当前蛋白身份：P24297
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BQ8 Rubredoxin (Methionine Mutant) from Pyrococcus Furiosus 提交 1998-08-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.6M NA,K PHOSPHATE, pH 8.5, vapor diffusion
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.149 |
| 1BQ9 Rubredoxin (Formyl Methionine Mutant) from Pyrococcus Furiosus 提交 1998-08-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
突变：FMET INSERTED IN N-TERMINAL POSITION 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FE FE (III) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.6M NA,K PHOSPHATE, pH 8.5, vapor diffusion
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.166 |
| 1BRF Rubredoxin (Wild Type) from Pyrococcus Furiosus 提交 1998-08-24 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–53（53 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.6M NA,K PHOSPHATE, pH 8.5, vapor diffusion
|
分辨率 0.95 Å R-free 0.162 |
| 1CAA X-RAY CRYSTAL STRUCTURES OF THE OXIDIZED AND REDUCED FORMS OF THE RUBREDOXIN FROM THE MARINE HYPERTHERMOPHILIC ARCHAEBACTERIUM PYROCOCCUS FURIOSUS 提交 1992-05-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–53（53 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1CAD X-RAY CRYSTAL STRUCTURES OF THE OXIDIZED AND REDUCED FORMS OF THE RUBREDOXIN FROM THE MARINE HYPERTHERMOPHILIC ARCHAEBACTERIUM PYROCOCCUS FURIOSUS 提交 1992-05-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–53（53 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1IU5 X-ray Crystal Structure of the rubredoxin mutant from Pyrococcus Furiosus 提交 2002-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–53（53 aa）
|
突变：W3Y, I23V, L32I | FE FE (III) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；Na/K phosphate, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.203 |
| 1IU6 Neutron Crystal Structure of the rubredoxin mutant from Pyrococcus Furiosus 提交 2002-02-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–53（53 aa）
|
突变：W3Y, I23V, L32I | FE FE (III) ION × 1 | NEUTRON DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；Na/K phosphate, VAPOR DIFFUSION
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.228 |
| 1QCV RUBREDOXIN VARIANT (PFRD-XC4) FOLDS WITHOUT IRON 提交 1999-05-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–53（53 aa）
|
突变：C5L C8T C38A C41T | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）225mM；压力 1
NMR样品组成
1.5MM PFRD-XC4 ACETATE-D3 PH 6.3; 200MM NACL; 90/10 H2O/D2O
|
分辨率未提供 |
| 1RWD Backbone NMR Structure of a Mutant P. Furiosus Rubredoxin Using Residual Dipolar Couplings 提交 2003-12-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–53（53 aa）
|
突变：W3Y, I23V, L32I | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
4.5 mM Rubredoxin U-15N; 50 mM Na Phosphate; 100 mM NaCl; pH 6.3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2.5 mM Rubredoxin U-15N; 50 mM Na Phosphate ; 50 mM NaCl; pH 6.3; 7% Bicelle (3:1 DMPC:DHPC with 4% CTAB relative to DMPC) | Bicelles in 90% H2O, 10% D2O
NMR样品组成
4.5 mM Rubredoxin U-15N; 50 mM Na Phosphate; 100 mM NaCl; pH 6.3; PF1 phage sample | Phage in 90% H2O, 10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1VCX Neutron Crystal Structure of the Wild Type Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 1.5A Resolution 提交 2004-03-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–53（53 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | NEUTRON DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
Macroseeding；pH 8；298 K；sodium dihydrogen phosphate, dipotassium hydrogen phosphate, pH 8.0, Macroseeding, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.217 |
| 1ZRP SOLUTION-STATE STRUCTURE BY NMR OF ZINC-SUBSTITUTED RUBREDOXIN FROM THE MARINE HYPERTHERMOPHILIC ARCHAEBACTERIUM PYROCOCCUS FURIOSUS 提交 1992-07-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–53（53 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 2PVX NMR and X-ray Analysis of Structural Additivity in Metal Binding Site-Swapped Hybrids of Rubredoxin 提交 2007-05-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
突变：A2K,K7T,I8V,I41L,A44V,P45G,S47D,E48Q | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；62% Ammonium Sulphate
0.1 M Sodium Acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.180 |
| 2PVX NMR and X-ray Analysis of Structural Additivity in Metal Binding Site-Swapped Hybrids of Rubredoxin 提交 2007-05-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–54（54 aa）
|
突变：A2K,K7T,I8V,I41L,A44V,P45G,S47D,E48Q | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；62% Ammonium Sulphate
0.1 M Sodium Acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.180 |
| 2PVX NMR and X-ray Analysis of Structural Additivity in Metal Binding Site-Swapped Hybrids of Rubredoxin 提交 2007-05-10 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–54（54 aa）
|
突变：A2K,K7T,I8V,I41L,A44V,P45G,S47D,E48Q | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；62% Ammonium Sulphate
0.1 M Sodium Acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.180 |
| 2PVX NMR and X-ray Analysis of Structural Additivity in Metal Binding Site-Swapped Hybrids of Rubredoxin 提交 2007-05-10 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–54（54 aa）
|
突变：A2K,K7T,I8V,I41L,A44V,P45G,S47D,E48Q | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；62% Ammonium Sulphate
0.1 M Sodium Acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.180 |
| 2PVX NMR and X-ray Analysis of Structural Additivity in Metal Binding Site-Swapped Hybrids of Rubredoxin 提交 2007-05-10 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
1–54（54 aa）
|
突变：A2K,K7T,I8V,I41L,A44V,P45G,S47D,E48Q | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；62% Ammonium Sulphate
0.1 M Sodium Acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.180 |
| 2PVX NMR and X-ray Analysis of Structural Additivity in Metal Binding Site-Swapped Hybrids of Rubredoxin 提交 2007-05-10 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
1–54（54 aa）
|
突变：A2K,K7T,I8V,I41L,A44V,P45G,S47D,E48Q | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；62% Ammonium Sulphate
0.1 M Sodium Acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.180 |
| 2PVX NMR and X-ray Analysis of Structural Additivity in Metal Binding Site-Swapped Hybrids of Rubredoxin 提交 2007-05-10 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
1–54（54 aa）
|
突变：A2K,K7T,I8V,I41L,A44V,P45G,S47D,E48Q | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；62% Ammonium Sulphate
0.1 M Sodium Acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.180 |
| 2PVX NMR and X-ray Analysis of Structural Additivity in Metal Binding Site-Swapped Hybrids of Rubredoxin 提交 2007-05-10 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
1–54（54 aa）
|
突变：A2K,K7T,I8V,I41L,A44V,P45G,S47D,E48Q | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；62% Ammonium Sulphate
0.1 M Sodium Acetate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.04 Å R-free 0.180 |
| 3KYU X-ray crystal structure determination of fully perdeuterated rubredoxin at 100K 提交 2009-12-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；3.8 M sodium/potassium phosphate, hanging drop
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.125 |
| 3KYV Denovo X-ray crystal structure determination of H-labeled perdeuterated rubredoxin at 100K 提交 2009-12-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；3.8 M sodium/potassium phosphate, hanging drop
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.147 |
| 3KYW Xray crystal structure determination of H-labeled perdeuterated rubredoxin at 295K 提交 2009-12-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
hanging drop；3.8 M sodium/potassium phosphate, hanging drop
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.165 |
| 3KYX Joint Xray/neutron crystal structure determination of fully perdeuterated rubredoxin at 295K 提交 2009-12-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | 未声明 |
X-ray结晶条件
hanging drop；3.8 M sodium/potassium phosphate, hanging drop
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.197 |
| 3KYY Joint Xray/neutron crystal structure determination of H-labeled perdeuterated rubredoxin at 295K 提交 2009-12-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | 未声明 |
X-ray结晶条件
3.8 M sodium/potassium phosphate, hanging drop
|
分辨率 1.10 Å |
| 3RYG 128 hours neutron structure of perdeuterated rubredoxin 提交 2011-05-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | NEUTRON DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mg/ml rubredoxin in 1.9 M sodium/potassium phosphate sitting drop equilibrated against 3.8 m sodium/potassium phosphate reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.200 |
| 3RZ6 Neutron structure of perdeuterated rubredoxin using 40 hours 1st pass data 提交 2011-05-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | NEUTRON DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mg/ml rubredoxin in 1.9 M sodium/potassium phosphate sitting drop equilibrated against 3.8 m sodium/potassium phosphate reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.238 |
| 3RZT Neutron structure of perdeuterated rubredoxin using rapid (14 hours) data 提交 2011-05-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | NEUTRON DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mg/ml rubredoxin in 1.9 M sodium/potassium phosphate sitting drop equilibrated against 3.8 m sodium/potassium phosphate reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.249 |
| 3SS2 Neutron structure of perdeuterated rubredoxin using 48 hours 3rd pass data 提交 2011-07-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | NEUTRON DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mg/ml rubredoxin in 1.9m sodium/potassium phosphate sitting drop equilibrated against 3.8 m sodium/potassium phosphate reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.242 |
| 4AR3 Near-atomic resolution neutron crystallography on the oxidised form perdeuterated Pyrococcus furiosus rubredoxin. 提交 2012-04-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 D8U deuterium(1+) × 4 D3O trideuteriooxidanium × 4 | NEUTRON DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；PH 6.5
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.237 |
| 4AR4 Neutron crystallographic structure of the reduced form perdeuterated Pyrococcus furiosus rubredoxin to 1.38 Angstrom resolution. 提交 2012-04-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 D8U deuterium(1+) × 2 D3O trideuteriooxidanium × 4 | NEUTRON DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.2；pH 6.2
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.226 |
| 4AR5 X-ray crystallographic structure of the oxidised form perdeuterated Pyrococcus furiosus rubredoxin in D2O at 295K (in quartz capillary) to 1.00 Angstrom resolution. 提交 2012-04-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.119 |
| 4AR6 X-ray crystallographic structure of the reduced form perdeuterated Pyrococcus furiosus rubredoxin at 295 K (in quartz capillary) to 0.92 Angstroms resolution. 提交 2012-04-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.2；pH 6.2
|
分辨率 0.92 Å R-free 0.136 |
