1cjk

COMPLEX OF GS-ALPHA WITH THE CATALYTIC DOMAINS OF MAMMALIAN ADENYLYL CYCLASE: COMPLEX WITH ADENOSINE 5'-(ALPHA THIO)-TRIPHOSPHATE (RP), MG, AND MN

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ADENYLATE CYCLASE, TYPE V

Canis lupus familiaris

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	ADENYLATE CYCLASE, TYPE II × 1 （P26769） GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(S) × 1 （P04896） MAGNESIUM ION × 2 MANGANESE (II) ION × 1 FORSKOLIN × 1 ADENOSINE-5'-RP-ALPHA-THIO-TRIPHOSPHATE × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 CHLORIDE ION × 1 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ADCY5_CANFA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–217； UniProt 364–580

ADENYLATE CYCLASE, TYPE II

Rattus norvegicus

UniProt P26769

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	ADENYLATE CYCLASE, TYPE V × 1 （P30803） GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(S) × 1 （P04896） MAGNESIUM ION × 2 MANGANESE (II) ION × 1 FORSKOLIN × 1 ADENOSINE-5'-RP-ALPHA-THIO-TRIPHOSPHATE × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 CHLORIDE ION × 1 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ADCY2_RAT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–212； UniProt 870–1081

GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(S)

Bos taurus

UniProt P04896

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	ADENYLATE CYCLASE, TYPE V × 1 （P30803） ADENYLATE CYCLASE, TYPE II × 1 （P26769） MAGNESIUM ION × 2 MANGANESE (II) ION × 1 FORSKOLIN × 1 ADENOSINE-5'-RP-ALPHA-THIO-TRIPHOSPHATE × 1 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 CHLORIDE ION × 1 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GNAS_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–394； UniProt 1–394

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1cjk
沉积日期 deposition_date	1999-04-16
结构标题 title	COMPLEX OF GS-ALPHA WITH THE CATALYTIC DOMAINS OF MAMMALIAN ADENYLYL CYCLASE: COMPLEX WITH ADENOSINE 5'-(ALPHA THIO)-TRIPHOSPHATE (RP), MG, AND MN
关键词 keywords	COMPLEX (LYASE-HYDROLASE), HYDROLASE, SIGNAL TRANSDUCING PROTEIN, CYCLASE, EFFECTOR ENZYME, LYASE-LYASE-SIGNALING PROTEIN COMPLEX; LYASE/LYASE/SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1cjk__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1cjk__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1cjk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	32.22 Å
Rg（电子密度）	31.56 Å
总 Rg	32.12 Å
原子数	5765
残基数	709
排除体积	102470 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1cjk__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ADENYLATE CYCLASE, TYPE V
分子量 formula_weight	24495.4 kDa
EC 编号 ec_number	4.6.1.1
突变 mutation	V476M
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	5799

MEMKADINAKQEDMMFHKIYIQKHDNVSILFADIEGFTSLASQCTAQELVMTLNELFARFDKLAAENHCLRIKILGDCYYCVSGLPEARADHAHCCVEMGMDMIEAISLVREMTGVNVNMRVGIHSGRVHCGVLGLRKWQFDVWSNDVTLANHMEAGGKAGRIHITKATLSYLNGDYEVEPGCGGERNAYLKEHSIETFLILRCTQKRKEEKAMIAK

来源 Source

来源生物 organism	Canis lupus familiaris
通用名 common_name	dog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9615
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ADENYLATE CYCLASE, TYPE II
分子量 formula_weight	23717.0 kDa
EC 编号 ec_number	4.6.1.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

RSLKNEELYHQSYDCVCVMFASIPDFKEFYTESDVNKEGLECLRLLNEIIADFDDLLSKPKFSGVEKIKTIGSTYMAATGLSAIPSQEHAQEPERQYMHIGTMVEFAYALVGKLDAINKHSFNDFKLRVGINHGPVIAGVIGAQKPQYDIWGNTVNVASRMDSTGVLDKIQVTEETSLILQTLGYTCTCRGIINVKGKGDLKTYFVNTEMSR

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(S)
分子量 formula_weight	46656.4 kDa
突变 mutation	N-TERMINAL HEXAHISTIDINE TAG
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MGCLGNSKTEDQRNEEKAQREANKKIEKQLQKDKQVYRATHRLLLLGAGESGKSTIVKQMRILHVNGFNGGEGGEEDPNAKSNSDGEKATKVQDIKNNLKEAIETIVAAMSNLVPPVELANPENQFRVDYILSVMNVPDFDFPPEFYEHAKALWEDEGVRACYERSNEYQLIDCAQYFLDKIDVIKQDDYVPSDQDLLRCRVLTSGIFETKFQVDKVNFHMFDVGGQRDERRKWIQCFNDVTAIIFVVASSSYNMVIREDNQTNRLQEALNLFKSIWNNRWLRTISVILFLNKQDLLAEKVLAGKSKIEDYFPEFARYTTPEDATPEPGEDPRVTRAKYFIRDEFLRISTASGDGRHYCYPHFTCAVDTENIRRVFNDCRDIIQRMHLRQYELLGGHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	cattle
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MANGANESE (II) ION
分子量 formula_weight	54.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	FORSKOLIN
分子量 formula_weight	410.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-RP-ALPHA-THIO-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	523.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	195.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE
分子量 formula_weight	539.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 11 Entity 11 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	34

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1cjka_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.29 — Nucleotide cyclase
家族 Family family	d.58.29.1 — Adenylyl and guanylyl cyclase catalytic domain

结构域编号 domain_id	d1cjkb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.29 — Nucleotide cyclase
家族 Family family	d.58.29.1 — Adenylyl and guanylyl cyclase catalytic domain

结构域编号 domain_id	d1cjkc1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.66 — Transducin (alpha subunit), insertion domain
超家族 Superfamily superfamily	a.66.1 — Transducin (alpha subunit), insertion domain
家族 Family family	a.66.1.1 — Transducin (alpha subunit), insertion domain

结构域编号 domain_id	d1cjkc2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1cjkA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1230 — Nucleotide cyclase, GGDEF domain

结构域编号 domain_id	1cjkB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1230 — Nucleotide cyclase, GGDEF domain

结构域编号 domain_id	1cjkC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1cjkC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	400 — GI Alpha 1, domain 2-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GI Alpha 1, domain 2-like

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晶胞边长 a length_a	118.900 Å
晶胞边长 b length_b	134.900 Å
晶胞边长 c length_c	72.200 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	15.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2200
R_free r_free	0.2660

COMPLEX OF GS-ALPHA WITH THE CATALYTIC DOMAINS OF MAMMALIAN ADENYLYL CYCLASE: COMPLEX WITH ADENOSINE 5'-(ALPHA THIO)-TRIPHOSPHATE (RP), MG, AND MN

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ADENYLATE CYCLASE, TYPE V

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ADENYLATE CYCLASE, TYPE II

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN G(S)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1cjk__assembly_1__model_1

1cjk__assembly_1__model_1 | I(q)

1cjk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 non-polymer

实体 11 Entity 11 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (2)