当前蛋白身份：P01112
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 10DC H-Ras GTPase R68A bound to GppNHp 提交 2026-01-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：R68A | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Calcium Acetate, 20% w/v PEG 3350, 0.1% N-octyl glucopyranoside
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.215 |
| 121P STRUKTUR UND GUANOSINTRIPHOSPHAT-HYDROLYSEMECHANISMUS DES C-TERMINAL VERKUERZTEN MENSCHLICHEN KREBSPROTEINS P21-H-RAS 提交 1991-06-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.54 Å |
| 1AA9 HUMAN C-HA-RAS(1-171)(DOT)GDP, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1997-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–171（171 aa）
片段：RESIDUES 1 - 171
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.5；303 K
|
分辨率未提供 |
| 1AGP THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES AND PROPERTIES OF A TRANSFORMING AND A NONTRANSFORMING GLY-12 MUTANT OF P21-H-RAS 提交 1993-03-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：G12D | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å |
| 1BKD COMPLEX OF HUMAN H-RAS WITH HUMAN SOS-1 提交 1998-07-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.0
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.281 |
| 1CLU H-RAS COMPLEXED WITH DIAMINOBENZOPHENONE-BETA,GAMMA-IMIDO-GTP 提交 1999-05-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 166
|
突变：GLY12PRO | MG MAGNESIUM ION × 1 DBG 3-AMINOBENZOPHENONE-4-YL-AMINOHYDROXYPHOSPHINYLAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；SEE REFERENCE DECRIBING THE STRUCTURE AND CITATIONS THEREIN, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.261 |
| 1CRP THE SOLUTION STRUCTURE AND DYNAMICS OF RAS P21. GDP DETERMINED BY HETERONUCLEAR THREE AND FOUR DIMENSIONAL NMR SPECTROSCOPY 提交 1993-11-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1CRQ THE SOLUTION STRUCTURE AND DYNAMICS OF RAS P21. GDP DETERMINED BY HETERONUCLEAR THREE AND FOUR DIMENSIONAL NMR SPECTROSCOPY 提交 1993-11-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1CRR THE SOLUTION STRUCTURE AND DYNAMICS OF RAS P21. GDP DETERMINED BY HETERONUCLEAR THREE AND FOUR DIMENSIONAL NMR SPECTROSCOPY 提交 1993-11-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1CTQ STRUCTURE OF P21RAS IN COMPLEX WITH GPPNHP AT 100 K 提交 1999-08-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 7.6；291 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 28 % PEG 400, 10MM MGCL 264MM TRIS/HCL, PH 7.6, pH 7.60, micro-batch, temperature 18K
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.224 |
| 1GNP X-RAY CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE CATALYTIC DOMAIN OF THE ONCOGENE PRODUCT P21H-RAS COMPLEXED WITH CAGED GTP AND MANT DGPPNHP 提交 1995-05-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 AGN PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID 3'-O-(N-METHYLANTHRANILOYL-2'-DEOXYGUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.70 Å |
| 1GNQ X-RAY CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE CATALYTIC DOMAIN OF THE ONCOGENE PRODUCT P21H-RAS COMPLEXED WITH CAGED GTP AND MANT DGPPNHP 提交 1995-05-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 CAG GUANOSINE 5'-TRIPHOSPHATE P3-[1-(2-NITROPHENYL)ETHYL ESTER] × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.269 |
| 1GNR X-RAY CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE CATALYTIC DOMAIN OF THE ONCOGENE PRODUCT P21H-RAS COMPLEXED WITH CAGED GTP AND MANT DGPPNHP 提交 1995-05-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 CAG GUANOSINE 5'-TRIPHOSPHATE P3-[1-(2-NITROPHENYL)ETHYL ESTER] × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.85 Å R-free 0.257 |
| 1IAQ C-H-RAS P21 PROTEIN MUTANT WITH THR 35 REPLACED BY SER (T35S) COMPLEXED WITH GUANOSINE-5'-[B,G-IMIDO] TRIPHOSPHATE 提交 2001-03-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN (RESIDUES 1-166)
|
突变：T35S | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG1500, calcium chloride, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.282 |
| 1IAQ C-H-RAS P21 PROTEIN MUTANT WITH THR 35 REPLACED BY SER (T35S) COMPLEXED WITH GUANOSINE-5'-[B,G-IMIDO] TRIPHOSPHATE 提交 2001-03-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN (RESIDUES 1-166)
|
突变：T35S | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG1500, calcium chloride, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.282 |
| 1IAQ C-H-RAS P21 PROTEIN MUTANT WITH THR 35 REPLACED BY SER (T35S) COMPLEXED WITH GUANOSINE-5'-[B,G-IMIDO] TRIPHOSPHATE 提交 2001-03-23 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN (RESIDUES 1-166)
|
突变：T35S | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG1500, calcium chloride, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.282 |
| 1IOZ Crystal Structure of the C-HA-RAS Protein Prepared by the Cell-Free Synthesis 提交 2001-04-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–171（171 aa）
片段：RESIDUES 1-171
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；calcium acetate, sodium cacodylate, PEG8000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.283 |
| 1JAH H-RAS P21 PROTEIN MUTANT G12P, COMPLEXED WITH GUANOSINE-5'-[BETA,GAMMA-METHYLENE] TRIPHOSPHATE AND MAGNESIUM 提交 1996-12-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 166
|
突变：G12P | MG MAGNESIUM ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.290 |
| 1JAI H-RAS P21 PROTEIN MUTANT G12P, COMPLEXED WITH GUANOSINE-5'-[BETA,GAMMA-METHYLENE] TRIPHOSPHATE AND MANGANESE 提交 1996-12-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 166
|
突变：G12P | MN MANGANESE (II) ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.290 |
| 1K8R Crystal structure of Ras-Bry2RBD complex 提交 2001-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTP-binding/catalytic domain, residues 1-166
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；PEG 3350, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.305 |
| 1LF0 Crystal Structure of RasA59G in the GTP-bound form 提交 2002-04-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：Residues 1-166
|
突变：A59G | MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG1500, calcium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.208 |
| 1LF5 Crystal Structure of RasA59G in the GDP-bound Form 提交 2002-04-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：Residues 1-166
|
突变：A59G | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG8000, calcium acetate, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.245 |
| 1LFD CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACTIVE RAS PROTEIN COMPLEXED WITH THE RAS-INTERACTING DOMAIN OF RALGDS 提交 1998-04-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–167（167 aa）
片段：RESIDUES 1-171
|
突变：E31K | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.282 |
| 1LFD CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACTIVE RAS PROTEIN COMPLEXED WITH THE RAS-INTERACTING DOMAIN OF RALGDS 提交 1998-04-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–167（167 aa）
片段：RESIDUES 1-171
|
突变：E31K | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.282 |
| 1NVU Structural evidence for feedback activation by RasGTP of the Ras-specific nucleotide exchange factor SOS 提交 2003-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：A59G 突变：A59G | MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.2-1.5 M phosphate, 100 mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.211 |
| 1NVU Structural evidence for feedback activation by RasGTP of the Ras-specific nucleotide exchange factor SOS 提交 2003-02-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：A59G 突变：A59G | MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 20 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.2-1.5 M phosphate, 100 mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.211 |
| 1NVV Structural evidence for feedback activation by RasGTP of the Ras-specific nucleotide exchange factor SOS 提交 2003-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：Y64A | MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.2-1.5 M phosphate, 100 mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.241 |
| 1NVV Structural evidence for feedback activation by RasGTP of the Ras-specific nucleotide exchange factor SOS 提交 2003-02-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：Y64A | MG MAGNESIUM ION × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 40 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.2-1.5 M phosphate, 100 mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.241 |
| 1NVV Structural evidence for feedback activation by RasGTP of the Ras-specific nucleotide exchange factor SOS 提交 2003-02-04 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：Y64A | MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 20 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.2-1.5 M phosphate, 100 mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.241 |
| 1NVV Structural evidence for feedback activation by RasGTP of the Ras-specific nucleotide exchange factor SOS 提交 2003-02-04 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：Y64A | MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 10 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.2-1.5 M phosphate, 100 mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.241 |
| 1NVW Structural evidence for feedback activation by RasGTP of the Ras-specific nucleotide exchange factor SOS 提交 2003-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 7 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.2-1.5 M phosphate, 100 mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.246 |
| 1NVW Structural evidence for feedback activation by RasGTP of the Ras-specific nucleotide exchange factor SOS 提交 2003-02-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 56 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.2-1.5 M phosphate, 100 mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.246 |
| 1NVW Structural evidence for feedback activation by RasGTP of the Ras-specific nucleotide exchange factor SOS 提交 2003-02-04 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 28 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；1.2-1.5 M phosphate, 100 mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.246 |
| 1NVX Structural evidence for feedback activation by RasGTP of the Ras-specific nucleotide exchange factor SOS 提交 2003-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：A59G 突变：A59G | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；2-8% PEG 4000, 100 mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.261 |
| 1P2S H-Ras 166 in 50% 2,2,2 triflouroethanol 提交 2003-04-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ETF TRIFLUOROETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；298 K；PEG, MAGNESIUM CHLORIDE, DITHIOTHREITOL, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.230 |
| 1P2T H-Ras 166 in Aqueous mother liqour, RT 提交 2003-04-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；298 K；PEG, MAGNESIUM CHLORIDE, DITHIOTHREITOL, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 1P2U H-Ras in 50% isopropanol 提交 2003-04-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.248 |
| 1P2V H-RAS 166 in 60 % 1,6 hexanediol 提交 2003-04-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å R-free 0.252 |
| 1PLJ CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES ON P21H-RAS USING SYNCHROTRON LAUE METHOD: IMPROVEMENT OF CRYSTAL QUALITY AND MONITORING OF THE GTPASE REACTION AT DIFFERENT TIME POINTS 提交 1994-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 CAG GUANOSINE 5'-TRIPHOSPHATE P3-[1-(2-NITROPHENYL)ETHYL ESTER] × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å |
| 1PLK CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES ON P21H-RAS USING SYNCHROTRON LAUE METHOD: IMPROVEMENT OF CRYSTAL QUALITY AND MONITORING OF THE GTPASE REACTION AT DIFFERENT TIME POINTS 提交 1994-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å |
| 1PLL CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES ON P21H-RAS USING SYNCHROTRON LAUE METHOD: IMPROVEMENT OF CRYSTAL QUALITY AND MONITORING OF THE GTPASE REACTION AT DIFFERENT TIME POINTS 提交 1994-03-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å |
| 1Q21 CRYSTAL STRUCTURES AT 2.2 ANGSTROMS RESOLUTION OF THE CATALYTIC DOMAINS OF NORMAL RAS PROTEIN AND AN ONCOGENIC MUTANT COMPLEXED WITH GSP 提交 1991-09-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–171（171 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1QRA STRUCTURE OF P21RAS IN COMPLEX WITH GTP AT 100 K 提交 1999-06-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1 - 166
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICRODIALYSIS；pH 7.6；293 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 26 % PEG 400, 10MM MGCL 264MM TRIS/HCL, PH 7.6, MICRODIALYSIS, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.228 |
| 1RVD H-RAS COMPLEXED WITH DIAMINOBENZOPHENONE-BETA,GAMMA-IMIDO-GTP 提交 1999-05-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 166
|
突变：GLY12VAL | MG MAGNESIUM ION × 1 DBG 3-AMINOBENZOPHENONE-4-YL-AMINOHYDROXYPHOSPHINYLAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；SEE REFERENCE DECRIBING THE STRUCTURE AND CITATIONS THEREIN, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.274 |
| 1WQ1 RAS-RASGAP COMPLEX 提交 1997-07-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 166
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；SEE REF. DESCRIBING THE STRUCTURE, pH 8.
