 5-({[(3,4-difluorophenyl)sulfonyl]amino}methyl)-6-methyl-N-[(2-methyl-4H-1lambda~4~,3-thiazol-5-yl)methyl]pyrazine-2-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium sulfate and 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.264 |
| 5JTY Glutamate- and DCKA-bound GluN1/GluN2A agonist binding domains with MPX-007 提交 2016-05-10 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
片段：unp residues 415-565; 684-821
链 A
684–821（138 aa）
片段：unp residues 415-565; 684-821
|
未记录 | 2JK 4-hydroxy-5,7-dimethylquinoline-2-carboxylic acid × 1 6ND 5-({[(3,4-difluorophenyl)sulfonyl]amino}methyl)-6-methyl-N-[(2-methyl-1,3-thiazol-5-yl)methyl]pyrazine-2-carboxamide × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE AND 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.278 |
| 5U8C CRYSTAL STRUCTURE OF GLUN1/GLUN2A LIGAND-BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH GLYCINE AND NVP-AAM077 提交 2016-12-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
394–544（151 aa）
片段：UNP residues 394-554, 663-800
链 A
663–800（138 aa）
片段：UNP residues 394-554, 663-800
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 84J [(R)-{[(1S)-1-(4-bromophenyl)ethyl]amino}(2,3-dihydroxyquinoxalin-5-yl)methyl]phosphonic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；18% Polyethylene glycol monoethylether 2000 (PEG2000 MME), 100mM HEPES-NaOH pH 7.0, and 75mM NaCl
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.204 |
| 5VIH Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, 4-fluorophenyl-ACEPC 提交 2017-04-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
链 A
684–821（138 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 5DZ 5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-(4-fluorophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonia Acetate, PEG 4000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.272 |
| 5VII Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, 4-(3-fluoropropyl)phenyl-ACEPC 提交 2017-04-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
链 A
684–821（138 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 5DY 5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-[4-(3-fluoropropyl)phenyl]-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonia Acetate, PEG 4000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.259 |
| 5VIJ Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, 4-bromophenyl-ACEPC 提交 2017-04-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
链 A
684–821（138 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 5DX 5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-(4-bromophenyl)-1H-pyrazole-3-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonia Acetate, PEG 4000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.255 |
| 6CNA GluN1-GluN2B NMDA receptors with exon 5 提交 2018-03-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–859（835 aa）
片段：residues 25-859
链 C
25–859（835 aa）
片段：residues 25-859
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 6MM9 Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '1-Knuckle' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 6.1 提交 2018-09-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 5.97 Å |
| 6MMA Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the 'Extended' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 6.1 提交 2018-09-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.31 Å |
| 6MMB Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the 'Super-Splayed' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 6.1 提交 2018-09-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 12.70 Å |
| 6MMG Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '2-Knuckle-Symmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 millimolar EDTA, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.23 Å |
| 6MMH Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the 'Extended-2' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 millimolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 8.21 Å |
| 6MMI Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the 'Splayed-Open' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 millimolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 8.93 Å |
| 6MMJ Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the 'Super-Splayed' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 millimolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 16.50 Å |
| 6MMK Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '1-Knuckle' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.08 Å |
| 6MML Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '2-Knuckle-Asymmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 7.14 Å |
| 6MMM Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the 'Extended-1' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-09-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.84 Å |
| 6MMN Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '2-Knuckle-Symmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 8.0 提交 2018-10-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 22 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 7.51 Å |
| 6MMP Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '2-Knuckle-Symmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 0.1 millimolar EDTA, and at pH 8.0 提交 2018-10-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.88 Å |
| 6MMR Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A in the '2-Knuckle-Symmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 millimolar zinc chloride, 3 millimolar EDTA, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 34 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 5.13 Å |
| 6MMS Triheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A/GluN2A* in the '2-Knuckle-Symmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 millimolar EDTA, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 5.38 Å |
| 6MMT Triheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A/GluN2A* in the '1-Knuckle' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 29 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 7.46 Å |
| 6MMU Triheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A/GluN2A* in the '2-Knuckle-Asymmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 5.30 Å |
| 6MMV Triheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A/GluN2A* Extracellular Domain in the '2-Knuckle-Asymmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–797（797 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–797（797 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 4.71 Å |
| 6MMW Triheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A/GluN2A* in the '2-Knuckle-Symmetric' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.20 Å |
| 6MMX Triheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A/GluN2A* in the 'Extended' conformation, in complex with glycine and glutamate, in the presence of 1 micromolar zinc chloride, and at pH 7.4 提交 2018-10-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
链 C
1–838（838 aa）
片段：UNP residues 1-838
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 3 seconds at blot force 1.
