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Cyro-EM structure of prefusion RSV fusion glycoprotein in complex with Ziresovir and motavizumab Fab

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 105.1 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fusion glycoprotein F0,Fibritin

Tequatrovirus T4

UniProt P03420

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–513 链 B； UniProt 1–513 链 C； UniProt 1–513 未记录 Motavizumab Fab heavy chain × 3 Motavizumab Fab light chain × 3 A1EV1 ~{N}-[(3-azanyloxetan-3-yl)methyl]-2-[1,1-bis(oxidanylidene)-3,5-dihydro-2~{H}-1$l^{6},4-benzothiazepin-4-yl]-6-methyl-quinazolin-4-amine × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.27 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9WDP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
29QJ Respiratory syncytial virus fusion protein N-terminal heptad repeat domain in complex with Double stapled peptide 4/4g 提交 2026-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 159–209（51 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.32 Å R-free 0.232
3IXT Crystal Structure of Motavizumab Fab Bound to Peptide Epitope 提交 2009-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 254–277（24 aa） 片段：sequence database residues 254-277
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；17.5% PEG 8000, 0.2 M zinc acetate, 0.1 M cacodylate pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.75 Å R-free 0.274
3IXT Crystal Structure of Motavizumab Fab Bound to Peptide Epitope 提交 2009-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 254–277（24 aa） 片段：sequence database residues 254-277
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；17.5% PEG 8000, 0.2 M zinc acetate, 0.1 M cacodylate pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.75 Å R-free 0.274
3KPE Solution structure of the respiratory syncytial virus (RSV)six-helix bundle complexed with TMC353121, a small-moleucule inhibitor of RSV 提交 2009-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 159–209（51 aa） 片段：proteinase K-resistant core of heptad repeat 1
链 B 482–520（39 aa） 片段：proteinase K-resistant core of heptad repeat 2
未记录 TM3 2-[[6-[[[2-(3-hydroxypropyl)-5-methylphenyl]amino]methyl]-2-[[3-(4-morpholinyl)propyl]amino]-1H-benzimidazol-1-yl]methyl]-6-methyl-3-pyridinol × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；30% (v/v) PEG-400 + 100 mM HEPES, pH 7.5 + 200 mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.47 Å R-free 0.196
3O41 Crystal Structure of 101F Fab Bound to 15-mer Peptide Epitope 提交 2010-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 422–436（15 aa） 片段：Residues 422-436
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20.5% (w/v) PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.217
3O41 Crystal Structure of 101F Fab Bound to 15-mer Peptide Epitope 提交 2010-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 422–436（15 aa） 片段：Residues 422-436
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20.5% (w/v) PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.217
3O45 Crystal Structure of 101F Fab Bound to 17-mer Peptide Epitope 提交 2010-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 422–438（17 aa） 片段：UNP residues 422-438
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20.5% (w/v) PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.87 Å R-free 0.254
3O45 Crystal Structure of 101F Fab Bound to 17-mer Peptide Epitope 提交 2010-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 422–438（17 aa） 片段：UNP residues 422-438
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；20.5% (w/v) PEG 4000, 0.2 M lithium sulfate monohydrate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.87 Å R-free 0.254
3RKI Structural basis for immunization with post-fusion RSV F to elicit high neutralizing antibody titers 提交 2011-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–524（524 aa） 片段：Respiratory Syncytial Virus F, residues 1-524
链 B 1–524（524 aa） 片段：Respiratory Syncytial Virus F, residues 1-524
链 C 1–524（524 aa） 片段：Respiratory Syncytial Virus F, residues 1-524
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.1；298 K；4.2 M Sodium Formate, 100 mM Sodium Acetate, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.264
4JHW Crystal Structure of Respiratory Syncytial Virus Fusion Glycoprotein Stabilized in the Prefusion Conformation by Human Antibody D25 提交 2013-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 F 26–109（84 aa）
链 F 137–513（377 aa）
突变：P102A, I379V, M447V 突变：P102A, I379V, M447V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；30% (w/v) PEG 400, 3.75% (w/v) PEG 3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, and 1% (v/v) 1,2-butanediol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.60 Å R-free 0.267
4MMQ Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F Variant DS 提交 2013-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 26–107（82 aa）
链 B 137–513（377 aa）
突变：P102A 突变：S155C, S290C, I379V, M447V SO4 SULFATE ION × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；1.4 M K/Na tartrate, 0.1M CHES pH 9.5, 0.2 M LiSO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.25 Å R-free 0.274
4MMR Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F Variant Cav1 at pH 9.5 提交 2013-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 26–107（82 aa）
链 B 137–513（377 aa）
突变：P102A 突变：S190F, V207L, I379V, M447V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；1.4M sodium potassium tartarate, 0.1M CHES, pH 9.5, 0.2M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.264
4MMS Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F Variant Cav1 at pH 5.5 提交 2013-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 26–107（82 aa）
链 B 137–513（377 aa）
链 C 26–107（82 aa）
链 D 137–513（377 aa）
链 E 26–107（82 aa）
链 F 137–513（377 aa）
突变：P102A 突变：S190F, V207L, I379V, M447V 突变：P102A 突变：S190F, V207L, I379V, M447V 突变：P102A 突变：S190F, V207L, I379V, M447V SO4 SULFATE ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M citrate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.214
4MMT Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F Variant DS-Cav1 at pH 9.5 提交 2013-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 26–107（82 aa）
链 B 137–513（377 aa）
突变：P102A 突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；1.8 M Na/K tartrate, 0.2 M LiSO4, 0.1 M CHES pH9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.05 Å R-free 0.243
4MMU Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F Variant DS-Cav1 at pH 5.5 提交 2013-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 26–107（82 aa）
链 B 137–513（377 aa）
突变：P102A 突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447V SO4 SULFATE ION × 12 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；1.8 M Ammonium sulphate 0.1 M citrate pH5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.00 Å R-free 0.228
4MMV Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F Variant DS-Cav1-TriC at pH 9.5 提交 2013-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 26–107（82 aa）
链 B 137–513（377 aa）
突变：P102A 突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447, VD486H, E487Q, F488W, D489H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；1.4M sodium potassium tartarate, 0.1M CHES, pH 9.5, 0.2M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.81 Å R-free 0.279
4ZYP Crystal Structure of Motavizumab and Quaternary-Specific RSV-Neutralizing Human Antibody AM14 in Complex with Prefusion RSV F Glycoprotein 提交 2015-05-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 A 26–513（488 aa）
链 B 26–513（488 aa）