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.319 |
| 1XCM Crystal structure of the GppNHp-bound H-Ras G60A mutant 提交 2004-09-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–167（167 aa）
|
突变：G60A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 2000 MME, magnesium sulfate, HEPES, hydrogen peroxide, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.244 |
| 1XD2 Crystal Structure of a ternary Ras:SOS:Ras*GDP complex 提交 2004-09-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
链 B
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
突变：Y64A | MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；Hepes, Na/K phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.245 |
| 1XJ0 Crystal Structure of the GDP-bound form of the RasG60A mutant 提交 2004-09-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：Residues 1-166
|
突变：G60A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG 4000, magnesium sulfate, Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.239 |
| 1ZVQ Structure of the Q61G mutant of Ras in the GDP-bound form 提交 2005-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：Q61G | MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；18% PEG4000, 50 mM Ca Acetate, 10 mM MgCl2, 100 mM Tris-HCl, 250 mM NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 1ZW6 Crystal Structure of the GTP-bound form of RasQ61G 提交 2005-06-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：Q61G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；22% PEG4000, 200mM Ca Acetate, 100 mM Tris-HCl, 10 mM MgCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.174 |
| 221P THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF H-RAS P21 MUTANTS: MOLECULAR BASIS FOR THEIR INABILITY TO FUNCTION AS SIGNAL SWITCH MOLECULES 提交 1991-06-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：D38E | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å |
| 2C5L Structure of PLC epsilon Ras association domain with hRas 提交 2005-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：YES | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.228 |
| 2C5L Structure of PLC epsilon Ras association domain with hRas 提交 2005-10-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
突变：YES | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.228 |
| 2CE2 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A FLUORESCENT FORM OF H-RAS P21 IN COMPLEX WITH GDP 提交 2006-02-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 X
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：YES | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 XY2 N,N'-DIMETHYL-N-(ACETYL)-N'-(7-NITROBENZ-2-OXA-1,3-DIAZOL-4-YL)ETHYLENEDIAMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291 K；PROTEIN SOLUTION: 17.22 MG/ML PROTEIN, 64 MM TRIS PH 7.6, 20 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 10 MM DTT, 0,1 MM SODIUM AZIDE; RESERVOIR SOLUTION: 64 MM TRIS PH 7.6, 20 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 10 MM DTT, 0,1 MM SODIUM AZIDE, 35% PEG 400 MIXTURE OF EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AND RESERVOIR SOLUTION, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291.15K
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.163 |
| 2CL0 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A FLUORESCENT FORM OF H-RAS P21 IN COMPLEX WITH GppNHp 提交 2006-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 X
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：YES | MG MAGNESIUM ION × 15 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 3 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 3 XY2 N,N'-DIMETHYL-N-(ACETYL)-N'-(7-NITROBENZ-2-OXA-1,3-DIAZOL-4-YL)ETHYLENEDIAMINE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.6；RESERVOIR SOLUTION: 64 MM TRIS PH 7.6, 20 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 10 MM DTT, 0.1 MM SODIUM AZIDE, 26% PEG 400; PROTEIN SOLUTION: 64 MM TRIS PH 7.6, 20 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 10 MM DTT, 0.1 MM SODIUM AZIDE
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.185 |
| 2CL6 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A FLUORESCENT FORM OF H-RAS P21 IN COMPLEX WITH S-caged GTP 提交 2006-04-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 X
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：YES | CAG GUANOSINE 5'-TRIPHOSPHATE P3-[1-(2-NITROPHENYL)ETHYL ESTER] × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 XY2 N,N'-DIMETHYL-N-(ACETYL)-N'-(7-NITROBENZ-2-OXA-1,3-DIAZOL-4-YL)ETHYLENEDIAMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；291.15 K；PROTEIN SOLUTION: 64 MM TRIS PH 7.6, 20 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 10 MM DTT, 0,1 MM SODIUM AZIDE; RESERVOIR SOLUTION: 100 MM HEPES PH 7.4, 200 MM MAGNESIUM ACETATE, 17% PEG 8000 (FRESHLY PREPARED) MIXTURE OF EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AND RESERVOIR SOLUTION, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291.15K
|
分辨率 1.24 Å R-free 0.186 |
| 2CL7 CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A FLUORESCENT FORM OF H-RAS P21 IN COMPLEX WITH GTP 提交 2006-04-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 X
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：YES | MG MAGNESIUM ION × 2 XY2 N,N'-DIMETHYL-N-(ACETYL)-N'-(7-NITROBENZ-2-OXA-1,3-DIAZOL-4-YL)ETHYLENEDIAMINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；291.15 K；PROTEIN SOLUTION: 13.35 MG/ML PROTEIN, 64 MM TRIS PH 7.6, 20 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 10 MM DTT, 0,1 MM SODIUM AZIDE; RESERVOIR SOLUTION: 100 MM HEPES PH 7.2, 200 MM MAGNESIUM ACETATE, 16% PEG 8000 (FRESHLY PREPARED) MIXTURE OF EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AND RESERVOIR SOLUTION, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291.15K
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.170 |
| 2CLC CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A FLUORESCENT FORM OF H-RAS P21 IN COMPLEX WITH GTP (2) 提交 2006-04-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 X
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：YES | MG MAGNESIUM ION × 2 XY2 N,N'-DIMETHYL-N-(ACETYL)-N'-(7-NITROBENZ-2-OXA-1,3-DIAZOL-4-YL)ETHYLENEDIAMINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；291.15 K；PROTEIN SOLUTION: 13.35 MG/ML PROTEIN, 64 MM TRIS PH 7.6, 20 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 10 MM DTT, 0,1 MM SODIUM AZIDE; RESERVOIR SOLUTION: 100 MM HEPES PH 7.2, 200 MM MAGNESIUM ACETATE, 16% PEG 8000 FRESHLY PREPARED) MIXTURE OF EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AND RESERVOIR SOLUTION, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291.15K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.180 |
| 2CLD CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A FLUORESCENT FORM OF H-RAS P21 IN COMPLEX WITH GDP (2) 提交 2006-04-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 X
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：YES | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；291.15 K；PROTEIN SOLUTION: 13.35 MG/ML PROTEIN, 64 MM TRIS PH 7.6, 20 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 10 MM DTT, 0,1 MM SODIUM AZIDE; RESERVOIR SOLUTION: 100 MM HEPES PH 7.2, 200 MM MAGNESIUM ACETATE, 16% PEG 8000 (FRESHLY PREPARED) MIXTURE OF EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AND RESERVOIR SOLUTION, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 291.15K
|
分辨率 1.22 Å R-free 0.176 |
| 2EVW Crystal structure analysis of a fluorescent form of H-Ras p21 in complex with R-caged GTP 提交 2005-11-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 X
1–166（166 aa）
片段：truncated form residues 1-166
|
突变：Y32C,C118S | MG MAGNESIUM ION × 1 CAG GUANOSINE 5'-TRIPHOSPHATE P3-[1-(2-NITROPHENYL)ETHYL ESTER] × 1 XY2 N,N'-DIMETHYL-N-(ACETYL)-N'-(7-NITROBENZ-2-OXA-1,3-DIAZOL-4-YL)ETHYLENEDIAMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；291.15 K；protein solution: 64 mM TRIS pH 7.6, 20 mM magnesium chloride, 10 mM DTT, 0,1 mM sodium azide;
reservoir solution: 100 mM HEPES pH 7.2, 200 mM magnesium acetate, 16% PEG 8000 (freshly prepared)
mixture of equal volumes of protein and reservoir solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.181 |
| 2LCF Solution structure of GppNHp-bound H-RasT35S mutant protein 提交 2011-04-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
突变：T35S | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.24；压力 ambient
NMR样品组成
1-2mM [U-98% 13C; U-98% 15N] HRas-1, 1-2mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-2, 10mM MAGNESIUM ION-3, 150mM sodium chloride-4, 25mM sodium phosphate-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1-2mM [U-98% 15N] HRas-6, 1-2mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-7, 10mM MAGNESIUM ION-8, 150mM sodium chloride-9, 25mM sodium phosphate-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LWI Solution structure of H-RasT35S mutant protein in complex with Kobe2601 提交 2012-08-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-166
|
突变：T35S | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 KOB 2-(2,4-dinitrophenyl)-N-(4-fluorophenyl)hydrazinecarbothioamide × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；278 K；离子强度（mmCIF原始值）0.22；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] entity_1-1, 1 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-2, 8 mM MAGNESIUM ION-3, 120 mM sodium chloride-4, 20 mM sodium phosphate-5, 3.8 mM KOB-6, 80% D2O/20% DMSO_d6 | 80% D2O/20% DMSO_d6
NMR样品组成
1 mM entity_1-7, 1 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER-8, 8 mM MAGNESIUM ION-9, 120 mM sodium chloride-10, 20 mM sodium phosphate-11, 3.8 mM KOB-12, 80% D2O/20% DMSO_d6 | 80% D2O/20% DMSO_d6
|
分辨率未提供 |
| 2N42 EC-NMR Structure of Human H-RasT35S mutant protein Determined by Combining Evolutionary Couplings (EC) and Sparse NMR Data 提交 2015-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：T35S | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 2N46 EC-NMR Structure of Human H-RasT35S mutant protein Determined by Combining Evolutionary Couplings (EC) and Sparse NMR Data 提交 2015-06-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：T35S | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 2Q21 CRYSTAL STRUCTURES AT 2.2 ANGSTROMS RESOLUTION OF THE CATALYTIC DOMAINS OF NORMAL RAS PROTEIN AND AN ONCOGENIC MUTANT COMPLEXED WITH GSP 提交 1991-09-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–171（171 aa）
|
突变：G12V | MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 2QUZ Crystal Structure of the activating H-RasK117R mutant in Costello Syndrome, bound to Mg-GDP 提交 2007-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：G-domain, residues 1-166
|
突变：K117R | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293 K；37% PEG3350, 50mM TrisHCl pH8, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.222 |
| 2RGA Crystal structure of H-RasQ61I-GppNHp 提交 2007-10-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：Residues 1-166
|
突变：Q61I | CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；20% PEG 3350, 10 % PEG 6000, 0.2M Calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.212 |
| 2RGB Crystal structure of H-RasQ61K-GppNHp 提交 2007-10-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：Residues 1-166
|
突变：Q61K | CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2M Calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.218 |
| 2RGC Crystal structure of H-RasQ61V-GppNHp 提交 2007-10-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：Residues 1-166
|
突变：Q61V | MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；20 % PEG 3350, 0.2 M Calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.213 |
| 2RGD Crystal structure of H-RasQ61L-GppNHp 提交 2007-10-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：Residues 1-166
|
突变：Q61L | CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；20 % PEG 3350, 0.2M Calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.220 |
| 2RGE Crystal structure of H-Ras-GppNHp 提交 2007-10-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：Residues 1-166
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；20% PEG 3350, 0.2M Calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.219 |
| 2RGG Crystal structure of H-RasQ61I-GppNHp, trigonal crystal form 提交 2007-10-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：Residues 1-166
|
突变：Q61I | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；20 % PEG 3350, 0.2 M Calcium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.234 |
| 2UZI Crystal structure of HRAS(G12V) - anti-RAS Fv complex 提交 2007-04-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：YES | ZN ZINC ION × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 17-18 % PEG3350, 400 MM ZINC ACETATE, 100 MM SODIUM CACODYLATE, PH 5.8, 0.03 % DICHLOROMETHANE
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.271 |
| 2VH5 CRYSTAL STRUCTURE OF HRAS(G12V) - ANTI-RAS FV (disulfide free mutant) COMPLEX 提交 2007-11-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
突变：YES | ZN ZINC ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.8；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 17-18 % PEG3350, 320 MM ZINC ACETATE, 100 MM SODIUM CACODYLATE, PH 5.8, 0.03 % DICHLOROMETHANE
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.291 |
| 2X1V Crystal Structure of the activating H-Ras I163F mutant in Costello Syndrome, bound to MG-GDP 提交 2010-01-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：G-DOMAIN, RESIDUES 1-166
|
突变：YES | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.6；18% POLYETHYLENE GLYCOL (PEG) 6000, 100 MM HEPES PH 7.4, 150 MM MGCL2.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.227 |
| 3DDC Crystal Structure of NORE1A in Complex with RAS 提交 2008-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：D30E, E31K | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；100MM C2H3NAO2, 20% PEG 2000, 250MM (NH4)2SO4, 10MM DTE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 3DDC Crystal Structure of NORE1A in Complex with RAS 提交 2008-06-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：D30E, E31K | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；100MM C2H3NAO2, 20% PEG 2000, 250MM (NH4)2SO4, 10MM DTE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 3I3S Crystal Structure of H-Ras with Thr50 replaced by Isoleucine 提交 2009-06-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：T50I | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；285 K；17% PEG 6000, 200 mM CaCl2, pH 7.5, hanging drop, temperature 285K
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.178 |
| 3I3S Crystal Structure of H-Ras with Thr50 replaced by Isoleucine 提交 2009-06-30 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：T50I | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 6 MG MAGNESIUM ION × 18 CA CALCIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；285 K；17% PEG 6000, 200 mM CaCl2, pH 7.5, hanging drop, temperature 285K
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.178 |
| 3I3S Crystal Structure of H-Ras with Thr50 replaced by Isoleucine 提交 2009-06-30 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：T50I | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；285 K；17% PEG 6000, 200 mM CaCl2, pH 7.5, hanging drop, temperature 285K
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.178 |
| 3I3S Crystal Structure of H-Ras with Thr50 replaced by Isoleucine 提交 2009-06-30 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：T50I | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 6 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；285 K；17% PEG 6000, 200 mM CaCl2, pH 7.5, hanging drop, temperature 285K
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.178 |
| 3K8Y Allosteric modulation of H-Ras GTPase 提交 2009-10-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291.15 K；0.2M Calcium acetate, 20% PEG 3350, 0.05% n-Octyl-B-D-glucopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.227 |
| 3K9L Allosteric modulation of H-Ras GTPase 提交 2009-10-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：Y32F | CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；0.2M Calcium Acetate, 5 mM MgCl2, 10 mM DTT, 20% PEG 3350., pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.271 |
| 3K9L Allosteric modulation of H-Ras GTPase 提交 2009-10-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：Y32F | CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；0.2M Calcium Acetate, 5 mM MgCl2, 10 mM DTT, 20% PEG 3350., pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.271 |
| 3K9L Allosteric modulation of H-Ras GTPase 提交 2009-10-15 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：Y32F | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；0.2M Calcium Acetate, 5 mM MgCl2, 10 mM DTT, 20% PEG 3350., pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.271 |
| 3K9N Allosteric modulation of H-Ras GTPase 提交 2009-10-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：Y32F | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.5 K；0.2M Calcium Acetate, 20 % PEG 3350, 5 mM MgCl2, 10 mM DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.5K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.277 |
| 3KKM Crystal structure of H-Ras T35S in complex with GppNHp 提交 2009-11-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：G domain, UNP residues 1-166
|
突变：T35S | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Tris-HCl, Ammonium Sulfate, DMSO, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.232 |
| 3KKN Crystal structure of H-Ras T35S in complex with GppNHp 提交 2009-11-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：G domain, UNP residues 1-166
|
突变：T35S | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；MES, Ammonium Sulfate, PEG-MME-5000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.242 |
| 3KUD Complex of Ras-GDP with RafRBD(A85K) 提交 2009-11-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；1.3M Na-Malonat pH 6.0, 100 mM MES pH 6.1, 4% Betaine, 2% Sarcosine, 2% N,N-dimethylglycine, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.264 |
| 3L8Y Complex of Ras with cyclen 提交 2010-01-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 YCN 1,4,7,10-tetraazacyclododecane × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；285 K；17% PEG6000, 200mM CaCl2, 30mM TRIS/HCL, 5mM MgCl2, 2mM DTE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.238 |
| 3L8Z H-Ras wildtype new crystal form 提交 2010-01-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；285 K；17% PEG6000, 200mM CaCl2, 30mM TRIS/HCL, 5mM MgCl2, 2mM DTE, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285K
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.220 |
| 3LBH Ras soaked in Calcium Acetate 提交 2010-01-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291.15 K；200 mM Calcium Acetate, 20 % PEG 3350, 0.05% n-Octylglucopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.209 |
| 3LBH Ras soaked in Calcium Acetate 提交 2010-01-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 3 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ACT ACETATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291.15 K；200 mM Calcium Acetate, 20 % PEG 3350, 0.05% n-Octylglucopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.209 |
| 3LBI Ras soaked in Magnesium Acetate and back soaked in Calcium Acetate 提交 2010-01-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291.15 K；200 mM Calcium Acetate, 20 % PEG 3350, 0.05% n-Octylglucopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.217 |
| 3LBI Ras soaked in Magnesium Acetate and back soaked in Calcium Acetate 提交 2010-01-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 3 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ACT ACETATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291.15 K；200 mM Calcium Acetate, 20 % PEG 3350, 0.05% n-Octylglucopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.217 |
| 3LBN Ras soaked in Magnesium Acetate 提交 2010-01-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291.15 K；200 mM Calcium Acetate, 20 % PEG 3350, 0.05% n-Octylglucopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.224 |
| 3LBN Ras soaked in Magnesium Acetate 提交 2010-01-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 3 CA CALCIUM ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291.15 K；200 mM Calcium Acetate, 20 % PEG 3350, 0.05% n-Octylglucopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.224 |
| 3LO5 Crystal Structure of the dominant negative S17N mutant of Ras 提交 2010-02-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：H-Ras (UNP residues 1-166)
|
突变：S17N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；15% (v/v) PEG400, 13% (w/v) PEG8000, 0.2 M calcium acetate, and 0.1 M Tris-HCl pH = 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.296 |
| 3LO5 Crystal Structure of the dominant negative S17N mutant of Ras 提交 2010-02-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
片段：H-Ras (UNP residues 1-166)
|
突变：S17N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；15% (v/v) PEG400, 13% (w/v) PEG8000, 0.2 M calcium acetate, and 0.1 M Tris-HCl pH = 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.296 |
| 3LO5 Crystal Structure of the dominant negative S17N mutant of Ras 提交 2010-02-03 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1–166（166 aa）
片段：H-Ras (UNP residues 1-166)
|
突变：S17N | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；15% (v/v) PEG400, 13% (w/v) PEG8000, 0.2 M calcium acetate, and 0.1 M Tris-HCl pH = 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.57 Å R-free 0.296 |
| 3OIU H-RasQ61L with allosteric switch in the "on" state 提交 2010-08-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：Q61L | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
sitting drop；pH 7.5；298 K；365mM Calcium Acetate, 24 % PEG 3350, pH 7.5, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 1.32 Å R-free 0.192 |
| 3OIU H-RasQ61L with allosteric switch in the "on" state 提交 2010-08-20 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：Q61L | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 3 CA CALCIUM ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 6 ACT ACETATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
sitting drop；pH 7.5；298 K；365mM Calcium Acetate, 24 % PEG 3350, pH 7.5, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 1.32 Å R-free 0.192 |
| 3OIV H-RasG12V with allosteric switch in the "off" state 提交 2010-08-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：G12V | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
sitting drop；pH 7.5；298 K；200 Mm Calcium Chloride, 20 % PEG 3350, pH 7.5, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.198 |
| 3OIV H-RasG12V with allosteric switch in the "off" state 提交 2010-08-20 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：G12V | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 3 CA CALCIUM ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 9 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
sitting drop；pH 7.5；298 K；200 Mm Calcium Chloride, 20 % PEG 3350, pH 7.5, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.198 |
| 3OIW H-RasG12V with allosteric switch in the "on" state 提交 2010-08-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：G12V | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
sitting drop；pH 7.5；298 K；200 Mm Calcium Acetate, 20 % PEG 3350, pH 7.5, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.210 |
| 3OIW H-RasG12V with allosteric switch in the "on" state 提交 2010-08-20 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：G12V | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 3 CA CALCIUM ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 6 ACT ACETATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
sitting drop；pH 7.5；298 K；200 Mm Calcium Acetate, 20 % PEG 3350, pH 7.5, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.210 |
| 3RRY H-Ras crosslinked control, soaked in aqueous solution: one of 10 in MSCS set 提交 2011-05-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；298 K；20 % PEG 3350, 200mM Calcium Chloride, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.201 |
| 3RRZ H-Ras in 70% glycerol: one of 10 in MSCS set 提交 2011-05-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；298 K；20 % PEG 3350, 200mM Calcium Chloride, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.205 |
| 3RS0 H-Ras soaked in neat cyclopentanol: one of 10 in MSCS set 提交 2011-05-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 YEG cyclopentanol × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；298 K；20 % PEG 3350, 200mM Calcium Chloride, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.185 |
| 3RS2 H-Ras soaked in 50% 2,2,2-trifluoroethanol: one of 10 in MSCS set 提交 2011-05-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ETF TRIFLUOROETHANOL × 2 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；298 K；20 % PEG 3350, 200mM Calcium Chloride, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.203 |
| 3RS3 H-Ras soaked in neat hexane: 1 of 10 in MSCS set 提交 2011-05-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 HEX HEXANE × 2 CA CALCIUM ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；298 K；20 % PEG 3350, 200mM Calcium Chloride, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.207 |
| 3RS4 H-Ras soaked in 60% 1,6-hexanediol: 1 of 10 in MSCS set 提交 2011-05-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；298 K；20 % PEG 3350, 200mM Calcium Chloride, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.198 |
| 3RS5 H-Ras soaked in 55% dimethylformamide: 1 of 10 in MSCS set 提交 2011-05-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 DMF DIMETHYLFORMAMIDE × 4 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；298 K；20 % PEG 3350, 200mM Calcium Chloride, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.182 |
| 3RS7 H-Ras soaked in 50% isopropanol: 1 of 10 in MSCS set 提交 2011-05-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；298 K；20 % PEG 3350, 200mM Calcium Chloride, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.208 |
| 3RSL H-Ras soaked in 90% R,S,R-bisfuranol: one of 10 in MSCS set 提交 2011-05-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 RSF (3R,3aS,6aR)-hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-ol × 13 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；298 K；20 % PEG 3350, 200mM Calcium Chloride, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.220 |
| 3RSO H-Ras soaked in 20% S,R,S-bisfuranol: 1 of 10 in MSCS set 提交 2011-05-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 RSG (3S,3aR,6aS)-hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；pH 7.5；298 K；20 % PEG 3350, 200mM Calcium Chloride, pH 7.5, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.199 |
| 3TGP Room temperature H-ras 提交 2011-08-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；pH 7.6；291 K；Protein was crystallized from 28 % PEG 400, 10mM MgCl 264 mM TRIS/HCl, PH 7.6, pH 7.60, micro-batch, temperature 291.0K
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.213 |
| 421P THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF H-RAS P21 MUTANTS: MOLECULAR BASIS FOR THEIR INABILITY TO FUNCTION AS SIGNAL SWITCH MOLECULES 提交 1991-06-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：G12R | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 4DLR H-Ras PEG 400/Ca(OAc)2, ordered off 提交 2012-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 DTU (2R,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM Ca Acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.32 Å R-free 0.186 |
| 4DLR H-Ras PEG 400/Ca(OAc)2, ordered off 提交 2012-02-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 18 DTU (2R,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL × 6 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM Ca Acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.32 Å R-free 0.186 |
| 4DLS H-Ras Set 1 CaCl2 'Mixed' 提交 2012-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.194 |
| 4DLS H-Ras Set 1 CaCl2 'Mixed' 提交 2012-02-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 12 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.82 Å R-free 0.194 |
| 4DLT H-Ras Set 2 Ca(OAc)2, on 提交 2012-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM Ca Acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.204 |
| 4DLT H-Ras Set 2 Ca(OAc)2, on 提交 2012-02-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 3 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ACT ACETATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM Ca Acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.204 |
| 4DLU H-Ras Set 1 Ca(OAc)2, on 提交 2012-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.203 |
| 4DLU H-Ras Set 1 Ca(OAc)2, on 提交 2012-02-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 3 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ACT ACETATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.203 |
| 4DLV H-Ras Set 2 CaCl2/DTT, ordered off 提交 2012-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
sitting drop；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM Ca Acetate, pH 7.5, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.211 |
| 4DLV H-Ras Set 2 CaCl2/DTT, ordered off 提交 2012-02-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 18 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 6 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
sitting drop；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM Ca Acetate, pH 7.5, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.211 |
| 4DLW H-Ras Set 2 Ca(OAc)2/DTT, on 提交 2012-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM Ca Acetate, pH 7.5, temperature 298K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.202 |
| 4DLW H-Ras Set 2 Ca(OAc)2/DTT, on 提交 2012-02-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 3 CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ACT ACETATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM Ca Acetate, pH 7.5, temperature 298K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.202 |
| 4DLX H-Ras Set 1 CaCl2/DTE, ordered off 提交 2012-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 DTU (2R,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350 200 mM CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.198 |
| 4DLX H-Ras Set 1 CaCl2/DTE, ordered off 提交 2012-02-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 18 DTU (2R,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL × 6 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350 200 mM CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.198 |
| 4DLY Set 1 CaCl2/DTT, ordered off 提交 2012-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.179 |
| 4DLY Set 1 CaCl2/DTT, ordered off 提交 2012-02-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 12 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 12 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.179 |
| 4DLZ H-Ras Set 2 Ca(OAc)2/DTE, ordered off 提交 2012-02-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 DTU (2R,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM Ca Acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.184 |
| 4DLZ H-Ras Set 2 Ca(OAc)2/DTE, ordered off 提交 2012-02-06 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 18 DTU (2R,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL × 12 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG 3350, 200 mM Ca Acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.184 |
| 4EFL Crystal structure of H-Ras WT in complex with GppNHp (state 1) 提交 2012-03-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：G domain, UNP residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MES, 0.2M ammonium sulfate, 30% (w/v) PEG 5000 MME, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.204 |
| 4EFM Crystal structure of H-Ras G12V in complex with GppNHp (state 1) 提交 2012-03-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：G domain, UNP residues 1-166
|
突变：G12V | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MES, 0.2M ammonium sulfate, 30% (w/v) PEG 5000 MME, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.221 |
| 4EFN Crystal structure of H-Ras Q61L in complex with GppNHp (state 1) 提交 2012-03-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：G domain, UNP residues 1-166
|
突变：Q61L | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M MES, 0.2M ammonium sulfate, 30% (w/v) PEG 5000 MME, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.237 |
| 4G0N Crystal Structure of wt H-Ras-GppNHp bound to the RBD of Raf Kinase 提交 2012-07-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 DTU (2R,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；291 K；Protein solution: 10 - 16 mg/mL, 50 mM HEPES, pH 7.2, 50 mM NaCl, 10mM MgCl2 5% Glycerol, 1mM DTE, 10 M ZnCl2
Reservoir solution:200mM calcium acetate, 100mM sodium cacodylate pH 6.5, 18% PEG 8000.
Drop: 1uL protein, 1uL reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.229 |
| 4G3X Crystal Structure of Q61L H-Ras-GppNHp bound to the RBD of Raf Kinase 提交 2012-07-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：Q61L | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；Protein solution: 10 - 18 mg/mL, 50 mM HEPES, pH 7.2, 50 mM NaCl, 10mM MgCl2 5% Glycerol, 1mM DTE, 10 M ZnCl2 Reservoir solution:200mM calcium acetate, 100mM sodium cacodylate pH 6.5, 18% PEG 8000. Drop: 3uL protein, 3uL reservoir , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.271 |
| 4K81 Crystal structure of the Grb14 RA and PH domains in complex with GTP-loaded H-Ras 提交 2013-04-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
片段：GTPase domain, UNP residues 1-166
|
突变：G12V | GOL GLYCEROL × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；315 K；14% (w/v) PEG 3350, 100 mM MES, pH 5.9, 200 mM MgCl2, 2% glycerol, and 3% glucose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 315K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.277 |
| 4K81 Crystal structure of the Grb14 RA and PH domains in complex with GTP-loaded H-Ras 提交 2013-04-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–166（166 aa）
片段：GTPase domain, UNP residues 1-166
|
突变：G12V | GOL GLYCEROL × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；315 K；14% (w/v) PEG 3350, 100 mM MES, pH 5.9, 200 mM MgCl2, 2% glycerol, and 3% glucose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 315K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.277 |
| 4K81 Crystal structure of the Grb14 RA and PH domains in complex with GTP-loaded H-Ras 提交 2013-04-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
1–166（166 aa）
片段：GTPase domain, UNP residues 1-166
|
突变：G12V | GOL GLYCEROL × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；315 K；14% (w/v) PEG 3350, 100 mM MES, pH 5.9, 200 mM MgCl2, 2% glycerol, and 3% glucose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 315K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.277 |
| 4K81 Crystal structure of the Grb14 RA and PH domains in complex with GTP-loaded H-Ras 提交 2013-04-17 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1–166（166 aa）
片段：GTPase domain, UNP residues 1-166
|
突变：G12V | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；315 K；14% (w/v) PEG 3350, 100 mM MES, pH 5.9, 200 mM MgCl2, 2% glycerol, and 3% glucose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 315K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.277 |
| 4L9S Crystal Structure of H-Ras G12C, GDP-bound 提交 2013-06-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase domain, UNP residues 1-166
|
突变：G12C | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；17% PEG8000, 0.1M CaCl2, 0.1M TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.173 |
| 4L9W Crystal Structure of H-Ras G12C, GMPPNP-bound 提交 2013-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase domain, UNP residues 1-166
|
突变：G12C | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；19% PEG3350, 0.2M CaCl2, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.189 |
| 4L9W Crystal Structure of H-Ras G12C, GMPPNP-bound 提交 2013-06-18 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase domain, UNP residues 1-166
|
突变：G12C | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；19% PEG3350, 0.2M CaCl2, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.189 |
| 4NYI Approach for Targeting Ras with Small Molecules that Activate SOS-Mediated Nucleotide Exchange 提交 2013-12-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
链 R
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 2PX N-{1-[(5-methyl-1H-indol-3-yl)methyl]piperidin-4-yl}-L-tryptophanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.208 |
| 4NYJ Approach for Targeting Ras with Small Molecules that Activate SOS-Mediated Nucleotide Exchange 提交 2013-12-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
链 R
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 2PZ N-[1-(1H-indol-3-ylmethyl)piperidin-4-yl]glycinamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.187 |
| 4NYM Approach for Targeting Ras with Small Molecules that Activate SOS-Mediated Nucleotide Exchange 提交 2013-12-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
链 R
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 RND N-[1-(1H-indol-3-ylmethyl)piperidin-4-yl]-L-tryptophanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；0.1 M sodium acetate, 1.8 M sodium formate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.55 Å R-free 0.214 |
| 4Q21 MOLECULAR SWITCH FOR SIGNAL TRANSDUCTION: STRUCTURAL DIFFERENCES BETWEEN ACTIVE AND INACTIVE FORMS OF PROTOONCOGENIC RAS PROTEINS 提交 1991-09-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 4RSG Neutron crystal structure of Ras bound to the GTP analogue GppNHp 提交 2014-11-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | NEUTRON DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；18mg/mL protein, 0.2M calcium acetate, 20% PEG 3350, 20mM HEPES, 50mM NaCl, 20mM MgCl2, 0.1% N-octy-B-D-glucopyranoside, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.287 |
| 4URU The crystal structure of H-Ras and SOS in complex with ligands 提交 2014-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-166
|
未记录 | 6W2 4-METHOXY-N-(1,3-THIAZOL-2-YL)BENZENESULFONAMIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
3.2M SODIUM FORMATE, 2% DMSO
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.237 |
| 4URV The crystal structure of H-Ras and SOS in complex with ligands 提交 2014-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-166
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 2 UMK 4-(4-BROMOPHENYL)PIPERIDIN-4-OL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
3.2M SODIUM FORMATE, 2% DMSO
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.232 |
| 4URW The crystal structure of H-Ras and SOS in complex with ligands 提交 2014-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-166
|
未记录 | DXO 2-(2,6-DIMETHYLPHENYL)-4-(METHYLSULFANYL)-6-(PIPERAZIN-1-YL)-1,3,5-TRIAZINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
3.2M SODIUM FORMATE, 2% DMSO
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.230 |
| 4URX The crystal structure of H-Ras and SOS in complex with ligands 提交 2014-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
未记录 | FK1 6-bromo-1H-indole × 1 HXY 1-(4-bromobenzyl)pyrrolidine × 1 FMT FORMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.49 Å R-free 0.227 |
| 4URY The crystal structure of H-Ras and SOS in complex with ligands 提交 2014-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
未记录 | RV1 N-[(4-aminophenyl)sulfonyl]cyclopropanecarboxamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.47 Å R-free 0.229 |
| 4URZ The crystal structure of H-Ras and SOS in complex with ligands 提交 2014-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：RESIDUES 1-166
|
未记录 | VJP 1-[(4-aminophenyl)sulfonyl]piperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.24 Å R-free 0.212 |
| 4US0 The crystal structure of H-Ras and SOS in complex with ligands 提交 2014-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-166
|
未记录 | NEN 1-ETHYL-PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.17 Å R-free 0.212 |
| 4US1 The crystal structure of H-Ras and SOS in complex with ligands 提交 2014-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-166
|
未记录 | L71 (3S)-3-[3-(aminomethyl)phenyl]-1-ethylpyrrolidine-2,5-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.65 Å R-free 0.231 |
| 4US2 The crystal structure of H-Ras and SOS in complex with ligands 提交 2014-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-166
|
未记录 | L7S 3-[(3R)-1-ethyl-2,5-dioxopyrrolidin-3-yl]benzamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.48 Å R-free 0.228 |
| 4XVQ H-Ras Y137E 提交 2015-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：Y137E | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；152mM Ca(OAc)2, 24.8% PEG 3350, 4.8% stabilization buffer at pH 7.5.
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.254 |
| 4XVR H-Ras Y137F 提交 2015-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：Y137F | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；139mM Ca(OAc)2, 22.6% PEG 3350, 13% stabilization buffer at pH 7.5
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.286 |
| 521P THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF H-RAS P21 MUTANTS: MOLECULAR BASIS FOR THEIR INABILITY TO FUNCTION AS SIGNAL SWITCH MOLECULES 提交 1991-06-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：G12V, A59T | MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å |
| 5B2Z H-Ras WT in complex with GppNHp (state 2*) before structural transition by humidity control 提交 2016-02-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；PEG400, SODIUM ACETATE, CALCIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.178 |
| 5B30 H-Ras WT in complex with GppNHp (state 1) after structural transition by humidity control 提交 2016-02-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；PEG400, SODIUM ACETATE, CALCIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.196 |
| 5E95 Crystal Structure of Mb(NS1)/H-Ras Complex 提交 2015-10-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；292 K；0.2M Ammonium Fluoride, 20% PEG 2250
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.192 |
| 5P21 REFINED CRYSTAL STRUCTURE OF THE TRIPHOSPHATE CONFORMATION OF H-RAS P21 AT 1.35 ANGSTROMS RESOLUTION: IMPLICATIONS FOR THE MECHANISM OF GTP HYDROLYSIS 提交 1990-04-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.35 Å |
| 5VBE Crystal Structure of Small Molecule Disulfide 2C07 Bound to H-Ras M72C GDP 提交 2017-03-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：M72C | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 92V 1-(4-methoxyphenyl)-N-(3-sulfanylpropyl)-5-(trifluoromethyl)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；293 K；22% PEG8000
.1M Tris HCl (pH 7.7)
.1 M CaCl2
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.201 |
| 5VBZ Crystal Structure of Small Molecule Disulfide 2C07 Bound to H-Ras M72C GppNHp 提交 2017-03-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：M72C | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；298 K；32% PEG4000
.1 M Na Cacodylate (pH 6.6)
.2 M CaCl2
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.253 |
| 5VBZ Crystal Structure of Small Molecule Disulfide 2C07 Bound to H-Ras M72C GppNHp 提交 2017-03-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
突变：M72C | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；298 K；32% PEG4000
.1 M Na Cacodylate (pH 6.6)
.2 M CaCl2
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.253 |
| 5VBZ Crystal Structure of Small Molecule Disulfide 2C07 Bound to H-Ras M72C GppNHp 提交 2017-03-30 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：M72C | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 92V 1-(4-methoxyphenyl)-N-(3-sulfanylpropyl)-5-(trifluoromethyl)-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；298 K；32% PEG4000
.1 M Na Cacodylate (pH 6.6)
.2 M CaCl2
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.253 |
| 5WDO H-Ras bound to GMP-PNP at 277K 提交 2017-07-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；16% PEG3350, 100 mM calcium acetate, pH 7.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.168 |
| 5WDP H-Ras mutant L120A bound to GMP-PNP at 277K 提交 2017-07-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：L120A | CA CALCIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；17% PEG8000, 200 mM calcium acetate, 100 mM MES/NaOH, pH 6.0
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.154 |
| 5WDQ H-Ras mutant L120A bound to GMP-PNP at 100K 提交 2017-07-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：L120A | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；17% PEG8000, 200 mM calcium acetate, 100 mM MES/NaOH, pH 6.0
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.150 |
| 5WFO Ligand-bound Ras:SOS:Ras complex 提交 2017-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
链 R
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 5UU 6-chloranyl-~{N}-(4-fluorophenyl)-1,2,3,4-tetrahydroacridin-9-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.188 |
| 5WFP Ligand-bound Ras:SOS:Ras complex 提交 2017-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
链 R
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 5UX 6-chloranyl-~{N}-(3-chloranyl-4-fluoranyl-phenyl)-1,2,3,4-tetrahydroacridin-9-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.203 |
| 5WFQ Ligand-bound Ras:SOS:Ras complex 提交 2017-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
链 R
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 5UV 7-chloranyl-~{N}-(3-chloranyl-4-fluoranyl-phenyl)-1,2,3,4-tetrahydroacridin-9-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.196 |
| 5WFR Ligand-bound Ras:SOS:Ras complex 提交 2017-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
链 R
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 5UW ~{N}-(3,3-diphenylpropyl)piperidin-4-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.194 |
| 5WPL KRas G12V, bound to GppNHp and miniprotein 225-11 提交 2017-08-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M ammonium sulfate and 20-25% PEG3,350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.258 |
| 5WPL KRas G12V, bound to GppNHp and miniprotein 225-11 提交 2017-08-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M ammonium sulfate and 20-25% PEG3,350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.258 |
| 5WPL KRas G12V, bound to GppNHp and miniprotein 225-11 提交 2017-08-05 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 G
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M ammonium sulfate and 20-25% PEG3,350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.258 |
| 5WPL KRas G12V, bound to GppNHp and miniprotein 225-11 提交 2017-08-05 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 J
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M ammonium sulfate and 20-25% PEG3,350
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.258 |
| 5X9S Crystal structure of fully modified H-Ras-GppNHp 提交 2017-03-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 3 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Ca acetate, 20%(w/v) PEG8000, 0.1M MES (pH6.0)
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.236 |
| 5ZC6 Solution structure of H-RasT35S mutant protein in complex with KBFM123 提交 2018-02-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：T35S | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 KBF 3-oxidanyl-~{N}-[[(2~{R})-oxolan-2-yl]methyl]naphthalene-2-carboxamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；278 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成
0.8 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] H-RasT35S, 3.0 mM KBFM123, 20 mM sodium phosphate, 40 mM sodium chloride, 8 mM MAGNESIUM ION, 0.8 mM PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER, 80% D2O/20% d6-DMSO | 80% D2O/20% d6-DMSO
|
分辨率未提供 |
| 621P THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF H-RAS P21 MUTANTS: MOLECULAR BASIS FOR THEIR INABILITY TO FUNCTION AS SIGNAL SWITCH MOLECULES 提交 1991-06-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：Q61H | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å |
| 6AMB Crystal Structure of the Afadin RA1 domain in complex with HRAS 提交 2017-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–168（168 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.9；297 K；PEG3350, K2HPO4
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 6AXG Structure of RasGRP4 in complex with HRas 提交 2017-09-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG3350 and 300 mM sodium thiocyanate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.260 |
| 6AXG Structure of RasGRP4 in complex with HRas 提交 2017-09-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–166（166 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG3350 and 300 mM sodium thiocyanate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.260 |
| 6AXG Structure of RasGRP4 in complex with HRas 提交 2017-09-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
1–166（166 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG3350 and 300 mM sodium thiocyanate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.260 |
| 6AXG Structure of RasGRP4 in complex with HRas 提交 2017-09-06 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1–166（166 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG3350 and 300 mM sodium thiocyanate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.260 |
| 6AXG Structure of RasGRP4 in complex with HRas 提交 2017-09-06 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
1–166（166 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG3350 and 300 mM sodium thiocyanate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.260 |
| 6AXG Structure of RasGRP4 in complex with HRas 提交 2017-09-06 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
1–166（166 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG3350 and 300 mM sodium thiocyanate
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.260 |
| 6BVI Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2017-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EC4 6-chloro-N-{1-[(5-chloro-1H-indol-3-yl)methyl]piperidin-4-yl}-L-tryptophanamide × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4；292 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.169 |
| 6BVJ Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2017-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EAS 5-chloro-N-{1-[(5-chloro-1H-indol-3-yl)methyl]piperidin-4-yl}-L-tryptophanamide × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4；292 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.168 |
| 6BVK Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2017-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EAV N-{1-[(5-chloro-1H-indol-3-yl)methyl]piperidin-4-yl}-6-methyl-L-tryptophanamide × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.179 |
| 6BVL Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2017-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EBY N-{1-[(5-chloro-1H-indol-3-yl)methyl]piperidin-4-yl}-5-methyl-L-tryptophanamide × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.171 |
| 6BVM Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2017-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EBV (2S)-2-amino-1-[(3aR,6aS)-5-[(5-chloro-1H-indol-3-yl)methyl]hexahydropyrrolo[3,4-c]pyrrol-2(1H)-yl]-3-(1H-indol-3-yl)propan-1-one × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.178 |
| 6CUO Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-03-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FMT FORMIC ACID × 6 FFS N~2~-(3-chlorophenyl)-N~4~-[(furan-2-yl)methyl]quinazoline-2,4-diamine × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.178 |
| 6CUP Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-03-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FFV N~2~-(3-chloro-4-fluorophenyl)-N~4~-[(1R)-1-cyclopropylethyl]quinazoline-2,4-diamine × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.174 |
| 6CUR Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-03-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FFY N~2~-(3-chloro-4-fluorophenyl)-N~4~-[(1R)-1-cyclopropylethyl]-8-(1,2,3,6-tetrahydropyridin-4-yl)quinazoline-2,4-diamine × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.176 |
| 6D55 Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FWA 6-chloro-2-(2,6-diazaspiro[3.3]heptan-2-yl)-1-[(4-fluoro-3,5-dimethylphenyl)methyl]-4-(4-methylpiperazin-1-yl)-1H-benzimidazole × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.178 |
| 6D56 Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FVM 6-chloro-2-(2,6-diazaspiro[3.3]heptan-2-yl)-4-(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-1-[(4-fluoro-3,5-dimethylphenyl)methyl]-1H-benzimidazole × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.171 |
| 6D59 Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FVJ 6-chloro-4-(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-1-[(4-fluoro-3,5-dimethylphenyl)methyl]-2-(piperazin-1-yl)-1H-benzimidazole × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 1；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.173 |
