当前蛋白身份：Q9H165
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5VTB Crystal structure of RBBP4 bound to BCL11a peptide 提交 2017-05-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–16（15 aa）
片段：UNP residues 2-16
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG2000 MME, 0.1 M potassium thiocyanate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.244 |
| 6KI6 Crystal structure of BCL11A in complex with gamma-globin -115 HPFH region 提交 2019-07-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
731–835（105 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M calcium acetate hydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate (pH6.5), 18% w/v polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.251 |
| 6KI6 Crystal structure of BCL11A in complex with gamma-globin -115 HPFH region 提交 2019-07-17 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 B
731–835（105 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M calcium acetate hydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate (pH6.5), 18% w/v polyethylene glycol 8,000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.251 |
| 6U9Q Crystal Structure Analysis of DNA-BCL11A Znf domain complex 提交 2019-09-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
730–835（106 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；NaMalate~8.0
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.195 |
| 8DTN The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6 提交 2022-07-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
797–826（30 aa）
链 D
797–826（30 aa）
链 F
797–826（30 aa）
链 H
797–826（30 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.232 |
| 8DTN The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6 提交 2022-07-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
797–826（30 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.232 |
| 8DTN The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6 提交 2022-07-26 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
797–826（30 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.232 |
| 8DTN The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6 提交 2022-07-26 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
797–826（30 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.232 |
| 8DTN The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6 提交 2022-07-26 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
797–826（30 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.232 |
| 8DTU The complex of nanobody 5344N74D with BCL11A ZF6. 提交 2022-07-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
799–826（28 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.5-8.2, 2.2M Li2SO4.
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分辨率 2.45 Å R-free 0.288 |
| 8THO Solution structure of the zinc finger repeat domain of BCL11A (ZnF456) 提交 2023-07-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
737–835（99 aa）
片段：residues 737-835
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）163；压力 1
NMR样品组成
137 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 1 mM dithiothreitol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8TLO Crystal Structure Analysis of BCL11A in complex with DNA 提交 2023-07-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
730–835（106 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；30% PEG6K and 0.1M Na Citrate pH 5.0
|
分辨率 2.76 Å R-free 0.269 |
| 9B4P Tetramer Formation of the BCL11A ZF0 Domain 提交 2024-03-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
45–71（27 aa）
片段：ZF0 domain
链 C
45–71（27 aa）
片段：ZF0 domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7.3；291.15 K；0.2M potassium nitrate, 0.1M Tris-HCl pH 7.3, 20% PEG3350
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.294 |
| 9B4P Tetramer Formation of the BCL11A ZF0 Domain 提交 2024-03-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
45–71（27 aa）
片段：ZF0 domain
链 D
45–71（27 aa）
片段：ZF0 domain
链 E
45–71（27 aa）
片段：ZF0 domain
链 F
45–71（27 aa）
片段：ZF0 domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7.3；291.15 K；0.2M potassium nitrate, 0.1M Tris-HCl pH 7.3, 20% PEG3350
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.294 |
| 9B4P Tetramer Formation of the BCL11A ZF0 Domain 提交 2024-03-21 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
45–71（27 aa）
片段：ZF0 domain
链 H
45–71（27 aa）
片段：ZF0 domain
链 I
45–71（27 aa）
片段：ZF0 domain
链 J
45–71（27 aa）
片段：ZF0 domain
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7.3；291.15 K；0.2M potassium nitrate, 0.1M Tris-HCl pH 7.3, 20% PEG3350
|
分辨率 2.56 Å R-free 0.294 |
| 9BV0 NMR structure of the Z0 CCHC zinc-finger of transcription repressor Bcl11A 提交 2024-05-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
46–72（27 aa）
片段：B0 atypical C2HC zinc-finger domain, residues 46-72
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.6；压力 1
NMR测量条件
pH 5.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.6；压力 1
NMR样品组成
40 uM Bcl11A-Z0, 600 uM Zn2+, 90% H2O/10% D20 | 90% H2O/10% D20
NMR样品组成
40 uM Bcl11A-Z0, 600 uM Zn2+, 100% D20 | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9E6R BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGACCA 提交 2024-10-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
730–835（106 aa）
片段：Zinc finger domains 4-6
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；292 K；24 % v/v Ethanol, 0.1 M HEPES 7.8, 40 mM Magnesium chloride hexahydrate
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.238 |
| 9E6R BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGACCA 提交 2024-10-30 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
730–835（106 aa）
片段：Zinc finger domains 4-6
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；292 K；24 % v/v Ethanol, 0.1 M HEPES 7.8, 40 mM Magnesium chloride hexahydrate
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.238 |
| 9E6R BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGACCA 提交 2024-10-30 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 Y
730–835（106 aa）
片段：Zinc finger domains 4-6
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；292 K；24 % v/v Ethanol, 0.1 M HEPES 7.8, 40 mM Magnesium chloride hexahydrate
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.238 |
| 9E6S BCL11A ZF4-6 with K784T Mutation in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGACCA 提交 2024-10-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
730–835（106 aa）
片段：Zinc finger domains 4-6
链 D
730–835（106 aa）
片段：Zinc finger domains 4-6
|
突变：K784T 突变：K784T | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；292 K；18 % w/v PEG 3350, 17 % v/v PEG 400, 4.8 % v/v 2-Propanol, 0.1 M CAPSO 9.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.275 |
| 9E6T BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGCCCA 提交 2024-10-30 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
730–835（106 aa）
片段：Zinc finger domains 4-6
链 B
730–835（106 aa）
片段：Zinc finger domains 4-6
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；15 % w/v PEG 1000, 30 % v/v PEG 300, 0.1 M Bis-Tris Propane 7.0
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.281 |
| 9YLL BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGTCCA (20-mer) 提交 2025-10-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
730–835（106 aa）
片段：Zinc finger domains 4-6
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；292 K；20% w/v Polyethylene glycol 3,350
0.2M sodium chloride
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.247 |
| 9YLM BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGTCCA (12-mer) 提交 2025-10-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
730–835（106 aa）
片段：Zinc finger domains 4-6
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；292 K；28 % w/v PEG 4000, 0.1 M Sodium citrate (pH 5.2), 0.2 M Ammonium acetate
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.244 |
| 9YLN BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGGCCA (12-mer) 提交 2025-10-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
730–835（106 aa）
片段：Zinc finger domains 4-6
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；292 K；28 % w/v PEG 4000, 0.1 M Sodium citrate (pH 5.2), 0.2 M Ammonium acetate
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.247 |
| 9YLO BCL11A ZF2-3 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGTCCA (P21212 crystal form) 提交 2025-10-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
373–433（61 aa）
片段：C2H2 zinc finger domains 2 and 3
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；10% w/v PEG 20 000, 20% v/v PEG MME 500, 60mM sodium fluoride, 60mM sodium bromide, 60mM sodium iodide, 0.1M Bicine- TRIS-base (pH 8.5)
|
分辨率 1.97 Å R-free 0.241 |
| 9YLP BCL11A ZF2-3 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGTCCA (C2221 Crystal Form) 提交 2025-10-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
373–433（61 aa）
片段：C2H2 zinc finger domains 2 and 3
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；278 K；28 % w/v PEG 4000,
0.1 M Sodium citrate (pH 6.5), 0.1 M Magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M Ammonium sulfate
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.245 |