当前蛋白身份:Q15006 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6WW7 Structure of the human ER membrane protein complex in a lipid nanodisc 提交 2020-05-08 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 B 1–297(297 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6Y4L Crystal structure of human ER membrane protein complex subunits EMC2 and EMC9 提交 2020-02-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 11–274(264 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PE4 2-{2-[2-(2-{2-[2-(2-ETHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;293.15 K;34% PEG4000, 0.1 M Tris pH 8.3, and 0.2 M lithium sulfate (For I03 native dataset)
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.3;293.15 K;28% PEG4000, 0.1 M Tris pH 8.3, and 0.2 M lithium sulfate (For I23 S-SAD dataset)
分辨率 2.20 Å R-free 0.250
6Z3W Human ER membrane protein complex 提交 2020-05-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 B 1–297(297 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
7ADO Cryo-EM structure of human ER membrane protein complex in lipid nanodiscs 提交 2020-09-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 B 1–297(297 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6;10 mM ammonium citrate pH 6.0, 100 mM sodium chloride, 0.25 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
7ADP Cryo-EM structure of human ER membrane protein complex in GDN detergent 提交 2020-09-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 B 1–297(297 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6;10 mM ammonium citrate pH 6.0, 100 mM sodium chloride, 0.25 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8EOI Structure of a human EMC:human Cav1.2 channel complex in GDN detergent 提交 2022-10-03 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致
链 B 3–293(291 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8J0N cryo-EM structure of human EMC 提交 2023-04-11 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 B 1–297(297 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.47 Å
8J0O cryo-EM structure of human EMC and VDAC 提交 2023-04-11 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 B 1–297(297 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
8S9S Structure of the human ER membrane protein complex (EMC) in GDN 提交 2023-03-30 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 2 1–297(297 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PCW 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9C7V Structure of the human BOS:human EMC complex in GDN 提交 2024-06-11 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 2 1–297(297 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
9ZZ6 The ER membrane protein complex acts as a chaperone to promote voltage-gated calcium channel assembly 提交 2026-01-06 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致
链 B 1–297(297 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;pH 7.5 adjusted with KOH ( potassium hydroxide).
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å