当前蛋白身份：Q12824
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5AJ1 Solution Structure of the Smarc Domain 提交 2015-02-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–113（112 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1.0
NMR样品组成
95% WATER/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5GJK Crystal Structure of BAF47 and BAF155 Complex 提交 2016-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
183–249（67 aa）
片段：UNP RESIDUES 183-249
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未记录 | GOL GLYCEROL × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.4；293 K；1 M sodium phosphate monobasic monohydrate, potassium phosphate dibasic, pH 5.4
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分辨率 2.05 Å R-free 0.213 |
| 5L7A The crystal structure of the Human SNF5/INI1 domain 提交 2016-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
184–252（69 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；1.4 M tri-sodium citrate and 100 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.260 |
| 5L7A The crystal structure of the Human SNF5/INI1 domain 提交 2016-06-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
184–252（69 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；1.4 M tri-sodium citrate and 100 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.260 |
| 5L7A The crystal structure of the Human SNF5/INI1 domain 提交 2016-06-02 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
184–252（69 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；1.4 M tri-sodium citrate and 100 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.260 |
| 5L7A The crystal structure of the Human SNF5/INI1 domain 提交 2016-06-02 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
184–252（69 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；1.4 M tri-sodium citrate and 100 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.260 |
| 5L7B Solution structure of the human SNF5/INI1 domain 提交 2016-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
184–258（75 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；293 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 1
NMR样品组成
20 mM potassium phosphate, 100 mM sodium chloride, 5 mM [U-100% 2H] beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
20 mM potassium phosphate, 100 mM sodium chloride, 5 mM [U-100% 2H] beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 6AX5 RPT1 region of INI1/SNF5/SMARCB1_HUMAN - SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1. 提交 2017-09-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
174–256（83 aa）
片段：UNP Residues 174-256
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）160；压力 1
NMR样品组成
400 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Rpt1/INI1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 6KAG Crystal structure of the SMARCB1/SMARCC2 subcomplex 提交 2019-06-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
160–376（217 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；150 mM CsCl2, 15% PEG3350.
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分辨率 2.60 Å R-free 0.240 |
| 6KZ7 The crystal structure of BAF155 SWIRM domain and N-terminal elongated hSNF5 RPT1 domain complex: Chromatin remodeling complex 提交 2019-09-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
171–252（82 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；288 K；TACSIMATE, HEPES, PEC3350, MICROBATCH, TEMPERATURE 288K
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.200 |
| 6KZ7 The crystal structure of BAF155 SWIRM domain and N-terminal elongated hSNF5 RPT1 domain complex: Chromatin remodeling complex 提交 2019-09-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
171–252（82 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH；288 K；TACSIMATE, HEPES, PEC3350, MICROBATCH, TEMPERATURE 288K
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.200 |
| 6LTH Structure of human BAF Base module 提交 2020-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 M
1–385（385 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.00 Å |
| 6LTJ Structure of nucleosome-bound human BAF complex 提交 2020-01-22 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–113（113 aa）
片段：UNP residues 1-113, UNP residues 172-385
链 M
172–385（214 aa）
片段：UNP residues 1-113, UNP residues 172-385
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6UCH SMARCB1 nucleosome-interacting C-terminal alpha helix 提交 2019-09-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
351–385（35 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成
300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] SMARCB1CC, 137 mM NaCl, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM Na2HPO4, 1.8 mM KH2PO4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
230 uM SMARCB1CC, 137 mM NaCl, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM Na2HPO4, 1.8 mM KH2PO4, 100% D2O | 100% D2O
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分辨率未提供 |
| 7VDV The overall structure of human chromatin remodeling PBAF-nucleosome complex 提交 2021-09-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric（24） 与全部聚合物一致 |
链 V
1–385（385 aa）
|
未记录 | BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7Y8R The nucleosome-bound human PBAF complex 提交 2022-06-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：27-meric（27） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–385（385 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 9RL4 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 提交 2025-06-16 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–385（385 aa）
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未记录 | PTD PENTANEDIAL × 16 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9RMC Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1 提交 2025-06-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–385（385 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 9RN1 Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 提交 2025-06-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric（22） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–385（385 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.90 Å |
| 9RN2 Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 提交 2025-06-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric（21） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–385（385 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |