3lw5

Improved model of plant photosystem I

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P05311） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I-N subunit × 1 CHAIN R × 1 AT3g54890 × 1 Type II chlorophyll a/b binding protein from photosystem I × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） CHLOROPHYLL A × 174 PHYLLOQUINONE × 2 BETA-CAROTENE × 19 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 53 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAA_PEA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–738； UniProt 21–758

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

物种未注明

UniProt P05311

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P05310） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I-N subunit × 1 CHAIN R × 1 AT3g54890 × 1 Type II chlorophyll a/b binding protein from photosystem I × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） CHLOROPHYLL A × 174 PHYLLOQUINONE × 2 BETA-CAROTENE × 19 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 53 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAB_PEA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–733； UniProt 2–734

Photosystem I iron-sulfur center

物种未注明

UniProt P10793

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P05310） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P05311） Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I-N subunit × 1 CHAIN R × 1 AT3g54890 × 1 Type II chlorophyll a/b binding protein from photosystem I × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） CHLOROPHYLL A × 174 PHYLLOQUINONE × 2 BETA-CAROTENE × 19 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 53 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAC_PEA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Photosystem I reaction center subunit VIII

物种未注明

UniProt P17227

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P05310） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P05311） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit IX × 1 Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I-N subunit × 1 CHAIN R × 1 AT3g54890 × 1 Type II chlorophyll a/b binding protein from photosystem I × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） CHLOROPHYLL A × 174 PHYLLOQUINONE × 2 BETA-CAROTENE × 19 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 53 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSAI_PEA
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–30； UniProt 1–30

Type II chlorophyll a/b binding protein from photosystem I

物种未注明

UniProt Q41038

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P05310） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P05311） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I-N subunit × 1 CHAIN R × 1 AT3g54890 × 1 Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） CHLOROPHYLL A × 174 PHYLLOQUINONE × 2 BETA-CAROTENE × 19 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 53 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q41038_PEA
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–176； UniProt 94–269

Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q32904

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P05310） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P05311） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I-N subunit × 1 CHAIN R × 1 AT3g54890 × 1 Type II chlorophyll a/b binding protein from photosystem I × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic × 1 （Q9SQL2） CHLOROPHYLL A × 174 PHYLLOQUINONE × 2 BETA-CAROTENE × 19 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 53 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CB23_PEA
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–172； UniProt 84–255

Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q9SQL2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 18	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （P05310） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （P05311） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （P10793） Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （P17227） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 Photosystem I reaction center subunit X psaK × 1 Putative uncharacterized protein × 1 Photosystem I-N subunit × 1 CHAIN R × 1 AT3g54890 × 1 Type II chlorophyll a/b binding protein from photosystem I × 1 （Q41038） Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic × 1 （Q32904） CHLOROPHYLL A × 174 PHYLLOQUINONE × 2 BETA-CAROTENE × 19 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 53 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CB24_PEA
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 4； PDB构建体 1–166； UniProt 81–247

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3lw5
沉积日期 deposition_date	2010-02-23
结构标题 title	Improved model of plant photosystem I
关键词 keywords	;Photosynthesis, Electron transfer, Membrane proteins, Large, 2 Complexes, Chlorophyll, Chloroplast, Chromophore, Electron transport, Iron, Iron-sulfur, Magnesium, Membrane, Metal-binding, Photosystem I, Thylakoid, Transmembrane, Transport ;; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3lw5__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3lw5__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3lw5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	55.52 Å
Rg（电子密度）	55.15 Å
总 Rg	55.66 Å
原子数	36370
残基数	3182
排除体积	676130 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3lw5__assembly_1__model_1`	octadecameric （18）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (24)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
分子量 formula_weight	82022.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	36370

LVDRDPIKTSFEQWAKPGHFSRTIAKGPDTTTWIWNLHADAHDFDSHTSDLEEISRKVFSAHFGQLSIIFLWLSGMYFHGARFSNYEAWLNDPTHIGPSAQVVWPIVGQEILNGDVGGGFRGIQITSGFFQIWRASGITSELQLYCTAIGALVFAGLMLFAGWFHYHKAAPKLAWFQDVESMLNHHLAGLLGLGSLSWARHQVHVSLPINQFLNAGVDPKEIPLPHEFILNRDLLAQLYPSFAEGATPFFTLNWSKYADFLTFRGGLDPLTGGLWLTDIAHHHLAIAILFLIAGHMYRTNWGIGHGIKDILEAHKGPFTGQGHKGLYEILTTSWHAQLSINLAMLGSLTIVVAQHMYSMPPYPYLATDYATQLSLFTHHMWIGGFLIVGAAAHAAIFMVRDYDPTTRYNDLLDRVLRHRDAIISHLNWVCIFLGFHSFGLYIHNDTMSALGRPQDMFSDTAIQLQPVFAQWIQNTHALAPGTTAPGATASTSLTWGGGDLVAVGNKVALLPIPLGTADFLVHHIHAFTIHVTVLILLKGVLFARSSRLIPDKANLGFRFPCDGPGRGGTCQVSAWDHVFLGLFWMYNSISVVIFHFSWKMQSDVWGTINDQGVVTHITAGNFAQSSITINGWLRDFLWAQASQVIQSYGSSLSAYGLFFLGAHFVWAFSLMFLFSGRGYWQELIESIVWAHNKLKVAPATQPRALSIVQGRAVGVTHYLLGGIATTWAFFLARIIAVG

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2
分子量 formula_weight	82359.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

ALRIPRFSQGIAQDPTTRRIWFGIATAHDFESHDDITEGRLYQNIFASHFGQLAIIFLWTSGNLFHVAWQGNFEAWVQDPFHVRPIAHAIWDPHFGQPAVEAFTRGGALGPVNNAYSGVYQWWYTIGLRTNEDLYTGAIFLLFLSFISLLAGWLHLQPKWKPSVSWFKNAESRLNHHLSGLFGVSSLAWAGHLVHVAIPGSRGEYVRWNNFLDVLPYPQGLGPLLTGQWNLYAQNPSSSNHLFGTTQGAGTAILTILGGFHPQTQSLWLTDVAHHHLAIAFLFLIGGLMYRTNFGIGHSIKYILEAHIPPGGRLGRGHKGLYDTINNSIHFQLGLALASLGVITSLVAQHMYSLPAYAFIAQDFTTQAALYTHHQYIAGFIMTGAFAHGPIFFIRDYNPEQNADNVLARMLEHKEAIISHLSWASLFLGFHTLGLYVHNDVMLAFGTPEKQILIEPIFAQWIQSAHGKTTYGFDIPLSSTNGPALNAGRNIWLPGWLNAINENSNSLFLTIGPGDFLVHHAIALGLHTTTLILVKGALDARGSKLMPDKKDFGYSFPCDGPGRGGTCDISAWDDFYLAVFWMLNTIGWVTFYWHWKHITLWRGNVSQFNESSTYLMGWLRDYLWLNSSQLINGITPLVCNSLSVWAWMFLFGHLVWATGFMFLISWRGYWQELIETLAWAHERTPLANLIRWRDKPVALSIVQARLVGLVHFSVGYIFTYAAFLIASTSGKFG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem I iron-sulfur center
分子量 formula_weight	8991.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSHSVKIYDTCIGCTQCVRACPTDVLEMIPWGGCKAKQIASAPRTEDCVGCKRCESACPTDFLSVRVYLWHETTRSMGLAY

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Putative uncharacterized protein
分子量 formula_weight	15557.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

ELDPNTPSPIFGGSTGGLLRKAQVEEFYVITWDSPKEQIFEMPTGGAAIMREGPNLLKLARKEQCLALGTRLRSKYKIKYQFYRVFPNGEVQYLHPKDGVYPEKVNAGRQGVGQNFRSIGKNVSPIEVKFTGKQPYDL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Putative uncharacterized protein
分子量 formula_weight	7270.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

IGPKRGAKVKILRKESYWYKGTGSVVAVDQDPNTRYPVVVRFNKVNYANVSTNNYALDEIVEVE

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic
分子量 formula_weight	17299.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

DIAGLTPCKESKQFAKREKQALKKLQASLKLYADDSAPALAIKATMEKTKKRFDNYGKYGLLCGSDGLPHLIVSGDQRHWGEFITPGILFLYIAGWIGWVGRSYLIAIRDEKKPTQKEIIIDVPLASSLLFRGFSWPVAAYRELLNGELVDNNF

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Putative uncharacterized protein
分子量 formula_weight	10456.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

SALVISLSTGLSLFLGRFVFFNFQRENVAKQVPEQNGLTHFEAGDTRAKEYVSLLKSNDPVGFNIVDVLAWGSIGHVVAYYILATTSNGYDPAFF

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Putative uncharacterized protein
分子量 formula_weight	7314.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

DLEDLGNTTGQWDSYGSDAPSPYNPLQSKLFETFAAPFTKRGLLLKFLILGGGSTLAYLSATASGDILP

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit VIII
分子量 formula_weight	3270.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MINLPSLFVPLVGLLFPAVAMASLFLHVEK

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IX
分子量 formula_weight	4793.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MRDLKTYLSVAPVVSTLWFGALAGLLIEINRFFPDALIFPFF

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit X psaK
分子量 formula_weight	8462.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

DFIGSPTNLIMVTSTSLMLFAGRFGLAPSANRKATAGLKLEVRDSGLQTGDPAGFTLADTLACGVVGHIIGVGVVLGLKNIGAL

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Putative uncharacterized protein
分子量 formula_weight	17059.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

KPTYQVIQPINGDPFIGSLETPVTSSPLIAWYLSNLPAYRTAVSPLLRGIEVGLAHGYLLVGPFVKAGPLRNTEIAGQAGSLAAGGLVVILSLCLTIYGISSFNEGAPSTAPSLTLTGRKKEPDQLQTADGWAKFTGGFFFGGISGVIWAYFLLYVLDLPY

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Photosystem I-N subunit
分子量 formula_weight	9767.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

GVIEEYLEKSKTNKELNDKKRLATTGANFARAYTVEFGSCKFPENFTGCQDLAKQKKVPFLSDDLDLECEGKDKYKCGSNVFWKW

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	CHAIN R
分子量 formula_weight	4528.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	AT3g54890
分子量 formula_weight	18616.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1

SAPGDFGFDPLGLGEVPANLERYKESELIHCRWAMLAVPGILVPEALGYGNWVKAQEWAALPGGQATYLGNPVPWGTLPTILAIEFLAIAFVEHQRSMEKDPEKKKYPGGAFDPLGYSKDPKKLEELKVKEIKNGRLALLAFVGFCVQQSAYPGTGPLENLATHLADPWH

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Type II chlorophyll a/b binding protein from photosystem I
分子量 formula_weight	19528.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

SDPESLRWNVQAELVHSRWAMLGAAGIFIPEFLTKLGILNTPSWYTAGEQEYFTDTTTLFIVELVFIGWAEGRRWADILNPGCVNTDPIFPNNKLTGTDVGYPGGLWFDPLGWGSASPQKLKELRTKEIKNGRLAMLAVMGAWFQHIYTGTGPIDNLFAHLADPGHATIFAAFTPK

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic
分子量 formula_weight	18723.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

SDPEGTGGFIEPRWLAYGEVINGRFAMLGAVGAIAPEYLGKVGLIPQETALAWFQTGVIPPAGTYNYWADNYTLFVLEMALMGFAEHRRFQDWAKPGSMGKQYFLGLEKGFGGSGNPAYPGGPFFNPLGFGKDEKSLKELKLKEVKNGRLAMLAILGYFIQGLVTGVGPYQN

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic
分子量 formula_weight	18704.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

LAEDPENLRWFVQAELVNGRWAMLGVAGMLLPEVFTSIGIINVPKWYAAGKEEYFASSSTLFVIEFILSHYVEIRRWQDIKNPGSVNQDPIFKQYSLPAGEVGYPGGIFNPLNFAPTLEAKEKEIANGRLMLAFLGFIIQHNVTGKGPFDNLLQHISDPWHNTIVQ

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	174

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	19

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE
分子量 formula_weight	510.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	53

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 11 domains

CATH v4.4 (11 domains)

结构域编号 domain_id	3lw5A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1130 — Photosystem I p700 chlorophyll A apoprotein A1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	3lw5B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1130 — Photosystem I p700 chlorophyll A apoprotein A1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaA/PsaB

结构域编号 domain_id	3lw5C00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	3lw5D00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1470 — Photosystem 1 Reaction Centre Subunit Ii; Chain: D;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaD, reaction center subunit II

结构域编号 domain_id	3lw5E00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	3lw5F00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 — Photosystem I, reaction centre, subunit PsaF

结构域编号 domain_id	3lw5G00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	286 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — Chlorophyll a-b binding protein like

结构域编号 domain_id	3lw5J00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	510 — Single helix bin

结构域编号 domain_id	3lw5K00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	286 — GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — Chlorophyll a-b binding protein like

结构域编号 domain_id	3lw5L00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1240 — Photosystem 1 Reaction Centre Subunit Xi; Chain: L;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI

结构域编号 domain_id	3lw5N00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	1190 — Chlorophyll A-B binding protein fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Chlorophyll A-B binding protein

▶

晶胞边长 a length_a	120.655 Å
晶胞边长 b length_b	189.086 Å
晶胞边长 c length_c	129.388 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	91.24 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.300 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.3510
R_work r_work	0.3490
R_free r_free	0.3830

Improved model of plant photosystem I

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I iron-sulfur center

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit VIII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Type II chlorophyll a/b binding protein from photosystem I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chlorophyll a-b binding protein 3, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chlorophyll a-b binding protein P4, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3lw5__assembly_1__model_1

3lw5__assembly_1__model_1 | I(q)

3lw5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (24)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer