当前蛋白身份：Q8R035
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1J26 Solution structure of a putative peptidyl-tRNA hydrolase domain in a mouse hypothetical protein 提交 2002-12-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
63–161（99 aa）
片段：peptidyl-tRNA hydrolase domain
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.7mM peptidyl-tRNA hydrolase domain U-15N, 13C; 20mM phosphate buffer NA; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 9E9C Mouse mitoribosome large subunit assembly intermediate bound to NSUN4, METRF4, GTPBP7, GTPBP10 and the MALSU1-L0R8F8-mt-ACP complex (without uL16m), State B1 (SAMC knock-out) 提交 2024-11-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–206（206 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 95 ZN ZINC ION × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.62 Å |
| 9HCC Mouse mitoribosome large subunit assembly intermediate (without uL16m) bound to MRM3-dimer, DDX28 and the MALSU-L0R8F8-mt-ACP complex, State A1 (SAMC knock-out) 提交 2024-11-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–206（206 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.67 Å |
| 9HCD Mouse mitoribosome large subunit assembly intermediate (with uL16m) bound to MRM3-dimer, DDX28 and the MALSU-L0R8F8-mt-ACP complex, state A2 (SAMC knock-out) 提交 2024-11-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–206（206 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.63 Å |
| 9HCE Mouse mitoribosome large subunit assembly intermediate (without uL16m) bound to MRM3 dimer and the MALSU-L0R8F8-mt-ACP complex, State A3 (SAMC knock out) 提交 2024-11-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–206（206 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.31 Å |
| 9HCF Mouse mitoribosome large subunit assembly intermediate bound to NSUN4, METRF4, GTPBP7, GTPBP10 and the MALSU-L0R8F8-mtACP complex with uL16m, State B2 (SAMC knock-out) 提交 2024-11-08 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–206（206 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 99 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.85 Å |
| 9HCG Mouse mitoribosome large subunit assembly intermediate bound to NSUN4, METRF4, MRM2, GTPBP7 and MALSU1-L0R8F8-mt-ACP complex, State D (SAMC knock-out) 提交 2024-11-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 57 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 p
38–190（153 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 105 ZN ZINC ION × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å |
| 9HCH Mouse mitoribosome large subunit assembly intermediate bound to NSUN4, METRF4, GTPBP7 and the MALSU1-L0R8F8-mt-ACP complex, State C1 (SAMC knock-out) 提交 2024-11-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric（58） 与全部聚合物一致 |
链 p
1–206（206 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 99 ZN ZINC ION × 2 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.85 Å |