9qvm

Cryo-EM reconstruction of the NEDD1 anchor protein and CDK5RAP2 bound to the gamma-tubulin ring complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gamma-tubulin complex component 3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Mitotic-spindle organizing protein 1 × 7 （Q08AG7） Protein NEDD1 × 4 （Q8NHV4） Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed × 1 （P60709） Tubulin gamma-1 chain × 14 （P23258） Gamma-tubulin complex component 4 × 2 （Q9UGJ1） Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 2 × 5 （Q9BSJ2） TUBGCP6 protein × 1 （B2RWN4） Gamma-tubulin complex component 5 × 1 （Q96RT8） Mitotic-spindle organizing protein 2B × 1 （Q6NZ67） CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 × 2 （A0A0A0MRG9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GCP3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–907； UniProt 1–907 作者链 D； PDB构建体 1–907； UniProt 1–907 作者链 F； PDB构建体 1–907； UniProt 1–907 作者链 H； PDB构建体 1–907； UniProt 1–907 作者链 N； PDB构建体 1–907； UniProt 1–907 作者链 r； PDB构建体 1–907； UniProt 1–907 作者链 s； PDB构建体 1–907； UniProt 1–907 作者链 t； PDB构建体 1–907； UniProt 1–907 作者链 u； PDB构建体 1–907； UniProt 1–907 作者链 v； PDB构建体 1–907； UniProt 1–907

Mitotic-spindle organizing protein 1

Homo sapiens

UniProt Q08AG7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Gamma-tubulin complex component 3 × 10 （Q96CW5） Protein NEDD1 × 4 （Q8NHV4） Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed × 1 （P60709） Tubulin gamma-1 chain × 14 （P23258） Gamma-tubulin complex component 4 × 2 （Q9UGJ1） Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 2 × 5 （Q9BSJ2） TUBGCP6 protein × 1 （B2RWN4） Gamma-tubulin complex component 5 × 1 （Q96RT8） Mitotic-spindle organizing protein 2B × 1 （Q6NZ67） CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 × 2 （A0A0A0MRG9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MZT1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82 作者链 P； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82 作者链 Q； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82 作者链 R； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82 作者链 S； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82 作者链 T； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82 作者链 U； PDB构建体 1–82； UniProt 1–82

Protein NEDD1

Homo sapiens

UniProt Q8NHV4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Gamma-tubulin complex component 3 × 10 （Q96CW5） Mitotic-spindle organizing protein 1 × 7 （Q08AG7） Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed × 1 （P60709） Tubulin gamma-1 chain × 14 （P23258） Gamma-tubulin complex component 4 × 2 （Q9UGJ1） Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 2 × 5 （Q9BSJ2） TUBGCP6 protein × 1 （B2RWN4） Gamma-tubulin complex component 5 × 1 （Q96RT8） Mitotic-spindle organizing protein 2B × 1 （Q6NZ67） CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 × 2 （A0A0A0MRG9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NEDD1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–660； UniProt 1–660 作者链 W； PDB构建体 1–660； UniProt 1–660 作者链 X； PDB构建体 1–660； UniProt 1–660 作者链 Y； PDB构建体 1–660； UniProt 1–660

Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed

Homo sapiens

UniProt P60709

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Gamma-tubulin complex component 3 × 10 （Q96CW5） Mitotic-spindle organizing protein 1 × 7 （Q08AG7） Protein NEDD1 × 4 （Q8NHV4） Tubulin gamma-1 chain × 14 （P23258） Gamma-tubulin complex component 4 × 2 （Q9UGJ1） Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 2 × 5 （Q9BSJ2） TUBGCP6 protein × 1 （B2RWN4） Gamma-tubulin complex component 5 × 1 （Q96RT8） Mitotic-spindle organizing protein 2B × 1 （Q6NZ67） CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 × 2 （A0A0A0MRG9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ACTB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375