链 C 26–513（488 aa）
突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447V 突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447V 突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；5.645mg/mL EndoH digested DS-Cav1 + AM14 Fab + Motavizumab Fab, 11.4% PEG8000, 1.71% MPD, 0.1M Imidazole pH 6.5
分辨率 5.50 Å R-free 0.277
5C69 Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F variant PR-DM 提交 2015-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 26–518（493 aa） 片段：F2 subunit, F1 subunit ectodomain
突变：N67I, S215P, I379V, M447V SO4 SULFATE ION × 42 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 12 CL CHLORIDE ION × 30 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；1.24M K/Na tartrate, 0.2M LiSO4, 0.1M CHES pH 9.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.217
5C6B Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F variant SC-TM 提交 2015-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 26–513（488 aa） 片段：ectodomain
突变：N67I, S215P, E487Q, I379V, M447V,N67I, S215P, E487Q, I379V, M447V NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 6 SO4 SULFATE ION × 24 CL CHLORIDE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；293 K；1.34M K/Na tartrate, 0.2M LiSO4, 0.1M CHES pH 9.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.211
5EA3 Crystal Structure of Inhibitor JNJ-2408068 in Complex with Prefusion RSV F Glycoprotein 提交 2015-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–513（513 aa） 片段：RSV F ectodomain (UNP residues 1-513)
突变：V207L, S190F, S155C, S290C NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 3 SO4 SULFATE ION × 18 5NK 2-[[2-[[1-(2-azanylethyl)piperidin-4-yl]amino]-4-methyl-benzimidazol-1-yl]methyl]-6-methyl-pyridin-3-ol × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；1.54 M potassium/sodium tartrate, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M CHES, pH 9.5
分辨率 2.75 Å R-free 0.229
5EA4 Crystal Structure of Inhibitor JNJ-49153390 in Complex with Prefusion RSV F Glycoprotein 提交 2015-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–513（513 aa） 片段：RSV F ectodomain (UNP residues 1-513)
突变：S190F, V207L, S155C, S290C NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 3 SO4 SULFATE ION × 15 5NM 3-[[5-bromanyl-1-(3-methylsulfonylpropyl)benzimidazol-2-yl]methyl]-1-cyclopropyl-imidazo[4,5-c]pyridin-2-one × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；1.54 M potassium/sodium tartrate, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M CHES, pH 9.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.214
5EA5 Crystal Structure of Inhibitor TMC-353121 in Complex with Prefusion RSV F Glycoprotein 提交 2015-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–513（513 aa） 片段：RSV F ectodomain (UNP residues 1-513)
突变：S190F, V207L, S155C, S290C NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 3 TM3 2-[[6-[[[2-(3-hydroxypropyl)-5-methylphenyl]amino]methyl]-2-[[3-(4-morpholinyl)propyl]amino]-1H-benzimidazol-1-yl]methyl]-6-methyl-3-pyridinol × 3 SO4 SULFATE ION × 3 TAR D(-)-TARTARIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；1.54 M potassium/sodium tartrate, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M CHES, pH 9.5
分辨率 3.05 Å R-free 0.248
5EA6 Crystal Structure of Inhibitor BTA-9881 in Complex with Prefusion RSV F Glycoprotein 提交 2015-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–513（513 aa） 片段：RSV F ectodomain (UNP residues 1-513)
突变：S190F, V207L, S155C, S290C NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 3 SO4 SULFATE ION × 12 5NP (9~{b}~{R})-9~{b}-(4-chlorophenyl)-1-pyridin-3-ylcarbonyl-2,3-dihydroimidazo[5,6]pyrrolo[1,2-~{a}]pyridin-5-one × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；1.54 M potassium/sodium tartrate, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M CHES, pH 9.5
分辨率 2.75 Å R-free 0.235
5EA7 Crystal Structure of Inhibitor BMS-433771 in Complex with Prefusion RSV F Glycoprotein 提交 2015-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–513（513 aa） 片段：RSV F ectodomain (UNP residues 1-513)
突变：S190F, V207L, S155C, S290C SO4 SULFATE ION × 15 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 3 5NO 1-cyclopropyl-3-[[1-(4-oxidanylbutyl)benzimidazol-2-yl]methyl]imidazo[4,5-c]pyridin-2-one × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；1.54 M potassium/sodium tartrate, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M CHES, pH 9.5
分辨率 2.85 Å R-free 0.241
5EA8 Crystal Structure of Prefusion RSV F Glycoprotein Fusion Inhibitor Resistance Mutant D489Y 提交 2015-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–513（513 aa） 片段：RSV F ectodomain (UNP residues 1-513)
突变：S190F, V207L, S155C, S290C, D489Y SO4 SULFATE ION × 15 NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 3 TAR D(-)-TARTARIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；1.54 M potassium/sodium tartrate, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M CHES, pH 9.5
分辨率 2.60 Å R-free 0.237
5J3D Crystal structure of human Fab 14N4 in complex with post-fusion RSV F 提交 2016-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 26–98（73 aa） 片段：UNP residues 26-98
链 F 147–513（367 aa） 片段：UNP residues 147-513
链 G 26–98（73 aa） 片段：UNP residues 26-98
链 I 147–513（367 aa） 片段：UNP residues 147-513
链 J 26–98（73 aa） 片段：UNP residues 26-98
链 K 147–513（367 aa） 片段：UNP residues 147-513
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；2 M ammonium sulfate, 5% 2-propanol
分辨率 4.08 Å R-free 0.282
5K6B Crystal structure of prefusion-stabilized RSV F single-chain 9 DS-Cav1 variant. 提交 2016-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 26–105（80 aa） 片段：UNP residues 26-105 linked to residues 145-509 via LINKER residues GS
链 F 145–509（365 aa） 片段：UNP residues 26-105 linked to residues 145-509 via LINKER residues GS
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 SO4 SULFATE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M NaOAc-Acetic Acid pH 5.5, 1.09 M Li2SO4, 0.12 M MgSO4, 3.33 % (w/v) PEG 400
分辨率 2.98 Å R-free 0.260
5K6C Crystal structure of prefusion-stabilized RSV F single-chain 9-10 DS-Cav1 variant. 提交 2016-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 26–103（78 aa） 片段：UNP residues 26-101 linked to residues 145-509 via LINKER residues ATGS
链 F 145–509（365 aa） 片段：UNP residues 26-101 linked to residues 145-509 via LINKER residues ATGS
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.19 M (NH4)2SO4, 11 % iso-propanol, 17 % PEG 8,000
分辨率 3.58 Å R-free 0.262
5K6F Crystal structure of prefusion-stabilized RSV F single-chain 9-19 DS-Cav1 variant. 提交 2016-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 26–103（78 aa） 片段：UNP residues 26-103 linked to residues 145-509 via LINKER residues GGSGGSG
链 F 145–509（365 aa） 片段：UNP residues 26-103 linked to residues 145-509 via LINKER residues GGSGGSG
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Na citrate pH 5.6, 15 % iso-propanol, 17 % PEG 4,000
分辨率 2.59 Å R-free 0.237
5K6G Crystal structure of prefusion-stabilized RSV F single-chain 9-24 DS-Cav1 variant. 提交 2016-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 26–96（71 aa） 片段：UNP residues 26-79 and UNP residues 145-509 linked via LINKER residues GS
链 F 145–509（365 aa） 片段：UNP residues 26-79 and UNP residues 145-509 linked via LINKER residues GS
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M NaOAc-Acetic Acid pH 5.5, 1.82 M Li2SO4, 0.1 M MgSO4, 5 % (w/v) PEG 400
分辨率 2.90 Å R-free 0.287
5K6H Crystal structure of prefusion-stabilized RSV F single-chain 9-10 DS-Cav1 A149C-Y458C variant. 提交 2016-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 26–103（78 aa） 片段：UNP residues 26-103 linked to residues 145-509 via LINKER residues GS
链 F 145–509（365 aa） 片段：UNP residues 26-103 linked to residues 145-509 via LINKER residues GS
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M phosphate-citrate, pH4.2, 0.12 M NaCl, 9.5% (w/v) PEG 8,000
分辨率 2.65 Å R-free 0.252
5K6I Crystal structure of prefusion-stabilized RSV F single-chain 9-10 DS-Cav1 A149C-Y458C, S46G-E92D-S215P-K465Q variant. 提交 2016-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 26–103（78 aa） 片段：UNP residues 26-103 and residues 145-509 linked via LINKER residues GS
链 F 145–509（365 aa） 片段：UNP residues 26-103 and residues 145-509 linked via LINKER residues GS
未记录 ZN ZINC ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Na Cacodylate, pH 6.5, 0.2M ZnAC, 17% (w/v) PEG 8,000
分辨率 2.92 Å R-free 0.253
5TOJ Crystal structure of the RSV F glycoprotein in complex with the neutralizing single-domain antibody F-VHH-4 提交 2016-10-17 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–513（513 aa）
链 B 1–513（513 aa）
链 C 1–513（513 aa）
突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447V 突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447V 突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；2.45 mg/mL EndoH-digested DS-Cav1 + F-VHH-4, 14.75% w/v PEG3350, 8.8% v/v isopropanol, 0.2 M ammonium citrate
分辨率 3.30 Å R-free 0.234
5TOK Crystal structure of the RSV F glycoprotein in complex with the neutralizing single-domain antibody F-VHH-L66 提交 2016-10-17 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–513（513 aa）
链 B 1–513（513 aa）
链 C 1–513（513 aa）
突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447V 突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447V 突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447V NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；293 K；4.79 mg/mL EndoH-digested DS-Cav1 + F-VHH-L66, 0.05 M potassium phosphate, 20% w/v PEG4000
分辨率 3.80 Å R-free 0.286
5TPN Crystal structure of RSV F in complex with human antibody hRSV90 提交 2016-10-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–513（487 aa）
突变：N67I, S215P, I379V, M447V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；30% PEG, 400/200 mM MgCl2, 6H2O/100 mM HEPES pH 7.5
分辨率 3.14 Å R-free 0.262
5U68 Structural basis for antibody cross-neutralization of respiratory syncytial virus and human metapneumovirus 提交 2016-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–513（513 aa） 片段：UNP P03420 residues 1-513,UNP M1E1E4 residues 1-28
链 B 1–513（513 aa） 片段：UNP P03420 residues 1-513,UNP M1E1E4 residues 1-28
链 C 1–513（513 aa） 片段：UNP P03420 residues 1-513,UNP M1E1E4 residues 1-28
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M Potassium Nitrate, 0.1M Citrate Phosphate pH 4.2, 1 % Tacsimate pH 7.0, 14 (w/v) % PEG 6000
分辨率 3.08 Å R-free 0.239
5UDC Crystal Structure of RSV F A2 Bound to MEDI8897 提交 2016-12-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–513（513 aa）
链 D 1–513（513 aa）
链 F 1–513（513 aa）
突变：S155C, S290C, S190F, V207L 突变：S155C, S290C, S190F, V207L 突变：S155C, S290C, S190F, V207L CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；10% w/v PEG8000, 20% v/v ethylene glycol, 0.1 M Tris/BICINE pH 8.5, 0.02 M carboxylic acids, 0.3 M NDSB-195
分辨率 3.45 Å R-free 0.232
5W23 Crystal Structure of RSV F in complex with 5C4 Fab 提交 2017-06-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 1–513（513 aa） 片段：UNP residues 1-513
链 B 1–513（513 aa） 片段：UNP residues 1-513
链 C 1–513（513 aa） 片段：UNP residues 1-513
未记录 ZN ZINC ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Seed stock: 0.01 M zinc sulfate heptahydrate, 0.1 M MES hydrate pH 6.5, 22.5% v/v PEG MME 550 and 0.5% w/v polyvinylpyrrolidone K15 Reservoir solution: 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5 and 25% PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.239
6CXC 3.9A Cryo-EM structure of murine antibody bound at a novel epitope of respiratory syncytial virus fusion protein 提交 2018-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 26–526（501 aa）
链 B 26–526（501 aa）
链 C 26–526（501 aa）
链 D 26–526（501 aa）
链 E 26–526（501 aa）
链 F 26–526（501 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.90 Å
6DC3 RSV prefusion F bound to RSD5 Fab 提交 2018-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 1–513（513 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 13 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.8 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.0
分辨率 3.50 Å R-free 0.205
6DC5 RSV prefusion F in complex with AM22 Fab 提交 2018-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–513（513 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CD CADMIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；32% PEG 400, 4% PEG 3350, 0.01 M cadmium chloride, 0.1 M sodium acetate pH 5.5
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
6DC5 RSV prefusion F in complex with AM22 Fab 提交 2018-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–513（513 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CD CADMIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；32% PEG 400, 4% PEG 3350, 0.01 M cadmium chloride, 0.1 M sodium acetate pH 5.5
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
6DC5 RSV prefusion F in complex with AM22 Fab 提交 2018-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 1–513（513 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CD CADMIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；32% PEG 400, 4% PEG 3350, 0.01 M cadmium chloride, 0.1 M sodium acetate pH 5.5
分辨率 3.50 Å R-free 0.280
6OE4 Prefusion RSV F monomer bound by neutralizing antibody CR9501 提交 2019-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–513（513 aa）
突变：S155C, S290C EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；4.2mg/mL monomeric prefusion F (DS-Cav1) + CR9501 Fab, 14.3% (w/v) PEG8000, 2.4% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M sodium citrate pH 5.5, 0.1 M sodium malonate pH 7.0
分辨率 3.30 Å R-free 0.259
6OE4 Prefusion RSV F monomer bound by neutralizing antibody CR9501 提交 2019-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–513（513 aa）
突变：S155C, S290C EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；4.2mg/mL monomeric prefusion F (DS-Cav1) + CR9501 Fab, 14.3% (w/v) PEG8000, 2.4% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M sodium citrate pH 5.5, 0.1 M sodium malonate pH 7.0
分辨率 3.30 Å R-free 0.259
6OE5 Splayed open prefusion RSV F captured by CR9501 and motavizumab Fabs 提交 2019-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–513（513 aa）
突变：N67I, S215P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；4.69 mg/mL prefusion F (PR-DM) + motavizumab Fab + CR9501 Fab, 30% (v/v) PEG400, 0.19 M ammonium sulfate, 3.1% (w/v) PEG8000, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 4.10 Å R-free 0.306
6OUS Structure of fusion glycoprotein from human respiratory syncytial virus 提交 2019-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 26–109（84 aa）
链 B 137–513（377 aa）
链 C 26–109（84 aa）
链 D 137–513（377 aa）
链 E 26–109（84 aa）
链 F 137–513（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Tris 8.5, 10% PEG 8000, 200 mM ammonium sulfate
分辨率 3.40 Å R-free 0.275
6OUS Structure of fusion glycoprotein from human respiratory syncytial virus 提交 2019-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 G 26–109（84 aa）
链 H 137–513（377 aa）
链 I 26–109（84 aa）
链 J 137–513（377 aa）
链 K 26–109（84 aa）
链 L 137–513（377 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM Tris 8.5, 10% PEG 8000, 200 mM ammonium sulfate
分辨率 3.40 Å R-free 0.275
6W52 Prefusion RSV F bound by neutralizing antibody RSB1 提交 2020-03-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 26–107（82 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 25% PEG 2000 MME, 0.01 M spermidine
分辨率 3.74 Å R-free 0.286
7MMN Crystal Structure of the Prefusion RSV F Glycoprotein bound by human antibody AM14 提交 2021-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 26–97（72 aa）
链 B 137–513（377 aa）
链 C 26–97（72 aa）
链 I 137–513（377 aa）
链 J 26–97（72 aa）
链 K 137–513（377 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2M NaCl, 0.1M MES pH 6.0, 20% w/v PEG 2000 MME
分辨率 3.57 Å R-free 0.245
8KG5 Prefusion RSV F Bound to Lonafarnib and D25 Fab 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–513（513 aa）
链 B 1–513（513 aa）
链 C 1–513（513 aa）
未记录 336 4-{2-[4-(3,10-DIBROMO-8-CHLORO-6,11-DIHYDRO-5H-BENZO[5,6]CYCLOHEPTA[1,2-B]PYRIDIN-11-YL)PIPERIDIN-1-YL]-2-OXOETHYL}PIPERIDINE-1-CARBOXAMIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8ULJ Prefusion RSV F bound by neutralizing antibody 2E08 提交 2023-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 26–104（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；23.64%w/v PEG 1500, 0.1 M MMT buffer (DL-malic acid:MES:Tris base at a molar ratio of 1:2:2) with pH 4.36
分辨率 3.00 Å R-free 0.264
8ULK Prefusion RSV F bound by neutralizing antibody 1G12 提交 2023-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 26–97（72 aa）
链 B 26–97（72 aa）
链 C 26–97（72 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Sodium sulfate, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 4.28 Å R-free 0.279
9HVW Respiratory Syncytial Virus Fusion protein in the postfusion conformation in complex with monoclonal antibody 131-2a Fab 提交 2025-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 26–105（80 aa）
链 B 26–105（80 aa）
链 C 26–105（80 aa）
链 D 137–515（379 aa）
链 E 137–515（379 aa）
链 F 137–515（379 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9LM5 Cryo-EM structure of prefusion-stabilized RSV F (DS-Cav1 strain: A2) in complex with nanobody 1G9 提交 2025-01-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–513（513 aa）
链 B 1–513（513 aa）
链 C 1–513（513 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
9LM6 Cryo-EM structure of prefusion-stabilized RSV F (DS-Cav1 strain: A2) in complex with nanobody 1D8 提交 2025-01-18 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–513（513 aa）
链 B 1–513（513 aa）
链 C 1–513（513 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
9MKN Structure of the Respiratory Syncytial Virus Fusion Protein Bound to Human Antibodies RSV_2245 and RSV_3301 提交 2024-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 27–96（70 aa）
链 B 137–506（370 aa）
链 C 27–96（70 aa）
链 D 137–506（370 aa）
链 E 27–96（70 aa）
链 F 137–506（370 aa）
突变：I379V, M447V variant 突变：I379V, M447V variant 突变：I379V, M447V variant 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9RA5 Respiratory syncytial virus fusion protein N-terminal heptad repeat domain in complex with Double stapled peptide 3/4i 提交 2025-05-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 159–209（51 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.62 Å R-free 0.207
9U74 Respiratory Syncytial Virus pre-F trimer bound by neutralizing antibody PR306007 提交 2025-03-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 26–103（78 aa）
链 B 137–513（377 aa）
链 C 26–103（78 aa）
链 D 137–513（377 aa）
链 E 26–103（78 aa）
链 F 137–513（377 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å

共 52 个其他 PDB 条目、59 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FUS_HRSVA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–513； UniProt 1–513 作者链 B； PDB构建体 1–513； UniProt 1–513 作者链 C； PDB构建体 1–513； UniProt 1–513

Fusion glycoprotein F0,Fibritin

Tequatrovirus T4

UniProt P10104

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 458–485 链 B； UniProt 458–485 链 C； UniProt 458–485 未记录 Motavizumab Fab heavy chain × 3 Motavizumab Fab light chain × 3 A1EV1 ~{N}-[(3-azanyloxetan-3-yl)methyl]-2-[1,1-bis(oxidanylidene)-3,5-dihydro-2~{H}-1$l^{6},4-benzothiazepin-4-yl]-6-methyl-quinazolin-4-amine × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.27 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9WDP Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1AA0 FIBRITIN DELETION MUTANT E (BACTERIOPHAGE T4) 提交 1997-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 371–483（113 aa） 片段：DELETION MUTANT E, DEL(368-486)
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED AT 22OC USING 34% PEG400, 0.1M ZN ACETATE IN 0.1M MES BUFFER AT PH6.0 AS WELL SOLUTION BY MIXING EQUAL AMOUNT OF WELL SOLUTION AND PROTEIN SOLUTION AT 29MG/ML IN A HANGING DROP, vapor diffusion - hanging drop
分辨率 2.20 Å R-free 0.259
1AVY FIBRITIN DELETION MUTANT M (BACTERIOPHAGE T4) 提交 1997-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 413–486（74 aa） 片段：DELETION MUTANT M, RESIDUES 413 - 486 OF THE WILD TYPE
突变：R416S, S421K, N425I, N428D, T433R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；HANGING DROPS WITH 20MG/ML PROTEIN AND 1.75M LI2SO4, 0.1M TRIS-HCL, PH7.5, AS PRECIPITANT, vapor diffusion - hanging drop
分辨率 1.85 Å R-free 0.253
1AVY FIBRITIN DELETION MUTANT M (BACTERIOPHAGE T4) 提交 1997-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 413–486（74 aa） 片段：DELETION MUTANT M, RESIDUES 413 - 486 OF THE WILD TYPE
突变：R416S, S421K, N425I, N428D, T433R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；HANGING DROPS WITH 20MG/ML PROTEIN AND 1.75M LI2SO4, 0.1M TRIS-HCL, PH7.5, AS PRECIPITANT, vapor diffusion - hanging drop
分辨率 1.85 Å R-free 0.253
1AVY FIBRITIN DELETION MUTANT M (BACTERIOPHAGE T4) 提交 1997-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 413–486（74 aa） 片段：DELETION MUTANT M, RESIDUES 413 - 486 OF THE WILD TYPE
突变：R416S, S421K, N425I, N428D, T433R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；HANGING DROPS WITH 20MG/ML PROTEIN AND 1.75M LI2SO4, 0.1M TRIS-HCL, PH7.5, AS PRECIPITANT, vapor diffusion - hanging drop
分辨率 1.85 Å R-free 0.253
1OX3 crystal structure of mini-fibritin 提交 2003-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–81（80 aa） 片段：UNP residues 2-81 and 456-484
链 A 456–484（29 aa） 片段：UNP residues 2-81 and 456-484
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；303 K；PEG 6000, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 303K
分辨率 2.00 Å R-free 0.221
1RFO Trimeric Foldon of the T4 phagehead fibritin 提交 2003-11-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa） 片段：trimerization domain (residues 457-483)
链 B 458–484（27 aa） 片段：trimerization domain (residues 457-483)
链 C 458–484（27 aa） 片段：trimerization domain (residues 457-483)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 1013
NMR样品组成 0.3 mM Foldon 15N,13C; 5mM phosphate buffer pH 7.1 | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
1V1H Adenovirus fibre shaft sequence N-terminally fused to the bacteriophage T4 fibritin foldon trimerisation motif with a short linker 提交 2004-04-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 457–483（27 aa） 片段：SHAFT DOMAIN PLUS FOLDON DOMAIN, RESIDUES 319-392 AND 457-483
链 B 457–483（27 aa） 片段：SHAFT DOMAIN PLUS FOLDON DOMAIN, RESIDUES 319-392 AND 457-483
链 C 457–483（27 aa） 片段：SHAFT DOMAIN PLUS FOLDON DOMAIN, RESIDUES 319-392 AND 457-483
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.2 M IMIDAZOLE-MALATE PH 6.0 8% (W/V) PEG 4000
分辨率 1.90 Å R-free 0.240
1V1H Adenovirus fibre shaft sequence N-terminally fused to the bacteriophage T4 fibritin foldon trimerisation motif with a short linker 提交 2004-04-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 457–483（27 aa） 片段：SHAFT DOMAIN PLUS FOLDON DOMAIN, RESIDUES 319-392 AND 457-483
链 E 457–483（27 aa） 片段：SHAFT DOMAIN PLUS FOLDON DOMAIN, RESIDUES 319-392 AND 457-483
链 F 457–483（27 aa） 片段：SHAFT DOMAIN PLUS FOLDON DOMAIN, RESIDUES 319-392 AND 457-483
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；0.2 M IMIDAZOLE-MALATE PH 6.0 8% (W/V) PEG 4000
分辨率 1.90 Å R-free 0.240
1V1I Adenovirus fibre shaft sequence N-terminally fused to the bacteriophage T4 fibritin foldon trimerisation motif with a long linker 提交 2004-04-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 457–483（27 aa） 片段：SHAFT DOMAIN PLUS FOLDON DOMAIN, RESIDUES 319-392 AND 457-483
链 B 457–483（27 aa） 片段：SHAFT DOMAIN PLUS FOLDON DOMAIN, RESIDUES 319-392 AND 457-483
链 C 457–483（27 aa） 片段：SHAFT DOMAIN PLUS FOLDON DOMAIN, RESIDUES 319-392 AND 457-483
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；10 MM HEPES-NAOH PH 7.0 0.2 M MAGNESIUM ACETATE, 20 % (W/V) PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.283
2BSG The modeled structure of fibritin (gpwac) of bacteriophage T4 based on cryo-EM reconstruction of the extended tail of bacteriophage T4 提交 2005-05-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–487（487 aa）
链 B 1–487（487 aa）
链 C 1–487（487 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；H2O
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 15.00 Å
2IBL Crystal structure of a helper molecule (HT-mf-thromb) based on mini-fibritin (mf) crystal structure (pdb:1OX3). 提交 2006-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 2–81（80 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；293 K；30% PEG 400, 0.1 M TrisHCl, 0.2 M magnesium chloride, pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 1.32 Å R-free 0.170
2KBL NMR Structure of a Monomeric Folding Intermediate Reveals the Structural Basis for Rapid Assembly of an Evolutionary Optimized Trimerization Module 提交 2008-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 458–484（27 aa） 片段：C-terminal Domain, UNP residues 458-484
突变：E5R, F22L 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；296.7 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成 200uM foldon E5R, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 210uM [U-99% 15N] foldon E5R, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
3A1M A fusion protein of a beta helix region of gene product 5 and the foldon region of bacteriophage T4 提交 2009-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
链 D 458–484（27 aa）
链 E 458–484（27 aa）
链 F 458–484（27 aa）
突变：V16L 突变：V16L 突变：V16L 突变：V16L 突变：V16L 突变：V16L K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Ammonium sulfate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.268
3J2O Model of the bacteriophage T4 fibritin based on the cryo-EM reconstruction of the contracted T4 tail containing the phage collar and whiskers 提交 2012-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–487（486 aa）
链 B 2–487（486 aa）
链 C 2–487（486 aa）
链 D 2–487（486 aa）
链 E 2–487（486 aa）
链 F 2–487（486 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M NaCl, 8 mM MgCl2；pH 8；50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M NaCl, 8 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；plunged into liquid ethane (homemade plunger)
分辨率 25.00 Å
4MMQ Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F Variant DS 提交 2013-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 458–484（27 aa）
突变：S155C, S290C, I379V, M447V SO4 SULFATE ION × 18 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；1.4 M K/Na tartrate, 0.1M CHES pH 9.5, 0.2 M LiSO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.25 Å R-free 0.274
4MMR Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F Variant Cav1 at pH 9.5 提交 2013-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 458–484（27 aa）
突变：S190F, V207L, I379V, M447V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；1.4M sodium potassium tartarate, 0.1M CHES, pH 9.5, 0.2M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.264
4MMS Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F Variant Cav1 at pH 5.5 提交 2013-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 458–484（27 aa）
链 D 458–484（27 aa）
链 F 458–484（27 aa）
突变：S190F, V207L, I379V, M447V 突变：S190F, V207L, I379V, M447V 突变：S190F, V207L, I379V, M447V SO4 SULFATE ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M citrate pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.214
4MMT Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F Variant DS-Cav1 at pH 9.5 提交 2013-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 458–484（27 aa）
突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；1.8 M Na/K tartrate, 0.2 M LiSO4, 0.1 M CHES pH9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.05 Å R-free 0.243
4MMU Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F Variant DS-Cav1 at pH 5.5 提交 2013-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 458–484（27 aa）
突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447V SO4 SULFATE ION × 12 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；1.8 M Ammonium sulphate 0.1 M citrate pH5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.00 Å R-free 0.228
4MMV Crystal Structure of Prefusion-stabilized RSV F Variant DS-Cav1-TriC at pH 9.5 提交 2013-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 458–484（27 aa）
突变：S155C, S190F, V207L, S290C, I379V, M447, VD486H, E487Q, F488W, D489H 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；1.4M sodium potassium tartarate, 0.1M CHES, pH 9.5, 0.2M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.81 Å R-free 0.279
5I08 Prefusion structure of a human coronavirus spike protein 提交 2016-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
突变：R751G, R752G, K753S, R754G, R755S,R751G, R752G, K753S, R754G, R755S 突变：R751G, R752G, K753S, R754G, R755S,R751G, R752G, K753S, R754G, R755S 突变：R751G, R752G, K753S, R754G, R755S,R751G, R752G, K753S, R754G, R755S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL sample was applied to grid, blotted, and plunged into liquid ethane.
分辨率 4.04 Å
5TDL Crystal structure of prefusion-stabilized bovine RSV fusion glycoprotein (single-chain DS2-v1 variant: strain 391-2 sc9 DS-Cav1 Q98C Q361C) 提交 2016-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 457–484（28 aa）
突变：Q98C, I144S, S155C, S190F, V207L, S290C, Q361C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.9 M of potassium and sodium tartrate, 0.16 M of Lithium sulfate, 0.1 M ches
分辨率 3.50 Å R-free 0.272
6OE5 Splayed open prefusion RSV F captured by CR9501 and motavizumab Fabs 提交 2019-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 458–484（27 aa）
突变：N67I, S215P 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；4.69 mg/mL prefusion F (PR-DM) + motavizumab Fab + CR9501 Fab, 30% (v/v) PEG400, 0.19 M ammonium sulfate, 3.1% (w/v) PEG8000, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 4.10 Å R-free 0.306
6Z97 Structure of the prefusion SARS-CoV-2 spike glycoprotein 提交 2020-06-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
6ZHD H11-H4 bound to Spike 提交 2020-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50 mM Tris, pH 7, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；SPT Labtech prototype 300 mesh 1.2/2.0 nanowire grids with a highly reproduceable rectangular bar cross-section were used. The grids were glow-discharged on low for 90 s (Plasma Cleaner PDC-002-CE, Harrick Plasma) to activate the nanowires. Approximately 6 nL of the complex were applied to the grids using a Chameleon EP system (SPT Labtech) at 81 % relative humidity and ambient temperature.
分辨率 3.70 Å
7A4N Cryo-EM structure of a prefusion stabilized SARS-CoV-2 Spike (D614N, R682S, R685G, A892P, A942P and V987P)(S-closed trimer) 提交 2020-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
突变：D614N,R682S,R685G,A892P,A942P,V987P 突变：D614N,R682S,R685G,A892P,A942P,V987P 突变：D614N,R682S,R685G,A892P,A942P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
7NS6 SARS-CoV-2 Spike (dimers) in complex with six Fu2 nanobodies 提交 2021-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 I 458–484（27 aa）
链 J 458–484（27 aa）
链 K 458–484（27 aa）
链 L 458–484（27 aa）
链 M 458–484（27 aa）
链 N 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 46 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
7QDG SARS-CoV-2 S protein S:A222V + S:D614G mutant 1-up 提交 2021-11-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–486（29 aa）
链 B 458–486（29 aa）
链 C 458–486（29 aa）
突变：S:A222V + S:D614G 突变：S:A222V + S:D614G 突变：S:A222V + S:D614G NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7QDH SARS-CoV-2 S protein S:D614G mutant 1-up 提交 2021-11-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–486（29 aa）
链 B 458–486（29 aa）
链 C 458–486（29 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7QUR SARS-CoV-2 Spike with ethylbenzamide-tri-iodo Siallyllactose, C3 symmetry 提交 2022-01-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 GE9 2,3,5-tris(iodanyl)benzamide × 3 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 3 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.27 Å
7QUS SARS-CoV-2 Spike, C3 symmetry 提交 2022-01-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 36 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.39 Å
7Z6V CRYO-EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE : H11 nanobody complex 提交 2022-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 458–485（28 aa）
链 B 458–485（28 aa）
链 C 458–485（28 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；SPT Labtech prototype 300 mesh 1.2/2.0 nanowire grids with a highly reproduceable rectangular bar cross-section were used. The grids were glow-discharged on low for 120 s (Plasma Cleaner PDC-002-CE, Harrick Plasma) to activate the nanowires. Approximately 6 nL of the complex were applied to the grids using a Chameleon EP system (SPT Labtech) at 82% relative humidity and ambient temperature.
分辨率 3.10 Å
7Z7X CRYO-EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE : H11-H6 nanobody complex 提交 2022-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 458–485（28 aa）
链 B 458–485（28 aa）
链 C 458–485（28 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；SPT Labtech prototype 300 mesh 1.2/2.0 nanowire grids with a highly reproduceable rectangular bar cross-section were used. The grids were glow-discharged on low for 120 s (Plasma Cleaner PDC-002-CE, Harrick Plasma) or for 60-80 s, 12 mA (easiGlow, Pelco) to activate the nanowires. Approximately 6 nL of the complex were applied to the grids using a Chameleon EP system (SPT Labtech) at 79-81% relative humidity and ambient temperature.
分辨率 3.30 Å
7Z85 CRYO-EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE : H11-B5 nanobody complex 提交 2022-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 458–485（28 aa）
链 B 458–485（28 aa）
链 C 458–485（28 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；SPT Labtech prototype 300 mesh 1.2/2.0 nanowire grids with a highly reproduceable rectangular bar cross-section were used. The grids were glow-discharged on low for 190 s (Plasma Cleaner PDC-002-CE, Harrick Plasma) to activate the nanowires. Approximately 6 nL of the complex were applied to the grids using a Chameleon EP system (SPT Labtech) at 83% relative humidity and ambient temperature.
分辨率 3.10 Å
7Z86 CRYO-EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE : H11-H4 Q98R H100E nanobody complex in 1Up2Down conformation 提交 2022-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 458–485（28 aa）
链 B 458–485（28 aa）
链 C 458–485（28 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7Z9Q CRYO-EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE : H11-A10 nanobody complex 提交 2022-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 458–485（28 aa）
链 B 458–485（28 aa）
链 C 458–485（28 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；SPT Labtech prototype 300 mesh 1.2/2.0 nanowire grids with a highly reproduceable rectangular bar cross-section were used. The grids were glow-discharged on low for 260 s (Plasma Cleaner PDC-002-CE, Harrick Plasma) to activate the nanowires. Approximately 6 nL of the complex were applied to the grids using a Chameleon EP system (SPT Labtech) at 80% relative humidity and ambient temperature.
分辨率 3.60 Å
7Z9R CRYO-EM STRUCTURE OF SARS-COV-2 SPIKE : H11-H4 Q98R H100E nanobody complex in 2Up1Down conformation 提交 2022-03-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 458–485（28 aa）
链 B 458–485（28 aa）
链 C 458–485（28 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7ZCE SARS-CoV-2 Spike protein in complex with the single chain fragment scFv76 提交 2022-03-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7ZCF SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with the single chain fragment scFv76 (Focused Refinement) 提交 2022-03-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7ZH1 SARS CoV Spike protein, Closed C3 conformation 提交 2022-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 EIC LINOLEIC ACID × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.48 Å
7ZH2 SARS CoV Spike protein, Closed C1 conformation 提交 2022-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 EIC LINOLEIC ACID × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 27 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.71 Å
7ZH5 SARS CoV Spike protein, Open conformation 提交 2022-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
7ZJ6 X-31 Hemagglutinin Precursor HA0 at pH 7.5 提交 2022-04-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4s blot
分辨率 2.60 Å
7ZJ7 X-31 Hemagglutinin Precursor HA0 at pH 4.8 提交 2022-04-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 4.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4s blot
分辨率 3.95 Å
7ZJ8 X-31 Hemagglutinin Precursor HA0 at pH 7.5 after reneutralization 提交 2022-04-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4s blot
分辨率 3.10 Å
7ZR7 OMI-42 FAB IN COMPLEX WITH SARS-COV-2 BETA SPIKE GLYCOPROTEIN 提交 2022-05-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7ZR8 OMI-38 FAB IN COMPLEX WITH SARS-COV-2 BETA SPIKE RBD (local refinement) 提交 2022-05-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7ZR9 OMI-2 FAB IN COMPLEX WITH SARS-COV-2 BETA SPIKE GLYCOPROTEIN 提交 2022-05-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7ZRC OMI-38 FAB IN COMPLEX WITH SARS-COV-2 BETA SPIKE 提交 2022-05-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8AJA Structure of the Ancestral Scaffold Antigen-5 of Coronavirus Spike protein 提交 2022-07-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.59 Å
8AJL Structure of the Ancestral Scaffold Antigen-6 of Coronavirus Spike protein 提交 2022-07-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 45 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.77 Å
8AQS BA.4/5 SARS-CoV-2 Spike bound to human ACE2 (local) 提交 2022-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
8AQT Beta SARS-CoV-2 Spike bound to mouse ACE2 (local) 提交 2022-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 460–484（25 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8AQU BA.1 SARS-CoV-2 Spike bound to mouse ACE2 (local) 提交 2022-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
8AQV BA.2.12.1 SARS-CoV-2 Spike bound to mouse ACE2 (local) 提交 2022-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 460–484（25 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
