当前蛋白身份:P09693 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1SY6 Crystal Structure of CD3gammaepsilon Heterodimer in Complex with OKT3 Fab Fragment 提交 2004-03-31 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 23–103(81 aa) 片段:CD3 epsilon/gamma ecto domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;294 K;PEG3350, potassium formate, TRIS, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 323K, temperature 294K
分辨率 2.10 Å R-free 0.255
6JXR Structure of human T cell receptor-CD3 complex 提交 2019-04-24 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.70 Å
7FJD Cryo-EM structure of a membrane protein(WT) 提交 2021-08-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.20 Å
7FJE Cryo-EM structure of a membrane protein(LL) 提交 2021-08-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.00 Å
7FJF Cryo-EM structure of a membrane protein(CS) 提交 2021-08-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 C3S CHOLEST-5-EN-3-YL HYDROGEN SULFATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.10 Å
7PHR Structure of a fully assembled T-cell receptor engaging a tumor-associated peptide-MHC I 提交 2021-08-18 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致
链 C 23–144(122 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
7Q5U The tandem SH2 domains of SYK with a bound CD3G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 LLL 157–176(20 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 P4G 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;100 mM MMT buffer, 30% PEG 1000
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7Q5U The tandem SH2 domains of SYK with a bound CD3G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 III 157–176(20 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;100 mM MMT buffer, 30% PEG 1000
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7Q5U The tandem SH2 domains of SYK with a bound CD3G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 JJJ 157–176(20 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;100 mM MMT buffer, 30% PEG 1000
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7Q5U The tandem SH2 domains of SYK with a bound CD3G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 HHH 157–176(20 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;100 mM MMT buffer, 30% PEG 1000
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7Q5U The tandem SH2 domains of SYK with a bound CD3G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 KKK 157–176(20 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 P4G 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;100 mM MMT buffer, 30% PEG 1000
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7Q5U The tandem SH2 domains of SYK with a bound CD3G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 GGG 157–176(20 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;293 K;100 mM MMT buffer, 30% PEG 1000
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
8ES7 CryoEM structure of PN45545 TCR-CD3 complex 提交 2022-10-13 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 1–182(182 aa)
未记录 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8ES8 CryoEM structure of PN45545 TCR-CD3 in complex with HLA-A2 MAGEA4 (230-239) 提交 2022-10-13 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致
链 G 1–182(182 aa)
未记录 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
8ES9 CryoEM structure of PN45428 TCR-CD3 in complex with HLA-A2 MAGEA4 提交 2022-10-13 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致
链 G 1–182(182 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
8JC0 V gamma9 V delta2 TCR and CD3 complex in LMNG 提交 2023-05-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8JCB Vgamma5 Vdelta1 T cell receptor complex 提交 2023-05-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 G 1–182(182 aa)
链 g 1–182(182 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.50 Å
8TW4 TCR in nanodisc ND-I 提交 2023-08-20 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 1–182(182 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CLR CHOLESTEROL × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8TW6 TCR in nanodisc ND-II 提交 2023-08-20 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 1–182(182 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8WXE Vgamma5Vdelta1 EH TCR-CD3 complex 提交 2023-10-28 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8WY0 T cell receptor delta 2 gamma 9 with F283A, F290A, and F291A 提交 2023-10-30 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8WYI T cell receptor delta 2 gamma 9 with TCRD TM domain chimera of TRAC 提交 2023-10-31 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8YC0 T cell receptor V delta2 V gamma9 in GDN 提交 2024-02-17 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.12 Å
8ZA6 Cryo-EM structure of the gdTCR-CD3 complex 提交 2024-04-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.43 Å
9BBC TCR GDN detergent micelle 提交 2024-04-05 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 G 1–137(137 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CLR CHOLESTEROL × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9C3E TCR - CD3 complex bound to HLA 提交 2024-05-31 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 G 1–182(182 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CLR CHOLESTEROL × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9CI8 T cell receptor complex 提交 2024-07-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 g 24–138(115 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;Hepes buffer saline
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
9CIA T cell receptor complex 提交 2024-07-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 g 25–138(114 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;HEPES buffer saline
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9CQ4 G115 gamma delta TCR/CD3 complex bound by OKT3 Fab 提交 2024-07-19 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 G 1–182(182 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
9IP8 Poly-alanine model for HL-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (closed conformation) 提交 2024-07-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 23–103(81 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
9IP9 Poly-alanine model for HL-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (middle conformation) 提交 2024-07-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 23–103(81 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.64 Å
9IPA Poly-alanine model for HL-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (open conformation) 提交 2024-07-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 23–103(81 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
9IPC Poly-alanine model for LH-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (closed conformation) 提交 2024-07-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 23–103(81 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9IPD Poly-alanine model for LH-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (middle conformation) 提交 2024-07-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 23–103(81 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9IPE Poly-alanine model for LH-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (open conformation) 提交 2024-07-10 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 23–103(81 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9IRS Cryo-EM structure of the TCR-OKT3 complex 提交 2024-07-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.18 Å
9IRU Cryo-em structure of TCR-4B1 complex 提交 2024-07-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.14 Å
9JXZ V gamma9 V delta2 TCR and CD3 complex 提交 2024-10-12 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 2 LPE 1-O-OCTADECYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9JY0 Fab-CD3-gamma epsilon-TCR complex 提交 2024-10-12 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 g 1–182(182 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
9JY1 delta epsilon/delta epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 G 1–182(182 aa)
链 g 1–182(182 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
9JY2 Fab-CD3-delta epsilon-TCR complex 提交 2024-10-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 g 26–140(115 aa)
未记录 CLR CHOLESTEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
9JY3 delta epsilon/gamma epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 G 26–140(115 aa)
链 g 26–140(115 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
9JY4 gamma epsilon/gamma epsilon Fab-TCR tetramer 提交 2024-10-12 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白数一致
链 G 1–182(182 aa)
链 g 1–182(182 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å