| 6D5E Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 4 FVG 1-[(2S)-1-{6-chloro-1-[(4-fluoro-3,5-dimethylphenyl)methyl]-2-(piperazin-1-yl)-1H-benzimidazol-4-yl}pyrrolidin-2-yl]methanamine × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.174 |
| 6D5G Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FMT FORMIC ACID × 6 CL CHLORIDE ION × 3 FVD 6-chloro-1-[(4-fluoro-3,5-dimethylphenyl)methyl]-2-(piperazin-1-yl)-4-(1,2,3,6-tetrahydropyridin-4-yl)-1H-benzimidazole × 1 GOL GLYCEROL × 3 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.172 |
| 6D5H Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 FV7 6-chloro-4-(2-chlorophenyl)-1-[(4-fluoro-3,5-dimethylphenyl)methyl]-2-(piperazin-1-yl)-1H-benzimidazole × 1 FMT FORMIC ACID × 5 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.189 |
| 6D5J Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FV4 6-chloro-1-[(4-fluoro-3,5-dimethylphenyl)methyl]-2-(piperazin-1-yl)-1H-benzimidazole × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.175 |
| 6D5L Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FMT FORMIC ACID × 6 FW7 6-chloro-1-[(3-chloro-4-fluorophenyl)methyl]-2-(piperazin-1-yl)-1H-benzimidazole × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.175 |
| 6D5M Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
链 R
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 FW4 1-[(3-chloro-4-fluorophenyl)methyl]-5,6-dimethyl-2-(piperazin-1-yl)-1H-benzimidazole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.194 |
| 6D5V Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
链 R
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 FVY 1-[(3-chloro-4-fluorophenyl)methyl]-5,6-dimethyl-1H-benzimidazol-2-amine × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.186 |
| 6D5W Ras:SOS:Ras in complex with a small molecule activator 提交 2018-04-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
1–166（166 aa）
链 R
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 FVV 10-[(4-fluorophenyl)methyl]-2,3,4,10-tetrahydropyrimido[1,2-a]benzimidazole × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.228 |
| 6DZH HRAS G13D bound to GDP (H13GDP) 提交 2018-07-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
突变：G13D | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；5.9% stabilization buffer (20 mM HEPES, 50 mM NaCl, 20 mM MgCl2, pH 7.5)
188.2 mM Calcium Acetate
18.8% PEG 3350
Crystals were grown in 2uL by 2uL drops of mother liquor to protein (7.7mg/mL)
Cryoprotectant for crystal diffraction: 70% mother liquor and 30% glycerol
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.218 |
| 6DZH HRAS G13D bound to GDP (H13GDP) 提交 2018-07-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
突变：G13D | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；5.9% stabilization buffer (20 mM HEPES, 50 mM NaCl, 20 mM MgCl2, pH 7.5)
188.2 mM Calcium Acetate
18.8% PEG 3350
Crystals were grown in 2uL by 2uL drops of mother liquor to protein (7.7mg/mL)
Cryoprotectant for crystal diffraction: 70% mother liquor and 30% glycerol
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.218 |
| 6DZH HRAS G13D bound to GDP (H13GDP) 提交 2018-07-04 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
突变：G13D | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；5.9% stabilization buffer (20 mM HEPES, 50 mM NaCl, 20 mM MgCl2, pH 7.5)
188.2 mM Calcium Acetate
18.8% PEG 3350
Crystals were grown in 2uL by 2uL drops of mother liquor to protein (7.7mg/mL)
Cryoprotectant for crystal diffraction: 70% mother liquor and 30% glycerol
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.218 |
| 6E6C HRAS G13D bound to GppNHp (H13GNP) 提交 2018-07-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；128 mM Calcium acetate, 20.8% PEG 3350, 20% stabilization buffer (20 mM HEPES, 50 mM NaCl, 20 mM MgCl2, at pH 7.5), Crystals were grown in 2uL by 2 uL drops of mother liquor to protein (22 mg/mL), Cryoprotectant: 70% glycerol and 30% mother liquor
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.230 |
| 6E6P HRAS G13D bound to GppNHp (Ha,b,c13GNP) 提交 2018-07-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
突变：G13D | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；152 mM Calcium Acetate, 22.8% PEG 3350, 9.5% stabilization buffer (20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl, 20 mM MgCl2), Crystals were grown in 2uL by 2 uL drops of mother liquor to protein (22 mg/mL), Cryoprotectant: 70% glycerol and 30% mother liquor
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.237 |
| 6E6P HRAS G13D bound to GppNHp (Ha,b,c13GNP) 提交 2018-07-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
突变：G13D | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；152 mM Calcium Acetate, 22.8% PEG 3350, 9.5% stabilization buffer (20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl, 20 mM MgCl2), Crystals were grown in 2uL by 2 uL drops of mother liquor to protein (22 mg/mL), Cryoprotectant: 70% glycerol and 30% mother liquor
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.237 |
| 6E6P HRAS G13D bound to GppNHp (Ha,b,c13GNP) 提交 2018-07-25 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
片段：residues 1-166
|
突变：G13D | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；152 mM Calcium Acetate, 22.8% PEG 3350, 9.5% stabilization buffer (20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl, 20 mM MgCl2), Crystals were grown in 2uL by 2 uL drops of mother liquor to protein (22 mg/mL), Cryoprotectant: 70% glycerol and 30% mother liquor
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.237 |
| 6MQT HRAS G12S in complex with GDP 提交 2018-10-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.195 |
| 6MQT HRAS G12S in complex with GDP 提交 2018-10-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.195 |
| 6MQT HRAS G12S in complex with GDP 提交 2018-10-10 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.195 |
| 6MQT HRAS G12S in complex with GDP 提交 2018-10-10 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.195 |
| 6MQT HRAS G12S in complex with GDP 提交 2018-10-10 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.195 |
| 6MQT HRAS G12S in complex with GDP 提交 2018-10-10 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.195 |
| 6MQT HRAS G12S in complex with GDP 提交 2018-10-10 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.195 |
| 6MQT HRAS G12S in complex with GDP 提交 2018-10-10 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.2 M Sodium acetate trihydrate, 0.1 M TRIS hydrochloride pH 8.5, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.195 |
| 6NTC Crystal Structure of G12V HRas-GppNHp bound in complex with the engineered RBD variant 1 of CRAF Kinase protein 提交 2019-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：G12V | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；30% PEG4000, 200mM NH4SO4, 100mM Na CaCo pH 6.5
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.278 |
| 6NTD Crystal Structure of G12V HRas-GppNHp bound in complex with the engineered RBD variant 12 of CRAF Kinase protein 提交 2019-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：G12V | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293.15 K；30% PEG4000, 200mM NH4SO4, 100mM Na Citrate
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.287 |
| 6Q21 MOLECULAR SWITCH FOR SIGNAL TRANSDUCTION: STRUCTURAL DIFFERENCES BETWEEN ACTIVE AND INACTIVE FORMS OF PROTOONCOGENIC RAS PROTEINS 提交 1992-07-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–171（171 aa）
链 B
1–171（171 aa）
链 C
1–171（171 aa）
链 D
1–171（171 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.95 Å |
| 6V94 Expanding the Chemical Landscape of SOS1 Activators Using Fragment Based Methods 提交 2019-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 QTV 1-[(4-fluorophenyl)methyl]-2-methyl-4-nitro-1H-imidazole × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.172 |
| 6V9F Expanding the Chemical Landscape of SOS1 Activators Using Fragment Based Methods 提交 2019-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FMT FORMIC ACID × 6 QTS 1-[(4-chlorophenyl)methyl]-1H-benzimidazol-2-amine × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.171 |
| 6V9J Expanding the Chemical Landscape of SOS1 Activators Using Fragment Based Methods 提交 2019-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 QTM 3-(2-aminoethyl)-4-(3-chloro-4-fluorophenoxy)benzene-1-sulfonamide × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.166 |
| 6V9L Expanding the Chemical Landscape of SOS1 Activators Using Fragment Based Methods 提交 2019-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 QTJ 4-(3-chloro-4-fluorophenoxy)benzene-1-sulfonamide × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.175 |
| 6V9M Expanding the Chemical Landscape of SOS1 Activators Using Fragment Based Methods 提交 2019-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 QTG 4-fluoro-2-methyl-N-propylbenzene-1-sulfonamide × 1 FMT FORMIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.180 |
| 6V9N Expanding the Chemical Landscape of SOS1 Activators Using Fragment Based Methods 提交 2019-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FMT FORMIC ACID × 6 QTD 4-phenoxybenzene-1-sulfonamide × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.177 |
| 6V9O Expanding the Chemical Landscape of SOS1 Activators Using Fragment Based Methods 提交 2019-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
链 C
1–166（166 aa）
|
突变：Y64A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 QTA 3-(phenylsulfonyl)benzene-1-sulfonamide × 2 FMT FORMIC ACID × 7 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate, 2.0 M sodium formate, pH 4.0
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.169 |
| 6ZJ0 CRYSTAL STRUCTURE OF HRAS-G12D IN COMPLEX WITH GCP AND COMPOUND 18 提交 2020-06-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 EZZ (3~{S})-3-[2-[(dimethylamino)methyl]-1~{H}-indol-3-yl]-5-oxidanyl-2,3-dihydroisoindol-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；278 K；30% PEG400, 200mM MgCl2, 100mM TRIS PH=8,5
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.228 |
| 6ZL3 CRYSTAL STRUCTURE OF HRAS IN COMPLEX WITH COMPOUND 18 and GDP 提交 2020-06-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 EZZ (3~{S})-3-[2-[(dimethylamino)methyl]-1~{H}-indol-3-yl]-5-oxidanyl-2,3-dihydroisoindol-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；278 K；160mM Calcium acetate
20% Glycerol
14.4% PEG8000
80mM Sodium cacodylate
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.223 |
| 721P THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF H-RAS P21 MUTANTS: MOLECULAR BASIS FOR THEIR INABILITY TO FUNCTION AS SIGNAL SWITCH MOLECULES 提交 1991-06-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：Q61L | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 7DPH H-Ras Q61H in complex with GppNHp (state 1) after structural transition by humidity control 提交 2020-12-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：Q61H | MG MAGNESIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 3 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；PEG400, SODIUM ACETATE, CALCIUM ACETATE
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.202 |
| 7DPJ H-Ras Q61L in complex with GppNHp (state 1) after structural transition by humidity control 提交 2020-12-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：Q61L | MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG400, SODIUM ACETATE, CALCIUM
ACETATE
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.221 |
| 7JHP Crystal structure of HRas in complex with the Ras-binding and cysteine-rich domains of CRaf-kinase 提交 2020-07-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：UNP residues 1-166
|
突变：R97C | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 17% w/v PEG10000
|
分辨率 2.77 Å R-free 0.264 |
| 7JIF HRAS A59T GppNHp 提交 2020-07-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：A59T | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；Starting concentration of HRAS A59T GppNHp was 12.1mg/mL in buffer containing 20mM HEPES, 50mM NaCl, 20mM MgCl2 and 1mM DTT at pH 7.5.
Used a 24-well plate sealed with Vaseline and total well volumes of 0.402mL. Hanging drops were 0.002mL mother liquor to 0.002mL protein. Mother liquor contained 2.6mM NaCl, 1mM MgCl2, 15.7mM HEPES (pH7.5), 2.5mM DTT, 37.3mM Ca(OAc)2, and 20.5% PEG 3350
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.250 |
| 7JIG HRAS A59T GppNHp crystal 2 提交 2020-07-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：A59T | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；Starting concentration of HRAS A59T GppNHp was 12.1mg/mL in buffer containing 20mM HEPES, 50mM NaCl, 20mM MgCl2 and 1mM DTT at pH 7.5.
Used a 24-well plate sealed with Vaseline and total well volumes of 0.402mL. Hanging drops were 0.001mL mother liquor to 0.001mL protein. Mother liquor contained 3.4mM NaCl, 1mM MgCl2, 15.7mM HEPES (pH7.5), 2.5mM DTT, 10mM Mg(OAc)2, and 44.8% PEG 400.
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.264 |
| 7JIH HRAS A59E GppNHp 提交 2020-07-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：A59E | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；Starting concentration of HRAS A59T GppNHp was 18.1mg/mL in buffer containing 20mM HEPES, 50mM NaCl, 20mM MgCl2 and 1mM DTT at pH 7.5.
Used a 24-well plate sealed with Vaseline and total well volumes of 0.402mL. Hanging drops were 0.001mL mother liquor to 0.001mL protein. Mother liquor contained 2.6mM NaCl, 1mM MgCl2, 15.7mM HEPES (pH7.5), 2.5mM DTT, 9.95mM Ca(OAc)2, and 19.9% PEG 3350.
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.254 |
| 7JIH HRAS A59E GppNHp 提交 2020-07-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
突变：A59E | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；Starting concentration of HRAS A59T GppNHp was 18.1mg/mL in buffer containing 20mM HEPES, 50mM NaCl, 20mM MgCl2 and 1mM DTT at pH 7.5.
Used a 24-well plate sealed with Vaseline and total well volumes of 0.402mL. Hanging drops were 0.001mL mother liquor to 0.001mL protein. Mother liquor contained 2.6mM NaCl, 1mM MgCl2, 15.7mM HEPES (pH7.5), 2.5mM DTT, 9.95mM Ca(OAc)2, and 19.9% PEG 3350.
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.254 |
| 7JII HRAS A59E GDP 提交 2020-07-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：A59E | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；Starting concentration of HRAS A59T GppNHp was 15.2mg/mL in buffer containing 20mM HEPES, 50mM NaCl, 20mM MgCl2 and 1mM DTT at pH 7.5.
Used a 24-well plate sealed with Vaseline and total well volumes of 0.402mL. Hanging drops were 0.001mL mother liquor to 0.001mL protein. Mother liquor contained 2.6mM NaCl, 1mM MgCl2, 15.7mM HEPES (pH7.5), 2.5mM DTT, 43.5mM Ca(OAc)2, and 20.5% PEG 3350.
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.203 |
| 7JII HRAS A59E GDP 提交 2020-07-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
突变：A59E | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；Starting concentration of HRAS A59T GppNHp was 15.2mg/mL in buffer containing 20mM HEPES, 50mM NaCl, 20mM MgCl2 and 1mM DTT at pH 7.5.
Used a 24-well plate sealed with Vaseline and total well volumes of 0.402mL. Hanging drops were 0.001mL mother liquor to 0.001mL protein. Mother liquor contained 2.6mM NaCl, 1mM MgCl2, 15.7mM HEPES (pH7.5), 2.5mM DTT, 43.5mM Ca(OAc)2, and 20.5% PEG 3350.
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.203 |
| 7L0F Monobody 12VC3 Bound to HRAS(WT) 提交 2020-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.225 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.191 |
| 7L0F Monobody 12VC3 Bound to HRAS(WT) 提交 2020-12-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.225 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.191 |
| 7L0F Monobody 12VC3 Bound to HRAS(WT) 提交 2020-12-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.225 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.191 |
| 7L0F Monobody 12VC3 Bound to HRAS(WT) 提交 2020-12-11 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.225 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.191 |
| 7L0G Monobody 12VC1 Bound to HRAS(G12C) 提交 2020-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：G12C | GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.225 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.229 |
| 7L0G Monobody 12VC1 Bound to HRAS(G12C) 提交 2020-12-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
突变：G12C | GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.225 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.229 |
| 7L0G Monobody 12VC1 Bound to HRAS(G12C) 提交 2020-12-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–166（166 aa）
|
突变：G12C | GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.225 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.229 |
| 7L0G Monobody 12VC1 Bound to HRAS(G12C) 提交 2020-12-11 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
1–166（166 aa）
|
突变：G12C | GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.225 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate, 15% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.229 |
| 7OG9 GTPase HRAS under ambient pressure 提交 2021-05-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；298 K；40 mM Tris HCL, 10 mM MgCl2, 2 mM DTE, 26-30 % PEG-400
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.217 |
| 7OGA GTPase HRAS under 200 MPa pressure 提交 2021-05-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；298 K；40 mM Tris HCL, 10 mM MgCl2, 2 mM DTE, 26-30 % PEG-400
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.235 |
| 7OGB GTPase HRAS under 500 MPa pressure 提交 2021-05-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；298 K；40 mM Tris HCL, 10 mM MgCl2, 2 mM DTE, 26-30 % PEG-400
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.236 |
| 7OGC GTPase HRAS under 650 MPa pressure 提交 2021-05-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；298 K；40 mM Tris HCL, 10 mM MgCl2, 2 mM DTE, 26-30 % PEG-400
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.221 |
| 7OGD GTPase HRAS mutant D33K under ambient pressure 提交 2021-05-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
|
突变：D33K | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；298 K；40 mM Tris HCL, 10 mM MgCl2, 2 mM DTE, 26-30 % PEG-400
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.250 |
| 7OGE GTPase HRAS mutant D33K under 200 MPa pressure 提交 2021-05-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
|
突变：D33K | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；298 K；40 mM Tris HCL, 10 mM MgCl2, 2 mM DTE, 26-30 % PEG-400
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.263 |
| 7OGF GTPase HRAS mutant D33K under 900 MPa pressure 提交 2021-05-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
|
突变：D33K | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；298 K；40 mM Tris HCL, 10 mM MgCl2, 2 mM DTE, 26-30 % PEG-400
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.333 |
| 7TAM HRas G12V in complex with GDP 提交 2021-12-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：G12V | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295.15 K；29% PEG 3350, 0.2 M calcium chloride, 0.1 M TRIS hydrochloride
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.201 |
| 7VV8 Crystal Structure of HRasQ61L(GMPPNP-bound) in complex with the Ras-binding domain(RBD) of SIN1 提交 2021-11-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG20000, 0.1M Sodim citrate. pH 5.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.199 |
| 7VV9 Crystal Structure of HRas(GMPPNP-bound) in complex with the Ras-binding domain(RBD) of SIN1 提交 2021-11-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–170（170 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；278 K；PEG 20000, Sodium citrate
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.200 |
| 7VVG Crystal Structure of HRasG12V(GMPPNP-bound) in complex with the Ras-binding domain(RBD) of SIN1 提交 2021-11-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；278 K；PEG2000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.202 |
| 821P THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES AND PROPERTIES OF A TRANSFORMING AND A NONTRANSFORMING GLYCINE-12 MUTANT OF P21H-RAS 提交 1993-03-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：G12P | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.50 Å |
| 8BE6 Crystal structure of SOS1-HRas-peptidomimetic2 提交 2022-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；sodium formate 3 M, Tris 100mM pH 8.0
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.273 |
| 8BE7 Crystal structure of SOS1-HRas-peptidomimetic3 提交 2022-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；sodium formate 3 M, Tris 100mM pH 8.0
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.267 |
| 8BE8 Crystal structure of SOS1-HRas-peptidomimetic4 提交 2022-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；sodium formate 3 M, Tris 100mM pH 8.0
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.237 |
| 8BE9 Crystal structure of SOS1-HRas-peptidomimetic5 提交 2022-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 3 FMT FORMIC ACID × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；sodium formate 3 M, Tris 100mM pH 8.0
|
分辨率 2.51 Å R-free 0.229 |
| 8BEA Crystal structure of SOS1-HRas-peptidomimetic10 提交 2022-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；sodium formate 3 M, Tris 100mM pH 8.0
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.233 |
| 8BOS Transition state analogue complex of small G protein and its GAP effector 提交 2022-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MGF TRIFLUOROMAGNESATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GAI GUANIDINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；precipitant: HEPES-Na 100 mM pH = 8.0, PEG3350 22% (w/v), (NH4)2SO4 20 mM, Gd-HCl 100 mM, NaF 20 mM
protein buffer: HRas 0.400 mM, RasGAP 0.400 mM, HEPES-Na 20 mM, NaF 20 mM
drop size: 5 uL, protein:precipitant ratio: 1:1.2
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.280 |
| 8BWG HRas (1-166) Y64 phosphorylation 提交 2022-12-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 R
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Using a commercial crystal screen (HAMPTON RESEARCH, HR2-130) yielded a hit for monophosphorylated HRas under sitting drop conditions (drop size 600 nL) with a 1:1 ratio of protein solution (phospho-HRas 0.4 mM, RasGAP 0.4 mM, Na-HEPES 20 mM pH = 8.0, MgCl2 5 mM, NaF 20 mM) and precipitant (Na-citrate 100 mM pH = 5.6, Li2SO4 1.0 M, CaCl2 200 mM). After three rounds of microseeding well-formed single crystals were obtained using 2.0 uL sitting drops and a 1:1 ratio of protein buffer (HRas 400 uM, RasGAP 400 uM, MgCl2 5 mM, Na-HEPES 20 mM pH = 8.0, NaF 20 mM) and precipitant (Na-Citrate 100 mM pH = 5.6, Li2SO4 800 mM, CaCl2 200 mM). These were harvested using cryoprotectant (80% precipitant, 20% glycerol (v/v)) and sent for data collection.
|
分辨率 1.32 Å R-free 0.174 |
| 8CNJ HRas(1-166) in complex with GDP and BeF3- 提交 2023-02-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
链 B
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；BeF3- GSA complexes were obtained under vapour diffusion sitting drop conditions. Protein buffer (HRas pY64 or HRas 0.4 mM, Na-HEPES 20 mM pH = 8.0, MgCl2 5 mM, NaF 20 mM) were mixed with precipitant in a 1:1 ratio with a total drop size of 600 nL. The precipitant solution consited of: (30 % (v/v) MPD, 100 mM imidazole, pH = 7.0). Protein crystals were soaked in their respective precipitant solutions containing 50 mM BeCl2 and subsequently flash-frozen using 20% glycerol as cryoprotectant.
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.179 |
| 8CNN BeF3 Phospho-HRas GSA complex 提交 2023-02-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 ACT ACETATE ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Protein buffer (phospho-HRas pY64 0.4 mM, RasGAP 0.4 mM, Na-HEPES 20 mM pH = 8.0, MgCl2 5 mM, NaF 20 mM) was mixed with precipitant in a 1:1 ratio with a total drop size of 600 nL. The precipitant solution consits of: 100 mM NaOAc, pH = 4.5, 200 mM Li2SO4, 50% PEG400 (v/v). Protein crystals were soaked in precipitant solutions containing 50-100 mM BeCl2 and subsequently flash-frozen using 20% glycerol as cryoprotectant.
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.188 |
| 8ELK HRAS R97F Crystal Form 1 提交 2022-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
|
突变：R97F | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；PEG 3350,
Calcium Acetate,
Magnesium Chloride,
Sodium Chloride,
HEPES
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.195 |
| 8ELR HRAS R97F Crystal Form 2 提交 2022-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
|
突变：R97F | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；Calcium Acetate
PEG3350,
Magnesium Chloride,
HEPES,
Sodium Chloride,
DTT
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.244 |
| 8ELS HRAS R97A Crystal Form 1 R-state 提交 2022-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
|
突变：R97A | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；PEG 3350,
Calcium Acetate,
HEPES,
Calcium Chloride,
Magnesium Chloride
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.211 |
| 8ELT HRAS R97G Crystal Form 2 提交 2022-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
|
突变：R97G | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；PEG 3350,
Calcium Acetate,
Magnesium Chloride,
Sodium Chloride,
DTT
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.239 |
| 8ELU HRAS R97G Crystal form 1 提交 2022-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
|
突变：R97G | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；PEG 3350,
Calcium Acetate,
Magnesium Chloride,
Sodium Chloride,
DTT
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.209 |
| 8ELV HRAS R97I Crystal Form 2 提交 2022-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
|
突变：R97I | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；PEG 3350,
Calcium Acetate,
Magnesium Chloride,
Sodium Chloride,
DTT
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.270 |
| 8ELW HRAS R97A Crystal Form 1 T-State 提交 2022-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
|
突变：R97A | CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；PEG 3350,
Calcium Acetate,
Sodium Chloride,
Magnesium Chloride,
HEPES
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.186 |
| 8ELX HRAS R97I Crystal Form 1 提交 2022-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
|
突变：R97I | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；PEG 3350,
Calcium Acetate,
Magnesium Chloride,
Sodium Chloride,
DTT
|
分辨率 1.98 Å R-free 0.286 |
| 8ELY HRAS R97M Crystal Form 2 提交 2022-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
|
突变：R97M | MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；PEG 3350,
Calcium Acetate,
Magnesium Chloride,
Sodium Chloride,
DTT
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.227 |
| 8ELZ HRAS R97M Crystal Form 1 提交 2022-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
|
突变：R97M | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；PEG 3350,
Calcium Acetate,
Magnesium Chloride,
Sodium Chloride,
DTT
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.202 |
| 8EM0 HRAS R97V Crystal Form 1 提交 2022-09-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–189（189 aa）
|
突变：R97V | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；PEG 3350,
Calcium Acetate,
Magnesium Chloride,
Sodium Chloride,
DTT
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.201 |
| 8FG3 HRAS R97L Crystal Form 2 提交 2022-12-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：R97L | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；PEG 3350,
Calcium Acetate,
Magnesium Chloride,
Sodium Chloride,
DTT
|
分辨率 1.49 Å R-free 0.247 |
| 8FG4 HRAS R97L Crystal Form 1 提交 2022-12-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：R97L | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 CA CALCIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；PEG 3350,
Calcium Acetate,
Magnesium Chloride,
Sodium Chloride,
DTT
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.227 |
| 8OSM GTPASE HRAS IN COMPLEX WITH ZN-CYCLEN AT 200 MPA PRESSURE 提交 2023-04-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；293 K；40 MM TRIS HCL, 10 MM MGCL2, 2 MM DTE,
26-30 % PEG-400
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.224 |
| 8OSN GTPASE HRAS IN COMPLEX WITH ZN-CYCLEN AT AMBIENT PRESSURE 提交 2023-04-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；293 K；40 MM TRIS HCL, 10 MM MGCL2, 2 MM DTE, 26-30 % PEG-400
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.215 |
| 8OSO GTPase HRAS in complex with Zn-cyclen under 500 MPa pressure 提交 2023-04-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
片段：GTPase HRAS N-terminally processed
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 YCN 1,4,7,10-tetraazacyclododecane × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 7.5；293 K；40 MM TRIS HCL, 10 MM MGCL2, 2 MM DTE,
26-30 % PEG-400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.280 |
| 8TBG Tricomplex of RMC-7977, HRAS WT, and CypA 提交 2023-06-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；28% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.192 |
| 8TBG Tricomplex of RMC-7977, HRAS WT, and CypA 提交 2023-06-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；28% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.192 |
| 8TLR Crystal Structure of human HRAS G12C covalently bound to AMG 510 提交 2023-07-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
突变：G12C | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MOV AMG 510 (bound form) × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES
30% PEG 4000
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.210 |
| 8WWC De novo design binder of HRAS -120-4 提交 2023-10-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1M Bis Tris Propane pH7.5 0.2M Sodium nitrate 20% w/v PEG3350 10%v/v Ethylene glycol
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.247 |
| 8WWC De novo design binder of HRAS -120-4 提交 2023-10-25 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1M Bis Tris Propane pH7.5 0.2M Sodium nitrate 20% w/v PEG3350 10%v/v Ethylene glycol
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.247 |
| 9P46 Crystal structure of HRAS-G12D/Q95H (GMPPNP-bound) in complex with BBO-11818 提交 2025-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–169（169 aa）
|
突变：G12D, Q95H, C118S | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1CG4 methyl (3S)-3-{[(7P)-7-(2-amino-3-cyano-7-fluoro-1-benzothiophen-4-yl)-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}-6-(trifluoromethyl)quinazolin-4-yl](ethyl)amino}pyrrolidine-1-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% PEG 3350, 0.2 M MgCl2
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.228 |
| 9P46 Crystal structure of HRAS-G12D/Q95H (GMPPNP-bound) in complex with BBO-11818 提交 2025-06-16 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–169（169 aa）
|
突变：G12D, Q95H, C118S | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1CG4 methyl (3S)-3-{[(7P)-7-(2-amino-3-cyano-7-fluoro-1-benzothiophen-4-yl)-8-fluoro-2-{[(2R,4R,7aS)-2-fluorotetrahydro-1H-pyrrolizin-7a(5H)-yl]methoxy}-6-(trifluoromethyl)quinazolin-4-yl](ethyl)amino}pyrrolidine-1-carboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% PEG 3350, 0.2 M MgCl2
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.228 |
| 9PU1 HRAS complex with UM0140401 compound 提交 2025-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；Tris
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.177 |
| 9PU3 HRAS complex with UM0140692 compound 提交 2025-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Tris
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.217 |
| 9PU8 HRAS complex with UM0140693 compound 提交 2025-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–165（165 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Tris
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.179 |
| 9PUL HRAS complex with UM0143525 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；0.1M Tris, 0.2 M CaCl2, 18 % PEG 4,000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.267 |
| 9PUL HRAS complex with UM0143525 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；0.1M Tris, 0.2 M CaCl2, 18 % PEG 4,000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.267 |
| 9PUL HRAS complex with UM0143525 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；0.1M Tris, 0.2 M CaCl2, 18 % PEG 4,000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.267 |
| 9PUL HRAS complex with UM0143525 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；0.1M Tris, 0.2 M CaCl2, 18 % PEG 4,000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.267 |
| 9PUN HRAS complex with UM0148697 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293.15 K；0.1 M Tris, 0.2 M MgCl2, 26 % PEG 3,350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 9PUN HRAS complex with UM0148697 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293.15 K；0.1 M Tris, 0.2 M MgCl2, 26 % PEG 3,350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 9PUN HRAS complex with UM0148697 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293.15 K；0.1 M Tris, 0.2 M MgCl2, 26 % PEG 3,350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.260 |
| 9PUQ HRAS complex with UM0152248 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, 0.2 M CaCl2, 23 % PEG 4,000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 9PUQ HRAS complex with UM0152248 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, 0.2 M CaCl2, 23 % PEG 4,000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 9PUQ HRAS complex with UM0152248 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, 0.2 M CaCl2, 23 % PEG 4,000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 9PUT HRAS complex with UM0152535 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293.15 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M NaCl2, 21 % PEG 3,350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 9PUT HRAS complex with UM0152535 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；293.15 K；0.1 M Bis-Tris, 0.2 M NaCl2, 21 % PEG 3,350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.233 |
| 9PUZ HRAS complex with UM0153030 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.7；293.15 K；0.1 M Tris, 0.2 M CaCl2, 22 % PEG 4,000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 9PUZ HRAS complex with UM0153030 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.7；293.15 K；0.1 M Tris, 0.2 M CaCl2, 22 % PEG 4,000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 9PUZ HRAS complex with UM0153030 compound 提交 2025-07-31 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.7；293.15 K；0.1 M Tris, 0.2 M CaCl2, 22 % PEG 4,000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 9PVE HRAS complex with UM0152533 compound 提交 2025-08-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；293.15 K；0.1 M Sodium citrate, 16 % PEG 3,350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.242 |
| 9PVE HRAS complex with UM0152533 compound 提交 2025-08-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；293.15 K；0.1 M Sodium citrate, 16 % PEG 3,350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.242 |
| 9PVE HRAS complex with UM0152533 compound 提交 2025-08-01 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；293.15 K；0.1 M Sodium citrate, 16 % PEG 3,350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.242 |
| 9PVE HRAS complex with UM0152533 compound 提交 2025-08-01 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–166（166 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；293.15 K；0.1 M Sodium citrate, 16 % PEG 3,350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.242 |
| 9Z5W Crystal structure of HRAS in complex with N-LHY affibody 提交 2025-11-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–166（166 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å R-free 0.224 |