SAXSdb — 3kza

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-lactoglobulin

Equus caballus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	单体	蛋白 1	water × 1	与蛋白数一致
3	信息不足	单体	蛋白 1	water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LACB_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 17–27； UniProt 33–43 作者链 A； PDB构建体 42–49； UniProt 58–65 作者链 A； PDB构建体 52–62； UniProt 68–78 作者链 A； PDB构建体 66–73； UniProt 82–89 作者链 A； PDB构建体 80–86； UniProt 96–102 作者链 A； PDB构建体 89–95； UniProt 105–111 作者链 A； PDB构建体 102–108； UniProt 118–124 作者链 A； PDB构建体 117–124； UniProt 133–140 作者链 A； PDB构建体 130–138； UniProt 146–154 作者链 A； PDB构建体 145–153； UniProt 161–169 作者链 B； PDB构建体 17–27； UniProt 33–43 作者链 B； PDB构建体 42–49； UniProt 58–65 作者链 B； PDB构建体 52–62； UniProt 68–78 作者链 B； PDB构建体 66–73； UniProt 82–89 作者链 B； PDB构建体 80–86； UniProt 96–102 作者链 B； PDB构建体 89–95； UniProt 105–111 作者链 B； PDB构建体 102–108； UniProt 118–124 作者链 B； PDB构建体 117–124； UniProt 133–140 作者链 B； PDB构建体 130–138； UniProt 146–154 作者链 B； PDB构建体 145–153； UniProt 161–169

Beta-lactoglobulin

Equus caballus

UniProt P02758

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	单体	蛋白 1	water × 1	与蛋白数一致
3	信息不足	单体	蛋白 1	water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LACB1_HORSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–16； UniProt 19–34 作者链 A； PDB构建体 28–41； UniProt 46–59 作者链 A； PDB构建体 50–51； UniProt 68–69 作者链 A； PDB构建体 63–65； UniProt 81–83 作者链 A； PDB构建体 74–79； UniProt 92–97 作者链 A； PDB构建体 87–88； UniProt 105–106 作者链 A； PDB构建体 96–101； UniProt 114–119 作者链 A； PDB构建体 109–116； UniProt 127–134 作者链 A； PDB构建体 125–129； UniProt 143–147 作者链 A； PDB构建体 139–144； UniProt 156–161 作者链 A； PDB构建体 154–162； UniProt 172–180 作者链 B； PDB构建体 1–16； UniProt 19–34 作者链 B； PDB构建体 28–41； UniProt 46–59 作者链 B； PDB构建体 50–51； UniProt 68–69 作者链 B； PDB构建体 63–65； UniProt 81–83 作者链 B； PDB构建体 74–79； UniProt 92–97 作者链 B； PDB构建体 87–88； UniProt 105–106 作者链 B； PDB构建体 96–101； UniProt 114–119 作者链 B； PDB构建体 109–116； UniProt 127–134 作者链 B； PDB构建体 125–129； UniProt 143–147 作者链 B； PDB构建体 139–144； UniProt 156–161 作者链 B； PDB构建体 154–162； UniProt 172–180

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3kza
沉积日期 deposition_date	2009-12-08
结构标题 title	Crystal structure of Gyuba, a patched chimera of b-lactglobulin
关键词 keywords	artificial protein, chimera protein, Disulfide bond, Milk protein, Retinol-binding, Secreted, Transport, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3kza__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3kza__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3kza__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	15.71 Å
Rg（电子密度）	14.13 Å
总 Rg	15.38 Å
原子数	1168
残基数	149
排除体积	21001 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3kza__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3kza__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`3kza__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d3kzaa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.60 — Lipocalins
超家族 Superfamily superfamily	b.60.1 — Lipocalins
家族 Family family	b.60.1.1 — Retinol binding protein-like

结构域编号 domain_id	d3kzab_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.60 — Lipocalins
超家族 Superfamily superfamily	b.60.1 — Lipocalins
家族 Family family	b.60.1.1 — Retinol binding protein-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3kzaA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Calycin beta-barrel core domain

结构域编号 domain_id	3kzaB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Calycin beta-barrel core domain

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晶胞边长 a length_a	68.925 Å
晶胞边长 b length_b	68.925 Å
晶胞边长 c length_c	151.616 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 65
空间群编号 int_tables_number	170
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	59.660 Å
R 因子 r_factor	0.2372
R_work r_work	0.2346
R_free r_free	0.2849

描述 description	Beta-lactoglobulin
分子量 formula_weight	18310.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	2576

Crystal structure of Gyuba, a patched chimera of b-lactglobulin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-lactoglobulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Beta-lactoglobulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3kza__assembly_2__model_1

3kza__assembly_2__model_1 | I(q)

3kza__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Equus caballus
通用名 common_name	equine, bovine
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9796
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	240

Crystal structure of Gyuba, a patched chimera of b-lactglobulin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-lactoglobulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Beta-lactoglobulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3kza__assembly_2__model_1

3kza__assembly_2__model_1 | I(q)

3kza__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)