Tubulin gamma-1 chain

Homo sapiens

UniProt P23258

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Gamma-tubulin complex component 3 × 10 （Q96CW5） Mitotic-spindle organizing protein 1 × 7 （Q08AG7） Protein NEDD1 × 4 （Q8NHV4） Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed × 1 （P60709） Gamma-tubulin complex component 4 × 2 （Q9UGJ1） Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 2 × 5 （Q9BSJ2） TUBGCP6 protein × 1 （B2RWN4） Gamma-tubulin complex component 5 × 1 （Q96RT8） Mitotic-spindle organizing protein 2B × 1 （Q6NZ67） CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 × 2 （A0A0A0MRG9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TBG1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 b； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 c； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 d； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 e； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 f； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 g； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 h； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 i； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 j； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 k； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 l； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 m； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451 作者链 n； PDB构建体 1–451； UniProt 1–451

Gamma-tubulin complex component 4

Homo sapiens

UniProt Q9UGJ1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Gamma-tubulin complex component 3 × 10 （Q96CW5） Mitotic-spindle organizing protein 1 × 7 （Q08AG7） Protein NEDD1 × 4 （Q8NHV4） Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed × 1 （P60709） Tubulin gamma-1 chain × 14 （P23258） Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 2 × 5 （Q9BSJ2） TUBGCP6 protein × 1 （B2RWN4） Gamma-tubulin complex component 5 × 1 （Q96RT8） Mitotic-spindle organizing protein 2B × 1 （Q6NZ67） CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 × 2 （A0A0A0MRG9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	GCP4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–667； UniProt 1–667 作者链 K； PDB构建体 1–667； UniProt 1–667

Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 2

Homo sapiens

UniProt Q9BSJ2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Gamma-tubulin complex component 3 × 10 （Q96CW5） Mitotic-spindle organizing protein 1 × 7 （Q08AG7） Protein NEDD1 × 4 （Q8NHV4） Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed × 1 （P60709） Tubulin gamma-1 chain × 14 （P23258） Gamma-tubulin complex component 4 × 2 （Q9UGJ1） TUBGCP6 protein × 1 （B2RWN4） Gamma-tubulin complex component 5 × 1 （Q96RT8） Mitotic-spindle organizing protein 2B × 1 （Q6NZ67） CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 × 2 （A0A0A0MRG9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	GCP2_HUMAN
Isoform	Q9BSJ2-4
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–930； UniProt 1–930 作者链 C； PDB构建体 1–930； UniProt 1–930 作者链 E； PDB构建体 1–930； UniProt 1–930 作者链 G； PDB构建体 1–930； UniProt 1–930 作者链 M； PDB构建体 1–930； UniProt 1–930

TUBGCP6 protein

Homo sapiens

UniProt B2RWN4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Gamma-tubulin complex component 3 × 10 （Q96CW5） Mitotic-spindle organizing protein 1 × 7 （Q08AG7） Protein NEDD1 × 4 （Q8NHV4） Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed × 1 （P60709） Tubulin gamma-1 chain × 14 （P23258） Gamma-tubulin complex component 4 × 2 （Q9UGJ1） Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 2 × 5 （Q9BSJ2） Gamma-tubulin complex component 5 × 1 （Q96RT8） Mitotic-spindle organizing protein 2B × 1 （Q6NZ67） CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 × 2 （A0A0A0MRG9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	B2RWN4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–1811； UniProt 1–1811

Gamma-tubulin complex component 5

Homo sapiens

UniProt Q96RT8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Gamma-tubulin complex component 3 × 10 （Q96CW5） Mitotic-spindle organizing protein 1 × 7 （Q08AG7） Protein NEDD1 × 4 （Q8NHV4） Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed × 1 （P60709） Tubulin gamma-1 chain × 14 （P23258） Gamma-tubulin complex component 4 × 2 （Q9UGJ1） Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 2 × 5 （Q9BSJ2） TUBGCP6 protein × 1 （B2RWN4） Mitotic-spindle organizing protein 2B × 1 （Q6NZ67） CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 × 2 （A0A0A0MRG9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	GCP5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–1024； UniProt 1–1024

Mitotic-spindle organizing protein 2B

Homo sapiens

UniProt Q6NZ67

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Gamma-tubulin complex component 3 × 10 （Q96CW5） Mitotic-spindle organizing protein 1 × 7 （Q08AG7） Protein NEDD1 × 4 （Q8NHV4） Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed × 1 （P60709） Tubulin gamma-1 chain × 14 （P23258） Gamma-tubulin complex component 4 × 2 （Q9UGJ1） Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 2 × 5 （Q9BSJ2） TUBGCP6 protein × 1 （B2RWN4） Gamma-tubulin complex component 5 × 1 （Q96RT8） CDK5 regulatory subunit-associated protein 2 × 2 （A0A0A0MRG9）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MZT2B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 p； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158

CDK5 regulatory subunit-associated protein 2

Homo sapiens

UniProt A0A0A0MRG9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 48	Gamma-tubulin complex component 3 × 10 （Q96CW5） Mitotic-spindle organizing protein 1 × 7 （Q08AG7） Protein NEDD1 × 4 （Q8NHV4） Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed × 1 （P60709） Tubulin gamma-1 chain × 14 （P23258） Gamma-tubulin complex component 4 × 2 （Q9UGJ1） Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 2 × 5 （Q9BSJ2） TUBGCP6 protein × 1 （B2RWN4） Gamma-tubulin complex component 5 × 1 （Q96RT8） Mitotic-spindle organizing protein 2B × 1 （Q6NZ67）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0A0MRG9_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 w； PDB构建体 1–1663； UniProt 1–1663 作者链 x； PDB构建体 1–1663； UniProt 1–1663

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9qvm
沉积日期 deposition_date	2025-04-11
结构标题 title	Cryo-EM reconstruction of the NEDD1 anchor protein and CDK5RAP2 bound to the gamma-tubulin ring complex
关键词 keywords	Tubulin complex, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9qvm__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9qvm__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9qvm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	110.10 Å
总 Rg	110.10 Å
原子数	88888
残基数	17948
排除体积	1433400 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9qvm__assembly_1__model_1`	48-meric （48）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Gamma-tubulin complex component 3
分子量 formula_weight	103710.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,F,H,r,s,t,u,v,B,N
原子数 atom_count	88888

MATPDQKSPNVLLQNLCCRILGRSEADVAQQFQYAVRVIGSNFAPTVERDEFLVAEKIKKELIRQRREADAALFSELHRKLHSQGVLKNKWSILYLLLSLSEDPRRQPSKVSSYATLFAQALPRDAHSTPYYYARPQTLPLSYQDRSAQSAQSSGSVGSSGISSIGLCALSGPAPAPQSLLPGQSNQAPGVGDCLRQQLGSRLAWTLTANQPSSQATTSKGVPSAVSRNMTRSRREGDTGGTMEITEAALVRDILYVFQGIDGKNIKMNNTENCYKVEGKANLSRSLRDTAVRLSELGWLHNKIRRYTDQRSLDRSFGLVGQSFCAALHQELREYYRLLSVLHSQLQLEDDQGVNLGLESSLTLRRLLVWTYDPKIRLKTLAALVDHCQGRKGGELASAVHAYTKTGDPYMRSLVQHILSLVSHPVLSFLYRWIYDGELEDTYHEFFVASDPTVKTDRLWHDKYTLRKSMIPSFMTMDQSRKVLLIGKSINFLHQVCHDQTPTTKMIAVTKSAESPQDAADLFTDLENAFQGKIDAAYFETSKYLLDVLNKKYSLLDHMQAMRRYLLLGQGDFIRHLMDLLKPELVRPATTLYQHNLTGILETAVRATNAQFDSPEILRRLDVRLLEVSPGDTGWDVFSLDYHVDGPIATVFTRECMSHYLRVFNFLWRAKRMEYILTDIRKGHMCNAKLLRNMPEFSGVLHQCHILASEMVHFIHQMQYYITFEVLECSWDELWNKVQQAQDLDHIIAAHEVFLDTIISRCLLDSDSRALLNQLRAVFDQIIELQNAQDAIYRAALEELQRRLQFEEKKKQREIEGQWGVTAAEEEEENKRIGEFKESIPKMCSQLRILTHFYQGIVQQFLVLLTTSSDESLRFLSFRLDFNEHYKAREPRLRVSLGTRGRRSSHT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Mitotic-spindle organizing protein 1
分子量 formula_weight	8485.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	7

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,P,Q,R,S,T,U

MASSSGAGAAAAAAAANLNAVRETMDVLLEISRILNTGLDMETLSICVRLCEQGINPEALSSVIKELRKATEALKAAENMTS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Protein NEDD1
分子量 formula_weight	72051.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W,X,V,Y

MQENLRFASSGDDIKIWDASSMTLVDKFNPHTSPHGISSICWSSNNNFLVTASSSGDKIVVSSCKCKPVPLLELAEGQKQTCVNLNSTSMYLVSGGLNNTVNIWDLKSKRVHRSLKDHKDQVTCVTYNWNDCYIASGSLSGEIILHSVTTNLSSTPFGHGSNQSVRHLKYSLFKKSLLGSVSDNGIVTLWDVNSQSPYHNFDSVHKAPASGICFSPVNELLFVTIGLDKRIILYDTSSKKLVKTLVADTPLTAVDFMPDGATLAIGSSRGKIYQYDLRMLKSPVKTISAHKTSVQCIAFQYSTVLTKSSLNKGCSNKPTTVNKRSVNVNAASGGVQNSGIVREAPATSIATVLPQPMTSAMGKGTVAVQEKAGLPRSINTDTLSKETDSGKNQDFSSFDDTGKSSLGDMFSPIRDDAVVNKGSDESIGKGDGFDFLPQLNSVFPPRKNPVTSSTSVLHSSPLNVFMGSPGKEENENRDLTAESKKIYMGKQESKDSFKQLAKLVTSGAESGNLNTSPSSNQTRNSEKFEKPENEIEAQLICEPPINGSSTPNPKIASSVTAGVASSLSEKIADSIGNNRQNAPLTSIQIRFIQNMIQETLDDFREACHRDIVNLQVEMIKQFHMQLNEMHSLLERYSVNEGLVAEIERLREENKRLRAHF

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed
分子量 formula_weight	41782.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Tubulin gamma-1 chain
分子量 formula_weight	52022.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	14

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,b,c,e,f,g,h,i,j,k,l,m,n,d

MPREIITLQLGQCGNQIGFEFWKQLCAEHGISPEGIVEEFATEGTDRKDVFFYQADDEHYIPRAVLLDLEPRVIHSILNSPYAKLYNPENIYLSEHGGGAGNNWASGFSQGEKIHEDIFDIIDREADGSDSLEGFVLCHSIAGGTGSGLGSYLLERLNDRYPKKLVQTYSVFPNQDEMSDVVVQPYNSLLTLKRLTQNADCVVVLDNTALNRIATDRLHIQNPSFSQINQLVSTIMSASTTTLRYPGYMNNDLIGLIASLIPTPRLHFLMTGYTPLTTDQSVASVRKTTVLDVMRRLLQPKNVMVSTGRDRQTNHCYIAILNIIQGEVDPTQVHKSLQRIRERKLANFIPWGPASIQVALSRKSPYLPSAHRVSGLMMANHTSISSLFERTCRQYDKLRKREAFLEQFRKEDMFKDNFDEMDTSREIVQQLIDEYHAATRPDYISWGTQEQENLYFQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Gamma-tubulin complex component 4
分子量 formula_weight	76180.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,I

