当前蛋白身份：A0R0B3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7BVC Cryo-EM structure of Mycobacterium smegmatis arabinosyltransferase EmbA-EmbB-AcpM2 in complex with ethambutol 提交 2020-04-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
1–99（99 aa）
|
未记录 | CDL CARDIOLIPIN × 2 F8L [(2Z,6E,10E,14Z,18E,22Z,26Z)-3,7,11,15,19,23,27,31,35,39-decamethyltetraconta-2,6,10,14,18,22,26,30,34,38-decaenyl] [(2S,3S,4S,5R)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl] hydrogen phosphate × 1 CA CALCIUM ION × 2 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 95E Ethambutol × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7BVE Cryo-EM structure of Mycobacterium smegmatis arabinosyltransferase EmbC2-AcpM2 in complex with ethambutol 提交 2020-04-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–99（99 aa）
链 D
1–99（99 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 95E Ethambutol × 2 PN7 N~3~-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-N-(2-sulfanylethyl)-beta-alaninamide × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å |
| 7BVF Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis arabinosyltransferase EmbA-EmbB-AcpM2 in complex with ethambutol 提交 2020-04-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
1–99（99 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 95E Ethambutol × 1 DSL MONO-TRANS, OCTA-CIS DECAPRENYL-PHOSPHATE × 1 CDL CARDIOLIPIN × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 7BVG Cryo-EM structure of Mycobacterium smegmatis arabinosyltransferase EmbA-EmbB-AcpM2 in complex with di-arabinose. 提交 2020-04-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
1–99（99 aa）
|
未记录 | F8L [(2Z,6E,10E,14Z,18E,22Z,26Z)-3,7,11,15,19,23,27,31,35,39-decamethyltetraconta-2,6,10,14,18,22,26,30,34,38-decaenyl] [(2S,3S,4S,5R)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl] hydrogen phosphate × 1 CDL CARDIOLIPIN × 2 CA CALCIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7BVH Crystal structure of arabinosyltransferase EmbC2-AcpM2 complex from Mycobacterium smegmatis complexed with di-arabinose 提交 2020-04-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–99（99 aa）
链 D
1–99（99 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 BXY alpha-D-arabinofuranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；50mM HEPES (pH 6.8~7.5), 100mM NaCl, 5-10% (v/v) polyethylene glycol 4000, 20-30% (v/v) polyethylene glycol 200
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.265 |
| 7BWR Mycobacterium smegmatis arabinosyltransferase complex EmbB2-AcpM2 in substrate DPA bound asymmetric "active state" 提交 2020-04-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–99（99 aa）
链 D
1–99（99 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 F8L [(2Z,6E,10E,14Z,18E,22Z,26Z)-3,7,11,15,19,23,27,31,35,39-decamethyltetraconta-2,6,10,14,18,22,26,30,34,38-decaenyl] [(2S,3S,4S,5R)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl] hydrogen phosphate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7BX8 Mycobacterium smegmatis arabinosyltransferase complex EmbB2-AcpM2 in symmetric "resting state" 提交 2020-04-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–99（99 aa）
链 D
1–99（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8ZKP Cryo-EM structure of the efflux transporter MmpL5/MmpS5 from Mycobacterium tuberculosis, C3 symmetry 提交 2024-05-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 D
1–99（99 aa）
链 H
1–99（99 aa）
链 I
1–99（99 aa）
|
未记录 | CDL CARDIOLIPIN × 6 PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 6 PN7 N~3~-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-N-(2-sulfanylethyl)-beta-alaninamide × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.64 Å |
| 8ZKQ Cryo-EM structure of the efflux transporter MmpL5/MmpS5 from Mycobacterium tuberculosis, C1 symmetry 提交 2024-05-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 D
1–99（99 aa）
链 H
1–99（99 aa）
链 I
1–99（99 aa）
|
未记录 | CDL CARDIOLIPIN × 6 PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 6 PN7 N~3~-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-N-(2-sulfanylethyl)-beta-alaninamide × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å |
| 9DP6 Mycolicibacterium smegmatis MmpL5-AcpM structure 提交 2024-09-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–99（99 aa）
|
未记录 | PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å |
| 9MVZ Tripartite complex of MmpL5-S5-AcpM from Mycolicibacterium smegmatis 提交 2025-01-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 G
1–99（99 aa）
链 H
1–99（99 aa）
链 I
1–99（99 aa）
|
未记录 | PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.81 Å |
| 9MW0 Bipartite complex of MmpL5-AcpM from Mycolicibacterium smegmatis 提交 2025-01-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 G
1–99（99 aa）
链 H
1–99（99 aa）
链 I
1–99（99 aa）
|
未记录 | PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 9MX0 Cluster of bipartite complex of MmpL5-AcpM from Mycolicibacterium smegmatis 提交 2025-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 B
1–99（99 aa）
链 C
1–99（99 aa）
链 E
1–99（99 aa）
链 G
1–99（99 aa）
链 I
1–99（99 aa）
链 K
1–99（99 aa）
链 M
1–99（99 aa）
链 N
1–99（99 aa）
链 O
1–99（99 aa）
链 S
1–99（99 aa）
链 T
1–99（99 aa）
链 U
1–99（99 aa）
|
未记录 | PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 9RFU M.tuberculosis MmpS5L5-acpM complex 提交 2025-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 G
3–80（78 aa）
链 H
3–80（78 aa）
链 I
3–80（78 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | L9Q (1S)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(octadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM HEPES pH 8.0, 150 mM NaCl, 0.004% LMNG
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9RGB M.tuberculosis MmpS5L5-acpM complex 提交 2025-06-06 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 G
1–99（99 aa）
链 H
1–99（99 aa）
链 I
1–99（99 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | L9Q (1S)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(octadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM HEPES pH 8.0, 150 mM NaCl, 0.004% LMNG
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9S2U 1:1 complex of M.tuberculosis MmpL5 and M.smegmatis AcpM 提交 2025-07-22 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
3–80（78 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM HEPES pH8.0, 150 mM NaCl, 0.004% LMNG, 50 uM Bedaquiline
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9U4T Cryo-EM map of MSMEG_3496 in complex with AcpM, size exclusion chromatography peak1 提交 2025-03-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–99（99 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 9U4V Cryo-EM map of MSMEG_3496 in complex with AcpM, size exclusion chromatography peak2 提交 2025-03-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–99（99 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 9U51 Cryo-EM structure of Mycobacterium tuberculosis MmpL5 in complex with AcpM 提交 2025-03-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–99（99 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |