SAXSdb — 9rt2

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Leukocidin/Hemolysin toxin family

Clostridium perfringens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12）与蛋白拷贝数一致	链 N1； UniProt 25–305 链 N2； UniProt 25–305 链 N3； UniProt 25–305 链 N4； UniProt 25–305 链 N5； UniProt 25–305 链 N6； UniProt 25–305 链 N7； UniProt 25–305 链 N8； UniProt 25–305	未记录	Anthrax toxin receptor 2 × 4 （P58335）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9RT2	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9RSM NetF 9mer pre-pore structure on 2N2 nanodiscs. 提交 2025-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 A 25–305（281 aa）链 B 25–305（281 aa）链 C 25–305（281 aa）链 D 25–305（281 aa）链 E 25–305（281 aa）链 F 25–305（281 aa）链 G 25–305（281 aa）链 H 25–305（281 aa）链 I 25–305（281 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.13 Å
9RSU NetF pore structure 提交 2025-07-01	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 25–305（281 aa）链 B 25–305（281 aa）链 C 25–305（281 aa）链 D 25–305（281 aa）链 E 25–305（281 aa）链 F 25–305（281 aa）链 G 25–305（281 aa）链 H 25–305（281 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
9RT4 NetF - ANTXR2 local refinement focused 提交 2025-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N2 25–305（281 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0D3QGV4_CLOPF
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 N1； PDB构建体 9–289； UniProt 25–305 作者链 N2； PDB构建体 9–289； UniProt 25–305 作者链 N3； PDB构建体 9–289； UniProt 25–305 作者链 N4； PDB构建体 9–289； UniProt 25–305 作者链 N5； PDB构建体 9–289； UniProt 25–305 作者链 N6； PDB构建体 9–289； UniProt 25–305 作者链 N7； PDB构建体 9–289； UniProt 25–305 作者链 N8； PDB构建体 9–289； UniProt 25–305

Anthrax toxin receptor 2

Homo sapiens

UniProt P58335

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12）与蛋白拷贝数一致	链 C1； UniProt 34–318 链 C2； UniProt 34–318 链 C3； UniProt 34–318 链 C4； UniProt 34–318	突变：deleted TM and cytoplasmic domains	Leukocidin/Hemolysin toxin family × 8 （A0A0D3QGV4）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9RT2	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1SHT Crystal Structure of the von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis protein 2: an anthrax toxin receptor 提交 2004-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 X 38–217（180 aa）片段：VWA domain	未记录	ACT ACETATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEG8K, magnesium acetate, sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.81 Å R-free 0.186
1SHU Crystal Structure of the von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis protein 2: an anthrax toxin receptor 提交 2004-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 X 38–218（181 aa）片段：VWA domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG3350, magnesium chloride, bis-tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.215
1T6B Crystal structure of B. anthracis Protective Antigen complexed with human Anthrax toxin receptor 提交 2004-05-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Y 35–212（178 aa）片段：A/I domain	未记录	CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；300 K；CHES buffer, PEG400, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 2.50 Å R-free 0.266
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 a 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 b 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 c 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 d 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 e 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 f 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 o 38–218（181 aa）片段：VWA domain	未记录	CA CALCIUM ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 g 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 h 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 i 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 j 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 k 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 l 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 m 38–218（181 aa）片段：VWA domain	未记录	CA CALCIUM ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 a 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 b 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 c 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 d 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 e 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 f 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 g 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 h 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 i 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 j 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 k 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 l 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 m 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 o 38–218（181 aa）片段：VWA domain	未记录	CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 a 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 b 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 c 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 d 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 e 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 f 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 g 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 h 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 i 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 j 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 k 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 l 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 m 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 o 38–218（181 aa）片段：VWA domain	未记录	CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 a 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 b 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 c 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 d 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 e 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 f 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 g 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 h 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 i 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 j 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 k 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 l 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 m 38–218（181 aa）片段：VWA domain 链 o 38–218（181 aa）片段：VWA domain	未记录	CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.30 Å R-free 0.330
7N1O The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone 提交 2021-05-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 40–217（178 aa）	突变：1TEL: R41A,D46G,V112E,K122A,vWa: R49A,C175A,V112A,K112A	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；298 K；100 mM BisTris, 3.0 M NaCl	分辨率 2.77 Å R-free 0.228
8FT6 The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, SUMO tag-free preparation. 提交 2023-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 40–217（178 aa）	突变：R14A,V77E,K87A,R89A,R91A,A225V	CIT CITRIC ACID × 1 IOD IODIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.2M Ammonium citrate tribasic, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.62 Å R-free 0.234
8FT8 The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, SUMO tag-free preparation 提交 2023-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 40–217（178 aa）	突变：R14A,V77E,K87A,R89A,R91T,A92V,A225V	GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 3 K POTASSIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES, 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.60 Å R-free 0.204
8FZ4 The von Willebrand factor A domain of Anthrax toxin receptor 2 提交 2023-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 37–217（181 aa）	突变：P37G, C39A, C175A	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；1.2 uL of 20 mg/mL protein in 12.5 mM Tris pH 8.8, 200mM KCl, 10mM MgCl2 combined with 1.2 uL of 0.1 M Glycine pH 9.5, 24% PEG 3350	分辨率 2.19 Å R-free 0.256
8FZ4 The von Willebrand factor A domain of Anthrax toxin receptor 2 提交 2023-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 37–217（181 aa）	突变：P37G, C39A, C175A	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；298 K；1.2 uL of 20 mg/mL protein in 12.5 mM Tris pH 8.8, 200mM KCl, 10mM MgCl2 combined with 1.2 uL of 0.1 M Glycine pH 9.5, 24% PEG 3350	分辨率 2.19 Å R-free 0.256
8FZU The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, Expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 39–217（179 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
8FZU The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, Expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 39–217（179 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
8FZU The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, Expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 39–217（179 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
8FZV The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 40–217（178 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate	分辨率 3.29 Å R-free 0.314
8FZV The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 40–217（178 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 32	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate	分辨率 3.29 Å R-free 0.314
8FZV The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 40–217（178 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 58	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate	分辨率 3.29 Å R-free 0.314
9DOC The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, at 1.2 Angstrom resolution 提交 2024-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 43–217（175 aa）片段：von Willebrand factor A domain of CMG2	突变：TELSAM: R80S,V112E (Uniprot numbering),vWA: C175A (Uniprot numbering)	GOL GLYCEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 7 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.25；298 K；100 mM Bis-Tris, pH 7.25, 1350 mM Sodium Potassium Phosphate	分辨率 1.19 Å R-free 0.197
9RT4 NetF - ANTXR2 local refinement focused 提交 2025-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C1 34–318（285 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
9YKB The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Val linker variant, expressed with SUMO tag. 提交 2025-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 40–217（178 aa）	突变：R4A,V67E,K77A,R81A,A82V,C215A	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M BisTrisPropane, 1.5M Ammonium Sulfate	分辨率 2.50 Å R-free 0.194
9YKB The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Val linker variant, expressed with SUMO tag. 提交 2025-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 40–217（178 aa）	突变：R4A,V67E,K77A,R81A,A82V,C215A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M BisTrisPropane, 1.5M Ammonium Sulfate	分辨率 2.50 Å R-free 0.194
9YKB The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Val linker variant, expressed with SUMO tag. 提交 2025-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 40–217（178 aa）	突变：R4A,V67E,K77A,R81A,A82V,C215A	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M BisTrisPropane, 1.5M Ammonium Sulfate	分辨率 2.50 Å R-free 0.194

