SAXSdb — 2mse

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apolipoprotein A-I

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	GTPase KRas × 1 （P01116） Serine/threonine-protein kinase A-Raf × 1 （P10398） 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	APOA1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–200； UniProt 68–265 作者链 C； PDB构建体 3–200； UniProt 68–265

GTPase KRas

Homo sapiens

UniProt P01116

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Apolipoprotein A-I × 2 （P02647） Serine/threonine-protein kinase A-Raf × 1 （P10398） 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RASK_HUMAN
Isoform	P01116-2
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–187； UniProt 1–185

Serine/threonine-protein kinase A-Raf

Homo sapiens

UniProt P10398

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Apolipoprotein A-I × 2 （P02647） GTPase KRas × 1 （P01116） 1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 64 O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 16 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MAGNESIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ARAF_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–73； UniProt 19–91

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	2mse
沉积日期 deposition_date	2014-07-29
结构标题 title	NMR data-driven model of GTPase KRas-GNP:ARafRBD complex tethered to a lipid-bilayer nanodisc
关键词 keywords	K-Ras, Nanodisc, PRE, Docking, A-RafRBD, LIPID BINDING PROTEIN; LIPID BINDING PROTEIN
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

2mse__assembly_1__model_8

Assembly 1 · Model 8 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

2mse__assembly_1__model_8 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

2mse__assembly_1__model_8 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	43.39 Å
Rg（电子密度）	38.53 Å
总 Rg	38.23 Å
原子数	9709
残基数	654
排除体积	192760 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`2mse__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	2	`2mse__assembly_1__model_2`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	3	`2mse__assembly_1__model_3`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	4	`2mse__assembly_1__model_4`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	5	`2mse__assembly_1__model_5`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	6	`2mse__assembly_1__model_6`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	7	`2mse__assembly_1__model_7`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	8	`2mse__assembly_1__model_8`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	9	`2mse__assembly_1__model_9`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
1	10	`2mse__assembly_1__model_10`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Apolipoprotein A-I
分子量 formula_weight	23234.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	97090

GPLKLLDNWDSVTSTFSKLREQLGPVTQEFWDNLEKETEGLRQEMSKDLEEVKAKVQPYLDDFQKKWQEEMELYRQKVEPLRAELQEGARQKLHELQEKLSPLGEEMRDRARAHVDALRTHLAPYSDELRQRLAARLEALKENGGARLAEYHAKATEHLSTLSEKAKPALEDLRQGLLPVLESFKVSFLSALEEYTKKLN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	GTPase KRas
分子量 formula_weight	21260.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

GSMTEYKLVVVGAGGVGKSALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRKQVVIDGETCLLDILDTAGQEEYSAMRDQYMRTGEGFLCVFAINNTKSFEDIHHYREQIKRVKDSEDVPMVLVGNKCDLPSRTVDTKQAQDLARSYGIPFIETSAKTRQGVDDAFYTLVREIRKHKEKMSKDGKKKKKKSKTKC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Serine/threonine-protein kinase A-Raf
分子量 formula_weight	8133.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

GTVKVYLPNKQRTVVTVRDGMSVYDSLDKALKVRGLNQDCCVVYRLIKGRKTVTAWDTAIAPLDGEELIVEVL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	1,2-DIOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
分子量 formula_weight	787.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	64

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	O-[(S)-({(2R)-2,3-bis[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl}oxy)(hydroxy)phosphoryl]-L-serine
分子量 formula_weight	788.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER
分子量 formula_weight	522.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	2mseB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	2mseD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1

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NMR data-driven model of GTPase KRas-GNP:ARafRBD complex tethered to a lipid-bilayer nanodisc

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apolipoprotein A-I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

GTPase KRas

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Serine/threonine-protein kinase A-Raf

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

2mse__assembly_1__model_8

2mse__assembly_1__model_8 | I(q)

2mse__assembly_1__model_8 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)