当前蛋白身份:Q15388 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
4APO AIP TPR domain in complex with human Tomm20 peptide 提交 2012-04-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 E 140–145(6 aa) 片段:RESIDUES 140-145
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 PEG 3350, AMMONIUM SULFATE, BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.234
4APO AIP TPR domain in complex with human Tomm20 peptide 提交 2012-04-04 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 140–145(6 aa) 片段:RESIDUES 140-145
未记录 12P DODECAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 PEG 3350, AMMONIUM SULFATE, BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.234
7VC9 Tom20 subunits 提交 2021-09-02 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 M 1–145(145 aa)
链 N 1–145(145 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 13.00 Å
8UY3 Fem1B with FNIP1 and Tom20 fragment 提交 2023-11-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 J 62–127(66 aa) 片段:residues 62-127
未记录 ZN ZINC ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;10 mg/mL protein complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 500 mM NaCl, 1 mM TCEP were mixed in a 2:1 ratio with the reservoir solution containing 30% PEG 3350, 0.2M Ammonium Citrate pH 7
分辨率 3.20 Å R-free 0.264
8UY3 Fem1B with FNIP1 and Tom20 fragment 提交 2023-11-12 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 K 62–127(66 aa) 片段:residues 62-127
未记录 ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;10 mg/mL protein complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 500 mM NaCl, 1 mM TCEP were mixed in a 2:1 ratio with the reservoir solution containing 30% PEG 3350, 0.2M Ammonium Citrate pH 7
分辨率 3.20 Å R-free 0.264
8UY3 Fem1B with FNIP1 and Tom20 fragment 提交 2023-11-12 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 M 62–127(66 aa) 片段:residues 62-127
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;10 mg/mL protein complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 500 mM NaCl, 1 mM TCEP were mixed in a 2:1 ratio with the reservoir solution containing 30% PEG 3350, 0.2M Ammonium Citrate pH 7
分辨率 3.20 Å R-free 0.264
8XVA Human TOM complex with whole Tom20 提交 2024-01-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:11-meric(11) 与蛋白数一致
链 K 1–145(145 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.92 Å
9EIH Import stalled PINK1 TOM complex 提交 2024-11-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白数一致
链 C 1–145(145 aa)
链 D 1–145(145 aa)
未记录 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 17 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9EII Import stalled PINK1 TOM complex, symmetry expanded 提交 2024-11-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:13-meric(13) 与蛋白数一致
链 D 1–145(145 aa)
未记录 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot force 10 for 2 s.
分辨率 2.75 Å
9EIJ Import stalled PINK1 TOM complex, extended TOM20 helix class 提交 2024-11-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:15-meric(15) 与蛋白数一致
链 D 1–145(145 aa)
未记录 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot force 10 for 2 s.
分辨率 3.30 Å
9J79 Cryo-EM structure of CRL2-FEM1B bound with TOM20(tetramer) 提交 2024-08-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:19-meric(19) 与蛋白数一致
链 B 25–145(121 aa)
链 C 25–145(121 aa)
链 G 25–145(121 aa)
链 S 25–145(121 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
9J7A local refinement of FEM1B bound with TOM20 (dimer) 提交 2024-08-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 B 25–145(121 aa)
链 C 25–145(121 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
9J7B local refinement of FEM1B bound with TOM20(tetramer) 提交 2024-08-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:11-meric(11) 与蛋白数一致
链 B 25–145(121 aa)
链 C 25–145(121 aa)
链 G 25–145(121 aa)
链 Q 25–145(121 aa)
链 S 25–145(121 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.12 Å
9JCE local refinement of FEM1B bound with TOM20 提交 2024-08-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 25–145(121 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å