|
分辨率 6.99 Å |
| 6OVD Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, 3-ethylphenyl-ACEPC 提交 2019-05-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
链 A
684–821（138 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 N9A (3S,5S)-5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-(3-ethylphenyl)pyrazolidine-3-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE AND 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.240 |
| 6OVE Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, 4-propylphenyl-ACEPC 提交 2019-05-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
链 A
684–821（138 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 N9D (3R,5S)-5-[(2R)-2-amino-2-carboxyethyl]-1-(4-propylphenyl)pyrazolidine-3-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE AND 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.216 |
| 6OVE Crystal structure of GluN1/GluN2A NMDA receptor agonist binding domains with glycine and antagonist, 4-propylphenyl-ACEPC 提交 2019-05-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
415–565（151 aa）
链 A
684–821（138 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M AMMONIUM SULFATE AND 16-22% PEG 4000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.216 |
| 6USU Crystal structure of GluN1/GluN2A ligand-binding domain in complex with L689,560 and glutamate 提交 2019-10-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
片段：UNP residues 415-565, 684-821
链 A
684–821（138 aa）
片段：UNP residues 415-565, 684-821
|
未记录 | QGM (2R,4S)-5,7-dichloro-4-[(phenylcarbamoyl)amino]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-2-carboxylic acid × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7；291 K；0.2 M HEPES, pH 7.0, 60-90 mM sodium chloride, 15-20% PEG2000 MME
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.222 |
| 6USV Crystal structure of GluN1/GluN2A ligand-binding domain in complex with glycine and SDZ 220-040 提交 2019-10-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
片段：UNP residues 415-565, 684-821
链 A
684–821（138 aa）
片段：UNP residues 415-565, 684-821
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 QGP (2S)-2-amino-3-[2',4'-dichloro-4-hydroxy-5-(phosphonomethyl)biphenyl-3-yl]propanoic acid × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7；291 K；0.2 M HEPES, pH 7.0, 60-90 mM sodium chloride, 15-20% PEG2000 MME
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.259 |
| 6UZ6 Crystal structure of GLUN1/GLUN2A-4M mutant ligand-binding domain in complex with glycine and glutamate 提交 2019-11-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 415-565,684-821)
链 A
684–821（138 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 415-565,684-821)
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM HEPES, pH 7.0, 75 mM sodium chloride, 18% PEG2000 MME
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.212 |
| 6UZG Crystal structure of GLUN1/GLUN2A-4M mutant ligand-binding domain in complex with glycine and homoquinolinic acid 提交 2019-11-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 415-565,684-821)
链 A
684–821（138 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 415-565,684-821)
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 QM1 3-(carboxymethyl)pyridine-2-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM HEPES, pH 7.0, 75 mM sodium chloride, 18% PEG2000 MME
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.250 |
| 6UZR Crystal structure of GLUN1/GLUN2A ligand-binding domain in complex with glycine and homoquinolinic acid 提交 2019-11-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 415-565,684-821)
链 A
684–821（138 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 415-565,684-821)
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 GOL GLYCEROL × 3 QM1 3-(carboxymethyl)pyridine-2-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM HEPES, pH 7.0, 75 mM sodium chloride, 18% PEG2000 MME
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.207 |
| 6UZW Crystal structure of GLUN1/GLUN2A ligand-binding domain in complex with glycine and UBP791 提交 2019-11-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 415-565,684-821)
链 A
684–821（138 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 415-565,684-821)
|
未记录 | GLY GLYCINE × 1 QM4 (2S,3R)-1-[7-(2-carboxyethyl)phenanthrene-2-carbonyl]piperazine-2,3-dicarboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM HEPES, pH 7.0, 75 mM sodium chloride, 18% PEG2000 MME
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.247 |
| 6UZX Crystal structure of GLUN1/GLUN2A-4M mutant ligand-binding domain in complex with glycine and UBP791 提交 2019-11-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
415–565（151 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 415-565,684-821)
链 A
684–821（138 aa）
片段：ligand-binding domain (UNP residues 415-565,684-821)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 GLY GLYCINE × 1 QM4 (2S,3R)-1-[7-(2-carboxyethyl)phenanthrene-2-carbonyl]piperazine-2,3-dicarboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；100 mM HEPES, pH 7.0, 75 mM sodium chloride, 18% PEG2000 MME
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.245 |
| 6WHR GluN1b-GluN2B NMDA receptor in non-active 2 conformation at 4 angstrom resolution 提交 2020-04-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–959（959 aa）
链 C
1–959（959 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.99 Å |
| 6WHS GluN1b-GluN2B NMDA receptor in non-active 1 conformation at 3.95 angstrom resolution 提交 2020-04-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–959（959 aa）
链 C
1–959（959 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6WHT GluN1b-GluN2B NMDA receptor in active conformation at 4.4 angstrom resolution 提交 2020-04-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–959（959 aa）
链 C
1–959（959 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.39 Å |
| 6WHU GluN1b-GluN2B NMDA receptor in complex with SDZ 220-040 and L689,560, class 1 提交 2020-04-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–959（959 aa）
链 C
1–959（959 aa）
|
未记录 | QGM (2R,4S)-5,7-dichloro-4-[(phenylcarbamoyl)amino]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-2-carboxylic acid × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 QGP (2S)-2-amino-3-[2',4'-dichloro-4-hydroxy-5-(phosphonomethyl)biphenyl-3-yl]propanoic acid × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.93 Å |
| 6WHV GluN1b-GluN2B NMDA receptor in complex with SDZ 220-040 and L689,560, class 2 提交 2020-04-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–959（959 aa）
链 C
1–959（959 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 QGP (2S)-2-amino-3-[2',4'-dichloro-4-hydroxy-5-(phosphonomethyl)biphenyl-3-yl]propanoic acid × 2 QGM (2R,4S)-5,7-dichloro-4-[(phenylcarbamoyl)amino]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-2-carboxylic acid × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.05 Å |
| 6WI0 GluN1b-GluN2B NMDA receptor in complex with GluN1 antagonist L689,560, class 2 提交 2020-04-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–959（959 aa）
链 C
1–959（959 aa）
|
未记录 | QGM (2R,4S)-5,7-dichloro-4-[(phenylcarbamoyl)amino]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-2-carboxylic acid × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.27 Å |
| 7SAA Glycine and glutamate bound GluN1a-GluN2B NMDA receptors in non-active 1 conformation at 2.97 Angstrom resolution 提交 2021-09-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 GLY GLYCINE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 7SAB Phencyclidine-bound GluN1a-GluN2B NMDA receptors 提交 2021-09-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 1PC 1-(PHENYL-1-CYCLOHEXYL)PIPERIDINE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7SAC S-(+)-ketamine bound GluN1a-GluN2B NMDA receptors at 3.69 Angstrom resolution 提交 2021-09-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 GLY GLYCINE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 JC9 (2~{S})-2-(2-chlorophenyl)-2-(methylamino)cyclohexan-1-one × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å |
| 7SAD Memantine-bound GluN1a-GluN2B NMDA receptors 提交 2021-09-22 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 377 Memantine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.96 Å |
| 7TE9 Cryo-EM structure of GluN1b-2B NMDAR complexed to Fab2 class1 提交 2022-01-04 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–859（859 aa）
链 C
1–859（859 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.92 Å |
| 7TEB Cryo-EM structure of GluN1b-2B NMDAR complexed to Fab2 non-active1-like 提交 2022-01-04 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–859（859 aa）
链 C
1–859（859 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.23 Å |
| 7TEE Cryo-EM structure of GluN1b-2B NMDAR complexed to Fab2 Non-active2-like 提交 2022-01-04 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–859（859 aa）
链 C
1–859（859 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.59 Å |
| 7TEQ Cryo-EM structure of GluN1b-2B NMDAR in complex with Fab5 active conformation 提交 2022-01-05 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–859（859 aa）
链 C
1–859（859 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.51 Å |
| 7TER Cryo-EM structure of GluN1b-2B NMDAR in complex with Fab5 non-active2 conformation 提交 2022-01-05 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–859（859 aa）
链 C
1–859（859 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.23 Å |
| 7TES Cryo-EM structure of GluN1b-2B NMDAR in complex with Fab5 in Non-active1 conformation 提交 2022-01-05 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–859（859 aa）
链 C
1–859（859 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 7TET Cryo-EM structure of GluN1b-2B NMDAR in complex with Fab5 in non-active2-like conformation 提交 2022-01-05 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–859（859 aa）
链 C
1–859（859 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.45 Å |
| 7YFG Structure of the Rat GluN1-GluN2C NMDA receptor in complex with glycine and glutamate (major class in asymmetry) 提交 2022-07-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 GLY GLYCINE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7YFH Structure of the Rat GluN1-GluN2C NMDA receptor in complex with glycine, glutamate and (R)-PYD-106 提交 2022-07-08 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 GLY GLYCINE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 IWB methyl 4-[(2~{R})-3-ethanoyl-1-[2-(2-methyl-1~{H}-indol-3-yl)ethyl]-4-oxidanyl-5-oxidanylidene-2~{H}-pyrrol-2-yl]benzoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7YFI Structure of the Rat tri-heteromeric GluN1-GluN2A-GluN2C NMDA receptor in complex with glycine and glutamate 提交 2022-07-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–798（798 aa）
链 C
1–798（798 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 GLY GLYCINE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8HDK Structure of the Rat GluN1-GluN2C NMDA receptor in complex with glycine and glutamate (minor class in symmetry) 提交 2022-11-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–796（796 aa）
链 C
1–796（796 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
|
分辨率未提供 |
| 8JF7 Triheteromeric NMDA receptor GluN1-GluN2A-GluN3A in complex with glycine, glutamate, a GluN1-specific Fab,and a GluN2A-specific Fab 提交 2023-05-17 | 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.73 Å |
| 8USW CNQX-bound GluN1a-3A NMDA receptor 提交 2023-10-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | DQC 7-nitro-2,3-dioxo-1,2,3,4-tetrahydroquinoxaline-6-carbonitrile × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.23 Å |
| 8VUY Rat GluN1-2B with Fab 003-102 提交 2024-01-30 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
25–838（814 aa）
链 C
25–838（814 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.81 Å |
| 8VVH rat GluN1a-2B Fab 003-102 local refinement 提交 2024-01-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
25–393（369 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.95 Å |
| 8XLK Structure of native tri-heteromeric GluN1-GluN2A-GluN2B NMDA receptor in rat cortex and hippocampus 提交 2023-12-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
1–938（938 aa）
链 C
1–938（938 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 7RC (2R)-4-(3-phosphonopropyl)piperazine-2-carboxylic acid × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 9ARE Rat GluN1-GluN2B NMDA receptor channel in complex with glycine, glutamate, and EU-1622-A, in open-channel conformation 提交 2024-02-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.72 Å |
| 9ARF Rat GluN1-GluN2B NMDA receptor channel in complex with glycine, glutamate, and EU-1622-A, in nonactive1 conformation 提交 2024-02-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.13 Å |
| 9ARG Rat GluN1-GluN2B NMDA receptor channel in apo conformation 提交 2024-02-23 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.05 Å |
| 9ARH Rat GluN1-GluN2B NMDA receptor channel in complex with glycine 提交 2024-02-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–959（959 aa）
链 C
1–959（959 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å |
| 9ARI Rat GluN1-GluN2B NMDA receptor channel in complex with glutamate 提交 2024-02-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–959（959 aa）
链 C
1–959（959 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9BIB Rat GluN1-GluN2B NMDA receptor channel in complex with glycine, glutamate, and EU-1622-A, in open-channel conformation, C1 symmetry 提交 2024-04-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.81 Å |
| 9C7C Diheteromeric GluN1/GluN2A (delM653) in nanodisc complexed with glycine, glutamate, and GNE-4123, open conformation 提交 2024-06-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | A1AUV 4-cyclohexyl-N-[(8R)-2-cyclopropyl-7-hydroxy-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-6-yl]benzene-1-sulfonamide × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 HP6 HEPTANE × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 8 GLY GLYCINE × 2 D12 DODECANE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 D10 DECANE × 2 HEX HEXANE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9C7E Diheteromeric GluN1/GluN2A (delM653) in nanodisc complex with glycine, glutamate, and GNE-4123, open conformation, C2 symmetry 提交 2024-06-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | A1AUV 4-cyclohexyl-N-[(8R)-2-cyclopropyl-7-hydroxy-5-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-6-yl]benzene-1-sulfonamide × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 6 D12 DODECANE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 9C7P Diheteromeric GluN1/GluN2A (delM653) in digitonin complexed with glycine, glutamate, and GNE-4123 提交 2024-06-10 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.61 Å |
