当前蛋白身份：P11716
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2BCX Crystal structure of calmodulin in complex with a ryanodine receptor peptide 提交 2005-10-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
3614–3643（30 aa）
片段：residues 3614-3643
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.7；293 K；23% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate, 5 mM DTT, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.249 |
| 2XOA Crystal Structure of the N-terminal three domains of the skeletal muscle Ryanodine Receptor (RyR1) 提交 2010-08-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–559（559 aa）
片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-559
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.234 |
| 3HSM Crystal structure of distal N-terminal beta-trefoil domain of Ryanodine Receptor type 1 提交 2009-06-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–210（210 aa）
片段：sequence database residues 1-210
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1M MES, 0.1M MgCl2, 24% PEG 3350, 5mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.276 |
| 3HSM Crystal structure of distal N-terminal beta-trefoil domain of Ryanodine Receptor type 1 提交 2009-06-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–210（210 aa）
片段：sequence database residues 1-210
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1M MES, 0.1M MgCl2, 24% PEG 3350, 5mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.276 |
| 3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
9–205（197 aa）
片段：N-Terminal Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.320 |
| 3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
9–205（197 aa）
片段：N-Terminal Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.320 |
| 3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
9–205（197 aa）
片段：N-Terminal Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.320 |
| 3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
9–205（197 aa）
片段：N-Terminal Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.320 |
| 3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
9–205（197 aa）
片段：N-Terminal Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.320 |
| 3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
9–205（197 aa）
片段：N-Terminal Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.320 |
| 3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
9–205（197 aa）
片段：N-Terminal Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.320 |
| 3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
9–205（197 aa）
片段：N-Terminal Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.320 |
| 3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 | Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 I
9–205（197 aa）
片段：N-Terminal Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.320 |
| 3J8H Structure of the rabbit ryanodine receptor RyR1 in complex with FKBP12 at 3.8 Angstrom resolution 提交 2014-10-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1491（1491 aa）
链 A
1510–1976（467 aa）
链 A
2057–2460（404 aa）
链 A
2494–2562（69 aa）
链 A
2734–2940（207 aa）
链 A
3645–5037（1393 aa）
链 C
1–1491（1491 aa）
链 C
1510–1976（467 aa）
链 C
2057–2460（404 aa）
链 C
2494–2562（69 aa）
链 C
2734–2940（207 aa）
链 C
3645–5037（1393 aa）
链 E
1–1491（1491 aa）
链 E
1510–1976（467 aa）
链 E
2057–2460（404 aa）
链 E
2494–2562（69 aa）
链 E
2734–2940（207 aa）
链 E
3645–5037（1393 aa）
链 G
1–1491（1491 aa）
链 G
1510–1976（467 aa）
链 G
2057–2460（404 aa）
链 G
2494–2562（69 aa）
链 G
2734–2940（207 aa）
链 G
3645–5037（1393 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20 mM MOPS sodium, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 2 mM EGTA, 0.015% Tween20, protein inhibitors；pH 7.4；20 mM MOPS sodium, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 2 mM EGTA, 0.015% Tween20, protein inhibitors
cryo-EM玻璃化条件
protein solution was applied to glow-discharged carbon coated grid and blotted for 2 seconds before plunging；冷冻剂 NITROGEN；Protein solution was applied to glow-discharged carbon coated grid and blotted for 2 seconds before plunging into liquid nitrogen (FEI VITROBOT MARK III)
|
分辨率 3.80 Å |
| 3RQR Crystal structure of the RYR domain of the rabbit ryanodine receptor 提交 2011-04-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2733–2940（208 aa）
片段：Residues 2733-2940
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；291 K；1.2M Na Citrate, 100mM Tris pH8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.258 |
| 4ERT Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (2734-2940) 提交 2012-04-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2734–2940（207 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；19% PEG3350, 30% Glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.225 |
| 4ESU Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 mutant S2776M 提交 2012-04-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2734–2940（207 aa）
|
突变：S2776M | GOL GLYCEROL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；25% PEG3350, 25% Glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.229 |
| 4ETT Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 mutant E2764K 提交 2012-04-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2734–2940（207 aa）
|
突变：E2764K | GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；25% PEG3350, 25% Glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.287 |
| 4ETU Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 mutant R2939S 提交 2012-04-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2734–2940（207 aa）
|
突变：R2939S | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15% PEG3350, 25% Glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.262 |
| 4I0Y CRYSTAL STRUCTURE OF RABBIT RYANODINE RECEPTOR 1 (RESIDUES 1-536) DISEASE MUTANT C36R 提交 2012-11-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–536（536 aa）
片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变：C36R | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 9.5；pH 9.5, EVAPORATION
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.246 |
| 4I1E Crystal structure of Rabbit Ryanodine Receptor 1 (residues 1-536) disease mutant G249R 提交 2012-11-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–536（536 aa）
片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变：G249R | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；pH 8.0, EVAPORATION
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.258 |
| 4I2S Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant I404M 提交 2012-11-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–536（536 aa）
片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变：I404M | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；pH 8.0, EVAPORATION
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.249 |
| 4I37 Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant R402G 提交 2012-11-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–536（536 aa）
片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变：R402G | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；pH 6.5, EVAPORATION
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.289 |
| 4I3N Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant D61N 提交 2012-11-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–536（536 aa）
片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变：D61N | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 9.5；pH 9.5, EVAPORATION
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.257 |
| 4I6I Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-559) disease mutant R45C 提交 2012-11-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–559（559 aa）
片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-559
|
突变：R45C | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7；pH 7.0, EVAPORATION
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.277 |
| 4I7I Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant L14R 提交 2012-11-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–536（536 aa）
片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变：L14R | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；pH 8.0, EVAPORATION
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.249 |
| 4I8M Crystal structure of rabbit Ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant V219I 提交 2012-12-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–536（536 aa）
片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
|
突变：V219I | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 9；pH 9.0, EVAPORATION
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.253 |
| 4I96 Crystal structure of the N-terminal two domains of the skeletal muscle ryanodine receptor (rabbit RyR1) residues 217-536 提交 2012-12-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
217–536（320 aa）
片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 217-536
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；pH 8.0, EVAPORATION
|
分辨率 2.73 Å R-free 0.241 |
| 4P9J Crystal Structure of rabbit Ryanodine Receptor 1 SPRY2 Domain (1070-1246) 提交 2014-04-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1070–1246（177 aa）
片段：UNP Residues 1070-1246
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298.15 K；sodium citrate
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 4P9J Crystal Structure of rabbit Ryanodine Receptor 1 SPRY2 Domain (1070-1246) 提交 2014-04-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1070–1246（177 aa）
片段：UNP Residues 1070-1246
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298.15 K；sodium citrate
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 4P9J Crystal Structure of rabbit Ryanodine Receptor 1 SPRY2 Domain (1070-1246) 提交 2014-04-04 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1070–1246（177 aa）
片段：UNP Residues 1070-1246
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298.15 K；sodium citrate
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.220 |
| 4UWA Structure of the ryanodine receptor at resolution of 6.1 A in closed state 提交 2014-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–533（533 aa）
链 A
649–1571（923 aa）
链 A
2734–2939（206 aa）
链 B
1–533（533 aa）
链 B
649–1571（923 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 C
1–533（533 aa）
链 C
649–1571（923 aa）
链 C
2734–2939（206 aa）
链 D
1–533（533 aa）
链 D
649–1571（923 aa）
链 D
2734–2939（206 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
10 MM MOPS, 200MM NACL, 2MM DTT, 1MM EGTA；pH 7.4；10 MM MOPS, 200MM NACL, 2MM DTT, 1MM EGTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 6.10 Å |
| 4UWE Structure of the ryanodine receptor at resolution of 8.5 A in partially open state 提交 2014-08-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–533（533 aa）
链 A
649–1571（923 aa）
链 A
2734–2939（206 aa）
链 B
1–533（533 aa）
链 B
649–1571（923 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 C
1–533（533 aa）
链 C
649–1571（923 aa）
链 C
2734–2939（206 aa）
链 D
1–533（533 aa）
链 D
649–1571（923 aa）
链 D
2734–2939（206 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
10 MM MOPS, 200 MM NACL, 2 MM DTT AND 10 MM CACL2, 0.2% FLUORINATED OCTYL- MALTOSIDE；pH 7.4；10 MM MOPS, 200 MM NACL, 2 MM DTT AND 10 MM CACL2, 0.2% FLUORINATED OCTYL- MALTOSIDE
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 8.50 Å |
| 5C30 Crystal Structure of Rabbit Ryanodine Receptor 1 Repeat12 Domain 提交 2015-06-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
857–1054（198 aa）
片段：repeat12 domain (UNP residues 857-1054)
|
突变：C906A, C937A, C1040A | IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.0, 19% w/v PEG20000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.165 |
| 5GKY Structure of RyR1 in a closed state (C1 conformer) 提交 2016-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 E
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM MOPS-Na, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.015% Tween20 (w/v) (Sigma-Aldrich) and protease inhibitor cocktail including 2 mM PMSF, 2.6 ug/ml aprotinin, 1.4 ug/ml pepstatin, and 10 ug/ml leupeptin (Amresco)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 5GKZ Structure of RyR1 in a closed state (C3 conformer) 提交 2016-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 E
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM MOPS-Na, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.015% Tween20 (w/v) (Sigma-Aldrich) and protease inhibitor cocktail including 2 mM PMSF, 2.6 ug/ml aprotinin, 1.4 ug/ml pepstatin, and 10 ug/ml leupeptin (Amresco)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 5GL0 Structure of RyR1 in a closed state (C4 conformer) 提交 2016-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 E
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM MOPS-Na, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.015% Tween20 (w/v) (Sigma-Aldrich) and protease inhibitor cocktail including 2 mM PMSF, 2.6 ug/ml aprotinin, 1.4 ug/ml pepstatin, and 10 ug/ml leupeptin (Amresco)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 5GL1 Structure of RyR1 in an open state 提交 2016-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 E
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM MOPS-Na, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.5% CHAPS (w/v) (Sigma-Aldrich) and protease inhibitor cocktail including 2 mM PMSF, 2.6 ug/ml aprotinin, 1.4 ug/ml pepstatin, and 10 ug/ml leupeptin (Amresco),50 uM CaCl2 and 10 uM PCB95
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.70 Å |
| 5J8V Structure of rabbit ryanodine receptor RyR1 open state activated by calcium ion 提交 2016-04-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；1:1000 diluted protease inhibitor cocktail was also added in buffer
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2s before plunging.
|
分辨率 4.90 Å |
| 5T15 Structural basis for gating and activation of RyR1 (30 uM Ca2+ dataset, all particles) 提交 2016-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–5037（1399 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–5037（1399 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–5037（1399 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–5037（1399 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 3.60 Å |
| 5T9M Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 1) 提交 2016-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–5037（1399 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–5037（1399 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–5037（1399 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–5037（1399 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.00 Å |
| 5T9N Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 2) 提交 2016-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–5037（1399 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–5037（1399 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–5037（1399 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–5037（1399 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 3.80 Å |
| 5T9R Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 3) 提交 2016-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–5037（1399 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–5037（1399 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–5037（1399 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–5037（1399 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 5.80 Å |
| 5T9S Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 4) 提交 2016-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–5037（1399 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–5037（1399 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–5037（1399 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–5037（1399 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.20 Å |
| 5T9V Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 1) 提交 2016-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4540–5037（498 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4540–5037（498 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4540–5037（498 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4540–5037（498 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å |
| 5TA3 Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 2) 提交 2016-09-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å |
| 5TAL Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 1&2) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.30 Å |
| 5TAM Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 4) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.30 Å |
| 5TAN Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 3) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.30 Å |
| 5TAP Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, all particles) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å |
| 5TAQ Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 3&4) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.10 Å |
| 5TAS Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 1) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 6.20 Å |
| 5TAT Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 2) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.80 Å |
| 5TAU Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 3) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 6.20 Å |
| 5TAV Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 4) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.80 Å |
| 5TAW Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, all particles) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å |
| 5TAX Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 1) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 6.60 Å |
| 5TAY Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 2) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.60 Å |
| 5TAZ Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 3) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.30 Å |
| 5TB0 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, all particles) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.40 Å |
| 5TB1 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 1) 提交 2016-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.60 Å |
| 5TB2 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 2) 提交 2016-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.60 Å |
| 5TB3 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 3) 提交 2016-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.70 Å |
| 5TB4 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 4) 提交 2016-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
12–1275（1264 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–4253（615 aa）
链 B
4541–5037（497 aa）
链 E
12–1275（1264 aa）
链 E
1573–2479（907 aa）
链 E
2734–2939（206 aa）
链 E
3639–4253（615 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
12–1275（1264 aa）
链 G
1573–2479（907 aa）
链 G
2734–2939（206 aa）
链 G
3639–4253（615 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 I
12–1275（1264 aa）
链 I
1573–2479（907 aa）
链 I
2734–2939（206 aa）
链 I
3639–4253（615 aa）
链 I
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
|
分辨率 4.50 Å |
| 6FG3 Structure of Ryanodine receptor 1 in nanodiscs in the presence of calcium, ATP and ryanodine 提交 2018-01-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1275（1275 aa）
链 A
1573–2479（907 aa）
链 A
2734–2939（206 aa）
链 A
3639–5037（1399 aa）
链 B
1–1275（1275 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–5037（1399 aa）
链 C
1–1275（1275 aa）
链 C
1573–2479（907 aa）
链 C
2734–2939（206 aa）
链 C
3639–5037（1399 aa）
链 D
1–1275（1275 aa）
链 D
1573–2479（907 aa）
链 D
2734–2939（206 aa）
链 D
3639–5037（1399 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.30 Å |
| 6FOO Structure of Ryanodine Receptor 1 in nanodiscs in the presence of calcium and ATP 提交 2018-02-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1297（1297 aa）
链 A
1573–2479（907 aa）
链 A
2734–2939（206 aa）
链 A
3639–5037（1399 aa）
链 B
1–1297（1297 aa）
链 B
1573–2479（907 aa）
链 B
2734–2939（206 aa）
链 B
3639–5037（1399 aa）
链 C
1–1297（1297 aa）
链 C
1573–2479（907 aa）
链 C
2734–2939（206 aa）
链 C
3639–5037（1399 aa）
链 D
1–1297（1297 aa）
链 D
1573–2479（907 aa）
链 D
2734–2939（206 aa）
链 D
3639–5037（1399 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 6M2W Structure of RyR1 (Ca2+/Caffeine/ATP/CaM1234/CHL) 提交 2020-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–2634（2634 aa）
链 A
2741–2939（199 aa）
链 A
3623–4253（631 aa）
链 A
4541–5037（497 aa）
链 D
1–2634（2634 aa）
链 D
2741–2939（199 aa）
链 D
3623–4253（631 aa）
链 D
4541–5037（497 aa）
链 G
1–2634（2634 aa）
链 G
2741–2939（199 aa）
链 G
3623–4253（631 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
链 J
1–2634（2634 aa）
链 J
2741–2939（199 aa）
链 J
3623–4253（631 aa）
链 J
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6WOT Cryo-EM structure of recombinant rabbit Ryanodine Receptor type 1 mutant R164C in complex with FKBP12.6 提交 2020-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
突变：R164C 突变：R164C 突变：R164C 突变：R164C | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 7CF9 Structure of RyR1 (Ca2+/CHL) 提交 2020-06-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–2634（2634 aa）
链 A
2741–2939（199 aa）
链 A
3623–4253（631 aa）
链 A
4541–5037（497 aa）
链 C
1–2634（2634 aa）
链 C
2741–2939（199 aa）
链 C
3623–4253（631 aa）
链 C
4541–5037（497 aa）
链 E
1–2634（2634 aa）
链 E
2741–2939（199 aa）
链 E
3623–4253（631 aa）
链 E
4541–5037（497 aa）
链 G
1–2634（2634 aa）
链 G
2741–2939（199 aa）
链 G
3623–4253（631 aa）
链 G
4541–5037（497 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 7M6A High resolution structure of the membrane embedded skeletal muscle ryanodine receptor 提交 2021-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
链 I
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.36 Å |
| 7M6L High resolution structure of the membrane embedded skeletal muscle ryanodine receptor 提交 2021-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
链 I
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å |
| 7T64 Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6 embedded in lipidic nanodisc in the closed state 提交 2021-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot force 2; blot for 1.0s before plunging
|
分辨率 4.00 Å |
| 7T65 Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6 embedded in lipidic nanodisc in the open state 提交 2021-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot force 2; blot for 1.0s before plunging
|
分辨率 4.05 Å |
| 7TDG Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in inactivated conformation (Dataset-A) 提交 2021-12-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1275（1275 aa）
链 A
1565–2486（922 aa）
链 A
2704–2941（238 aa）
链 A
3614–5037（1424 aa）
链 B
1–1275（1275 aa）
链 B
1565–2486（922 aa）
链 B
2704–2941（238 aa）
链 B
3614–5037（1424 aa）
链 C
1–1275（1275 aa）
链 C
1565–2486（922 aa）
链 C
2704–2941（238 aa）
链 C
3614–5037（1424 aa）
链 D
1–1275（1275 aa）
链 D
1565–2486（922 aa）
链 D
2704–2941（238 aa）
链 D
3614–5037（1424 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
|
分辨率 3.80 Å |
| 7TDH Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in open conformation 提交 2021-12-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1275（1275 aa）
链 A
1565–2486（922 aa）
链 A
2704–2941（238 aa）
链 A
3614–5037（1424 aa）
链 B
1–1275（1275 aa）
链 B
1565–2486（922 aa）
链 B
2704–2941（238 aa）
链 B
3614–5037（1424 aa）
链 C
1–1275（1275 aa）
链 C
1565–2486（922 aa）
链 C
2704–2941（238 aa）
链 C
3614–5037（1424 aa）
链 D
1–1275（1275 aa）
链 D
1565–2486（922 aa）
链 D
2704–2941（238 aa）
链 D
3614–5037（1424 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
|
分辨率 4.00 Å |
| 7TDI Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in closed-inactivated conformation class 2 (Dataset-A) 提交 2021-12-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1275（1275 aa）
链 A
1565–2486（922 aa）
链 A
2704–2941（238 aa）
链 A
3614–5037（1424 aa）
链 B
1–1275（1275 aa）
链 B
1565–2486（922 aa）
链 B
2704–2941（238 aa）
链 B
3614–5037（1424 aa）
链 C
1–1275（1275 aa）
链 C
1565–2486（922 aa）
链 C
2704–2941（238 aa）
链 C
3614–5037（1424 aa）
链 D
1–1275（1275 aa）
链 D
1565–2486（922 aa）
链 D
2704–2941（238 aa）
链 D
3614–5037（1424 aa）
|
未记录 | ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
|
分辨率 3.30 Å |
| 7TDJ Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in closed-inactivated conformation class 1(Dataset-A) 提交 2021-12-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1275（1275 aa）
链 A
1565–2486（922 aa）
链 A
2704–2941（238 aa）
链 A
3614–5037（1424 aa）
链 B
1–1275（1275 aa）
链 B
1565–2486（922 aa）
链 B
2704–2941（238 aa）
链 B
3614–5037（1424 aa）
链 C
1–1275（1275 aa）
链 C
1565–2486（922 aa）
链 C
2704–2941（238 aa）
链 C
3614–5037（1424 aa）
链 D
1–1275（1275 aa）
链 D
1565–2486（922 aa）
链 D
2704–2941（238 aa）
链 D
3614–5037（1424 aa）
|
未记录 | ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
|
分辨率 3.70 Å |
| 7TDK Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in closed-inactivated conformation class 3 (Dataset-A) 提交 2021-12-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1275（1275 aa）
链 A
1565–2486（922 aa）
链 A
2704–2941（238 aa）
链 A
3614–5037（1424 aa）
链 B
1–1275（1275 aa）
链 B
1565–2486（922 aa）
链 B
2704–2941（238 aa）
链 B
3614–5037（1424 aa）
链 C
1–1275（1275 aa）
链 C
1565–2486（922 aa）
链 C
2704–2941（238 aa）
链 C
3614–5037（1424 aa）
链 D
1–1275（1275 aa）
链 D
1565–2486（922 aa）
链 D
2704–2941（238 aa）
链 D
3614–5037（1424 aa）
|
未记录 | ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
|
分辨率 3.80 Å |
| 7TZC A drug and ATP binding site in type 1 ryanodine receptor 提交 2022-02-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
链 I
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 20 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 L9R (2S)-3-(octadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.45 Å |
| 8DRP Focus/local refined map in C4 of signal subtracted RyR1 particles 提交 2022-07-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CFF CAFFEINE × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å |
| 8DTB Focus/local refined map in C1 of signal subtracted RyR1 particles in complex with ImperaCalcin 提交 2022-07-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
链 J
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.14 Å |
| 8DUJ Global map in C1 of RyR1 particles in complex with ImperaCalcin 提交 2022-07-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
链 J
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8DVE RyR1 in presence of IpCa-T26E phosphomimetic and activating ligands 提交 2022-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
链 J
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å |
| 8RRT Structure of rabbit RyR1 reconstituted into lipid liposomes in open state in complex with FKBP and Nb9657 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
11–5037（5027 aa）
链 E
11–5037（5027 aa）
链 G
11–5037（5027 aa）
链 J
11–5037（5027 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 8RRU Structure of RyR1 reconstituted into lipid liposomes in primed state in complex with FKBP and Nb9657. 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
11–5037（5027 aa）
链 E
11–5037（5027 aa）
链 G
11–5037（5027 aa）
链 J
11–5037（5027 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 8RRV Structure of RyR1 in detergent in close state in complex with FKBP and Nb9657. 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
1–5037（5037 aa）
链 E
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
链 J
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8RRW Structure of RyR1 in detergent in open state in complex with FKBP and Nb9657. 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
11–5037（5027 aa）
链 E
11–5037（5027 aa）
链 G
11–5037（5027 aa）
链 J
11–5037（5027 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8RRX Structure of RyR1 reconstituted into lipid nanodisc in primed state in complex with Ca2+, ATP, caffeine and Nb9657 提交 2024-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
11–5037（5027 aa）
链 D
11–5037（5027 aa）
链 G
11–5037（5027 aa）
链 I
11–5037（5027 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8RS0 Structure of RyR1 in detergent in primed state in complex with nanobody and FKBP 提交 2024-01-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
11–5037（5027 aa）
链 E
11–5037（5027 aa）
链 G
11–5037（5027 aa）
链 J
11–5037（5027 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8SEN Cryo-EM Structure of RyR1 提交 2023-04-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 8SEO Cryo-EM Structure of RyR1 + ATP-gamma-S 提交 2023-04-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.92 Å |
| 8SEP Cryo-EM Structure of RyR1 + ADP 提交 2023-04-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å |
| 8SEQ Cryo-EM Structure of RyR1 + AMP 提交 2023-04-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8SER Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenosine 提交 2023-04-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ADN ADENOSINE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.42 Å |
| 8SES Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenine 提交 2023-04-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ADE ADENINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.98 Å |
| 8SET Cryo-EM Structure of RyR1 + cAMP 提交 2023-04-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.42 Å |
| 8SEU Cryo-EM Structure of RyR1 (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8SEV Cryo-EM Structure of RyR1 + ATP-gamma-S (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 8SEW Cryo-EM Structure of RyR1 + ADP (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.89 Å |
| 8SEX Cryo-EM Structure of RyR1 + AMP (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å |
| 8SEY Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenosine (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ADN ADENOSINE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.99 Å |
| 8SEZ Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenine (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ADE ADENINE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 8SF0 Cryo-EM Structure of RyR1 + cAMP (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8X48 Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (EGTA) 提交 2023-11-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8X49 Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (100 nM Ca2+) 提交 2023-11-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8X4A Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (TM helix S0,100 nM Ca2+, closed state) 提交 2023-11-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8X4B Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (TM helix S0,100 nM Ca2+, open state) 提交 2023-11-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8X4C Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (20 uM Ca2+, 2 mM ATP) 提交 2023-11-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8X4D Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (TM helix S0,20 uM Ca2+, 2 mM ATP) 提交 2023-11-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8X4E Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (TM helix S0, 5 mM Ca2+) 提交 2023-11-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8XJI Structure of chimeric RyR complex with flubendiamide 提交 2023-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S | A1LVX Flubendiamide × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.91 Å |
| 8XKH Structure of chimeric RyR Complex with tetraniliprole 提交 2023-12-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 A1LV1 tetraniliprole × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.87 Å |
| 8XLF Structure of chimeric RyR 提交 2023-12-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 8XLH Structure of chimeric RyR-I4657M/G4819E 提交 2023-12-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E 突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E 突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E 突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 8Y40 Structure of chimeric RyR-I4657M/G4819E complex with chlorantraniliprole 提交 2024-01-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E 突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E 突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E 突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E | F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.58 Å |
| 9CGP RyR1 disease mutant Y523S with FKBP12.6, nanodisc and inhibitor dantrolene in the absence of calcium with refined P1 domain 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 U1C Dantrolene × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.34 Å |
| 9CGQ Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6, nanodisc and inhibitor dantrolene in the presence of activating calcium 提交 2024-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 U1C Dantrolene × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 9E17 Structure of RyR1 in the primed state in the presence of caffeine (reprocessed/reanalyzed from EMPIAR-10997, 7TZC, EMD-26205) 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
链 I
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 20 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 L9R (2S)-3-(octadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.45 Å |
| 9E18 Structure of RyR1 in the primed state in the presence of pentoxifylline 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 PNX 3,7-DIMETHYL-1-(5-OXOHEXYL)-3,7-DIHYDRO-1H-PURINE-2,6-DIONE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；2 mM pentoxifylline was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.68 Å |
| 9E19 Structure of RyR1 in the open state in the presence of pentoxifylline 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 PNX 3,7-DIMETHYL-1-(5-OXOHEXYL)-3,7-DIHYDRO-1H-PURINE-2,6-DIONE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；2 mM pentoxifylline was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.04 Å |
| 9E1A Structure of RyR1 in the primed state in the presence of dyphylline 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 A1BD2 dyphylline × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；2 mM dyphylline was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 9E1B Structure of RyR1 in the open state in the presence of dyphylline 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 A1BD2 dyphylline × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；2 mM dyphylline was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.49 Å |
| 9E1C Structure of RyR1 in the primed state in the presence of IBMX 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 IBM 3-ISOBUTYL-1-METHYLXANTHINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；2 mM IBMX was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.63 Å |
| 9E1D Structure of RyR1 in the primed state in the presence of enprofylline 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 A1BD3 enprofylline × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；2 mM enprofylline was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |
| 9E1E Structure of RyR1 in the primed state in the presence of uracil 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 URA URACIL × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；2 mM uracil was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.92 Å |
| 9E1F Structure of RyR1 in the primed state in the presence of allopurinol 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 A1BD4 allopurinol × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；2 mM allopurinol was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 9E1G Structure of RyR1 in the primed state in the presence of oxypurinol 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 141 Oxypurinol × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；2 mM oxypurinol was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 9E1H Structure of RyR1 in the primed state in the presence of oxopyricid 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 A1BD5 oxopyricid × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；2 mM oxopyricid was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 9E1I Structure of RyR1 in the open state in the presence of oxopyricid 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 B
1–5037（5037 aa）
链 C
1–5037（5037 aa）
链 D
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 A1BD5 oxopyricid × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；2 mM oxopyricid was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9HEO Open-state RyR1 in 0.05% POPC micelles, in complex with a nanobody and FKBP 提交 2024-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
11–5037（5027 aa）
链 C
11–5037（5027 aa）
链 G
11–5037（5027 aa）
链 J
11–5037（5027 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 72 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9HEQ Open-state RyR1 in 0.01% POPC micelles, in complex with a nanobody and FKBP12 提交 2024-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
11–5037（5027 aa）
链 C
11–5037（5027 aa）
链 G
11–5037（5027 aa）
链 J
11–5037（5027 aa）
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 40 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9OL4 Cryo-EM Structure of Ryanodine Receptor 1: Drug Bound Open Conformation 提交 2025-05-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
链 M
1–5037（5037 aa）
链 S
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 117 7-[2-(4-FLUORO-PHENYL)-5-ISOPROPYL-3-PHENYL-4-PHENYLCARBAMOYL-PYRROL-1-YL]- 3,5-DIHYDROXY-HEPTANOIC ACID × 12 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |
| 9OL5 Rabbit Ryanodine Receptor 1: Atorvastatin Bound Closed Conformation 提交 2025-05-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
链 M
1–5037（5037 aa）
链 S
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 117 7-[2-(4-FLUORO-PHENYL)-5-ISOPROPYL-3-PHENYL-4-PHENYLCARBAMOYL-PYRROL-1-YL]- 3,5-DIHYDROXY-HEPTANOIC ACID × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 9OL6 Rabbit Ryanodine Receptor 1: DMSO Control Closed Conformation 提交 2025-05-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–5037（5037 aa）
链 G
1–5037（5037 aa）
链 M
1–5037（5037 aa）
链 S
1–5037（5037 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 9R8O Primed-state RyR1 in 0.05% POPC micelles, in complex with a nanobody and FKBP 提交 2025-05-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 C
11–5037（5027 aa）
链 F
11–5037（5027 aa）
链 I
11–5037（5027 aa）
链 J
11–5037（5027 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 40 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9RCW Primed-state RyR1 in 0.01% POPC micelles, in complex with a nanobody and FKBP12 提交 2025-05-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
11–5037（5027 aa）
链 C
11–5037（5027 aa）
链 G
11–5037（5027 aa）
链 J
11–5037（5027 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 24 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |