当前蛋白身份:P62751 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6SWA Mus musculus brain neocortex ribosome 60S bound to Ebp1 提交 2019-09-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 43 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物一致
链 V 39–156(118 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 247 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7CPU Cryo-EM structure of 80S ribosome from mouse kidney 提交 2020-08-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 73 PDB 声明:78-meric(78) 与全部聚合物一致
链 LX 1–156(156 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 271 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
7CPV Cryo-EM structure of 80S ribosome from mouse testis 提交 2020-08-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 73 PDB 声明:78-meric(78) 与全部聚合物一致
链 LX 1–156(156 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 247 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.03 Å
7LS1 80S ribosome from mouse bound to eEF2 (Class II) 提交 2021-02-17 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 R2 1–156(156 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;3 second blotting, force 3
分辨率 3.30 Å
7LS2 80S ribosome from mouse bound to eEF2 (Class I) 提交 2021-02-17 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 R2 1–156(156 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;3 second blotting, force 3
分辨率 3.10 Å
9H4N RPL13 (eL13)-mutant 80S ribosome from mouse 提交 2024-10-21 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 70 PDB 声明:76-meric(76) 与全部聚合物一致
链 R2 39–156(118 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;1,2 second blotting
分辨率 2.46 Å
9KDT Cryo-EM structure of 80S ribosome 提交 2024-11-04 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:81-meric(81) 与全部聚合物一致
链 LX 1–156(156 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
9KDU Cryo-EM structure of 80S ribosome 提交 2024-11-04 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:80-meric(80) 与全部聚合物一致
链 LX 1–156(156 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
9KDV Cryo-EM structure of 80S ribosome 提交 2024-11-04 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:81-meric(81) 与全部聚合物一致
链 LX 1–156(156 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.33 Å
9KDW Cryo-EM structure of 80S ribosome 提交 2024-11-04 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:81-meric(81) 与全部聚合物一致
链 LX 1–156(156 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.67 Å
9QOH Mouse Ribosome POST translocation state 提交 2025-03-26 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:83-meric(83) 待复核
链 R2 1–156(156 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 122 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
9QQL Mouse RPS15 P131 Mutant Ribosome POST translocation state 提交 2025-04-01 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 76 PDB 声明:83-meric(83) 与全部聚合物一致
链 R2 1–156(156 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 122 UNK UNKNOWN × 22 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9QQP Mouse Ribosome rotated-2 PRE state 提交 2025-04-01 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致
链 R2 1–156(156 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 123 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9QSA Mouse Ribosome rotated-1 PRE state 提交 2025-04-04 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致
链 R2 1–156(156 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 117 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9QWT Mouse Ribosome RPS15 (uS19) P131S rotated-2 PRE state 提交 2025-04-15 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致
链 R2 1–156(156 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 123 ZN ZINC ION × 6 B8N (2~{R})-2-azanyl-4-[5-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-3,4-bis(oxidanyl)-5-(phosphonooxymethyl)oxolan-2-yl]-3-methyl-2,6-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]butanoic acid × 1 4AC N(4)-ACETYLCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9QZP Mouse Ribosome Classical Pre translocation state 提交 2025-04-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 R2 1–156(156 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 118 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å