当前蛋白身份：P04234
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1XIW Crystal structure of human CD3-e/d dimer in complex with a UCHT1 single-chain antibody fragment 提交 2004-09-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
23–100（78 aa）
片段：ectodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；PEG 3350, sodium chloride, HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.241 |
| 1XIW Crystal structure of human CD3-e/d dimer in complex with a UCHT1 single-chain antibody fragment 提交 2004-09-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
23–100（78 aa）
片段：ectodomain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；PEG 3350, sodium chloride, HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 22K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.241 |
| 6JXR Structure of human T cell receptor-CD3 complex 提交 2019-04-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.70 Å |
| 7FJD Cryo-EM structure of a membrane protein(WT) 提交 2021-08-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.20 Å |
| 7FJE Cryo-EM structure of a membrane protein(LL) 提交 2021-08-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.00 Å |
| 7FJF Cryo-EM structure of a membrane protein(CS) 提交 2021-08-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | C3S CHOLEST-5-EN-3-YL HYDROGEN SULFATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.10 Å |
| 7PHR Structure of a fully assembled T-cell receptor engaging a tumor-associated peptide-MHC I 提交 2021-08-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 D
22–132（111 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 8ES7 CryoEM structure of PN45545 TCR-CD3 complex 提交 2022-10-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 D
1–171（171 aa）
|
未记录 | Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 8ES8 CryoEM structure of PN45545 TCR-CD3 in complex with HLA-A2 MAGEA4 (230-239) 提交 2022-10-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 D
1–171（171 aa）
|
未记录 | Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å |
| 8ES9 CryoEM structure of PN45428 TCR-CD3 in complex with HLA-A2 MAGEA4 提交 2022-10-13 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 D
1–171（171 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 8JC0 V gamma9 V delta2 TCR and CD3 complex in LMNG 提交 2023-05-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8JCB Vgamma5 Vdelta1 T cell receptor complex 提交 2023-05-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 D
1–171（171 aa）
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.50 Å |
| 8TW4 TCR in nanodisc ND-I 提交 2023-08-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 D
1–171（171 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8TW6 TCR in nanodisc ND-II 提交 2023-08-20 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 D
1–171（171 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8WXE Vgamma5Vdelta1 EH TCR-CD3 complex 提交 2023-10-28 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8WY0 T cell receptor delta 2 gamma 9 with F283A, F290A, and F291A 提交 2023-10-30 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8WYI T cell receptor delta 2 gamma 9 with TCRD TM domain chimera of TRAC 提交 2023-10-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8YC0 T cell receptor V delta2 V gamma9 in GDN 提交 2024-02-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.12 Å |
| 8ZA6 Cryo-EM structure of the gdTCR-CD3 complex 提交 2024-04-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.43 Å |
| 9BBC TCR GDN detergent micelle 提交 2024-04-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 D
1–171（171 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9C3E TCR - CD3 complex bound to HLA 提交 2024-05-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 D
1–125（125 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9CI8 T cell receptor complex 提交 2024-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 d
22–126（105 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；Hepes buffer saline
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9CIA T cell receptor complex 提交 2024-07-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 d
22–127（106 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；HEPES buffer saline
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 9CQ4 G115 gamma delta TCR/CD3 complex bound by OKT3 Fab 提交 2024-07-19 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 K
1–171（171 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.27 Å |
| 9IRS Cryo-EM structure of the TCR-OKT3 complex 提交 2024-07-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.18 Å |
| 9IRU Cryo-em structure of TCR-4B1 complex 提交 2024-07-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.14 Å |
| 9JXZ V gamma9 V delta2 TCR and CD3 complex 提交 2024-10-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 2 LPE 1-O-OCTADECYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.31 Å |
| 9JY0 Fab-CD3-gamma epsilon-TCR complex 提交 2024-10-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.69 Å |
| 9JY1 delta epsilon/delta epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 D
1–171（171 aa）
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.08 Å |
| 9JY2 Fab-CD3-delta epsilon-TCR complex 提交 2024-10-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 d
22–126（105 aa）
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.24 Å |
| 9JY3 delta epsilon/gamma epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 D
22–126（105 aa）
链 d
22–126（105 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 9JY4 gamma epsilon/gamma epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 D
1–171（171 aa）
链 d
1–171（171 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |