当前蛋白身份：P17676
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1GTW crystal structure of C/EBPbeta bZip homodimer bound to a DNA fragment from the tom-1A promoter 提交 2002-01-22 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 A
259–336（78 aa）
片段：BZIP DOMAIN, RESIDUES 259-336
链 B
259–336（78 aa）
片段：BZIP DOMAIN, RESIDUES 259-336
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；0.2 M POTASSIUM CHLORIDE, 0.1 M MAGNESIUM ACETATE, 10.0% W/V PEG 8000, 0.05 M SODIUM CACODYLATE CACODYLATE BUFFER PH 6.5, PROTEIN-DNA COMPLEX SOLUTION CONTAINS 0.01 M DTT AND 0.005 M NAN3, PROTEIN:DNA RATIO IS 1:1.2
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.271 |
| 1GTW crystal structure of C/EBPbeta bZip homodimer bound to a DNA fragment from the tom-1A promoter 提交 2002-01-22 | Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
259–336（78 aa）
片段：BZIP DOMAIN, RESIDUES 259-336
链 B
259–336（78 aa）
片段：BZIP DOMAIN, RESIDUES 259-336
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；0.2 M POTASSIUM CHLORIDE, 0.1 M MAGNESIUM ACETATE, 10.0% W/V PEG 8000, 0.05 M SODIUM CACODYLATE CACODYLATE BUFFER PH 6.5, PROTEIN-DNA COMPLEX SOLUTION CONTAINS 0.01 M DTT AND 0.005 M NAN3, PROTEIN:DNA RATIO IS 1:1.2
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.271 |
| 1GU4 Crystal structure of C/EBPBETA BZIP homodimer bound to a high affinity DNA fragment 提交 2002-01-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
259–336（78 aa）
片段：BZIP DOMAIN, RESIDUES 259-336
链 B
259–336（78 aa）
片段：BZIP DOMAIN, RESIDUES 259-336
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；0.2 M POTASSIUM CHLORIDE, 0.01 M MAGNESIUM SULFATE, 10.0% V/V PEG 400, 0.05 M MES BUFFER PH 6.0, PROTEIN-DNA COMPLEX CONCENTRATION WAS 12 MG/ML AND CONTAINS 0.01 M DTT, PROTEIN:DNA RATIO WAS 1:1.2. FOR CRYOPROTECTION THE CONCENTRATION OF PEG 400 WAS ADJUSTED TO 36% V/V
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.266 |
| 1GU5 Crystal structure of C/EBPBETA BZIP homodimer bound to a DNA fragment from the MIM-1 promoter 提交 2002-01-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
259–336（78 aa）
片段：BZIP DOMAIN, RESIDUES 259-336
链 B
259–336（78 aa）
片段：BZIP DOMAIN, RESIDUES 259-336
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；0.08 M MAGNESIUM ACETATE, 15.0% V/V PEG 400, 0.05 M SODIUM CACODYLATE BUFFER PH 6.5, PROTEIN-DNA COMPLEX CONCENTRATION WAS 12 MG/ML WITH ADDITION OF 0.01 M DTT, PROTEIN:DNA RATIO WAS 1:1.2 FOR CRYOPROTECTION THE CONCENTRATION OF PEG 400 WAS ADJUSTED TO 36% V/V
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.277 |
| 1H88 CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY PROTEIN-DNA COMPLEX1 提交 2001-01-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
259–336（78 aa）
片段：RESIDUES 259-336
链 B
259–336（78 aa）
片段：RESIDUES 259-336
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；0.05 M AMMONIUM ACETATE, 0.01 M MAGNESIUM CHLORIDE, 10% V/V MPD, 6% V/V GLYCEROL, 0.05 M TRIS HCL BUFFER PH 7.5 AT 24 DEGREES C
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.277 |
| 1H89 CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY PROTEIN-DNA COMPLEX2 提交 2001-01-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
273–336（64 aa）
片段：RESIDUES 273-336
链 B
273–336（64 aa）
片段：RESIDUES 273-336
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；297 K；0.1 M KCL, 0.05 MGSO4, 4% V/V MPD, 6% V/V GLYCEROL, 0.05 M NA HEPES PH 7.0 AT 24 DEGREES C
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.267 |
| 1H8A CRYSTAL STRUCTURE OF TERNARY PROTEIN-DNA COMPLEX3 提交 2001-01-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
259–336（78 aa）
片段：RESIDUES 259-336
链 B
259–336（78 aa）
片段：RESIDUES 259-336
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；297 K；0.04 M MAGNESIUM CHLORIDE, 20% V/V MPD, 0.05 M SODIUM CACODYLATE BUFFER PH 6.0 AT 24 DEGREES C
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.288 |
| 1HJB CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN AND C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER 提交 2001-01-11 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
259–345（87 aa）
片段：RESIDUES 259-345
链 B
259–345（87 aa）
片段：RESIDUES 259-345
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；297 K；5 MM MGSO4, 3% W/V PEG 4000, 1% V/V DIOXANE, 50 MM MES BUFFER, PH 5.6 AT 24 DEGREES C
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.313 |
| 1HJB CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN AND C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER 提交 2001-01-11 | Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 D
259–345（87 aa）
片段：RESIDUES 259-345
链 E
259–345（87 aa）
片段：RESIDUES 259-345
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；297 K；5 MM MGSO4, 3% W/V PEG 4000, 1% V/V DIOXANE, 50 MM MES BUFFER, PH 5.6 AT 24 DEGREES C
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.313 |
| 1IO4 CRYSTAL STRUCTURE OF RUNX-1/AML1/CBFALPHA RUNT DOMAIN-CBFBETA CORE DOMAIN HETERODIMER AND C/EBPBETA BZIP HOMODIMER BOUND TO A DNA FRAGMENT FROM THE CSF-1R PROMOTER 提交 2001-01-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
259–336（78 aa）
片段：BZIP DOMAIN
链 B
259–336（78 aa）
片段：BZIP DOMAIN
|
未记录 | AU GOLD ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；297 K；0.2 M potassium chloride, 0.01 M magnesium chloride, 0.01 M DTT, 4.5% V/V PEG 8000, 1% V/V glycerol, 1% V/V MPD, 0.05 M MES buffer pH 5.6, pH 5.60, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.299 |
| 2E42 Crystal structure of C/EBPbeta Bzip homodimer V285A mutant bound to A High Affinity DNA fragment 提交 2006-12-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
259–336（78 aa）
片段：residues 259-336
链 B
259–336（78 aa）
片段：residues 259-336
|
突变：V285A 突变：V285A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；magnesium chloride, MES, PEG400, PH 6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.252 |
| 2E43 Crystal structure of C/EBPbeta Bzip homodimer K269A mutant bound to A High Affinity DNA fragment 提交 2006-12-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
259–336（78 aa）
片段：residues 259-336
链 B
259–336（78 aa）
片段：residues 259-336
|
突变：K269A 突变：K269A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；magnesium chloride, Tris-Hcl, PEG4000, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.259 |
| 6MG1 C-terminal bZIP domain of human C/EBPbeta with 16bp Methylated Oligonucleotide Containing Consensus Recognition Sequence-C2 Crystal Form 提交 2018-09-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
246–321（76 aa）
链 B
246–321（76 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 25% (w/v) polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.250 |
| 6MG2 C-terminal bZIP domain of human C/EBPbeta with 16bp Methylated Oligonucleotide Containing Consensus Recognition Sequence-C2221 Crystal Form 提交 2018-09-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
246–321（76 aa）
链 B
246–321（76 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；0.1 M sodium acetate trihydrate pH 7.0, 12% (w/v) polyethylene glycol 3350
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.210 |
| 6MG3 V285A Mutant of the C-terminal bZIP domain of human C/EBPbeta with 16bp Methylated Oligonucleotide Containing Consensus Recognition Sequence 提交 2018-09-12 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
246–321（76 aa）
链 B
246–321（76 aa）
|
突变：V285A 突变：V285A | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；0.1 M sodium acetate trihydrate pH 7.0, 12% (w/v) polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 7L4V C-terminal bZIP domain of human C/EBPbeta Bound to DNA with Consensus Recognition with GT Mismatch 提交 2020-12-21 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
246–321（76 aa）
链 B
246–321（76 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；50 mM ammonium sulfate, 50 mM BIS-TRIS pH 6.5, 30% (v/v) pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH)
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分辨率 1.75 Å R-free 0.221 |
| 7UPZ Structural basis for cell type specific DNA binding of C/EBPbeta: the case of cell cycle inhibitor p15INK4b promoter 提交 2022-04-18 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
257–336（80 aa）
片段：UNP residues 257-336
链 B
257–336（80 aa）
片段：UNP residues 257-336
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；100 mM potassium chloride, 10 mM magnesium chloride, 50 mM MES, pH 6.0, 10% v/v PEG400, 5% v/v glycerol
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分辨率 2.49 Å R-free 0.264 |
| 8K8D Crystal structure of C/EBPbeta BZIP domain bound to a high affinity DNA 提交 2023-07-29 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
259–336（78 aa）
链 B
259–336（78 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.02 M Calcium chloride dihydrate,0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6 and 20% v/v 2-Propanol
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分辨率 2.20 Å R-free 0.292 |