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1cee

SOLUTION STRUCTURE OF CDC42 IN COMPLEX WITH THE GTPASE BINDING DOMAIN OF WASP

Method: SOLUTION NMR Dmax: 49.2 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GTP-BINDING RHO-LIKE PROTEIN

Homo sapiens

UniProt P60953

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–179 片段：CDC42 WISKOTT-ALDRICH SYNDROME PROTEIN WASP × 1 （P42768） MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM；压力 1 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 1CEE Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1A4R G12V MUTANT OF HUMAN PLACENTAL CDC42 GTPASE IN THE GDP FORM 提交 1998-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–191（191 aa）
链 B 1–191（191 aa）
突变：YES 突变：YES MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GNH AMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.60
分辨率 2.50 Å R-free 0.280
1AJE CDC42 FROM HUMAN, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-05-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–187（187 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5；298 K
分辨率未提供
1AM4 COMPLEX BETWEEN CDC42HS.GMPPNP AND P50 RHOGAP (H. SAPIENS) 提交 1997-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–177（176 aa）
突变：M501P MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.9；pH 5.9
分辨率 2.70 Å R-free 0.280
1AM4 COMPLEX BETWEEN CDC42HS.GMPPNP AND P50 RHOGAP (H. SAPIENS) 提交 1997-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 2–177（176 aa）
突变：M501P MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.9；pH 5.9
分辨率 2.70 Å R-free 0.280
1AM4 COMPLEX BETWEEN CDC42HS.GMPPNP AND P50 RHOGAP (H. SAPIENS) 提交 1997-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2–177（176 aa）
突变：M501P MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.9；pH 5.9
分辨率 2.70 Å R-free 0.280
1AN0 CDC42HS-GDP COMPLEX 提交 1997-06-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–190（189 aa）
链 B 2–190（189 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.8；pH 4.8
分辨率 2.80 Å R-free 0.344
1CF4 CDC42/ACK GTPASE-BINDING DOMAIN COMPLEX 提交 1999-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–191（191 aa）
突变：Q61L MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5；298 K
NMR样品组成 [50%2H; 100%15N,13C]-labelled Cdc42, unlabelled f-ACK, 90% H2O/10% | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 [U-15N] f-ACK, Cdc42, 90% H2O/10% | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 [U-13C; U-15N] f-ACK, Cdc42, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 [U-13C; U-15N] Cdc42, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 [U-100% 15N] Cdc42, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
1DOA Structure of the rho family gtp-binding protein cdc42 in complex with the multifunctional regulator rhogdi 提交 1999-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–188（188 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GER GERAN-8-YL GERAN × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；15% PEG 4000, 100 mM Glutamic Acid, 25 mM MgSO4, 50 mM Tris, 2 mM NaN3, 2 mM LDAO , pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.320
1DOA Structure of the rho family gtp-binding protein cdc42 in complex with the multifunctional regulator rhogdi 提交 1999-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–188（188 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 GER GERAN-8-YL GERAN × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；15% PEG 4000, 100 mM Glutamic Acid, 25 mM MgSO4, 50 mM Tris, 2 mM NaN3, 2 mM LDAO , pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.320
1E0A Cdc42 complexed with the GTPase binding domain of p21 activated kinase 提交 2000-03-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa） 片段：1-184
突变：YES GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）5 MM NA2HPO4, 25MM NACL；压力 1
NMR样品组成 90% WATER, 10% D2O
分辨率未提供
1EES SOLUTION STRUCTURE OF CDC42HS COMPLEXED WITH A PEPTIDE DERIVED FROM P-21 ACTIVATED KINASE, NMR, 20 STRUCTURES 提交 2000-02-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–178（178 aa） 片段：AMINO ACIDS 1-178
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）64 mM；压力 ambient
NMR样品组成 0.8 mM U-15N,13C Cdc42Hs, 0.8 mM PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8 mM U-15N Cdc42Hs, 0.8 mM PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8 mM Cdc42Hs, 0.8 mM U-15N,13C PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8 mM Cdc42Hs, 0.8 mM U-15N PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8 mM 70%-2H,U-15N,13C Cdc42Hs, 0.8 mM PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8 mM U-2H,15N Cdc42Hs, 0.8 mM PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8 mM U-15N,13C Cdc42Hs, 0.8 mM PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 | 100% D2O
NMR样品组成 0.8 mM Cdc42Hs, 0.8 mM U-15N,13C PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 | 100% D2O
分辨率未提供
1GRN CRYSTAL STRUCTURE OF THE CDC42/CDC42GAP/ALF3 COMPLEX. 提交 1998-07-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–191（191 aa） 片段：CDC42
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.259
1KI1 Guanine Nucleotide Exchange Region of Intersectin in Complex with Cdc42 提交 2001-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–188（188 aa） 片段：residues 1-188
突变：C188S SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 4000, ammonium sulfate, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
1KI1 Guanine Nucleotide Exchange Region of Intersectin in Complex with Cdc42 提交 2001-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–188（188 aa） 片段：residues 1-188
突变：C188S SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 4000, ammonium sulfate, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.247
1KZ7 Crystal Structure of the DH/PH Fragment of Murine Dbs in Complex with the Placental Isoform of Human Cdc42 提交 2002-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–188（188 aa） 片段：residues 1-188
突变：C188S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；PEG 8000, sodium formate, Tris HCL, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.40 Å R-free 0.239
1KZ7 Crystal Structure of the DH/PH Fragment of Murine Dbs in Complex with the Placental Isoform of Human Cdc42 提交 2002-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–188（188 aa） 片段：residues 1-188
突变：C188S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；PEG 8000, sodium formate, Tris HCL, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.40 Å R-free 0.239
1KZG DbsCdc42(Y889F) 提交 2002-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–188（188 aa） 片段：residues 1-188
突变：C188S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；PEG 8000,Tris HCL, NaFormate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.259
1KZG DbsCdc42(Y889F) 提交 2002-02-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–188（188 aa） 片段：residues 1-188
突变：C188S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；PEG 8000,Tris HCL, NaFormate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.259
1NF3 Structure of Cdc42 in a complex with the GTPase-binding domain of the cell polarity protein, Par6 提交 2002-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–181（180 aa）
突变：Q61L MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；24% PEG 4000, 100mM sodium citrate, 0.2M ammonium acetate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.273
1NF3 Structure of Cdc42 in a complex with the GTPase-binding domain of the cell polarity protein, Par6 提交 2002-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–181（180 aa）
突变：Q61L MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；24% PEG 4000, 100mM sodium citrate, 0.2M ammonium acetate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.273
1NF3 Structure of Cdc42 in a complex with the GTPase-binding domain of the cell polarity protein, Par6 提交 2002-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–181（180 aa）
链 B 2–181（180 aa）
突变：Q61L 突变：Q61L MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；24% PEG 4000, 100mM sodium citrate, 0.2M ammonium acetate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.273
2ASE NMR structure of the F28L mutant of Cdc42Hs 提交 2005-08-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–178（178 aa）
突变：F28L 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）30 mM；压力 ambient
NMR样品组成 U-15N Cdc42Hs, 25 mM phosphate buffer, 5 mM MgCl2, pH 5.5, 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 U-15N Cdc42Hs, 25 mM phosphate buffer, 5 mM MgCl2, pH 5.5, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 Cdc42Hs, 25 mM phosphate buffer, 5 mM MgCl2, pH 5.5, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2DFK Crystal structure of the CDC42-Collybistin II complex 提交 2006-03-02 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–191（191 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；PEG 8000, Potassium dihydrogen phosphate, NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K, pH 8.00
分辨率 2.15 Å R-free 0.229
2DFK Crystal structure of the CDC42-Collybistin II complex 提交 2006-03-02 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–191（191 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；PEG 8000, Potassium dihydrogen phosphate, NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K, pH 8.00
分辨率 2.15 Å R-free 0.229
2DFK Crystal structure of the CDC42-Collybistin II complex 提交 2006-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–191（191 aa）
链 D 1–191（191 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；PEG 8000, Potassium dihydrogen phosphate, NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K, pH 8.00
分辨率 2.15 Å R-free 0.229
2KB0 Cdc42(T35A) 提交 2008-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–178（178 aa）
突变：T35A 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 0.4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Cdc42(T35A), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2NGR TRANSITION STATE COMPLEX FOR GTP HYDROLYSIS BY CDC42: COMPARISONS OF THE HIGH RESOLUTION STRUCTURES FOR CDC42 BOUND TO THE ACTIVE AND CATALYTICALLY COMPROMISED FORMS OF THE CDC42-GAP. 提交 1998-07-31 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–191（191 aa） 片段：FULL-LENGTH CDC42 IN COMPLEX WITH A C-TERMINAL ACTIVE DOMAIN OF CDC42GAP(R305A) MUTANT.
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 1.90 Å R-free 0.293
2ODB The crystal structure of human cdc42 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 6 (PAK6) 提交 2006-12-22 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–181（181 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M acetate, 2M (NH4)2SO4, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.232
2ODB The crystal structure of human cdc42 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 6 (PAK6) 提交 2006-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–181（181 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M acetate, 2M (NH4)2SO4, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.232
2ODB The crystal structure of human cdc42 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 6 (PAK6) 提交 2006-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–181（181 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M acetate, 2M (NH4)2SO4, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.232
2ODB The crystal structure of human cdc42 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 6 (PAK6) 提交 2006-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–181（181 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M acetate, 2M (NH4)2SO4, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.232
2QRZ Cdc42 bound to GMP-PCP: Induced Fit by Effector is Required 提交 2007-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–189（189 aa）
链 B 1–189（189 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；12% PEG 6K, 100 mM Na Acetate, 50 mM MES, pH 6.0, 100 mM Ammonium Sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.40 Å R-free 0.263
2WM9 Structure of the complex between DOCK9 and Cdc42. 提交 2009-06-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–188（188 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 6 MG/ML. CRYSTALS WERE GROWN USING HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION. 1 UL OF COMPLEX WITH 200 MM NDSB-201 ADDED TO PROTEIN PRIOR TO CRYSTALLIZATION WAS MIXED WITH EQUAL VOLUME OF CRYSTALLIZATION BUFFER: 14% (W/V) PEG3350,100 MM MES (PH 6.0), 200 MM AMMONIUM ACETATE, 12% GLYCEROL. CRYSTALS WERE GROWN AT 20C.
分辨率 2.20 Å R-free 0.251
2WMN Structure of the complex between DOCK9 and Cdc42-GDP. 提交 2009-07-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–188（188 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.39 Å R-free 0.276
2WMO Structure of the complex between DOCK9 and Cdc42. 提交 2009-07-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–188（188 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.20 Å R-free 0.272
3GCG crystal structure of MAP and CDC42 complex 提交 2009-02-22 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–178（177 aa） 片段：UNP residues 2-178
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Hepes pH 7.5, 10% PEG 6000, 5% MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.277
3QBV Structure of designed orthogonal interaction between CDC42 and nucleotide exchange domains of intersectin 提交 2011-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–178（178 aa） 片段：UNP Residues 1-178
突变：F56R GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；100mm TRIS pH 7.5, 25% PEG 3350, 150mm ammonium sulfate, and 1mM DTT, temperature 295k, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.65 Å R-free 0.284
3QBV Structure of designed orthogonal interaction between CDC42 and nucleotide exchange domains of intersectin 提交 2011-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–178（178 aa） 片段：UNP Residues 1-178
突变：F56R GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；100mm TRIS pH 7.5, 25% PEG 3350, 150mm ammonium sulfate, and 1mM DTT, temperature 295k, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.65 Å R-free 0.284
