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5FMG
Structure and function based design of Plasmodium-selective proteasome inhibitors
提交 2015-11-04
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 28
PDB 声明:28-meric
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链 A
1–260(260 aa)
链 O
1–260(260 aa)
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未记录
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7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
50MM TRIS HCL, 5MM MGCL2, 1MM DITHIOTREITOL;pH 7.5;50MM TRIS HCL, 5MM MGCL2, 1MM DITHIOTREITOL
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT 2.5 SECONDS BEFORE PLUNGING,
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分辨率 3.60 Å
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6MUV
The structure of the Plasmodium falciparum 20S proteasome in complex with two PA28 activators
提交 2018-10-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 42
PDB 声明:42-meric
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链 A
1–260(260 aa)
链 O
1–260(260 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;wait time 0sec
blot time 2sec
blot force -1
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分辨率 3.80 Å
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6MUW
The structure of the Plasmodium falciparum 20S proteasome.
提交 2018-10-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 28
PDB 声明:28-meric
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链 A
1–260(260 aa)
链 O
1–260(260 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;wait time 0sec
blot time 2sec
blot force -1
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分辨率 3.60 Å
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6MUX
The structure of the Plasmodium falciparum 20S proteasome in complex with one PA28 activator
提交 2018-10-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 35
PDB 声明:35-meric
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链 A
1–260(260 aa)
链 O
1–260(260 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;wait time 0sec
blot time 2sec
blot force -1
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分辨率 3.90 Å
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7LXT
Structure of Plasmodium falciparum 20S proteasome with bound bortezomib
提交 2021-03-05
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 28
PDB 声明:28-meric
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链 A
1–260(260 aa)
链 O
1–260(260 aa)
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未记录
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BO2 N-[(1R)-1-(DIHYDROXYBORYL)-3-METHYLBUTYL]-N-(PYRAZIN-2-YLCARBONYL)-L-PHENYLALANINAMIDE × 6
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.40 Å
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7LXU
Structure of Plasmodium falciparum 20S proteasome with bound MPI-5
提交 2021-03-05
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 28
PDB 声明:28-meric
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链 A
1–260(260 aa)
链 O
1–260(260 aa)
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未记录
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YHD N-[(1R)-2-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-1-boronoethyl]-1-methyl-L-prolinamide × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å
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8G6F
Structure of the Plasmodium falciparum 20S proteasome beta-6 A117D mutant complexed with inhibitor WLW-vs
提交 2023-02-15
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 28
PDB 声明:28-meric
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链 A
1–260(260 aa)
链 O
1–260(260 aa)
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未记录
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7F1 (2S)-N-[(E,2S)-1-(1H-indol-3-yl)-4-methylsulfonyl-but-3-en-2-yl]-2-[[(2S)-3-(1H-indol-3-yl)-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]-4-methyl-pentanamide × 4
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.58 Å
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8W2F
Plasmodium falciparum 20S proteasome bound to an inhibitor
提交 2024-02-20
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 28
PDB 声明:28-meric
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链 A
1–260(260 aa)
链 O
1–260(260 aa)
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未记录
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A1AE6 (3S)-1-[(2-fluoroethoxy)acetyl]-N-{[(4P)-4-(6-methylpyridin-3-yl)-1,3-thiazol-2-yl]methyl}piperidine-3-carboxamide × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å
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9O3E
Plasmodium falciparum 20S proteasome bound to inhibitor 159
提交 2025-04-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 28
PDB 声明:28-meric
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链 A
1–260(260 aa)
链 O
1–260(260 aa)
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未记录
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A1B74 (3S)-N~3~-{(1S)-1-[4-(4-cyanophenyl)-1,3-thiazol-2-yl]ethyl}-N~1~-ethoxypiperidine-1,3-dicarboxamide × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.79 Å
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9O3F
Plasmodium falciparum 20S proteasome bound to inhibitor 296
提交 2025-04-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 28
PDB 声明:28-meric
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链 A
1–260(260 aa)
链 O
1–260(260 aa)
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未记录
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A1B73 (3S)-1-({[(3S)-piperidin-3-yl]oxy}acetyl)-N-({4-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-1,3-thiazol-2-yl}methyl)piperidine-3-carboxamide × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.28 Å
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9Y0K
Structure of Plasmodium falciparum 20S proteasome with bound J80
提交 2025-08-28
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 28
PDB 声明:28-meric
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链 A
1–260(260 aa)
链 O
1–260(260 aa)
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未记录
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A1CRO N,N-diethyl-N~2~-hexanoyl-D-asparaginyl-N-{(1S)-2-(2,4-difluorophenyl)-1-[(2S,3S,5S,6S)-5-formyl-2-hydroxy-3-(hydroxymethyl)-3,6-dimethylmorpholin-2-yl]ethyl}-4-fluoro-L-phenylalaninamide × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.00 Å
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9Y1O
The structure of the Plasmodium falciparum 20S proteasome
提交 2025-08-29
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 28
PDB 声明:28-meric
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链 A
1–260(260 aa)
链 O
1–260(260 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.10 Å
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9YUY
Structure of the Plasmodium falciparum 20S proteasome in complex with a beta5-selective covalent syringolin analogue inhibitor.
提交 2025-10-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 28
PDB 声明:28-meric
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链 A
1–260(260 aa)
链 O
1–260(260 aa)
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未记录
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A1CY6 methyl N-{[(2R)-1-({(5R,8R)-5-[(3-fluorophenyl)methyl]-2,7-dioxo-1,6-diazacyclododecan-8-yl}amino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl}-L-valinate × 2
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
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