9qtn

Human alpha7 nicotinic receptor in complex with the F1 nanobody

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 117.3 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7

Homo sapiens

UniProt P36544

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 10 其他聚合物 15 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 24–502 链 B; UniProt 24–502 链 C; UniProt 24–502 链 D; UniProt 24–502 链 E; UniProt 24–502 未记录 Nanobody F1 × 5 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 4 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ;alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 ;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.28 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 44 个其他 PDB 条目、44 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACHA7_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–479; UniProt 24–502 作者链 B; PDB构建体 1–479; UniProt 24–502 作者链 C; PDB构建体 1–479; UniProt 24–502 作者链 D; PDB构建体 1–479; UniProt 24–502 作者链 E; PDB构建体 1–479; UniProt 24–502

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9qtn

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9qtn
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9qtn
沉积日期 deposition_date2025-04-09
结构标题 titleHuman alpha7 nicotinic receptor in complex with the F1 nanobody
关键词 keywordsNicotinic receptor, Nanobody, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier39.09
回转半径 Rg (电子) rg_electron38.21
零角强度 I(0) i0622156000.00
分子量 molecular_weight204520.0 kDa
排除体积 excluded_volume255790 ų
包络体积 envelope_volume347090 ų
水化壳体积 shell_volume72564 ų
包络直径 envelope_diameter127.6
壳层 Rg shell_rg46.78
包络 Rg envelope_rg37.43
形状 Rg shape_rg38.15
总 Rg total_rg38.89
总原子数 total_atoms14419
残基数 n_residues1695
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax117.3
Rg (实空间) rg_real38.74
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.49
I(0) (实空间) i0_real6.2220e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error9.5080e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal38.96
I(0) (倒空间) i0_reciprocal622300000.0000
解质量估计 total_estimate0.8863
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary52.8
偏度 Skewness skewness0.068
峰度 Kurtosis kurtosis-0.400
角度范围 angular_range— – 0.2000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha83760000.0000
实空间数据点数 n_real_points41
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.904; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.958; Smooth: 0.847

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)