8AQW BA.4/5 SARS-CoV-2 Spike bound to mouse ACE2 (local) 提交 2022-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 459–484（26 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8BON Structure of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with the macrocyclic peptide S1B3inL1 提交 2022-11-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 23 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8CIM BA.2-07 FAB IN COMPLEX WITH SARS-COV-2 BA.2.12.1 SPIKE GLYCOPROTEIN 提交 2023-02-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8H3D Structure of apo SARS-CoV-2 spike protein with one RBD up 提交 2022-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–485（28 aa） 片段：SARS-CoV-2 spike protein,SARS-CoV-2 spike protein
链 B 458–485（28 aa） 片段：SARS-CoV-2 spike protein,SARS-CoV-2 spike protein
链 C 458–485（28 aa） 片段：SARS-CoV-2 spike protein,SARS-CoV-2 spike protein
突变：R682S,R683G,R685G,K986P,V987P 突变：R682S,R683G,R685G,K986P,V987P 突变：R682S,R683G,R685G,K986P,V987P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
8H3E Complex structure of a small molecule (SPC-14) bound SARS-CoV-2 spike protein, closed state 提交 2022-10-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–485（28 aa） 片段：SARS-CoV-2 spike protein,SARS-CoV-2 spike protein
链 B 458–485（28 aa） 片段：SARS-CoV-2 spike protein,SARS-CoV-2 spike protein
链 C 458–485（28 aa） 片段：SARS-CoV-2 spike protein,SARS-CoV-2 spike protein
突变：R682S,R683G,R685G,K986P,V987P 突变：R682S,R683G,R685G,K986P,V987P 突变：R682S,R683G,R685G,K986P,V987P Q83 7-(6-nitro-2,3-dihydroindol-1-yl)-7-oxidanyidene-heptanoic acid × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
8KG5 Prefusion RSV F Bound to Lonafarnib and D25 Fab 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 458–485（28 aa）
链 B 458–485（28 aa）
链 C 458–485（28 aa）
未记录 336 4-{2-[4-(3,10-DIBROMO-8-CHLORO-6,11-DIHYDRO-5H-BENZO[5,6]CYCLOHEPTA[1,2-B]PYRIDIN-11-YL)PIPERIDIN-1-YL]-2-OXOETHYL}PIPERIDINE-1-CARBOXAMIDE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8OYT Stabilised BA.1 SARS-CoV-2 spike with H6 nanobodies in '3 up' RBD conformation 提交 2023-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8OYU Stabilised BA.1 SARS-CoV-2 spike with H6 nanobodies in '2 up 1 down' RBD conformation 提交 2023-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8QPR SARS-CoV-2 S protein bound to human neutralising antibody UZGENT_G5 提交 2023-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8QQ0 SARS-CoV-2 S protein bound to neutralising antibody UZGENT_A3 提交 2023-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–485（28 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8QTD Local refinement of SARS-CoV-2 BA.2.86 Spike and XBB-7 Fab 提交 2023-10-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8R1C SD1-2 Fab in complex with SARS-CoV-2 BA.2.12.1 Spike Glycoprotein 提交 2023-11-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.20 Å
8R1D SD1-3 Fab in complex with SARS-CoV-2 BA.2.12.1 Spike Glycoprotein 提交 2023-11-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 30 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.37 Å
8R87 Cryo-EM structure of the Sars-Cov2 S trimer without RBDs 提交 2023-11-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8R8K XBB-4 Fab in complex with SARS-CoV-2 BA.2.12.1 Spike Glycoprotein 提交 2023-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
8UDN A Stable Heterotrimeric Foldon with Minimum Mutation 提交 2023-09-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；MPD
分辨率 0.97 Å R-free 0.158
8ULJ Prefusion RSV F bound by neutralizing antibody 2E08 提交 2023-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 B 458–484（27 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；23.64%w/v PEG 1500, 0.1 M MMT buffer (DL-malic acid:MES:Tris base at a molar ratio of 1:2:2) with pH 4.36
分辨率 3.00 Å R-free 0.264
8ULK Prefusion RSV F bound by neutralizing antibody 1G12 提交 2023-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 I 458–484（27 aa）
链 J 458–484（27 aa）
链 K 458–484（27 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.2 M Sodium sulfate, 20 % w/v PEG 3350
分辨率 4.28 Å R-free 0.279
8V5V Structure of a SARS-CoV-2 spike S2 subunit in a pre-fusion, open conformation 提交 2023-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 E 458–484（27 aa）
链 F 458–484（27 aa）
链 G 458–484（27 aa）
突变：F817P,A892P,A899P,A942P,V987P,Y707C,T883C,Y788C,A876C 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,V987P,Y707C,T883C,Y788C,A876C 突变：F817P,A892P,A899P,A942P,V987P,Y707C,T883C,Y788C,A876C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Filtered and degased
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；6 seconds blotting time at force 0
分辨率 2.93 Å
8YZB BA.2.86 RBD protein in complex with ACE2. 提交 2024-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 458–485（28 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
8YZC Structure of BA.2.86 spike protein in complex with ACE2. 提交 2024-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 458–481（24 aa）
链 B 458–481（24 aa）
链 C 458–481（24 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8YZD Structure of JN.1 RBD protein in complex with ACE2. 提交 2024-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 458–485（28 aa） 片段：RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.07 Å
8YZE The JN.1 spike protein (S) in complex with ACE2. 提交 2024-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 458–481（24 aa）
链 B 458–481（24 aa）
链 C 458–481（24 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
8Z6Q SARS-CoV-2 XBB.1.16 Spike in complex with CYFN1006-1(S-CYFN1006-1 dimer trimer). 提交 2024-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 458–485（28 aa）
链 B 458–485（28 aa）
链 C 458–485（28 aa）
链 J 458–485（28 aa）
链 K 458–485（28 aa）
链 L 458–485（28 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.41 Å
8Z6R Structure of XBB.1.16 S trimer with 3 down-RBDs complex with antibody CYFN1006-1. 提交 2024-04-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 458–485（28 aa）
链 B 458–485（28 aa）
链 C 458–485（28 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
8Z6S Structure of XBB.1.16 S trimer with 2 down-RBDs complex with antibody CYFN1006-1. 提交 2024-04-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 458–485（28 aa）
链 B 458–485（28 aa）
链 C 458–485（28 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.84 Å
8Z6T Structure of XBB.1.16 RBD in complex with antibody CYFN1006-1. 提交 2024-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–485（28 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å
8Z6U SARS-CoV-2 EG.5.1 Spike in complex with CYFN1006-2(S-CYFN1006-2 dimer trimer). 提交 2024-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 A 458–481（24 aa）
链 B 458–481（24 aa）
链 C 458–481（24 aa）
链 D 458–481（24 aa）
链 E 458–481（24 aa）
链 F 458–481（24 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.83 Å
8Z6W Structure of EG.5.1 S trimer with 3 down-RBDs complex with antibody CYFN1006-2. 提交 2024-04-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 458–485（28 aa）
链 B 458–485（28 aa）
链 C 458–485（28 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8Z6X Structure of EG.5.1 RBD in complex with antibody CYFN1006-2. 提交 2024-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–485（28 aa） 片段：RBD,RBD
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
8ZPP Local CryoEM structure of the SARS-CoV-2 BA.5 in complex with ORB10 Fab 提交 2024-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9F9Y SARS-CoV-2 BA-2.87.1 Spike ectodomain 提交 2024-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9FGS SARS-CoV-2 (wuhan variant) Spike protein in complex with the single chain fragment scFv41N (focused refinement) 提交 2024-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9FGT SARS-CoV-2 (B.1.1.529/Omicron variant) Spike protein in complex with the single chain fragment scFv76 (focused refinement) 提交 2024-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9FGU SARS-CoV-2 (B.1.1.529/Omicron variant) Spike protein in complex with the single chain fragment scFv76-77 (focused refinement) 提交 2024-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；PBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9FJK Omicron BA.1 Spike protein with neutralizing NTD specific mAb K501SP6 提交 2024-05-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；TBS, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.84 Å
9FMW Omicron BA.1 Spike protein with neutralizing NTD specific mAb K501SP6 提交 2024-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；TBS, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9GDX SARS-CoV-2 Spike protein Beta Variant at 4C structural flexibility / heterogeneity analyses 提交 2024-08-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9GDY SARS-CoV-2 Spike protein Beta Variant at 37C structural flexibility / heterogeneity analyses 提交 2024-08-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9H6U SARS-CoV-2 S protein in complex with pT1679 Fab 提交 2024-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
9JMF Cryo-EM structure of SA-BatCoV (Neoromicia/PML-PHE1/RSA/2011) S-trimer 提交 2024-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 33 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9JMG Cryo-EM structure of EU-HedgehogCoV (Erinaceus/VMC/DEU/2012) S-trimer in a locked-2 conformation 提交 2024-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 37 FOL FOLIC ACID × 3 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9JMH Cryo-EM structure of HKU25-BatCoV S-trimer stabilized with 2P and x1 disulfide bond 提交 2024-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
突变：S437C,D1051C,A1052P,V1053P 突变：S437C,D1051C,A1052P,V1053P 突变：S437C,D1051C,A1052P,V1053P EIC LINOLEIC ACID × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 38 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9JMI Cryo-EM structure of CN-HedgehogCoV (HKU31/Erinaceus amurensis/China/2014) S-trimer in a locked-2 conformation 提交 2024-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 FOL FOLIC ACID × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 39 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9JMN Cryo-EM structure of CN-HedgehogCoV (HKU31/Erinaceus amurensis/China/2014) S-trimer in a locked-1 conformation 提交 2024-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 25 FOL FOLIC ACID × 3 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9JMO Cryo-EM structure of Japan-BatCoV (Vs-CoV-1) S-trimer 提交 2024-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9JMP Cryo-EM structure of GD-BatCoV (BtCoV/Ii/GD/2014-422) S-trimer 提交 2024-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 458–484（27 aa）
链 B 458–484（27 aa）
链 C 458–484（27 aa）
突变：A885P,S962P,A969P,N1012P,A1056P,V1057P 突变：A885P,S962P,A969P,N1012P,A1056P,V1057P 突变：A885P,S962P,A969P,N1012P,A1056P,V1057P NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21 EIC LINOLEIC ACID × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9KT3 Structure of EG.5.1 S trimer with 2 down-RBDs complex with antibody CYFN1006-2. 提交 2024-12-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 A 458–481（24 aa）
链 B 458–481（24 aa）
链 C 458–481（24 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
9MKB Structure of the bacteriophage T4 portal-neck-tail complex 提交 2024-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 541 PDB 声明：541-meric
链 A 1–487（487 aa）
链 B 1–487（487 aa）
链 C 1–487（487 aa）
链 D 1–487（487 aa）
链 E 1–487（487 aa）
链 F 1–487（487 aa）
链 G 1–487（487 aa）
链 H 1–487（487 aa）
链 I 1–487（487 aa）
链 J 1–487（487 aa）
链 K 1–487（487 aa）
链 L 1–487（487 aa）
链 M 1–487（487 aa）
链 N 1–487（487 aa）
链 O 1–487（487 aa）
链 P 1–487（487 aa）
链 Q 1–487（487 aa）
链 R 1–487（487 aa）
链 S 1–487（487 aa）
链 T 1–487（487 aa）
链 U 1–487（487 aa）
链 V 1–487（487 aa）
链 W 1–487（487 aa）
链 X 1–487（487 aa）
链 Y 1–487（487 aa）
链 Z 1–487（487 aa）
链 a 1–487（487 aa）
链 b 1–487（487 aa）
链 c 1–487（487 aa）
链 d 1–487（487 aa）
链 e 1–487（487 aa）
链 f 1–487（487 aa）
链 g 1–487（487 aa）
链 h 1–487（487 aa）
链 i 1–487（487 aa）
链 j 1–487（487 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Ted Pella lacey carbon 400 mesh grids (catalog No: 01824) were used.
分辨率 3.80 Å
9MLA Pre-fusion HERV-K Envelope Protein Trimer Ectodomain in complex with Kenv-6 Fab 提交 2024-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 D 459–484（26 aa）
链 E 459–484（26 aa）
链 F 459–484（26 aa）
突变：V498C 突变：V498C 突变：V498C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Filtered and degassed
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.24 Å
9MOF Structure of the bacteriophage T4 portal-neck-tail connector complex 提交 2024-12-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 183 PDB 声明：183-meric
链 A 1–487（487 aa）
链 B 1–487（487 aa）
链 C 1–487（487 aa）
链 D 1–487（487 aa）
链 E 1–487（487 aa）
链 F 1–487（487 aa）
链 G 1–487（487 aa）
链 H 1–487（487 aa）
链 I 1–487（487 aa）
链 J 1–487（487 aa）
链 K 1–487（487 aa）
链 L 1–487（487 aa）
链 M 1–487（487 aa）
链 N 1–487（487 aa）
链 O 1–487（487 aa）
链 P 1–487（487 aa）
链 Q 1–487（487 aa）
链 R 1–487（487 aa）
链 S 1–487（487 aa）
链 T 1–487（487 aa）
链 U 1–487（487 aa）
链 V 1–487（487 aa）
链 W 1–487（487 aa）
链 X 1–487（487 aa）
链 Y 1–487（487 aa）
链 Z 1–487（487 aa）
链 a 1–487（487 aa）
链 b 1–487（487 aa）
链 c 1–487（487 aa）
链 d 1–487（487 aa）
链 e 1–487（487 aa）
链 f 1–487（487 aa）
链 g 1–487（487 aa）
链 h 1–487（487 aa）
链 i 1–487（487 aa）
链 j 1–487（487 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Ted Pella lacey carbon 400 mesh grids (catalog No: 01824) were used.
分辨率 3.80 Å
9O4F Pre-fusion Stabilized HERV-K Envelope Trimer Ectodomain 提交 2025-04-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 459–484（26 aa）
链 E 459–484（26 aa）
链 F 459–484（26 aa）
突变：V498C 突变：V498C 突变：V498C NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Filtered and degassed
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.24 Å

共 104 个其他 PDB 条目、107 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 WAC_BPT4
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 516–543； UniProt 458–485 作者链 B； PDB构建体 516–543； UniProt 458–485 作者链 C； PDB构建体 516–543； UniProt 458–485

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9wdp

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9wdp
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9wdp
沉积日期 deposition_date2025-08-19
结构标题 titleCyro-EM structure of prefusion RSV fusion glycoprotein in complex with Ziresovir and motavizumab Fab
关键词 keywordsInhibitor, Complex, VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex; VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier33.72 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron33.12 Å
零角强度 I(0) i0762846000.00
分子量 molecular_weight150040.0 kDa
排除体积 excluded_volume145680 ų
包络体积 envelope_volume262560 ų
水化壳体积 shell_volume62046 ų
包络直径 envelope_diameter114.2 Å
壳层 Rg shell_rg42.46 Å
包络 Rg envelope_rg33.43 Å
形状 Rg shape_rg33.17 Å
总 Rg total_rg33.55 Å
总原子数 total_atoms11338
残基数 n_residues1454
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax105.1 Å
Rg (实空间) rg_real33.52 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.70 Å
I(0) (实空间) i0_real7.6280e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2080e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal33.64 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal762900000.0000
解质量估计 total_estimate0.8887
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary44.7 Å
偏度 Skewness skewness0.150
峰度 Kurtosis kurtosis-0.369
角度范围 angular_range— – 0.2350 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha122300000.0000
实空间数据点数 n_real_points48
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.870; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.977; Smooth: 0.963
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)