共 13 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ANTR2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C1； PDB构建体 1–285； UniProt 34–318 作者链 C2； PDB构建体 1–285； UniProt 34–318 作者链 C3； PDB构建体 1–285； UniProt 34–318 作者链 C4； PDB构建体 1–285； UniProt 34–318

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9rt2
沉积日期 deposition_date	2025-07-01
结构标题 title	NetF - ANTXR2 structure (C4)
关键词 keywords	NetF, clostridium perfringens, hemolysin, CMG2, ANTXR2, toxin receptor interaction, transmembrane beta-barrel, TOXIN; TOXIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	49.93 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	49.77 Å
零角强度 I(0) i0	1882030000.00
分子量 molecular_weight	365170.0 kDa
排除体积 excluded_volume	458310 Å³
包络体积 envelope_volume	641460 Å³
水化壳体积 shell_volume	106430 Å³
包络直径 envelope_diameter	160.7 Å
壳层 Rg shell_rg	55.60 Å
包络 Rg envelope_rg	47.87 Å
形状 Rg shape_rg	49.74 Å
总 Rg total_rg	50.07 Å
总原子数 total_atoms	51141
残基数 n_residues	3279
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	151.0 Å
Rg (实空间) rg_real	49.74 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.90 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.8820e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.0110e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	50.07 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1883000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8796
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	66.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.134
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.390
角度范围 angular_range	— – 0.1600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	143200000.0000
实空间数据点数 n_real_points	33
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.945; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.965; Smooth: 0.632

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Leukocidin/Hemolysin toxin family
分子量 formula_weight	32874.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N1,N2,N3,N4,N5,N6,N7,N8
原子数 atom_count	51141

MVHHHHHHNSFPESIINSKGKQAEVYTSSDASERDGIKTSLSASFIEDPNSNNLTALVSLKGFIPSGLIKTGTYYSANMYWPSKYNINIETTDEKNNVKILESIPSNTIETVRVTESMGYSIGGNVSVSKKSSSVGANAGFNVQRSVQYEQPDFKTIQKSDGIRKASWNIVFNKTKDGYDQNSYHALYGNQLFMKSRLHNTGAKNLVEDKDLSPLISGGFTPNMVIALKAPKGTKKSMINLNYNLYQDLYTLEWYKTQWWGENRVAKEPYYTYQTYELDWENHTVEFIY

来源 Source

来源生物 organism	Clostridium perfringens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1502
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Anthrax toxin receptor 2
分子量 formula_weight	34978.7 kDa
突变 mutation	deleted TM and cytoplasmic domains
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C1,C2,C3,C4

QEQPSCRRAFDLYFVLDKSGSVANNWIEIYNFVQQLAERFVSPEMRLSFIVFSSQATIILPLTGDRGKISKGLEDLKRVSPVGETYIHEGLKLANEQIQKAGGLKTSSIIIALTDGKLDGLVPSYAEKEAKISRSLGASVYCVGVLDFEQAQLERIADSKEQVFPVKGGFQALKGIINSILAQSCTEILELQPSSVCVGEEFQIVLSGRGFMLGSRNGSVLCTYTVNETYTTSVKPVSVQLNSMLCPAPILNKAGETLDVSVSFNGGKSVISGSLIVTATECSNGRTENLYFQGGAGARSIEGRIVKDYKDDDDKHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	67074

fit	/app/data/saxs_computation/rt/9rt2/9rt2.fit
pddf	/app/data/pr_computation/rt/9rt2/9rt2.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/rt/9rt2/9rt2.dat

NetF - ANTXR2 structure (C4)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Leukocidin/Hemolysin toxin family

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Anthrax toxin receptor 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)