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1nf3

Structure of Cdc42 in a complex with the GTPase-binding domain of the cell polarity protein, Par6

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

G25K GTP-binding protein, placental isoform

Homo sapiens

UniProt P60953

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 PAR-6B × 1 （Q9JK83） MAGNESIUM ION × 1 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 PAR-6B × 1 （Q9JK83） MAGNESIUM ION × 1 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 water × 2 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 PAR-6B × 2 （Q9JK83） MAGNESIUM ION × 2 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1aje 2ase 2kb0

共 3 个 assembly

同源二聚体
1a4r 1an0 2qrz

共 3 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1am4 1am4 1am4 1cee 1cf4 1doa 1doa 1e0a 1ees 1grn 1ki1 1ki1

共 63 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDC42_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 6–195； UniProt 2–181 作者链 B； PDB构建体 6–195； UniProt 2–181

PAR-6B

Mus musculus

UniProt Q9JK83

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 G25K GTP-binding protein, placental isoform × 1 （P60953） MAGNESIUM ION × 1 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 G25K GTP-binding protein, placental isoform × 1 （P60953） MAGNESIUM ION × 1 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 water × 2 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 G25K GTP-binding protein, placental isoform × 2 （P60953） MAGNESIUM ION × 2 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1nf3 1nf3 1nf3

共 3 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PAR6B_MOUSE
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–128； UniProt 126–253 作者链 D； PDB构建体 1–128； UniProt 126–253

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1nf3
沉积日期 deposition_date2002-12-12
结构标题 titleStructure of Cdc42 in a complex with the GTPase-binding domain of the cell polarity protein, Par6
关键词 keywordssemi-CRIB motif, Switch I and II, PDZ domain, GTPase binding domain, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1nf3__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1nf3__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1nf3__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）22.10 Å
Rg（电子密度）21.28 Å
总 Rg22.20 Å
原子数2486
残基数317
排除体积44636 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1nf3__assembly_1__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1nf3__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 1nf3__assembly_3__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd1nf3a1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family familyc.37.1.8 — G proteins
结构域编号 domain_idd1nf3a2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd1nf3b1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamilyc.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family familyc.37.1.8 — G proteins
结构域编号 domain_idd1nf3b2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd1nf3c_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.36 — PDZ domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.36.1 — PDZ domain-like
家族 Family familyb.36.1.1 — PDZ domain
结构域编号 domain_idd1nf3d_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.36 — PDZ domain-like
超家族 Superfamily superfamilyb.36.1 — PDZ domain-like
家族 Family familyb.36.1.1 — PDZ domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1nf3A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id1nf3B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id1nf3C00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology42 — Pdz3 Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — PDZ domain
结构域编号 domain_id1nf3D00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology42 — Pdz3 Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — PDZ domain
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7. 引用文献 (6)