3s90

Human vinculin head domain Vh1 (residues 1-252) in complex with murine talin (VBS33; residues 1512-1546)

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Vinculin

Homo sapiens

UniProt P18206

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Talin-1 × 1 (P26039) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Talin-1 × 1 (P26039) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VINC_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–253; UniProt 1–252 作者链 B; PDB构建体 2–253; UniProt 1–252

Talin-1

Mus musculus

UniProt P26039

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Vinculin × 1 (P18206) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Vinculin × 1 (P18206) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TLN1_MOUSE
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 6–40; UniProt 1512–1546 作者链 D; PDB构建体 6–40; UniProt 1512–1546

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3s90
沉积日期 deposition_date2011-05-31
结构标题 titleHuman vinculin head domain Vh1 (residues 1-252) in complex with murine talin (VBS33; residues 1512-1546)
关键词 keywordsfour-helix bundle, cell adhesion, focal adhesion; CELL ADHESION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3s90__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3s90__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3s90__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)26.64 Å
Rg(电子密度)26.80 Å
总 Rg27.07 Å
原子数2138
残基数275
排除体积38567 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3s90__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3s90__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd3s90a1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.24 — Four-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamilya.24.9 — alpha-catenin/vinculin-like
家族 Family familya.24.9.1 — alpha-catenin/vinculin
结构域编号 domain_idd3s90a2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.24 — Four-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamilya.24.9 — alpha-catenin/vinculin-like
家族 Family familya.24.9.1 — alpha-catenin/vinculin
结构域编号 domain_idd3s90b1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.24 — Four-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamilya.24.9 — alpha-catenin/vinculin-like
家族 Family familya.24.9.1 — alpha-catenin/vinculin
结构域编号 domain_idd3s90b2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.24 — Four-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamilya.24.9 — alpha-catenin/vinculin-like
家族 Family familya.24.9.1 — alpha-catenin/vinculin

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3s90A01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily230 — Alpha-catenin/vinculin-like
结构域编号 domain_id3s90A02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily230 — Alpha-catenin/vinculin-like
结构域编号 domain_id3s90B01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily230 — Alpha-catenin/vinculin-like
结构域编号 domain_id3s90B02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily230 — Alpha-catenin/vinculin-like
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7. 引用文献 (1)