MIHELLLALSGYPGSIFTWNKRSGLQVSQDFPFLHPSETSVLNRLCRLGTDYIRFTEFIEQYTGHVQQQDHHPSQQGQGGLHGIYLRAFCTGLDSVLQPYRQALLDLEQEFLGDPHLSISHVNYFLDQFQLLFPSVMVVVEQIKSQKIHGCQILETVYKHSCGGLPPVRSALEKILAVCHGVMYKQLSAWMLHGLLLDQHEEFFIKQGPSSGNVSAQPEEDEEDLGIGGLTGKQLRELQDLRLIEEENMLAPSLKQFSLRVEILPSYIPVRVAEKILFVGESVQMFENQNVNLTRKGSILKNQEDTFAAELHRLKQQPLFSLVDFEQVVDRIRSTVAEHLWKLMVEESDLLGQLKIIKDFYLLGRGELFQAFIDTAQHMLKTPPTAVTEHDVNVAFQQSAHKVLLDDDNLLPLLHLTIEYHGKEHKADATQAREGPSRETSPREAPASGWAALGLSYKVQWPLHILFTPAVLEKYNVVFKYLLSVRRVQAELQHCWALQMQRKHLKSNQTDAIKWRLRNHMAFLVDNLQYYLQVDVLESQFSQLLHQINSTRDFESIRLAHDHFLSNLLAQSFILLKPVFHCLNEILDLCHSFCSLVSQNLGPLDERGAAQLSILVKGFSRQSSLLFKILSSVRNHQINSDLAQLLLRLDYNKYYTQAGGTLGSFGM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 2
分子量 formula_weight	105765.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,C,A,E,M

MSEFRIHHDVNELLSLLRVHGGDGAEVYIDLLQKNRTPYVTTTVSAHSAKVKIAEFSRTPEDFLKKYDELKSKNTRNLDPLVYLLSKLTEDKETLQYLQQNAKERAELAAAAVGSSTTSINVPAAASKISMQELEELRKQLGSVATGSTLQQSLELKRKMLRDKQNKKNSGQHLPIFPAWVYERPALIGDFLIGAGISTDTALPIVLLRWNLALSPRLKCSGVISAHCNLHLPGTLPLASQESAVVEDLLYVLVGVDGRYVSAQPLAGRQSRTFLVDPNLDLSIRELVHRILPVAASYSAVTRFIEEKSSFEYGQVNHALAAAMRTLVKEHLILVSQLEQLHRQGLLSLQKLWFYIQPAMRTMDILASLATSVDKGECLGGSTLSLLHDRSFSYTGDSQAQELCLYLTKAASAPYFEVLEKWIYRGIIHDPYSEFMVEEHELRKERIQEDYNDKYWDQRYTIVQQQIPSFLQKMADKILSTGKYLNVVRECGHDVTCPVAKEIIYTLKERAYVEQIEKAFNYASKVLLDFLMEEKELVAHLRSIKRYFLMDQGDFFVHFMDLAEEELRKPVEDITPPRLEALLELALRMSTANTDPFKDDLKIDLMPHDLITQLLRVLAIETKQEKAMAHADPTELALSGLEAFSFDYIVKWPLSLIINRKALTRYQMLFRHMFYCKHVERQLCSVWISNKTAKQHSLHSAQWFAGAFTLRQRMLNFVQNIQYYMMFEVMEPTWHILEKNLKSASNIDDVLGHHTGFLDTCLKDCMLTNPELLKVFSKLMSVCVMFTNCMQKFTQSMKLDGELGGQTLEHSTVLGLPAGAEERARKELARKHLAEHADTVQLVSGFEATINKFDKNFSAHLLDLLARLSIYSTSDCEHGMASVISRLDFNGFYTERLERLSAERSQKATPQVPVLRGPPAPAPRVAVTAQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	TUBGCP6 protein
分子量 formula_weight	199732.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MASITQLFDDLCEALLPAAKTHLGQRSVNRKRAKRSLKKVAYNALFTNLFQDETQQLQPDMSKLPARNKILMLSFDLRVGGLGPKADRLEELVEELEAAPCCPLLEVGSVLDLLVQLAGSGPPQVLPRKRDYFLNNKHVGRNVPYSGYDCDDLSVFEMDVQSLISREECLCHSMIQETLQVMEAAPGTGLPTVGLFSFGDPCGDRFERDTRVSLFGALVHSRTYDMDVRLGLPPVPDNADLSGLAIKVPPSVDQWEDEGFQSASNLTPDSQSEPSVTPDVDLWEAALTYEASKRRCWERVGCPPGHREEPYLTEAGRDAFDKFCRLHQGELQLLAGGVLQAPQPVLVKECELVKDVLNVLIGVVSATFSLCQPAQAFVVKRGVHVSGASPESISSLLSEVAEYGTCYTRLSHFSLQPVLDSLYSKGLVFQAFTSGLRRYLQYYRACVLSTPPTLSLLTIGFLFKKLGRQLRYLAELCGVGAVLPGTCGGGPRAAFPTGVKLLSYLYQEALHNCSNEHYPVLLSLLKTSCEPYTRFIHDWVYSGVFRDAYGEFMIQVNHEYLSFRDKLYWTHGYVLISKEVEDCVPVFLKHIAHDIYVCGKTINLLKLCCPRHYLCWSDVPVPRISVIFSLEELKEIEKDCAVYVGRMERVARHSSVSKEEKELRMEIAKQELIAHAREAASRVLSALSDRQMSERMALDARKREQFQRLKEQFVKDQERRQAARQEELDDDFSYARELRDRERRLKSLEEELERKASKLSAEAARREQKALWRIQRHRLESARLRFLLEDEKHIQEMLKAVSEAHQPQEPPDVLLSVHPQVTSPGPEHPEGGQGCDSGSAEQHSPAWDGWNRPGLLTPQPLKPLAVGAGGRGLQQAEGARPFSDSLSIGDFLPVGPGAEPSVQTGMVPLLEVALQTINLDLPPSAPGEAPAAASTQPSRPQEYDFSTVLRPAVATSPAPGPLQAAECSLGSSGLQLWEDSCGKMDACGSASRETLLPSHPPRRAALEEGSSQPTERLFGQVSGGGLPTGDYASEIAPTRPRWNTHGHVSDASIRVGENVSDVAPTQPRWNTHGHVSNASISLGESVSDVAPTRPRWNIHGHVSNASIRVGENVSDVAPTRPRWNTHGHVSNASIRVGENVSDVAPTRPRWNTHGHVSDASISLGESVSDMAPARPRWNTHGHVSDASISLGESVSDMAPTRPRWNTHGHVSDTSIRVGENVSDVAPIRSRCNTHGHVSDASISLGEPVSDVVSTRPRWNTHVPIPPPHMVLGALSPEAEPNTPRPQQSPPGHTSQSALSLGAQSAVLDCGPRLPVEVGPSLSSPSSGCGEGSISVGENVSDVAPTQPWWPNTPGDSVSEELGPGRSGDTEDLSPNWPLNSQEDTAAQSSPGRGEEAEASAAEAQGGEQAYLAGLAGQYHLERYPDSYESMSEPPIAHLLRPVLPRAFAFPVDPQVQSAADETAVQLSELLTLPVLMKRSITAPLAAHISLVNKAAVDYFFVELHLEAHYEALRHFLLMEDGEFAQSLSDLLFEKLGAGQTPGELLNPLVLNSVLSKALQCSLHGDTPHASNLSLALKYLPEVFAPNAPDVLSCLELRYKVDWPLNIVITEGCLSKYSGVFSFLLQLKLMMWALKDVCFHLKRTALLSHMAGSVQFRQLQLFKHEMQHFVKVIQGYIANQILHVTWCEFRARLATVGDLEEIQRAHAEYLHEAVFRGLLTEKAAPVMNVIHSIFSLVLKFRSQLISQAWGPPGGPRGAEHPNFALMQQSYNTFKYYSHFLFKVVTKLVNRGYQPHLEDFLLRINFNNYYQDA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Gamma-tubulin complex component 5
分子量 formula_weight	118467.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MARHGPPWSRLDAQQERDVRELVRGVAGLQDEADPNFQLALNFAWSNFRFHRFLDVNSHKIEKTIEGIYEKFVIHSDLSKAASWKRLTEEFLNAPLPSIKEIKTDAHYSILSLLLCLSDSPSNSSYVETPRNKEVEKKDDFDWGKYLMEDEEMDIGPYMDTPNWSEESEEENDQQPLSREDSGIQVDRTPLEEQDQNRKLDPCISWKDEPDDRSWLEHHVVHQYWTARPSQFPHSLHLHSNLAAVWDQHLYSSDPLYVPDDRVLVTETQVIRETLWLLSGVKKLFIFQLIDGKVTVRNNIIVTHLTHSCLRSVLEQIAAYGQVVFRLQEFIDEVMGHSSESMLPGSGSVPKKSTEAPFRTYQAFMWALYKYFISFKEELAEIEKCIINNDTTITLAIVVDKLAPRLSQLKVLHKVFSTGVAEVPPDTRNVVRASHLLNTLYKAILEYDNVGEASEQTVSLLFSLWVETVRPYLQTVDEWIVHGHLWDGAREFIIQRNKNVPVNHRDFWYATYTLYSVSEKTENEEKMSDNASASSGSDQGPSSRQHTMVSFLKPVLKQIIMAGKSMQLLKNLQCAESTTCQAGARDAERKSLYTLFLESVQSRLRHGEDSTPQVLTEQQATKENLMKMQSIAESHLELDDVHDPLLAINFARMYLEQSDFHEKFAGGDVCVDRSSESVTCQTFELTLRSCLYPHIDKQYLDCCGNLMQTLKKDYRLVEYLQAMRNFFLMEGGDTMYDFYTSIFDKIREKETWQNVSFLNVQLQEAVGQRYPEDSSRLSISFENVDTAKKKLPVHILDGLTLSYKVPWPVDIVISLECQKIYNQVFLLLLQIKWAKYSLDVLLFGELVSTAEKPRLKEGLIHEQDTVAQFGPQKEPVRQQIHRMFLLRVKLMHFVNSLHNYIMTRILHSTGLEFQHQVEEAKDLDQLIKIHYRYLSTIHDRCLLREKVSFVKEAIMKVLNLALMFADGWQAGLGTWRMESIEKMESDFKNCHMFLVTILNKAVCRGSFPHLESLALSLMAGMEQS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Mitotic-spindle organizing protein 2B
分子量 formula_weight	16246.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	p

