4bdu

Bax BH3-in-Groove dimer (GFP)

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GREEN FLUORESCENT PROTEIN, APOPTOSIS REGULATOR BAX

HOMO SAPIENS

UniProt P42212

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 4 water × 8 与蛋白数一致
2 信息不足 同源多聚体 蛋白 4 water × 8 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GFP_AEQVI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 4–231; UniProt 1–230 作者链 B; PDB构建体 4–231; UniProt 1–230 作者链 C; PDB构建体 4–231; UniProt 1–230 作者链 D; PDB构建体 4–231; UniProt 1–230

GREEN FLUORESCENT PROTEIN, APOPTOSIS REGULATOR BAX

HOMO SAPIENS

UniProt Q07812

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 4 water × 8 与蛋白数一致
2 信息不足 同源多聚体 蛋白 4 water × 8 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BAX_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 234–309; UniProt 53–128 作者链 B; PDB构建体 234–309; UniProt 53–128 作者链 C; PDB构建体 234–309; UniProt 53–128 作者链 D; PDB构建体 234–309; UniProt 53–128

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4bdu
沉积日期 deposition_date2012-10-08
结构标题 titleBax BH3-in-Groove dimer (GFP)
关键词 keywordsAPOPTOSIS, PROGRAMMED CELL DEATH, BCL-2 FAMILY, CHIMERA; APOPTOSIS
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4bdu__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4bdu__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4bdu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)39.68 Å
Rg(电子密度)39.42 Å
总 Rg39.75 Å
原子数9464
残基数1180
排除体积167850 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4bdu__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4bdu__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_idd4bdua1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.22 — GFP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.22.1 — GFP-like
家族 Family familyd.22.1.1 — Fluorescent proteins
结构域编号 domain_idd4bdua2
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamilyf.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family familyf.1.4.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4bdub1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.22 — GFP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.22.1 — GFP-like
家族 Family familyd.22.1.1 — Fluorescent proteins
结构域编号 domain_idd4bdub2
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamilyf.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family familyf.1.4.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4bduc1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.22 — GFP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.22.1 — GFP-like
家族 Family familyd.22.1.1 — Fluorescent proteins
结构域编号 domain_idd4bduc2
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamilyf.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family familyf.1.4.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4bdud1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.22 — GFP-like
超家族 Superfamily superfamilyd.22.1 — GFP-like
家族 Family familyd.22.1.1 — Fluorescent proteins
结构域编号 domain_idd4bdud2
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamilyf.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family familyf.1.4.0 — automated matches

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id4bduA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology155 — Green Fluorescent Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Green fluorescent protein
结构域编号 domain_id4bduA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Blc2-like
结构域编号 domain_id4bduB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology155 — Green Fluorescent Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Green fluorescent protein
结构域编号 domain_id4bduB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Blc2-like
结构域编号 domain_id4bduC01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology155 — Green Fluorescent Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Green fluorescent protein
结构域编号 domain_id4bduC02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Blc2-like
结构域编号 domain_id4bduD01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology155 — Green Fluorescent Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Green fluorescent protein
结构域编号 domain_id4bduD02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Blc2-like
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7. 引用文献 (1)