3esd

cut-2b; NCN-Pt-Pincer-Cutinase Hybrid

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 50.6 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cutinase 1

Fusarium solani f. pisi

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 17–230	突变：N172K	SXC bromo(4-{3-[(R)-ethoxy(4-nitrophenoxy)phosphoryl]propyl}-2,6-bis[(methylsulfanyl-kappaS)methyl]phenyl-kappaC~1~)palladium(2+) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；291 K；6%(w/v) PEG-3350, 30%(v/v) glycerol, 0.05M BisTrisP, 0.1M potassium thiocyanate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 1.22 Å R-free 0.222

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3ESD	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AGY The 1.15 angstrom refined structure of fusarium solani pisi cutinase 提交 1997-03-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–230（200 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 15 - 20% PEG 6000, 0.1 M HEPES, PH 7.0	分辨率 1.15 Å R-free 0.197
1CEX STRUCTURE OF CUTINASE 提交 1997-02-18	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.00 Å R-free 0.119
1CUA CUTINASE, N172K MUTANT 提交 1995-11-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：N172K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1CUB CUTINASE, N172K, R196D MUTANT, MONOCLINIC CRYSTAL FORM 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：N172K, R196E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 CRYSTAL FORMS OF THIS MUTANT. THE THREE FORMS ARE REFERRED TO AS N172K,R196E_I, N172K,R196E_II, N172K,R196E_III BY THE AUTHORS. FORM I CRYSTALLIZES IN THE SAME SPACE GROUP OF THE NATIVE ENZYME.	分辨率 1.75 Å
1CUC CUTINASE, N172K, R196D MUTANT, ORTHORHOMBIC CRYSTAL FORM 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：N172K, R196E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 CRYSTAL FORMS OF THIS MUTANT. THE THREE FORMS ARE REFERRED TO AS N172K,R196E_I, N172K,R196E_II, N172K,R196E_III BY THE AUTHORS.	分辨率 1.75 Å
1CUD CUTINASE, N172K, R196D MUTANT, MONOCLINIC CRYSTAL FORM WITH THREE MOLECULES PER ASYMMETRIC UNIT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 17–230（214 aa）	突变：N172K, R196E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1CUD CUTINASE, N172K, R196D MUTANT, MONOCLINIC CRYSTAL FORM WITH THREE MOLECULES PER ASYMMETRIC UNIT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：N172K, R196E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1CUD CUTINASE, N172K, R196D MUTANT, MONOCLINIC CRYSTAL FORM WITH THREE MOLECULES PER ASYMMETRIC UNIT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 17–230（214 aa）	突变：N172K, R196E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1CUE CUTINASE, Q121L MUTANT 提交 1995-11-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 33–229（197 aa）	突变：Q121L	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å
1CUF CUTINASE, R156L MUTANT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：R156L	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
1CUG CUTINASE, R17E, N172K MUTANT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：R17E, N172K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
1CUH CUTINASE, R196E MUTANT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：R196E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
1CUI CUTINASE, S120A MUTANT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：S120A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1CUJ CUTINASE, S120C MUTANT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：S120C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.60 Å
1CUS FUSARIUM SOLANI CUTINASE IS A LIPOLYTIC ENZYME WITH A CATALYTIC SERINE ACCESSIBLE TO SOLVENT 提交 1994-04-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–230（200 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.25 Å
1CUU CUTINASE, A199C MUTANT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：A199C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.69 Å
1CUV CUTINASE, A85F MUTANT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：A85F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.01 Å
1CUW CUTINASE, G82A, A85F, V184I, A185L, L189F MUTANT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：G82A, A85F, V184I, A185L, L189F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1CUW CUTINASE, G82A, A85F, V184I, A185L, L189F MUTANT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 17–230（214 aa）	突变：G82A, A85F, V184I, A185L, L189F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1CUX CUTINASE, L114Y MUTANT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：L114Y	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
1CUY CUTINASE, L189F MUTANT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：L189F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.69 Å
1CUZ CUTINASE, L81G, L182G MUTANT 提交 1995-11-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：L81G, L182G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å
1FFA CONTRIBUTION OF CUTINASE SERINE 42 SIDE CHAIN TO THE STABILIZATION OF THE OXYANION TRANSITION STATE 提交 1995-10-07	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：N84A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.69 Å
1FFB CONTRIBUTION OF CUTINASE SERINE 42 SIDE CHAIN TO THE STABILIZATION OF THE OXYANION TRANSITION STATE 提交 1995-10-07	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：N84D	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
1FFC CONTRIBUTION OF CUTINASE SERINE 42 SIDE CHAIN TO THE STABILIZATION OF THE OXYANION TRANSITION STATE 提交 1995-10-07	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：N84L	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
1FFD CONTRIBUTION OF CUTINASE SERINE 42 SIDE CHAIN TO THE STABILIZATION OF THE OXYANION TRANSITION STATE 提交 1995-10-07	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：N84W	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.69 Å
1FFE CONTRIBUTION OF CUTINASE SERINE 42 SIDE CHAIN TO THE STABILIZATION OF THE OXYANION TRANSITION STATE 提交 1995-10-07	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：S42A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.69 Å
1OXM STRUCTURE OF CUTINASE 提交 1996-10-26	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	未记录	TC4 BUTYL-PHOSPHINIC ACID 2,3-BIS-BUTYLCARBAMOYLOXY-PROPYL ESTER GROUP × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；PEG 6000 IN HEPES 0.1 M PH 7, pH 7.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.227
1OXM STRUCTURE OF CUTINASE 提交 1996-10-26	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 17–230（214 aa）	未记录	TC4 BUTYL-PHOSPHINIC ACID 2,3-BIS-BUTYLCARBAMOYLOXY-PROPYL ESTER GROUP × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；PEG 6000 IN HEPES 0.1 M PH 7, pH 7.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.227
1XZA FUSARIUM SOLANI CUTINASE MUTANT WITH SER 129 REPLACED BY CYS 提交 1995-11-17	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：S129C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.80 Å
1XZB FUSARIUM SOLANI CUTINASE MUTANT WITH SER 129 REPLACED BY CYS COMPLEX WITH MERCURY ACETATE 提交 1995-11-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：S129C	MAC MERCURY ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
1XZC FUSARIUM SOLANI CUTINASE MUTANT WITH SER 129 REPLACED BY CYS COMPLEX WITH PARA-SULFUROUSPHENYL MERCURY 提交 1995-11-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：S129C	PMB PARA-MERCURY-BENZENESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
1XZD FUSARIUM SOLANI CUTINASE MUTANT WITH SER 213 REPLACED BY CYS 提交 1995-11-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：S213C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å
1XZE FUSARIUM SOLANI CUTINASE MUTANT WITH SER 92 REPLACED BY CYS 提交 1995-11-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：S92C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
1XZF FUSARIUM SOLANI CUTINASE MUTANT WITH THR 144 REPLACED BY CYS 提交 1995-11-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：T144C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.69 Å
1XZG FUSARIUM SOLANI CUTINASE MUTANT WITH THR 45 REPLACED BY ALA 提交 1995-11-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：T45A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.69 Å
1XZH FUSARIUM SOLANI CUTINASE MUTANT WITH THR 80 REPLACED BY PRO 提交 1995-11-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：T80P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.69 Å
1XZI FUSARIUM SOLANI CUTINASE MUTANT WITH THR 119 REPLACED BY HIS 提交 1995-11-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：T119H	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.69 Å
1XZJ FUSARIUM SOLANI CUTINASE MUTANT WITH THR 38 REPLACED BY PHE 提交 1995-11-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：T38F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.69 Å
1XZK FUSARIUM SOLANI CUTINASE COMPLEX WITH DI(ISOPROPYL)PHOSPHATE 提交 1995-11-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	未记录	DFP DIISOPROPYL PHOSPHONATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.01 Å
1XZK FUSARIUM SOLANI CUTINASE COMPLEX WITH DI(ISOPROPYL)PHOSPHATE 提交 1995-11-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 17–230（214 aa）	未记录	DFP DIISOPROPYL PHOSPHONATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.01 Å
1XZL FUSARIUM SOLANI CUTINASE COMPLEX WITH N-HEXYLPHOSPHONATE ETHYL ESTER 提交 1995-11-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	未记录	HEE N-HEXYLPHOSPHONATE ETHYL ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.69 Å
1XZM FUSARIUM SOLANI CUTINASE COMPLEX WITH N-UNDECYL O-METHYL CHLORO PHOSPHONATE ESTER 提交 1995-11-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	未记录	DPE N-UNDECANYLPHOSPHONATE METHYL ESTER GROUP × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.75 Å
2CUT CUTINASE, A LIPOLYTIC ENZYME WITH A PREFORMED OXYANION HOLE 提交 1994-06-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–228（198 aa）	未记录	DEP DIETHYL PHOSPHONATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å
3EF3 cut-1a; NCN-Pt-Pincer-Cutinase Hybrid 提交 2008-09-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：N172K	NXC (2,6-bis[(dimethylamino-kappaN)methyl]-4-{3-[(S)-ethoxy(4-nitrophenoxy)phosphoryl]propyl}phenyl-kappaC~1~)(chloro)platinum(2+) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；291 K；20%(w/v) PEG-6000, 0.1M sodium acetate, 0.2M sodium chloride, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 1.50 Å R-free 0.178
3ESA cut-1b; NCN-Pt-Pincer-Cutinase Hybrid 提交 2008-10-05	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：N172K	NXC (2,6-bis[(dimethylamino-kappaN)methyl]-4-{3-[(S)-ethoxy(4-nitrophenoxy)phosphoryl]propyl}phenyl-kappaC~1~)(chloro)platinum(2+) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；291 K；22%(w/v) PEG-6000, 0.1M sodium acetate, 0.2M sodium chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.253
3ESA cut-1b; NCN-Pt-Pincer-Cutinase Hybrid 提交 2008-10-05	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 17–230（214 aa）	突变：N172K	NXC (2,6-bis[(dimethylamino-kappaN)methyl]-4-{3-[(S)-ethoxy(4-nitrophenoxy)phosphoryl]propyl}phenyl-kappaC~1~)(chloro)platinum(2+) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；291 K；22%(w/v) PEG-6000, 0.1M sodium acetate, 0.2M sodium chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.253
3ESB cut-1c; NCN-Pt-Pincer-Cutinase Hybrid 提交 2008-10-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：N172K	CL CHLORIDE ION × 2 NXC (2,6-bis[(dimethylamino-kappaN)methyl]-4-{3-[(S)-ethoxy(4-nitrophenoxy)phosphoryl]propyl}phenyl-kappaC~1~)(chloro)platinum(2+) × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；2%(w/v) PEG-1000, 0.1M 4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineethanesulfonic acid(Hepes), pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 2.30 Å R-free 0.247
3ESC cut-2a; NCN-Pt-Pincer-Cutinase Hybrid 提交 2008-10-05	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–230（214 aa）	突变：N172K	SXC bromo(4-{3-[(R)-ethoxy(4-nitrophenoxy)phosphoryl]propyl}-2,6-bis[(methylsulfanyl-kappaS)methyl]phenyl-kappaC~1~)palladium(2+) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；10%(w/v) PEG-3350, 25%(v/v) glycerol, 0.1M 2-(bis(2-hydroxyethyl)amino)-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol (BisTrisP), 0.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 1.20 Å R-free 0.194

共 43 个其他 PDB 条目、49 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CUTI1_FUSSO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–214； UniProt 17–230

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3esd
沉积日期 deposition_date	2008-10-05
结构标题 title	cut-2b; NCN-Pt-Pincer-Cutinase Hybrid
关键词 keywords	protein-metallopincer complex, Glycoprotein, Hydrolase, Secreted, Serine esterase; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	16.49 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	15.17 Å
零角强度 I(0) i0	8574610.00
分子量 molecular_weight	20853.0 kDa
排除体积 excluded_volume	25777 Å³
包络体积 envelope_volume	27481 Å³
水化壳体积 shell_volume	15053 Å³
包络直径 envelope_diameter	51.4 Å
壳层 Rg shell_rg	21.32 Å
包络 Rg envelope_rg	15.43 Å
形状 Rg shape_rg	15.07 Å
总 Rg total_rg	16.46 Å
总原子数 total_atoms	1452
残基数 n_residues	195
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	50.6 Å
Rg (实空间) rg_real	16.35 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.26 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.5750e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.4900e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	16.37 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	8575000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8110
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	22.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.113
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.358
角度范围 angular_range	— – 0.4850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	2471000.0000
实空间数据点数 n_real_points	79
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.855; Stabil: 0.998; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.981; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cutinase 1
分子量 formula_weight	22294.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.1.74
突变 mutation	N172K
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1525

LPTSNPAQELEARQLGRTTRDDLINGNSASCADVIFIYARGSTETGNLGTLGPSIASNLESAFGKDGVWIQGVGGAYRATLGDNALPRGTSSAAIREMLGLFQQANTKCPDATLIAGGYSQGAALAAASIEDLDSAIRDKIAGTVLFGYTKNLQNRGRIPNYPADRTKVFCKTGDLVCTGSLIVAAPHLAYGPDARGPAPEFLIEKVRAVRGSA

来源 Source

来源生物 organism	Fusarium solani f. pisi
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	70791
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	bromo(4-{3-[(R)-ethoxy(4-nitrophenoxy)phosphoryl]propyl}-2,6-bis[(methylsulfanyl-kappaS)methyl]phenyl-kappaC~1~)palladium(2+)
分子量 formula_weight	654.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	73

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d3esda_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.69 — alpha/beta-Hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.69.1 — alpha/beta-Hydrolases
家族 Family family	c.69.1.30 — Cutinase-like

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	3esdA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1820 — Alpha/Beta hydrolase fold, catalytic domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	72.360 Å
晶胞边长 b length_b	72.360 Å
晶胞边长 c length_c	110.770 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	9

空间群 space_group	H 3
空间群编号 int_tables_number	146
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.220 Å
最低分辨率 resolution_low	41.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1990
R_free r_free	0.2220

fit	/app/data/saxs_computation/es/3esd/3esd.fit
pddf	/app/data/pr_computation/es/3esd/3esd.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/es/3esd/3esd.dat