MAAQGVGPGPGSAAPPGLEAARQKLALRRKKVLSTEEMELYELAQAAGGAIDPDVFKILVDLLKLNVAPLAVFQMLKSMCAGQRLASEPQDPAAVSLPTSSVPETRGRNKGSAALGGALALAERSSREGSSQRMPRQPSATRLPKGGGPGKSPTRGST

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	CDK5 regulatory subunit-associated protein 2
分子量 formula_weight	189905.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	x,w

MMDLVLEEDVTVPGTLSGCSGLVPSVPDDLDGINPNAGLGNGLLPNVSEETVSPTRARNMKDFENQITELKKENFNLKLRIYFLEERMQQEFHGPTEHIYKTNIELKVEVESLKRELQEREQLLIKASKAVESLAEAGGSEIQRVKEDARKKVQQVEDLLTKRILLLEKDVTAAQAELEKAFAGTETEKALRLRLESKLSEMKKMHEGDLAMALVLDEKDRLIEELKLSLKSKEALIQCLKEEKSQMACPDENVSSGELRGLCAAPREEKERETEAAQMEHQKERNSFEERIQALEEDLREKEREIATEKKNSLKRDKAIQGLTMALKSKEKKVEELNSEIEKLSAAFAKAREALQKAQTQEFQGSEDYETALSGKEALSAALRSQNLTKSTENHRLRRSIKKITQELSDLQQERERLEKDLEEAHREKSKGDCTIRDLRNEVEKLRNEVNEREKAMENRYKSLLSESNKKLHNQEQVIKHLTESTNQKDVLLQKFNEKDLEVIQQNCYLMAAEDLELRSEGLITEKCSSQQPPGSKTIFSKEKKQSSDYEELIQVLKKEQDIYTHLVKSLQESDSINNLQAELNKIFALRKQLEQDVLSYQNLRKTLEEQISEIRRREESFSLYSDQTSYLSICLEENNRFQVEHFSQEELKKKVSDLIQLVKELYTDNQHLKKTIFDLSCMGFQGNGFPDRLASTEQTEEAKKSRLPILIKPSRSLGNMYRLPATQEVVTQLQSQILELQGELKEFKTCNKQLHQKLILAEAVMEGRPTPDKTLLNAQPPVGAAYQDSPGEQKGIKTTSSVWRDKEMDSDQQRSYEIDSEICPPDDLASLPSCKENPEDVLSPTSVATYLSSKSQPSAKVSVMGTDQSESINTSNETEYLKQKIHDLETELEGYQNFIFQLQKHSQCSEAIITVLCGTEGAQDGLSKPKNGSDGEEMTFSSLHQVRYVKHVKILGPLAPEMIDSRVLENLKQQLEEQEYKLQKEQNLNMQLFSEIHNLQNKFRDLSPPRYDSLVQSQARELSLQRQQIKDGHGICVISRQHMNTMIKAFEELLQASDVDYCVAEGFQEQLNQCAELLEKLEKLFLNGKSVGVEMNTQNELMERIEEDNLTYQHLLPESPEPSASHALSDYETSEKSFFSRDQKQDNETEKTSVMVNSFSQDLLMEHIQEIRTLRKRLEESIKTNEKLRKQLERQGSEFVQGSTSIFASGSELHSSLTSEIHFLRKQNQALNAMLIKGSRDKQKENDKLRESLSRKTVSLEHLQREYASVKEENERLQKEGSEKERHNQQLIQEVRCSGQELSRVQEEVKLRQQLLSQNDKLLQSLRVELKAYEKLDEEHRRLREASGEGWKGQDPFRDLHSLLMEIQALRLQLERSIETSSTLQSRLKEQLARGAEKAQEGALTLAVQAVSIPEVPLQPDKHDGDKYPMESDNSFDLFDSSQAVTPKSVSETPPLSGNDTDSLSCDSGSSATSTPCVSRLVTGHHLWASKNGRHVLGLIEDYEALLKQISQGQRLLAEMDIQTQEAPSSTSQELGTKGPHPAPLSKFVSSVSTAKLTLEEAYRRLKLLWRVSLPEDGQCPLHCEQIGEMKAEVTKLHKKLFEQEKKLQNTMKLLQLSKRQEKVIFDQLVVTHKILRKARGNLELRPGGAHPGTCSPSRPGS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	6.800 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	6.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	71778

Cryo-EM reconstruction of the NEDD1 anchor protein and CDK5RAP2 bound to the gamma-tubulin ring complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gamma-tubulin complex component 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitotic-spindle organizing protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein NEDD1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tubulin gamma-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Gamma-tubulin complex component 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Isoform 3 of Gamma-tubulin complex component 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

TUBGCP6 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Gamma-tubulin complex component 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mitotic-spindle organizing protein 2B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体