| 9C7Q Diheteromeric NMDA receptor GluN1/GluN2A, in complex with glycine and glutamate 提交 2024-06-11 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.05 Å |
| 9C7R Diheteromeric GluN1/GluN2A (M817V) in digitonin complexed with glycine, glutamate, and GNE-4123 提交 2024-06-11 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.99 Å |
| 9JNN Structure of native di-heteromeric GluN1-GluN2B NMDA receptor in rat cortex and hippocampus 提交 2024-09-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
25–841（817 aa）
链 C
25–841（817 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 14 7RC (2R)-4-(3-phosphonopropyl)piperazine-2-carboxylic acid × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.40 Å |
| 9NYZ Crystal structure of DCKA/glutamate-bound GluN1/GluN2A agonist binding domains with UCM-101 提交 2025-03-30 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
394–544（151 aa）
链 A
663–800（138 aa）
|
未记录 | DK1 5,7-DICHLORO-4-HYDROXYQUINOLINE-2-CARBOXYLIC ACID × 1 A1B7E N-(cyclohexylmethyl)-2-[(5-{[(1R)-1-phenylpropyl]amino}-1,3,4-thiadiazol-2-yl)sulfanyl]acetamide × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；ammonium acetate, PEG 4000
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.202 |
| 9OBS glutamate/glycine-bound GluN1a/2B NMDAR 提交 2025-04-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 CLR CHOLESTEROL × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 9OBT TMD of glutamate/glycine-bound GluN1a/2B NMDAR 提交 2025-04-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9OBU glycine/glutamate and Mg2+-bound GluN1a/2B NMDAR 提交 2025-04-23 | 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 9OBV Mg2+-bound GluN1a/2B NMDAR (upper) 提交 2025-04-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.21 Å |
| 9OBW Mg2+ bound GluN1a/2B NMDAR (lower) 提交 2025-04-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.15 Å |
| 9OBX glutamate/glycine and Ca2+-bound GluN1a/2B NMDAR 提交 2025-04-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 2 GLU GLUTAMIC ACID × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.59 Å |
| 9OBY Ca2+-bound GluN1a/2B NMDAR (S1) 提交 2025-04-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9OBZ Ca2+-bound GluN1a/2B NMDAR (S2) 提交 2025-04-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 CLR CHOLESTEROL × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å |
| 9OC0 Ca2+-bound GluN1a/2B NMDAR (S3) 提交 2025-04-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 CLR CHOLESTEROL × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 9OC1 Ca2+-bound GluN1a/2B NMDAR (S4) 提交 2025-04-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |
| 9OC2 Ca2+-bound GluN1a/2B NMDAR (S5) 提交 2025-04-23 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 CLR CHOLESTEROL × 2 CA CALCIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.69 Å |
| 9OOU Glycine/Glutamate/EU 1622-240 rGluN1a-2B NMDAR 提交 2025-05-16 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
突变：N61Q, N239D, N350Q, N471Q, N491Q, N771Q, R844Q, R845G, K846A 突变：N61Q, N239D, N350Q, N471Q, N491Q, N771Q, R844Q, R845G, K846A | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 2 A1AFT (5M)-5-(3-bromo-4-fluorophenyl)-6-ethynyl-3-[2-(3-fluoro-3-methylazetidin-1-yl)-2-oxoethyl]thieno[2,3-d]pyrimidin-4(3H)-one × 4 CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.34 Å |
| 9PZR GluN1/GluN2A in complex with polyclonal autoantibody Fab fragments (class 2), glycine- and glutamate-bound state 提交 2025-08-11 | 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.92 Å |
| 9PZW GluN1/GluN2A in complex with 3D2 Fab, glycine and glutamate-bound state 提交 2025-08-11 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
1–847（847 aa）
链 C
1–847（847 aa）
|
未记录 | GLY GLYCINE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 16 GLU GLUTAMIC ACID × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9PZX GluN1/GluN2A in complex with 3D2 Fab, local ATD dimer 提交 2025-08-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
1–847（847 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.76 Å |
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| UniProt名称 | NMDZ1_RAT |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–847； UniProt 1–847 作者链 C； PDB构建体 1–847； UniProt 1–847 |