3VHL Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK8 in complex with Cdc42 (T17N mutant) 提交 2011-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–188（188 aa）
突变：T17N, C188S PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.2M Potassium phosphate, 20% PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.08 Å R-free 0.232
4DID Crystal structure of Salmonella effector N-terminal domain SopB in complex with Cdc42 提交 2012-01-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–183（183 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；277 K；0.2M sodium chloride, 0.1M phosphate-citrate pH 4.2, 20% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.35 Å R-free 0.237
4ITR Crystal Structure of IbpAFic2-H3717A in complex with adenylylated Cdc42 提交 2013-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–191（191 aa）
链 D 1–191（191 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3350, Bis-Tris, (NH4)2SO4, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
4JS0 Complex of Cdc42 with the CRIB-PR domain of IRSp53 提交 2013-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–178（178 aa）
突变：G12V GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PE4 2-{2-[2-(2-{2-[2-(2-ETHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；18-20% PEG 4000, 0.2M magnesium chloride, 0.004M betain hydrochloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.199
4YC7 Crystal structure of human FMNL2 GBD-FH3 Domains bound to Cdc42-GppNHp 提交 2015-02-19 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–179（179 aa） 片段：UNP residues 1-179
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；20 mM Tris/HCl (pH 8.0), 14% (v/v) PEG 3350, 0.25 M magnesium acetate
分辨率 2.50 Å R-free 0.253
4YDH The structure of human FMNL1 N-terminal domains bound to Cdc42 提交 2015-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–179（179 aa）
链 D 1–179（179 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；17% (v/v) PEG 3350, 0.16 M tri-ammonium citrate
分辨率 3.80 Å R-free 0.281
5FI1 Crystal Structure of the P-Rex1 DH/PH tandem in complex with Cdc42 提交 2015-12-22 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–191（191 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；Ammonium citrate, PEG 3350
分辨率 3.20 Å R-free 0.198
5HZK Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain in complex with Cdc42 提交 2016-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–188（188 aa）
突变：C188S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；0.1 M MES, 20% (w/v) PEG 6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.257
5HZK Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain in complex with Cdc42 提交 2016-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–188（188 aa）
突变：C188S GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；0.1 M MES, 20% (w/v) PEG 6000
分辨率 3.30 Å R-free 0.257
5UPK CDC42 binds PAK4 via an extended GTPase-effector interface - 3 peptide: PAK4cat, PAK4-N45, CDC42 提交 2017-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1–177（177 aa）
突变：Q61L ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 22% PEG1,000
分辨率 2.40 Å R-free 0.264
5UPL CDC42 binds PAK4 via an extended GTPase-effector inteface - 2 peptide: PAK4FL, CDC42 - UNREFINED 提交 2017-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–177（177 aa） 片段：UNP residues 1-177
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；0.1M Tris-HCl pH 8.5, 50mM Na2SO4, 6% PEG6000
分辨率 3.00 Å R-free 0.310
6AJ4 Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK7 in complex with Cdc42 提交 2018-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–188（188 aa）
突变：C188S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350 and tri-potassium citrate monohydrate
分辨率 3.26 Å R-free 0.259
6AJ4 Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK7 in complex with Cdc42 提交 2018-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–188（188 aa）
突变：C188S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350 and tri-potassium citrate monohydrate
分辨率 3.26 Å R-free 0.259
6AJ4 Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK7 in complex with Cdc42 提交 2018-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–188（188 aa）
突变：C188S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350 and tri-potassium citrate monohydrate
分辨率 3.26 Å R-free 0.259
6AJ4 Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK7 in complex with Cdc42 提交 2018-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1–188（188 aa）
突变：C188S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350 and tri-potassium citrate monohydrate
分辨率 3.26 Å R-free 0.259
6AJL DOCK7 mutant I1836Y complexed with Cdc42 提交 2018-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–188（188 aa）
突变：C188S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, tri-potassium citrate monohydrate
分辨率 3.23 Å R-free 0.259
6AJL DOCK7 mutant I1836Y complexed with Cdc42 提交 2018-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–188（188 aa）
突变：C188S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, tri-potassium citrate monohydrate
分辨率 3.23 Å R-free 0.259
6AJL DOCK7 mutant I1836Y complexed with Cdc42 提交 2018-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–188（188 aa）
突变：C188S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, tri-potassium citrate monohydrate
分辨率 3.23 Å R-free 0.259
6AJL DOCK7 mutant I1836Y complexed with Cdc42 提交 2018-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1–188（188 aa）
突变：C188S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, tri-potassium citrate monohydrate
分辨率 3.23 Å R-free 0.259
6SIU Crystal structure of IbpAFic2 covalently tethered to Cdc42 提交 2019-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–191（191 aa）
链 D 1–191（191 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 10 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 2 LJN [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[4-(acetamidomethyl)-1,2,3-triazol-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；1.6 M ammonium sulfate and 0.1 M citric acid
分辨率 2.49 Å R-free 0.239
6SUP Crystal Structure of TcdB2-TccC3-Cdc42 提交 2019-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 167–179（13 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293.15 K；0.1 M sodium chloride, 0.1 M magnesium chloride, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.5, 12 % PEG 4000 Seeding: 0.1 M magnesium chloride, 0.1 M tri-sodium acetate pH 4.6, 12 % PEG 6000
分辨率 2.00 Å R-free 0.320
6TKY Crystal structure of the DHR2 domain of DOCK10 in complex with CDC42 提交 2019-11-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–188（188 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 200 mM potassium acetate, 8% (v/v) 1,1,1,3,3,3-Hexafluoro-2-propanol.
分辨率 2.55 Å R-free 0.246
6TKY Crystal structure of the DHR2 domain of DOCK10 in complex with CDC42 提交 2019-11-29 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–188（188 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 200 mM potassium acetate, 8% (v/v) 1,1,1,3,3,3-Hexafluoro-2-propanol.
分辨率 2.55 Å R-free 0.246
6TKZ Crystal structure of the DHR2 domain of DOCK10 in complex with CDC42 提交 2019-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：dimeric
链 C 1–188（188 aa）
链 D 1–188（188 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 200 mM potassium acetate, 8% (v/v) 1,1,1,3,3,3-Hexafluoro-2-propanol.
分辨率 2.64 Å R-free 0.274
6TKZ Crystal structure of the DHR2 domain of DOCK10 in complex with CDC42 提交 2019-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：dimeric
链 C 1–188（188 aa）
链 D 1–188（188 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 200 mM potassium acetate, 8% (v/v) 1,1,1,3,3,3-Hexafluoro-2-propanol.
分辨率 2.64 Å R-free 0.274
7S0Y Structures of TcdB in complex with Cdc42 提交 2021-08-31 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 4–179（176 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 11 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate (pH 6.6), 2.4 M ammonium sulfate, and 2.5% (v/v) Jeffamine M-600 (pH 7.0)
分辨率 2.79 Å R-free 0.259
8I5F Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK10 in complex with Cdc42 (T17N mutant) 提交 2023-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–188（188 aa）
链 D 1–188（188 aa）
突变：T17N, C188S 突变：T17N, C188S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 8000, sodium chloride
分辨率 2.80 Å R-free 0.296
9GRM Cdc42 in complex with inhibitory peptide 提交 2024-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–184（184 aa） 片段：1-184
突变：Q61L GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 1
NMR样品组成 0.48 mM [U-100% 15N] Cdc42, 0.58 mM None Peptide, 50 mM None sodium phosphate, 150 mM None sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.4 mM [U-13C; U-15N] Cdc42, 0.45 mM None Peptide, 50 mM None sodium phosphate, 150 mM None sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.415 mM [U-100% 15N] Peptide, 0.45 mM None Cdc42, 50 mM None sodium phosphate, 150 mM None sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
9VM2 Structure of DOCK6-Cdc42 complex protomer 提交 2025-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–187（187 aa）
突变：G15A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.94 Å
9VM3 Structure of DOCK6-Cdc42 complex 提交 2025-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–187（187 aa）
链 D 1–187（187 aa）
突变：G15A 突变：G15A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 4.52 Å