| 4K9F Neutron structure of Perdeuterated Rubredoxin refined against 1.75 resolution data collected on the new IMAGINE instrument at HFIR, ORNL 提交 2013-04-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | NEUTRON DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 mg/ml rubredoxin in 1.9 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE sitting drop equilibrated against 3.8 M SODIUM/POTASSIUM PHOSPHATE reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.241 |
| 5AI2 Anomalous Neutron phased crystal structure of 113Cd-substituted Perdeuterated Pyrococcus furiosus rubredoxin to 1.75A resolution at 295K 提交 2015-02-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | CD CADMIUM ION × 1 D8U deuterium(1+) × 3 | NEUTRON DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；PH 6.5
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.286 |
| 5AI3 X-ray structure of 113Cd-substituted Perdeuterated Pyrococcus furiosus rubredoxin to 1.02A resolution at 295K in a quartz capillary 提交 2015-02-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | CD CADMIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；3.8 M NAH2PO4, 3.8M K2HPO4 IN MORE THAN 99.7 PERCENT PURE D2O, pH 6.5
|
分辨率 1.02 Å R-free 0.126 |
| 5NW3 The cryofrozen atomic resolution X-ray crystal structure of perdeuterated Pyrococcus furiosus Rubredoxin (100K, 0.59A resolution) 提交 2017-05-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；seeded 3.4M equimolar Na/K phosphate buffer
|
分辨率 0.59 Å R-free 0.146 |
| 5OME The cryofrozen atomic resolution X-ray crystal structure of the reduced form (Fe2+) perdeuterated Pyrococcus furiosus Rubredoxin in D2O (100K, 0.75 Angstrom resolution) 提交 2017-07-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 NA SODIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；SEEDED 3.4M EQUIMOLAR NA/K PHOSPHATE
BUFFER
|
分辨率 0.75 Å R-free 0.121 |
| 9BKL Cobalt substituted rubredoxin from Pyrococcus furiosus solved by Co/S-SAD 提交 2024-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；3.8M NaH2PO4, 3.8M K2HPO4 (1:1, v/v)
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.183 |
| 9BKP Crystal structure of rubredoxin from Pyrococcus furiosus reconstituted with FeCl3 solved by Fe/S-SAD 提交 2024-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Tris pH 8.4, 2.2M ammonium sulfate, 30% MPD
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.185 |
| 9BKT Crystal structure of rubredoxin from Pyrococcus furiosus reconstituted with FeSO4 solved by Fe/S-SAD 提交 2024-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | FE2 FE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M tris pH 8.4
2.2 M ammonium sulfate
30% MPD
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.166 |
| 9XZU Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 100K, Alanine-2 N terminus 提交 2025-08-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 0.82 Å R-free 0.148 |
| 9Y00 Zinc Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 140K, A2 Nterminus 提交 2025-08-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 0.83 Å R-free 0.140 |
| 9Y0Y Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 180K, Alanine-2 N terminus 提交 2025-08-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 0.85 Å R-free 0.150 |
| 9Y0Z Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 200K, Alanine-2 N terminus 提交 2025-08-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 0.86 Å R-free 0.149 |
| 9Y11 Zn Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 220K, Alanine-2 N terminus 提交 2025-08-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 0.91 Å R-free 0.147 |
| 9Y1U Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 240K, Alanine-2 N terminus 提交 2025-08-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 0.98 Å R-free 0.148 |
| 9Y28 Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 260K, Alanine-2 N terminus 提交 2025-08-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 1.01 Å R-free 0.143 |
| 9Y29 Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 280K, Alanine-2 N terminus 提交 2025-08-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.144 |
| 9Y2E Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 100K, formyl-Methionine N-terminus 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 0.78 Å R-free 0.140 |
| 9Y2G Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 293K, formyl-Methionine N-terminus 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 1.14 Å R-free 0.158 |
| 9Y2Y Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 393K, formyl-Methionine N-terminus 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.243 |
| 9Y30 Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 383K, formyl-Methionine N-terminus 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 1.53 Å R-free 0.190 |
| 9Y32 Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 373K, formyl-Methionine N-terminus 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.173 |
| 9Y33 Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 363K, formyl-Methionine N-terminus 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.154 |
| 9Y37 Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 353K, formyl-Methionine N-terminus 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.253 |
| 9Y38 Rubredoxin from Pyrococcus Furiosus at 313K, formyl-Methionine N-terminus 提交 2025-09-01 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–54（54 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；VAPOR DIFFUSION AGAINST 3.1 M NaCl with 3.6M Na,K PHOSPHATE, pH 8.0
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.195 |