共 45 个其他 PDB 条目、68 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDC42_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–179； UniProt 1–179

WISKOTT-ALDRICH SYNDROME PROTEIN WASP

Homo sapiens

UniProt P42768

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 230–288 片段：GTPASE BINDING DOMAIN OF WASP GTP-BINDING RHO-LIKE PROTEIN × 1 （P60953） MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM；压力 1 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1CEE Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1EJ5 SOLUTION STRUCTURE OF THE AUTOINHIBITED CONFORMATION OF WASP 提交 2000-02-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 242–310（69 aa）
链 A 461–492（32 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）75mM；压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）75mM；压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）75mM；压力 ambient
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）75mM；压力 ambient
NMR样品组成 1.6 mM protein U-15N; 25 mM phosphate buffer pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM EDTA, 2 mM DTT | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.6 mM protein U-15N,13C; 25 mM phosphate buffer pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM EDTA, 2 mM DTT | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.6 mM protein U-15N, 10% 13C; 25 mM phosphate buffer pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM EDTA, 2 mM DTT | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.6 mM protein U-15N,13C; 25 mM phosphate buffer pH 6.5, 50 mM NaCl, 1 mM EDTA, 2 mM DTT | 100% D2O
分辨率未提供
1T84 Solution structure of the Wiskott-Aldrich Syndrome Protein (WASP) autoinhibited core domain complexed with (S)-wiskostatin, a small molecule inhibitor 提交 2004-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 242–310（69 aa） 片段：core autoinhibited domain (GTPase binding domain is covalently linked to the cofilin homology and acidic regions)
链 A 361–492（132 aa） 片段：core autoinhibited domain (GTPase binding domain is covalently linked to the cofilin homology and acidic regions)
未记录 WSK (2S)-1-(3,6-DIBROMO-9H-CARBAZOL-9-YL)-3-(DIMETHYLAMINO)PROPAN-2-OL × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM；压力 ambient
NMR样品组成 1mM WASP U-15N,13C; 1mM (S)-wiskostatin | 20 mM Acetate-d3 pH 5.0; 20mM NaCl; 1mM DTT-d10; 5% DMSO-d6; 90% H2O/10% D2O or 100% D2O
分辨率未提供
2K42 Solution Structure of the GTPase Binding Domain of WASP in Complex with EspFU, an EHEC Effector 提交 2008-05-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 242–310（69 aa） 片段：CRIB domain, UNP residues 242-310
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；298.15 K；压力 ambient
NMR样品组成 1~1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] GBD/R33 complex, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1~1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] GBD/R33 complex, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2OT0 Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle in complex with a C-terminal peptide of Wiskott-Aldrich syndrome protein 提交 2007-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 488–502（15 aa）
链 F 488–502（15 aa）
链 G 488–502（15 aa）
链 H 488–502（15 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；HEPES, MgCl2, PEG 550 MME, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.05 Å R-free 0.200

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 WASP_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–59； UniProt 230–288

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1cee

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1cee
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1cee
沉积日期 deposition_date1999-03-08
结构标题 titleSOLUTION STRUCTURE OF CDC42 IN COMPLEX WITH THE GTPASE BINDING DOMAIN OF WASP
关键词 keywordsCDC42 ACTIN REGULATOR GTPASE AND THE GTPASE BINDING DOMAIN OF ITS EFFECTOR WASP, Structural protein Regulation; Structural protein Regulation
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier18.92 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron18.57 Å
零角强度 I(0) i03926820000.00
分子量 molecular_weight535490.0 kDa
排除体积 excluded_volume670900 ų
包络体积 envelope_volume89200 ų
水化壳体积 shell_volume30452 ų
包络直径 envelope_diameter84.1 Å
壳层 Rg shell_rg32.06 Å
包络 Rg envelope_rg24.98 Å
形状 Rg shape_rg18.54 Å
总 Rg total_rg18.86 Å
总原子数 total_atoms75020
残基数 n_residues4760
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax49.2 Å
Rg (实空间) rg_real18.01 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.06 Å
I(0) (实空间) i0_real3.7450e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.2240e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal18.92 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal3927000000.0000
解质量估计 total_estimate0.6846
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary21.9 Å
偏度 Skewness skewness0.204
峰度 Kurtosis kurtosis-0.434
角度范围 angular_range— – 0.4200 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha2.3900
最高正则化参数 α highest_alpha3848000.0000
实空间数据点数 n_real_points73
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.001; Oscil: 0.986; Stabil: 0.984; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1ceea_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family familyc.37.1.8 — G proteins

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id1ceeA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id1ceeB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology810 — SerineThreonine-protein kinase PAK-alpha; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CRIB domain
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)